4JR4A

Crystal structure of mtb dsba (oxidized)
Total Genus 63
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
63
sequence length
197
structure length
197
Chain Sequence
DAVRVTSSKLVTQPGTSNPKAVVSFYEDFLCPACGIFERGFGPTVSKLVDIGAVAADYTMVAILDSASNQHYSSRAAAAAYCVADESIEAFRRFHAALFSKDIQPAELGKDFPDNARLIELAREAGVVGKVPDCINSGKYIEKVDGLAAAVNVHATPTVRVNGTEYEWSTPAALVAKIKEIVGDVPGIDSAAATATS
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
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molecule tags Oxidoreductase
molecule keywords Possible conserved membrane or secreted protein
publication title Structure analysis of the extracellular domain reveals disulfide bond forming-protein properties of Mycobacterium tuberculosis Rv2969c.
pubmed doi rcsb
source organism Mycobacterium tuberculosis
total genus 63
structure length 197
sequence length 197
chains with identical sequence B
ec nomenclature
pdb deposition date 2013-03-21

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF13462 Thioredoxin_4 Thioredoxin
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.30.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich Glutaredoxin Glutaredoxin 4jr4A00
2C3QA 2HNLA 3IC4A 3QFBC 3WT2A 4KCAA 1TRVA 1OC9B 5IMCA 3LJRA 1AQWA 1G6YA 2F51A 3H8QA 1K3LA 2VLVA 2HLSA 2LNSA 3PH9A 4KH7A 1ZZYA 3VLNA 3D5JA 3GMFA 1ABAA 2HYXA 4CDOA 4YQUA 2XBQA 1O73A 4K9ZA 4IVFA 4N11A 5CO3A 2GSRA 1THXA 5J9BA 3VFIA 1V40A 4NV2A 1DUGA 2ZUPA 1Z3EA 3IV4A 3IXRA 2LUSA 1SJZA 1XWKA 1N8JA 2OA7A 2YWOA 1BAYA 4G19A 4MK3A 4D73B 2VLUA 2R6KA 3ERWA 3HXSA 14GSA 1GTIA 2H74A 5IPGA 1MEKA 2GGTA 4J56E 1XOAA 1FVKA 1WP0A 4NPBA 1SL2B 2IIYA 5G1KA 2QGVA 1AAZA 1ZMAA 1W89A 2MZCA 4X43A 3GKKA 3CSJA 3KJYA 3CBUA 3LWAA 1QK8A 2WFCA 1GWCA 5DAKA 3IE3A 1EP7A 4GSTA 2DMMA 5ECRB 4PUAA 4F2IA 5DQSA 4WF5A 