4BPYA

Crystal structure of the c90a mutant of the sco copper chaperone protein from streptomyces lividans
Total Genus 48
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
48
sequence length
175
structure length
162
Chain Sequence
QAATVLDKPFEKPDLVLTDTQGKKYDLREQTAGKPTLIYFGYTHPDVAPLTMNNIAVAKKQLSQAEQDKLRVVFVSTDPERDTPAALGKWLKGIDPQIVGLTGEFDTIQAGARTLGISIDPPGTQVVAFSPKSDAGYVLYGEDATVDDYTKDLPKLIKGENP
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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molecule keywords SCO PROTEIN
publication title Structural and Mechanistic Insights Into an Extracytoplasmic Copper Trafficking Pathway in Streptomyces Lividans.
pubmed doi rcsb
source organism Streptomyces lividans
molecule tags Chaperone
total genus 48
structure length 162
sequence length 175
ec nomenclature
pdb deposition date 2013-05-29

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF02630 SCO1-SenC SCO1/SenC
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.30.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich Glutaredoxin Glutaredoxin 4bpyA00
1V58A 4KW6A 4PUFC 1EWXA 4FYCA 1GSSA 3GA4A 4Z7XA 2H66A 1GTAA 4I2TA 5HQPA 2KLXA 5IPHA 1Z6NA 2GT5A 2F8FA 2J23A 3ZLPA 1EZKA 1ABAA 1PSQA 4DSQA 5ECOB 2FUG2 4N10A 4BWSA 3WD6A 5IM9A 2X99A 3RHCA 5DAKA 1Y6EA 2PERA 5DCGA 2DC5A 4QL7A 2VCWA 2IFQB 5IOWA 4N0ZA 1SL0B 4V1Ap 1R7HA 2H0HA 2C1YA 4XS1A 3VWUA 3SWLA 1GSDA 4FO5A 5G30A 1V2AA 2L57A 4YQMA 1THXA 2FA8A 2P5QA 1NM3A 2G0FA 4GSSA 4PXOA 5CREA 2YZHA 2HZEA 4N30A 1TRUA 4HDEA 3GTUA 3APSA 3BCIA 3VI5A 4MABA 1SD8A 3CTGA 4BA7A 2HYXA 3TDGA 1YF1A 3UARA 2DJJA 1HNCA 4OWYA 4BVXA 2YWMA 2AUVA 3VWWA 2DJ0A 3FKFA 4TXOB 2YOIA 1K3OA 3RPPA 5ECPB 3VI7A 1ZOFA 3DXBA 1SL1B 3FRCA 2IMFA 2L6DA 2VL2A 1PKWA 1YF0A 2VAFA 2ZUPA 2E0QA 