2L4CA

Solution structure of the b domain of human erp27
Total Genus 19
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
19
sequence length
116
structure length
116
Chain Sequence
EVEKSSDGPGAAQEPTWLTDVPAAMEFIAATEVAVIGFFQDLEIPAVPILHSMVQKFPGVSFGISTDSEVLTHYNITGNTICLFRLVDNEQLNLEDEDIESIDATKLSRFIEINSL
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
{{ tooltip.sname }} connected with {{ tooltip.tname }} : {{qFormat(tooltip.svalue) }}
molecule tags Peptide binding protein
source organism Homo sapiens
publication title Solution structure and dynamics of the b domain of human ERp27
rcsb
molecule keywords Endoplasmic reticulum resident protein 27
total genus 19
structure length 116
sequence length 116
ec nomenclature
pdb deposition date 2010-10-03
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.30.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich Glutaredoxin Glutaredoxin 2l4cA00
3FR6A 1X5EA 4HJ2A 4IQAA 5IMVA 1URMA 1SD9A 5FT3A 1PX6A 3EURA 2NBSA 5J4UA 1SKWB 4O92A 3QMXA 1SKSB 1OE8A 3TB2A 3RAZA 1EEMA 1WE0A 1T8EB 1WWJA 1GNEA 1SK0A 2H1GA 3ERWA 4ZIJA 3GKXA 2EIQA 3LYPA 2ZNMA 1A2MA 3KGKA 3IAS2 2L4QA 3HKRA 4PUAA 3A3TA 3L0HA 3ZTLA 2REMA 4MF7A 3CXGA 2N5BA 1AQXA 2HXKA 4KNDA 2H0HA 2NVLA 2FNOA 1A8LA 2WS2A 2TRXA 2OJLA 4NXIA 4N0ZA 5D73A 5B8BA 1EEJA 2F3MA 1J0FA 1OAZA 3MNGA 5LCZA 2IMEA 1Q98A 3UARA 3QOUA 1HQOA 2PGTA 1M7TA 7GSSA 1QK8A 2HZEA 2KUCA 2E0QA 3GRXA 3EYTA 2VM2A 1SK1A 4IGJA 1FVKA 4I6XA 3CMIA 5AIXA 3Q74A 3CYNA 1Z5YE 2CAIA 3KM6A 2H74A 5ECIB 1O7UA 3K8NA 4OO5A 4KSOA 5DJMA 3CTGA 2FY6A 4NHWA 4QQ7A 2JZRA 3VLNA 3AY8A 2YZHA 1PL2A 1SJIA 16GSA 1C72A 1KTEA 2DJ3A 4Z7XA 5ECMB 4MZBA 12GSA 2BMXA 5E4WA 3BOAA 3C7MA 1QQ2A 3ZIJA 1SL1B 2O7KA 4GSSA 5CAXA 5J41A 2F8AA 