1XOAA

Thioredoxin (oxidized disulfide form), nmr, 20 structures
Total Genus 35
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
35
sequence length
108
structure length
108
Chain Sequence
b'SDKIIHLTDDSFDTDVLKADGAILVDFWAEWCGPCKMIAPILDEIADEYQGKLTVAKLNIDQNPGTAPKYGIRGIPTLLLFKNGEVAATKVGALSKGQLKEFLDANLA'
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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publication title High-resolution solution structures of oxidized and reduced Escherichia coli thioredoxin.
pubmed doi rcsb
molecule keywords THIOREDOXIN
source organism Escherichia coli
molecule tags Electron transport
total genus 35
structure length 108
sequence length 108
ec nomenclature
pdb deposition date 1995-11-28

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00085 Thioredoxin Thioredoxin
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.30.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich Glutaredoxin Glutaredoxin 1xoaA00
1QQ2A 5B8BA 1FW1A 3IV4A 4HJ2A 5D96A 4J2FA 1YEPA 1J0FA 2B6MA 4J57E 4V2NA 1XOBA 1GH2A 16GSA 3UBKA 5JWOB 1M99A 4FYBA 3GL3A 1AIUA 3CSIA 3FKFA 11GSA 1KBNA 4KB3A 4E8EA 2AV4A 2MMZA 1THXA 2GZZA 1YKCA 1SYXA 4OFNA 2FWEA 3CMIA 4G10A 1R5PA 12GSA 5DQYA 1M2BA 3R2QA 4YAVA 1OC3A 2CV4A 2VCQA 3QPMA 3ZIJA 4HS1A 2C3NA 3FR9A 9GSSA 2RM6A 3RDWA 3F6DA 4IQ1A 4DSSA 1DE1A 3TJBA 2JL4A 1XWKA 1X5EA 3DVXA 1DBYA 1Z5YE 3KTLA 4QQ7A 1XBSA 1CQGA 4TR0A 2DJ0A 4IBPA 2HYXA 2LRCA 3UJ1A 4F9ZA 1M2AA 1BG5A 1Z7RA 4L5OA 5JCUA 2YWNA 4I5QA 5H5RA 2VAFA 2LNTA 1EP8A 2VUPA 2PPTA 3EU3A 1OE8A 5D93A 2YWMA 4DSRA 4XS4B 3FHKA 4KAEA 3HDCA 4IVFA 2YWIA 4N0ZA 3QR6A 4XIHA 3HZ8A 5CNWA 3UAPA 3VI5A 1EZKA 1ZGNA 3GFKA 4K0NA 2JSYA 5GSSA 4QL9A 2FWGA 4L0UA 3O6TA 2MMNA 