3F4TA

Crystal structure of wolbachia pipientis alpha-dsba1 c97a/c146a
Total Genus 75
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
75
sequence length
200
structure length
200
Chain Sequence
ITSNELLLPLPNDKLLGDPKAPILMIEYASLTCYHCSLFHRNVFPKIKEKYIDTGKMLYIFRHFPLDYRGLKAAMLSHAYEKQEDYFNFNKAVFNSIDSWNYYNLSDLTLLQRIAALSNLKQDAFNQAINDKKIMDKIVNDKSLAINKLGITATPIFFIKLNDDKSYIEHNKVKHGGYKELKYFTNVIDKLYGKAIVKLE
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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molecule keywords Putative uncharacterized protein
publication title Structural and Functional Characterization of the Oxidoreductase alpha-DsbA1 from Wolbachia pipientis
pubmed doi rcsb
source organism Wolbachia pipientis
molecule tags Oxidoreductase
total genus 75
structure length 200
sequence length 200
ec nomenclature
pdb deposition date 2008-11-02

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF13462 Thioredoxin_4 Thioredoxin
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.10.40.80 Mainly Alpha Orthogonal Bundle Ribonucleotide Reductase Protein R1; domain 1 Ribonucleotide Reductase Protein R1; domain 1 3f4tA02
3.40.30.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich Glutaredoxin Glutaredoxin 3f4tA01
1UVZA 3GL5A 1TU7A 2P5QA 3VLNA 1SYXA 1X5CA 1YEXA 3C1RA 2PERA 2JADA 2O7KA 3GKKA 13GSA 1O8WA 2PVQA 3BOAA 2LSTA 1M7TA 1XCCA 3K8NA 3TJGA 1Q4JA 2C1YA 2TRXA 3M8NA 3I43A 4BWSA 4K7OA 2GZZA 2P31A 2DBCA 1OC9A 4TOPA 4K7NA 3VI7A 2VAFA 4TRXA 2MZCA 1U88A 2JSZA 1XVWA 3GH9A 2F3MA 3LGCA 3IXRA 4FH8A 3IHQA 1FO5A 1CQGA 3HY2A 6GSYA 2CAQA 4FYCA 5DJMA 3DVWA 1ZMAA 2FWHA 2VL9A 3DEXA 4NXIA 1T7PB 3GHAA 4XS6A 1UC7A 4PXOA 1OYJA 2H76A 5IOXA 1T1VA 5J4UA 3BBYA 3LEFA 2NBSA 2E2MA 1A8YA 1DBYA 2L6DA 3UVHA 4IQAA 1DE2A 