5JWQB

Crystal structure of kaic s431e in complex with foldswitch-stabilized kaib from thermosynechococcus elongatus
Total Genus 15
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
15
sequence length
88
structure length
88
Chain Sequence
TAVLKLYVAGNTPNSVRALKTLNNILEKEFKGVYALKVIDVLKNPQLAEEDKILATPTLAKVLPPPVRRIIGDLSNREKVLAGLDLLA
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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molecule keywords Circadian clock protein kinase KaiC
publication title Structural basis of the day-night transition in a bacterial circadian clock.
pubmed doi rcsb
source organism Thermosynechococcus elongatus (strain bp-1)
molecule tags Transcription regulator
total genus 15
structure length 88
sequence length 88
chains with identical sequence D
ec nomenclature
pdb deposition date 2016-05-12

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
B PF07689 KaiB KaiB domain
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.30.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich Glutaredoxin Glutaredoxin 5jwqB00
3MDKA 3LORA 3GIXA 3GKKA 4TN8A 2MMNA 4O7HA 4EKZA 2H30A 4XS4A 2ON7A 4FYCA 2MBTA 2FHEA 3RPNA 1YQ1A 2F8AA 3IE3A 1JHBA 5C04A 2IMDA 3D5JA 5JWOB 2V6OA 4WEYA 2HZFA 1ZL9A 2WDUA 1XWBA 5D9TA 1OYJA 4ECCA 2LNSA 2YP6A 4GCIA 3A2WA 5LCZA 2DJ3A 1A8YA 2B7JA 2X8CA 2IMEA 1M7TA 1PMTA 2EIOA 1TOFA 2HYXA 2P5QA 2RUEA 2R2JA 1NW2A 2P0GA 3ZITA 3ZIJA 4TW5A 4D73B 5HR2A 2FUG2 4Z7XA 1VRSD 2B5YA 2KOKA 3HXSA 4FH8A 2VL3A 2KP2A 2Z9SA 1JLWA 1SJIA 3TJBA 4POKA 5J3RA 2CVKA 2VLTA 3TJFA 1PKWA 3TRXA 4BPYA 2L6DA 3F0IA 3ERFA 1A0RP 2HZEB 3KH7A 1UN2A 2IMIA 5E4WA 5ECPB 1S3CA 1UA5A 1CQGA 4LLRA 2PERA 1K0OA 1OVNA 1XVWA 1AQVA 1YEXA 3QAVA 2LNTA 4MF6A 5A5KA 1WP0A 3GX8A 2YJ7A 