1A8LA

Protein disulfide oxidoreductase from archaeon pyrococcus furiosus
Total Genus 83
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
83
sequence length
226
structure length
226
Chain Sequence
MGLISDADKKVIKEEFFSKMVNPVKLIVFVRKDHCQYCDQLKQLVQELSELTDKLSYEIVDFDTPEGKELAKRYRIDRAPATTITQDGKDFGVRYFGLPAGHEFAAFLEDIVDVSREETNLMDETKQAIRNIDQDVRILVFVTPTCPYCPLAVRMAHKFAIENTKAGKGKILGDMVEAIEYPEWADQYNVMAVPKIVIQVNGEDRVEFEGAYPEKMFLEKLLSALS
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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publication title A protein disulfide oxidoreductase from the archaeon Pyrococcus furiosus contains two thioredoxin fold units.
pubmed doi rcsb
molecule tags Oxidoreductase
source organism Pyrococcus furiosus
molecule keywords PROTEIN DISULFIDE OXIDOREDUCTASE
total genus 83
structure length 226
sequence length 226
ec nomenclature
pdb deposition date 1998-03-26

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF13192 Thioredoxin_3 Thioredoxin domain
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.30.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich Glutaredoxin Glutaredoxin 1a8lA01
3.40.30.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich Glutaredoxin Glutaredoxin 1a8lA02
19GSA 3ZZXA 1DBYA 2VL2C 2YWIA 3EWLA 5J5NA 2BMXA 2P5RA 1F6MC 1RW1A 1M9AA 1Z5YE 4QL7A 5JCUA 1MD4A 1WOUA 2GVPA 3H4KA 2VD1A 4EO3A 4LL1B 2HE3A 5IIZA 6GSWA 4ID0A 3RHBA 2JZTA 1GLQA 2OE3A 3A2XA 1LJRA 2TIRA 3H93A 4EE0A 1OE7A 5GAND 3WT2A 4K6XA 2VCXA 2X8GA 2C0GA 3J7Yb 1G7OA 4EVMA 2LQOA 1BJXA 4HEA2 4YAPA 3D21A 3P8WA 3GH9A 2YV9A 2ALBA 1YZXA 2R3XA 4TW5A 1U6TA 2CX3A 5JWRB 4AJ8A 4MK3A 3DVXA 2LSTA 2YWNA 5F06A 4RI7A 4MF7A 1EGRA 1OE8A 3TRPA 1SKWB 4HS1A 1YEPA 1BYEA 3GL5A 5CP1A 5HR3A 4WETA 4MCUA 4WF5A 