2CVKA

Crystal structure of thermus thermophilus thioredoxin
Total Genus 31
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
31
sequence length
105
structure length
105
Chain Sequence
KPIEVTDQNFDETLGQHPLVLVDFWAEWCAPCRMIAPILEEIAKEYEGKLLVAKLDVDENPKTAMRYRVMSIPTVILFKDGQPVEVLVGAQPKRNYQAKIEKHLP
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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molecule tags Electron transport
source organism Thermus thermophilus
publication title Crystal Structure of a Reduced Thioredoxin from Thermus thermophilus HB8
rcsb
molecule keywords Thioredoxin
total genus 31
structure length 105
sequence length 105
ec nomenclature
pdb deposition date 2005-06-04

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00085 Thioredoxin Thioredoxin
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.30.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich Glutaredoxin Glutaredoxin 2cvkA00
1TJDA 2JZTA 5B6MA 2REMA 4DSSA 4I2UA 2H0IA 1T3BA 3CYNA 1GSEA 2PVQA 1XVWA 3G7JA 2OJLA 2DLXA 4TXOA 1FW1A 4K2DA 1UVZA 3BCIA 4IELA 4N0VA 3UARA 17GSA 4MK3A 3PINA 2LNSA 1RK4A 3Q19A 2B5YA 3VWXA 3HDCA 3EU4A 1ERWA 4HU9A 4NV5A 3DD3A 1XFLA 3QDNA 2VLUA 4MCUA 4I8BA 1M9AA 2YWOA 2YN1A 4BL7A 1JZDA 1OVNA 1VGLA 5GSTA 1CQHA 2LUSA 4ZL7A 4OFNA 4ML6A 4DSSB 5JCWA 4F03A 1WE0A 2GZPA 4JU5A 5HR1A 1F2EA 4MABA 2CQ9A 1VRSD 3ZZXA 4IQAA 1OKDA 3VFIA 2XC2A 2LJKA 4TXOB 1BJXA 3G9BA 2FHEA 2ON7A 3DVXA 1K0NA 1OC3A 1U3AA 1K0OA 1GULA 3APOA 1E6BA 3IPZA 4L5LA 1M2DA 5KN3A 2IMEA 2B1KA 3SBCA 3FR6A 5HR2A 4V2LA 5FWGA 4IVFA 1XWKA 4ZL9A 2VL2A 2H74A 3GX8A 1HQOA 4O92A 3TOTA 1AXDA 4Q5QA 1O8XA 1ZYEA 1XOBA 2G0FA 2H73A 1YF0A 2K8SA 1JZWA 4RQRA 1TU8A 2HRFA 4AGSA 4K7NA 4N30A 5EY6A 4MZBA 1S3CA 3ZRDA 4NV2A 3LXTA 4FO5A 1LBKA 3MWHA 2WB9A 2V2GA 