1XOAA

Thioredoxin (oxidized disulfide form), nmr, 20 structures
Total Genus 35
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
35
sequence length
108
structure length
108
Chain Sequence
SDKIIHLTDDSFDTDVLKADGAILVDFWAEWCGPCKMIAPILDEIADEYQGKLTVAKLNIDQNPGTAPKYGIRGIPTLLLFKNGEVAATKVGALSKGQLKEFLDANLA
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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molecule tags Electron transport
molecule keywords THIOREDOXIN
publication title High-resolution solution structures of oxidized and reduced Escherichia coli thioredoxin.
pubmed doi rcsb
source organism Escherichia coli
total genus 35
structure length 108
sequence length 108
ec nomenclature
pdb deposition date 1995-11-28

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00085 Thioredoxin Thioredoxin
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.30.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich Glutaredoxin Glutaredoxin 1xoaA00
4K6XA 2WFCA 2BTOT 1AC1A 5HFKA 1TU8A 1SK1A 2RM5A 2VM2A 3GKXA 2P31A 5DAKB 4TR3A 2H6YA 2L5LA 4X0XA 1FO5A 4N0ZA 2I3YA 5COHA 4I2TA 1X5DA 2OE3A 2K8VA 2XPDA 4NHZA 5G2ZA 4MJEA 1K3YA 1MDJA 2YP6A 1GP1A 1O8XA 1A23A 5G1KA 1C72A 2H1DA 1HNAA 3ZFLA 1NW2A 3DIEA 4LA1A 4V2MA 1XXUA 3M1GA 2FWEA 3GTUB 3GURA 1TRSA 4LL1B 1XPVA 2NBSA 1W89A 1T1VA 4ECJA 3EU4A 1T3BA 3TRQA 2WDUA 3UL3A 1K3OA 2FWGA 1BEDA 5LCZA 3HYPA 1MDIA 4DSSB 2YANA 3TJKA 5B6MA 4OCFA 1K0CA 2H30A 1ERWA 4ZB6A 3RAZA 3QAGA 3K8NA 3IK9A 4MZCA 3UEMA 4RQRA 4K9ZA 4GQCA 5G30A 1ST9A 2VLUA 5ECQB 4WEYA 5DDLA 4MABA 3VPTA 3GSSA 3RHCA 2E2GA 4ZBBA 4AJ8A 4CHSA 3FRCA 2L57A 2H70A 1DBYA 1JFUA 3C71A 5JWOB 4EE0A 3KXOA 2HRFA 3VURA 3ZIJA 4G19A 1RK4A 1V9WA 4ACSA 2MZCA 4DEJA 5GZZB 4CW9A 2FUG2 1XWCA 