2H6ZA

Crystal structure of thioredoxin mutant e44d in hexagonal (p61) space group
Total Genus 30
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
30
sequence length
108
structure length
108
Chain Sequence
SDKIIHLTDDSFDTDVLKADGAILVDFWAEWCGPCKMIAPILDDIADEYQGKLTVAKLNIDQNPGTAPKYGIRGIPTLLLFKNGEVAATKVGALSKGQLKEFLDANLA
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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publication title A stability pattern of protein hydrophobic mutations that reflects evolutionary structural optimization.
pubmed doi rcsb
molecule keywords Thioredoxin
molecule tags Electron transport
source organism Escherichia coli
total genus 30
structure length 108
sequence length 108
chains with identical sequence B
ec nomenclature
pdb deposition date 2006-06-01

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00085 Thioredoxin Thioredoxin
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.30.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich Glutaredoxin Glutaredoxin 2h6zA00
4Q5FA 4V1Ap 3I6AA 1FHEA 1MEKA 1QQ2A 3HJPA 5EVOA 1SL0B 3O6TA 1KNGA 4HI7A 4DSSA 5F07A 4ZB6A 4EE0A 5E4WA 4K7OA 4F9ZA 4ZB8A 3UEMA 2F3MA 3QAGA 2PPTA 1URMA 1EOGA 1GSUA 3ERFA 4PGTA 4RQRA 2EIOA 4O5RA 3GA4A 1ZZYA 3TRQA 1EGRA 2TIRA 2R4VA 3HZ4A 2B5XA 1Z7PA 4K8MA 3FK8A 5INYA 3KMOA 3CSJA 2LRNA 3KEBA 3KZQA 3GTUA 1V2AA 4NMUA 2VCVA 4HU9A 3L9UA 3ME8A 1XWCA 4ZL8A 3NZNA 5DJLA 2KP2A 4I2TA 2H70A 2F8AA 1GSSA 3CRTA 3TKQA 3P7XA 2XBQA 3H93A 1FW1A 2OBKA 1FG4A 3CSIA 1K3LA 3G7YA 6GSYA 2V6KA 3M1GA 1GUMA 1OKDA 3C1RA 2CT6A 3GKMA 4WEYA 1IYHA 1F6MC 1YY7A 3ZZXA 3GKNA 4IJ3A 5AN1A 2FY6A 3IDVA 1QK8A 5ECPB 2IPAA 3FEUA 2C0EA 1M2DA 4EDZA 1XCCA 2VLUA 3F63A 1T7PB 2C0GA 4K0NA 1ZYQB 2JZRA 3GH6A 2OA7A 3GL5A 4HUAA 2LJAA 3LYKA 