1TXXA

Active-site variant of e.coli thioredoxin
Total Genus 29
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
29
sequence length
108
structure length
108
Chain Sequence
SDKIIHLTDDSFDTDVLKADGAILVDFWAEWCVWCKMIAPILDEIADEYQGKLTVAKLNIDQNPGTAPKYGIRGIPTLLLFKNGEVAATKVGALSKGQLKEFLDANLA
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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publication title The CXXC motif: crystal structure of an active-site variant of Escherichia coli thioredoxin.
pubmed doi rcsb
molecule tags Oxidoreductase
source organism Escherichia coli
molecule keywords PROTEIN (THIOREDOXIN)
total genus 29
structure length 108
sequence length 108
ec nomenclature ec 1.8.-.-:
pdb deposition date 1999-04-07

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00085 Thioredoxin Thioredoxin
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.30.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich Glutaredoxin Glutaredoxin 1txxA00
4TKYA 2XBQA 2VCZA 5GSTA 5DJMA 5J9CA 3LYKA 2MMOA 3LXTA 4DVCA 2GLRA 4X0XA 2OE0A 3TCOA 1F3AA 2RUEA 4DSQA 1Z5YE 2LKUA 1GULA 4KDUA 1M2BA 5DALA 4MPGA 2H0IA 1XZOA 3UAPA 4PURA 1ZOFA 3KD0A 2VM1A 4WF4A 2RLIA 3G7IA 5ECHB 1SL1B 1K0NA 2DJ3A 3ISOA 4V1Ag 2VD0A 1LJRA 1X5CA 4JR6A 2H6YA 5DAKB 3E9JB 1E2YA 4F0CA 3A5WA 3KXOA 4GWRA 3HVVA 4GXZA 2OACA 4KDXA 3C7MA 1TI3A 3QAVA 1MDKA 4N11A 4JR4A 1TTZA 3PINA 1PL2A 3ZYWA 1PN9A 4AJ8A 1WIKA 2WULA 3O3TA 5EL8A 3Q74A 5DJLA 2DJJA 4KE3A 3UL3A 1BX9A 3VI7A 4V2MA 2YANA 4KCEA 5IMCA 2LJKA 2AB6A 1X9WB 1B9YC 2H19A 1A0RP 4KSMA 1N8JA 3F0IA 4ISDA 2MBTA 2GQKA 2CVBA 2H0HA 4TR1A 3N9JA 2QSIA 3FR6A 5D9XA 3FZ9A 3MWHA 4K1FA 3E0UA 1NHOA 1GWCA 2ALBA 3P2AA 3TKQA 2MZCA 5JCGA 5AIVA 2C3TA 1LU4A 2V6OA 4ZBBA 2LSTA 