2CZ3A 1W4VA 3PGTA 1V57A 1T4ZA 4HU7A 3HVSA 3ME8A 3VWWA 4YQVA 1XCCA 1A0FA 1EOGA 2XPEA 4I97A 22GSA 3TKQA 2YWOA 3UVTA 3F3QA 4ZILA 2CAQA 4BVXA 5J9CA 3EVIA 3HZ8A 1K3LA 3F4SA 10GSA 2JZRA 1FVKA 5G5EA 1A8LA 4ISDA 2HZEB 4WR5A 3KGKA 3PINA 4MH2A 4V1Ag 3LYPA 1YF0A 4KX4A 2GT6A 2R5GA 4AJ7A 1B9YC 1XWAA 1X9MB 1K0BA 3TKSA 1WE0A 1SD8A 5INYA 5J3RA 2DLXA 4KDXA 1O73A 3M0FA 2K6VA 4MJBA 2R37A 5ID2B 2XC2A 1ML6A 5ECPB 4ZL7A 4WR4A 4DSQA 5FHIA 2GQLA 1LJRA 1UA5A 2LJAA 3GL5A 3G7IA 3V1WA 2K8SA 2HSYA 1OC8A 2F8AA 1X9WB 3G7YA 2EC4A 5GSSA 4KAEA 3ERFA 1QK8A 3MWHA 1TK0B 2HE3A 1F6MC 5IIZA 4KE3A 1OC9A 2M72A 3GNJA 2PPTA 4BVYA 4ML1A 3I43A 4GWRA 4FYBA 4AJ6A 3P7XA 4G10A 5IM9A 1O81A 3F9UA 4K8MA 3U6VA 1B4QA 5DQYA 5CP1A 3DYRA 3TKSC 1TKDB 5CRHA 4GSSA 1X9SB 1IYIA 1OAZA 1WMJA 3HD5A 4MF5A 3QCPA 2GSRA 1SYXA 1T8EB 4F82A 2A2RA 4KGIA 1Z7PA 2VL9A 5KN1A 4LMVA 4AGSA 4POMA 1M9BA 3GIXA 5DALA 2YWIA 3CBUA 1N8JA 2MBSA 4ECCA 1U87A 2C0FA 4NMUA 3SWLA 4RI6A 6GSVA 1WRYA 3VI7A 1E6BA 4MF7A 1Z9HA 1EP8A 1AQXA 1ILOA 3M8NA 2JACA 3PH9A 1GL8A 4MCUA 2VL2A 2R3XA 1YEPA 3VK9A 4IBPA 3JCML 3WT1A 3CMIA 2WJUA 1OYJA 3TJBA 2DIYA 2H0HA 3WT2A 5CNWA 2VCQA 4XS4B 3VLNA 3R2QA 2PVOC 2VIMA 4HEA2 3OR5A 5HQPA 2AV4A 2H0GA 5HFGA 3H4KA 5IPHA 2AYTA 2L4QA 5AGYA 2N5BA 2FGXA 1Z6MA 3EURA 4YAPA 4IJ3A 2AUVA 2YPMA 1GSDA 3E0UA 2RLIA 1X5EA 4J57E 2VLTA 2VL2C 3LFLA 1K0AA 3A2VA 5DVBA 3TKPA 5CYYA 2G0FA 2RUFA 1RW1A 3LXTA 5D9WA 2VCVA 1EOHA 5CRWA 2NVLA 5IO0A 3KH7A 1U3AA 2JL4A 4PUAA 3H93A 5ECIB 2C3QA 2YNXA 1KBNA 1U6TA 4KDUA 2FLSA 2CVDA 1SD9A 4MMMA 3F4RA 3FYGA 4NV5A 4YH2A 4TN8A 5DJLA 1U88A 2LRTA 2B5EA 3KP8A 4POKA 4WF5A 2H0IA 1GTIA 1XOBA 1H4OA 1HYUA 2LRCA 1I9DA 2OA7A 3QAWA 5DCHA 3D21A 3EU3A 1X5CA 2H76A 1BAYA 5L71A 4QQ7A 2DSAA 4HUAA 4PQ1A 2X64A 4I5QA 11GSA 3FZAA 4X43A 