4BPYA

Crystal structure of the c90a mutant of the sco copper chaperone protein from streptomyces lividans
Total Genus 48
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
48
sequence length
175
structure length
162
Chain Sequence
QAATVLDKPFEKPDLVLTDTQGKKYDLREQTAGKPTLIYFGYTHPDVAPLTMNNIAVAKKQLSQAEQDKLRVVFVSTDPERDTPAALGKWLKGIDPQIVGLTGEFDTIQAGARTLGISIDPPGTQVVAFSPKSDAGYVLYGEDATVDDYTKDLPKLIKGENP
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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molecule tags Chaperone
source organism Streptomyces lividans
publication title Structural and Mechanistic Insights Into an Extracytoplasmic Copper Trafficking Pathway in Streptomyces Lividans.
pubmed doi rcsb
molecule keywords SCO PROTEIN
total genus 48
structure length 162
sequence length 175
ec nomenclature
pdb deposition date 2013-05-29

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF02630 SCO1-SenC SCO1/SenC
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.30.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich Glutaredoxin Glutaredoxin 4bpyA00
5LNKe 3HVSA 3LYKA 5AIVA 5B7CA 2MYGA 1YEPA 4PUAA 3C73A 3E0UA 2WDUA 4YQUA 4CHSA 2HI7A 4WKWA 5CO3A 3KP8A 2FWHA 1UN2A 1I5GA 3F6DA 2H6ZA 1B4PA 20GSA 5ABRA 3NIVA 4IS0A 5LCZA 2O8VB 1XPVA 3DVWA 1T4ZA 4AJ8A 3G7JA 4EVMA 3TJGA 1ZYQB 3VPTA 1GNWA 3GYKA 4XTSA 3IAS2 1OE8A 2DSAA 3GSTA 1SL0B 1PA3A 1WOUA 3QMXA 3ZZXA 5G5EA 2P31A 2L6DA 3J7Yk 4MABA 2HRFA 1T4YA 3W8JA 1WMJA 4FIWA 2X8HA 1PRXA 2B3SA 1BX9A 4YQVA 1BJXA 5CRWA 5HR2A 5D93A 3JCML 5HQPA 4O7HA 2E2GA 1SD8A 2OJLA 2HLSA 4BWQA 4NXIA 1URMA 1TKDB 3D6IA 4Z7XA 2BMXA 1BEDA 1UA5A 3PR8A 1Z6NA 4NV5A 2MZCA 2CA8A 5F05A 2NBSA 4MF6A 1EGOA 4EXJA 1T3BA 1X9MB 2IMDA 2ON7A 2H1GA 2RUEA 3L9UA 2CAIA 2DIZA 4NPBA 4JZQA 1AW9A 