3FHKA 3QFAC 1QXHA 3WYWA 1W89A 1PX7A 3KIJA 3NOFA 3VI5A 2YCDA 5ID2B 3HY2A 3HKRA 1EV4A 1GL8A 5D9TA 4FO5A 3IE3A 1OYJA 1MD3A 3GKXA 1WP0A 3GYKA 1XXUA 1VF4A 1THXA 4ZBDA 5J9BA 5C00A 1AQWA 3A2VA 2A2RA 2VLTA 4FYBA 2P5RA 5ECLB 5F0GA 2FWHA 5DDLA 3ZMKA 1ERWA 3GIXA 4DSSA 1Z7PA 13GSA 3LYPA 4MA9A 4XIHA 2BTOT 4POKA 4HZ4A 2WJUA 1YQ1A 2FA4A 2C0DA 4MJBA 2VCTA 3PGTA 3VWUA 4BPYA 1A0FA 3S9FA 4XRDA 4J57E 2VL9A 4Q5QA 1G6YA 3NZNA 1PSQA 3H93A 2VCXA 4X43A 4OO4A 5D9WA 3IC4A 3U6VA 4FH8A 3LXZA 1NSWA 4V2LA 4ZL9A 1FAAA 4Z7XA 2YV9A 4KB3A 1UC7A 2IWTA 3TB2A 2CVKA 1Q4JA 3TRQA 5JWOB 3IXRA 3HJMA 4H86A 4MABA 3FYGA 1M99A 2O87A 3FKFA 4NHZA 2H72A 1XWKA 1M2DA 4ZB8A 1X0RA 3O76A 3HZ8A 3GL3A 3TKRA 1F9MA 2NBSA 3VPTA 3I6AA 2D2ZA 5DQSA 2KP1A 3U5RE 3GH6A 4POBA 4BVXA 4PNGA 1T3BA 3CRTA 3TJGA 1ZMAA 5E59A 4F9ZA 3GKMA 1I5GA 4TRXA 3R2QA 3KZQA 2HZEA 4IQ1A 3DMLA 3GFKA 3EMXA 1ERUA 2PMTA 1SENA 3H4KA 2QGVA 1AQXA 3EWLA 1Z7RA 4AJ7A 1PKZA 3UIWA 5IO0A 5G5FA 10GSA 3MNGA 4BWSA 1X9MB 2K18A 4E8EA 1SK0A 2A4VA 4EXJA 2DIZA 4HS1A 1O73A 2E2GA 2XPDA 1ZZYA 1ZYQB 4ECIA 2LRNA 4RQRA 2R3XA 3HZ4A 3RAZA 1CQHA 4HDEA 3W8SA 2FWFA 2PBJA 4G2EA 4KUNA 2CV4A 2CA8A 5IQYA 3RBTA 3BCIA 4FYCA 2FCHA 4IQAA 1KTEA 1GTIA 1FOVA 1AC1A 3GSTA 2FUG2 1V9WA 2I81A 2B7JA 1ABAA 4IW9A 3TGZA 1PD21 1SD9A 3KH9A 3KP9A 4IELA 3KCMA 5B7CA 1C72A 3FZ4A 2R2JA 1XCCA 5HR2A 4D73A 3FZAA 5ELGA 5DBQA 4OD7A 5J4UA 4MMMA 1A2MA 1TI1A 4E8HA 1GSDA 2N5BA 5ID2A 3QDNA 12GSA 1SYRA 2HLSA 5ECKB 1SK1A 2H01A 1DUGA 4IJ3A 2H74A 19GSA 4HI7A 2AUVA 2FWGA 4RQXA 4Q5NA 3HD5A 5CYYA 2LUSA 2HI7A 5JWRB 5G30A 4ECCA 1OKTA 3W8JA 1EEJA 4K8MA 3TUEA 3EMPA 1N2AA 1JZDA 1A23A 1NM3A 2I9HA 2QC7A 3CTFA 2V2GA 2H75A 2CZ2A 1GNWA 3LORA 1EGRA 1Z6NA 4POLA 1QK8A 5ECRB 3BCKA 3EYTA 1NW2A 5F05A 2VLUA 1YY7A 4HJ2A 2MYGA 1DE2A 