4IHUA 3VURA 3VPTA 5J3RA 3WGEA 3UOMA 4XIHA 5COHA 1PX7A 4IKHA 1X0RA 2CAQA 4IN0A 2VL3A 3ZYWA 4O5RA 2PGTA 3KH7A 2PU9C 3ZMKA 2E2GA 3IRAA 3VLNA 3ZREA 5INYA 2EIQA 2OACA 2LV3A 3TJGA 3GSTA 5D93A 3BJ5A 3ZRDA 1QFNA 4ACSA 3CTFA 3QDNA 2B1KA 1X5CA 5CNWA 2LNSA 4WBRD 4ULXA 1AQVA 2C4JA 4HZ2A 2K6VA 4TR3A 1TKDB 4EVMA 4I5QA 4MJCA 3KM6A 1ZYEA 3IAM2 4MP4A 5JWRB 4IP6A 2IN3A 3D6IA 1N8JA 3ZFLA 3EMXA 1OAZA 3E9JB 1AQXA 5KN1A 5HR0A 2HLSA 2K18A 2C8UA 2OE3A 4F0CA 1N2AA 2VLTA 4HJ2A 2M46A 5DJMA 3EU4A 1TRVA 4MMMA 4MF6A 4N0VA 4NAXA 5AGYA 11GSA 3DMLA 5KN0A 2H19A 2H1DA 3TOTA 5G31A 1LJRA 2DJKA 1MDKA 5IPGA 2PMTA 2B1LA 3MDKA 2G2QA 2N5BA 3KJYA 1WRYA 1XW5A 4I6XA 4Q5NA 5ECSA 1O7UA 2MMZA 1M7TA 5B7CA 2YWIA 3VPQA 2CA8A 2IMIA 4PNGA 1GL8A 4HQZA 4HEA2 3QAVA 1A8LA 4KGIA 3F6DA 2K9FA 4IS0A 3IK7A 2H1BA 1DE1A 1TU8A 2LNTA 2HFDA 4BL7A 4POBA 1XCCA 4GQCA 5DCHA 2L4CA 1I5GA 4HI7A 1E2YA 1Z6MA 2I4AA 4ECBA 4EXJA 6GSWA 5LNKe 5F8BA 4KB3A 3QPMA 2FGXA 4TKYA 1YKAA 4NPBA 5ELAA 4AJ6A 4KX4A 2RM6A 3ZIJA 2CVKA 5IMDA 1VF3A 2H72A 4E8HA 2C0DA 4D73A 1FVKA 3C1SA 2B5EA 3NZNA 5ECLB 3LQ7A 3KMNA 8GSSA 3L9UA 5G5EA 1GP1A 4K1FA 4NWYA 1RK4A 3HJPA 4HU9A 4ZL8A 1T7PB 1A23A 2KP1A 4WR5A 2ZCTA 1HNAA 2AB6A 3CXGA 5DVBA 3BBYA 1WJKA 1AUCA 2LSTA 1ERTA 4F2IA 3F3RA 1HD2A 4RUVA 4TR1B 4X0XA 1WPIA 1G6WA 1TDIA 1TOFA 4L0WA 1O73A 5ENUA 1M2AA 2VD1A 1Z7RA 1OKDA 2YZUA 1K0DA 3FR6A 5D9WA 3TKQA 4G2EA 3LYPA 2R5GA 4DSSB 1T00A 1TRWA 2V2GA 1F9MA 1RW1A 1X9SB 1W89A 2P31A 2J9HA 4I97A 2H76A 4GF0A 2HSYA 1T8EB 3L0HA 1KBNA 1JZWA 2X64A 5F06A 2MMNA 3QMXA 4PUAA 3TRPA 3QAGA 2DIYA 4LLRA 4ECCA 1GNEA 2FWGA 3H4KA 1ML6A 1GH2A 1Y25A 1G0TA 2HT9A 1U6TA 4MA9A 4TOPA 3QOUA 1XFLA 4PX1A 1AXDA 3KTLA 1XBSA 3RBTA 5AIVA 2VIMA 3PINA 1MD3A 3L9VA 4MH3A 5B6MA 2C3NA 5FT3A 4XTSA 5IMVA 4HOJA 2IJYA 4YAVA 1BQ7A 4GSTA 3UBKA 1BYEA 5C04A 