4E8EA 2HI7A 3ZMLA 1XWCA 3EWLA 5KN0A 2DJ1A 2H73A 3GIXA 2HZEB 3KMNA 3TKSA 3G9BA 2O87A 1JZOA 4IVFA 2LKUA 2R6KA 3E3EA 1JHBA 2GZPA 1VGLA 3IV4A 3Q18A 2C1YA 4WKWA 1XW6A 2H6XA 1TDIA 2GVPA 3LYKA 3HZ8A 4FO5A 2L5OA 3DD3A 4ACSA 2I3YA 6GSWA 4OD7A 3LFLA 3FW2A 1GRXA 19GSA 5AN1A 2M80A 2IWTA 2KHPA 1JFUA 4HU7A 1EV9A 2LS5A 4OCEA 2R3XA 1IYIA 1TW9A 1WRYA 3VPQA 5ABRA 3RDWA 5IMCA 4WR5A 3J7Yb 2H1AA 5KN1A 3C1SA 4V1Ap 4GXZA 2CX4A 3EU4A 3RHCA 1TRWA 4K8MA 1F2EA 5DCGA 1UN2A 2DIYA 5AGYA 1R4WA 2OE1A 4RQXA 2XBQA 3VWUA 4O7HA 4PX1A 3KMOA 5G31A 1SYXA 1YF0A 2NPBA 2YN1A 4JRRA 1AAZA 3VPTA 5J9CA 3F63A 1S3AA 2FCHA 4L0UA 4MPFA 3H8QA 4BA7A 1T4ZA 1NW2A 2M72A 5IO0A 3ZFBA 2V1MA 3F4RA 4PUFC 5F07A 2YJ7A 2PUKC 2GDRA 1EOGA 2F51A 2K18A 5DCHA 5ECKB 3WYWA 4MDCA 3QAGA 3IRAA 4KA0A 2PN8A 3QAVA 2LV3A 3DRNA 2I4AA 1XIYA 3UAPA 4FH8A 3TRPA 2B6MA 4JEDA 2LNTA 4WF5A 1GUHA 2R2JA 5G5FA 4ILFA 4CW9A 3EU3A 5E59A 4V2LA 1USBA 2C0EA 5CO3A 4OMVA 1SK2A 3OR5A 1GTIA 2IJYA 3NZNA 2PERA 4L5LA 1F3AA 1GUMA 3MDKA 1ZCPA 4MA9A 3W8SA 1MEKA 1XVWA 5H5SA 1GL8A 5ECOB 2EIRA 5CP1A 4BWQA 4JU5A 3ZIVA 1V40A 4I5QA 2JSYA 1A0FA 5HR3A 3LG6A 4YQVA 3TGZA 2JACA 5IOWA 1GP1A 1VRSD 1TK0B 1AQWA 2FD3A 2K6VA 3LWAA 4MMMA 1KNGA 2XBIA 3GSSA 2E2MA 4POKA 2VO4A 2ON7A 1U88A 3G7YA 3Q6OA 2IFQA 1GSQA 1TRVA 4PURA 1XPVA 4O32A 5FWGA 2LJRA 4PXOA 1SENA 2HSYA 1PN9A 3N5OA 1Z7RA 5CNWA 3FEUA 3KTBA 1M2DA 3I9V2 1Y25A 2MMNA 4IJ3A 1XCCA 2GQKA 1Z6NA 1DBYA 5C04A 11GSA 1JZWA 1TI3A 4O5RA 1HNAA 4I97A 4LLRA 3BBYA 4AJ6A 2FHEA 2O8VB 4L0WA 3LXTA 4EVMA 4OFTA 4GWRA 1GULA 4NHZA 4POBA 1WIKA 3RHBA 3W6GA 1BJXA 1K0CA 1OC3A 4ZBDA 1GTAA 4N10A 3U6VA 3TJFA 4IS0A 2IFQB 2LUSA 4J57E 2K8SA 3HHVA 4OO4A 4BVYA 5H5RA 2YNXA 3HVVA 8GSSA 2HRFA 1MDKA 5D9TA 1DSBA 1O73A 2OBKA 5GAND 1I5GA 1VF3A 1GUKA 4WF4A 2G0FA 