3QOUA 3I43A 1ABAA 1PRXA 1E2YA 2BTOT 4BVYA 4FYCA 1QMVA 3HCZA 5IM9A 3W6GA 4MJEA 4L0UA 4PNFA 4HQSA 4ML6A 5CAXA 4BL7A 3P2AA 4YQUA 2LUSA 2NVLA 1X5EA 2F8AA 1I9DA 2WDUA 3FY7A 1O81A 1M0UA 1JZRA 2NBSA 4NWYA 3F0IA 5DVBA 4OFMA 4F03A 1EZKA 1F37A 1TXXA 3DWVA 1TOFA 4HDEA 3IHQA 3QFAC 1FHEA 1FVKA 4OMVA 1QK8A 2OKAA 1K3OA 2AUVA 2CZ2A 2MYGA 2PPTA 4L0WA 2IFQB 5IQYA 4ZBDA 4HI7A 2GLRA 2QC7A 2TRCP 2V1MA 2IPAA 3EVIA 4OFTA 2M80A 4ECCA 2V6KA 4OO5A 1Q98A 4JBBA 4K7IA 1K3YA 3VWUA 3A2WA 1B9YC 2PWJA 2WULA 5G30A 3TOTA 5H5SA 2LRNA 4ZB9A 3UVTA 5CYYA 1DE2A 4I6XA 1MD3A 1VF1A 1UA5A 6GSYA 3QFBC 5AIVA 5G5EA 3F6DA 2JACA 3QR6A 4KB3A 3GX0A 4I2UA 1MDJA 2XBQA 3EU3A 5IPHA 1EP8A 1KNGA 2KHPA 2V32A 2GT5A 2DJJA 5AN1A 1SD8A 20GSA 1J0FA 4EUYA 1SJ6A 2H0HA 1Z6NA 1NW2A 2IFQA 1VF3A 2GT6A 2AJQB 3VK9A 3TRQA 3N5OA 2ES7A 1HD2A 2B6MA 4GQFA 3WD6A 1SKSB 3A2VA 4PQHA 1U87A 3M3MA 3IC4A 3CSJA 1G0TA 3QMXA 3VURA 4I97A 3HVXA 2KOKA 3TKSA 3HDCA 1SD9A 4XS4B 3CTFA 2YWMA 4FYUA 2E2MA 4LMVA 2HT9A 5IMFA 4K7NA 1AQXA 3TJFA 4KNDA 1K0OA 1YKAA 1XBSA 1FB6A 3HHVA 1TK0B 4WEYA 1Z7RA 3ZVJD 3IE3A 1FW1A 3GTUB 5D96A 2VAFA 3HYPA 4KAEA 1CQGA 2FWEA 5G2ZA 5H5QA 3G7IA 2H73A 2DIYA 2P5QA 5DDLA 4K7OA 2HSYA 2YANA 4F82A 1XW9A 4AGSA 2L6DA 4CHSA 5L71A 3ERFA 1O6JA 3FHKA 4V2NA 2JZRA 4V1Ap 3WT1A 3L9VA 5A4VA 2L57A 3WGEA 2VO4A 4MP4A 2V6OA 3DEXA 4IQAA 3WGXA 3F4SA 2C1YA 4IQ1A 4YAVA 5JWQB 1XW6A 5ECSA 4JU5A 1GP1A 1XWAA 3SWLA 4XS4A 2B3SA 1WIKA 2PVQA 2K8SA 1XZOA 5D9VA 4IW9A 3TKSC 2GQKA 2C0EA 1PMTA 1T4YA 1NSWA 2J23A 4DSRA 4JZQA 2X99A 2DSAA 2H75A 3GTUA 3M0FA 1JZWA 5KEJA 1QFNA 2FNOA 2R6KA 4OWYA 1X9SB 2H01A 3HKRA 3HY2A 2HYXA 3KXOA 4EDYA 5ELAA 1FVJA 4G2EA 5B6NA 1EEMA 3KMNA 3GKXA 1OYJA 4PQIA 5IPGA 1K0DA 1EP7A 2K9FA 6GSXA 4XRAA 3U6VA 5GSSA 2HNLA 2H1GA 4X1UA 2H8LA 3BOAA 4EXJA 3TCOA 1PL2A 3M9JA 4BWSA 2B7JA 2I81A 3FYGA 