2CX4A 1A0FA 3CSIA 2DSAA 3GIXA 3GH9A 4G9HA 1PL1A 4YQUA 3CRUA 1U3IA 2GS3A 4L0UA 4LL1B 6GSSA 4HU7A 2HXKA 1J08A 1GULA 2WGRA 2R4VA 1U3AA 2GSTA 5A4WA 2VCQA 2R3XA 3NOFA 1B8XA 2H6XA 3SBCA 3GKMA 3DYRA 5DALB 1XW6A 3ERFA 4OCEA 1XWBA 1PN9A 2HZEB 4MPFA 2V6OA 1QUWA 1X9WB 4NMUA 3DGQA 3O6TA 3IC4A 4MZBA 5ECMB 2PVOC 1OC8A 5J4UA 4ZL9A 3APOA 1THOA 1AAZA 1YEPA 4RI7A 5EY6A 3VWXA 5D9VA 1V98A 4HJMA 2H30A 3H93A 2DJ3A 1NW2A 2LRCA 4MJBA 3FW2A 2LTKA 4OCFA 2V6KA 3BOAA 2BJXA 4OFMA 2VCXA 2O87A 5H5QA 3U6VA 1SJIA 4EE0A 1SL2B 3TB2A 3I69A 5EPFA 1ERVA 1PMTA 1HYUA 1SKWB 5DBQA 2V32A 2YCDA 4AGSA 5B8AA 1T4YA 4I8BA 2JACA 2YWNA 3RDWA 1U88A 4J56E 3N5OA 2FD3A 2RUFA 3WYWA 1O85A 1S3CA 1I9DA 2OKAA 1SJZA 1UN2A 1YZXA 4ZBDA 1Z5YE 3L4NA 4DEJA 5H5SA 4ML6A 5E4WA 3TJJA 5HR1A 1GNWA 4LA1A 1OC9A 1XVQA 2MBSA 2YV9A 3HJMA 5DQSA 1FW1A 4KE3A 4F0BA 2CAIA 4GRFA 2A2SA 2LUSA 3UAPA 1EEMA 5CO3A 1XW9A 2O85A 5JCUA 2FY6A 6GSYA 4JR6A 3D22A 3GL3A 4TVEA 2DJ1A 1B9XC 5HR3A 20GSA 3A2XA 5LCZA 2GSQA 3CRTA 4KDUA 1S3AA 3F4SA 1YY7A 1MD4A 3MNGA 1GUKA 4KSMA 5GAND 2WJUA 3M9JA 4IGJA 4GQFA 2FCHA 1K0CA 4K7IA 4PNFA 1JLWA 3W6GA 2Z9SA 3UJ1A 1EOGA 2X8HA 3D4MA 3F3QA 1RQMA 2NVLA 3KGKA 4GWRA 1C72A 5ID2B 4WXTA 3O76A 4ML1A 2ES7A 4O32A 2GLRA 3IHQA 5HR2A 2GZYA 2HI7A 3Q19A 1FHEA 5HFGA 1GUMA 2H1AA 4XRDA 3C8EA 1URMA 2N5FA 2VO4A 4MH2A 2AHEA 1NSWA 2OBIA 2R6KA 2YPMA 1F37A 1CQGA 3PH9A 2H70A 2PN8A 2NDOA 2QGVA 2I3YA 1GSFA 3F63A 5G1LA 3F0IA 3GN3A 6GSXA 2D2ZA 3C1RA 1JLVA 3ZZXA 5F0GA 4D73B 2B6MA 3A2WA 3P7XA 2RUEA 1PX6A 3F8UA 1O8XA 3R2QA 4RQXA 3HHVA 2ON5A 3RAZA 1YJ6A 4PURA 3GH6A 1BX9A 2IMEA 2DBCA 4NXIA 1JZRA 4RQRA 1T4ZA 1SENA 1FB0A 10GSA 2V41A 2XPDA 1T1VA 2EIRA 1ZGNA 4V2LA 4ZBBA 4MK3A 3ZTLA 1ST9A 2LEGA 4IP1A 5JCWA 2H0GA 2QKEA 4CDOA 1W4VA 3WGXA 1R26A 1GRXA 1PRXA 4NHZA 1G6YA 3EU3A 2GZZA 1GSQA 5D9TA 4AF2A 