2LQQA 4IQ1A 2VLVA 6GSUA 4NMUA 1SJZA 1SL0B 4MP4A 4Q5QA 4QL9A 4X1UA 5DBQA 1BYEA 6GSTA 4XS6A 3GTUA 3WGXA 3DYRA 3LORA 3D4TA 1OVNA 1EGRA 1MTCA 1YDKA 3GH9A 3H79A 3L9SA 4OWYA 1X9WB 2NTOA 4MJCA 2K8VA 3DKSA 5F0GA 3V1WA 4FYUA 3HCZA 5EY6A 1BX9A 3TKSE 1EWXA 3GV1A 5ECPB 4ZL8A 1GSYA 3IDVA 3C1RA 1FB0A 1V57A 3KJYA 1X9SB 3IPZA 3HDCA 1DE1A 2OBIA 2KLXA 3ZYWA 5JWQB 1T3BA 1M0UA 2V2GA 1TKDB 3I69A 3DMLA 4TXVA 4POLA 1R26A 1U3IA 4MF5A 4K1FA 3F9UA 3RBTA 1QUWA 4YH2A 3GX0A 2GQLA 4V2NA 3GTUB 4HJMA 2GSQA 1GH2A 4ZXGA 1G0TA 3TKRA 1KEBA 1B8XA 1WOUA 1R7HA 4IW9A 2EC4A 4MJEA 1TRUA 1O85A 2P0GA 2VD0A 2HLSA 3E9JB 4XS1A 6GSSA 1MDJA 3TJBA 1GSFA 2LJKA 3TJJA 4K7OA 3VWWA 2YWOA 3KH9A 4MZWA 1K0NA 5LD0A 2DJ0A 2B7KA 1N8JA 2TRCP 3O76A 3G7IA 1M9BA 3QAWA 1GNWA 5F06A 2GSTA 3FK8A 4KW6A 1G6WA 2GQMA 4ECCA 3RPNA 2AUVA 2BJXA 2C3QA 3BCIA 4OCFA 1SYRA 5B8AA 4GF0A 1SL2B 4EE0A 1YF1A 4K9ZA 5HFGA 2VL3A 2WFCA 1ST9A 2YWIA 3P90A 1YJ6A 2P31A 4MH3A 2C3NA 4HU9A 2HRNA 4DVCA 2XPDA 3US3A 5B6NA 5H5QA 1VF1A 3TDGA 4F0CA 3GMFA 2RIIA 3CSIA 4EKZA 2YWMA 3CRTA 3QFAC 3DIEA 4YAPA 4CDOA 4F0BA 4EC0A 2IL3A 1M99A 5HFIA 4QL7A 2L6DA 4WETA 2MMZA 4TW5A 4FYBA 3BCKA 4AJ8A 3QPMA 4CHSA 3KIJA 3HXSA 2NDOA 2R4VA 2GGTA 2VL2A 5J9BA 2V41A 1F9MA 1XWBA 2GT5A 3KZQA 3TOUA 2X99A 2H8LA 4EL1A 2KP2A 1CQGA 1K3OA 3KTLA 3D22A 5F05A 3L9UA 5CRDA 4TVEA 3UVTA 3IR4A 3NOFA 1GSSA 2B1LA 3VWVA 2LQOA 2DMMA 2MMOA 4POMA 2VUPA 2CAQA 1O6JA 4IHUA 4KDYA 4FIWA 5DALA 1PD21 1OKDA 5GSSA 5DDLA 4ML1A 2VOCA 2HFDA 3S9FA 5COHA 1GSDA 3EMXA 3TKPA 2C0FA 3DEXA 2LJAA 1XOAA 1O8WA 3D4MA 4HOJA 2FGXA 2VL9A 2QC7A 4V1Ag 3HVSA 4BVXA 1TK8B 1U3AA 3A2XA 3VWXA 3DVWA 5G1LA 3IOSA 2ZCTA 3GH6A 4TXOA 4DSSA 1QXHA 1FB6A 2J23A 3UJ1A 3ZFLA 2I81A 2C8UA 2HT9A 4JR4A 5D8IA 4ID0A 5GZZB 5ECQB 4PNFA 3IHQA 2JZSA 