4OCFA

Crystal structure of the disulfide oxidoreductase dsba (s30xxc33) active site mutant from proteus mirabilis
Total Genus 62
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
62
sequence length
187
structure length
187
Chain Sequence
ADISEGKQYTNLSKPVAGAPQVVEFFSFYSPHCYQFSEVYKVNSTVEKNVPENTKMARYHVDFLGPLGKEMTRAWAVAIALGVEDQVSPALFKGIQETQSIRSVDDIRTTFINAGVKAEDYDAAINSFVVNSLVSQQQNAVTDFQINGVPAMVIDGKYKMKNDGISAKSPEEYAKAYSDVVNQLLMK
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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molecule tags Oxidoreductase
source organism Proteus mirabilis
publication title Crystal Structure of the Dithiol Oxidase DsbA Enzyme from Proteus Mirabilis Bound Non-covalently to an Active Site Peptide Ligand.
pubmed doi rcsb
molecule keywords Thiol:disulfide interchange protein
total genus 62
structure length 187
sequence length 187
chains with identical sequence B, C, D
ec nomenclature
pdb deposition date 2014-01-09

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF01323 DSBA DSBA-like thioredoxin domain
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.30.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich Glutaredoxin Glutaredoxin 4ocfA00
4NWYA 2V32A 1T7PB 3GKXA 1A8YA 3ZYWA 3FK8A 3H4KA 3CSHA 3PINA 3VFIA 2LKUA 5JCGA 3GX0A 4TR0A 1QQ2A 5IPGA 2GT5A 2VLVA 4ECCA 1TU7A 1BX9A 2KUCA 6GSXA 3Q6OA 3ZITA 2L57A 1NHYA 5E4WA 4PNGA 1XXUA 4BVXA 1DE2A 4PNFA 5F0GA 2C0DA 3CTFA 1GRXA 3FZ4A 5AN1A 3GTUB 1XCCA 2P5QA 3C1SA 1JLWA 2GDRA 1ERUA 3UL3A 3KIJA 1F3BA 2JSZA 3LGCA 1TJDA 2NVLA 3UIWA 2AAWA 5IMFA 3GYKA 3TRXA 1GLQA 4ZBDA 4DSSA 3F4RA 1LJRA 2LUSA 2XBIA 3HXSA 4BVYA 2VD1A 5HR0A 1GTBA 4X43A 3ZTLA 1R7HA 2QGVA 1QFNA 3KMOA 2VD0A 3ME8A 5J3RA 2DC5A 1PMTA 5J5NA 4IQAA 2PUKC 1R5PA 3HHVA 1TOFA 4D73A 