1DE1A 4JR4A 1NSWA 2AV4A 3EE2A 5IMVA 4WXTA 2TIRA 1WRYA 1EOHA 2NDOA 2ON5A 3LEFA 3J7Yb 3HY2A 2H30A 4GRFA 2B1LA 2BTOT 3G7YA 3TJFA 5ECSA 5F06A 1FOVA 3KJYA 4IJIA 5B8AA 2NPBA 3GV1A 1WP0A 6GSXA 3H4KA 1JFUA 4YQVA 4XS6A 1EV4A 1K0MA 3TJKA 1TI1A 5IMDA 4ECCA 3C71A 2M80A 5EPFA 2HNLA 4FIWA 2VUPA 5AGYA 1THXA 2VOCA 2IWTA 2LS5A 4MJAA 5D8IA 3GFKA 3I43A 5ELAA 6GSUA 3GX0A 1Q98A 2LQQA 1PL2A 5IOXA 2YZUA 3MAKA 3DMLA 1EP7A 2C1YA 5G1KA 5DAKA 3KP9A 2C3QA 4ZBAA 1O7UA 4ZL8A 3RHCA 1X0RA 1QQ2A 3ZITA 2EIRA 3CRTA 3PGTA 6GSTA 5ECRB 1AQVA 2YJ7A 2GT6A 2LRCA 2DJ1A 2YPMA 2YANA 3FEUA 3ZMKA 3F3QA 4MPGA 1PRXA 2KOKA 3GUSA 2QC7A 3KTBA 2WULA 1SKSB 4EVMA 4GQFA 2GSTA 2V32A 2I1UA 5EL8A 4NXIA 2IMFA 4JR6A 1GUHA 3ERFA 3WGXA 1SJIA 1YF1A 1T7PB 3I9V2 1AQXA 2OKAA 5DJLA 8GSSA 3DRNA 1GNEA 1ML6A 2N5BA 3IK7A 3TRQA 18GSA 2OE0A 4KSOA 4ECBA 3D5JA 5DAKB 4QL7A 1EZKA 4AF2A 4YQUA 4ZXGA 4TRXA 3KTLA 1YQ1A 3IRAA 1GLPA 2V6KA 3TKRA 1W4VA 1MD4A 3LWAA 4MJCA 5C00A 3VI7A 3F63A 4Q5FA 3ZREA 3KCMA 1PKWA 4YH2A 5FT3A 1HNCA 4K1FA 4PQIA 2V41A 2GQLA 5G1LA 3QAVA 1TP9A 2MBTA 4OMVA 1T8EB 1HYUA 2FCHA 2L6CA 3GH9A 2VM2A 1B9YC 3KGKA 5CNWA 5G2ZA 2D2ZA 1JLVA 1PQNA 4OO4A 11GSA 1A8YA 5CRHA 4IHUA 1SK0A 2DJ2A 1GSFA 4EL1A 1EGRA 5A5KA 1PMTA 2JSZA 1ZZYA 2IN3A 2ZNMA 2WS2A 2G2QA 4RI7A 1OYJA 1NM3A 2QKEA 1PN9A 1MDKA 1S3AA 1X5EA 3UEMA 2QSIA 1EOGA 1Q4JA 3ZMLA 4JRRA 3CTFA 4YQMA 3GYKA 1K0CA 3IAS2 3ERWA 1EV9A 4YAVA 4ID0A 2CX3A 5IQYA 3FRCA 4H86A 3KH7A 3BBYA 2P5RA 2EC4A 3EVIA 1DSBA 5HFGA 2RUFA 2EIOA 3EURA 1X9MB 1XW9A 4ZIJA 3FZ4A 4DVCA 4NAXA 3IOSA 1RQMA 2YWMA 2VIMA 3KP8A 4G9HA 3HYPA 3C1RA 3KM6A 1MEKA 3TJBA 4BWQA 3QAGA 3TKQA 3M9JA 2M72A 2MBSA 1XW5A 4RQXA 1A2LA 1SYRA 4EC0A 2OA7A 2LQOA 2HYXA 5IMAA 2HSHA 4ECJA 2C3NA 4PNFA 2H75A 1XXUA 1KTEA 3IE3A 2N5FA 2DC5A 4NMUA 3FHKA 1MD3A 5IMCA 5D9TA 5KN0A 2HZEA 2I4AA 4HUAA 