3HDCA 1K3LA 1B4PA 5KEJA 3FK8A 2YJ7A 5DDLA 1UA5A 2P5RA 3G7JA 1TJDA 2MBTA 2RM5A 1EP8A 1SK2A 5GAPD 3AY8A 2IFQA 1WE0A 1YQ1A 3C73A 3FEUA 4GSNA 17GSA 4POMA 1E6BA 4ZXGA 1MTCA 3GUSA 4XS4A 2M72A 2F51A 4TR4A 1WP0A 1ACVA 2DMLA 1JHBA 1K0NA 3QFBC 4ECJA 3S9FA 1Q98A 1K0AA 4ECIA 5GSTA 2C0GA 1SKSB 4MCUA 2FWHA 4OD7A 5CP1A 2HNLA 5DJLA 4V2NA 1QXHA 3A3TA 2K8SA 2YV7A 3LWAA 5J9CA 4IBPA 3HY2A 4KH7A 3C7MA 1ZYQB 1TTZA 13GSA 2MMAA 1FAAA 2YJHA 2YWOA 1HQOA 3G9BA 3M9KA 2OE0A 4WF4A 2NPBA 1J0FA 5IIZA 2XBIA 3EC3A 3RHBA 2GQMA 2WDUA 3VFIA 3WGDA 4WEYA 1J9BA 2B5XA 3MWHA 1TI1A 3QAWA 2PPTA 3LJRA 5KN2A 5DQYA 5FWGA 1K0BA 3DIEA 5JWQB 4I2UA 3TKSE 4K9ZA 2JL4A 1TU7A 3I9V2 4TRXA 3F4RA 5CAXA 5A4VA 2AAWA 4J57E 2AV4A 2A2RA 5CYYA 2KP2A 4JU5A 2JSYA 1F6MC 5LD0A 4FYUA 4OO4A 3LFLA 3KEBA 1GUHA 2VOCA 3FZ9A 3GX0A 2O89A 4DVCA 2YANA 4K7NA 3EVIA 3NIVA 4IJ3A 1GTUA 3CYNA 5ELGA 3IDVA 2AJQB 2WFCA 2JZTA 2LRTA 4V1Ag 1KNGA 2C3QA 4XCSA 5D96A 4CW9A 3QCPA 3DRNA 2GQLA 2H6ZA 3HVVA 4MZCA 3ME8A 2IMDA 3GNJA 1ERUA 1ZZYA 1OKTA 1AW9A 3KD0A 1TRSA 1DUGA 4QL9A 4E8EA 2REMA 4BVYA 4KA0A 3D5JA 3GHAA 5L71A 2GTUA 1XWCA 3QD9A 1DE2A 3MSZA 2B7JA 4XS6A 4G10A 1FOVA 4PQ1A 4WETA 5ECNB 3C71A 2V1MA 2LJAA 5C00A 2H1GA 1SYXA 1OE7A 1TP9A 1XVWA 2MMOA 4O7HA 1TK0B 1SU9A 2ZNMA 4L5LA 1B4QA 1FVJA 1GTBA 1Z9HA 1ZL9A 3IV4A 1M99A 1F3AA 1K0OA 1LBKA 4ZB9A 1V9WA 3KZQA 1XWGA 2YNXA 4F82A 2HRFA 3BCKA 3TUEA 3PR8A 3IOSA 3IE3A 1WIKA 5ECRB 2GSRA 2MZCA 2L6CA 2H73A 5DAKB 3WT1A 2LS5A 1XOAA 4POLA 2EIOA 19GSA 5CRHA 5JCGA 1SK0A 2B7KA 4MF5A 3LG6A 3FY7A 3ERGA 2JU5A 3F4TA 1ZMAA 4AJ7A 3GURA 2L4QA 1USBA 4FH8A 4FYBA 4KDYA 4ZL7A 22GSA 4FIWA 2B5YA 3ZFBA 4KNDA 2CV4A 2GVPA 4KAEA 5CRDA 3TOUA 2CZ3A 2VCVA 3GKXA 3HXSA 3GTUB 5E59A 3EYTA 2ON7A 2JZSA 3MAKA 3QFAC 2L5OA 4J2FA 4JRRA 4JE1A 1PL2A 4F9ZA 3DKSA 1JZDA 1XWKA 3W8SA 2WZ9A 