2JSYA 3WT2A 1GSYA 3PR8A 2HSHA 5J9BA 4IP6A 5J4UA 3HY2A 2PWJA 2WGRA 3EU3A 5ID2B 3MWHA 1GUMA 3F4RA 3CSJA 1R5AA 3GFKA 5ECQB 2I9HA 3QFAC 4RUVA 1SJ6A 1O6JA 3ISOA 4IGJA 4N0VA 3Q74A 3EWLA 4JR4A 3H4KA 1ERWA 3DKSA 3ZLPA 1XWGA 4GQFA 1F2EA 1PSQA 3JCML 1QXHA 1V98A 1OKTA 2TRCP 4OO5A 3IOSA 1TRWA 5GSTA 1ERTA 2ZUPA 2B1LA 4EXJA 2GT6A 1AUCA 4MJBA 1BX9A 4FYBA 1GWCA 3IAM2 1XPVA 1GL8A 1JZRA 4WKWA 2B5XA 5IO0A 1A24A 1GNWA 4F2IA 1LBKA 5J9CA 3TRPA 2MMOA 3TKQA 4NHZA 2IJYA 2V6KA 3BD2A 4WF4A 5HQPA 4GF0A 1GUKA 3APOA 4TOPA 2B7KA 3ZYWA 3G7JA 3O6TA 4I5QA 4I6XA 5ID2A 2AUVA 4IQ1A 4Q5QA 3DMLA 1G0TA 5HR0A 2H01A 3DYRA 5HR1A 2AV4A 1Z7PA 2K6VA 3M9JA 2FCHA 1XOAA 4BA7A 3N5OA 5DDLA 4EL1A 3KZQA 1YEPA 2B3SA 4ZB8A 4F03A 2XPDA 3C73A 5JCGA 1UC7A 1F9MA 4ULXA 3WGXA 1EEMA 2FWEA 1QUWA 3F3RA 4OD7A 4ID0A 1T7PB 2H74A 5DJMA 1XZOA 5H5SA 1PQNA 5A4VA 4KCEA 3KJYA 2CA8A 2IPAA 2H0HA 4GSTA 3QDNA 4GRFA 2JZTA 3MAKA 2ON5A 1EZKA 4LMVA 1GRXA 1DUGA 1XW6A 1PGTA 3UIWA 2IMFA 5E59A 6GSYA 1BAYA 2HXKA 3I69A 4L0WA 4IBPA 4GXZA 2DJKA 4YQVA 1KBNA 2H71A 3L9SA 4Q5NA 3O76A 3TJGA 4KUNA 2OE0A 1G6WA 1HNBA 2K8SA 3HVVA 2H75A 1XIYA 1G6YA 2LJRA 3TDGA 2L5OA 4H86A 2M46A 4V2NA 2H1GA 4F9ZA 2ES7A 3GA4A 2HE3A 1KTEA 2QSIA 2R4VA 1EV9A 2CAQA 1PN9A 3KP9A 3R2QA 11GSA 1SKWB 4TR1B 4IVFA 1X5EA 4KDXA 1K0CA 2RM6A 4IN0A 1M0UA 1Y6EA 3H93A 4JBBA 3ZL5A 3A5WA 2PBJA 3GX0A 3FR6A 2FY6A 3EMPA 4LA1A 4TXVA 4E8HA 5F07A 2IWTA 3ZMLA 3HJOA 3I43A 1ZGNA 4OCEA 5IOXA 2IMKA 1U87A 2JZRA 4J57E 3AY8A 2H8LA 4FO5A 4ZBAA 1AQXA 1ACVA 4ZL7A 4EVMA 5C00A 2FWHA 2VLVA 3IK7A 3HJPA 2R37A 4O5RA 2LEGA 4BL7A 3F6DA 2V41A 2F9SA 4ECIA 2CV4A 4QL9A 1TI3A 1UVZA 3W6GA 2H73A 1GTUA 1K0NA 5B6MA 1TTZA 2NDOA 3GN3A 1DE1A 2R3XA 5D93A 4ISDA 3IHQA 3MSZA 2MMZA 2VOCA 5IMDA 1T3BA 3UJ1A 3UEMA 5ECIB 2H6XA 4F82A 3W8JA 4HU9A 1SYXA 