3CTFA 3A2VA 2WB9A 1BYEA 1SJ6A 1HD2A 2RUFA 2BMXA 5DJMA 1WPIA 3TOUA 1MTCA 1F3BA 3D6IA 5IMDA 4MJBA 1O81A 2FA4A 4F03A 3M1GA 3ZLPA 3LXZA 5DQSA 2PN8A 2QGVA 1BX9A 3LQ7A 1ERTA 5DALA 2VM2A 4IHUA 2VCXA 1ILOA 5KN1A 2PVQA 2YJ7A 2WDUA 1EP7A 2B5XA 4I2UA 3TJGA 1U87A 2LRTA 3S9FA 1Q98A 4GRFA 2YANA 4MCUA 3TKSA 4OO5A 1T4ZA 1TRWA 5DDLA 2E7PA 1AQWA 3QAWA 2VLTA 1GSEA 1THOA 2YJHA 1A2LA 5CP1A 2XC2A 1OVNA 3EURA 1Y6EA 4K9ZA 1PKWA 2H76A 2H0GA 5J4UA 5IIZA 5FWGA 5ECKB 1A23A 3QOUA 3VK9A 4MH2A 4JE1A 4YH2A 3EWLA 1NM3A 2R5GA 5G2ZA 1N8JA 1OE7A 2TRXA 3KCMA 4PQ1A 3IPZA 4WBJA 2CT6A 3C1SA 2H73A 3MSZA 4F82A 1PX6A 3TRXA 2OA7A 3ZIVA 2H1GA 3PR8A 3E9JB 3ZVJD 4IN0A 2P5RA 4MA9A 2OE3A 3VPQA 1K0NA 5IPGA 3UMAA 4DEJA 2AUVA 2C0FA 2F8AA 2R3XA 3GMFA 4IP6A 1DSBA 4DSSB 1JZRA 2CZ3A 3TDGA 3KP9A 5ID2A 4KDUA 2V6KA 1XWGA 5KN3A 3DKSA 4TXOA 4NV2A 4XRDA 1GP1A 1KTEA 2KP1A 3N5OA 3ZYWA 1NHOA 2PUKC 1GSFA 2ALBA 3A2WA 3DD3A 1B9YC 1U3IA 5DAKB 4ULXA 1KEBA 2NBSA 1QXHA 2N5BA 1XCCA 1OC9A 3W8JA 2ES7A 3IOSA 3IXRA 4MDCA 1R26A 5HFKA 4IJ3A 1O6JA 1BQ7A 2QSIA 4PGTA 4MJCA 2OJLA 1ERUA 3KH7A 3HYPA 1XWBA 1O85A 5DCHA 4BVYA 4KH7A 3FYGA 3LYPA 3KH9A 5J41A 7GSSA 2AAWA 3EE2A 1EOHA 3VFIA 2FLSA 1SJIA 2GZPA 2HRFA 1TTZA 4MMMA 1VRSD 1V98A 1SK2A 1XOAA 3GN3A 1X9SB 1XFLA 5ECRB 4Q5QA 5B6NA 3GV1A 3GX0A 3LXTA 3SWLA 4LA1A 2O87A 1K0BA 4WR5A 4TN8A 2IMDA 1G7OA 1Z3EA 1ACVA 5DBQA 5ECPB 3GNJA 2R2JA 4N10A 4JZQA 4PNGA 4L0WA 4V2LA 1G6YA 3FY7A 1X0RA 3BCKA 4Q5NA 3F4RA 4NHZA 1MD3A 2VLVA 3GH9A 4J56E 4D73B 1Y25A 4KDYA 1M7TA 1T3BA 2B5YA 1TU7A 4X0XA 4X1UA 5B6MA 2CX4A 2FCHA 3I6AA 4ECJA 2JADA 1HNAA 2O7KA 3H93A 4ZIJA 3UVHA 2KOKA 3LFLA 3ZFLA 4KW6A 4F0CA 4QL7A 1SL1B 5DVBA 5B8AA 2VD1A 2NDOA 1SKRB 4K0GA 1YY7A 3D4MA 5DCGA 1JLWA 4EO3A 1SK0A 3M0FA 3JCML 5COHA 1O8WA 6GSUA 