2WS2A 5ECQB 2FHEA 1T3BA 1UVZA 1EOHA 3VK9A 4KCAA 4EDYA 4G19A 4YAPA 3DD3A 1GSYA 5HFKA 2E2MA 2M80A 3DWVA 5G5FA 1AQWA 1WOUA 3HYPA 4YQVA 2HRNA 1Q4JA 2VL9A 4GTUA 4ZBAA 1YKCA 2H74A 3IAS2 3Q74A 2R37A 5J5NA 3CBUA 1V40A 1YDKA 5CRGA 4N11A 3V1WA 4DSSA 2A4VA 2H01A 2TRXA 3F9UA 3GL5A 4BWQA 3TCOA 4DSRA 4EF0A 1OC3A 2AYTA 4F03A 3TJBA 3P90A 4NV2A 4CHSA 4V2MA 3H1NA 3P8WA 4EL1A 1MDIA 1GTIA 1H75A 4EKZA 4WBJA 3CSJA 2PUKC 3KMOA 3U5RE 2BTOT 1OE8A 3KCMA 5IMCA 4EC0A 1UC7A 1B48A 3UIWA 2P0GA 2GT6A 3CMIA 3LORA 1M9AA 3LGCA 1PA3A 3APQA 1M9BA 4HS1A 1M2BA 4NV5A 3WT2A 3EE2A 1XXUA 3GFKA 5EL8A 2C0EA 3D4TA 4XS4B 1GLPA 2VCTA 1M2DA 3F6FA 3FZ5A 1XIYA 2VM1A 2FNOA 5EVOA 4GLTA 2H71A 1BEDA 1R4WA 3DVWA 4ZILA 3UL3A 2H75A 1VF1A 1X9MB 5DALA 4K6XA 3E3EA 5ECIB 1EV9A 4LMWA 3LEFA 2H6YA 4IJIA 1TXXA 4POKA 2FA4A 5ECHB 5FHIA 3EINA 3IR4A 1ERWA 1VF4A 2VL2C 1BJXA 3VWVA 3FR9A 3ZL5A 3ME7A 3LXTA 4HQSA 14GSA 3UEMA 1F3BA 1PGTA 2CQ9A 2KHPA 9GSSA 3KH9A 2N5AA 5AISA 4L8EA 3FHKA 2F9SA 3FZ4A 1FG4A 1JZOA 3TGZA 2E7PA 3EURA 4EO3A 2MYGA 4ILFA 2DJ2A 2O7KA 1IYHA 2QSIA 2LQQA 5GZZB 1R5PA 3PGTA 2IMKA 4TR0A 2KOKA 2VLUA 1A8YA 5D8IA 4LL4B 4NHWA 1PD21 4X43A 2B3SA 1A24A 4IQAA 4YH2A 4MJAA 2LJKA 3TKRA 1QK8A 4XHMA 3K8NA 1A2LA 1QGVA 1Z3EA 5IMZA 3W8JA 1X5DA 2F3MA 4HZ4A 3LXZA 3OR5A 5CRWA 5AN1A 1DBYA 2H8LA 4XRAA 3GMFA 4L5OA 5GSSA 3M8NA 2VCZA 1F2EA 3TRQA 3O3TA 3HKRA 4TXVA 3TRXA 5IQYA 2IWTA 1TK8B 3A5WA 3JCML 4GCIA 3FR3A 2TIRA 3ZMLA 2IIYA 5F05A 3HJOA 4P3YB 2NTOA 1R5AA 4WKWA 2CT6A 1EEJA 2VD0A 1XPVA 3ED3A 2WULA 2PBJA 4PQHA 5IO2A 4JZQA 4MF7A 4KUNA 2WRTA 1CQHA 1ZCPA 3TJKA 2VUPA 3HZ4A 2FLSA 3Q18A 5A4UA 1G7OA 2CX3A 3I43A 3UVHA 2XBQA 3L9SA 2WB9A 1WWJA 2I1UA 3G7YA 4PGTA 2LKUA 5ID2A 3TJFA 1K3YA 1QQ2A 5D73A 2KUCA 5G1KA 5J41A 1PKZA 3GKKA 2H0IA 1VGLA 4ID0A 4TXOA 5IO0A 1X5EA 5ABRA 4QQ7A 2GGTA 