4GSTA 4ILFA 1VRSD 2H1BA 3IPZA 2H6YA 4F2IA 1GUMA 2FA4A 3TKSA 2PERA 3VWWA 2PVOC 4GSNA 5B6NA 3ZVJA 2JU5A 2YWIA 4MABA 5DQSA 1G6WA 1EV9A 1Y6EA 1V57A 3QAVA 3KH9A 5ECOB 1BYEA 5D96A 3QAGA 2H76A 4FYUA 4ACSA 4BWSA 1ML6A 3U5RE 3APOA 4XRAA 3KM6A 5AISA 2OE1A 4K6XA 4F9ZA 4HQSA 4YQVA 3LYKA 2C0GA 5H5RA 5IMVA 4NXIA 1UA5A 4OWYA 2K8SA 3EU3A 3KMNA 1K0MA 4IS0A 2H75A 1FG4A 2L5LA 2YWMA 4HU7A 3BD2A 3WYWA 4WBRD 4MZWA 3UVTA 2R4VA 2IMIA 2TRXA 4HS1A 3GX8A 1QMVA 4POMA 5J9CA 2AUVA 2GQMA 5F05A 1X9WB 4MF7A 4OFMA 5DQYA 2O85A 2YNXA 3ZL5A 3KTBA 1KNGA 5CREA 4WKWA 1LU4A 4ZBBA 1SL2B 2TRCP 2OACA 2IL3A 2H6XA 4EL1A 1GLPA 2GSSA 2CZ2A 3DEXA 2YOIA 2H8LA 5ID2B 2I9HA 2VCZA 2FWHA 1TK5B 5GSSA 2C1YA 1F37A 3KJYA 3F4SA 2GZYA 7GSSA 1Z7PA 2WFCA 5KN2A 3GH6A 5CP1A 4XRDA 2V6KA 3VK9A 1GUHA 1T00A 3UOMA 2FUG2 5A4WA 3FR3A 4Q5FA 5ECLB 4GQFA 3FY7A 2R37A 2FWEA 2LNSA 2L59A 1WIKA 4PQ1A 1MTCA 1J0FA 5JCWA 4K0GA 2VL2A 3MWHA 5DVBA 1WWJA 1JZDA 1PQNA 1OKTA 1A24A 3F3QA 4WR5A 1OAZA 3RDWA 4N10A 14GSA 1Z6NA 2JADA 2VM1A 4IJ3A 1BQ7A 4IHUA 2H0HA 2RIIA 4J57E 2VIMA 2IPAA 2ZNMA 1ACVA 4JZQA 2HNLA 4MK3A 4AJ8A 2X64A 2EC4A 1ZYEA 5E59A 2VOCA 3F6FA 1H75A 2DMMA 1QXHA 3UBLA 4WETA 2DJ3A 4K8MA 4K1FA 1ERWA 3KH7A 4TRXA 4WF4A 4L0UA 4NPBA 3TOTA 2J23A 5D93A 1SJZA 1YJ6A 3EWLA 3I69A 3KD0A 1G7EA 3TRPA 2KLXA 3J7Yk 3DRNA 3CSIA 2VCXA 5IMZA 3BOAA 1XWCA 2O87A 4WEYA 3ZVJD 4DSQA 2H70A 1ERVA 2CAIA 3GMFA 1F6MC 1TI1A 4HQZA 3TCOA 3WD6A 3ZFLA 3D6IA 3US3A 2H71A 2HI7A 2I3YA 2WGRA 5D8IA 5J41A 4X0XA 1XVQA 1SD8A 2HLSA 4LL4B 2C80A 5IO2A 1B9YC 4NMUA 4HU9A 1HYUA 2A2SA 1GSFA 3UBKA 1YZXA 1YF1A 4XS1A 2DBCA 4FYCA 1MD3A 1AXDA 1GSEA 1YF0A 2OE0A 5CRHA 4ZL8A 3TJBA 2F9SA 2JZRA 2GZZA 1Z5YE 1TI3A 1PSQA 3L4NA 2WCIA 5KN1A 4IGJA 3EE2A 1F2EA 1SYXA 1X0RA 4MP4A 1E6BA 4KUNA 2DJ0A 18GSA 5ELAA 4K7NA 2CT6A 1DUGA 2M46A 1FHEA 1F9MA 3IK9A 3K8NA 1JLVA 