1AUCA 1GWCA 4MF6A 2JSZA 1VF3A 1FAAA 1SENA 2DJ1A 3ZVJA 3CRTA 2F8FA 2M72A 2CVBA 2HFDA 1ZOFA 5ENUA 2MMAA 4XS4A 1A0FA 2C8UA 1EGOA 4V1Ap 2FHEA 3ERWA 1V2AA 4KGIA 4RI7A 5ID2B 3WD6A 3ZMLA 1PA3A 2VM1A 2BTOT 2YPMA 3GH6A 1XZOA 2I1UA 3ZITA 2JZTA 2TIRA 1EOGA 5J3RA 4ML1A 2A2SA 4TW5A 5HQPA 10GSA 4NAXA 3P8WA 5ECQB 1YKAA 4AF2A 1OAZA 3NOFA 1K0OA 1GTAA 2L6DA 2H8LA 3F0IA 1V40A 3GSSA 1SD9A 4POBA 3HJPA 1ERWA 1X5CA 4KUNA 5FT3A 4TR4A 5ECMB 5EVOA 4MP4A 4EDZA 1RQMA 2E2GA 5IO0A 5AGYA 4O7HA 3F9UA 2HLSA 3TJKA 1GUMA 3MWHA 1XWCA 3RPPA 4ZL9A 5G5EA 1FB6A 4MZBA 2C0GA 3FEUA 5HR3A 1AQVA 1ST9A 4NMUA 4TR1B 5ELAA 4XCSA 4H86A 2IFQA 3CRUA 3HVVA 1LJRA 2GS3A 2X8HA 4ML6A 1B48A 1TDIA 2OKAA 3M8NA 2DC5A 5KEJA 3D22A 2HNLA 4XRAA 3E0UA 3GKKA 4DSQA 2IPAA 5ECOB 3IC4A 1M9AA 4BPYA 3HD5A 4IGJA 5CRHA 2JU5A 3EVIA 3QAVA 2I9HA 3LG6A 2G2QA 3HZ4A 2H1BA 2WFCA 5JCWA 3CSJA 2QKEA 4LL1B 1T8EB 2IIYA 3Q19A 1GNWA 3QMXA 4POMA 5A4UA 3F8UA 5G1KA 5AN1A 3CYNA 3H1NA 2E2MA 2X64A 4NWYA 3C73A 2YCDA 2GGTA 2CX3A 3DEXA 5IM9A 2R4VA 4IKHA 5HR0A 4TVEA 1X9WB 1JFUA 1URMA 2VL9A 5IQYA 4KSMA 4AGSA 3H79A 3G7YA 2HT9A 2O89A 1F3AA 1AXDA 3BJ5A 4K7OA 4ZL8A 3KTBA 3C7MA 2LRNA 4LMVA 2V1MA 3FR3A 5DAKA 1FVJA 5LNKe 1ABAA 1GTUA 2HI7A 2IWTA 3WGXA 3J7Yk 3PGTA 4JU5A 2FY6A 3G7IA 4N11A 1WRYA 2LJKA 3TGZA 2PU9C 4ZB6A 2GLRA 3J7Yb 4I2TA 2AJQB 1FB0A 2L4CA 3IR4A 1FOVA 1W89A 5KN0A 2V6OA 3US3A 4WF4A 2GQLA 5E59A 4OCEA 3GX8A 4OFMA 4OO4A 2A2RA 2EIQA 5ABRA 3IA1A 4MLYA 5GZZB 2L59A 3KP8A 5ECSA 1Z9HA 4NHWA 3IDVA 3F6FA 3BBYA 5F06A 2MYGA 1KNGA 1EEMA 3KMOA 2JACA 4EE0A 4EKZA 1R7HA 2LS5A 2JZRA 1HNCA 3VURA 2B1KA 4POLA 4WBRD 3TRPA 1YJ6A 3DXBA 3TB2A 4ZB8A 1AAZA 1MD4A 1BJXA 4D73A 4GLTA 2IN3A 2YV7A 3P7XA 1ZYQB 1A24A 1Z7PA 5E4WA 2HE3A 2IFQB 4O32A 5EY6A 5GAPD 3EC3A 2H1AA 