2L4CA

Solution structure of the b domain of human erp27
Total Genus 19
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
19
sequence length
116
structure length
116
Chain Sequence
b'EVEKSSDGPGAAQEPTWLTDVPAAMEFIAATEVAVIGFFQDLEIPAVPILHSMVQKFPGVSFGISTDSEVLTHYNITGNTICLFRLVDNEQLNLEDEDIESIDATKLSRFIEINSL'
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
{{ tooltip.sname }} connected with {{ tooltip.tname }} : {{qFormat(tooltip.svalue) }}
molecule keywords Endoplasmic reticulum resident protein 27
publication title Solution structure and dynamics of the b domain of human ERp27
rcsb
source organism Homo sapiens
molecule tags Peptide binding protein
total genus 19
structure length 116
sequence length 116
ec nomenclature
pdb deposition date 2010-10-03
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.30.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich Glutaredoxin Glutaredoxin 2l4cA00
7GSSA 1Z6MA 2CV4A 2L5LA 5HFGA 2D2ZA 5D8IA 1GP1A 4HZ2A 4P3YB 19GSA 3L9SA 4KCEA 1T4ZA 1N2AA 4N0ZA 2IFQB 2CZ2A 4MJCA 2YCDA 4GQFA 3UBLA 3M9JA 4V1Ag 4ZL9A 4IW9A 3SWLA 2A2SA 2G0FA 2L59A 1NHYA 3Q74A 2NTOA 3CRTA 3F4TA 1BEDA 2OE3A 4RUVA 3LSZA 2ON5A 4YQVA 3O3TA 2RIIA 1HYUA 3L9VA 4OFTA 4F03A 2IMFA 4ECCA 5C00A 2KP1A 3A2VA 5LCZA 2R3XA 5ECKB 1U88A 3PR8A 4TR3A 3A2XA 2NDOA 2FWHA 3IK9A 6GSSA 4OFMA 1YZXA 4POMA 12GSA 3L4NA 1GSEA 3TGZA 5ECMB 1G7OA 2P5QA 2OKAA 2R6KA 4OD7A 1ACVA 1QGVA 2DLXA 3IPZA 1R4WA 2AUVA 1S3CA 4QQ7A 1A2LA 1F3BA 4IQ1A 5G31A 4XRDA 4BVXA 2I3YA 4ECIA 1YY7A 4OO5A 1OE7A 2CVKA 4NV2A 2CT6A 4AGSA 5GAND 1MD3A 1Z6NA 2GQKA 5IQYA 2LRTA 4DSRA 4TXOB 3KZQA 3W6GA 5IMAA 4F0CA 2FLSA 5KN3A 3QOUA 1XBSA 2L4QA 2P0GA 2VCTA 2YWOA 3GURA 5AGYA 4HZ4A 3ZYWA 2AAWA 1Z3EA 4KGIA 3JCML 2VD1A 