3RHCA 3QAGA 4MLYA 5D9WA 1F3AA 1GUMA 4XS4B 2L6CA 2FUG2 2DIYA 1Z5YE 2I81A 2L5LA 1PN9A 1BYEA 1QFNA 4ECBA 1EP8A 2VOCA 1OKDA 1E6BA 3F4TA 3MWHA 2M80A 2IMIA 1XW5A 3TDGA 4G10A 3ZYWA 1V9WA 3QAVA 1TRVA 4L5LA 1XW6A 2LJKA 2H6ZA 4PQHA 5J5NA 4MZCA 4OFMA 4BVXA 1THOA 4OFTA 5JWRB 2LNSA 3H1NA 5LCZA 2HNLA 4YQVA 3GYKA 3A2WA 3WT2A 4G19A 3KEBA 2B5YA 4PUAA 4ZILA 11GSA 3MDKA 5KN0A 3ZVJA 3M9JA 3LYKA 3Q18A 5GZZB 1M9AA 2I3YA 4LL1B 2YWOA 2DJ1A 4TKYA 1MDIA 4EL1A 1TRUA 2AV4A 2JZSA 1ERUA 2R37A 2C4JA 2QGVA 2WFCA 5AIVA 4ZBDA 3VWUA 4WBRD 1V2AA 3EVIA 5D93A 3ZTLA 1XWKA 4ML1A 2MBTA 2CVBA 3CXGA 4MF7A 3QR6A 4TXOA 1K0CA 2C80A 2LQOA 3LG6A 3BJ5A 5IO0A 2H70A 4RI6A 3W8JA 1GNWA 4MZWA 2WB9A 2WJUA 5ECHB 4N30A 3AY8A 2FWEA 2K18A 4BVYA 2C0DA 1HQOA 3UOMA 1OC9B 3GFKA 3TOUA 4TR0A 1V98A 1EOHA 3ZFBA 2CT6A 3UL3A 1M2BA 1LJRA 3HD5A 4LMWA 1NSWA 2V6OA 4Q5QA 2WRTA 1TW9A 2CA8A 2F8AA 5JCUA 2V6KA 6GSXA 5DBQA 3ISOA 2C0FA 3FZ5A 4WKWA 4IS0A 4ZL8A 1H4OA 2FWGA 2NTOA 5CRWA 2GT5A 4GXZA 2YV9A 4KA0A 2B7KA 2GZPA 2K8SA 4HI7A 4IJIA 4I97A 3CMIA 2X8GA 2RLIA 1A2MA 3ZIJA 5CP1A 6GSVA 3FK8A 4POBA 2ALBA 2GVPA 4Q5RA 2YV7A 2LKUA 5DAKA 2IMEA 1O7UA 1QXHA 4V1Ap 3TKPA 1VF1A 3HCZA 4WETA 4OCFA 2FNOA 1BQ7A 3VURA 5IMVA 3W6GA 3WGEA 4PURA 1PD21 2PMTA 1GTIA 2I9HA 2FHEA 5IPHA 3IC4A 1R7HA 2YPMA 1ZYEA 3VWXA 4KGIA 2X99A 3IAS2 1EV9A 4HJMA 2I4AA 1PL1A 4ML6A 5DCGA 3ZMLA 2V1MA 4QL9A 1PGTA 1C72A 2YWNA 3EU3A 1TXXA 3MNGA 3NOFA 3HZ4A 1A23A 1TRSA 2R5GA 4G2EA 4BA7A 3C71A 2LS5A 4FYUA 3UBKA 5ECIB 2GQLA 2O87A 2XHFA 3DWVA 4OFNA 1O81A 2JU5A 4N10A 1O73A 5ECQB 3TGZA 3M3MA 2OACA 4XRDA 3VK9A 4G9HA 1ILOA 2WGRA 5J9CA 1GSEA 4ECCA 5DALA 2B3SA 4TXOB 4K1FA 3LWAA 2HRNA 4LMVA 5D73A 5KEJA 1XWBA 3GSTA 1AXDA 1IYHA 4HU7A 1K0NA 1N2AA 4GQCA 4MK3A 2IMKA 1K0AA 4ZB6A 4GF0A 1JZWA 5IMDA 3US3A 2MMAA 2HFDA 3UEMA 1SJZA 3TKQA 3I6AA 4F0BA 