5IPGA 1UVZA 3VFIA 3W6GA 4IN0A 1JZOA 5F8BA 2WGRA 5DCGA 2H74A 4HJ2A 5HR0A 4EXJA 5HR3A 1IYHA 2IMDA 3DMLA 3LXZA 3P8WA 2GGTA 3UMAA 1XOAA 3D22A 2KLXA 1GSUA 2H01A 2PMTA 4GCIA 4L5OA 2P0GA 2I1UA 4GTUA 3P90A 1TXXA 4Q5NA 5JCUA 2YWMA 2E7PA 3H8QA 2E2MA 2VM1A 5C00A 1PKWA 1T4YA 1EGOA 3GHAA 5J5NA 5IMVA 1Q98A 3QDNA 1KNGA 3HJMA 3O6TA 4MA9A 4WETA 3UARA 1CQHA 4NWYA 1OKTA 5ABRA 1NSWA 1SKRB 3ZL5A 2DMLA 4TR1B 1YY7A 4EKZA 1OKDA 1ERUA 2K9FA 2LEGA 2HLSA 3BCIA 2OBIA 1SK0A 2FHEA 2JSYA 3ZVJD 4IW9A 2VOCA 4X1UA 1ACVA 1PKZA 1SL1B 2JSZA 2VD0A 1GUMA 3IA1A 3HCZA 3RBTA 3ZZXA 3F6FA 3CTGA 3UBKA 5ELAA 1EZKA 2IMKA 2CVBA 4NHWA 3ZFBA 3TRPA 2VCTA 3TRXA 2A2SA 1N2AA 2B7JA 1G6WA 2NTOA 1K0MA 2AAWA 3M9KA 1FAAA 2VLVA 3ED3A 1F9MA 1SK2A 5IMAA 3U5RE 4FO5A 2MMNA 1JZWA 2I81A 4JR6A 4POBA 2QGVA 3CSHA 4Z7XA 2HI7A 3GUSA 1YKCA 2B5YA 3GX8A 4DVCA 3IV4A 4F9ZA 3HVXA 4OWYA 5HR1A 1DE2A 3QD9A 4IELA 4J2FA 4K7OA 3APSA 3ZMLA 2N5AA 5ECHB 4HZ2A 1ZL9A 5EY6A 5E4WA 5IQYA 4IVFA 2YJHA 4MPFA 3UJ1A 5AISA 2H73A 1Z6NA 1EWXA 4L5LA 1WWJA 4Q5FA 3VWVA 1ZCPA 3MSZA 1TK5B 4FIWA 1A8YA 4OFNA 1F37A 2VO4A 4EVMA 4POLA 3QOUA 3J7Yb 3C7MA 4RQXA 1BX9A 2C8UA 4ML6A 2E0QA 4ZIJA 2TIRA 5H5SA 5C04A 5F06A 3FHKA 4O5RA 1WP0A 3NZNA 5H5QA 3US3A 1I5GA 1FB0A 1Z3EA 1EP7A 4JR4A 3LQ7A 1TU7A 3FK8A 4MZWA 3J7Yk 1PRXA 1GNWA 4NV2A 4KSOA 4P3YB 5B8AA 2ZCTA 3P2AA 4PGTA 1QQ2A 1GSYA 3HDCA 3WGXA 3KJYA 4NAXA 1Q4JA 1V2AA 3I6AA 4IP1A 2GZYA 1GSFA 2C4JA 2CX3A 2WB9A 3IOSA 2XBQA 4ZB9A 1V98A 2IFQA 4MJCA 3TB2A 6GSWA 2LJRA 6GSUA 4K7NA 5E59A 4XHMA 4IS0A 2LQQA 2HZEA 4JEDA 4KW6A 1XZOA 1TDIA 1TOFA 5D73A 18GSA 2ES7A 3WGEA 2L59A 1AAZA 1Y25A 3DWVA 1NHYA 5CRGA 3UVHA 4XTSA 1XWGA 4MK3A 2OACA 3WGDA 4PQIA 14GSA 5A4WA 2V32A 2H75A 1JLWA 3SBCA 4IP6A 1R7HA 4D73B 4HU9A 4ECBA 8GSSA 4I8BA 4KA0A 4Q5QA 