4GWRA 2N5FA 1OE7A 3EC3A 3EINA 2GZPA 4QQ7A 1YQ1A 1JZOA 1G0TA 3QR6A 3HJOA 4NV2A 1RW1A 4OO4A 4BWQA 2V1MA 3TKRA 4MJAA 1XWBA 2R5GA 2GTUA 2O89A 2JZTA 2K18A 1XFLA 2IFQB 2WB9A 1KTEA 1AUCA 3MSZA 3ZMKA 2WJUA 3BCIA 3OR5A 4IP1A 1W4VA 2I4AA 3DYRA 1TRUA 3KXOA 4WR4A 1N8JA 1ZL9A 1M2DA 1OYJA 4AJ6A 1WE0A 3HJPA 5G1KA 3DVWA 1X9MB 2VL3A 5HR2A 2V2GA 3KGKA 1U88A 2XHFA 4KDXA 2HZEA 3ZZXA 1ABAA 2NTOA 2LRNA 3GNJA 4MH2A 3KTLA 1M0UA 2TIRA 1TXXA 3PGTA 3ERFA 3PR8A 4LL1B 1V98A 1YKAA 3TKSC 3CMIA 5JCUA 1T1VA 2FNOA 5ECQB 4OD7A 2YWOA 4IELA 17GSA 2GGTA 3WT2A 4JR6A 5HFIA 2MMZA 3ZLPA 4EDYA 2ON5A 2G2QA 3W8JA 1NSWA 3HJMA 5A4UA 4KH7A 2C3QA 1SK0A 2DJJA 1SKWB 4MJCA 5LD0A 4OMVA 5ECNB 3A2XA 5G2ZA 5LCZA 1FO5A 3FR9A 3D0ZA 3HVXA 3UMAA 4F82A 4AF2A 3IR4A 1TK8B 1THOA 4TR1A 4JBBA 1JZRA 3L9VA 1K3LA 2D2ZA 5B8AA 3KP9A 5DAKA 2FLSA 2WDUA 5CRGA 5HR3A 5DCGA 1YDKA 5DALB 20GSA 2GT6A 2XC2A 5AIVA 4PGTA 4BPYA 3LEFA 2R3XA 1QGVA 6GSUA 1AQVA 2L5OA 2KOKA 2H19A 3IAS2 2E2MA 4F03A 5IPHA 1XBSA 4Q5QA 2YPMA 2CVBA 1PN9A 2DIYA 2EIQA 1RQMA 3KCMA 4DVCA 4ZB8A 4POKA 3BCKA 1G7OA 2X8GA 1KEBA 3TKPA 1Z9HA 2IWTA 2FWGA 4ECJA 2A2RA 4TR4A 4XS6A 1A8LA 1FB0A 1JHBA 3UEMA 2X99A 2X8CA 2H0GA 4TVEA 2VCVA 1MDJA 3FKFA 2H74A 3H93A 3MNGA 2X8HA 2HT9A 1KBNA 5EPFA 1T3BA 3F0IA 1GH2A 3M1GA 5D73A 3LYPA 3E0UA 1O85A 4H86A 3W8SA 4CDOA 1GWCA 2VL2C 2IN3A 1YY7A 1O8WA 3O76A 3CSJA 3C73A 3LJRA 4TXOB 2DSAA 3F8UA 1HNAA 4ZXGA 1SL1B 2LS5A 4QL7A 2R2JA 5DBQA 4KDYA 4HZ4A 3E9JB 1QK8A 2HSHA 4GQCA 4GSSA 1WJKA 1NHOA 4TW5A 1S3AA 3D5JA 5F06A 2GSRA 4KW6A 4YAVA 1UN2A 2AYTA 3LSZA 1PL1A 3IC4A 6GSTA 1J08A 2YZUA 3Q18A 1VGLA 2B1LA 1A0RP 3F6DA 1FVJA 2MMAA 1K0BA 1K0AA 3LXTA 4O32A 1GSYA 4MJEA 4RI7A 6GSYA 1OC9A 5COHA 4EVMA 2CV4A 2C0EA 3E3EA 4POLA 3QCPA 5D9VA 3ZIJA 4O7HA 4PQHA 2XBQA 3C1RA 2IMKA 2L6DA 1FVKA 2EIRA 3APSA 3GV1A 5G30A 4HDEA 2E2GA 4PUFC 