1Z6MA 1QMVA 3C71A 2LKUA 1TXXA 3TUEA 2V2GA 4NXIA 1G6WA 3LEFA 3ERGA 5JCGA 3ISOA 5CYYA 2H6ZA 4WF5A 1QUWA 1XVWA 4MABA 5JWQB 3IAS2 2R37A 1MEKA 1GSSA 1K0MA 4GSNA 1XWAA 3Q6OA 3BCIA 2RUEA 2PMTA 5ELGA 4ECIA 4KX4A 3H8QA 3KMNA 5KN2A 5CRWA 4BWSA 4HI7A 1TRUA 4EL1A 2ZNMA 3O76A 4HZ2A 4XTSA 1VF4A 5INYA 2GTUA 4HJMA 4I8BA 4PURA 2I4AA 4XS1A 2EIRA 1YZXA 2YNXA 3F63A 4YQMA 4KNDA 4NPBA 1VF2A 3GL5A 1K3YA 4IQAA 4I97A 4MJEA 3VLNA 2CAQA 1A2MA 3A3TA 3UEMA 1S3DA 1VF1A 5D9VA 2CAIA 4LLRA 1NSWA 2RIIA 2JZSA 1K0CA 3FZ5A 3P90A 5JWRB 3W8SA 4X43A 3LORA 4Z7XA 1OKDA 2H66A 3VWWA 4LL4B 3DWVA 2OE1A 1U88A 2WS2A 3C8EA 6GSXA 2MBTA 5F8BA 2H19A 5G1LA 1M9BA 3APQA 4HEA2 1GUKA 4GTUA 3ZMKA 4Q5FA 5IMZA 2GQKA 5D9WA 2MMOA 5ECHB 1J08A 2M46A 3G9BA 1A2JA 2ZCTA 1PD21 3DYRA 3C1RA 1EWXA 4TXVA 1SYRA 2K8SA 1GSUA 3IE3A 5AIVA 4ECCA 4TR1A 2L5LA 3PINA 4GSSA 4GSTA 4GWRA 1FVKA 1W4VA 3QFBC 2XBQA 3Q74A 2H70A 4V2MA 4G2EA 1BAYA 1JZWA 2HZFA 2V41A 5A4VA 2HRNA 3FRCA 2DIZA 2K18A 2PWJA 3EU4A 5F05A 3QDNA 1JZDA 1SKSB 4GQFA 1ZYEA 1YEXA 4KCEA 4MK3A 4K2DA 3A5WA 1V9WA 1YF0A 4I6XA 3NIVA 4K1FA 1JLVA 8GSSA 4EUYA 2LSTA 4EXJA 2XBIA 3KEBA 4POKA 3D5JA 4ZBDA 3RBTA 1XVQA 2IJYA 3HXSA 4RI6A 3VWVA 1AQXA 3UL3A 3ZREA 2DJKA 1YF1A 3H4KA 3HVXA 4TRXA 1F37A 2LQOA 1SK1A 1RK4A 2WZ9A 2H6XA 3CXGA 5GSTA 4JR4A 3D0ZA 5A5KA 5HR1A 3WT1A 3TKSC 2VCVA 3HKRA 3LGCA 3FZ4A 3IAM2 2PBJA 2E0QA 3LSZA 2HSYA 2B1LA 3ME7A 2NPBA 3KIJA 3LJRA 2FD3A 5IPHA 1AW9A 5IO2A 1MDIA 3OR5A 3KD0A 4RQXA 5LD0A 1V58A 2VO4A 4TKYA 1I9DA 1NW2A 2IMEA 1JZOA 2CVDA 5C04A 3DRNA 1NHYA 4FO5A 2YP6A 6GSWA 5L71A 2B3SA 1TW9A 5DJLA 3RPNA 1USBA 1TU8A 1B4PA 3IRAA 4JRRA 1G0TA 3UBLA 1WIKA 1OYJA 3RAZA 3U6VA 2ON7A 3RHBA 3RHCA 3PH9A 3F3RA 2XHFA 1R5AA 4IS0A 3KXOA 5IMAA 4K6XA 6GSYA 4PXOA 3GKMA 1O8XA 2KLXA 4NV5A 