4XHMA 1EEMA 1H4OA 2JZSA 3F4SA 2B5YA 2PBJA 3D5JA 5B6MA 4PURA 2HSHA 2VCZA 3LYPA 1A8LA 2H76A 4XIHA 3IOSA 2WS2A 4GRFA 3CYNA 4ULXA 4HJMA 2YANA 2GDRA 1A2JA 1XVQA 1HNCA 2GT5A 1EOHA 3EMPA 1GSDA 1U87A 3KD0A 2HRFA 2N5BA 3EYTA 5DBQA 4ML1A 2LEGA 2FGXA 3RBTA 1T8EB 2IFQA 4IP6A 1B48A 4KAEA 3TKRA 3ZMKA 3F3RA 2P5RA 4KA0A 3WYWA 5IOXA 1O85A 3VK9A 1USBA 2H70A 5ECLB 3ZVJA 2QC7A 4N30A 2IMKA 2H1DA 3DWVA 2JZRA 1O73A 1URMA 5ELGA 1K3OA 1TJDA 4HDEA 1QQ2A 4IQAA 1RQMA 1ZZYA 1FG4A 1MD4A 3LYKA 3TB2A 4V2LA 1XWCA 2H01A 1GTAA 3AY8A 1GTBA 1YF1A 3IA1A 1HQOA 5IO2A 4E8EA 4KDYA 4I5QA 3ZIVA 2LQOA 2EC4A 1PL2A 2DJJA 4ZL7A 1F9MA 4MMMA 4GSTA 4I6XA 2REMA 2TIRA 4LLRA 4TVEA 3W8SA 3FZ4A 1THXA 1M0UA 5DJLA 2H66A 3C7MA 5ECPB 3ED3A 4BA7A 1TKDB 1A0RP 4K0GA 1M9BA 4RI7A 2H0IA 4DVCA 20GSA 1LBKA 3WGDA 1G0TA 1ZOFA 3EINA 4PX1A 5E4WA 2FA8A 2K9FA 3GYKA 1PQNA 1O7UA 3CRUA 4Q5QA 2V6OA 5DVBA 2OBIA 1ABAA 1CQHA 5A4WA 1OKDA 2I9HA 4Z7XA 3ZFLA 2LRCA 1TU7A 2WFCA 4LL1B 2YN1A 4WR4A 2XPEA 3MAKA 3M8NA 2HT9A 4X43A 1OAZA 5ECRB 2X64A 3CBUA 5DDLA 2VAFA 3F6DA 4HUAA 3BOAA 3ZLPA 2C3QA 3HHVA 5ABRA 1ERTA 2WDUA 2JSZA 1OC8A 3U5RE 1F3AA 2LJKA 3I43A 3FZ5A 4GTUA 2H0GA 4HEA2 4TR4A 4RQRA 3J7Yb 5ELAA 5D9WA 3DEXA 1SD8A 3ZL5A 1A0FA 4ECJA 1MEKA 2HI7A 3RPNA 3TJBA 3K8NA 1JLWA 4XRAA 4TXVA 2GTUA 1EZKA 2NVLA 1T1VA 4MJBA 2LJAA 2C3TA 4JEDA 3F8UA 2LV3A 3WGEA 3FZ9A 1SJ6A 3R2QA 3A2WA 3QR6A 2MMZA 1B4PA 5G1LA 1XOBA 4ECBA 2F8FA 3Q18A 3CTGA 4PQ1A 1V40A 4K9ZA 1PKZA 1K0MA 1KTEA 2VM1A 2OE1A 3DVXA 3EVIA 4MABA 4OFNA 3ERWA 2M80A 6GSTA 1U3IA 2XHFA 1K0NA 5EVOA 16GSA 1ZYQB 4CHSA 4WR5A 2MBTA 3IC4A 1TU8A 3CSJA 3TKQA 2F9SA 2WULA 1JHBA 1B8XA 3GIXA 2K8VA 4POKA 1KEBA 4BWQA 4L0WA 5F0GA 1A24A 1YEXA 1NHOA 4J56E 2DJ2A 3UMAA 1KBNA 3LORA 3HJOA 1QMVA 1XVWA 3UAPA 3GNJA 3H79A 