1ERVA

Human thioredoxin mutant with cys 73 replaced by ser (reduced form)
Total Genus 39
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
39
sequence length
105
structure length
105
Chain Sequence
MVKQIESKTAFQEALDAAGDKLVVVDFSATWCGPCKMIKPFFHSLSEKYSNVIFLEVDVDDCQDVASECEVKSMPTFQFFKKGQKVGEFSGANKEKLEATINELV
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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publication title Crystal structures of reduced, oxidized, and mutated human thioredoxins: evidence for a regulatory homodimer.
pubmed doi rcsb
molecule keywords THIOREDOXIN
molecule tags Oxidoreductase
source organism Homo sapiens
total genus 39
structure length 105
sequence length 105
ec nomenclature
pdb deposition date 1996-02-07

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00085 Thioredoxin Thioredoxin
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.30.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich Glutaredoxin Glutaredoxin 1ervA00
5B8BA 1MDJA 2JSZA 2LV3A 5DQSA 4IELA 3J7Yk 1H75A 2JZTA 3ZFLA 1V40A 4JZQA 3P8WA 1U3AA 3DVWA 2PVOC 3LYKA 1OC8A 5IMAA 2GSRA 2GLRA 1OE8A 4HQSA 1ABAA 2LTKA 4IJIA 4XRDA 16GSA 3CSJA 1AUCA 4JR4A 4ML6A 4E8EA 3UVHA 4YH2A 4WR4A 4EKZA 4FYCA 1XZOA 5JWOB 3GKMA 1JZDA 2R6KA 1EZKA 3NIVA 5IOXA 2PUKC 1PX6A 4NPBA 5HFKA 4WBRD 4GLTA 3GH6A 3GV1A 2LS5A 1KEBA 3CSHA 3ZMLA 4ZL8A 3BBYA 3C1SA 3G9BA 3GUSA 2YV9A 4TXOB 2H66A 4I97A 4BPYA 5GSTA 2AV4A 1EP7A 3VI7A 1HYUA 1SL0B 3G7YA 1PA3A 4TR4A 3FZAA 5D9VA 1FB6A 4IN0A 2H19A 2LJKA 3ERFA 1YQ1A 4MK3A 5IO2A 2J9HA 4PXOA 3HZ8A 4MJAA 2AUVA 5B7CA 3O6TA 5HFGA 5JWRB 2LEGA 3U6VA 4OCEA 2C0DA 3MAKA 3VI5A 5H5SA 4MJBA 5G5EA 2FGXA 3HJOA 4JRRA 3W8SA 4MJEA 2DLXA 5GSSA 1A8LA 5J4UA 3C73A 1XXUA 4MH3A 2B3SA 5EL8A 3F4RA 