3UIWA 2VLUA 1TK8B 2YN1A 2VIMA 3F3QA 2H74A 3WYWA 2N5FA 5HFIA 3W6GA 3FZ9A 3WGEA 3EMXA 3DVWA 4O5RA 2GSSA 4MJAA 1K0DA 3I9V2 4EVMA 2P0GA 4GCIA 1XW5A 2VCTA 2AHEA 1GL8A 4HZ4A 1EV9A 2PVOC 1S3CA 2L4QA 4IELA 4MF7A 3I43A 2C80A 1PKZA 2H0HA 1EGRA 4XS6A 5HFGA 4JR6A 2F9SA 3D4TA 4MH3A 2D2ZA 4F2IA 5D73A 1TI1A 3GKXA 4AJ7A 2EIOA 1C72A 1XPVA 2M80A 4DVCA 4YQVA 1PQNA 1GTBA 3NZNA 2H75A 1B4QA 5IMVA 1K0AA 2AB6A 2C4JA 1WWJA 1TOFA 3HY2A 1O7UA 2XPEA 2H71A 5AIXA 4ZBAA 2J9HA 3ZFBA 2LTKA 1PSQA 3GURA 2H01A 3UVTA 2IL3A 19GSA 2HZEB 5F0GA 4KDXA 3TKQA 2NTOA 4HDEA 4TR3A 3TKPA 2O8VB 2H1DA 3HJOA 3KM6A 1GLPA 4HQZA 3QCPA 5G5FA 2YZHA 4HUAA 2LNSA 1SL2B 2CVKA 1PRXA 3WT2A 1ZZYA 2F3MA 2L6CA 1IYIA 1SJZA 5IOWA 2A4VA 22GSA 1TP9A 5B7CA 4CW9A 2FUG2 4K7NA 3ZZXA 1CQHA 3DIEA 1J9BA 1T7PB 1IYHA 3K8NA 4PUFC 4OD7A 2AYTA 2DIYA 5J5NA 3L78A 3MAKA 4ISDA 2ON5A 1XXUA 2REMA 4KE3A 1LU4A 2H6YA 2RM5A 5CRGA 1XW6A 4L8EA 4N0VA 17GSA 3F4SA 1U6TA 2VL2A 1Q4JA 4ZBBA 2GSRA 4FYUA 5H5QA 1GSYA 3DGQA 4RUVA 3GTUA 1MDJA 1UA5A 2LJRA 1PX7A 1F6MC 3MDKA 2CQ9A 1F2EA 2C0EA 20GSA 4ZL7A 4YQUA 3O3TA 1TRSA 3I69A 3L4NA 2FA8A 1TK0B 5ECNB 1UN2A 3MNGA 2LV3A 3HHVA 3VI7A 5A4WA 2GSTA 4G9HA 2YOIA 5G31A 1GRXA 3Q18A 1EV4A 2F51A 3F4TA 1HQOA 1YDKA 4GQCA 2NVLA 2L5OA 2QC7A 2GZYA 3IK7A 3VWUA 2XPDA 1K3LA 2YZUA 1F9MA 4JBBA 4LMWA 3FK8A 4MPFA 4OFTA 5ECLB 4KSOA 1PL1A 5GAND 1S3AA 2DSAA 3ERFA 2VL3A 4PX1A 2X99A 1DE2A 4WXTA 4Q5RA 3E3EA 3HA9A 5D9TA 2KHPA 2DBCA 2Z9SA 1OC8A 1U3AA 2GT5A 3AY8A 2OE0A 1H4OA 1T4YA 3FW2A 1GNEA 1OKTA 4WETA 3N9JA 4BVXA 4XHMA 2DJ3A 2YV9A 3WGDA 1SU9A 1WMJA 1UC7A 13GSA 1V57A 2DMMA 4P3YB 3EINA 1LBKA 3KJYA 5J9CA 2WCIA 3FR6A 2I81A 14GSA 1HNBA 3IBHA 5F07A 3BOAA 2I3YA 1GTIA 4WKWA 5IMCA 1M2DA 2HSHA 2KUCA 1X5DA 2N5AA 3HCZA 2BJXA 1N2AA 3ZRDA 5C00A 