2L5LA 3KH7A 4NXIA 3HXSA 1XXUA 1FB0A 1ERVA 1ZGNA 3RAZA 2VM1A 2H0GA 1THXA 2FA4A 2VCTA 5ECIB 4ZL9A 3P90A 1PGTA 2A2RA 3VWVA 3QAVA 2IWTA 3NOFA 1B9XC 3GYKA 4OFNA 2VOCA 2B5YA 3APQA 4TOPA 13GSA 2DMLA 3WGDA 5G5FA 2VL3A 2KUCA 4JEDA 4TRXA 5JCWA 2CVDA 2FWGA 1PKZA 2OJLA 5FT3A 3UBLA 4KX4A 4ECIA 2X64A 4MH3A 17GSA 4GRFA 3O3TA 3WYWA 2IIYA 6GSUA 1JLVA 3GHAA 2HZEB 3FR9A 4JRRA 2LJAA 3DRNA 3DXBA 1PSQA 3HVVA 4PQ1A 6GSTA 5DQYA 4G9HA 5D9TA 2WB9A 2PVOC 2LJKA 3TJGA 4ZB6A 1SL2B 18GSA 3TJJA 2PMTA 3GURA 1T00A 1GTIA 3QAWA 1XWCA 4GF0A 3UIWA 3LORA 2H1BA 1TK8B 4FO5A 1A8LA 2AYTA 3VI7A 3KEBA 3A3TA 5D93A 3ED3A 3F6FA 5H5RA 4O7HA 1AC1A 3VLNA 4WR5A 1SYXA 4BWQA 2P0GA 2VUPA 4TR3A 5B8AA 2MMNA 4P3YB 3IOSA 4ISDA 4HZ2A 1A2JA 3L9UA 4MMMA 1A8YA 2YWOA 3BBYA 3ERGA 1Z6MA 3UEMA 1LU4A 2VIMA 3RBTA 1TJDA 1ON4A 2C3NA 2VCQA 16GSA 1XWBA 2RLIA 3AY8A 1ZL9A 3GUSA 1PQNA 3PH9A 4IBPA 5HR1A 5ECLB 3GA4A 2HZEA 4WR4A 1N2AA 4CDOA 4N0ZA 3RPNA 1MDIA 3ZLPA 4BA7A 3G7JA 4NAXA 4G19A 4WXTA 2GZYA 4ILFA 3ZREA 4TKYA 3F63A 3C7MA 2XBIA 2PGTA 1V40A 3FZ4A 4I5QA 1LBKA 2M46A 3IAM2 2DBCA 4I2TA 2IMKA 2O7KA 3FRCA 1K0CA 2L4QA 5CNWA 2H6XA 2RUEA 3FZ9A 5JCGA 5CRWA 2QGVA 2CA8A 5A5KA 4YQVA 4KCEA 2IMEA 2YP6A 2LNSA 3KM6A 2MMOA 5F8BA 3KJYA 3DD3A 3FR3A 3I6AA 1TU7A 2DMMA 1G7EA 1XIYA 1QQ2A 2IN3A 1I5GA 4GTUA 1WPIA 1XCCA 3ZMKA 4MDCA 4MABA 1U3AA 3N9JA 3TKPA 1IYIA 2H30A 1SKRB 1TDIA 1MTCA 2OE0A 2O85A 2VCZA 3RHCA 3EMPA 1J08A 3D22A 1Y25A 3LYKA 4N30A 4HJMA 4QL9A 5LCZA 3MDKA 4NV2A 3TJBA 4ZBAA 2O89A 1O73A 2RM5A 3ZIJA 2CVBA 4L8EA 3HD5A 3ME8A 1AIUA 1ERUA 5CO3A 3SBCA 1ZCPA 1K0MA 1PN9A 3CYNA 1A2MA 1OKTA 2C3TA 1H4OA 4NPBA 5HR0A 3LFLA 1GTAA 3GSTA 2IJYA 1AUCA 4V1Ag 14GSA 2GZZA 3CTGA 3L78A 4KE3A 3KGKA 2B7KA 2BJXA 4XHMA 4HZ4A 3ZFLA 3EURA 1V57A 2B5XA 3KMOA 4GQCA 1R7HA 1YJ6A 3GKKA 4H86A 2QSIA 4JE1A 3ZFBA 3K8NA 4MJCA 