4TXOB 1TRSA 5G2ZA 4MK3A 1FW1A 1SL0B 1FB0A 4L0UA 3WGXA 4TW5A 2DIYA 5IOXA 2BJXA 2IN3A 3TJFA 1HD2A 1M0UA 1O81A 1SU9A 3MSZA 2K8VA 4TR0A 1F3BA 2VOCA 2G2QA 3A2XA 2JADA 5FT3A 4HOJA 5A4WA 1KEBA 5DCGA 1FHEA 1F2EA 1AQVA 5D73A 2X8HA 1TRWA 4K0NA 4MCUA 4ZL8A 2F8FA 3ZMLA 1USBA 4MPFA 2DC5A 5CP1A 2H6XA 3ERFA 1DSBA 4Q5FA 1WWJA 2M72A 2DBCA 1K0BA 5G31A 5KN0A 3I69A 1TU7A 4MH3A 2IMKA 3DEXA 5IMFA 2C80A 3F4SA 2H0GA 3CXGA 4NAXA 3BOAA 1BJXA 2CX3A 2H66A 3GSSA 4EO3A 1YDKA 3CTGA 1PX6A 1WMJA 1A8YA 5CO3A 5INYA 2ZCTA 3IBHA 2OE3A 1TXXA 4HQSA 3KM6A 5CRHA 1XOAA 1R7HA 2VUPA 2HSHA 1O8WA 4QQ7A 2GS3A 5L71A 1Y25A 1JZWA 3P7XA 4ML1A 1GUKA 3Q6OA 3ZIVA 5J41A 2YWNA 3DXBA 3LGCA 3CSIA 4ZIJA 2IJYA 4TN8A 4TOPA 2RUFA 4J56E 1B4QA 1OAZA 1T4ZA 2V32A 2V6KA 3LWAA 2NVLA 4HEA2 4GQFA 3VPQA 3W6GA 1J9BA 9GSSA 2IFQA 1V98A 3F9UA 4EL1A 2HRNA 3G7JA 2PVOC 1XVQA 2PU9C 4NV5A 1JZOA 3F4RA 5ECMB 2B6MA 1O8XA 1BG5A 2GVPA 2A2SA 20GSA 3GN3A 5HR0A 3APOA 4JEDA 2KLXA 1XVWA 4IP1A 2DJKA 2PPTA 3DIEA 4Q5RA 2X8CA 1FO5A 1H4OA 2EIRA 4KNDA 1OE7A 5D96A 1T4YA 2L6DA 3GNJA 3LQ7A 4K7IA 4WF5A 1GSUA 3UJ1A 2M80A 6GSYA 3MAKA 3ZRDA 4LLRA 4JRRA 1YEXA 1QFNA 5GSSA 2K9FA 4IS0A 1TJDA 3GMFA 2VL2A 1IYHA 5KN2A 4O5RA 1FVKA 1YJ6A 1EV9A 2HYXA 1BQ7A 2F3MA 7GSSA 1XIYA 3PH9A 3ZZXA 1GSSA 1GUHA 1AUCA 3UBKA 2KP2A 5EPFA 4KW6A 3HJPA 4KSOA 5ECPB 2C0EA 3IHQA 3M0FA 3UVHA 1VF2A 1GTUA 5KN3A 2VCVA 1EOGA 3D0ZA 2HT9A 3EC3A 3GUSA 2TIRA 4IP6A 1YEPA 3D4TA 2NPBA 2R37A 3VWWA 3Q18A 3F3QA 1WPIA 3ERGA 2ZNMA 4O32A 2JSYA 1VF1A 1FVJA 2B1KA 1A2JA 2LNTA 5ECSA 3F8UA 2L4CA 3FEUA 1TP9A 2O7KA 4L0WA 22GSA 1EOHA 2R6KA 2LS5A 3HJOA 2RM5A 2VCQA 3E3EA 1Z9HA 3F6FA 4V1Ap 1OC9B 4NMUA 3KMNA 1IYIA 3CRUA 5ABRA 1EP8A 3H8QA 1EP7A 4JZQA 1G0TA 6GSVA 17GSA 1TRVA 4ZBAA 1ON4A 3H79A 1R4WA 1KBNA 2VM2A 1AAZA 2GGTA 