4EIPA

Native and k252c bound rebc-10x
Total Genus 163
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
163
sequence length
526
structure length
521
Chain Sequence
PIETDVLILGGGPVGMALALDLAHRQVGHLVVDAGDGTITHPKVSTIGPRSMELFRRWGVAKQIRTAGWPGDHPLDAAWVTRVGGHEVYRIPLGTADTRATPEHTPEPDAICPAHWLAPLLAEAVGERLRTRSRLDSFEQRDDHVRATITDLRTGATRAVHARYLVACDGASSPTRKALGIDAPPRHRTQVFRNILFRAPELRSLLGERAALVFFLMLSSSLRFPLRSLDGRGLYNLVVGVDDMDSFELVRRAVAFDTEIEVLSDSEWHLTHRVADSFSAGRVFLTGDAAHTLSPSGGFGMNTGIGSAADLGWKLAATLRGWAGPGLLATYEEERRPVAITSLEEANVNLRRTMDRELPPGLHDDGPRGERIRAAVAEKLERSGARREFDAPGIHFGHTYRSSIVCGEPETEVATGGWRPSARPGARAPHAWLTPTTSTLDLFGRGFVLLSFGTTDGVEAVTRAFADRHVPLETVTCHAPEIHALYERAHVLVRPDGHVAWRGDHLPAELGGLVDKVRGAA
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
publication title An Unusual Role for a Mobile Flavin in StaC-like Indolocarbazole Biosynthetic Enzymes.
pubmed doi rcsb
molecule keywords Putative FAD-monooxygenase
molecule tags Oxidoreductase/oxidoreductase inhibitor
source organism Lechevalieria aerocolonigenes
total genus 163
structure length 521
sequence length 526
chains with identical sequence B
ec nomenclature
pdb deposition date 2012-04-05

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF01494 FAD_binding_3 FAD binding domain
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.30.9.50 Alpha Beta 2-Layer Sandwich D-Amino Acid Oxidase; Chain A, domain 2 D-Amino Acid Oxidase; Chain A, domain 2 4eipA02
3.40.30.120 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich Glutaredoxin Glutaredoxin 4eipA03
3.50.50.60 Alpha Beta 3-Layer(bba) Sandwich FAD/NAD(P)-binding domain FAD/NAD(P)-binding domain 4eipA01
4YKFA 5TR3A 2FJEA 3NN0X 3LJPA 4YKGA 3PS9A 4H4TA 3HZLA 2WS3A 3KD9A 3GD4A 4PABA 3AYIA 2WDRA 4ECHA 1E1KA 3ALMA 2R0GA 2Z5XA 4GRTA 3ABVA 3V3NA 3AE2A 3RP7A 3NRNA 2B9WA 1PBFA 2GQWA 4AT2A 1X31B 2A89A 4I58A 4JY2A 1Y56A 1ZMDA 4NTEA 1MO9A 3ISHA 3V76A 4OCGA 2OALA 2XVJA 1PBBA 2YG3A 1E1NA 2GH5A 1DOBA 2WPEA 2HQMA 2BK5A 1CJ2A 3BNUA 3EF6A 1NHPA 3NK0X 1OJ9A 4DSGA 4YTNA 2YLSA 4K22A 2E1MA 2GR3A 1MOKA 3AECA 4IVOB 1FEAA 1XANA 3UKKA 4GR1A 4GCMA 1M64A 1PHHA 2YLRA 3NYCA 2EQ9A 3UKLA 4H2QA 4EIPA 2JAEA 