4BPYA 1JFUA 1TU8A 4IVFA 1GSYA 1X9MB 2H0IA 2EIRA 1VRSD 1FG4A 2YV7A 5KN1A 2H6YA 2K8VA 2M72A 1R26A 2YN1A 3CRUA 2GSQA 1B4QA 3F3RA 1ZYQB 4OD7A 2X8HA 3PR8A 5F0GA 2FA8A 4TVEA 1NM3A 1TRUA 3QAGA 5AIXA 2OA7A 5HFIA 1ZOFA 4GCIA 3Q18A 3DKSA 2LS5A 3LGCA 2LQQA 3HJOA 3V1WA 1GWCA 4TXVA 5IOWA 3GX8A 3GMFA 1OAZA 5DQSA 1TW9A 3L4NA 5DCGA 1OKDA 3E9JB 5AISA 1M9BA 1XVWA 1UVZA 5DALB 4K8MA 5COHA 5DJLA 5GSTA 4HUAA 4MPGA 4K0NA 1EEJA 2E7PA 2AB6A 2PERA 8GSSA 3G7YA 4XIHA 2KLXA 3DIEA 4XS6A 3UARA 2CT6A 5C00A 2FLSA 4ZXGA 3D4TA 1TRWA 1Z7PA 2F9SA 2B1KA 1GNEA 2O8VB 5F05A 2VM2A 1GTUA 4LA1A 5CREA 4X43A 1KBNA 4FIWA 5J3RA 3PGTA 1SL0B 3IK7A 2JZSA 1MEKA 3RDWA 2F8FA 5KN3A 1GSDA 4MZBA 4KH7A 2WGRA 2VCVA 1AW9A 4ZBBA 1A0FA 1V2AA 2RM6A 2V41A 2WRTA 1M99A 2G0FA 1E6BA 3A5WA 4O5RA 1A0RP 3CBUA 3KP9A 2DLXA 1B48A 4L5OA 3TKSE 4MF5A 3UMAA 1ZZYA 5LD0A 2EIOA 3EINA 3LXTA 4PGTA 1OC8A 3HVSA 5DALA 5FHIA 1V98A 3IA1A 1DUGA 3F4TA 1WP0A 4OCEA 4MLYA 2GSTA 4EF0A 5IMZA 1O8XA 5EY6A 5ID2B 4ZB8A 1F3BA 2H19A 4KDXA 3LYPA 5IO2A 5C04A 4K1FA 3GSSA 2TRXA 4XS1A 5EVOA 2ZCTA 2ZUPA 4MZWA 1S3CA 1TTZA 1U3IA 1SJIA 4N11A 2GZPA 2LJRA 4Q5FA 3VWXA 1O8WA 2RUFA 4JR6A 1AQVA 1G6WA 5ECKB 5ECHB 2ZNMA 3GH6A 3TOUA 3ZL5A 2FD3A 3FR6A 2DJ1A 4IKHA 1WRYA 1R5PA 4NHWA 3FZ5A 5J9BA 2FGXA 1OC9B 1X9WB 5J4UA 3DMLA 5ECQB 2H72A 5B7CA 1QGVA 1QUWA 1DE1A 3IR4A 1R4WA 6GSVA 2VL9A 5E4WA 3C1SA 1EV4A 2JU5A 4PURA 2GQLA 2QKEA 2I9HA 2N5AA 3W8JA 1M2BA 4LL4B 3GV1A 1YF0A 1T1VA 4HOJA 1R5AA 1EGOA 1BQ7A 4O32A 4RQXA 4KA0A 5JWOB 2CVKA 4V2LA 2ON7A 3CSHA 5ID2A 3G9BA 4MJBA 5EPFA 2C0DA 1AXDA 3FZAA 2F51A 3D4MA 4J57E 2KP1A 1A24A 1V58A 2L4CA 3GL3A 3KCMA 4K0GA 1F3AA 1XVQA 1X5DA 4XCSA 5D8IA 1URMA 5ECMB 3LSZA 2DJ2A 2C80A 1DSBA 1TP9A 3QDNA 4GLTA 2VLUA 2CX4A 2XPEA 1EWXA 1XWKA 2K6VA 2IL3A 3VFIA 4JR4A 2CAIA 3M8NA 1UN2A 1VF4A 2VLVA 4IP6A 4TR4A 