1OE8A 1V40A 1RQMA 1AUCA 3DD3A 1S3CA 5KN2A 1JZDA 2REMA 4EO3A 1FW1A 5JWQB 1XWKA 2DC5A 3NIVA 2H72A 3TOUA 19GSA 1DE1A 3RDWA 4YQUA 2MBTA 3LEFA 1JZRA 2X8HA 1B9XC 4XCSA 3RHBA 4AF2A 4YAVA 1ZZYA 2IPAA 9GSSA 3I9V2 3BJ5A 2VD1A 4HQZA 2OJLA 3A3TA 3L9UA 3KCMA 3DVWA 3GMFA 2L6CA 3APOA 3Q19A 2PBJA 1BG5A 1YKAA 3F63A 5KN3A 1OC9B 3ERWA 3APQA 5CAXA 4IGJA 5D9VA 2RUEA 4MH3A 4PXOA 3VWXA 3EC3A 1Y6EA 1PD21 5ECNB 2FWHA 2B1LA 4FYUA 2GSQA 4PNFA 7GSSA 4EDYA 2LKUA 1GNEA 2WRTA 1AW9A 1O85A 2FA4A 3QAVA 4K0GA 1BJXA 2F51A 4MZBA 1VF1A 3CSJA 3FR3A 3TGZA 2A4VA 3A2WA 3CTFA 5IO2A 5J4UA 1J08A 1TP9A 4CDOA 1Z7RA 4XS4A 4EC0A 5A4VA 1HQOA 2WZ9A 1ZOFA 2YN1A 1UN2A 4GQFA 3GN3A 2FNOA 2Z9SA 1SL2B 3F6DA 3EE2A 3KMOA 1AQVA 1GTBA 2PWJA 4XRDA 3F8UA 2M46A 1BQ7A 1PA3A 1GTAA 1HNCA 4TXVA 1GLPA 2WCIA 2DBCA 2O8VB 2CV4A 2EIOA 1B48A 4WBRD 2TRXA 2N5FA 2B7KA 3BCKA 1WOUA 2C0EA 2RIIA 2CAIA 5D8IA 5JCWA 1F2EA 1TW9A 1GULA 5KEJA 4Q5RA 2H6ZA 3W8JA 3TOTA 5CO3A 1GUHA 3KTBA 3A5WA 5DBQA 1QFNA 2PVQA 1V58A 2JZSA 3M3MA 1K0OA 1O6JA 1X0RA 3NOFA 1U3IA 3GV1A 3GA4A 5DQSA 2YV7A 2ON5A 3EMXA 2KOKA 2C1YA 1FVJA 2D2ZA 4KDYA 3KEBA 1ERVA 1HD2A 4WXTA 4O92A 1A2MA 1VF3A 4TXOA 5ECMB 2R4VA 1XWBA 4N11A 3ZMKA 3DXBA 1TK8B 1E2YA 2M80A 4GLTA 5LNKe 2IL3A 4GRFA 1XFLA 2OBKA 1PMTA 2QSIA 1FB6A 1GUKA 2DJ2A 3QFAC 1TI1A 1FG4A 4N30A 3EMPA 2H71A 1ON4A 3FKFA 2IMEA 4HS1A 3L78A 4FH8A 3HZ4A 1CQGA 4N0VA 2EIQA 1XIYA 4IHUA 4TKYA 1YDKA 3UAPA 2P5RA 1GSSA 1M2BA 3ZIVA 2GLRA 1FOVA 2PU9C 3GRXA 2VL3A 4MF6A 3ME7A 4GXZA 5IMDA 1AQWA 2YZUA 1G6YA 3H79A 1SJIA 4HQSA 2YJ7A 5F07A 2YCDA 4ZXGA 4J56E 3IR4A 5F05A 3LJRA 2CZ2A 4KB3A 2IWTA 3GKMA 4TOPA 3KH9A 4QL9A 3S9FA 2WULA 3BD2A 2HNLA 1F3BA 2H66A 4TR1A 1A2LA 5ECKB 4ECIA 3KMNA 2GZZA 1GH2A 16GSA 2HT9A 4MLYA 2FA8A 3A2XA 2AB6A 3GX0A 3DGQA 3VI5A 