4Q5NA 2YZHA 2MYGA 4I8BA 4KSOA 3P8WA 5G5EA 5DJMA 2YP6A 5ECSA 2DJ1A 5A5KA 4JRRA 4X1UA 3EMXA 3IBHA 2LV3A 5ECMB 3G7IA 1F3AA 5KEJA 2FY6A 1SU9A 2PMTA 3HVSA 4JEDA 4EO3A 1B4PA 1M2BA 1Z3EA 4KDUA 5C00A 4DSSB 3H1NA 1A23A 3HKRA 5AIXA 3IA1A 4PURA 1R5AA 2DJ2A 4MDCA 1U6TA 3KEBA 1BJXA 4JE1A 1FAAA 3DMLA 4EF0A 2DIZA 3HY2A 1B9XC 2H1AA 3GHAA 3ZFBA 4D73B 4G19A 3F4TA 4WBJA 2XPEA 4KAEA 1ST9A 2H1DA 1E2YA 3CBUA 4DSRA 2KP1A 4FH8A 4GCIA 1IYIA 2NBSA 4WXTA 5CO3A 2RUFA 3MAKA 4LLRA 1PD21 3C7MA 1CQGA 2HRNA 2YV7A 4YQUA 2YN1A 3DXBA 1K0CA 4AJ7A 3IHQA 3ERGA 4ECIA 1ZZYA 5JWQB 16GSA 4TR3A 3I6AA 4K2DA 2LQOA 4TOPA 2PGTA 2ZCTA 3FZ9A 1GNEA 1X5EA 1XOBA 2IMDA 4GXZA 3A5WA 3HZ8A 3IRAA 1LBKA 2GLRA 5B7CA 1V58A 4E8HA 3EURA 1AAZA 4PQIA 3GL3A 4KB3A 4KGIA 3R2QA 1GSDA 4G2EA 2C3NA 3RHBA 2FGXA 3P90A 1VF3A 2L4CA 1PRXA 4MLYA 1HNBA 3TDGA 3CXGA 3GSSA 1GSQA 3TB2A 3D21A 1M9BA 4MF6A 3GKMA 3CYNA 4XS4A 4K7OA 4POBA 4MPGA 4JR4A 5EY6A 3A2WA 1EEJA 1PX7A 2LEGA 3FEUA 4RQXA 3M3MA 2CQ9A 1CQHA 2CA8A 1B4QA 4EE0A 2VLTA 5GAPD 1T4ZA 1ZYQB 4CW9A 5J9BA 5B8BA 1X9SB 3DKSA 3SWLA 3DIEA 2M72A 2G0FA 3LFLA 2HFDA 4NHWA 4MA9A 1DE1A 1PA3A 4ID0A 2HSYA 1S3DA 2H73A 3UVHA 4ULXA 5HFGA 3LORA 5IO0A 1EV4A 1XWKA 3MDKA 3QD9A 5FT3A 2EIOA 4HOJA 3RPNA 5H5SA 3GTUA 4IBPA 2VCWA 3L9SA 3HDCA 2B5XA 4ZB6A 3UARA 4L5OA 2B7KA 2JSYA 1Q4JA 4HEA2 2RUEA 5IOWA 4YH2A 2HYXA 2JL4A 1SKRB 1BEDA 1UVZA 2YWNA 1AC1A 3FW2A 4MH3A 2LTKA 2PN8A 1DBYA 1J9BA 2H01A 4TXVA 1AW9A 2F3MA 2R6KA 3ZIVA 1SKSB 4J2FA 5FHIA 5FWGA 4RUVA 2B5YA 4OO5A 4OFTA 2BJXA 1GTIA 2K8VA 3GURA 1TKDB 3G9BA 5J4UA 2B5EA 3DGQA 4MZBA 2L4QA 5ABRA 1MEKA 1Z6MA 3CTGA 3WGEA 5IM9A 3HZ4A 2GS3A 4TN8A 4EKZA 3FR6A 3FYGA 3ISOA 2RM5A 2FWFA 1XW9A 1SYRA 5CRWA 2H1GA 3L9UA 2QC7A 4KA0A 4I2UA 4WF5A 1A2JA 1EGOA 3VPTA 2YJ7A 1ON4A 1FB6A 3EYTA 2M80A 4G10A 4BA7A 3GIXA 1K0OA 2C8UA 1Q98A 6GSWA 5HFKA 