1PKWA 1RK4A 4TR1B 1USBA 3H79A 3F3QA 4MZCA 1ILOA 2LKUA 3QCPA 1ZMAA 4Z7XA 1T3BA 1GSUA 1OC9A 4DVCA 2OACA 3LQ7A 3IDVA 22GSA 2XPDA 1JLWA 1GSFA 1S3DA 2LNTA 2CV4A 2AHEA 5J41A 2AAWA 1PA3A 3H1NA 1HYUA 4EKZA 4RUVA 1M7TA 3UJ1A 3J7Yk 3Q74A 1MDKA 2R37A 2L5OA 4DEJA 1ERTA 2FHEA 3APOA 4IELA 1UC7A 4AJ7A 2GGTA 4NV5A 4GWRA 3TGZA 10GSA 5IO0A 4KDYA 2XC2A 6GSSA 4XRDA 3IPZA 3UBKA 2EC4A 2N5FA 1WE0A 1A2LA 1X5CA 5F07A 4YQMA 1SK1A 4HJ2A 4OO4A 2WZ9A 1K0BA 2P31A 4TR1A 3CRTA 2FWHA 4Q5RA 3ZRDA 3PINA 3FEUA 3GIXA 2CQ9A 2OBIA 1ML6A 3IXRA 5ECOB 4IN0A 2DJKA 4POBA 1U88A 4ML1A 2B5EA 2YZHA 3ME7A 2K18A 2C3QA 2HFDA 2G2QA 5ENUA 7GSSA 4IGJA 2F3MA 3Q6OA 2DJ3A 4EL1A 2IMDA 3P7XA 1WWJA 1TI1A 4KSOA 4PX1A 2CAQA 3L0HA 3LEFA 1HNAA 4FYBA 4YH2A 4RI6A 4WBJA 2H71A 4GSTA 2MBSA 1M2DA 3C8EA 3UOMA 2PU9C 4TXOB 4J2FA 2YPMA 4GSNA 4K2DA 1S3AA 4NMUA 2YCDA 3TKQA 3LXZA 4GXZA 3ZMLA 3ZVJA 4F9ZA 2ON5A 1T4ZA 2GTUA 3EC3A 3C71A 2L6CA 3UAPA 5D73A 1XOBA 4ULXA 2I4AA 2YOIA 1SYRA 5B6MA 4PUAA 5DJMA 5CRGA 3GKMA 5G1KA 1AQWA 2HRFA 2YJ7A 5ECRB 2N5BA 2A4VA 4I8BA 4AJ6A 3ZYWA 3Q19A 1XFLA 4KGIA 1EOGA 3QPMA 1JHBA 2EIQA 4IJIA 4MF6A 3UL3A 3BJ5A 3VPQA 2WS2A 4EDZA 1Q4JA 1GH2A 4GSSA 2VCWA 3HA9A 1FOVA 4TXOA 3US3A 4DSQA 2YNXA 4OCFA 3TB2A 5CRHA 4PNGA 2H66A 5D9WA 1GLPA 5GAPD 4F0CA 4IJ3A 3M1GA 1GL8A 3U5RE 2HSHA 3MAKA 2WFCA 1H75A 2HRNA 1HNCA 5HFKA 3KZQA 5GZZB 4X0XA 3LWAA 3BCIA 2PBJA 3DVWA 4Q5NA 2O87A 2A2SA 1ST9A 2X8CA 3GRXA 2H6ZA 3F9UA 2GDRA 1VGLA 3HJMA 2IMIA 2LRTA 4IHUA 3TUEA 3KTBA 3ZIVA 3D0ZA 1EV9A 5DBQA 1CQHA 1YQ1A 2FY6A 1M2AA 2J9HA 3FKFA 5IOXA 4F2IA 3O6TA 4LLRA 4Q5QA 4TN8A 5KN0A 2C8UA 2OE1A 1XW5A 2RIIA 5G1LA 2LTKA 2HLSA 1YKCA 5A4UA 4E8EA 3TJKA 2YZUA 1WMJA 1VF2A 2HZFA 2I3YA 5HQPA 2HI7A 1B4PA 1YEXA 4V2MA 1K3LA 1GUHA 1FO5A 3EE2A 3IAS2 4POLA 5J9CA 1G6YA 4ACSA 5IMVA 3BD2A 5HFGA 3IBHA 1OC3A 4NHZA 