3F8UA 4OFTA 3TJKA 1A8YA 3FR6A 2H76A 3HHVA 4PQIA 2C1YA 4ULXA 4YH2A 4KGIA 2H1BA 4YAPA 3BCKA 1MTCA 5A4WA 3TKPA 3KP9A 3KH9A 5ECSA 1W4VA 1A2MA 2LNSA 1WIKA 3M3MA 5G30A 3BJ5A 4BPYA 1O85A 5ECPB 4WEYA 5DDLA 2IMIA 3CBUA 4MDCA 4RQXA 5FT3A 2JL4A 1ERUA 4TR3A 2XHFA 16GSA 4LL4B 1U88A 1XW6A 3QR6A 4V2MA 2VM1A 3GTUA 1M2BA 1Y25A 3EMPA 3WGDA 2VD1A 1PGTA 2YCDA 2M72A 1K0NA 1M7TA 3FHKA 3VFIA 4OCEA 5F06A 3FKFA 2VCTA 4J56E 4G10A 1GSYA 1XCCA 1MEKA 1AQWA 4ZIJA 3TB2A 2PERA 1GLPA 1XWBA 1GTIA 1U87A 2DJ0A 1NW2A 1SJIA 1J0FA 4XCSA 2AHEA 1SYRA 5F0GA 2B1KA 3TJJA 4HJMA 1XZOA 3GRXA 4HQSA 3EMXA 1TW9A 5B6MA 4KSMA 4WBRD 1DSBA 2ZNMA 3VWVA 5J5NA 4K2DA 2P5QA 4POKA 1GTBA 4F0BA 2GSQA 2K8SA 3FY7A 3ME7A 3RBTA 5HR0A 2JACA 5JCGA 3TKSC 1FB6A 2LJKA 1F2EA 4XS4A 3Q6OA 3MDKA 4TR1B 3APQA 4LA1A 2V32A 6GSYA 3ZTLA 2YWIA 2HNLA 1B9YC 2NVLA 2DMLA 4LMVA 3MNGA 3TGZA 4TXOB 2R6KA 1NHOA 2E7PA 5C04A 4WF5A 1TRVA 1UC7A 5G2ZA 4KDYA 5GSTA 4L5LA 4K6XA 1RQMA 4G19A 2J23A 2YPMA 1MD4A 4DSSB 3ZFBA 1M2AA 3DXBA 1TP9A 1M9AA 4WR4A 3ZRDA 1EOHA 2PWJA 5B8BA 1SJ6A 1YEXA 1SYXA 1JFUA 3QOUA 4KDXA 3FR9A 5J9CA 4IJIA 1SKSB 2C0GA 2H75A 4AGSA 4KB3A 4Q5NA 2KOKA 3Q19A 3P8WA 4KCEA 1I9DA 1M99A 1GSFA 5ECLB 2IMFA 3GA4A 3LSZA 2H72A 4DSQA 2RM5A 4KDUA 1JZDA 1XVQA 3O6TA 3FZAA 1G6YA 3TCOA 3L9SA 4NHZA 2C3NA 2ZCTA 3LEFA 3EURA 4XIHA 1QFNA 4EO3A 1NM3A 5G5FA 1TK5B 2LJAA 4BVXA 3VI5A 1GUHA 2H66A 1T7PB 3I69A 2C3QA 2YV7A 4MH3A 2RM6A 2YJ7A 3WGEA 3E9JB 13GSA 4TW5A 3EU4A 2GT6A 3P90A 4TR4A 3RHCA 14GSA 2DMMA 4WXTA 1HNAA 5C00A 3UEMA 2C3TA 4IELA 4O32A 4PQ1A 2OE0A 1QMVA 2HRNA 4FH8A 4OO5A 4MPGA 5IMFA 1FOVA 4KAEA 1K0DA 4N0ZA 4K0GA 3LYPA 2VCWA 5DJMA 4ML1A 3RHBA 1R5AA 1ERWA 4IW9A 2CVBA 2M80A 2WB9A 2FLSA 1AAZA 1H4OA 4N11A 5D8IA 2FHEA 3G9BA 1LU4A 2O87A 1XWGA 3HA9A 3QCPA 3KH7A 1A0RP 5JWOB 1VF3A 3FEUA 5DJLA 4JBBA 