5ENUA 3BCIA 2XBIA 1MD3A 5B8AA 5CYYA 5DJLA 1XW5A 2WCIA 3CBUA 1M2BA 6GSXA 4ECBA 1O85A 4NAXA 4PQIA 2OJLA 3QMXA 2NVLA 4OFNA 1B4QA 4ZBDA 2B5EA 1AQWA 5ECLB 2H1BA 3Q19A 1XXUA 3HDCA 3GH9A 3BJ5A 5G5FA 2AAWA 3FZAA 3CXGA 3A2VA 2OKAA 3FR9A 4MJCA 4MZBA 3ZVJD 3IRAA 2E7PA 4WBRD 2YCDA 1T4YA 2GSRA 3NOFA 3TJJA 4EO3A 5CRHA 2VCXA 3KMOA 2VL9A 2OA7A 3DGQA 2DC5A 3UBLA 5F05A 1E2YA 3UOMA 3IV4A 9GSSA 2J9HA 4PUFC 2JL4A 4NMUA 4AJ8A 2TIRA 2F8FA 1A2LA 4GWRA 4KGIA 3VPTA 1XWAA 3KXOA 3BCKA 3TGZA 1EV4A 2HRNA 4JEDA 3J7Yk 3L0HA 5HFKA 3RAZA 4YQUA 1TP9A 4ZB6A 1A23A 2F3MA 3EMXA 1AIUA 1S3AA 4K7NA 2AHEA 1VF4A 17GSA 5CREA 1Y25A 1PX7A 3O3TA 1GULA 4X0XA 3GNJA 1R5PA 2O85A 5F0GA 4TKYA 5D96A 2B1KA 4ZL8A 2M80A 2GZYA 4XRAA 3W8SA 3ZFBA 2VAFA 1F6MC 5AGYA 1Z7RA 4IS0A 1OC8A 3EVIA 4KE3A 2PMTA 5AISA 5DVBA 3UL3A 2CVDA 4KNDA 3D21A 4N0ZA 1PD21 3UARA 5AIVA 5LD0A 1OAZA 1ZCPA 4OMVA 2GQLA 3FYGA 2H72A 3P2AA 1TI1A 1LU4A 4NXIA 1XVQA 1ERVA 3GH6A 1MDJA 2E0QA 1OE7A 3IBHA 1XCCA 3LFLA 3KH9A 5D73A 3IR4A 4MZCA 1HYUA 1FG4A 2H70A 4WETA 3C8EA 1RW1A 2IFQB 2TRXA 2GTUA 5G31A 4GSSA 4Q5FA 2GGTA 3GSTA 1A2MA 2IIYA 5JWQB 2WJUA 3VI5A 3KP8A 4I97A 3FEUA 5G30A 1PL2A 3CMIA 1K0MA 3C1SA 1EP7A 6GSSA 3HA9A 4NPBA 1WMJA 2H1AA 3Q18A 3FY7A 1R26A 2HI7A 4WBJA 1BEDA 3F3QA 5IPHA 1CQHA 3ZZXA 4MDCA 3QD9A 2GS3A 3L4NA 2C0DA 5CAXA 5JCWA 4IELA 1U3AA 1TJDA 4HU7A 2H6YA 2XHFA 4I2UA 5B6NA 4MLYA 2CAIA 3UMAA 4ILFA 2IFQA 2FWFA 6GSVA 5D9VA 3K8NA 1Q98A 1VF2A 3TOUA 4KW6A 1YJ6A 1HNAA 4MF5A 5L71A 4MP4A 4WF5A 1M2DA 3UAPA 4ACSA 4N10A 1TKDB 1QK8A 4IJIA 2AB6A 5CNWA 2XPEA 4GSNA 3F6FA 4ZIJA 2H66A 1O8XA 5HR3A 1WJKA 3TUEA 3DIEA 1HNCA 2C3TA 1W89A 2K8VA 1GSFA 2YJHA 4FYUA 1Z9HA 1F37A 2I3YA 6GSTA 1U88A 3PGTA 4NHWA 1ZZYA 1O73A 1AAZA 1PKZA 1JZOA 5EL8A 3KIJA 1OE8A 2CZ3A 2YOIA 1YKCA 1HQOA 3KEBA 3VFIA 