3QR6A 1GLQA 4EL1A 3IPZA 3FW2A 3G7JA 4F03A 1M2DA 3HJPA 1TRWA 4IJIA 4LMWA 4YQMA 4RUVA 5DAKA 4JBBA 5ECRB 4MJAA 4XRAA 1KTEA 2HZFA 5ECLB 2O85A 3F4TA 2OADA 4PURA 1MTCA 1DUGA 2VCWA 3KIJA 3IXRA 3DRNA 4XIHA 2HFDA 2LS5A 5GSTA 3GFKA 2V6OA 1PL2A 3GKNA 4TR0A 1R4WA 4WF4A 4RI7A 3IHQA 3DKSA 1T00A 4KH7A 3M9JA 1EGRA 3GTUA 2GVPA 3CSIA 3D5JA 2V1MA 1ZYEA 3LSZA 3KM6A 1PQNA 3WYWA 2R6KA 1SJ6A 2X99A 1WIKA 3TDGA 2XHFA 5JCGA 4DSSA 3FZ9A 3KTLA 1WPIA 4OO5A 4PX1A 3EWLA 1YEXA 3HVVA 4HJMA 5A4UA 4KCAA 2B5XA 12GSA 3TKRA 1EV9A 17GSA 3C1SA 4BPYA 2YV9A 2LNTA 3UBLA 4ZBDA 1ZMAA 3ERGA 5IMZA 4HDEA 1JHBA 3ZYWA 1OVNA 2AJQB 3VPQA 2VCXA 3GL3A 5FT3A 1K0NA 1VRSD 2GQKA 4F2IA 4LL4B 4TRXA 4N10A 2QC7A 4OFTA 2OKAA 1DSBA 3GSTA 2CVKA 5LD0A 4H86A 1Z5YE 3RPNA 4I2UA 1WJKA 4OCEA 2GSTA 2IN3A 1PX6A 2AHEA 4KSMA 2H19A 4V1Ap 2LRNA 2LNSA 2V6KA 1BYEA 2ZUPA 3L9SA 3PR8A 3Q74A 4O32A 3IAS2 5HR2A 1ABAA 5IMFA 2O89A 5G5FA 3I69A 3L9VA 4HI7A 1YQ1A 2I9HA 4IQAA 4K2DA 2GDRA 4OO4A 4NXIA 3W8SA 1YJ6A 2JADA 5ECSA 4DSRA 1LU4A 3D4TA 2J9HA 3O76A 20GSA 3F0IA 3IK7A 3WD6A 3DVXA 3LG6A 2GSSA 4F0BA 3BBYA 2K18A 4HOJA 3QPMA 2IFQB 1J9BA 2OE1A 1H75A 1J0FA 2PUKC 4D73A 1PSQA 1M0UA 2MMOA 5ID2A 3IE3A 1ZYQB 4E8EA 2KUCA 2C80A 4K1FA 1A0RP 3MDKA 3HXSA 3C73A 5ECOB 2KP1A 2CX4A 3KP9A 3TJFA 5D9TA 1VF2A 2H1GA 5D96A 4TW5A 3FZ4A 1M99A 1M2AA 3G9BA 2IMIA 3IC4A 3C1RA 3ZREA 5CREA 4PNGA 3UOMA 1M7TA 1S3AA 3ZITA 1AIUA 2O87A 1SL0B 4ZB8A 2H1AA 3D0ZA 2F9SA 3TJGA 3FZ5A 1QUWA 2GS3A 3LWAA 1KEBA 2LSTA 3KZQA 1O7UA 2TRCP 2H8LA 1EEJA 1EEMA 4GSNA 1PX7A 5A5KA 5KN0A 3KD0A 4E8HA 1G7EA 3TCOA 1ZGNA 1M9AA 3GH6A 1PN9A 3HJOA 4ZL8A 4K0NA 3VWUA 4FYCA 5H5RA 3MNGA 4O7HA 4ILFA 2VUPA 4L0WA 1FHEA 1SYRA 2DJ1A 4PUFC 3O3TA 4BL7A 3ZVJA 5JWRB 3GH9A 2EIRA 13GSA 3ZTLA 4G9HA 3GYKA 5B6NA 4LLRA 4OFMA 