3LQ7A 3I6AA 3NZNA 1R4WA 3HJOA 3HVXA 3C8EA 4MJBA 5AISA 2YZUA 3EC3A 3ISOA 5DBQA 1SKWB 3IDVA 2AUVA 2P5RA 4PX1A 4MF7A 1GWCA 4TN8A 4D73B 3FW2A 1PKWA 2FD3A 1XOBA 3C7MA 1S3DA 1A23A 2FY6A 4IQ1A 2H0HA 5H5SA 11GSA 3D4TA 5EVOA 4IJ3A 3H93A 1A2JA 1GLQA 4K7OA 2CAQA 3D21A 2BJXA 2IPAA 2DJ3A 1QUWA 5LD0A 4MF5A 3TKSE 3ZFLA 5FWGA 3VWUA 3F3QA 2QSIA 2KHPA 5B6NA 1B9XC 4V2LA 4IQAA 3DIEA 2VIMA 1ILOA 2VLVA 5D9TA 3DVXA 1S3AA 2A2RA 4GTUA 3O3TA 4BVYA 5J41A 5J4UA 5FHIA 1O73A 1G7OA 4IP1A 2QGVA 4TR1A 2B1LA 4K9ZA 3L78A 4HOJA 4GLTA 5D9VA 3GL5A 4AF2A 3U6VA 3UIWA 5HFIA 4TXOA 4EE0A 1OC3A 3A2XA 4MZCA 2GDRA 2VL9A 2YJHA 2PMTA 3HCZA 4F2IA 4JE1A 2OADA 4ACSA 2H30A 4ZBDA 4I2TA 4K7IA 3EINA 2DJ2A 1TRWA 4DSSA 2VL2A 4IN0A 4NMUA 1A2LA 3ZYWA 3DGQA 3P2AA 5EY6A 1ZYEA 1TU7A 4FO5A 1XOAA 1XVWA 4NWYA 2QC7A 2C4JA 2VCZA 2ZUPA 4ZB8A 5A4VA 4N30A 1WPIA 3IHQA 4ECIA 2NPBA 2HFDA 4WBJA 2H01A 5L71A 2VCQA 3IAM2 2DIYA 3GKKA 2B7KA 4N10A 4FYBA 2DJKA 1PN9A 1HNCA 2H0IA 2MBTA 3L9VA 1GSDA 4OO4A 1KEBA 4H86A 1PL1A 4MK3A 6GSXA 4EF0A 4YQMA 3DKSA 2D2ZA 4JRRA 3V1WA 4E8HA 2F8AA 5JWQB 4YAVA 2LSTA 4GF0A 2L59A 3GX8A 2R2JA 4IKHA 4MMMA 4MZWA 1AQXA 2L4QA 5ENUA 3OR5A 2N5BA 1XWKA 1H75A 1R5PA 4OFMA 1SD9A 2FWFA 3QAWA 3I9V2 2IMKA 8GSSA 2PVQA 3IBHA 2YP6A 1EEMA 3HDCA 1JZRA 3UVTA 1T00A 5ECHB 5H5QA 1OKDA 2XBQA 2IIYA 3W6GA 2LKUA 4NAXA 1QK8A 3FR3A 3F3RA 3KIJA 2HZFA 3S9FA 2EIRA 5IOWA 3LGCA 1GTAA 2F51A 3IK9A 4P3YB 2LRCA 3ZIVA 4RI7A 3DD3A 4ZB9A 1MDIA 1SK1A 4GRFA 1DE2A 1A8LA 2OE1A 2H1AA 2YANA 1G7EA 3ERGA 3P7XA 3QDNA 3CSIA 3ME8A 3ZMLA 1XW5A 4HDEA 4I2UA 5JCWA 3A2WA 1GULA 4HJ2A 5HFGA 5D73A 2YWOA 1K3OA 1Q98A 3L0HA 5GAND 5ECRB 1V9WA 3F4RA 2IJYA 2B5XA 5HFKA 2Z9SA 2JZRA 3EVIA 2GQLA 3GUSA 3D22A 2R3XA 5F07A 6GSWA 3KTLA 4KX4A 2O89A 3KJYA 4D73A 2JADA 2VCVA 3TDGA 1JLVA 2R5GA 3H4KA 1YF0A 1DBYA 5IMVA 4RI6A 