4NWYA 1BYEA 1Z7PA 4KE3A 3WT1A 1FB6A 3ZIJA 1AUCA 3D4MA 5DALA 4HZ2A 10GSA 1OC9A 2FWFA 2PPTA 2R37A 3W6GA 5JCGA 4MJEA 4TXVA 4K0NA 3LYKA 1SJZA 3O3TA 5D73A 3VLNA 1SKRB 2DJ3A 3TKSA 2FA8A 2VD1A 3IAM2 5CYYA 1A0RP 4FYCA 5DCHA 1PL1A 2FWEA 5E59A 3ME8A 2YOIA 4XIHA 4WR4A 5J3RA 1SD8A 3I6AA 4G2EA 4GQCA 4KA0A 1B4QA 3ZFBA 3ZYWA 2GSRA 1LJRA 2HZEB 1SKWB 2OACA 4N10A 2C3TA 5DQYA 2FWHA 2VM1A 3KMOA 3QPMA 1GRXA 2YWIA 1H75A 1XZOA 5DALB 4JEDA 4IS0A 3QOUA 1OC9B 5HFIA 1AAZA 3VPTA 1FB0A 2E2GA 3QFBC 2MMOA 3PR8A 3FZ9A 1V98A 3CMIA 2WDUA 4XRDA 3Q6OA 5ECLB 4XS1A 1CQGA 2FA4A 3CSJA 1UC7A 3D21A 5E4WA 1B8XA 4KB3A 1ZYQB 1WMJA 4J2FA 1MTCA 1QK8A 4PUAA 4OWYA 1M2BA 3HHVA 3AY8A 2E2MA 2ZUPA 4HJ2A 3WD6A 2FNOA 1JHBA 2Z9SA 1YZXA 4MH3A 5CREA 2VL2C 2I3YA 1XW6A 4XTSA 3EMPA 4OO5A 4NPBA 2KP1A 2P0GA 3GL3A 4MA9A 2LJRA 1B48A 3FW2A 4O32A 3GIXA 1GWCA 3UVHA 5D93A 1WJKA 1C72A 1KBNA 4X1UA 2KP2A 3A2XA 3U5RE 5G5EA 3EC3A 4HI7A 1OC8A 1ZOFA 1EEMA 1QXHA 4DEJA 1VF3A 3Q74A 4O5RA 3VK9A 4MF6A 1R26A 2CV4A 6GSVA 2NBSA 2GZYA 2GZZA 4HQSA 3ZL5A 1Y25A 4JZQA 4IP6A 2R6KA 2PMTA 1PD21 4Q5NA 2OADA 2XPEA 1Z6NA 2F8FA 1R5PA 1PGTA 2OE1A 2HI7A 2YV9A 4ISDA 1F9MA 2QGVA 3QAWA 3LQ7A 4XCSA 4IP1A 1G6WA 1XVQA 4G19A 3DKSA 5CRGA 2XPDA 4POLA 4CW9A 1X5CA 1FG4A 3F6DA 2VCWA 4KGIA 2TRCP 1K0BA 2A2RA 3F4TA 3ZIVA 3FK8A 3EU3A 3MSZA 3UOMA 3VURA 4LA1A 4HJMA 3L9UA 4GSNA 3GMFA 16GSA 1K3LA 1GH2A 1GUKA 2K18A 3UMAA 3LG6A 2LKUA 1TU7A 1NHYA 2FGXA 1J08A 5H5SA 5IPHA 4WEYA 9GSSA 2GS3A 4TR3A 1MDIA 4L0UA 5KN2A 2CVKA 1O85A 3VWVA 5J4UA 1SD9A 3IV4A 5EVOA 1GSQA 2VCVA 5FHIA 3TJJA 3BJ5A 4ZB9A 4IN0A 3RHBA 4L0WA 2FLSA 1R5AA 2YCDA 3TKSE 3TDGA 2TRXA 3KH9A 4QQ7A 2HFDA 2PGTA 5DCGA 1SK1A 1ZCPA 4WBRD 2CT6A 5F0GA 1TRUA 4KCEA 4AJ8A 3FYGA 1TK5B 5IPGA 1TOFA 2H0GA 4JE1A 2P5QA 4I6XA 2C80A 2FD3A 4KDYA 4OFTA 2YWNA 1YKAA 1OKTA 3DXBA 2PU9C 