5ID2B 3I9V2 1ZCPA 4K1FA 1OC9A 3GH6A 3D0ZA 1SD8A 1YF0A 5F8BA 2C0DA 2M80A 4KDYA 4TR1B 1SYRA 1THOA 3WYWA 5A4UA 2PVQA 1ERWA 2H1DA 3F63A 3ZL5A 1PSQA 2K8VA 3CTGA 4WR4A 2LQOA 1T4YA 1M99A 5B8BA 1A24A 5ECLB 2YV7A 6GSWA 3HA9A 2YWMA 4YQVA 1R5PA 3APQA 1TW9A 2L57A 4BPYA 5J5NA 1AIUA 2C0GA 4XRDA 2VL3A 5ELGA 1SK0A 1V9WA 4NWYA 4JBBA 2HSYA 4FH8A 3E9JB 1O8XA 2AAWA 5G31A 1R5AA 2FHEA 1F6MC 3G9BA 4MF7A 5IMZA 3RDWA 3TKSC 2EIOA 4MH3A 3V1WA 5E4WA 1OE7A 4K2DA 2HZEA 5L71A 1F2EA 4IHUA 1GUHA 4FIWA 2V2GA 2RUEA 1BG5A 1NM3A 4F0BA 1GSEA 13GSA 1B4QA 4KGIA 2GSSA 4AJ8A 1M7TA 5IOXA 4NHWA 2GSQA 1EWXA 3E0UA 3KMNA 1W4VA 4EO3A 3C1SA 2LKUA 4KB3A 1A0FA 2O8VB 3EMPA 3E3EA 5HQPA 1WE0A 3O6TA 3UIWA 2DJ2A 5GAND 2B1KA 1FOVA 3ZITA 1PL2A 1YKAA 3WGDA 1HNCA 1LU4A 3QR6A 1SK2A 2GTUA 3A2WA 5KN1A 1WIKA 3HVVA 4Q5NA 4ISDA 3QMXA 2GT5A 4QQ7A 1GSYA 2HT9A 3R2QA 2CX4A 2L6DA 1R26A 3J7Yb 1M9BA 2OKAA 2FUG2 2WULA 2VAFA 1DSBA 3H1NA 4HU9A 1XBSA 3RPNA 2H76A 2LJAA 2HXKA 1PGTA 1A23A 1GNEA 2FA8A 2AV4A 3DD3A 3WD6A 2L6CA 4KDXA 1GTUA 4NAXA 2ZCTA 4JZQA 1PQNA 2F8FA 3RAZA 1V58A 4DSRA 1SL1B 1Z6MA 2F3MA 1A2MA 5JCWA 1FB0A 1ZOFA 4HUAA 4G9HA 2GQKA 5D9TA 1X5CA 2X64A 5ECMB 3FKFA 4ECJA 2R4VA 1XWBA 1B9YC 1VF1A 4YQMA 4BVYA 1A8LA 5COHA 1PA3A 2L4QA 5IQYA 1TI3A 2A4VA 3UJ1A 1Y6EA 4MJCA 2L5OA 3K8NA 3GH9A 1JZWA 3UVTA 4DVCA 3I6AA 1GSQA 4I2UA 1OC8A 3M0FA 3NOFA 4XS6A 2VCWA 4BWQA 4ZL9A 1F3BA 2H6ZA 2CT6A 4MZCA 1G7OA 4LL4B 1VF3A 5GSTA 4HZ4A 2LSTA 2VLTA 1YEXA 4HOJA 1KEBA 4MP4A 5D93A 1TP9A 1EOHA 4OO5A 1GSUA 3LEFA 4MPGA 5HFIA 4E8EA 4K0GA 2YP6A 1XW9A 1TU8A 3FZAA 2MBTA 2IFQB 4HEA2 4ACSA 1EV4A 3KEBA 2RM6A 4H86A 2B3SA 2ES7A 4V2LA 2K9FA 2LQQA 3UAPA 4MH2A 5B6NA 2JZTA 2C3NA 4WXTA 3C7MA 4GLTA 3IDVA 4K0NA 4V1Ag 4ULXA 4LMVA 2YZUA 3HDCA 3QAVA 1LBKA 2FWGA 2NTOA 4ZIJA 1OC3A 2F8AA 3QCPA 4F03A 1WWJA 3IK7A 3VPTA 5EL8A 5AGYA 2O89A 