1W4VA 5HR2A 4DSSB 2JSZA 1ACVA 2LEGA 3C73A 3KP8A 1X0RA 4AF2A 4O92A 2XHFA 2H70A 2MMAA 1Z3EA 2KP2A 4F0BA 5ECPB 2H1DA 2D2ZA 3TKRA 1GSSA 3DYRA 11GSA 3HZ4A 1SENA 4D73B 5IMCA 1F2EA 5G31A 1SL1B 5AGYA 3VWWA 4IP1A 3HZ8A 4EC0A 1XPVA 1Z9HA 2Z9SA 4MJAA 3QD9A 1HQOA 3OR5A 3APSA 2V2GA 4N0VA 3I9V2 1O85A 4E8HA 1B8XA 2DIZA 1EOHA 3E0UA 5E59A 3CSIA 1Y6EA 3NZNA 4CW9A 2LV3A 3I69A 2JL4A 2MZCA 4MH2A 1YDKA 4QQ7A 4DSSA 2JADA 4N10A 5IMDA 5ABRA 5DAKB 2R2JA 1BAYA 3S9FA 2CZ3A 4XTSA 1F9MA 1N8JA 2IMFA 3JCML 1NHOA 1V9WA 3NIVA 1TKDB 4G10A 1K0AA 1SK2A 2R5GA 2C4JA 3GNJA 4D73A 2MMZA 3RPPA 1BG5A 3IK9A 1HNBA 1JZDA 2OBKA 3GKNA 2H74A 2AV4A 2C0FA 1A23A 5ECNB 1TRSA 1IYHA 1GRXA 1SJZA 1THOA 3DGQA 5B8BA 5ELGA 2R4VA 2FWFA 3KIJA 3FW2A 3O76A 3FK8A 3M9KA 2L59A 1BEDA 1NHYA 1GULA 4WF4A 2MBTA 3KTLA 5IMAA 3C1RA 5INYA 4WKWA 2I1UA 5DCHA 3TDGA 4KCAA 4IS0A 2FCHA 1T8EB 5CRDA 3KD0A 4ZILA 3KH9A 1SU9A 5DAKA 4ZIJA 4PUFC 1GNWA 3F8UA 2B1LA 3MWHA 1PL1A 3E3EA 2VLTA 2PN8A 1T7PB 3D5JA 4POKA 4POMA 3MSZA 1GTBA 1TK5B 3EMXA 5LNKe 3ZTLA 3GN3A 4MA9A 2WCIA 1ERWA 2GQMA 4KW6A 3VI5A 3GFKA 4L5LA 5KN2A 2GSRA 1J9BA 3MNGA 1YY7A 2DC5A 4RQRA 1K0NA 4ECBA 3R2QA 4FH8A 2YJHA 4HU9A 4J56E 3LG6A 2REMA 3EYTA 2H76A 1GSEA 1C72A 1O7UA 4KUNA 2VL2A 2WJUA 2PUKC 1GSQA 1BX9A 2HXKA 4ECJA 1TI3A 4HQZA 2GSSA 1OVNA 1GUMA 5EL8A 2LRCA 1ZYEA 4BVXA 3TRXA 3D6IA 3HJPA 4WBRD 3ZITA 2DJ0A 3UVHA 4ZL8A 1QXHA 1TRVA 2NPBA 2E0QA 1AAZA 3CXGA 3F4RA 1KEBA 2NDOA 1XOAA 9GSSA 2VD0A 4LMWA 2H1AA 5D9XA 4TR0A 2NTOA 1RQMA 5FWGA 1YF1A 4K9ZA 1KTEA 1JZOA 3EU4A 5A4WA 12GSA 3IV4A 2FUG2 1SK0A 4ZL7A 1WJKA 2E2GA 1PX7A 3VPTA 3CMIA 4PXOA 1XWGA 4MPFA 4KDUA 3ERWA 4HU7A 1GUKA 3L9SA 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chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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