2REMA 1SKRB 5A4UA 3WGXA 1B8XA 1N8JA 1QXHA 4OWYA 3L4NA 1M0UA 4MJAA 1ZCPA 3DEXA 2VL2C 2O7KA 3HY2A 1TOFA 1PKZA 3TJFA 1ABAA 3F4SA 3HJPA 1E2YA 3CTFA 3HZ8A 3KXOA 1PQNA 4LL1B 1B48A 5JWRB 2TIRA 4KUNA 3LFLA 5A5KA 2G0FA 5CYYA 2V1MA 3TOUA 1EZKA 1OVNA 4I97A 5IMCA 4EUYA 2LV3A 2WZ9A 2FA4A 1XW9A 3KD0A 4AJ7A 1R7HA 5CNWA 3U5RE 4ZXGA 2C0DA 1K0BA 1O8WA 1JHBA 4MZBA 5G1KA 1AC1A 2X8CA 4MPFA 2GVPA 3FZ5A 5IIZA 6GSTA 3VURA 2EIQA 4F9ZA 2K8VA 2L57A 1EV9A 3EE2A 4PUFC 5IPHA 3QAGA 2NDOA 2LNTA 3ERWA 3F9UA 4F0CA 2GSSA 5ECOB 1NSWA 2GS3A 4V1Ap 5ECIB 3N5OA 3UL3A 4PGTA 1GP1A 1K0CA 2I4AA 3IK7A 2B5EA 5IM9A 2OA7A 3DMLA 1OAZA 1HYUA 2YN1A 1CQGA 1O8XA 4IVFA 7GSSA 2L5LA 2JZSA 1SL2B 4KH7A 2NTOA 2JSZA 6GSUA 4L0WA 3HZ4A 2F9SA 2IL3A 1F37A 1Z3EA 1QQ2A 3KM6A 1SK0A 2V2GA 2K9FA 2LRTA 3A2VA 3F0IA 5CREA 4ILFA 3RPNA 2FA8A 1R26A 3ZLPA 3IV4A 2VCXA 4F82A 1QGVA 2VUPA 2V6KA 3D5JA 1MDJA 4ID0A 5HR1A 1U6TA 2H74A 3BOAA 1EP7A 1F9MA 4JEDA 1F6MC 4GCIA 2PU9C 1EWXA 6GSVA 2GTUA 1OE7A 5ECQB 5EL8A 3BBYA 4IBPA 3VI7A 1O7UA 5IMZA 4ZL7A 1V58A 1WWJA 4JR4A 4RQRA 1GH2A 2HT9A 4L8EA 1LJRA 1EGRA 4PNFA 3ZITA 4XRAA 2B6MA 1MD3A 2MMZA 4POLA 2GT5A 5J9BA 1PX6A 2DLXA 2H73A 2LJRA 1K3YA 2VLUA 1GNEA 1X5CA 2WJUA 3GMFA 4ZBBA 1ZGNA 2AV4A 1TXXA 4X0XA 3HVVA 1BQ7A 5CP1A 1TRUA 3H8QA 5ID2B 4RUVA 5DCHA 2FCHA 1TI1A 2H6XA 2ON5A 1YKCA 2HE3A 1DE1A 3RPPA 3APSA 3TRXA 1Z9HA 4TRXA 3K8NA 4QQ7A 5KEJA 2H6YA 1Z5YE 4G9HA 2IN3A 3LWAA 2DJJA 2WS2A 3HD5A 1Z6MA 4Q5QA 3UBKA 3QAVA 4K1FA 2VL3A 1YZXA 2GZZA 1USBA 4BWSA 1A24A 2FWGA 1FVJA 2WFCA 1IYHA 4PNGA 2MMOA 3G7YA 3TJBA 4I8BA 2O85A 4MCUA 4OFNA 4AJ6A 4TXVA 2J9HA 5KN0A 4GWRA 2CZ3A 2I1UA 2HSYA 3NOFA 3M1GA 1HD2A 4KCAA 5DAKB 5COHA 3ZVJD 3FZ9A 4MJEA 2V6OA 4OMVA 3GV1A 10GSA 4KW6A 1BG5A 1ERVA 4TR0A 4K7NA 2MMAA 1SENA 3LXZA 2DBCA 2CX3A 4Q5RA 1Q4JA 4ECBA 1OYJA 3VLNA 