4RI6A 4GSSA 4EXJA 2IL3A 2HLSA 1X5DA 3HKRA 5ENUA 3WGEA 2GVPA 3BOAA 5ECIB 3TUEA 5G30A 4ECIA 5HFKA 3E9JB 3EINA 2CVBA 5ECQB 1Z6MA 2CZ3A 2H66A 3BD2A 3GKXA 2IMDA 2LV3A 1FAAA 3LJRA 5F05A 3UL3A 5COHA 1XWAA 1XBSA 3D0ZA 3TGZA 3UBKA 3BCKA 1BQ7A 4PUFC 3NZNA 2AYTA 14GSA 3LORA 5H5QA 5HR3A 1GSSA 5IO2A 2X8GA 3IXRA 1B9XC 1WPIA 13GSA 3H1NA 3M8NA 3TKPA 4FH8A 1JLWA 1GSDA 1SL0B 2IPAA 4TN8A 2L4CA 3GN3A 1U88A 1UA5A 2J23A 2K9FA 4F0BA 3F0IA 3TCOA 1BX9A 1JZOA 3RBTA 1TXXA 5CAXA 3DWVA 2GSQA 1K0AA 2VO4A 2H1AA 2X64A 1A2MA 3MNGA 5A4VA 4G10A 2H1GA 5JWOB 5AN1A 2V1MA 1J9BA 3C73A 3ZTLA 2VCZA 2M46A 1AQWA 2H8LA 5IIZA 2DIZA 2DJ0A 2X8CA 1O81A 1J0FA 1ERTA 1PSQA 1FVKA 1AW9A 5A4WA 4I97A 4IJ3A 4ML1A 5IM9A 1T00A 4K0GA 5D9XA 3IDVA 1G0TA 3WYWA 2F51A 1HNAA 3O6TA 3A3TA 5JWQB 2L5LA 4MF7A 1PX7A 2H76A 3APSA 1OE8A 2JZRA 3EWLA 4KNDA 3IK9A 4K7OA 1XCCA 3CRUA 2WGRA 2VL3A 1F3BA 2MYGA 2C8UA 3CXGA 3RPNA 2DJKA 2L59A 4EE0A 5CRWA 2K8VA 1GSYA 4X0XA 3H8QA 4NHWA 4GCIA 5CP1A 2AB6A 3C8EA 4PURA 2H70A 2O8VB 3APQA 5ECMB 3L4NA 3FR3A 3H79A 3U6VA 1A8LA 4TKYA 3GURA 4BVYA 3TRXA 1JZRA 3GA4A 2LRNA 1K0DA 2HT9A 2RM6A 2C0EA 1YEPA 3TKSC 2WFCA 3MDKA 2MMNA 3FZAA 4POKA 1T4YA 1BEDA 4JBBA 3L0HA 4POMA 4PGTA 4ZILA 1M9BA 3GKMA 1UN2A 4MLYA 1W89A 2F8AA 2LNTA 3J7Yk 1U6TA 1AC1A 2L57A 3CTGA 3JCML 3UJ1A 1GSUA 4GLTA 1QFNA 1HD2A 4MP4A 3V1WA 4PQHA 1X9SB 3FZ5A 4I5QA 4F9ZA 5ECHB 2H71A 3HJPA 2IMIA 5ECOB 5D9VA 4KDXA 4HS1A 5B7CA 1E2YA 2E7PA 3KMNA 1YY7A 3UVTA 2YJHA 1Z3EA 5INYA 3KEBA 4ZBDA 2CX4A 4BVXA 5GAPD 1XIYA 4GXZA 4TR1A 4TOPA 4V2MA 2LSTA 4WKWA 1DE2A 1F6MC 2R5GA 4GWRA 1O6JA 3CSIA 4L5OA 2EIQA 2VCQA 3ED3A 1N2AA 2IIYA 2J9HA 2ES7A 2LTKA 1FVJA 2ALBA 3HVSA 1THOA 3ZVJD 4OFMA 4BA7A 2O7KA 4LMWA 5GAND 1TRVA 2H6ZA 3D22A 1Z7RA 1ABAA 4LL4B 5ECPB 2GDRA 1VF4A 4O7HA 5JWRB 1X9WB 1AIUA 1R7HA 3P2AA 1BG5A 3OR5A 4EO3A 