1XOAA

Thioredoxin (oxidized disulfide form), nmr, 20 structures
Total Genus 35
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
35
sequence length
108
structure length
108
Chain Sequence
SDKIIHLTDDSFDTDVLKADGAILVDFWAEWCGPCKMIAPILDEIADEYQGKLTVAKLNIDQNPGTAPKYGIRGIPTLLLFKNGEVAATKVGALSKGQLKEFLDANLA
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
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publication title High-resolution solution structures of oxidized and reduced Escherichia coli thioredoxin.
pubmed doi rcsb
molecule keywords THIOREDOXIN
molecule tags Electron transport
source organism Escherichia coli
total genus 35
structure length 108
sequence length 108
ec nomenclature
pdb deposition date 1995-11-28

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00085 Thioredoxin Thioredoxin
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.30.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich Glutaredoxin Glutaredoxin 1xoaA00
4HS1A 2WZ9A 5KEJA 2IIYA 1WE0A 3TCOA 2IFQB 5B6NA 2O8VB 3V1WA 2CV4A 4AJ7A 4HI7A 1N8JA 2LRNA 2VCVA 1NHYA 1R4WA 3MSZA 1Q4JA 3C1SA 3GSTA 2DSAA 3CTGA 4DSSB 5G31A 4KW6A 5A4WA 4POLA 4ZL8A 1TRSA 1GWCA 3ZVJA 4XRDA 2X8GA 1MDKA 4IBPA 1RK4A 1JLVA 2P5QA 2WB9A 3ZIJA 2X8CA 1OE8A 3KTBA 2L5LA 4PQ1A 2R2JA 1E2YA 6GSTA 3FKFA 5B7CA 1B48A 1Q98A 2C3NA 2GT6A 2LUSA 4WBRD 3C7MA 5J4UA 1Z3EA 1GULA 1A23A 1USBA 3IA1A 2R37A 4V2LA 1X0RA 5EPFA 1G0TA 3ZIVA 1O85A 2B5YA 3F4RA 3HCZA 2VL2C 2HSHA 2DJ3A 1MTCA 1PL2A 4GTUA 1ZMAA 4ZBBA 4KAEA 3F3RA 3G7YA 4NHWA 3QFAC 2RLIA 2QGVA 3QAWA 1QQ2A 3IE3A 2NDOA 5CO3A 4XIHA 3WGEA 3FZ5A 4X0XA 4AGSA 4NMUA 4JU5A 3ME8A 4MCUA 5ECRB 2LS5A 3GKNA 1QGVA 2WCIA 2HRNA 2LJRA 5B6MA 5ECPB 1PGTA 1OC3A 1GSEA 1OVNA 3PR8A 4MZCA 1FB0A 4MH3A 