3QFAA 1GTHA 1PXCA 5JCKA 4EIQA 2EQ8A 3SM8A 5KRQA 2OLOA 4H4PA 3FMWA 3FIMB 2X50A 1GRHA 2R4EA 1FL2A 2VVMA 1ZMCA 4B68A 3SFDA 1YY5A 2YR4A 1L9CA 4AOXA 1E39A 2QCUA 1P2EA 3CPHG 3ATQA 4ICYA 1AOGA 1IUUA 4KX6A 4H4WA 4K5SA 1TDEA 1PS9A 1CJ3A 1GNDA 2APGA 1QLBA 1QJDA 2VOUA 2JKCA 1EL7A 4C74A 4BK1A 3CGBA 3AYLA 4GF7A 1LQUA 2BYBA 4P9SA 3CNJA 3CPIG 4REKA 4JN9A 2FJBA 4CNKA 3O0HA 3AEAA 4BJYA 3PO7A 4OPDA 3QVPA 1B8SA 3Q6JA 4O5UA 5HYMA 3BI5A 1LJ1A 3AE5A 3LOVA 4H4ZA 4D04A 1F8WA 1GESA 1XPQA 4NEVA 1COYA 2WPFA 4XWRA 3AEFA 3LZXA 4Z2RA 4OPIA 2UZZA 2EQ6A 5J7XA 4EMIA 4HA6A 3VRAA 2FJAA 4B1BA 1IUVA 2VVLA 1GETA 2C70A 1N4WA 5J60A 1OJCA 5KVHA 1ZDLA 3EAOA 4TLXA 4Y4LA 4UDPA 4A9WA 2IIDA 1E1LA 1PJ5A 1FEBA 1VG0A 1CBOA 2XLRA 2C75A 2IVEA 3BNMA 3CGDA 5KXJA 1NHSA 1K0LA 1GV4A 1GT8A 3DGZA 1FECA 2XLPA 1B4VA 3KVEA 3DK9A 2WOWA 1OJAA 1H84A 2VZ2A 3AD7B 3LZWA 4H4SA 3IHGA 2XFPA 3D8XA 3UCLA 5BUKA 2RGHA 3OC4A 4AP3A 1NHRA 4B64A 4D03A 3DMEA 3AD9B 4LA1A 3B3RA 2XFNA 3NT6A 2YLXA 4FX9A 4AT0A 4NZHA 3C4AA 3K7QX 3GMCA 1GRTA 3GRTA 4OPCA 4B63A 5HY5A 3UTGA 4YXDA 2BS4A 1JEHA 3URHA 1JRYA 3G5QA 3M12A 1YQZA 2XYOA 2YR6A 2XFQA 3I6DA 2R0PA 3M0OA 4HB9A 5U1OA 1F8SA 2W0HA 4OPLA 3NG7X 4TM1A 1CL0A 1K4QA 3E1TA 4PAAA 4ADWA 2WPCA 1E6EA 4EM4A 2X3NA 2XVFA 4H4QA 2Z5YA 2B9YA 3UTEA 3ICTA 4EQWA 1D7YA 3QJ4A 3UOXA 4X9MA 1H82A 3ICRA 5IQ4A 2WP6A 3BHKA 1CC6A 4OPUA 1E7PA 1B5QA 1REOA 4J56A 4EQRA 2CFYA 3CGCA 1NENA 2X8GA 3CTYA 3NK2X 3PVCA 5FS6A 1TDNA 2TPRA 4JQ9A 3UKQA 1PXAA 1JRXA 2YG4A 5EB5A 5L46A 4CCRA 4H2NA 3DH9A 5ER0A 3ALJA 2GR0A 4NTDA 1L9DA 2YLWA 3CPJG 3Q9TA 3L8KA 2FJDA 2BS2A 3G5RA 4Z26A 3GRSA 1GERA 3GYJA 4YSXA 1GPEA 2XVHA 3KLJA 1GOSA 1H83A 2V6OA 3I3LA 3RP6A 3BI4A 4DSHA 2JBVA 2CVJA 2YG5A 2QA2A 2RGOA 2H89A 2PYXA 3AXBA 1GREA 2VQBA 3SQPA 3UTFA 4B67A 3WE0A 2BK4A 4UP3A 3GSIA 3DA1A 3C4NA 5M10A 4LIIA 4EMWA 4I59A 1Q1WA 1ELIA 2VVLG 3AEBA 1P2HA 3AYJA 2BC1A 1DXLA 2WQYA 2AAQA 1JNZA 3CIRA 2GRTA 2TMDA 2YLZA 3KA7A 2ZZ0A 4TM3A 5EOWA 2BS3A 2XFUA 3ATRA 4A6NB 2GR2A 3RHAA 3AE7A 3DK8A 2C72A 5CKUA 3CN8A 4J34A 4K8DA 2WEUA 2E4GA 4K2XA 2V60A 4CY6A 1KFYA 2O9ZA 1OJDA 4FK1A 1XDIA 2V3AA 4H4YA 2CDUA 1KDGA 1IUSA 1CHUA 1Z6LA 1BZLA 2BCGG 3CNDA 1ZK7A 4BURA 5EB4A 2XVIA 1JRZA 5FMHA 1GRGA 3FBSA 