5DALB 4ULXA 1NHYA 2FUG2 4KGIA 3UVHA 3ME8A 5IPHA 3ZITA 1BG5A 2H75A 3IXRA 5ID2A 5ELGA 2X64A 3HJPA 4F2IA 3DXBA 3Q19A 1OC9A 3GA4A 2LRNA 3I6AA 1Y6EA 4BPYA 4AJ7A 5KEJA 3ZVJD 1LJRA 3A2VA 13GSA 2B1KA 1YY7A 1WPIA 3O3TA 2CVBA 2A2RA 2N5AA 2PPTA 2DJ2A 2LTKA 3EINA 1XVQA 1TI1A 10GSA 2DBCA 4TXOB 4DSSB 1RQMA 2AAWA 2GT6A 5ECHB 3GL3A 4ISDA 4K0NA 3ERGA 4WR4A 1J08A 4KX4A 2X8GA 3GFKA 2DJKA 3C73A 3CSJA 4L5OA 5IM9A 1Z7PA 2A2SA 3GNJA 1QMVA 2CZ2A 2FA4A 3QFBC 2C80A 1HYUA 5ID2B 5J5NA 4ZB8A 3BJ5A 2B3SA 1AC1A 2L5LA 2LEGA 1FW1A 1OC9B 4OFNA 2H72A 5DAKA 5JCGA 2O85A 5G1KA 3HA9A 1MD4A 2PMTA 1ERVA 3FZ4A 3PGTA 1XW5A 4F03A 2FWHA 5GAPD 4K7NA 2H0GA 4YQMA 4TRXA 2WDUA 2L4CA 1HD2A 2WRTA 4NV5A 2MBSA 4RI6A 1X0RA 1EP8A 1Z9HA 3GUSA 2KP1A 4HZ4A 3IAM2 5A5KA 2AJQB 3CSHA 3EVIA 2QGVA 1GLQA 5DQSA 2B5XA 5A4UA 3TKSC 2V6OA 3GN3A 1G7OA 4LL1B 5D93A 4ZBAA 5CREA 3UMAA 3GKMA 2H70A 5IQYA 4JZQA 4LA1A 2H1DA 3FKFA 2IMIA 4DSRA 2GZZA 4N30A 1IYHA 2JSZA 5DAKB 5B6MA 3F6DA 2H6ZA 3GURA 2KOKA 2AB6A 5HFKA 1ERUA 1T7PB 3MSZA 4ECBA 3HJOA 3HY2A 4MABA 5ECNB 3FHKA 4FYCA 5FHIA 1PSQA 1ZGNA 6GSXA 3IK9A 1M2AA 4KSMA 1AW9A 2G2QA 2VCWA 3GYKA 2DC5A 4TR4A 3FZ9A 1H75A 3TKQA 4WBRD 2RUFA 4RI7A 5ECSA 1I9DA 3P8WA 2IMDA 2YCDA 5ENUA 2FWEA 1PQNA 2VCQA 1EGOA 4G9HA 2H66A 2IMFA 1K0AA 4EDZA 2LSTA 3CRUA 1NHOA 3ZVJA 1U6TA 4MZCA 1K0OA 1TJDA 5IMAA 4DEJA 1NSWA 1UC7A 1GTBA 1FVJA 4GSNA 1TU8A 5KN2A 2OKAA 3WGEA 5JCWA 4ML6A 5HR1A 2GZYA 4PQHA 1TK5B 2VCXA 1G7EA 1ZOFA 4Q5FA 2ON5A 4IP6A 5J3RA 3ME7A 4KUNA 4YQUA 3WT2A 3I43A 1ILOA 1AIUA 2B5YA 2WB9A 4D73A 3GHAA 2P5RA 2GS3A 4ECIA 4XHMA 1N2AA 1M9AA 1PRXA 4G19A 2JU5A 14GSA 2F9SA 1DE2A 2LRCA 1K0BA 1PKZA 3APOA 3UEMA 1H4OA 1A2JA 1ACVA 4KH7A 3U5RE 1AUCA 3KP8A 3EMPA 2AHEA 3ZLPA 4EO3A 2DJJA 2C0GA 4KCEA 2LRTA 1WJKA 4K0GA 1XWKA 