1QGVA 3N9JA 2IJYA 4BWSA 1G0TA 3D6IA 5EPFA 1S3DA 2RM6A 4HZ4A 2KP2A 2MMAA 4BA7A 5IOWA 4I6XA 3TUEA 3L0HA 1HNBA 4JE1A 2CQ9A 2H6XA 1NHOA 4ID0A 3CYNA 4XS1A 2HRNA 5D9XA 4NPBA 5ELGA 2QKEA 3HY2A 1QXHA 5DALB 5IOXA 2NPBA 2PGTA 1GSQA 1YZXA 1NM3A 5AIXA 1O8WA 5IMCA 1B4PA 2GZPA 3FY7A 3FR6A 5B8BA 1OC3A 2P5QA 3HHVA 3FEUA 2L4CA 2DJKA 4QL7A 1A24A 3D4MA 2X8GA 2XBIA 1USBA 2G2QA 2BJXA 1XW5A 1XW9A 6GSYA 1R5PA 2DIZA 2HXKA 2NDOA 4TVEA 3TKSE 1URMA 1SJZA 5EL8A 4JZQA 1AXDA 1GWCA 3ISOA 5ENUA 4MPGA 2GTUA 5AN1A 3QMXA 1K0DA 2F3MA 2L5OA 2FY6A 5EVOA 4ZBAA 5F0GA 2MYGA 2C0DA 2JU5A 5DJMA 2YZHA 3N5OA 4K7IA 5J41A 2VAFA 1F3AA 1LBKA 1MD3A 3TJJA 2KHPA 1JLVA 4V2LA 1VGLA 1OE7A 2WS2A 1R26A 4G2EA 2ALBA 3LYKA 3UIWA 6GSTA 1TRVA 2LUSA 3QFBC 1MEKA 5CRDA 2IMFA 1TRUA 1XVQA 1ERTA 2GQMA 3ZRDA 2CA8A 4BWQA 2O7KA 3LORA 2LTKA 4MP4A 5FWGA 2LJKA 3Q18A 4WBJA 3CXGA 5AIVA 3IAM2 2J23A 3GKKA 3F3RA 4ZL9A 1TTZA 1SU9A 3HKRA 2IIYA 2HYXA 2DJJA 4XS6A 2PN8A 3RPPA 2FD3A 1GSEA 2MMZA 2B6MA 5G31A 2YOIA 4L8EA 2X8CA 4TXOB 1T7PB 4V2NA 2ZNMA 3CRTA 2R2JA 3IRAA 3H1NA 2V41A 2LQOA 3FR9A 2OE0A 3Q6OA 5G1LA 2BMXA 1GRXA 3E3EA 3BOAA 1MD4A 2ON7A 5J9BA 1EV4A 2B1KA 4EUYA 3E9JB 4L0UA 2C0GA 1XBSA 2HSHA 3AY8A 1THOA 3EINA 6GSXA 4OMVA 4F0CA 2FWFA 3IBHA 1SKWB 4GF0A 2VCZA 2CT6A 4OD7A 4KCEA 3DEXA 6GSSA 3L4NA 2DJ0A 2PERA 1A2JA 1SKSB 2I4AA 1SENA 2JZTA 3CRUA 1B8XA 2C3NA 1QMVA 4KUNA 1XW6A 3ZLPA 2LV3A 1YF1A 3EYTA 4IQ1A 3LGCA 5D93A 1TI3A 2H1BA 4EF0A 2C3TA 1TJDA 2B3SA 4PQHA 4WKWA 3HA9A 2L6DA 4JU5A 1R5AA 1G7OA 2GT5A 5GAND 1UC7A 3C8EA 1PGTA 4MDCA 4GSTA 2FCHA 1MDKA 3MAKA 4IKHA 5HFIA 2F8FA 4TR4A 4JRRA 3IDVA 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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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