5J41A 4K7OA 3ZZXA 1C72A 3H93A 2PBJA 1QGVA 3ZVJA 3RDWA 1T3BA 2ZUPA 3LORA 2YANA 4JU5A 2LUSA 2OE3A 2B5XA 4AJ6A 2VL9A 1YEPA 4TR1B 4XCSA 1GTBA 3ZITA 2CT6A 5JCGA 2H6ZA 4L0UA 4LL1B 2CVDA 2VL3A 5IM9A 2Z9SA 1A23A 1IYIA 3NOFA 4ZB9A 1FO5A 2JZSA 1PD21 2GZPA 2IIYA 2WS2A 4IS0A 3VWUA 3GL5A 3VWXA 1THXA 3GH9A 2V1MA 18GSA 1ILOA 3G7IA 2H75A 3PR8A 1IYHA 2GQMA 5F8BA 1F37A 2ZCTA 3IAM2 3EE2A 3GX8A 1EV9A 4CDOA 2C3TA 2OE0A 1ZYQB 4KH7A 2FWFA 2DJ3A 1GNWA 2H74A 3EU4A 1MDIA 2YV7A 3UMAA 4YQMA 3R2QA 1NHYA 4DSRA 3DXBA 1ZZYA 1TRVA 3TJKA 1A0RP 4YQVA 1CQGA 2AAWA 2DJ1A 1GLPA 3ME7A 1W4VA 1Z5YE 2QSIA 4ZILA 3MWHA 2J23A 3HVSA 4OFMA 2PU9C 2YWOA 3KCMA 3TJJA 3C7MA 4MPFA 2HFDA 2K8VA 3P7XA 4V1Ag 2TRCP 3GKNA 2C3QA 3F4SA 2NVLA 2GSQA 1A24A 3LFLA 3H79A 1YF0A 2LJRA 1EP8A 1HQOA 4I8BA 4I6XA 5A4UA 3IV4A 2HZEA 4JBBA 1UA5A 1SYRA 2H6XA 2R37A 3GFKA 2JU5A 2DMLA 6GSUA 1FG4A 3FZ9A 4F2IA 3F4TA 1S3AA 4IKHA 1ON4A 2E2MA 4MH2A 1XW9A 3E3EA 2RM6A 2GTUA 4GWRA 3LQ7A 2VCVA 5B6NA 3LSZA 3GA4A 4F9ZA 3DRNA 1O8WA 5IMFA 2G2QA 4RQXA 1G0TA 4QQ7A 1A8YA 3NZNA 2H70A 2I9HA 17GSA 3TRXA 4QL9A 4J56E 1V98A 3UL3A 1Z6NA 1XCCA 1JLWA 1GUHA 4ZBAA 4WXTA 1I9DA 1GLQA 3QAWA 2H72A 4N30A 4YAVA 3KM6A 11GSA 3L78A 2GQLA 3GTUA 4KB3A 2C4JA 3IRAA 1I5GA 1M9AA 2KLXA 4GQCA 5IMDA 3ZIVA 3EURA 1Q98A 2MMAA 2IMDA 4XS6A 4D73B 3CYNA 2M80A 3M3MA 3HVVA 3D4MA 3RHBA 2GZYA 1OKDA 6GSXA 3GKXA 1GSSA 1AQXA 3E9JB 4ID0A 4KGIA 5G5FA 2YOIA 4MF7A 2CA8A 2EIQA 2X64A 3UBLA 2H0IA 2GQKA 1S3DA 4XS4A 4GSTA 4LL4B 2GT6A 2LNTA 5DBQA 1F3AA 1ERVA 5CRGA 3IC4A 1TKDB 3APOA 3DGQA 4ACSA 5J3RA 3FR3A 1WPIA 4GRFA 4FYUA 4GCIA 3QAGA 3SWLA 4MDCA 1GTUA 3QR6A 1R5AA 2FD3A 4XRAA 5ID2B 1T8EB 5J9CA 1U6TA 3D21A 3UBKA 5LNKe 3F6DA 2X8GA 4PX1A 3UIWA 2WDUA 3F0IA 4G19A 5DALA 4MZBA 4KSMA 1WE0A 2H1GA 3IK9A 2HLSA 1K0CA 1UN2A 2M72A 2KOKA 