1PX7A 2RLIA 2YOIA 1NHYA 3TUEA 2TRXA 3PINA 2I3YA 1YQ1A 2HYXA 2ALBA 1XBSA 4V2NA 3A3TA 4KNDA 1ZOFA 3EU3A 4POMA 4QL7A 2FWEA 5AN1A 1ZL9A 3E3EA 2R4VA 1FG4A 3BD2A 4ML6A 3LJRA 3QD9A 1FHEA 4HZ2A 1O6JA 1YJ6A 3Q18A 3ZREA 2WGRA 2C80A 1CQHA 1ML6A 5GZZB 3FK8A 2AAWA 3CYNA 4GQCA 5JCUA 2AJQB 3A5WA 3GKXA 5GAPD 3LG6A 2VOCA 3J7Yb 1V2AA 4IGJA 3ZMKA 1ZMAA 2F8FA 2LEGA 4K0NA 4DEJA 4HI7A 4L0UA 1F3BA 1EEJA 4HU7A 2IMEA 3C71A 4HS1A 1ON4A 1GRXA 2V41A 3PGTA 4G2EA 2JSYA 4ECJA 2YV9A 1THOA 1GUMA 12GSA 3ZIJA 1WP0A 3UAPA 3ERFA 1VF2A 2CX4A 1J08A 4BA7A 1X5EA 3ZL5A 1VGLA 1M2DA 1LBKA 3TKSA 3SBCA 5ECNB 4MP4A 3WYWA 1U3AA 1X9SB 1GTUA 1T8EB 2A4VA 5KN2A 2B7JA 1GSEA 2H70A 2CVKA 2YNXA 3CSHA 2C8UA 4MJCA 3O76A 2H8LA 1N2AA 2EIOA 3UARA 4HUAA 4N0VA 5IO0A 3IA1A 4BL7A 4LLRA 4OCFA 2N5AA 4IHUA 4GQFA 3F63A 2C0EA 2GQMA 5INYA 4MA9A 4O92A 1K0MA 2XPDA 4EDYA 1TK0B 4WETA 4JU5A 2M46A 4KA0A 4L5OA 5ID2A 2FGXA 1EV4A 2PGTA 3IRAA 1AUCA 2GSTA 1HNBA 4V1Ag 2HZEB 3KTBA 2KLXA 1KNGA 3I43A 3RDWA 1B4QA 3GNJA 1XWCA 3CSJA 1W89A 3N9JA 4XS6A 3WT1A 5ELGA 5G1LA 1PD21 5E4WA 4CDOA 2XPEA 1MDKA 1FVKA 4PQHA 3W8SA 4TVEA 2MBSA 1TRSA 2JZTA 2AB6A 3VWWA 2TRCP 1VF1A 1ZZYA 18GSA 2VO4A 4X1UA 4PXOA 3H79A 4HEA2 1JZOA 3UBLA 2OKAA 1Z7PA 1ACVA 1F3AA 5IQYA 2LTKA 1G6WA 3QFBC 2YWNA 1YDKA 2R37A 3HYPA 1Y6EA 2XC2A 5DAKA 4ISDA 1WJKA 4EDZA 1HQOA 1K0OA 1E6BA 1S3CA 2H71A 2VM2A 1FW1A 1K3LA 1TJDA 4O5RA 2CVDA 2LQOA 4ECCA 9GSSA 2WRTA 4E8EA 2FUG2 5AGYA 1GSSA 1T1VA 3BCIA 2KP1A 3MWHA 5IOXA 5DALB 3VPQA 4ZL8A 2B5YA 2IFQB 2PN8A 2OBIA 3UOMA 4ZILA 2GLRA 1THXA 6GSSA 2DJ1A 4FYUA 3GKMA 1BYEA 4KE3A 1OC9A 3UJ1A 5F8BA 2GZYA 2X8GA 2K6VA 1JZWA 4TOPA 2GGTA 3DWVA 3F6FA 3M8NA 17GSA 1C72A 4WF4A 4EKZA 4NHWA 4I5QA 1EOGA 3GHAA 3H1NA 5J3RA 4FYCA 1FB0A 4ZL9A 3M9JA 3C1RA 5EPFA 1GSUA 5CRHA 1U3IA 2K18A 2OACA 3ED3A 4J2FA 4ZBAA 