4KA0A 3QPMA 1QFNA 3EWLA 1SK1A 5CRGA 2NPBA 2MMZA 4MA9A 1V98A 3EVIA 5LCZA 2E0QA 1K0BA 5C04A 4DSQA 4KUNA 2H30A 3L9VA 4HJMA 1FOVA 4K7NA 2H73A 1ZYEA 2DJJA 2H1AA 1AIUA 3D0ZA 2NDOA 2LNTA 4JBBA 5D9VA 3IK9A 3WT2A 5J3RA 2L4QA 3CTFA 3EYTA 3UOMA 1GWCA 2YWIA 1GSDA 2CVDA 4MZBA 2YNXA 4IHUA 3IPZA 2EC4A 2RLIA 4IQ1A 3H8QA 1A8YA 1T00A 1DUGA 2H0GA 1TTZA 2CAIA 4ECBA 4J57E 1XWAA 4KSOA 2IMDA 4JR6A 3M9KA 4GQCA 3KMNA 2B7JA 1Z3EA 1T3BA 2GSRA 3KTBA 2DJ0A 4G9HA 2DBCA 4JU5A 4KDXA 2LRTA 1ERTA 3IAM2 4ML6A 1OE8A 3IA1A 2HRFA 2P31A 2H1GA 4JE1A 4PUFC 1RQMA 2VLVA 5KEJA 4ZBAA 2L5OA 1X9SB 3WGEA 5DJMA 2DMLA 4LLRA 4O7HA 1BEDA 2OE1A 5ECSA 2CAQA 3DMLA 1U88A 3LORA 5J9CA 2L6CA 2J9HA 4PX1A 1V9WA 3NOFA 3ME7A 3H1NA 1QXHA 4OCFA 2HSHA 3LG6A 3UMAA 2LQOA 2RM6A 4IN0A 2N5FA 5DQSA 3UL3A 1FVJA 5JCUA 1YKCA 3KM6A 1AQWA 4POBA 1ACVA 1QUWA 1T4ZA 2NTOA 4FO5A 2BMXA 3C7MA 5F8BA 2CVKA 3TJJA 4N0ZA 1SL2B 4Z7XA 4NXIA 1GSEA 3UBLA 1OC9B 1HD2A 5ECLB 1U3IA 1TDIA 3C1SA 1XVWA 2O8VB 1ON4A 1BYEA 4JRRA 1PA3A 1ML6A 2MBSA 3CTGA 1XWGA 3LXTA 1XW9A 1MD3A 2LV3A 4L8EA 4PXOA 3L78A 4TVEA 2V32A 4GTUA 1THOA 3APOA 5DAKB 2H66A 4YQVA 5H5SA 1BG5A 1NSWA 1A0FA 13GSA 1GNWA 4Q5RA 1JFUA 1EZKA 4KAEA 1ABAA 5DALB 5ECQB 2HXKA 1K3YA 1MDKA 4CDOA 1TKDB 4TR0A 5IMCA 4K1FA 1JZRA 5J4UA 1GUKA 11GSA 1PX6A 3W6GA 3DYRA 2H6YA 1E2YA 2AUVA 1SJ6A 2M46A 3HKRA 5ID2B 2VL2C 2JSZA 1GP1A 4RUVA 1GNEA 3FHKA 3A2XA 2GVPA 4X1UA 1B9XC 3A2VA 5ECHB 4ZXGA 4HZ4A 5ECOB 4HU7A 1GTAA 4PQHA 2PN8A 1O85A 5G1KA 2B1KA 3F0IA 1TRWA 2IFQA 1EGOA 4KX4A 1BAYA 3HXSA 5JCGA 1EOHA 4TXOB 3TJBA 4IKHA 4KCEA 3FR3A 5FHIA 2DJ1A 3MDKA 5HR3A 3GIXA 3F3RA 1GSYA 3LGCA 3TJGA 2VCQA 4I2UA 4CHSA 4OWYA 1V58A 6GSUA 2LKUA 2MMOA 4GSTA 2DJ3A 3M3MA 3J7Yk 3L4NA 2YPMA 3W8SA 1AW9A 6GSWA 2ON5A 4IQAA 3APSA 4PUAA 1UA5A 4FYCA 3G7IA 1TRVA 4FIWA 2X8HA 1PN9A 2JADA 4ECIA 