4NXIA 1JHBA 4PUFC 9GSSA 3IHQA 5ECKB 1LJRA 4ILFA 2DJ2A 4ISDA 3DWVA 3KH7A 5AIXA 2F9SA 4BA7A 5IPHA 1F3BA 2H6YA 1YZXA 2RUEA 3FKFA 3IK7A 3OR5A 3ISOA 4I2UA 1F6MC 2L6DA 3LEFA 5IIZA 1T4YA 1R7HA 1XOBA 5D73A 4F03A 1HNCA 3FEUA 1KTEA 2VD0A 5ECOB 3QDNA 3D4TA 3HA9A 3EYTA 2B7KA 1WWJA 3MSZA 2XPDA 4AF2A 5HQPA 1TU8A 2B1LA 1ERUA 4MF6A 3Q19A 4GF0A 2VAFA 4O7HA 1UVZA 2B5EA 5ECNB 3VWVA 2N5AA 2FUG2 5E59A 1X5CA 2FNOA 2VM1A 3VPTA 2B1KA 1X5EA 4LMVA 3GRXA 3VFIA 2K9FA 4MMMA 5CAXA 4OMVA 3TJBA 4OO5A 3FRCA 1Z3EA 2OKAA 4NWYA 1TRUA 3DVXA 1PQNA 2WZ9A 2WFCA 3DKSA 5D9XA 3PH9A 3U5RE 1VRSD 4NV2A 5DAKA 1X0RA 5CO3A 4IP6A 5DVBA 5DQYA 2OA7A 2LRTA 1XWAA 5CRWA 6GSVA 1E2YA 4HI7A 2DJJA 3D6IA 3UEMA 3N5OA 2HSYA 5A4WA 1OYJA 1VF2A 2PWJA 3HKRA 3Q74A 3F8UA 2C0EA 2TRXA 4KCAA 2XHFA 3BCKA 4TXOA 5G2ZA 2VL2C 3E0UA 4JE1A 3TKQA 3IR4A 4ZBBA 1XWKA 1HNAA 4XIHA 2ALBA 4X0XA 3L9SA 1E6BA 1ZOFA 4N0ZA 3M9JA 4Q5FA 3TGZA 2BTOT 3ZYWA 4TW5A 2G0FA 4AJ7A 1M2DA 1OKTA 4GSSA 1OAZA 2NPBA 2JZRA 3I43A 4OCFA 2IJYA 2VUPA 2H73A 4WF4A 4PUAA 2DSAA 5ECLB 4POBA 1BJXA 1Z7RA 3M9KA 1EGOA 4ECBA 2V6OA 2HRFA 1HNBA 4WETA 4K0GA 2PMTA 2F51A 5ENUA 5DDLA 1DSBA 2GGTA 2FWGA 4MCUA 3LYPA 1WRYA 1XBSA 3WYWA 2DJKA 4N11A 1J08A 3VWWA 5D9WA 1MEKA 4EL1A 4TR1A 5CP1A 3N9JA 1MTCA 3RHCA 5J5NA 4MJCA 2H76A 2YWIA 1ERTA 2E7PA 4PNGA 3TJFA 2RIIA 4HJMA 1K0AA 1GSDA 5J9BA 2AJQB 3QAVA 1QK8A 4RQRA 3MNGA 1SJZA 4TN8A 5G1KA 5DCHA 1XWCA 4HZ4A 1TXXA 1WJKA 5HFIA 4OWYA 5F05A 4MZCA 3ZFBA 1XWGA 2I3YA 4TKYA 4MF5A 2XPEA 1TI3A 3HJPA 2DMMA 5ECQB 4HU9A 1TK0B 3LXTA 1B9YC 5D93A 1V9WA 2O89A 1LU4A 3TRQA 4GTUA 2PGTA 5AGYA 1ERWA 4OO4A 3H4KA 1MD4A 3VK9A 3A5WA 4EUYA 1WMJA 1Z7PA 2IFQB 1ZCPA 5AIVA 1RQMA 1B4QA 1SU9A 2AB6A 2H1DA 5KN1A 3F9UA 5ECSA 3LJRA 1V2AA 3JCML 2I4AA 4PQHA 1PMTA 3IPZA 2C0FA 3US3A 2O85A 8GSSA 2CVBA 