3HD5A 4TN8A 3KCMA 2E7PA 5DJLA 1SD8A 3BD2A 4K6XA 2L59A 2YP6A 1WP0A 4TR1A 2HE3A 3F3RA 1GSEA 3WT1A 1ZZYA 1XOBA 2PWJA 1S3CA 4HDEA 2HSHA 4HS1A 2H19A 4D73B 1B4QA 3D21A 2QSIA 2VIMA 1ABAA 3FRCA 4ZL7A 1SU9A 2PVOC 1TU7A 4I8BA 3KH7A 4HZ2A 4PGTA 1W4VA 4H86A 1ZMAA 5D9VA 3UBKA 2JZTA 1YZXA 2L57A 3F8UA 2LNSA 1XWAA 3ED3A 4KDUA 1QFNA 1ERWA 2K9FA 4X0XA 4RUVA 3EE2A 3UBLA 2VCTA 2FLSA 3HVXA 4PQIA 5A4VA 2TIRA 4OFMA 1OYJA 1MDIA 2VAFA 4TR1B 4TR3A 2C0DA 3ZREA 3WD6A 4XS4A 1F6MC 3PINA 3JCML 4XRDA 4LL4B 4XCSA 1T1VA 5DQYA 2YOIA 2OA7A 1UA5A 4V2MA 3MWHA 3DVXA 2N5FA 2H01A 4TR0A 5IMDA 1YKAA 5IOXA 3VURA 3LSZA 4KE3A 1XBSA 2RLIA 4P3YB 5C00A 4HQSA 2M46A 5EVOA 3KD0A 1LU4A 3D0ZA 1QGVA 3EC3A 2DLXA 5F8BA 5DVBA 4Q5RA 2FWFA 3FY7A 3RPPA 4KAEA 4ZBBA 3DWVA 2CT6A 3F4TA 1PA3A 4MPGA 5LNKe 2VLTA 1R5PA 5EPFA 4EF0A 4XS4B 2MYGA 3TJKA 4PQ1A 1YKCA 1NM3A 5B7CA 1BQ7A 4DSQA 1MD3A 4HEA2 1M2BA 5ELAA 3LGCA 1PX7A 2DMLA 4J2FA 5HR0A 3IE3A 1B4PA 1SKRB 3W8JA 2MZCA 2XPEA 2WJUA 3GSTA 4XIHA 4G10A 5IMFA 4KB3A 1O8XA 2OE0A 3M9JA 4IN0A 4RQRA 9GSSA 1A24A 2JADA 1PKWA 3ZZXA 2YZUA 2IPAA 3UOMA 1YEPA 4GQFA 4MK3A 1GLPA 3F4SA 4F9ZA 4EUYA 4ZB6A 1JLVA 4I2TA 3SWLA 1GWCA 1PMTA 3E0UA 1K3LA 4GQCA 3FR9A 3A2WA 2WZ9A 1O81A 1U87A 1GTUA 2RUEA 5JWRB 1Z6MA 5G2ZA 2PVQA 3GX8A 4I2UA 1JZRA 4IJIA 3TCOA 2H1BA 2YJHA 5ECRB 1W89A 5D96A 1B9XC 2WCIA 1BAYA 1EV4A 1OE7A 5A4WA 3GKNA 2C3TA 3KP9A 4KDXA 3UL3A 4TOPA 2Z9SA 5IIZA 1GSUA 5JCUA 1F37A 3TRXA 4F82A 1RW1A 1R5AA 4NAXA 4NWYA 2JL4A 2OE3A 3APSA 1E2YA 4JE1A 2AYTA 3IK7A 2BTOT 2VLUA 5HR2A 2DSAA 1EZKA 4HUAA 2H30A 4XRAA 1ZYQB 1K0DA 2J9HA 3CTFA 2B7JA 3DGQA 3APQA 3L9VA 1TTZA 1JLWA 5IMZA 2WGRA 5EL8A 2B5EA 2RM6A 4JR6A 1ML6A 4J56E 4K7IA 3H1NA 5G5EA 1S3DA 4WXTA 1XFLA 3FZ5A 1HNCA 2GSSA 2FA8A 2E2GA 1E6BA 3IBHA 5HQPA 