4XTSA 2PN8A 4ECBA 2PGTA 1BEDA 2DJKA 4MCUA 3TRQA 1AUCA 4QL9A 2HSHA 3ZFLA 3A2VA 4XCSA 2VIMA 1CQGA 3D4MA 6GSYA 2FWFA 1F9MA 2H0GA 3UARA 2IFQA 3HZ8A 3L9SA 3JCML 5CRHA 5AN1A 3VWWA 2CV4A 4GSSA 3CSHA 3LORA 3U5RE 3C8EA 3D4TA 3ERFA 5KEJA 1GUMA 1IYHA 4KAEA 4RUVA 3GKMA 1OKDA 1B9XC 3HYPA 1TRSA 1JZDA 2JSZA 1MDKA 4HU7A 3F4RA 3VWXA 1LJRA 5IMVA 5DJMA 4MMMA 1GLPA 2ON5A 1ERVA 3GFKA 5F06A 2DLXA 4IS0A 1HQOA 4ML1A 4OMVA 3TDGA 5A4WA 4KE3A 3PINA 1YEPA 2QSIA 1Z7RA 1YY7A 2B5XA 5ECKB 4MZBA 2OBIA 3TRPA 3C71A 1OVNA 3FW2A 3DVXA 1BX9A 3ME8A 4O32A 2KOKA 4HS1A 2FD3A 1K0NA 5ECNB 3ISOA 2PBJA 3HJPA 12GSA 1AQXA 1TDIA 2V6KA 1EP8A 3KXOA 1R4WA 1XFLA 2MBSA 2E0QA 3APSA 2XPEA 2LJKA 4TR3A 4TRXA 4XIHA 1T4ZA 5ECQB 4BA7A 3ERGA 2YV9A 4NHZA 2RUFA 5JCUA 4LA1A 1PD21 1XW6A 4ZBDA 5INYA 1O85A 5IM9A 2H71A 3BCIA 2I1UA 3N9JA 2QC7A 2CZ2A 1TKDB 2O87A 2I4AA 4HQSA 2CA8A 3HCZA 5KN2A 5ABRA 2WS2A 2DJJA 5G30A 1C72A 5J9CA 2FWHA 1XW5A 4TW5A 1XWCA 1JLVA 3MNGA 4BL7A 3HVXA 4PURA 5G5EA 3GSTA 4X1UA 4K7IA 2JSYA 3WGXA 3F3QA 2LRCA 3APOA 5CRWA 3TUEA 4MZWA 1XVWA 3L78A 1VF2A 1FHEA 1IYIA 2CVKA 3BD2A 3QFAC 2GZPA 3M3MA 1DE2A 1SYXA 3I43A 2CX3A 1X9MB 2GLRA 6GSXA 5KN3A 3ZYWA 3EVIA 1A8YA 2YPMA 2DJ3A 5ECPB 2IMEA 2N5FA 1TRWA 4IGJA 2IJYA 5E59A 3FRCA 2DSAA 4POMA 3FZ4A 2BMXA 4XS1A 3Q74A 3G7YA 5EVOA 2HZEB 3LXTA 4ID0A 3MWHA 5D96A 10GSA 2C3TA 2VM1A 4IJ3A 20GSA 2P5RA 2FY6A 4X0XA 3HKRA 3GKXA 2GS3A 3NZNA 2TRCP 4KSMA 5LD0A 3KZQA 3KMOA 3ZREA 4OWYA 2M72A 2IPAA 2H1GA 2L4CA 2BJXA 1X9WB 3KP8A 3ZMKA 1OE8A 2DC5A 4JE1A 1SKSB 3KGKA 2OBKA 3A2XA 2V32A 3EU4A 2IN3A 2P0GA 4Q5QA 4J2FA 2VCQA 1FVJA 5LCZA 3FR3A 4GWRA 3VWVA 2WCIA 2NVLA 2H75A 4GQCA 4F9ZA 2FLSA 2J9HA 4MJAA 3ZRDA 2REMA 4OCFA 2YWIA 3KD0A 3FZ5A 5HR2A 3P8WA 1MTCA 1WJKA 1V57A 3WT1A 4NXIA 4TR4A 5DJLA 1ZL9A 1S3CA 4MLYA 5G1LA 4IKHA 2CAIA 4JRRA 2OACA 4PX1A 2EIRA 4MPFA 