3A2XA 3VURA 10GSA 4ECCA 3P90A 2MMZA 1BYEA 4KDUA 2QC7A 3GMFA 5C00A 1DE2A 3LG6A 5CNWA 1XW6A 2BJXA 2CQ9A 2VIMA 4BVYA 4KDYA 5DCGA 2E0QA 2GDRA 3ED3A 4DSQA 3CRUA 1M2BA 2EC4A 3QD9A 3F63A 2IMKA 5GAPD 6GSTA 2V2GA 1EOGA 1SKRB 4BWSA 2D2ZA 1FB0A 3ZIJA 2KHPA 1TJDA 1B8XA 1JLVA 3IBHA 1DE1A 2KUCA 1QUWA 1TK8B 1MD3A 1XVQA 3FW2A 3G7JA 1XIYA 1SL2B 5KN2A 5HR2A 1K3OA 4NHWA 1SENA 2RM5A 2VL2A 2IMEA 1K0DA 1R26A 2HYXA 1FHEA 5D96A 2F3MA 2XC2A 2B5YA 1A0FA 2FY6A 4KA0A 14GSA 4ML1A 2DJ0A 2GT5A 4WR5A 1LBKA 3M8NA 4WBJA 2FA8A 3IE3A 4MPGA 5ELGA 3KTLA 4YQUA 2WB9A 2R3XA 5ECRB 1JZWA 5ECPB 5CYYA 5CRHA 2VOCA 3BJ5A 4OD7A 1K0BA 2MMNA 5HR0A 4WKWA 1SYXA 1W89A 1GUKA 5LD0A 2NBSA 5IO0A 2DC5A 4G10A 4HEA2 2FLSA 4GSNA 4D73A 4K9ZA 5JCUA 2YCDA 1FOVA 3C1RA 5G31A 4KSOA 2ON5A 3CRTA 2C3NA 3GYKA 2X99A 20GSA 4POLA 2FWEA 4DEJA 1XFLA 1TRSA 3ERWA 2FA4A 5AN1A 4QL7A 3EMPA 2HRNA 2M46A 3TKRA 1EV4A 1H4OA 3A3TA 1TI1A 5GAND 3ZTLA 1GSQA 1ACVA 5FT3A 2L4QA 5COHA 5F07A 1O81A 3GSTA 2R5GA 3ZVJD 2LKUA 1Q4JA 1AQVA 1S3CA 3I9V2 1M99A 1K3LA 1B4PA 2FCHA 3GKKA 3P2AA 2REMA 3ZL5A 1MDKA 4L5LA 4HOJA 4IQAA 1NHOA 2OACA 3GL3A 5ID2A 7GSSA 1PKZA 4O5RA 2VCTA 2VM2A 1PX7A 1B48A 2P5RA 3FZ4A 1TOFA 3QFBC 1F2EA 1A2JA 2WJUA 2VLVA 4KDXA 1TK5B 4V2LA 1U88A 1OC3A 2WCIA 5JCWA 1YKAA 4F0CA 4N10A 2L57A 1QFNA 1X5DA 2LRCA 4NV5A 3EVIA 4L8EA 1OC9B 1N8JA 4FO5A 2CAIA 1XVWA 2F8AA 1G7EA 3HHVA 4ECIA 3O76A 3KTBA 2DIYA 1M9BA 2YNXA 3QOUA 2HE3A 2RLIA 4F0BA 1U87A 4V2NA 5DJMA 3HZ4A 2QKEA 1EEJA 3FYGA 5KN3A 4RI6A 5FHIA 4HQZA 1GNEA 4DSSB 4PQ1A 2XBQA 3QFAC 1SL1B 1J0FA 2OBIA 1TTZA 1OE7A 1RW1A 4TXVA 2LNSA 4EVMA 1PL1A 3GHAA 3UAPA 1GSFA 3UVTA 4LA1A 4IQ1A 1OVNA 2YJ7A 2YZHA 1A2LA 2OE1A 2PERA 2R4VA 2MZCA 4NAXA 3TUEA 4FH8A 1EOHA 1Y6EA 2V41A 4AJ8A 4N0VA 4AGSA 3DIEA 2BMXA 5ECHB 1KBNA 4CW9A 2XBIA 1VGLA 4P3YB 