1X5DA 1G6WA 1PKWA 5KN1A 3HVVA 1MDJA 5F06A 5B7CA 1N8JA 4O7HA 5EPFA 4F82A 5IPGA 1URMA 1R5PA 1THXA 3PINA 3E9JB 4MJEA 3HDCA 2XBIA 1AIUA 1XWGA 1SL2B 1I5GA 4F03A 1B8XA 2O8VB 4X43A 5G1LA 2H1BA 1KEBA 3TCOA 5AIXA 1VF4A 4IQ1A 1A24A 2BJXA 2XPDA 1M2AA 1NHYA 1PMTA 3LJRA 5H5QA 1I9DA 1B4PA 2YP6A 4EO3A 3FW2A 5JCGA 2YNXA 2MYGA 3KP8A 1F3BA 3P8WA 4KCEA 1VF3A 3F0IA 1ZCPA 4N0ZA 5DAKB 3PH9A 3ZRDA 4I2TA 2K8VA 4KUNA 1U3AA 4EXJA 2G0FA 2L5OA 3H93A 2VD0A 2OBIA 2HLSA 3ERGA 2FY6A 3RHBA 3TRXA 4I5QA 1XOAA 3ED3A 1CQHA 1GLPA 4AJ7A 1V57A 2VUPA 2H66A 4PQ1A 1YF0A 3WGXA 4L0WA 2B5XA 5HFIA 5A5KA 4JRRA 2REMA 1YDKA 3GH6A 1PL2A 4AJ8A 1F37A 2OE0A 3TJJA 1T3BA 4KAEA 2DJ3A 1HNAA 2EIOA 1FB6A 5CRHA 3IPZA 5FWGA 2H19A 4J56E 2ZUPA 3HVSA 4H86A 4JBBA 1TOFA 2LJRA 2CVKA 3ME8A 2H0HA 1ZL9A 2CV4A 4V1Ag 1OE7A 3DMLA 5HR2A 1OAZA 5H5SA 3HJOA 3KIJA 5CRDA 3GL3A 4OO5A 2LUSA 2ZCTA 4RI7A 1NW2A 3UARA 2EIQA 4ID0A 1W89A 5D9VA 3ZFLA 5G1KA 4LLRA 1R5AA 1GSFA 3HXSA 4MP4A 2OKAA 1J0FA 3QD9A 5DCHA 2DMMA 1PQNA 3GIXA 1SENA 4ZBAA 2YANA 4HJ2A 2VL3A 4IHUA 3TKRA 2QSIA 4NV5A 3UMAA 2DC5A 4IN0A 4OWYA 1K0MA 2OA7A 3VPTA 1UN2A 4K0NA 2PGTA 1U6TA 4YAPA 2GSRA 1TK0B 2FCHA 3TJFA 1ON4A 2OE1A 1PX6A 3IV4A 4JR4A 4KDXA 2BTOT 2L59A 4ACSA 22GSA 1SKWB 1O85A 3EMPA 1VRSD 1O8XA 1B48A 2IFQA 1ZYQB 5J3RA 2CZ2A 3F63A 4HZ2A 3C8EA 5ECOB 5ENUA 4FYBA 1A2LA 3Q6OA 3JCML 2O89A 2VO4A 5ECKB 5F07A 1ZZYA 2L4QA 3GX8A 3IK9A 5GAND 3O3TA 2DLXA 3D4MA 4KH7A 1PA3A 4XTSA 5GSTA 1FG4A 2VCTA 3EMXA 3D6IA 4I6XA 4EDZA 2DJKA 1JHBA 1GTAA 2VCVA 3GMFA 5ELGA 4WR5A 1TI3A 3D21A 1JZDA 2H1DA 3APSA 3QAWA 1YJ6A 1WP0A 3IE3A 4KE3A 1NM3A 5CAXA 4CW9A 4HQZA 5CRGA 2HSYA 4O5RA 2V41A 4NMUA 5CO3A 5B8AA 4LA1A 5KN3A 4WR4A 3HKRA 2PVOC 1AQXA 2IJYA 2B5EA 4AJ6A 4GCIA 4ECJA 1XZOA 3A5WA 1J08A 3VWVA 1Z9HA 2X8HA 2VD1A 4N11A 4LL4B 4POKA 3GSSA 7GSSA 5LNKe 3V1WA 