2GAHB 3VR9A 1H7WA 2C3CA 2C66A 2WDQA 5BVAA 2ZBWA 4BK2A 1K0IA 1K0JA 2Q7VA 4Z2UA 1H86A 4M52A 4EM3A 3H8IA 3P4QA 1YKJA 4ZCDA 4BK3A 1S3BA 3S61A 1S2YA 2BA9A 1IJHA 3NH3X 4X4JA 4Z24A 2A87A 4TM4A 1LQTA 3K7MX 4DGKA 3KKJA 4RG4A 2YG6A 2R9ZA 2GVCA 1S3EA 4YTMA 2NPXA 2VRLA 3CGEA 3K7TA 5FS7A 4C77A 5LV9A 4YTPA 2I0ZA 2FBWA 2ZZCA 4OPGA 3GWFA 2V5ZA 4U2TA 3DJJA 1ZY8A 5JCLA 2GV8A 2YLTA 4WCTA 2Y6RA 3AEEA 2ZZBA 2AQJA 4NEWA 5KVIA 2WOVA 3B6DA 4CBQA 4H2PA 1GRFA 3BI2A 3DJEA 5BULA 2YAUA 4EMJA 4K7ZA 3SFEA 1BGJA 4TLZA 2IVDA 4A79A 3S5WA 3P4RA 1LVLA 3RP8A 2BCPA 3DJDA 4H7UA 4AP1A 2CULA 4H4RA 4U8NA 1PDHA 1CF3A 3AB1A 4U8MA 5U25A 3VRDB 1ZOYA 3P4PA 4BJZA 1TDOA 1W4XA 4U8OA 1LPFA 2Q0LA 2WP5A 2VRMA 2XLSA 5CQFA 4UDRA 3BHFA 1GALA 1YQ3A 3KPFA 3NIXA 3NK1X 2WBAA 4O5QA 4BV6A 1RYIA 1NHQA 5JCIA 4RSLA 2B7RA 5JCNA 3ZDNA 1N4UA 3KU9A 1S2QA 2WESA 4TM0A 1LTXR 2OA1A 1TYTA 4H4VA 3AE9A 2YQUA 2AR8A 4B69A 1CJCA 4J36A 3IHMA 2YR5A 3C96A 1ZP0A 5JCMA 2OLNA 5KWFA 4J2WA 4U2SA 3QVRA 4K5RA 4C3XA 2C73A 4DNAA 1L9EA 1VG9A 3H4KA 4U8PA 4ZN0A 3DJGX 3QSMA 4U8KA 4J33A 1VQWA 4MJWA 1O94A 2BK3A 3NTDA 3UP5A 3M13A 1PBDA 3VRBA 4YSHA 1CC2A 2R4JA 1BKWA 3D1CA 1DNCA 5M0ZA 3GWDA 3GD3A 3LADA 4A99A 1PJ7A 4FDCB 3L1RA 2C7GA 3NNEA 1Y0PA 2XCGA 1BGNA 2GQFA 1ZX9A 3K30A 2C67A 4FK1C 2X8CA 4J31A 2YM2A 1DODA 1M6IA 1L0VA 1ZKQA 4Z44A 3AD8B 4WX1A 4YSYA 1RP0A 1F8RA 1BWCA 1NAAA 1N4VA 4LU6A 1NG3A 2C65A 2BXRA 2XLUA 1HYUA 2C64A 4JNAA 4A7AA 1O95A 2YVGA 1H81A 3NHOX 2YVFA 4JDRA 3UKFA 3P1WA 2PHHA 2ACZA 3NTAA 1PBCA 4IVMB 3AEDA 4XWZA 3RNMA 4NTCA 1Q1RA 1GRAA 1V59A 3QFBA 2GEWA 1TYPA 1F3PA 2OAMA 3GDNA 3GYIA 4USQA 3UOVA 4ZCCA 1JU2A 2X8HA 2YG7A 3UKHA 3V3OA 4UDQA 4JY3A 1F6MA 2B9XA 3AWIA 5FS9A 2R0CA 4CRTA 1H6VA 2C3DA 3GMBA 5EBKA 2JK6A 1O5WA 3DGHA 3EPTA 4YSZA 2VQ7A 5BRTA 1VRQB 1N1PA 1BF3A 4Z25A 1GSNA 1KSSA 1Q9IA 2YM1A 3IF9A 3LXDA 2QA1A 2B7SA 1UKVG 4RG3A 2GAGB 3II4A 5C3JA 2GB0A 1KF6A 4YWOA 2WOIA 3SGLA 4B65A 1DOCA 2E5VA 1GTEA 4Z43A 4USRA 3P4SA 3UKPA 4H2RA 4AOSA 5HHFA 4IA5A 2A8XA 3NLCA 1D4EA 1D4CA 1DJQA 2GMHA 2H88A 4IA6A 2Q0KA 4U8LA 3ZYXA 1RSGA 3UKAA 1QO8A 1D7LA 3CNSA 3ICSA 1JNRA 1SEZA 1VDCA 3T37A 4H4UA 2JB1A 1IUTA 1PN0A 2YWLA 3NKSA 3UP4A 1IUWA 2QAEA 3AE4A 1TDFA 2F5ZA 2NVKX 2XDOA 3EANA 1D5TA 