4KSMA 3H1NA 2FLSA 1SKRB 1KEBA 1F3BA 3GKXA 3CRTA 4PNGA 3P7XA 5KEJA 4PNFA 4CHSA 3P8WA 2E2MA 2GLRA 4MJAA 5G2ZA 5IOWA 5DCHA 5GSSA 2CQ9A 4MPFA 2CVBA 2C4JA 2O87A 2ZCTA 3GYKA 2RLIA 2GQMA 4DVCA 1DSBA 2ALBA 4G19A 4LMWA 3DVXA 4EDZA 4IHUA 4L5LA 5A4UA 3EC3A 1QQ2A 4NV5A 3HVSA 4LL1B 19GSA 1SK1A 2VM2A 4TRXA 3GUSA 3VWUA 2REMA 1FAAA 4MA9A 3ERWA 1X9MB 1GUHA 2C0EA 2GVPA 1ABAA 1AC1A 1J0FA 3CSHA 4HDEA 1FVJA 4XS6A 5H5RA 1FOVA 3GRXA 20GSA 4RI6A 2EIQA 4PX1A 2YZUA 2FWGA 2G0FA 1C72A 4ZB9A 3ZIVA 3LEFA 3LG6A 1A8LA 4PUAA 5ECSA 4HI7A 2FGXA 3UVHA 2K18A 4L5OA 2GSSA 2L4QA 1IYIA 2EIRA 4ECJA 1T00A 5AIXA 3GL3A 4BWQA 2FA4A 2AYTA 5ECMB 3SWLA 5ABRA 14GSA 1PA3A 4XS1A 2L6CA 5B8BA 1RQMA 4POMA 4MK3A 5DQSA 1WIKA 2MZCA 4DSRA 1ERUA 2VO4A 2DJ1A 2FNOA 2OE3A 3LYKA 1ST9A 3LSZA 4IQAA 4MH3A 5GAND 4BVYA 1J08A 4YH2A 4GQCA 2ZNMA 5EY6A 1B4PA 4IJ3A 2B6MA 3FR3A 3CRUA 2GZPA 4K8MA 4TR3A 5DCGA 1O7UA 3TKSA 1JZDA 3GHAA 3I6AA 2DSAA 2VLUA 1T4ZA 3ZFLA 1GP1A 4K7OA 10GSA 2VCVA 2HT9A 2BTOT 2F51A 5G5EA 1XWCA 3G9BA 5CRDA 3RHCA 3D4TA 1G7OA 2WS2A 13GSA 1YF1A 4HUAA 1V58A 3J7Yb 4KA0A 1FO5A 4KB3A 4V2MA 4XIHA 1GLQA 4NV2A 3DRNA 2C8UA 4HQSA 4OCFA 5GZZB 2O89A 2D2ZA 1YZXA 2I1UA 2IN3A 1K0AA 3OR5A 1EWXA 2OBIA 1GTIA 2CZ2A 5JCUA 2DJJA 3C1RA 1TRSA 2XC2A 3QOUA 5J41A 1FB0A 1GSSA 4XRDA 2LKUA 2BMXA 2GSTA 2HRFA 3E3EA 2KP1A 3FW2A 3D4MA 3GKNA 3H8QA 3ZVJA 3ZTLA 2LTKA 2PVQA 1V2AA 1GNEA 3M9KA 1FHEA 4KDUA 2P31A 1R4WA 4CW9A 2RIIA 4Q5RA 1MEKA 4POBA 4OWYA 5DBQA 4HZ4A 2A4VA 1OC9B 2JZSA 2VL2A 1B8XA 1AXDA 3EURA 1NSWA 4K6XA 1M9AA 1ML6A 2R6KA 1XBSA 3IA1A 3VWXA 4RQXA 3LYPA 4HJMA 4AGSA 3TKRA 3WD6A 3QAGA 4XHMA 5ECKB 1QGVA 1X9SB 3M3MA 4HEA2 2GQKA 1MDKA 4KDYA 2VCZA 1PL1A 2VIMA 3TKPA 2MMAA 4CDOA 8GSSA 5IMVA 1M2AA 2N5FA 1EGOA 4EE0A 1SD9A 4K2DA 5H5QA 5F8BA 2DMMA 2DBCA 1K0DA 1IYHA 