1PL1A 1K0OA 2CZ3A 3EMPA 4ILFA 5D9VA 5FWGA 1S3AA 1THOA 3GTUA 2C0EA 2FA4A 4MP4A 2WGRA 1NSWA 3GH6A 5ENUA 1TRUA 3HHVA 4MABA 4OD7A 1JZDA 5G2ZA 4D73A 1ZYEA 2AV4A 1XCCA 2F51A 1M2BA 3ERGA 2C80A 2N5FA 4KX4A 1BX9A 3LWAA 3KMNA 3ZMKA 3FZ4A 5ECSA 1NHOA 5B8AA 5AIXA 2X64A 1LU4A 2QKEA 4GSNA 2JSYA 1UVZA 2PUKC 4ZILA 5C00A 4HU9A 5DBQA 2AB6A 1WWJA 4K1FA 1NW2A 1GLPA 3KTLA 4WKWA 4G2EA 2EIRA 1GSYA 2ZCTA 2ON7A 2IMFA 4DSRA 3U6VA 2WULA 2L4CA 3W8JA 5JWRB 2DJJA 1T00A 4IJ3A 1GNWA 3GX8A 4WETA 1XFLA 5F8BA 4WF5A 3C73A 2WJUA 2H1BA 4F03A 2VD0A 1G7OA 1WPIA 2DJ0A 6GSUA 2CA8A 4KDXA 4BWQA 6GSWA 4BL7A 10GSA 2B1LA 1AXDA 3KIJA 5G1KA 1EGOA 1GUHA 1A0RP 3FR9A 1KNGA 4FO5A 2FWHA 4JRRA 2V6OA 8GSSA 5B8BA 4V1Ag 1J9BA 1WP0A 1U88A 4MJCA 3DEXA 3SBCA 1XVQA 4EO3A 4V1Ap 5HR1A 2YZHA 3ME7A 4P3YB 2JSZA 3QOUA 3RPNA 2QC7A 5AGYA 4PNGA 2C0GA 2OBKA 2NPBA 3FYGA 3GX0A 1JZRA 2NTOA 1O7UA 2CT6A 1OKTA 3CSHA 2F3MA 4AF2A 1ERUA 1V40A 3HDCA 3Q18A 1BAYA 1HNCA 1OC8A 3LXTA 5HQPA 2R3XA 3CSJA 3QD9A 4WR4A 2VL9A 4Q5RA 4TKYA 4L5LA 3TOTA 2V41A 4KSMA 4NXIA 3LXZA 5DJLA 2TRXA 3BCKA 3O76A 1EWXA 3UMAA 1RQMA 5IO2A 4IP1A 3ERWA 4HJ2A 3QAVA 3DD3A 3D0ZA 4ZL9A 3BOAA 4OO4A 2PPTA 3FEUA 3UBKA 2C4JA 2HRFA 4LLRA 4MPGA 1F2EA 2ES7A 1ON4A 4JEDA 2LNSA 2GSSA 1OC9B 4TVEA 1HNAA 2I1UA 2H6YA 1JZOA 2OE1A 5ECNB 3A2VA 3A2WA 5HFIA 4BPYA 1FOVA 4KUNA 4NV2A 2FWEA 4L8EA 1PKWA 4EVMA 5CRGA 1M2AA 5IMVA 1GLQA 3TKSC 5FT3A 5GZZB 2ZNMA 4LA1A 1GSFA 4ACSA 1SYRA 3APQA 2IWTA 5IPGA 5F0GA 3KZQA 3Q19A 1TK0B 2B6MA 2N5AA 5ECMB 3C1RA 3WD6A 3G7IA 5HFKA 5DALA 4CW9A 4ID0A 4RQRA 1BQ7A 5D9TA 1MEKA 3FR3A 1PSQA 4AJ6A 4WBJA 3VK9A 1BJXA 1TTZA 4V2NA 3GYKA 1SKWB 2H6ZA 2GVPA 3I69A 3VPQA 1TJDA 4L5OA 3ZVJD 4JZQA 1Z6NA 2IFQA 2K18A 2VO4A 2HNLA 1XWGA 3WYWA 2RM6A 3DGQA 1ZZYA 2C3TA 3NOFA 4DSSA 2OE3A 4MZWA 2QSIA 