1XW5A 2J9HA 5G5FA 1T7PB 1VF2A 2IMDA 3V1WA 3C71A 3F63A 2YWMA 4WXTA 4EE0A 4EDZA 4IBPA 2XBIA 5FWGA 3VLNA 2PU9C 4ML6A 4NMUA 2H6XA 1QFNA 3D4MA 2F8AA 4N0VA 3TJJA 4Q5NA 5ECOB 1Z5YE 5J41A 4JU5A 2YZUA 4V2NA 2ZNMA 3APQA 3P8WA 1AUCA 2XBQA 4GWRA 2DC5A 4K8MA 1TK5B 1Z9HA 2FWGA 3C1SA 5B8BA 1EGOA 3KEBA 1BJXA 4ZBAA 3F9UA 4XS6A 3BCIA 5IO0A 1F37A 1M99A 1DBYA 3TOUA 4TW5A 3MDKA 2PWJA 4NAXA 1O81A 1MDJA 2P31A 3E3EA 2PGTA 3BD2A 1EWXA 3TOTA 2VLVA 2A4VA 5HQPA 4ZB8A 4IJ3A 3FKFA 2BJXA 2LNTA 2VO4A 4MH3A 2R2JA 4AJ7A 2IMEA 4ZBDA 2GZPA 2TRCP 4OWYA 5A5KA 2WJUA 3FRCA 5GZZB 1DUGA 1I9DA 2KLXA 4O32A 3FR3A 3I69A 5D9TA 2HZEB 3HZ8A 1PMTA 2C0DA 3HD5A 5JCGA 3NZNA 3RPPA 1AQWA 3D22A 2YWIA 4BPYA 1JZWA 4WKWA 5CYYA 4Q5RA 3OR5A 2ON7A 2AYTA 2IPAA 1J0FA 2B7JA 2DJKA 1K3YA 4XS4B 3GHAA 5JCUA 3CMIA 3IR4A 3QD9A 4JE1A 1DE1A 1ST9A 2RLIA 1JZRA 4HJ2A 3VWWA 1V2AA 2OE0A 2VL2A 3RHCA 1FVJA 3PH9A 2GSTA 5EL8A 4I2UA 2RUFA 1PRXA 3CXGA 3HJMA 5JWOB 3GX8A 3GKMA 1FVKA 2DJ0A 2L5OA 1GWCA 4O7HA 2R5GA 1U6TA 5HR1A 2B5XA 3L9UA 3FR6A 4ACSA 2B6MA 3IBHA 4TR1B 1WP0A 5FT3A 5INYA 3IK7A 2GQMA 3I6AA 3QMXA 5F06A 4I8BA 3ME7A 1O8WA 3BBYA 3KH9A 1ON4A 5B7CA 3VURA 2KP2A 1M2DA 2VCQA 2E2MA 5IIZA 2RUEA 2KUCA 3UEMA 4MZCA 5EY6A 1OC9B 2LQQA 4GXZA 3UARA 1TOFA 18GSA 2GLRA 2AHEA 4IP1A 5IMDA 3M3MA 5L71A 2MBSA 1HNBA 5B6NA 2H1BA 2R37A 1OE8A 2KOKA 4YQUA 4BL7A 1TRSA 2VLTA 4DSQA 2IJYA 3F0IA 22GSA 2QGVA 5CRGA 1WE0A 2PMTA 4N11A 1J9BA 4GCIA 4N10A 1A2MA 1R5PA 2I4AA 2MZCA 2O89A 1WPIA 2O7KA 3GTUB 2VIMA 4EXJA 4X1UA 1QUWA 3KM6A 5DAKB 2L4CA 1GSUA 1PX7A 4XTSA 2C0FA 3G7JA 4LA1A 4BWSA 2HZEA 2FHEA 2K8SA 1H75A 5D9VA 3CTFA 2H19A 5CNWA 2DJ1A 5H5RA 3TJGA 4YAPA 2RM5A 4ZILA 2DMLA 2H6YA 3EMXA 1YEPA 3GV1A 4KCAA 3KIJA 3TCOA 4F82A 4KSOA 1R5AA 3GKNA 3IRAA 1B9XC 4XS4A 2H6ZA 1ERWA 