2J23A 2RUEA 3EMXA 2HFDA 1GLQA 2DJKA 2IMKA 2GT5A 4ISDA 2FUG2 3FZAA 1SJIA 1JZOA 5CYYA 2RIIA 1M99A 1F3BA 5B6MA 1O8WA 3HY2A 3OR5A 1THXA 5IMVA 2JL4A 4MPFA 3TRXA 3K8NA 1EV9A 4WETA 2E7PA 4XRDA 1GL8A 4F0BA 2P5RA 1FVKA 4V2LA 5ECRB 3ZVJA 2H6ZA 1YEXA 1PMTA 3ZVJD 3FKFA 4POLA 2FNOA 1M9BA 1M2BA 4TR1A 5AIXA 2O85A 1G7EA 4QL9A 2HZEB 2JSYA 4BWSA 4BA7A 5DCGA 4GQFA 5J9BA 1KEBA 1ZL9A 2CX4A 2IL3A 3FRCA 3KJYA 3PR8A 1CQHA 4XS6A 2V6OA 5ECNB 2GSQA 2YP6A 3PH9A 1F2EA 3FR9A 4EXJA 1WPIA 1W4VA 3CRUA 1OAZA 1YKAA 5IPHA 1K0CA 1TJDA 1OKTA 3VLNA 3UBKA 2V1MA 4JR4A 1J0FA 3ERWA 3GHAA 4GXZA 1XIYA 2VL2A 1B48A 2GT6A 3UJ1A 4HS1A 3GYKA 1K0AA 1G7OA 2X8CA 4L5LA 2B5EA 1C72A 1R7HA 1TK0B 5DDLA 3KTLA 4XRAA 1EEJA 4N30A 8GSSA 1WOUA 4P3YB 1Z7RA 4G2EA 3GUSA 1R26A 3D6IA 4MDCA 1JLVA 3C71A 1HQOA 5IIZA 3HJOA 3KP8A 4KB3A 1Z5YE 2HT9A 4XS1A 5G30A 3HYPA 2V2GA 1JHBA 3UVHA 1B8XA 4KE3A 4EVMA 3KCMA 2QC7A 2OJLA 2JZTA 3HA9A 2O87A 3FR6A 1VRSD 2CA8A 4F0CA 5LNKe 2YJ7A 2XPDA 4PQ1A 3V1WA 4YQUA 2M80A 2C0DA 2YV9A 1FO5A 4H86A 1A2JA 3DD3A 4IVFA 2PERA 4TRXA 3P2AA 1G0TA 1X5EA 4MJEA 1U6TA 4IP6A 3QDNA 2PU9C 1O6JA 2MMAA 4DSRA 2PMTA 2O89A 1S3CA 5CP1A 3MSZA 4WR4A 4EUYA 3FYGA 2IJYA 1TI3A 4NHWA 4O32A 5CRWA 1PQNA 1QGVA 2P0GA 3F8UA 3N5OA 3QAWA 1PX7A 1N8JA 1WE0A 1PL2A 2H1BA 3IXRA 4GF0A 2VOCA 3JCML 2VAFA 5B8BA 2H8LA 3M0FA 4MABA 4E8EA 5J5NA 1TK5B 6GSVA 5HFKA 2KOKA 3DWVA 4LL4B 5D96A 2LJRA 1J9BA 1ILOA 2FWEA 1ZMAA 2VM1A 1F37A 1USBA 2M72A 5IOXA 4LA1A 2REMA 4HOJA 4IS0A 1TRUA 4IBPA 2ALBA 2X64A 1M7TA 1J08A 1BJXA 1JLWA 3VURA 2B7KA 2FLSA 3RPNA 2H75A 22GSA 5EY6A 1Z9HA 1Z6NA 3WD6A 6GSSA 4YQMA 4IJIA 3VPTA 1VF1A 4IGJA 4MH3A 4ID0A 1VF2A 3F4TA 4I97A 4WR5A 5LD0A 3UAPA 1A24A 4ACSA 5G2ZA 4K9ZA 3RAZA 1YEPA 2CVBA 2AYTA 2N5BA 2YANA 2OE0A 1OVNA 4CW9A 3IV4A 4RI7A 3HVSA 3DXBA 1A0RP 5ENUA 3HJMA 4QL7A 