1MTCA 3FHKA 1XOBA 1GTAA 1DBYA 5IMCA 5D9WA 3M1GA 4JRRA 5B7CA 4JU5A 2L4CA 3FZ4A 1GTBA 1SJZA 4MH2A 3VWWA 4IP1A 3TB2A 2VD0A 2I4AA 3APQA 2LJAA 1VGLA 4OFTA 3GTUB 22GSA 5CRWA 2HSYA 5G1LA 1OC9A 1OKDA 1DE2A 2AJQB 3M0FA 4O92A 1GSUA 5KN3A 1GSEA 3LJRA 1ZOFA 4E8EA 5IQYA 1EEJA 5D8IA 2VCWA 3MNGA 3D6IA 4EF0A 4KX4A 3ME7A 3S9FA 3KMNA 4ZL9A 3IK9A 5KN2A 4KH7A 4QQ7A 3F4SA 1Z5YE 2YWNA 4TXOA 1SK0A 1GH2A 2LRTA 2GDRA 1SL1B 5IMAA 2K9FA 1K0BA 3VK9A 3LXTA 3N9JA 5D9XA 2PN8A 2NPBA 5EPFA 3L9UA 3DEXA 6GSUA 3A2XA 2P5RA 1WWJA 3EE2A 3WYWA 4J56E 4RI7A 2O8VB 5HFGA 3E0UA 1B9XC 1A2JA 4ZXGA 1B48A 3GL5A 3C71A 2YWOA 4YQMA 3IDVA 3NZNA 5EVOA 2YWMA 1K3YA 1ZMAA 2X8GA 3F9UA 1XW9A 4PQ1A 1ILOA 3GTUA 1YKAA 1OC3A 4MMMA 2OE1A 2N5BA 1KNGA 1QFNA 1PRXA 2VCQA 4IW9A 2DIZA 2HNLA 4MF7A 4BWSA 4TVEA 3G7YA 2J23A 5FWGA 3TKSE 4GTUA 3HZ4A 1BQ7A 1XFLA 4EC0A 2GT5A 3EYTA 1EOGA 3QPMA 2WB9A 2DMLA 2GSQA 1EP8A 5IM9A 16GSA 1SL2B 2YV9A 5DALB 2LUSA 3RPPA 1N8JA 2VD1A 3ED3A 2H0IA 4AJ7A 2JACA 1Z3EA 1B9YC 4K0GA 2MYGA 3FKFA 2VCTA 3I9V2 4JR6A 3FZ9A 3US3A 1ZYQB 1TW9A 5IO2A 3WT1A 5DAKB 1X9WB 2OADA 1TRUA 4D73A 3HVXA 4TR0A 4X43A 4MZWA 3C7MA 4ZILA 3D0ZA 4HZ2A 4P3YB 2YNXA 2V32A 2H6ZA 4O32A 2HZEA 5F06A 5J5NA 4YAPA 3HHVA 1THOA 1A0FA 4POLA 1JLVA 3GURA 3RBTA 2HLSA 3ME8A 4PURA 2LRCA 1I5GA 1H4OA 2N5AA 2JSZA 3EINA 1SU9A 5IMFA 4PXOA 3LWAA 3ZMKA 2YANA 3HJMA 1R7HA 3U6VA 1M99A 5DALA 1V9WA 1ZYEA 3LGCA 2A2SA 1TRVA 2L57A 2X64A 4V1Ag 4I2TA 3TKSC 1V40A 1U6TA 3QFBC 1SL0B 5HFIA 3L78A 3SBCA 2A2RA 4ML6A 5IMZA 2DIYA 1BYEA 1SKSB 2LQQA 2PUKC 3BOAA 3WGEA 2LRNA 3FRCA 4XTSA 2G2QA 5GAPD 6GSWA 18GSA 1O81A 5DAKA 3CTGA 3EU4A 4LL4B 4QL7A 2CT6A 4KAEA 2PGTA 1WRYA 4L0UA 1XWKA 2XBQA 3HZ8A 1BJXA 4IKHA 3IAS2 1MD4A 1SENA 3F63A 4HJ2A 4PQHA 4AJ6A 4HOJA 4TR4A 1EOHA 1VF1A 4F0BA 2V1MA 4G9HA 3F4TA 