2LJAA 1Z9HA 4I2TA 4HUAA 2FUG2 4K0NA 3UOMA 1F37A 4MZBA 1OAZA 2DMLA 4IN0A 1T3BA 4TW5A 1PX6A 2AYTA 1TRVA 4H86A 3CBUA 2CVDA 1M7TA 3I43A 4ML6A 2L57A 2H72A 1EGRA 2AJQB 3M1GA 4O32A 4FH8A 2YWOA 4TR0A 4EDYA 1SU9A 2KLXA 1WRYA 5LD0A 4HEA2 1J0FA 3UARA 5KN3A 4RI7A 1EP7A 3VFIA 3G7JA 1I5GA 4ECCA 3E0UA 1SL1B 3CXGA 4IP6A 3F9UA 12GSA 2MMOA 3C71A 3F63A 1EOGA 1FHEA 2YWIA 5C04A 3EVIA 4GCIA 3ED3A 1PN9A 4NPBA 5A4VA 1LBKA 2E7PA 3P2AA 3GV1A 2BTOT 1SYXA 4ECJA 5GAPD 3HVVA 2MZCA 3HZ8A 3L0HA 5J9BA 3UJ1A 4XTSA 1VGLA 2FHEA 3KCMA 1B9XC 1T7PB 1X5CA 1TOFA 2RM5A 1TI3A 3PGTA 4TXOB 1V9WA 3L9SA 4PQHA 5HFGA 3F4SA 1U3AA 3ZRDA 3MAKA 5IIZA 1TXXA 3E9JB 4KSOA 4OCFA 5JCUA 1AW9A 2B1KA 1M9BA 5H5SA 1MD4A 3VI7A 1JZWA 2JZRA 3HVSA 5ECLB 6GSXA 2LEGA 2H76A 1GSQA 1YDKA 4G19A 1R5PA 2HFDA 1M2DA 2RUEA 1V57A 4DSQA 1U87A 3RAZA 1XVWA 1Z7RA 3D21A 2H66A 2NVLA 1XZOA 3VWVA 5H5QA 3L9UA 2F8AA 2H8LA 3QFBC 4ZBAA 1UC7A 4Z7XA 2CVKA 3FW2A 2V32A 5G30A 5LCZA 6GSSA 2GQMA 4ZB6A 4F2IA 4F82A 1DBYA 2H0GA 4J56E 4O5RA 4K2DA 1GTUA 4TR1B 4MF6A 5AIVA 4MA9A 4GXZA 3DWVA 2LJKA 4HDEA 5E4WA 3GN3A 5F06A 3IK9A 2GZZA 3GURA 1FO5A 3TKSE 3FHKA 2PVQA 3DRNA 1BYEA 1EV9A 3H79A 3A5WA 1B4PA 2C8UA 2H1DA 5ELGA 4TN8A 3CSIA 5IMAA 5IOWA 3IRAA 3KJYA 2KUCA 2VL3A 3EMXA 3TRPA 2HI7A 4KCAA 4FYBA 5J5NA 2PVOC 5CRDA 3RHCA 2GQKA 2H30A 1ILOA 4K0GA 3TOUA 4FIWA 2C3QA 2YANA 3IHQA 5F07A 2DC5A 5INYA 4F0BA 1T1VA 5AISA 3LJRA 2LRTA 1GTIA 2PGTA 3TJKA 4NWYA 4ZB9A 2H19A 2V1MA 5DAKB 2HZEB 3DKSA 2MMAA 3BBYA 1GRXA 3VPTA 1XIYA 3TUEA 3H4KA 4V2MA 3UIWA 4F0CA 3FK8A 3F3QA 1PD21 1X5EA 2X99A 4AJ8A 2VLUA 2HE3A 1JFUA 2OE0A 4NHZA 1SJIA 2IJYA 1SK0A 1XXUA 4ML1A 1QXHA 4BVYA 2OBIA 5G5EA 2JL4A 5KN2A 4YAPA 2PERA 1TW9A 2WDUA 3UEMA 4OFMA 1WIKA 1AIUA 1SL0B 2YOIA 4LMWA 1OC9A 4X1UA 4L0WA 5DVBA 1A0FA 3QMXA 2JZTA 