5DQSA 1M2AA 1ERUA 3TKPA 4WBJA 5D9XA 2E0QA 4NHZA 1JLVA 1U3AA 3L0HA 3RAZA 4AJ6A 3EU4A 4FYUA 3LXZA 2H1AA 2CX4A 1R26A 4D73B 3CSIA 1X0RA 3GSTA 1AW9A 4RI6A 1UA5A 3APSA 3FW2A 1GRXA 2Z9SA 4MPGA 5IMCA 4J2FA 1JZOA 2HXKA 1DSBA 4ZL8A 5IMVA 5IOWA 1VGLA 1JZDA 4HQZA 2VUPA 1EGRA 1FW1A 4ZB6A 1WIKA 3C1RA 4HI7A 3UVTA 4PQIA 3IXRA 1FB0A 2K18A 4POBA 4GSNA 4H86A 4PUAA 4L5OA 3G9BA 4MDCA 1EV4A 1BG5A 1FHEA 3F4RA 2WGRA 1F6MC 3C73A 2C0GA 2MMOA 4TXOA 3I9V2 1OC3A 4WETA 2CX3A 2H72A 3GUSA 5ID2B 5B8AA 4YAVA 4DSSB 2HNLA 3GKKA 5GAPD 1EP7A 1S3AA 2IIYA 4FYBA 2PVOC 1GH2A 1GLQA 3O6TA 4X0XA 3RHBA 1LJRA 3VPTA 1GULA 3LEFA 2HLSA 4L8EA 1K0CA 2YJ7A 3LXTA 2GZZA 4F9ZA 1E2YA 2IN3A 2CQ9A 1SKSB 5CAXA 5F05A 4EC0A 1ZGNA 2B5EA 2XPDA 1K0OA 4NPBA 2GSRA 1GSSA 4F2IA 1WMJA 2O87A 1CQGA 4KX4A 3GA4A 4ZB9A 3ZTLA 5DCGA 3GX0A 1XWAA 3N9JA 4AF2A 1SJZA 3H8QA 3H1NA 4K7OA 3M1GA 3GTUA 2OA7A 1GUKA 1T4YA 5DAKA 2ALBA 3GL5A 2YNXA 2JZTA 4L5LA 2IL3A 2GGTA 2WCIA 4WBRD 5HFIA 4HU7A 3GH9A 14GSA 1PN9A 4KDXA 5ECIB 2K6VA 1ZYEA 1AAZA 4G10A 4G19A 4IS0A 1JFUA 2EIOA 2VM2A 5IM9A 3P90A 4KH7A 3HJPA 5KN2A 3E0UA 1K0DA 3QCPA 5COHA 2L6CA 2H73A 4HOJA 5HFKA 4TRXA 5IPHA 4ZBBA 1J08A 4L0UA 3VI7A 2CZ3A 1SJIA 1BQ7A 3D6IA 2C80A 1FAAA 3DRNA 4YQMA 3F3QA 3TUEA 5H5SA 4KSMA 3KTLA 4GQCA 2I81A 2FWEA 2FCHA 2YZHA 2C3NA 6GSVA 2JACA 4PNFA 2V32A 1V58A 4LMWA 4XCSA 3H93A 2PN8A 1YJ6A 1A8YA 4ID0A 3QDNA 2VCXA 1O6JA 3HDCA 3LQ7A 5CRWA 3EC3A 1GLPA 4PXOA 2G2QA 1G7EA 3IDVA 2E2GA 2N5FA 4OCEA 3J7Yk 2HYXA 2HFDA 1K0BA 2O85A 3TKSA 1VF3A 3QAWA 1W89A 2H1GA 1TK8B 1SYRA 5C04A 5ID2A 2L6DA 4DSSA 3KGKA 3ERGA 3KXOA 4EUYA 5A4VA 3QFBC 4KUNA 2DBCA 5G5EA 4IHUA 1TI1A 5AIVA 2LUSA 3KP8A 3D21A 2OACA 1THOA 2C0EA 4HQSA 3D4TA 2DIYA 2VCVA 2CAIA 1IYIA 4LL4B 1A23A 3EU3A 3TRXA 4QL9A 3TRPA 3GFKA 