3CRUA 4V2LA 1EOGA 2LRTA 4EUYA 2PBJA 3S9FA 1S3CA 1M7TA 4N11A 1GTAA 4EXJA 5IIZA 1Z7RA 2ON7A 3IV4A 2PU9C 1A2LA 4AGSA 1A0FA 2F51A 2WZ9A 1M2AA 1MD4A 1V2AA 4HI7A 2CVDA 3TRQA 3GUSA 5D9XA 3ED3A 2K9FA 1R26A 1A2MA 3G7YA 1PKWA 3J7Yb 5AGYA 1U3IA 3TGZA 4NV5A 3LG6A 5IOXA 1O81A 3GSTA 3TJKA 4NHZA 4FO5A 2BMXA 1SD9A 4N0ZA 3GA4A 4I5QA 1OVNA 3M9KA 5A4VA 9GSSA 3IXRA 1M99A 1TRSA 5IMAA 1U87A 3PH9A 4MJBA 3VWVA 2QSIA 5DJLA 5ID2A 2OBIA 1O8XA 4K0NA 4MF5A 3UJ1A 2JACA 3TJGA 3APQA 1WPIA 3N9JA 4K9ZA 3Q19A 1XVWA 3IAM2 4ML6A 2LQQA 3U6VA 1T8EB 2MMOA 2P31A 2H72A 1YEPA 1M9AA 2VM2A 5DCHA 1O6JA 4IN0A 4HUAA 3FHKA 4GF0A 4HJ2A 4LMVA 5IMDA 2GQKA 4FIWA 2AV4A 1N2AA 1VF2A 2PVQA 2C0FA 4IJIA 1K3YA 3H8QA 1ZGNA 2OE3A 13GSA 1SENA 1EEMA 2GQLA 1SJIA 3TUEA 3HYPA 3F9UA 4MCUA 1GL8A 1HNCA 1GUKA 1ZCPA 1XPVA 1EWXA 1V40A 2GVPA 3LQ7A 1XOAA 2N5AA 4Q5RA 2WULA 2P5RA 2HZEB 4IW9A 1X5DA 2K6VA 1UC7A 2VAFA 2CX4A 4KNDA 5CYYA 2OJLA 3BJ5A 1PX6A 2WRTA 1WOUA 3IE3A 5GZZB 1TRVA 3O3TA 2RLIA 1GTUA 4V1Ag 1SK1A 1XZOA 4ISDA 4PXOA 3LWAA 4RI6A 1SK2A 1VF4A 3D4MA 2I81A 1EP7A 2DLXA 1BAYA 4IKHA 3FRCA 1B48A 3ZMLA 2MBTA 2H0IA 3KP8A 4YQMA 3JCML 2B3SA 3VWXA 1IYHA 1PKZA 2XPDA 4KCAA 1K3OA 2IIYA 2OKAA 4I6XA 1JZWA 2MBSA 4KE3A 4N0VA 5HQPA 4O5RA 4FYBA 4P3YB 12GSA 3G7JA 3L0HA 5F07A 5IMCA 3F63A 4TR1B 3VPQA 1GSUA 1MDIA 2VL9A 2B1KA 1FW1A 5DAKB 5GAND 1OC3A 1W89A 3WGXA 3QAWA 1VF1A 1THXA 2NDOA 1TW9A 1TK0B 4ML1A 2YJHA 2I1UA 2HE3A 2MZCA 5CRDA 1I9DA 2IMEA 4Z7XA 1SJ6A 4I2TA 3RHCA 5C04A 3I43A 3ERWA 3GN3A 1C72A 4DEJA 2VO4A 4ZB9A 4ECBA 3C71A 3QOUA 3GKNA 5KN3A 1BG5A 1TP9A 1Y25A 5G1LA 1WP0A 3M8NA 2PPTA 3VI7A 4HZ2A 4F0CA 2H6ZA 2ES7A 5ECPB 3TKSE 2PWJA 5B6MA 1B8XA 1DSBA 2IFQA 2LJRA 4BL7A 5L71A 4ZBAA 3TJJA 4GLTA 2FHEA 4OCFA 3IDVA 3I9V2 2OA7A 1USBA 1OKDA 2IMFA 1ILOA 3ZREA 3DVXA 2E7PA 2AHEA 3KZQA 3DWVA 2VCTA 3ME7A 5DDLA 2F8AA 