3QSSA 4KPRA 5IQ1A 4H4XA 3AE3A 3H8LA 4U2LA 3GDPA 4OPTA 4GDPA 4EQSA 2R45A 3REDA 3DK4A 1NPXA 4U8IA 3AEGA 4EQXA 3IC9A 4Z2TA 5KOWA 1PXBA 2BC0A 2R46A 2XVEA 2XFOA 4C5OA 3VQRA 4CNJA 5KOXA 1D4DA 1E1MA 4U8JA 4A6NA 2GMJA 4J57A 3F8DA 1KNPA 3CNTA 3OZ2A 4A65A 1CC4A 2V3BA 1KNRA 1B37A 4H50A 2B76A 4OVIA 3UOYA 1CJ4A 4XXGA 5GSNA 1GXFA 3AE1A 2YVJA 3IWAA 1Y56B 1GEUA 1LV0A 2BACA 5GRTA 3NN6X 1EBDA 1GRBA 4Y4NA 3UTHA 3CNPA 2GR1A 3ALLA 1DJNA 4N9XA 1DOEA 4CY8A 1PBEA 1PJ6A 2Q6UA 1H7XA 3NYFA 1MXTA 4X9NA 2WDVA 3AE6A 5DBJA 5C2TA 4IV9A 2J3NA 2C76A 2XLTA 5IPYA 2X99A 4CCQA 4JNQA 3ADAB 3FPZA 3ITJA 1EL5A 3JSKA 1IUXA 3NGCX 2WHDA 4B66A 2ARDA 4APNA 1FOHA 2JB2A 4A5LA 2Y6QA 2RABA 2WU2A 1ONFA 1YQ4A 2BABA 2DKHA 1TRBA 2BXSA 4GUVA 3LB8A 5HXIA 1JOAA 3F8RA 1NG4A 4GDEA 1XHCA 1NEKA 2WETA 2JB3A 2GF3A 3COXA 4C3YA 2DKIA 3FG2P 1KSUA 3AE8A 2V61A 3VR8A 3UOZA 5U63A 1NDAA 3P9UA 1OJTA 5FS8A 1TDKA 3QSEA 3NYEA 2WP9A 2RGJA 4Y4MA 1EL8A 3G5SA 4E0VA 1EL9A 1ZOVA 2WU5A 4YT0A 3R9UA 3F8PA 1FCDA 2EQ7A
chains in the Genus database with same CATH superfamily
4YKFA 1GSSA 3FYGA 4YKGA 10GSA 1XCCA 3HHVA 1E2YA 3KD9A 4XRDA 3ZIJA 2R0GA 4NXIA 3ABVA 2HZEB 3V3NA 2PERA 1EWXA 4GTUA 4TN8A 2IIYA 1GL8A 2JSYA 5IOXA 4KCAA 4G6HA 2E48A 1OC8A 4ZILA 4I58A 4MMMA 1ZMDA 3L0HA 4ZB8A 3V76A 3D4MA 2WPEA 2BK5A 4PQ1A 4YTNA 2YLSA 4IJ3A 4K2DA 3U6VA 1T3BA 1MOKA 4IVOB 5D9VA 1VRSD 2YLRA 3UKLA 3QFAA 3HJPA 3GTUA 2EQ8A 1AC1A 3KCMA 3TKSE 4H4PA 4HJMA 1FL2A 3SFDA 2QCUA 1P2EA 3ATQA 5A4UA 3MWHA 1IUUA 4KX6A 1GULA 4BA7A 1TDEA 2OE0A 4I6XA 4ACSA 2APGA 2VOUA 4WF4A 3CGBA 4J2FA 1XW9A 5CRDA 4P9SA 5B8AA 6GSXA 3CNJA 3CPIG 4ZXGA 1PQNA 1WOUA 3AEAA 3PO7A 1QQ2A 5ECLB 4OPDA 3ZTLA 3QVPA 2CVDA 2N5BA 3FR3A 2HLSA 4G10A 4H4ZA 2LNSA 1COYA 4OFNA 4HA6A 1GSUA 4B1BA 3L9UA 1IUVA 5F06A 1N4WA 2HRAA 1OJCA 3DRNA 1T00A 3EAOA 4TLXA 4Y4LA 1TTZA 2IIDA 2GQLA 3LFLA 5ECOB 1ZOFA 3FZAA 5C00A 1CBOA 2XLRA 1BAYA 1K0LA 2PVOC 3DGZA 1KEBA 1SL2B 18GSA 3KVEA 3AD7B 1SK2A 1TI3A 3IHGA 3E0UA 4TR0A 2XFPA 1JLWA 3UCLA 4JRRA 4AJ7A 3LWAA 4D03A 3DMEA 3AD9B 4BL7B 2YLXA 4FX9A 4NZHA 4WF5A 3K7QX 4B63A 5HY5A 4OWYA 3URHA 2Z9SA 1JRYA 4HB9A 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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