2D2ZA 4FYBA 3TOUA 3H79A 4TOPA 3A3TA 7GSSA 4E8HA 4PURA 2L4CA 4HQSA 2GS3A 1O81A 2GSTA 1NHOA 1TW9A 2PVOC 3LFLA 4F2IA 1Q4JA 2HLSA 1WJKA 2ES7A 2B3SA 5COHA 4OD7A 1WIKA 1AQXA 1TU8A 1CQGA 2CX3A 5B8AA 4OMVA 3E0UA 1XPVA 5H5RA 2XBIA 3TDGA 2L57A 3US3A 4Q5QA 4MK3A 2FWHA 1B9YC 2FD3A 1YDKA 1LU4A 5HFGA 4EL1A 3QMXA 1FB0A 2H1DA 3GKXA 3DVWA 5HR2A 4KDYA 1TP9A 3D21A 1I9DA 2I81A 1X0RA 2KUCA 6GSXA 2LEGA 6GSTA 3GRXA 3MNGA 1N2AA 4TKYA 3GSSA 4HZ2A 3CXGA 1SKWB 4MPGA 2R6KA 4V2MA 1XZOA 2AAWA 2VL9A 3ZREA 2HRNA 5G1LA 4F82A 4DEJA 5D9TA 4WBRD 5D73A 1TOFA 4MH2A 1MDIA 1E6BA 2DJ2A 5AGYA 2FA4A 5GZZB 2JACA 3F4SA 4PNFA 4TR4A 5ELGA 4K6XA 3LJRA 3EINA 2LS5A 3W8JA 3R2QA 3CMIA 4XTSA 2I9HA 4LMWA 1SD8A 3ZIJA 3LWAA 2DIYA 18GSA 5FT3A 3GURA 5G5EA 2H72A 4LMVA 4RI6A 4MF5A 3ZFLA 1QMVA 3LSZA 3I69A 2K8VA 2H19A 4XS4B 4KNDA 1SU9A 1OYJA 2GLRA 3ISOA 3HHVA 3SWLA 2E2GA 3N9JA 3D5JA 1BQ7A 3HVXA 3MWHA 4TR3A 1XWKA 2FWGA 4GCIA 5D9WA 5HR0A 1U3AA 2H0IA 1I5GA 4L0WA 3RHBA 2FHEA 3IC4A 3GNJA 1PKWA 10GSA 3PINA 2RM5A 4NPBA 2OACA 3KP9A 1TI1A 5EPFA 5CNWA 1S3AA 3VFIA 2H0HA 3TKSE 4MCUA 12GSA 3FZ9A 1GSQA 3S9FA 2BTOT 1NM3A 1OC9A 2P5QA 2C4JA 3C73A 1ERWA 3VK9A 3TKRA 4GLTA 4HJ2A 4EO3A 3J7Yb 1WRYA 1YQ1A 3QD9A 4O92A 2FGXA 4D73B 2LRCA 1M9AA 1B4QA 1K0OA 3F3QA 5DAKA 3TJFA 2AJQB 2LNSA 5CRDA 1F9MA 3LEFA 4OO5A 2A2SA 3TJKA 4DSSB 1K0DA 2VD0A 3IE3A 2DC5A 2KP1A 4ECCA 1XXUA 4Q5NA 4YAVA 3F6FA 1XBSA 4GSNA 3IBHA 3KH7A 1ZGNA 2C80A 4GRFA 5DALA 1YJ6A 3UIWA 1HNAA 4QQ7A 2OKAA 2F51A 3GV1A 2AHEA 2CV4A 2A4VA 3G7JA 5DBQA 3KD0A 2B5YA 3TOTA 5ECMB 3A2WA 4JEDA 2WULA 4MLYA 2GQKA 2H71A 1MDJA 1FAAA 1Z6MA 3QFAC 3Q74A 1RK4A 1GTIA 2WFCA 5ID2A 2IMFA 5D93A 4K0GA 2WS2A 4AJ7A 4BPYA 2I4AA 4EKZA 1T1VA 3PGTA 3CBUA 5D8IA 3GTUB 3A5WA 3ZLPA 1PSQA 4AJ6A 3BCKA 1UVZA 3RDWA 4NHZA 2PWJA 4EF0A 2K18A 1T4YA 2F9SA 2E2MA 1PD21 