4LL4B 4TR4A 4YQVA 3K8NA 4XS4A 1QQ2A 2XC2A 1GP1A 4OWYA 3IK9A 4YQUA 3QOUA 4N30A 2OKAA 5ECQB 2DLXA 1V40A 3C8EA 4ML6A 3TOTA 4EF0A 1X5EA 4XRAA 2PGTA 1SKWB 1OVNA 5H5QA 4IHUA 5CAXA 1SL2B 2IMIA 2PVQA 2WCIA 2JZTA 4YAPA 5F07A 3GTUA 5IPHA 4RUVA 5D93A 3TKSA 4HU9A 3J7Yk 3M1GA 1XW5A 2LEGA 5ECIB 2MMAA 2V1MA 4PGTA 3APSA 1DE1A 3EU3A 2ON5A 4WR5A 5CNWA 5F06A 1TRUA 2R5GA 2BMXA 1O7UA 2H1DA 4QL9A 3VWXA 3M9JA 4FYUA 5ECNB 3ZVJA 2IIYA 4LA1A 2RIIA 1ZCPA 4MZWA 1J0FA 2HFDA 5AGYA 3DRNA 5DAKA 2GT5A 4PXOA 5JCWA 4GSNA 2C0GA 3V1WA 2DJ2A 6GSUA 3GRXA 1O6JA 3KP8A 1V58A 1I9DA 3D5JA 2YN1A 2OA7A 4LMWA 2FD3A 3Q19A 4MF6A 5LCZA 4WBRD 3FR3A 3ZREA 4XS6A 4NPBA 5CRGA 2X99A 4J2FA 3IA1A 2MMNA 4O92A 3DYRA 3GKKA 2AV4A 3APQA 2OJLA 1H75A 1TW9A 2EIQA 2WB9A 1THOA 3L9SA 2LRCA 2FY6A 5HFIA 1EWXA 1OKDA 4NV2A 2CQ9A 3GX0A 3M3MA 4F03A 4N10A 2F9SA 5KEJA 4ZB6A 4EDYA 3TKPA 2YV7A 1TDIA 2QKEA 3LJRA 1PGTA 2VL2C 5IMZA 4NWYA 3O6TA 2GZZA 3TDGA 1JLVA 4LL1B 3IK7A 2CZ3A 1YKAA 4O7HA 4OCEA 4MLYA 5IM9A 2ON7A 4PX1A 2L4QA 3CSHA 5AIXA 4RI7A 1GRXA 1U3AA 2O89A 3BD2A 4GQCA 4WKWA 1SK2A 1YKCA 5HFGA 2WFCA 1R5PA 3UARA 3ZTLA 2JZRA 4I8BA 3UBLA 1KNGA 5LD0A 1S3AA 4N0ZA 1ZYEA 2XBIA 4IBPA 6GSSA 3IR4A 3GH9A 2L5LA 2H70A 1U6TA 1GSFA 5G1LA 4GSTA 4IKHA 5F8BA 4HZ2A 3LFLA 2PUKC 1LBKA 1PL1A 4YH2A 2P5QA 4P3YB 1Y6EA 2DMLA 2I4AA 5H5SA 1GSQA 2EC4A 1EEMA 1SD8A 4IGJA 1TK5B 3ZVJD 3HHVA 4KX4A 1PMTA 3EVIA 2O85A 2C3QA 4MDCA 2IMDA 2VD1A 3F6DA 1PQNA 3GURA 3GL5A 2ZUPA 1GLPA 2NTOA 2KUCA 5ELAA 4KA0A 1PRXA 2YZUA 4ECBA 3FR9A 2C0FA 4EUYA 2FWEA 5B6MA 3KGKA 4F2IA 2GZYA 1B48A 4MZBA 2GQMA 2GSQA 3GKNA 4DSSB 4GSSA 5HR3A 18GSA 2B5YA 3AY8A 1K0OA 1SJ6A 3QD9A 1GTBA 2WZ9A 3BJ5A 3FZ5A 2TRXA 1S3CA 2VLVA 1Z6MA 2C4JA 4K0GA 2GTUA 2HRFA 1SJIA 2WDUA 3QPMA 1ILOA 4IJIA 5FHIA 2YOIA 3TKSC 