5IMFA 1G0TA 2HE3A 3ZIJA 3F9UA 1MD3A 1BQ7A 1GSDA 3FY7A 3DIEA 1VF4A 2DMLA 8GSSA 3UMAA 4OFNA 4TXVA 2MMOA 4CHSA 2NBSA 2BTOT 4V2MA 1A2JA 1TTZA 4POBA 2OE3A 3TCOA 3DGQA 2PVOC 1MDIA 2RIIA 1GLQA 2H8LA 3CRUA 3GN3A 3W8SA 5HFKA 1U87A 1Z5YE 1M2BA 1I5GA 3DKSA 1M2DA 3BBYA 1BJXA 1FO5A 2C8UA 2CVDA 5FWGA 3ZIVA 2VCTA 1GSFA 4V1Ap 4PQHA 1UVZA 1YQ1A 4L8EA 1XWAA 2B6MA 1RK4A 2XC2A 4V2NA 3VURA 3GRXA 1GNWA 1E2YA 1PX7A 2G0FA 2N5BA 4I5QA 5G2ZA 2JZSA 1CQHA 1PRXA 2X8HA 1M9AA 2LV3A 2H66A 2HZFA 3KTBA 5ELAA 4POLA 2E2GA 4WR5A 2R37A 4HDEA 5JWOB 2WGRA 3MDKA 3EMXA 4ZILA 4OCEA 4PQIA 2DIZA 3F4SA 1J08A 2VL2C 4ML6A 4EDZA 5IMAA 2TIRA 1K0BA 1HD2A 2AUVA 3DVWA 4K7OA 1OAZA 2FCHA 4ZB6A 2R3XA 3HZ4A 3EINA 4DEJA 11GSA 4BWSA 3FYGA 1Y25A 5J4UA 4GTUA 3GL5A 1Q4JA 1SD9A 5JWQB 3F4TA 2PUKC 3FR9A 1ERTA 1KTEA 2ZNMA 1S3AA 4TXOA 1ZYEA 2V6OA 3LYKA 2LJRA 5B8AA 6GSVA 5DDLA 2YCDA 3H79A 3TOUA 2JACA 4XS4A 1ERUA 3Q19A 3HVSA 3CMIA 1KBNA 1AXDA 4DSSA 3AY8A 1K3OA 1PKWA 4HZ2A 4NMUA 5IPHA 2HFDA 1NHYA 4WKWA 2TRXA 2KLXA 1TU7A 1TRUA 2H70A 1HNBA 1TOFA 2B7KA 2WJUA 3P7XA 1N2AA 4BVXA 2K18A 2H01A 3F6FA 4EF0A 4IELA 1H75A 2KP2A 4L5OA 2GDRA 2YWNA 2GZYA 1J0FA 1F3AA 1ZGNA 3BJ5A 2YN1A 2I81A 2H1AA 2P31A 3O76A 4LLRA 4Q5RA 3HJOA 1GSSA 2LS5A 3W6GA 1T7PB 1R7HA 1WMJA 3UL3A 1Q98A 1U3AA 4N10A 4CW9A 2DJ0A 4NV5A 2VD0A 3IPZA 3PGTA 1SU9A 4K6XA 5HFGA 1SK1A 1XXUA 2H30A 4E8HA 1XVQA 4EUYA 3GX8A 3DWVA 4J57E 1ILOA 2YANA 3OR5A 1T8EB 2D2ZA 2NPBA 3F0IA 4MF6A 4IW9A 1U3IA 1X0RA 4HQZA 4I97A 5JCGA 3F6DA 2LTKA 4MA9A 3FEUA 2GVPA 5ECHB 2DIYA 2O7KA 1WRYA 2X8CA 2C80A 3I69A 1A2LA 3VI7A 3TOTA 3KTLA 2CZ3A 3TJKA 1TK5B 1AQVA 3UBKA 17GSA 3BCKA 2X8GA 3FK8A 3L0HA 4MJBA 3VK9A 3FHKA 1MD4A 3CXGA 2I3YA 3DEXA 3UVHA 5AIVA 1NSWA 4ZXGA 2JL4A 4Q5FA 4O92A 4PXOA 1M2AA 3EE2A 4FYCA 1O8WA 5G5FA 2HI7A 4TR0A 4O5RA 1K0CA 1JHBA 1MDJA 2FNOA 1OKTA 3TKRA 2V41A 