1TRWA 4HDEA 3IOSA 4Q5NA 1EEMA 1XW5A 4OFNA 1HD2A 5LCZA 2YZUA 3IA1A 1VF3A 1GL8A 1K0MA 1K0NA 3CMIA 1SKWB 1SK2A 1KNGA 2K6VA 3LWAA 5HR3A 4K7NA 4GXZA 5H5RA 2KP2A 4K0NA 1FAAA 5IMCA 4ZXGA 1BAYA 2H0HA 3C71A 4I5QA 3RPNA 1TDIA 4IP1A 2P0GA 2HT9A 1SD9A 3L4NA 4HU7A 3Q18A 1GWCA 3HVXA 4IGJA 1SD8A 1VF4A 4E8HA 1V57A 3BD2A 2VO4A 3I6AA 4K2DA 5DAKB 2AYTA 1YKCA 4J2FA 4HUAA 3KD0A 1O7UA 4WEYA 3GSSA 4TVEA 4G9HA 1PGTA 1YJ6A 2A4VA 2VD1A 2DBCA 4I2TA 1GUMA 2IN3A 3IAS2 3WT1A 1R5PA 2OJLA 1AXDA 3LXZA 5IQYA 1G6YA 1QMVA 1GP1A 2YN1A 3HCZA 13GSA 3K8NA 4ZB8A 3TKSE 5HR1A 2HXKA 12GSA 1Y25A 5INYA 2EIRA 6GSWA 4TRXA 2HSHA 3KP8A 1NSWA 2VCWA 4K6XA 5F0GA 3KEBA 1F9MA 2CZ3A 3FR6A 2L5LA 5A4VA 4K7IA 4MA9A 3WT2A 3CXGA 3ZRDA 3KMOA 1O73A 2X8CA 1YDKA 2HZFA 3GNJA 1YEXA 3TB2A 3ERGA 4TR0A 2CVKA 3IXRA 3A2WA 1K0OA 4KCEA 2H0GA 3TKSC 2C8UA 1RK4A 1SJIA 1ST9A 1T7PB 5L71A 5AISA 1TW9A 3RBTA 3M1GA 1ZMAA 4RUVA 3UJ1A 4IVFA 4YAPA 2K8SA 3CSIA 3H1NA 3AY8A 3EMXA 5C04A 5FWGA 3QCPA 2A2SA 5ABRA 5JWQB 1FVKA 4KX4A 2FHEA 4ZL7A 3HJMA 3MDKA 3EINA 2WGRA 5G1LA 2IFQA 2O87A 1SK1A 4Q5QA 3F3RA 3RAZA 1WOUA 2V32A 5EVOA 1XWBA 1M7TA 2KP1A 4IJ3A 5IMZA 2GS3A 2L6CA 3J7Yb 4FIWA 2GZZA 2VCQA 4EDZA 4BWQA 2C0GA 2HI7A 3CTFA 4BL7A 3BCIA 5IPGA 1Z9HA 3KP9A 5EPFA 1THOA 4HZ2A 3S9FA 3TCOA 1ZL9A 1TU7A 4EC0A 3KH9A 1VF1A 1AW9A 1JFUA 6GSYA 2LQQA 3WGEA 1URMA 2VCZA 4X43A 3CTGA 5KEJA 2PVQA 4NMUA 3GN3A 4MABA 2H01A 5ELAA 5B6MA 1ML6A 3CBUA 2EIOA 2E2GA 3KJYA 4Z7XA 2WRTA 3C8EA 4PNFA 1WIKA 2OBKA 4V1Ap 3F6FA 3HYPA 2WULA 4JR6A 4XHMA 2PPTA 3FK8A 2O7KA 2C1YA 1Z6MA 5CRDA 4POMA 4IBPA 4O32A 4ZBDA 1CQHA 1J9BA 2PN8A 1DBYA 3M0FA 2V6KA 1A2MA 5GZZB 4ZIJA 1JZOA 2X8HA 3KXOA 3DEXA 1GSEA 1GTIA 5D9TA 2JL4A 1BX9A 1O85A 1U3IA 4PGTA 3D5JA 2R2JA 1FW1A 2P5QA 4L5OA 1XPVA 2CX4A 3FR9A 3GX0A 3F3QA 3UOMA 3O3TA 1GH2A 