3FW2A 4POMA 2IPAA 2LTKA 4ID0A 4MH2A 5IIZA 4EDZA 3D4MA 1HNAA 1CQGA 1RW1A 1V57A 4CW9A 4XTSA 3GA4A 2HZFA 4OFMA 4KGIA 5ECOB 1EZKA 1FB6A 1MEKA 1XWBA 2AJQB 3N5OA 1QGVA 2N5AA 2H1AA 2KHPA 1GLQA 4DEJA 5IPGA 4MF5A 3G7YA 4HUAA 2C1YA 3EU4A 1Q98A 2RM6A 4MJEA 5H5RA 2Z9SA 2OBIA 5IO2A 1U87A 3RHCA 2LQOA 2VAFA 4CDOA 1TU8A 3ZFBA 3QR6A 4FIWA 2DJ0A 1YF0A 1OC3A 5FWGA 4ACSA 3TKSE 1ZL9A 1HQOA 1A2LA 1K0CA 2HZEB 3IRAA 2L57A 6GSWA 3F63A 3HVSA 2WRTA 5DVBA 3IAS2 2E7PA 1A24A 3FRCA 1B8XA 2KOKA 2B5EA 1GSYA 1WJKA 5IMVA 2LJAA 2FNOA 1U3IA 5LNKe 1AIUA 4ZL7A 3QMXA 1B9XC 2WGRA 2YWIA 4L5OA 5A5KA 2LQQA 3QFBC 2JL4A 3D22A 4EC0A 3FK8A 3ZFLA 3KMOA 4WXTA 3ERWA 3US3A 1VGLA 1XPVA 2GZPA 3DVXA 5A4VA 4KCAA 5EY6A 3TJJA 1K0MA 3C1SA 4GF0A 1JFUA 2L5OA 2OADA 2CT6A 1J08A 3IV4A 1XW6A 1G7OA 1K0DA 1YF1A 2HSYA 5IOWA 2VO4A 2YNXA 3RPNA 5IMAA 2E0QA 3FY7A 1ERTA 2R4VA 3C1RA 4TXOA 3M8NA 4ZB9A 4IVFA 1PKWA 3J7Yb 1K3YA 2OE1A 3CSJA 1T7PB 2C3NA 2VCWA 4D73B 2DSAA 4ZILA 4PQ1A 1BYEA 3VLNA 1F6MC 2H73A 3RPPA 1T8EB 4MF7A 3WGEA 6GSTA 3D21A 1M9AA 1WOUA 3IAM2 2B3SA 5AN1A 2C8UA 5ENUA 1RQMA 4EVMA 4LMVA 2FGXA 2J9HA 1TKDB 1SKRB 3ME7A 1HNBA 4GCIA 4WETA 3ZL5A 1BAYA 4PQIA 2LRTA 2TRCP 2CAIA 5D9VA 3OR5A 4JE1A 2IMEA 3ME8A 3DGQA 2GSRA 5JWQB 2AAWA 4YAVA 1NHYA 1OE8A 3I9V2 4NXIA 2FA8A 2L59A 1XBSA 3TRXA 4XHMA 4JU5A 3ZIJA 1RK4A 1G7EA 4F0BA 2JSZA 3TJKA 3TOUA 4L8EA 11GSA 5HR1A 1GNEA 1XWGA 1MD4A 3WGDA 4WEYA 1EGOA 5D8IA 3DKSA 2IL3A 4N0VA 2YWMA 4HU7A 4G10A 1Z3EA 2YJ7A 2FLSA 1R26A 3BBYA 3UMAA 3QAWA 5CRWA 2CAQA 2GQLA 5JCUA 2JU5A 6GSXA 2AYTA 5HQPA 3GX8A 4XCSA 3UOMA 1K0AA 4CHSA 2GSTA 1W4VA 4MJCA 1T00A 5HFKA 1MDJA 1WE0A 4EKZA 3TJBA 2PWJA 3EURA 2WS2A 2P0GA 3EINA 5J5NA 4EE0A 2MMZA 2K6VA 4I97A 1ACVA 2XPEA 1JZRA 1MDIA 5A4UA 2E2MA 2J23A 5EVOA 4XS1A 5B8BA 1SJZA 