1SENA 1J9BA 3RBTA 2OADA 2PPTA 2V1MA 3H93A 2PMTA 1B8XA 2B5EA 1GP1A 4RI7A 1USBA 3HD5A 5IOWA 2GT6A 2OE0A 1YKCA 5GZZB 1E6BA 3M9JA 3GNJA 5AISA 2XBIA 3ZTLA 3LSZA 3CRTA 5CP1A 3L9VA 2N5AA 4F82A 4IQAA 1ACVA 2IL3A 2AHEA 3IR4A 1XOBA 4ILFA 1QUWA 3QAWA 1F37A 3RHCA 1I9DA 4YAVA 1XIYA 2KP1A 3C73A 4ZL8A 4ZBAA 2H6YA 5CYYA 3J7Yk 3SBCA 4KDUA 3LFLA 3UBLA 1A0RP 2C4JA 5LNKe 2XPDA 5DCGA 3LQ7A 4MABA 4O7HA 3EU3A 1SL0B 5D9XA 5ECOB 3DXBA 5H5QA 5D9WA 4EKZA 4HJ2A 4KX4A 2VO4A 2Z9SA 5DALB 4L5LA 3M8NA 9GSSA 3C1RA 2O85A 3VWUA 2CAQA 3DYRA 4L0WA 1FW1A 4LMWA 3QPMA 1XPVA 4PNFA 2KHPA 4OFTA 3M9KA 2GQLA 1JZOA 4ECCA 3O3TA 5H5SA 2B5YA 1EEMA 4KA0A 1FG4A 2B7JA 4TKYA 5CRGA 6GSUA 3GTUA 2K6VA 5ECSA 1DBYA 2IMDA 5IO2A 1K0AA 3TRXA 3GUSA 1URMA 2DJ1A 4IP1A 4AGSA 4PUFC 3GIXA 2VOCA 4L0UA 3TGZA 5JWRB 1SKRB 3GV1A 2FA4A 3RPPA 5HR1A 3GHAA 4I6XA 4KCEA 3HHVA 4PGTA 2R5GA 1U88A 3H4KA 3EC3A 4EVMA 2GQMA 22GSA 3SWLA 2H72A 4Z7XA 1PN9A 5DALA 2DBCA 5F0GA 3GL3A 3P2AA 3TJJA 4RQXA 3IAM2 6GSTA 1EZKA 3UEMA 2H1BA 2RLIA 3LG6A 4HI7A 5B6MA 3D21A 2WDUA 3CSIA 4YH2A 4IJIA 3IRAA 4EC0A 1UA5A 5F05A 3CYNA 3TB2A 2WB9A 1BYEA 2P5QA 1FAAA 1VGLA 3A5WA 5B7CA 2A2RA 5HR0A 3QAGA 2H6XA 4D73A 3RHBA 1YF1A 2E2MA 4KUNA 2WZ9A 4GRFA 1V2AA 1WOUA 3PR8A 1HNAA 3G7IA 2QKEA 5HR3A 1RW1A 1TK8B 1GULA 4KNDA 2C0EA 3GA4A 1G7EA 2M46A 2FGXA 4ECIA 4JU5A 1X9SB 2CQ9A 5DQYA 3FR6A 4WBJA 3TKPA 2MMAA 4FYBA 5ID2A 3FZ9A 4IBPA 1PMTA 2WRTA 1Z6NA 5CAXA 1YZXA 1O81A 4K8MA 2GZZA 1ML6A 4WEYA 2AJQB 3MAKA 5D9VA 3Q18A 1WPIA 3U6VA 4TN8A 4F0CA 4WF4A 1Z9HA 3P90A 4IP6A 4TR1A 5GAPD 2C1YA 1SJIA 3GKNA 5F07A 2IMKA 4ZL7A 2ON7A 2YZHA 1O6JA 1YJ6A 4TOPA 1ST9A 1VRSD 2LRTA 1V98A 1EOGA 1B48A 1X5EA 3KH9A 3ZVJA 1K0OA 5EY6A 2OJLA 2MYGA 3TJBA 2IMIA 1Z7PA 1PX6A 3TKSA 2VCVA 4AJ7A 2XHFA 4OO4A 4TXOB 3EYTA 3GYKA 3QDNA 1T3BA 4EE0A 3VPQA 1QGVA 2MMNA 4XS4B 2VD1A 2JZRA 