1EEMA 2PN8A 4MK3A 2XHFA 2LTKA 3ISOA 4WF4A 2LKUA 5IO0A 5HR2A 4GSSA 4YQVA 1X9SB 2FWFA 1AQWA 3ZYWA 2TRCP 3VWWA 1R26A 2H71A 4QL7A 1K3LA 2J9HA 2H75A 2XPDA 4KDUA 2OKAA 4PX1A 2E0QA 1XOBA 2G2QA 1FVKA 5EVOA 3FZ9A 1S3CA 3D22A 3IDVA 3QDNA 1ZGNA 4PQIA 1G6WA 3LEFA 1FAAA 3DVWA 3EWLA 2CX3A 6GSYA 4O7HA 1EOHA 4KDYA 4KGIA 3KH7A 1GP1A 3F0IA 2O7KA 1VF2A 3VLNA 4YAVA 1GNEA 1SK2A 3ZTLA 2A2SA 5ECOB 1PMTA 2JZSA 3ZL5A 2IPAA 3HJPA 1OYJA 2E2MA 4ULXA 1T4YA 4WXTA 1VF3A 2D2ZA 1GTBA 2VLTA 3CMIA 5D73A 1V98A 1SK1A 3IOSA 3S9FA 5D8IA 4X43A 3M9KA 2YV9A 1OE7A 3CRTA 2LRCA 3VURA 3FY7A 4MJAA 1A24A 3F4TA 2BMXA 5HR0A 1YY7A 1TP9A 1DUGA 3C8EA 3GA4A 1ZL9A 4QL9A 5F05A 1XW5A 4PXOA 5D96A 4PGTA 1U6TA 2VCZA 4I2UA 1GSDA 2M80A 1TDIA 2P5RA 2OACA 2GZYA 3BCIA 1E6BA 4IKHA 4Q5QA 2HYXA 2CZ2A 3GL3A 4POBA 2VLVA 2I9HA 3BJ5A 2CQ9A 1XWCA 5DQSA 5COHA 3EC3A 2FNOA 1MDJA 1XWKA 1XW9A 4IQAA 3K8NA 4DVCA 5DJMA 2KP1A 3ZFBA 4TXVA 5IMDA 2PBJA 2RIIA 3ZREA 4TRXA 3APOA 2HZFA 5G1LA 4NV5A 3KEBA 5IMFA 2CX4A 4TXOA 4ECIA 2LQOA 3DMLA 2VAFA 5ABRA 1W4VA 1SKRB 3RBTA 4ZBDA 3LG6A 3TB2A 2WS2A 3UAPA 2DJ2A 11GSA 2I81A 1FW1A 1THXA 5D9WA 1HQOA 3I9V2 1AQXA 1YEPA 4OFNA 2VD1A 3DXBA 4IW9A 3W8SA 2MYGA 2B3SA 2K9FA 4PUAA 3RHBA 1TK8B 2CAQA 4E8EA 1F6MC 2VOCA 2DBCA 4G9HA 1ABAA 5GSSA 2B7KA 1G7EA 2H74A 3QPMA 1EV4A 4G10A 2P0GA 2JU5A 1IYIA 4TR1A 4EUYA 5ECKB 4HU7A 4ECBA 3IXRA 1CQGA 1M99A 3EU3A 4N0ZA 5E59A 1WOUA 2PMTA 3IAS2 2XBIA 2FGXA 3D4MA 5ECHB 1A2JA 4IQ1A 5ELAA 1SL2B 2F9SA 1M0UA 2YZUA 2F8FA 3HY2A 5A4UA 4N0VA 2K8SA 3UBLA 22GSA 2A2RA 5JCGA 2L59A 3EINA 2EC4A 2BJXA 2V6KA 2GSQA 1O8XA 4BA7A 9GSSA 2E2GA 1Y25A 2H1AA 1PX7A 2LSTA 1K0MA 3WT1A 1EEJA 2NBSA 3CRUA 2P31A 2R5GA 4F9ZA 3IBHA 4MDCA 4OWYA 5H5RA 2LQQA 1U3IA 1GTAA 2FCHA 2IL3A 5IQYA 19GSA 1TK5B 5DAKA 2HZEA 3GH9A 1GSUA 