4GTUA 2KHPA 3QR6A 1OAZA 5ECKB 3O76A 3VI5A 1M2AA 5GZZB 3WGDA 1WIKA 4TR1B 4ILFA 2H19A 3LXZA 3F3RA 1ZMAA 4BWSA 2HXKA 2DBCA 4MH2A 3F8UA 3TOUA 3P8WA 4KW6A 2AHEA 3TRPA 1XOAA 2JL4A 2DMLA 5ABRA 4V1Ap 3IHQA 1H4OA 1U3IA 3ZFLA 4DSQA 3LFLA 2BMXA 2A2SA 1LU4A 2DIYA 4ULXA 3A2WA 2GQKA 3HVXA 4XHMA 3GTUA 4D73A 2XBQA 1G6YA 5DDLA 3L78A 3D6IA 1YDKA 3HA9A 1EGOA 2O85A 4MF5A 1XWGA 4Z7XA 4ZB6A 3FR9A 2B6MA 2ZCTA 4EUYA 1BAYA 1HNBA 4ACSA 2KLXA 3EYTA 2RIIA 3HJMA 2PUKC 2JZSA 4LL1B 2GLRA 3GKNA 4CHSA 5ID2A 4MMMA 1T4ZA 3ZLPA 5D9WA 4K9ZA 2VD0A 20GSA 1B4PA 5CO3A 5IOWA 3LGCA 4P3YB 4IGJA 1PA3A 2WJUA 1OE7A 2FUG2 5L71A 1TI3A 3GTUB 2L4QA 2C0FA 4D73B 2FY6A 5J9CA 5D96A 5IO0A 1XWBA 4PQ1A 2AAWA 2B5XA 3ZVJA 5GSSA 3M9KA 2MZCA 6GSWA 1TRWA 3QMXA 3ME7A 4PX1A 2HRNA 1GLQA 2MMAA 5LCZA 2AJQB 5ID2B 3DIEA 1VF1A 2O87A 1GP1A 1V57A 2GTUA 3IA1A 2I9HA 1PX6A 3GSTA 5DVBA 2L6DA 4E8EA 4KSMA 3FY7A 5ECNB 2CVDA 5IMZA 1U87A 1URMA 4OD7A 5LNKe 6GSYA 2IMKA 2XHFA 5J41A 1KEBA 5AISA 2WRTA 4HOJA 2GT5A 2B7KA 3N5OA 4FYUA 4K7IA 3US3A 4KAEA 2H1DA 5B8BA 2LEGA 3E0UA 2P31A 1TRSA 3CSHA 3VWWA 1YJ6A 4HU7A 3NOFA 4OCEA 1TTZA 2XBIA 2DSAA 1IYHA 3K8NA 3P90A 4TR0A 4WF5A 3W8SA 1TW9A 4J57E 4FYBA 4IQ1A 1R4WA 3C7MA 5A4UA 1SYXA 2B7JA 5KEJA 1WWJA 5JCUA 2R4VA 4AJ7A 2YP6A 4ZB8A 3N9JA 3LYPA 3L9VA 1WOUA 1GUMA 1ACVA 2VCXA 2CAIA 5ELGA 3HCZA 4TR4A 4WETA 3R2QA 3QFAC 1GTIA 3L9SA 2HZFA 4DSRA 1F3AA 5DQSA 4E8HA 5LD0A 1ON4A 1QMVA 1ZL9A 1K3OA 1SENA 2CZ2A 1MDJA 4V1Ag 4I2TA 2GGTA 2FWGA 2VLVA 5G5FA 2H6YA 3M3MA 3RAZA 2MMZA 5G31A 4HZ4A 2NVLA 3M1GA 4HEA2 3M0FA 1A2JA 4BPYA 3Q18A 2DMMA 4N0ZA 4LLRA 1IYIA 3A5WA 1F37A 4X43A 7GSSA 4KCAA 4AJ6A 2R3XA 12GSA 3S9FA 3GSSA 2A4VA 4J56E 4OCFA 1DUGA 1NHOA 1O8WA 1ZGNA 3EMXA 1EWXA 3W8JA 4F0CA 1N8JA 1RW1A 1QGVA 4IW9A 3RPPA 2VCTA 3GRXA 3FKFA 4POBA 4XS4A 3VWUA 2PERA 5CRDA 3ISOA 3DEXA 