5G30A 1B9XC 4L0WA 3VLNA 4G2EA 3DD3A 2RUFA 4ECJA 2H1BA 3HD5A 4IW9A 4K8MA 1SJ6A 1BG5A 3GIXA 3TOUA 2IL3A 2JSYA 3L9UA 3V1WA 2F8FA 2CZ2A 4DVCA 2HZEB 4JEDA 4J57E 2YWNA 4EXJA 1DUGA 1R4WA 2O8VB 3L0HA 1GTAA 4LMWA 2MYGA 3TRPA 4MLYA 4Q5RA 1SK0A 4GQFA 4KW6A 3Q6OA 2GVPA 4O92A 4PURA 3UARA 5F06A 2L4CA 4PQIA 4CHSA 4X1UA 1NW2A 3H8QA 2C80A 2B7JA 2NDOA 1GSYA 3PINA 1BQ7A 3ME8A 4OFTA 4BVXA 4XS1A 19GSA 2OADA 3WGDA 2AHEA 4TR3A 2CV4A 3TJGA 4ULXA 4LLRA 5D8IA 1YY7A 1X9MB 2H71A 3TDGA 1M0UA 3TKSA 1TP9A 3GTUB 1X9SB 3DMLA 4EDYA 2L59A 2N5FA 4WF5A 3PGTA 1PKWA 4FYBA 4IHUA 3EU3A 2K18A 2ON7A 3TOTA 5KN0A 2P31A 2QGVA 2VLUA 3EC3A 3FY7A 3KZQA 3WGXA 4EF0A 1M2AA 2H8LA 2I1UA 2IMIA 3SBCA 3EWLA 3A2VA 1BEDA 2I81A 2GSSA 4POKA 2MBTA 2IPAA 4TOPA 1PRXA 3BOAA 2L5OA 3GURA 3ZREA 1AC1A 2ZNMA 1ZGNA 1UC7A 3ZLPA 3VPQA 3WD6A 3D22A 1PL2A 3D0ZA 5A5KA 1NM3A 3LGCA 1FVJA 3HDCA 3TKPA 4XS4B 1OC9A 4ZL9A 1USBA 1GSUA 2YWMA 4MZWA 1AIUA 3KMNA 1GRXA 22GSA 3RPPA 1X9WB 5ECIB 3APSA 4V2MA 2VCXA 3KIJA 2HNLA 3DYRA 3FZ5A 6GSSA 2YP6A 2LJAA 5CREA 1XOAA 1N2AA 4NHZA 2VLTA 1YF1A 2GSTA 2IWTA 4H86A 1ZYEA 1AAZA 1QQ2A 3FHKA 4DSSA 1SKSB 2ES7A 5DALB 1T1VA 2LRNA 2MMOA 3L9VA 1JZRA 1O6JA 3IDVA 2JADA 3APQA 1G7OA 2CX3A 5H5QA 5DJLA 2N5BA 4ZB6A 5E4WA 5IOWA 4KE3A 3HY2A 4XTSA 2LSTA 3HXSA 4KAEA 4KUNA 1PSQA 4KNDA 4RI7A 2CAQA 4K1FA 4F82A 3I69A 3KGKA 2YJHA 1G6WA 2H1AA 2H30A 1EWXA 1O8XA 4HJ2A 1K3YA 3QPMA 3W6GA 2B6MA 2TIRA 1V58A 2NTOA 4MP4A 5ECMB 1QXHA 1T00A 2JACA 4EE0A 4HS1A 2MBSA 1WP0A 1GULA 1T4ZA 3ZMKA 2YPMA 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chains in the Genus database with same CATH superfamily
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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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