3U5RE 2VM1A 2YZHA 3VI7A 2E2GA 4YAVA 3RHBA 2L5LA 5ELGA 4DSSB 1W4VA 1SYRA 5IIZA 1J9BA 1Q4JA 1WE0A 2C80A 2PVOC 4OO4A 2RUFA 1NHOA 2I81A 1QMVA 2DLXA 4J2FA 2LS5A 2FA8A 4EUYA 4G2EA 2WFCA 4MJEA 5ECOB 2JADA 4RQRA 2GZZA 4N30A 2QKEA 3QAWA 1FW1A 4ZBBA 2VL2C 2QGVA 1SD8A 3UBKA 3IC4A 2NBSA 4AF2A 4PGTA 4K0NA 2PPTA 3HYPA 4JZQA 1WOUA 3DWVA 3VURA 2WULA 1EGRA 2YV7A 1X0RA 3TOTA 4I8BA 3CYNA 2OACA 5LNKe 3DXBA 3GKMA 2O7KA 2H0GA 1GLPA 3BBYA 3NIVA 4NWYA 1G7EA 2CX3A 2LQOA 1THXA 1GSDA 2WRTA 1FB6A 5ELAA 1JFUA 4MCUA 4XCSA 3TCOA 3ZREA 1YDKA 4FIWA 1AW9A 4GLTA 1TK5B 5ECRB 1T1VA 2DJ2A 1TXXA 1WPIA 1TU7A 3G7IA 1U3IA 5CO3A 12GSA 3PINA 1URMA 5KN1A 1HD2A 2HFDA 4DSSA 3E9JB 4WR5A 3V1WA 4L8EA 1PX6A 4BVXA 3CTFA 4EDYA 4K9ZA 2IL3A 3QR6A 2V2GA 3P90A 3APSA 3KCMA 4K7IA 4F0CA 5A4WA 3KTLA 4K1FA 4DSQA 4JE1A 3TRQA 2MBSA 2KUCA 4DEJA 4N11A 2C3QA 3HCZA 5AN1A 2NTOA 1V57A 1USBA 3RDWA 1YY7A 1K3OA 3HKRA 3L9VA 3DD3A 1TK8B 1SK2A 2FD3A 2C1YA 3D22A 5ECNB 2QC7A 4HQZA 2H76A 5COHA 1Z6NA 2C3NA 3IPZA 4TR1A 4OFMA 1BG5A 4KCAA 3TJKA 3F8UA 3H79A 3IXRA 1LJRA 1TDIA 1E6BA 5IPGA 5FHIA 2RM5A 1NM3A 5INYA 1S3DA 3GMFA 2YWIA 1I9DA 1N2AA 1RK4A 3GSSA 4WXTA 1GSQA 2LSTA 3DVWA 3M8NA 4G10A 2BJXA 3ERGA 3Q6OA 1YF0A 5CRGA 3WGDA 1X5CA 4V1Ap 1T8EB 2YN1A 2VUPA 1JZWA 2JU5A 2LV3A 4HS1A 2DJ0A 1H75A 2OBKA 3UVTA 4XS4B 4TXOB 4MABA 2EC4A 2WZ9A 1NHYA 2H1DA 3VPQA 3FZ5A 3FK8A 3ZRDA 1TK0B 2KHPA 3VLNA 2H19A 1Z6MA 4WR4A 1ON4A 3PH9A 3KGKA 1TU8A 4MPGA 4X1UA 5ECHB 3A3TA 1M9BA 4V2LA 1MDIA 2PU9C 2C0FA 2KLXA 3KTBA 4KSOA 5JWRB 3KM6A 5FT3A 2X8HA 5KN0A 2C0GA 2X99A 2R5GA 2YPMA 1K3LA 5DQYA 2M72A 1O8WA 3CSIA 2L59A 3GV1A 2LJKA 3VWVA 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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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