4MH3A 2P5RA 1XPVA 3GKMA 4KX4A 5GSSA 1Y25A 4E8EA 4MCUA 3FR3A 5CREA 3RAZA 2HZFA 1Z7RA 1A0FA 1EP7A 4K9ZA 14GSA 1Q98A 1YKAA 4MMMA 2HYXA 3F9UA 1K3OA 5D9XA 3N9JA 1DSBA 2GT6A 4EDYA 4ECIA 3DYRA 4K0GA 1K3LA 2FD3A 1EV4A 1RK4A 1HNBA 2FA4A 3IAM2 1T00A 2RUFA 1ZGNA 3KXOA 3CTFA 1X9SB 2O85A 3UBLA 4F0CA 3UAPA 2RM6A 1DUGA 2C0GA 4GTUA 10GSA 4HEA2 5G30A 2GGTA 2QC7A 3FZ4A 1TKDB 3A2XA 3H4KA 4IJ3A 1PKZA 2HSHA 2GTUA 1RQMA 2AAWA 4HQSA 5JWOB 4NV2A 4YQMA 3IDVA 5DDLA 1SJIA 2PPTA 4MABA 2WZ9A 1SU9A 3KJYA 18GSA 4HUAA 1SL0B 1OKTA 2IFQB 3QCPA 2NVLA 9GSSA 5KN2A 3WT1A 2CAIA 4YAVA 2FA8A 1T4YA 5IMZA 3GTUA 3TOTA 2WCIA 3ZVJD 2E0QA 4NHZA 4AF2A 2A2SA 4F2IA 1VF2A 2KLXA 1TRWA 3DKSA 2JZRA 2QKEA 2ON7A 2H8LA 4TN8A 1A0RP 1RW1A 3C7MA 2LTKA 3KM6A 2DMLA 2M46A 4IGJA 2R4VA 4X1UA 1MEKA 5F0GA 5ECRB 2DJ0A 3WD6A 2HI7A 1JZOA 5EL8A 2H71A 1GP1A 3GA4A 1EEMA 4HDEA 5ECNB 3RDWA 3IBHA 2EC4A 2H0IA 4ZIJA 4GSNA 5IOWA 2HT9A 3QPMA 2DJJA 3TJKA 3CSHA 3WYWA 2RM5A 4OMVA 3TB2A 1K0OA 1SK2A 1UA5A 2C3TA 3GKXA 1LU4A 2VL2C 4KSMA 5G5EA 2YJ7A 5E4WA 1S3CA 1T4ZA 3L78A 2E7PA 4D73A 5GAPD 1XXUA 1X9MB 3UJ1A 3VI5A 1YQ1A 3TRQA 2M72A 4O92A 12GSA 1PX7A 4NPBA 1W4VA 3O76A 5E59A 3RPNA 2GZYA 3F4RA 1GL8A 2N5BA 3QFBC 5HFKA 4KSOA 3C1SA 4GSSA 1EEJA 1XIYA 2H75A 4TR1A 3FZAA 2GQKA 1NHOA 4I8BA 4YQUA 3A3TA 4N0VA 1B9YC 1QQ2A 3J7Yk 3KH9A 1WPIA 1ERTA 3QFAC 4ZB8A 1XWCA 1QUWA 5A4VA 5ECSA 4V2LA 1GLQA 1FOVA 3IA1A 2KUCA 5IMAA 2YOIA 3A2VA 2H1AA 2H0GA 2R6KA 4JE1A 3P2AA 1K0BA 5C00A 4WF4A 3IRAA 3CTGA 2GS3A 3Q74A 2H6XA 2XBQA 3LYPA 5AGYA 5HR0A 1U3IA 2VM2A 1Z6MA 2N5FA 1V40A 1FHEA 1G7EA 2IMDA 1GNEA 3I9V2 2VCQA 4NHWA 2YZUA 1JFUA 6GSTA 2MMNA 1KNGA 3GTUB 4IVFA 1SYRA 2FLSA 1IYIA 1BX9A 2YWIA 3SWLA 5DQSA 1OC8A 3ZREA 4IP6A 3UIWA 3ERWA 3EURA 3HZ8A 1GRXA 3KZQA 3GX0A 3EINA 3M0FA 3IK7A 3DRNA 3N5OA 5JCWA 3L9UA 3EU4A 5HR1A 1R26A 