1X9WB 2KP2A 2G2QA 2X99A 4XRDA 3FYGA 4Q5FA 2WULA 22GSA 4IP6A 4POBA 5ECMB 1XWAA 5AIXA 2LUSA 1M9BA 3KMNA 2GZPA 3CXGA 3DYRA 3IXRA 4NV2A 3GIXA 3PH9A 3VK9A 2F3MA 1TTZA 3KGKA 4TKYA 2MMNA 3R2QA 4JR6A 3G7IA 3MSZA 5G31A 1A0FA 1WRYA 4EL1A 3IOSA 5CAXA 1FAAA 2IWTA 1XIYA 2HSHA 2EC4A 1TDIA 1SL1B 2DC5A 2H0GA 4HQZA 3HKRA 2C0FA 3M9KA 1V40A 1K0AA 2WCIA 1FO5A 2L5OA 2FNOA 2X64A 2JU5A 5GSSA 3KCMA 2XBIA 4GXZA 1TI3A 5IO2A 4DVCA 3GH9A 3TOTA 4HU9A 1OC8A 4KSOA 2CQ9A 4ZB6A 3QFAC 2HXKA 1GL8A 2E0QA 2H19A 3C1SA 3RAZA 2LS5A 1AIUA 3GKNA 1ERTA 3HJMA 1SU9A 1IYIA 3SWLA 1ST9A 2L6CA 1RK4A 2LQQA 4J57E 3CRTA 1X5DA 3IR4A 2CZ2A 2CV4A 2HZEA 2N5FA 3D0ZA 3DRNA 3ZVJA 3FZ4A 2E2MA 5ECKB 1PL2A 3HXSA 2OE3A 5CRGA 2I9HA 3LORA 2VD0A 3D4MA 3KEBA 5D96A 3EYTA 1GSQA 1Z7RA 3QPMA 2GSRA 1YF1A 1TK8B 5IMDA 3IE3A 1WE0A 2PPTA 3CTGA 1PMTA 1X0RA 5D9XA 2P0GA 1VF4A 4DSRA 4X43A 3IPZA 2I81A 1SK2A 2OBKA 4QL9A 3EWLA 3MAKA 2VLTA 2QKEA 1EP8A 4K8MA 4I6XA 2PUKC 2H1DA 3GTUB 3M0FA 2PVOC 4XS1A 3VWXA 1KTEA 3FRCA 1DUGA 1TU8A 2VAFA 3KZQA 3CRUA 2A2SA 3WD6A 3GURA 4PURA 19GSA 1KBNA 4OD7A 4HZ4A 2L4CA 5IMAA 2BTOT 3CMIA 2YZHA 3GX0A 5DALA 4F03A 1AQVA 3UMAA 2LRNA 3GFKA 5E59A 5H5RA 5DCGA 2IFQA 1OKTA 5DQSA 3US3A 4XHMA 3TRPA 5ELAA 3KMOA 4MH2A 3TRQA 2KUCA 3TKRA 5DQYA 1V57A 5KN1A 1J9BA 3GN3A 5HR3A 1AXDA 1PSQA 2RUFA 1VRSD 1SJZA 2AYTA 2GQKA 1OC9B 1O81A 1GUKA 5KN3A 1V98A 4GSSA 4LMWA 2ES7A 5DVBA 2PBJA 4CW9A 3LXTA 3WT2A 1XFLA 3AY8A 3GL3A 3GH6A 4WR5A 1RW1A 3F4TA 3IC4A 1XXUA 2YWMA 3GSSA 3UVHA 1JLWA 4MLYA 5IPGA 1G0TA 4GSNA 5B8AA 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chains in the Genus database with same CATH superfamily
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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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