1FO5A 2C4JA 4TKYA 4MJBA 1ON4A 2YV9A 2VL2C 2O89A 3QD9A 1OKTA 3VI7A 2GTUA 3GL5A 4NPBA 4GSTA 3J7Yk 4L8EA 2I9HA 3ZMKA 5IO2A 4AF2A 3MAKA 1J9BA 5KN3A 3G7JA 3KXOA 1K3YA 1PL1A 3WGDA 5JWOB 3LQ7A 4KCAA 3TUEA 3ERFA 1THXA 3F3QA 4EXJA 4ECJA 4NV2A 4HQZA 5IPGA 3NIVA 3LXZA 5D9WA 1HNBA 2L6CA 5CRHA 1X5DA 2RM5A 1EP7A 2CQ9A 1FAAA 3FYGA 2X8CA 1BEDA 1B48A 1XXUA 2PU9C 1CQHA 1K0MA 1FG4A 3IC4A 1AXDA 5ECLB 2I1UA 1XZOA 4IBPA 4MF6A 2OACA 4EDYA 2DIZA 1XW9A 2R37A 3SBCA 2R5GA 4GCIA 5INYA 3ZL5A 1FOVA 1ZL9A 4ZB9A 4MLYA 3VI5A 3C71A 1OC8A 4GRFA 2V32A 2A4VA 3H93A 3TJGA 1DUGA 2VM1A 5GSTA 6GSYA 3H4KA 2FWGA 1RK4A 1Z3EA 3N9JA 2D2ZA 1YEXA 2H0IA 3QDNA 2CX3A 2QKEA 4MJAA 3ISOA 3ZRDA 4K2DA 4YAVA 1XWGA 3M9KA 2ALBA 4E8HA 3PH9A 1X9MB 18GSA 1FHEA 3M0FA 2AV4A 2VD1A 1V9WA 3M8NA 4WEYA 3F0IA 1THOA 1Q4JA 2HNLA 2VCVA 3HZ4A 4PNGA 1A23A 1SJ6A 2V6KA 3M3MA 3R2QA 3UIWA 20GSA 2F8FA 1VF2A 2PBJA 3HYPA 2YV7A 2GSRA 2YWNA 2WULA 2MBTA 1AQVA 4X43A 4IP1A 1V98A 2ES7A 4Q5NA 1A2LA 1EOHA 3A5WA 4BL7A 4ZL9A 2IN3A 2X8HA 3CBUA 2CV4A 4N11A 3FR3A 1T4YA 3LJRA 1ERTA 4MH2A 2YANA 2H71A 2VCZA 5CRWA 3C8EA 17GSA 5D9XA 2HZFA 3VK9A 2CVKA 1LBKA 4HI7A 1VF4A 3TRQA 3QCPA 1ZYEA 4AGSA 1UVZA 4IELA 1V2AA 2MMAA 1YQ1A 2P5QA 4N0VA 5AIVA 3QR6A 2XHFA 4LMVA 1PGTA 2CVDA 3VFIA 3L4NA 3L78A 5CRGA 2CZ3A 3D5JA 3F6FA 3LEFA 4BWSA 5L71A 1TOFA 1WMJA 3IA1A 1A0RP 4WBJA 4IKHA 4XTSA 2IIYA 2GLRA 1V58A 1KBNA 2CA8A 3TOTA 2EIOA 2H76A 3D6IA 3PR8A 1G6YA 1T00A 3HJMA 2YPMA 4MCUA 4LMWA 4G2EA 1TRSA 2IMKA 3O6TA 1TXXA 2XC2A 4JBBA 2ZUPA 2OADA 1A8YA 3P2AA 6GSVA 3M1GA 3FZAA 3GKKA 1F3BA 4ZILA 3P7XA 22GSA 5CYYA 3KEBA 2H6YA 4GLTA 4GTUA 1JZDA 1X5CA 2HYXA 5G30A 5AISA 1B9YC 1TP9A
chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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