4XHMA 1XW6A 3QFAC 2RM6A 1FOVA 5ENUA 3HCZA 5INYA 4J56E 19GSA 3WT1A 5G5FA 2MMNA 4L8EA 1ZOFA 4LMWA 2OADA 1EP8A 1NW2A 1XW5A 4GTUA 3QDNA 3IOSA 3VLNA 2FA8A 2KHPA 1JFUA 3M0FA 4G9HA 5CNWA 5JWOB 1X5CA 5ECHB 3SBCA 4L5LA 1NM3A 8GSSA 4JU5A 1TTZA 3UAPA 5D9TA 1AQXA 5LNKe 5HR1A 3QPMA 4MZCA 4F0BA 2VLUA 4MPFA 1GNWA 2CAQA 1K0NA 3FZ5A 4V2MA 5IQYA 2REMA 3GKKA 4YAPA 4KCEA 2AJQB 2J9HA 5ECKB 4RQRA 11GSA 2VUPA 1OE8A 6GSVA 5F8BA 1URMA 4OFNA 3VURA 2C3TA 1OC9B 3NIVA 1YKCA 3HD5A 3N5OA 3TKQA 4ZILA 3GL5A 5JWRB 5H5QA 4IQ1A 2IJYA 1HQOA 1O7UA 2HZFA 1RK4A 1G6YA 3LXZA 2V41A 2HRFA 5EVOA 3ZRDA 2FD3A 2V6OA 4MMMA 4V1Ap 2L6CA 4LA1A 2HXKA 4IVFA 3A2VA 3C8EA 2NPBA 3IK7A 4L0WA 3QFBC 4GRFA 3NZNA 1SL0B 5ECRB 3AY8A 1I5GA 4PX1A 3W6GA 4ZL9A 5D9WA 1TU8A 3GH9A 3EMPA 3H79A 1O73A 3L78A 1QUWA 2LRCA 3P7XA 5DALA 2ALBA 3VWUA 3RBTA 4ZL7A 1OC8A 4ZIJA 2E0QA 3P2AA 3QMXA 4CHSA 2DJKA 2Z9SA 3BBYA 3D22A 2LJKA 1ZMAA 3GFKA 2WS2A 2C4JA 3EU4A 2AB6A 4PUAA 4XIHA 3FZAA 4NAXA 4E8EA 2LJAA 1GULA 1EGRA 1XWGA 2FCHA 22GSA 10GSA 1TRWA 3WGDA 2KP2A 4TKYA 2VCQA 2YANA 1AIUA 4XCSA 1EOHA 1TDIA 2H66A 3Q74A 4OCEA 2O8VB 3F3RA 2YV9A 1XWAA 4V2NA 1U3AA 2CVKA 2JZSA 4IP6A 1R4WA 4I97A 1PL2A 2N5BA 4EC0A 4KX4A 5ELGA 1ERTA 1WMJA 2CX3A 3HVVA 3GRXA 1GP1A 2H30A 1EZKA 5GSTA 3CRTA 2CZ3A 1MDKA 3TOUA 2GSQA 3TJFA 3M9JA 3DD3A 3V1WA 3O6TA 2LSTA 4TXOA 5EL8A 4KSMA 2O7KA 5ECIB 4K7IA 2QKEA 3HA9A 5CAXA 4XTSA 4HJMA 2BTOT 3RPPA 1PGTA 6GSSA 1YEXA 3D4TA 2B7JA 5G31A 1V9WA 4QL9A 2DMLA 2A4VA 2P0GA 2LNTA 4EDZA 3A3TA 2YCDA 1T4YA 2B6MA 2ZUPA 2F8FA 1HD2A 2GSTA 2OBKA 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chains in the Genus database with same CATH superfamily
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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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