4G19A 2GVPA 2C1YA 1YQ1A 1GULA 3ZL5A 2KP2A 3ME8A 1GLQA 3APSA 4GXZA 4ILFA 3L9UA 3L9VA 2TRCP 4HQSA 1A8YA 3GKNA 2B5EA 5EPFA 2MBSA 3L0HA 1TI3A 2YWOA 2H72A 1T1VA 4EF0A 1MDKA 3GIXA 5CREA 2VOCA 1TK5B 1GUHA 2P5QA 2H0IA 2RLIA 2O85A 5D9XA 3L9SA 2WGRA 2L57A 1ON4A 3ED3A 4V1Ag 2GT6A 2FWHA 3P2AA 4AJ8A 3HJMA 4BA7A 2OBKA 4N30A 4E8HA 3KGKA 3GYKA 4ZB9A 1O73A 4TOPA 1ML6A 1WE0A 2MZCA 1QGVA 2OBIA 3GTUB 2B7KA 2WRTA 1XIYA 5CRDA 1PN9A 1TRVA 2EC4A 4KA0A 2FNOA 2C0DA 2G0FA 1FHEA 1ZL9A 1XW9A 5AISA 2H30A 1PL2A 3GHAA 1BEDA 3G7JA 1G7EA 2CA8A 4O92A 4PNFA 3QD9A 3A2XA 5H5SA 6GSVA 2J23A 1PMTA 1QK8A 2LEGA 2PGTA 6GSSA 5LCZA 3V1WA 5HR2A 3LWAA 1Z6NA 2LQQA 4K7IA 4WEYA 4WR4A 4HU7A 3QFAC 18GSA 1HYUA 3M9KA 1WP0A 1TKDB 4KCAA 4OMVA 2HXKA 2VL2C 3BD2A 3D21A 4MPGA 2C3TA 5DALB 2K6VA 5EL8A 1VGLA 1A8LA 1DUGA 1GSQA 2IMIA 3GRXA 1H75A 5IMFA 2C3QA 3U5RE 1SD8A 1I5GA 1ERVA 4RQRA 2P31A 4EC0A 4ECBA 2HZEA 2V32A 1K3OA 4YAPA 4FIWA 4CHSA 2DMLA 1SKWB 4IW9A 3VWXA 1SL0B 4MZWA 2ZUPA 3DMLA 2K9FA 4HU9A 4PQHA 4GF0A 1JHBA 2PERA 1E2YA 1GSDA 5IOXA 4JEDA 4PUAA 5J9BA 4ZILA 4CDOA 3GSTA 1M0UA 1QFNA 3GA4A 4AJ6A 4FYCA 2R6KA 1B9XC 3IHQA 3TOTA 3EYTA 1RW1A 3M3MA 4ID0A 3APOA 1ZMAA 1FG4A 3HVSA 4IP1A 2K8VA 3TRQA 2X8GA 2VCWA 4ZXGA 3TJJA 4HOJA 1T00A 1AC1A 2WULA 3GUSA 1X9MB 1UVZA 3LYKA 4MF5A 3TKRA 1PGTA 1WOUA 4K8MA 3CSHA 1FO5A 4L5LA 1WJKA 5D8IA 4BWQA 4OCFA 3FZAA 1B8XA 5ECIB 3CTGA 2VD0A 3ZTLA 2CZ2A 2OACA 4EDYA 1EEJA 1R4WA 4TXOB 2IMKA 4FH8A 3TKSE 5G30A 4BL7A 2GSQA 2IMFA 3VPTA 3UARA 4OWYA 4ACSA 2VCZA 3QAGA 2OADA 2LUSA 2GDRA 3TJFA 1E6BA 1OC9B 2DLXA 5CO3A 4MZCA 2DJ2A 4PQIA 2DJJA 1ZCPA 6GSTA 4IJIA 2B7JA 2FGXA 2GQMA 3TCOA 5CAXA 2X8CA 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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