3TKSE 2MMOA 1ACVA 1M9BA 3ZLPA 2X8CA 2HRFA 2KHPA 3U5RE 3G7IA 4EUYA 1GTUA 2LRTA 1YZXA 1JLVA 4MF6A 4DSSA 4EE0A 2FGXA 3DGQA 3NIVA 2JACA 4GWRA 3MSZA 1XFLA 2H30A 1MTCA 2LNTA 5G31A 4AGSA 4ISDA 4E8HA 3FYGA 2H1GA 4IP1A 1BAYA 4D73B 2VLTA 4KNDA 1A8LA 1FW1A 3FHKA 2WS2A 5J41A 5J9BA 2YJHA 2D2ZA 2CZ3A 3CBUA 3LFLA 5CYYA 2K6VA 1XBSA 3QDNA 4XIHA 3FR6A 1B9XC 5G5FA 1MD3A 3LSZA 4DSRA 5IQYA 3HHVA 3VFIA 1M2DA 2X64A 4O32A 3FEUA 3DIEA 4XRAA 2LRNA 4KDYA 2F51A 4HU9A 5DALB 3U6VA 5DQYA 2RIIA 5EY6A 4MZBA 4TR1B 5JWQB 3HJMA 1AQVA 4TR3A 4IBPA 2R2JA 5IO2A 3HYPA 2VIMA 2A4VA 4K8MA 4MPGA 1Z7PA 4TVEA 1QMVA 3H8QA 1XVQA 20GSA 5HFGA 2NDOA 5C04A 5D9TA 1GSSA 2A2RA 2XC2A 3QOUA 5DVBA 4EC0A 1GWCA 1Z6NA 4FIWA 5G2ZA 1SKSB 1KTEA 3HA9A 17GSA 3E0UA 5FT3A 4MF5A 4ZL7A 2YN1A 2CX4A 2IWTA 2K9FA 4XHMA 4PUFC 1T8EB 3BCKA 6GSWA 4EF0A 2VLUA 16GSA 2PU9C 2LQQA 1GSQA 1HD2A 2GSTA 1M0UA 3WGDA 4K6XA 1TP9A 4RQRA 3F3QA 2PBJA 2KP1A 1KBNA 3CRUA 1SKRB 4HZ4A 5F05A 1XW9A 2TRCP 4L5OA 2HE3A 2DIZA 3ZMKA 2JL4A 1WRYA 4WEYA 4GLTA 4YH2A 1WE0A 3GUSA 4QQ7A 1QK8A 3UVTA 2AJQB 5ABRA 1SL1B 1MD4A 3D0ZA 1EGRA 3KMOA 4V2NA 4QL7A 2HZEA 3F8UA 2I1UA 4HS1A 6GSSA 2B7JA 3APOA 1FVJA 2H74A 1BJXA 5ECLB 1AAZA 3G7YA 2F9SA 5ECPB 4ZL9A 4DSSB 3LORA 1ZOFA 1TDIA 3FRCA 1B4QA 4EKZA 3L0HA 3TUEA 3DVXA 1G7OA 3F6DA 3KCMA 3CRTA 3O6TA 2JZTA 2CVDA 4CHSA 3APQA 3LXTA 2VL2A 4GQFA 2LEGA 2RUEA 5HR3A 1ERWA 4MH2A 2IL3A 4HOJA 2VCWA 1GULA 2AHEA 2V32A 1R4WA 3J7Yb 2OBKA 3KMNA 3KTLA 2VM1A 1BG5A 2VCZA 1GSDA 8GSSA 1GTBA 3KH7A 6GSUA 3D5JA 4MDCA 4BL7A 4ULXA 4BWQA 2Z9SA 3L9SA 1AUCA 4IKHA 4L0UA 3M9KA 3LQ7A 4RUVA 2IN3A 1X5EA 3F6FA 3LXZA 4PX1A 1AC1A 2B1LA 2LJAA 4KCAA 4NWYA 4DSQA 3G7JA 1GSUA 3P90A 2GSSA 3D4TA 2H72A 3FR9A 3ME7A 2J9HA 3ZL5A 1OC3A 3VWWA 3HJPA 1QGVA 1XOBA 1ABAA 2P0GA 1Y6EA 1E2YA 3S9FA 1WJKA 2E2GA 4IELA 4Q5NA 1G6YA 1WWJA 