2GGTA 3EE2A 3TGZA 4TXOA 4L5OA 1EWXA 5JWOB 1OE7A 4ML1A 3IAS2 3DKSA 1X9WB 4K7IA 3L9SA 5DQYA 1WWJA 2YZHA 3U6VA 3GMFA 4MJBA 4AF2A 2DSAA 2FWFA 1U87A 1JZDA 3C8EA 2YJHA 1O8XA 3H4KA 1GLPA 2LJKA 3RBTA 2YV7A 1RW1A 4ZB9A 1YF1A 2WCIA 4F03A 3EC3A 1SK0A 2VL3A 3KH9A 3VWUA 1Y25A 3SBCA 1EEMA 2FCHA 4ZL9A 5KN3A 2IN3A 3EU4A 1XOAA 2YWNA 2Z9SA 1XVQA 1MTCA 4IW9A 4V2NA 2WZ9A 2TRCP 4OFNA 3EU3A 1A8LA 2V41A 4XHMA 2OE3A 4I5QA 5IMFA 1G6YA 5AISA 4DVCA 2IMEA 2AB6A 1Q98A 1X5CA 4FH8A 3LQ7A 3AY8A 5IQYA 3VI7A 2LQQA 2R37A 4PNGA 5ECIB 4KDUA 4ILFA 3WGXA 3MAKA 1LJRA 3TUEA 1HYUA 3FY7A 1FB6A 1X9MB 2HZEA 3HCZA 3QR6A 1SENA 2L6DA 4G19A 2I3YA 1S3DA 5GAPD 3BD2A 2VD1A 2GZPA 2H74A 4MJAA 4NWYA 1OC8A 1V40A 1K0MA 1XW6A 5HFIA 3WT1A 3CYNA 3UARA 3FW2A 4POKA 2B6MA 1GSFA 2DLXA 1K0NA 4TN8A 4XCSA 1R5PA 3I9V2 4OFMA 5A4WA 1T8EB 2LSTA 2G2QA 1AXDA 3ED3A 2C8UA 3TKSC 3TB2A 2YOIA 1AUCA 2K8SA 2HYXA 3QOUA 5JWQB 3VWXA 3QCPA 3APQA 3ZYWA 2R5GA 1DBYA 1JZWA 1XOBA 2C1YA 3ZIVA 2C0FA 2WDUA 4BVYA 2IIYA 3IR4A 5G5FA 4ECJA 3F4RA 1A23A 2GDRA 1A2LA 4PQIA 3KXOA 1GUHA 1ZOFA 3D4TA 1VGLA 2DMMA 4MZWA 1XW5A 4NAXA 1H4OA 3GFKA 3CSHA 3HD5A 5L71A 1NW2A 5A4UA 1ERUA 4KGIA 2O7KA 1XWBA 1YF0A 3HDCA 1VF3A 3GX8A 1SYRA 5A5KA 2VCTA 1M0UA 3U5RE 3VWWA 2MBTA 2I1UA 1H75A 4NV2A 1SKSB 4ZBDA 1VF4A 3IRAA 3HZ8A 1AAZA 2DIZA 4HEA2 2R2JA 3I43A 2K6VA 5F06A 2L59A 4BL7A 3DRNA 1TXXA 2WGRA 3GL3A 5GSTA 5G31A 3L0HA 3BCIA 4KW6A 2X8GA 2XPEA 4HDEA 3LYPA 1TK8B 3M8NA 5CREA 2G0FA 5EL8A 5IO0A 4MJCA 5C00A 2ZCTA 4ULXA 2B1LA 19GSA 1GH2A 4WBJA 3WGDA 2ZNMA 4EC0A 3D4MA 4MMMA 2PBJA 4OCEA 1AC1A 1TRSA 4X43A 4ZL7A 3UVTA 1SD9A 9GSSA 3RPPA 2JU5A 5IO2A 2PVQA 3BJ5A 4JZQA 1PKZA 5GAND 4N0VA 5KN1A 2H01A 2WJUA 1IYIA 5IM9A 1X5DA 3GSTA 4KH7A 2QSIA 5CO3A 3ZL5A 1M2AA 1XFLA 1GULA 2KLXA 1OC3A 1B4PA 1EP7A 5IMAA 1PL1A 2VLTA 3Q19A 3F9UA 2IFQB 