4K7NA 3M0FA 2GSQA 1ILOA 9GSSA 1GTIA 3DMLA 2ES7A 1LU4A 3FEUA 1AQVA 4OCFA 1PSQA 4EO3A 4MZWA 4GF0A 5A4UA 1PL1A 3ERFA 2X8CA 3DD3A 2VOCA 2M46A 1AIUA 2GZYA 1FOVA 2NPBA 5IMZA 4MF6A 3HVXA 3P7XA 5F07A 2WRTA 2R4VA 2ZUPA 3ZFBA 1XOAA 3EE2A 3IE3A 4ZIJA 6GSXA 1V57A 5HR2A 4IJIA 1OVNA 1SKWB 3IAM2 5H5QA 3FHKA 5E59A 4K1FA 1AC1A 2X8HA 2FD3A 3PGTA 3WD6A 2LSTA 1X5CA 1GSQA 5J5NA 1BX9A 1YQ1A 4RQXA 2DSAA 2YP6A 2JADA 4AJ8A 6GSYA 1X9WB 3ZVJD 2IMIA 2H75A 3VWUA 1SKRB 5DALB 1XW9A 4TR0A 3Q6OA 3FYGA 1R7HA 1QXHA 4G9HA 1Z7PA 4KW6A 3VPQA 3APOA 4GLTA 5LNKe 4MPFA 4OMVA 2YV7A 3DGQA 3O76A 3ZMLA 1UVZA 4JBBA 4YH2A 4EKZA 4EVMA 3HXSA 1X5EA 5GSSA 3UBKA 1V98A 1Y25A 3FK8A 2FNOA 4KNDA 5G1KA 1XWGA 1M9AA 4E8HA 3ISOA 2BTOT 2CVBA 4MF7A 3GN3A 5CREA 2VL2C 5IPGA 1Q98A 3W8JA 3UIWA 5DQYA 1HD2A 1XWBA 1BYEA 4FH8A 3DVWA 2V6KA 1PA3A 2PPTA 1K3LA 4MA9A 4EL1A 1TI3A 4WF5A 5EPFA 1BAYA 1XWKA 1TW9A 2CVDA 3ZREA 5D73A 3DKSA 4KE3A 1PX6A 1B9YC 1XIYA 1G6YA 2PVQA 3HCZA 3EURA 4I2TA 5ECSA 2DMMA 5ENUA 5J3RA 5IMFA 1UC7A 1SL0B 1TRVA 3GL3A 3KP9A 2EIQA 3FY7A 4O5RA 5HR0A 4PGTA 2PUKC 3DXBA 1XW6A 1MDIA 2C8UA 1NW2A 5JWQB 5J9CA 2JL4A 4KDUA 4JRRA 4POLA 4IVFA 3HYPA 1GNEA 4FO5A 2I1UA 1ML6A 3E9JB 5ECNB 4MF5A 3HKRA 1UN2A 2ZCTA 3TKSE 3KJYA 1G6WA 4K2DA 3D0ZA 2B1KA 2B7KA 2KHPA 6GSUA 5J9BA 2AJQB 5CRHA 2MMAA 3TJKA 3LJRA 5G2ZA 3KMOA 4WEYA 2V2GA 4PNGA 2GVPA 4Q5FA 2VCWA 3FZAA 3UOMA 1GL8A 1EOGA 4G2EA 5DALA 1EEJA 3TJFA 1EP8A 1OKTA 3G7IA 1GUMA 4K7IA 1E6BA 2FY6A 5DJMA 4DEJA 1RK4A 3H4KA 3F6FA 3ZRDA 2MMNA 10GSA 1EV9A 4IN0A 4EF0A 1TRWA 4J57E 3L78A 1WRYA 4PUFC 1XCCA 3QAGA 2LRNA 2XC2A 2RM6A 1M7TA 3PINA 3GMFA 1QK8A 3GKXA 4HU9A 4FYCA 3BJ5A 5HR3A 2H0HA 2VLUA 3GH6A 3KTBA 4TR1A 1ERVA 1O8XA 3FR9A 2AV4A 4IELA 1T3BA 1XXUA 3U6VA 3UJ1A 2NBSA 2V1MA 4BVYA 1GSYA 1OC9A 