5F07A 5G2ZA 2FWFA 3IA1A 2CZ2A 3US3A 2ALBA 2EC4A 1BG5A 3E0UA 4RI6A 3H8QA 5B8BA 1JFUA 1GLQA 3M1GA 2NBSA 5KN3A 2OADA 3I6AA 2DLXA 3CSHA 5J9BA 5D9XA 3KXOA 1G7EA 3DEXA 3FZAA 2I9HA 2X8GA 4GXZA 5IMFA 3KIJA 4BPYA 1SJ6A 4OFTA 3J7Yk 5JWOB 2YN1A 3HVXA 2BMXA 1HNBA 4ZIJA 4HUAA 2GSSA 2TRCP 2XHFA 5A5KA 1FB6A 1DSBA 2WCIA 2I81A 2R2JA 3GRXA 6GSVA 3HA9A 4Q5FA 1GSEA 3GKNA 1GWCA 1A2MA 2XPEA 2GZPA 4K0NA 3HCZA 1BAYA 1O8WA 3IK9A 3L78A 4O92A 3GSSA 5HFIA 1VF2A 2QC7A 4K2DA 3GX8A 2JZRA 4Q5RA 1A0RP 1U87A 1EP7A 4ZB8A 4IQ1A 4WF5A 4OMVA 3ERWA 1A2JA 2RIIA 3KTBA 1EGRA 1KTEA 4EUYA 1TK5B 1O81A 4MJEA 2VM2A 1VRSD 1QMVA 2PWJA 3H79A 1Z7PA 2C0FA 2XC2A 4PQIA 2JSZA 4IVFA 5IMAA 3EWLA 4TN8A 3BD2A 1OC9B 3ISOA 4KSOA 2RLIA 4MDCA 4MLYA 1EGOA 3UVTA 1MDJA 3M3MA 1YEXA 2C80A 2F8AA 4H86A 1SD9A 3ZITA 6GSTA 1V57A 1O6JA 2IL3A 2HSHA 3IBHA 4EDZA 1B9YC 1NHOA 4Q5QA 1SYRA 7GSSA 3IPZA 4OFNA 3LSZA 3TKPA 2DIZA 2OE1A 3GYKA 1NHYA 6GSUA 4JR4A 2YP6A 5ECKB 16GSA 2LJRA 2C3TA 4IELA 3IXRA 4KDXA 1SK1A 3P2AA 1TW9A 2OA7A 1KEBA 1TI3A 3HD5A 2CVDA 2K8VA 3N9JA 4IW9A 4K8MA 18GSA 5B6NA 3A2VA 2DMMA 4JEDA 4ZB6A 3ZVJD 1GSUA 2PVQA 2L59A 1AIUA 1AC1A 1H4OA 1OYJA 3UMAA 4TW5A 2O8VB 2HE3A 4MZWA 3Q6OA 3ZIVA 1S3DA 2L5LA 1XZOA 3FYGA 5AIXA 4K7OA 2IPAA 3ZVJA 2OBKA 3GV1A 2JADA 4JBBA 3QR6A 4OO5A 1ILOA 1SKRB 2FWEA 12GSA 1M0UA 4TR1A 2CVBA 3UBLA 1OVNA 4ISDA 3D0ZA 1PQNA 5IOXA 2GQKA 3HVSA 2HZFA 3M0FA 3TKSC 4AJ8A 1K0MA 4K0GA 4LMVA 1XWAA 3G7IA 3J7Yb 1MEKA 3RPNA 1XOBA 2X8CA 2OJLA 2VLVA 3HZ8A 4KCEA 4X1UA 3DVXA 1LU4A 4WR4A 3KP8A 3EMPA 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chains in the Genus database with same CATH superfamily
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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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