1R4WA 2X99A 4OO4A 1Y6EA 2CZ2A 4ZBBA 1GRXA 1TU7A 3P90A 2ZUPA 1YZXA 4POMA 2WB9A 2LUSA 4BWQA 5DVBA 4BVXA 4TW5A 3DEXA 5CAXA 2JZSA 1DE2A 4OFTA 4IELA 1WP0A 2YN1A 5ABRA 1PGTA 1WMJA 5CRHA 1SK2A 4KSMA 5J41A 3Q6OA 1G6WA 1R5AA 3BBYA 1SL1B 2HE3A 1KBNA 1V57A 4WXTA 4I6XA 3TKSA 3E3EA 5KN2A 3P8WA 2WRTA 2GSSA 5ECKB 3ZTLA 17GSA 1NHYA 3O3TA 3LXZA 2NBSA 2MZCA 3M9JA 2YWMA 4MF6A 1SKRB 3FZ4A 1GTBA 3F6DA 3VWVA 20GSA 3EURA 5JWRB 2FA8A 2YCDA 16GSA 2R3XA 2VCXA 5IMDA 3ZFBA 3G9BA 2MYGA 2L5LA 1K3OA 2N5AA 4AJ8A 1GTUA 4HQZA 4N11A 3ERGA 5IMZA 3GN3A 1O73A 2VO4A 3VI5A 4LL1B 3O76A 4TXVA 3TRPA 2OADA 1DE1A 4RQXA 2PGTA 3TKPA 1DSBA 2C3NA 4L0UA 3KGKA 2HI7A 5F05A 2VM2A 1BX9A 4MP4A 4AGSA 5HQPA 4WKWA 1W89A 3IOSA 4X0XA 5D9XA 2YZUA 2RUFA 2H6XA 4GWRA 4V1Ag 4FYUA 2VCWA 2XC2A 2GQLA 2ON7A 2IWTA 2BJXA 3D22A 1ZCPA 4IP1A 2YWOA 3RHCA 4J2FA 1EV4A 2KHPA 4ZILA 5ELAA 3ZMKA 4KCAA 2A2RA 4ZIJA 2QKEA 4TR1B 5F0GA 1ERVA 2VCZA 1KTEA 5B6NA 5IOWA 2IMIA 2HSYA 4XIHA 2C3QA 1SJZA 3IHQA 1PRXA 3Q18A 5FWGA 4YAPA 2AV4A 2CQ9A 2C3TA 1ST9A 3DGQA 4I8BA 4MF7A 2EIQA 4G10A 5H5QA 5A4VA 1SYXA 2TRXA 2H76A 3TCOA 5JCWA 2LTKA 2F8FA 2VIMA 1HNCA 4XS4A 5GSSA 3VPQA 2GZZA 3NIVA 4WF5A 5B7CA 3BOAA 1MD4A 3E9JB 3WYWA 4J56E 3QAVA 3GX0A 1UN2A 4NV5A 2EIRA 2MMNA 3DVXA 1LBKA 5AIVA 1A2MA 4GSSA 5DCHA 14GSA 1UC7A 3ZITA 3GH9A 3DIEA 3ZRDA 3GKKA 3QFBC 4N10A 1F3AA 3KIJA 4WF4A 2GQMA 2HNLA 5HR1A 1EP8A 2K9FA 2XHFA 1O7UA 2VUPA 1HNBA 4YH2A 2CZ3A 3EMPA 4EDYA 2HZFA 2OBIA 2PUKC 3ZMLA 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chains in the Genus database with same CATH superfamily
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chains in the Genus database with same CATH homology

  
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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