2YWMA 3DXBA 2DSAA 3F4SA 4KB3A 3FY7A 4ZBBA 4KDUA 4F9ZA 4WXTA 1HYUA 3EC3A 4K2DA 3DD3A 1TK8B 5ID2A 2NPBA 1FB0A 3TKSA 2H01A 2VLVA 4IW9A 3TRPA 5IMCA 3GN3A 3GNJA 1S3AA 2OADA 3P7XA 1FAAA 2FWFA 4J57E 5HQPA 3M1GA 5COHA 2J23A 1AW9A 3KP9A 4Z7XA 1H75A 2AUVA 2H73A 5AN1A 2CX3A 3SBCA 1M99A 1JZRA 1Z3EA 1V58A 1EZKA 2IPAA 1ST9A 1TJDA 2B6MA 3EE2A 1AQWA 2HZEB 2OJLA 2F8FA 5FHIA 1FVKA 4L8EA 5ELAA 3GV1A 1GUKA 2GSQA 2GDRA 1DE1A 1WIKA 3F3RA 1YF1A 4P3YB 4MA9A 2JSYA 1K0DA 1WMJA 2B1KA 2L57A 19GSA 2XPEA 4MJAA 5A4UA 4BPYA 3RBTA 5IIZA 2IIYA 1TI1A 3Q19A 2ES7A 5L71A 4I2UA 4TW5A 2N5AA 2WULA 1EGOA 3FKFA 2MBSA 2ZNMA 1WOUA 1LBKA 1GH2A 3E3EA 4OO4A 4PQIA 3CYNA 3EWLA 3PGTA 2AB6A 4Q5FA 1GUHA 4ZXGA 1K3YA 4NAXA 5EVOA 4TR4A 1X9WB 3HVXA 1TU8A 5CNWA 4RQXA 5ECMB 2LV3A 3C73A 3RPPA 1SJ6A 4ZB9A 3QMXA 2DJ2A 4JEDA 1A2JA 3ZZXA 4CDOA 1PSQA 4GRFA 1EOGA 3MAKA 3VPQA 1G0TA 1X0RA 2PN8A 3ERFA 3I69A 1JLWA 2KOKA 1F9MA 3L9VA 4JZQA 3GURA 1GSYA 5AISA 4XCSA 3TKSC 5IM9A 3OR5A 2WDUA 1EWXA 4WBJA 3L4NA 3IR4A 1BEDA 4WF5A 1XWAA 2OE3A 5LD0A 4PGTA 2GQMA 5ID2B 3CSJA 2C8UA 3GRXA 2EIRA 3PR8A 4KW6A 3TJBA 2IMFA 4MJCA 3KD0A 3ZITA 5INYA 1YKCA 1O6JA 1SK1A 2G2QA 3NZNA 5IMFA 1OE8A 5D96A 1TTZA 2C3NA 4X0XA 1YY7A 1VGLA 2MMZA 4PNGA 4XS4A 2PWJA 2C3QA 1MDKA 3GKNA 5H5RA 2KP2A 2L4CA 1S3DA 3EYTA 4DVCA 2PUKC 5DJLA 2R3XA 1J9BA 2CQ9A 2YCDA 1SK0A 3D22A 2V2GA 2H6YA 1F6MC 4GSTA 1SD9A 4V2MA 1ML6A 4DEJA 3KGKA 4OD7A 1USBA 5B6NA 1HNCA 1F2EA 3FZ9A 4K7IA 2LRCA 1ERVA 1PRXA 3G9BA 4TXVA 5B6MA 2ON5A 2HXKA 2BMXA 1OVNA 4JR6A 4XS1A 4ILFA 1TK5B 4EVMA 4MJBA 2C0EA 4J2FA 4JU5A 1YEPA 5D8IA 3BCIA 1U87A 5B8BA 2TIRA 3ZIVA 2YZHA 3W8SA 4MPFA 4OCEA 5A4WA 4FO5A 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chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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