4V1Ap 2YJHA 4TOPA 2VL3A 1Z7RA 1YF0A 1NSWA 3HVVA 3MWHA 1TTZA 1ZMAA 4V2MA 4MLYA 4TKYA 4TN8A 1TRUA 3DYRA 2B1LA 3BCKA 2L57A 1N8JA 2H74A 2QKEA 3IAS2 4K6XA 5ECQB 2HSYA 3HA9A 3VWXA 4MK3A 2LJRA 1Y6EA 5G30A 4MP4A 2WZ9A 2C1YA 3IV4A 4CDOA 1GTUA 2B3SA 3TRQA 3CSHA 1SK1A 3MNGA 3KCMA 1TXXA 3QPMA 1VF1A 1SYXA 4MJAA 1YDKA 5AN1A 4CW9A 2GT6A 1X5DA 11GSA 2GSSA 3M9KA 3KMNA 2FA4A 1W4VA 2E7PA 3N5OA 1YKAA 6GSWA 3QFAC 1HNAA 4O92A 5CP1A 2IWTA 3IHQA 1SD9A 5LD0A 2CA8A 2H8LA 4K0NA 3WT2A 1M2BA 3LFLA 2GS3A 1ZL9A 1T00A 1GNWA 2LTKA 2QSIA 4JZQA 5KN1A 2N5AA 4MZBA 1GSFA 1MTCA 5GSTA 1XZOA 1SL1B 1SENA 4MCUA 4QL7A 1RW1A 4ILFA 3P2AA 4ZXGA 2GQLA 3RDWA 3ME8A 2HE3A 4NWYA 3NIVA 3GRXA 5JWRB 2AB6A 2HZFA 2J23A 1Q4JA 5AIXA 4D73A 2JU5A 5KEJA 1I5GA 2OBKA 3VWVA 3SBCA 1PD21 3VFIA 1FB6A 1TP9A 4NXIA 1SL2B 8GSSA 1XFLA 4IKHA 2JSYA 3WT1A 4JR6A 1IYHA 2TRXA 2YPMA 3G7YA 3C8EA 1YKCA 2FWFA 3EWLA 4MH2A 2YOIA 1MDKA 1K0AA 2F3MA 4EDYA 3HZ4A 1AXDA 1SU9A 2X8GA 1FO5A 5F8BA 1X9MB 2M72A 2YV9A 1SK0A 3ZIJA 2F51A 1WWJA 4F0BA 4HS1A 4XS1A 5D96A 2X99A 1PKWA 3QAVA 1WOUA 1X9SB 2VL9A 4IGJA 4NHWA 3ZZXA 2H71A 3DIEA 1S3DA 3GSSA 4PQHA 1C72A 5FHIA 3Q19A 3A3TA 5JCWA 3UL3A 3MSZA 3S9FA 5CRDA 4KB3A 2MYGA 3LG6A 4GSSA 2O8VB 3ZITA 1NM3A 1GUHA 3TKSC 2YWNA 2A2RA 1TK0B 1SK2A 4OO4A 4I97A 1KNGA 2WB9A 3LWAA 1VF4A 4JR4A 3US3A 2VD0A 2DIZA 5D93A 2H30A 3TDGA 2C4JA 3VI5A 5AISA 2DJ3A 3UVHA 1XPVA 2OJLA 3LGCA 2CAQA 13GSA 3WGXA 2FUG2 2OADA 2LS5A 5J4UA 2PERA 3A5WA 3NOFA 2BMXA 4WF4A 1B4QA 2HRNA 5ECHB 5KN0A 1F2EA 1V9WA 1DE2A 1PGTA 1VRSD 2V41A 4ISDA 4LMVA 2EIRA 1OYJA 17GSA 4MJEA 5DCHA 2LNSA 3HY2A 3KH7A 2LKUA 4FIWA 3HVSA 1AQXA 1TDIA 5CO3A 1WJKA 4NV5A 1ZCPA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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