3IBHA 2CAQA 1ILOA 1ERVA 2E0QA 3TB2A 3HD5A 4GF0A 4EF0A 1DBYA 2GSSA 3GL5A 3HJOA 3KXOA 2H0HA 4QL9A 4TVEA 1SU9A 3HVVA 4KH7A 1QUWA 2WZ9A 4EDYA 2K6VA 6GSSA 3E3EA 2GQMA 5HR0A 2PWJA 3F9UA 2KUCA 1A23A 1ERUA 3DVWA 3DGQA 4ZBBA 3P7XA 1PKZA 2X99A 2HSYA 5DBQA 1Z9HA 4NHZA 2H1BA 2YZHA 2NTOA 4XS4B 2BJXA 2X8HA 4L8EA 2LRTA 2H01A 2PN8A 3GHAA 1USBA 2VLTA 2YV7A 2F9SA 4F82A 3F4SA 1XWCA 2L5OA 2JU5A 4PXOA 4V2NA 3QD9A 3IC4A 5F07A 2I81A 1EEJA 1O73A 2CA8A 3RDWA 4YAPA 4MDCA 4F2IA 4K8MA 5J9BA 1M7TA 2VL9A 1I5GA 2H6XA 2N5AA 4MPFA 2O89A 1TKDB 3A2VA 3QCPA 1M99A 1YEXA 4TW5A 2VAFA 3KD0A 3KZQA 1SL2B 4IBPA 1M0UA 4K6XA 1Z5YE 2JACA 3F6FA 1FHEA 2PBJA 2WCIA 1KNGA 3DYRA 3D4TA 3UAPA 4CDOA 5HQPA 2B5EA 4KUNA 2DJJA 1V40A 1XPVA 1GL8A 3HZ4A 3G7IA 5AIXA 2C0DA 2H72A 5C04A 1A0FA 3GH6A 2OE3A 4EDZA 1NW2A 3ERGA 1SJ6A 2C0GA 1SL1B 22GSA 1TK0B 2B3SA 3NIVA 2RLIA 2OBKA 3PH9A 3GNJA 1Y6EA 2RUEA 3H93A 3I69A 2IFQA 5J5NA 3TJGA 4LMVA 3HZ8A 1YKCA 2RM5A 1K3YA 1V58A 1V2AA 4KX4A 1S3DA 1GTUA 4HDEA 2LJAA 4XRAA 2YNXA 4WBJA 2C4JA 4IKHA 4MJBA 4EKZA 2IJYA 5F8BA 1TDIA 1G7OA 4MZCA 1GTAA 5DJMA 3GKKA 1GNWA 3HXSA 5IMFA 1A24A 2V6OA 2IFQB 5AIVA 4KDUA 3LSZA 2HE3A 5KN1A 4WR5A 2JADA 5B6NA 3UBLA 2JSYA 1TK8B 3C1SA 1EP8A 4PNGA 1VF2A 4RUVA 2PVOC 3CBUA 3F4RA 1SK2A 2OBIA 4Q5RA 1FO5A 3IR4A 4MZWA 4N11A 1I9DA 1G7EA 3WT2A 3SWLA 3KIJA 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chains in the Genus database with same CATH superfamily
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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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#similar chains, but unknotted
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#similar chains in the pdb database (?% sequence similarity)
...loading similar chains, please wait...
How to cite