4GQCA 4POMA 5CRHA 1YZXA 2V2GA 3GIXA 1TRWA 3HJMA 1RW1A 3CTFA 4NAXA 4HQSA 3D4TA 2VL2A 4YH2A 1H75A 2H6XA 3KD0A 4YQUA 3A3TA 4HOJA 18GSA 5FHIA 2DJ1A 4RUVA 1TKDB 2K8VA 1O6JA 3P8WA 5AN1A 3P90A 2DMMA 1F9MA 4I8BA 2HSYA 2H0IA 14GSA 5CAXA 4WR5A 2K6VA 1G6YA 4TR3A 5L71A 3TGZA 1W89A 5IM9A 5GSTA 3L4NA 1X9MB 2ZUPA 3UL3A 5DDLA 1VF1A 3FRCA 3F6FA 16GSA 2Z9SA 4J57E 5HR3A 4MJBA 4KH7A 1DE2A 3IC4A 3D5JA 2FD3A 5EY6A 1K0DA 2VCXA 3TRQA 3PH9A 5ID2B 2L4QA 3WGDA 2J23A 3M9JA 4ZL7A 5ECIB 4OO5A 1ST9A 2VM1A 4GLTA 4WEYA 2B5XA 4MJEA 3HVXA 4XS4B 2GS3A 5DCHA 2GDRA 2FLSA 3LFLA 3KMOA 2N5BA 1SD9A 3TJBA 1KEBA 3UVTA 3W6GA 5CNWA 4IJIA 4PURA 3HD5A 5J41A 1K0AA 3FR6A 3QCPA 1QFNA 4GWRA 3TDGA 3TJGA 1UN2A 4TR4A 2WRTA 2B7JA 1A2MA 1F3AA 3LGCA 3MNGA 1PKZA 2VCQA 2MBSA 3BD2A 2YPMA 3IK7A 3GFKA 3H1NA 3HYPA 4KB3A 2FWGA 1SD8A 2GSRA 3LSZA 4Q5NA 4ISDA 3PINA 1HNBA 4YQMA 3L9VA 4XHMA 1X5DA 3F6DA 5JWQB 1A8LA 3ZLPA 4EF0A 2GLRA 3UVHA 2REMA 4ZIJA 2GQLA 3NIVA 6GSVA 1GSSA 3IPZA 2TIRA 4IVFA 2DLXA 3O3TA 2YP6A 1C72A 1FG4A 4N10A 3MDKA 1DE1A 1N2AA 5LNKe 1K3OA 4GQFA 2C1YA 2XC2A 3HJOA 5DQYA 2VCTA 1ACVA 2JACA 3TJJA 2ON5A 4OFTA 4Q5FA 1AAZA 3Q6OA 3LQ7A 3QAGA 4OMVA 5CRWA 1ERTA 1V2AA 1VRSD 5GAND 3GSSA 5KN1A 3IV4A 5CREA 3LORA 3GHAA 1AC1A 3GRXA 2L5OA 2B5EA 3WGXA 1O81A 3O6TA 1WMJA 1FVJA 2AUVA 4GF0A 4K8MA 1PQNA 4TOPA 3NZNA 1QK8A 3I6AA 2PWJA 2KP2A 4QQ7A 4MH2A 2O85A 1WJKA 4FYUA 3U5RE 3DIEA 1M9AA 3TKSA 2GZPA 3ZFLA 3ZMLA 1Z7PA 2YN1A 2LNTA 5G5FA 1OKDA 3AY8A 4PNFA 5ECQB 2GSTA 2EIOA 4PUFC 5CYYA 4XS1A 1EP8A 4JR4A 4O92A 3KXOA 3TKRA 2O87A 4HQZA 1H4OA 4MF7A 4EXJA 3EYTA 3DVXA 2WFCA 3HXSA 1XWAA 2CAIA 1ZYQB 1I9DA 1XW6A 1B4QA 2L6DA 17GSA 3ZZXA 3J7Yk 1YKCA 1QUWA 1NM3A 4MF5A 2HLSA 3DYRA 1A2LA 3LYKA 1F3BA 1YJ6A 3MWHA 5JWOB 1ERWA 4K7NA 1BEDA 4JR6A 1J08A 2DIZA 1GH2A 