3VURA 1E6BA 3G9BA 3ZLPA 3C73A 2OBKA 8GSSA 2YJHA 1FG4A 2L6CA 5COHA 1ST9A 4F82A 2FHEA 3P90A 1PA3A 2HNLA 2PN8A 4OCFA 2B7KA 3LEFA 4TR3A 4KAEA 14GSA 2YZHA 3L9VA 4WR4A 2REMA 5CRDA 4K2DA 1UN2A 4GLTA 3KTBA 1R5AA 1WRYA 1V2AA 3DD3A 1T1VA 1QMVA 2P31A 2CVDA 3SBCA 4NHWA 5DALB 4JBBA 3GV1A 1ZGNA 4ILFA 1OC8A 3PR8A 2IFQB 2GDRA 4AF2A 3L0HA 3RDWA 2HE3A 2JZSA 2O8VB 3I43A 4I5QA 3CMIA 4X1UA 4GTUA 4AJ6A 2H71A 2H8LA 3C71A 4QL7A 1XOBA 3QCPA 3A2WA 4PUFC 2G0FA 2V41A 1JHBA 3IDVA 1MTCA 3F4TA 1UA5A 2PERA 3HVXA 3L78A 2F51A 4K6XA 4G9HA 1BEDA 3L4NA 2X8GA 2H1BA 3JCML 5B6NA 2YWOA 4G19A 4K7OA 4PQHA 4HJMA 1G6WA 3LSZA 5GAND 5GAPD 1OC9A 1JLWA 3VFIA 1XFLA 1M7TA 2YP6A 4I2UA 5DQYA 1S3DA 4IN0A 3KH7A 1XWAA 2GSSA 2LJRA 1ERVA 4TR1B 2JACA 1YZXA 4RI6A 3DWVA 2EIOA 3QAGA 1X9SB 3TRPA 2N5FA 5C04A 1URMA 2K8SA 3HYPA 1XW9A 3F3RA 5GZZB 1QUWA 2DMMA 4OFTA 5G1KA 4AGSA 4BWQA 4TXVA 3EE2A 3MDKA 1SKSB 3KEBA 1U88A 2HXKA 3WT1A 3M9KA 2GT6A 1XWCA 1DBYA 3D6IA 4ECJA 5E4WA 3NIVA 3ED3A 2H1GA 1TK8B 5AISA 2AHEA 1F37A 1X5DA 4TVEA 2X64A 4YQMA 4MJAA 2F8AA 1VRSD 4PUAA 5IMDA 5J3RA 3SWLA 3CYNA 1UVZA 4BVYA 3P8WA 3HCZA 2H76A 3VWVA 1AXDA 2VIMA 3HDCA 4GRFA 4OO5A 1AW9A 1GSEA 1HYUA 3GHAA 5KN1A 4PNFA 2IMFA 5CREA 3WD6A 2M46A 2NDOA 2I3YA 3H1NA 2LV3A 4HQZA 2YPMA 2B1LA 1O85A 1M9BA 2I1UA 3HA9A 5B8AA 1B4PA 4K9ZA 3HXSA 3UVTA 2DJ1A 3CBUA 3A3TA 3RHBA 4OMVA 2ES7A 3VK9A 2XHFA 2B5XA 3ZITA 4XS4B 4BL7A 4WBJA 4OFNA 1TOFA 4V2NA 4L5LA 2H30A 4ULXA 4I6XA 1TK0B 4MP4A 1ML6A 1SYXA 4KDYA 1K3OA 4DSRA 2H6ZA 3LG6A 1M2AA 2MBSA 2LNSA 4KH7A 3WT2A 1GH2A 2CX4A 1HNCA 1VF3A 4BA7A 4K7NA 3L9UA 1A8LA 16GSA 4I2TA 1GTAA 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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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