2H0IA 2EC4A 4WETA 3KM6A 1QQ2A 4DSSB 1GL8A 1NW2A 1KNGA 1S3DA 4K7NA 4OD7A 2PWJA 1TI1A 4N30A 5CRDA 4OFMA 1TXXA 4GCIA 2YJ7A 4IQ1A 2YOIA 3KCMA 5C04A 4FO5A 2VCZA 4IN0A 5D8IA 1EGOA 1HYUA 2G2QA 3D6IA 3WGEA 2AB6A 2H0HA 4MF5A 5CNWA 2LNTA 4N0VA 3KIJA 4GXZA 4FYUA 2JU5A 1QXHA 3ZZXA 3NIVA 18GSA 2CVBA 3LYPA 1TK0B 1NHOA 1EEJA 1GTBA 4DSQA 5FT3A 4JR4A 1XCCA 4I2TA 3D22A 4PNGA 1QFNA 5DCHA 5A4VA 1O7UA 4GSNA 4MDCA 3ZMLA 4P3YB 3ZVJD 4GF0A 5ENUA 2VUPA 4KW6A 6GSSA 2PU9C 1AW9A 1K3YA 3GSSA 1G6WA 2ALBA 2F9SA 2VL2A 1H4OA 4AJ6A 4G10A 1JZRA 4AF2A 3EWLA 4POKA 1K0MA 2B1LA 5FHIA 5J41A 2YNXA 2H19A 2KUCA 2HRNA 4HJMA 1JLWA 3IA1A 2LRNA 1DE1A 2L59A 2OE1A 2VCXA 4TVEA 1T1VA 4N0ZA 1SJ6A 2AYTA 4ZB9A 4JR6A 4ZB8A 5C00A 5AIXA 1GH2A 2J23A 3TKSE 1EGRA 1K0DA 2EIQA 2E7PA 2FWEA 3IK9A 2PERA 3UOMA 4EL1A 2JADA 3BOAA 4XRAA 1GTAA 3TJFA 2NDOA 3A3TA 2R2JA 3ME7A 1SKWB 3MSZA 3QOUA 4ZBBA 2YJHA 2HRFA 1T00A 4WBRD 3L9UA 1ZYQB 16GSA 1GUKA 2VM2A 3IOSA 1GRXA 2C0FA 5DBQA 5CREA 3GURA 2GSTA 5GSSA 4EDYA 1U6TA 1EV9A 3GX0A 1ON4A 3S9FA 5IMDA 3ED3A 3IHQA 1JFUA 1UC7A 4RI6A 5DVBA 3QD9A 3L4NA 2A2SA 3EURA 5H5RA 4RQRA 3KH7A 2X99A 7GSSA 3HJMA 3US3A 1FB6A 3IAS2 3ZLPA 1M0UA 4G2EA 3G7JA 3F3RA 5A5KA 19GSA 4KSOA 3CTFA 2VL9A 4MJEA 1XZOA 3M1GA 1YDKA 2H73A 1TJDA 3F8UA 4EXJA 3KP9A 5IIZA 3LXZA 1RQMA 2LEGA 1QMVA 4PQ1A 4YAPA 3TJGA 3DMLA 5J3RA 3LGCA 4GQFA 2IWTA 3IBHA 1X5DA 2IMFA 3Q6OA 1OYJA 3HY2A 1XWGA 5D73A 3TKQA 3ZFBA 2I9HA 4XHMA 2K8SA 3GTUB 4I8BA 2RM5A 3N5OA 3W8JA 2L5LA 1AC1A 5EPFA 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chains in the Genus database with same CATH superfamily
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chains in the Genus database with same CATH homology


 
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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