1CQHA 2RUFA 3ZITA 4EKZA 5A5KA 3KP8A 3LYPA 5CP1A 2IMKA 2DJKA 2VIMA 1YQ1A 1GL8A 4XCSA 4XS6A 1AUCA 2AAWA 3VWUA 1YEXA 5EL8A 3SWLA 4IS0A 1B9YC 1XWBA 4CHSA 1TU7A 4HZ2A 3GKKA 1X9WB 3G9BA 4KNDA 2FY6A 1DSBA 2IMEA 2GTUA 4K6XA 1R5AA 2MMZA 5JCWA 1R7HA 1O73A 2C0DA 3N5OA 1Z6MA 1AQVA 3JCML 4RI6A 3GTUB 3TKQA 4K7IA 1T4ZA 1ERVA 2H0HA 4K9ZA 2XBQA 2O89A 4IELA 2YJ7A 1XOAA 13GSA 2X8HA 2VCWA 4IGJA 4D73B 3N9JA 2H70A 1K0NA 1K3YA 1ZCPA 4RQXA 3EE2A 3M0FA 5J3RA 4FYCA 1KTEA 2H01A 2EIQA 2M72A 2CVBA 4KE3A 2MBTA 1SJ6A 2VM2A 4HJMA 1HYUA 2XPEA 2IMIA 3H8QA 3IR4A 3IAM2 1EZKA 4BWSA 1BG5A 1Y6EA 3A2XA 4I6XA 1JHBA 3FZAA 1XPVA 4EDZA 3D6IA 3VI5A 3APSA 3CYNA 3KH9A 3KP9A 3M3MA 4GSTA 2C0FA 4EC0A 1S3DA 3ERFA 5J9CA 2M46A 1O8WA 1TU8A 1VF4A 2OADA 3KM6A 4BVXA 1A8YA 3QR6A 2ALBA 5ID2A 2KOKA 3J7Yb 2OJLA 2GGTA 1B8XA 2R4VA 2G0FA 4L0UA 20GSA 2AHEA 4XS4A 1K0BA 5D9XA 1YKAA 2KHPA 1SENA 1K0CA 4KA0A 1SJZA 1GUMA 2VUPA 1MD3A 2IMDA 3RPPA 1ZOFA 4ZXGA 2I4AA 1MDIA 3VWXA 4MLYA 3HA9A 7GSSA 2FA8A 1Z5YE 4I97A 5IMZA 4JE1A 3P7XA 4MPFA 4N11A 4N30A 1FB6A 1UA5A 4GRFA 1TI1A 2HT9A 3RDWA 2YJHA 3TRXA 4E8HA 1V58A 3TKPA 2YCDA 4ZB8A 2I3YA 4LMVA 4J2FA 3EURA 2GT5A 2H1GA 4KCEA 3H93A 2IN3A 4OCEA 1QMVA 1JLWA 1PA3A 2R6KA 3GUSA 4EL1A 2PU9C 2YWMA 4HZ4A 3OR5A 2YWNA 4IHUA 3HZ4A 4LL4B 4JBBA 3GNJA 3HKRA 3M8NA 3Q74A 2YNXA 1YF1A 5IPHA 4XRAA 1KBNA 4LL1B 2MMNA 1ML6A 3F8UA 3E3EA 1URMA 5D93A 1XBSA 1HD2A 4MMMA 1PRXA 2DIYA 2JADA 5IOXA 1IYHA 1SKSB 3GKXA 3EU4A 3US3A 4DEJA 4EE0A 2YV7A 3GL5A 3KGKA 2L6CA 4K7OA 1YF0A 3GMFA 2OA7A 5DCGA 1T8EB 5IMCA 5DALB 2H73A 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chains in the Genus database with same CATH homology


 
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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