4OCFA

Crystal structure of the disulfide oxidoreductase dsba (s30xxc33) active site mutant from proteus mirabilis
Total Genus 62
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
62
sequence length
187
structure length
187
Chain Sequence
ADISEGKQYTNLSKPVAGAPQVVEFFSFYSPHCYQFSEVYKVNSTVEKNVPENTKMARYHVDFLGPLGKEMTRAWAVAIALGVEDQVSPALFKGIQETQSIRSVDDIRTTFINAGVKAEDYDAAINSFVVNSLVSQQQNAVTDFQINGVPAMVIDGKYKMKNDGISAKSPEEYAKAYSDVVNQLLMK
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
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molecule tags Oxidoreductase
molecule keywords Thiol:disulfide interchange protein
publication title Crystal Structure of the Dithiol Oxidase DsbA Enzyme from Proteus Mirabilis Bound Non-covalently to an Active Site Peptide Ligand.
pubmed doi rcsb
source organism Proteus mirabilis
total genus 62
structure length 187
sequence length 187
chains with identical sequence B, C, D
ec nomenclature
pdb deposition date 2014-01-09

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF01323 DSBA DSBA-like thioredoxin domain
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.30.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich Glutaredoxin Glutaredoxin 4ocfA00
2YN1A 2OE3A 3KCMA 2GZZA 1EP7A 1TI3A 1O7UA 2NPBA 1I5GA 3IXRA 3VPQA 3GV1A 1R5AA 1GH2A 2BJXA 4KAEA 1THXA 3KXOA 3FZ9A 3FR3A 4HI7A 2C0EA 3HHVA 1F2EA 4LMWA 2HZEA 3W8SA 2MZCA 2DJJA 4V1Ag 3DRNA 2E7PA 2F3MA 2FWGA 4GQFA 1KTEA 2JSYA 8GSSA 4GRFA 4XHMA 2HRNA 2ZCTA 4IGJA 3GKNA 1ERWA 2FA4A 2H8LA 3ISOA 4MMMA 5AIVA 5J9CA 3BCKA 3D21A 1GTBA 3GH6A 4ZB9A 1X9MB 1K3OA 2ALBA 3QOUA 4EVMA 1URMA 1OAZA 2TRCP 4JE1A 1FB6A 1PGTA 1WRYA 1SKSB 5DAKB 5DCHA 5IIZA 2C80A 3ZVJA 3RPNA 4MPFA 1VF3A 3H1NA 2GQKA 3KM6A 5CYYA 2CAQA 2R6KA 3P7XA 1FAAA 16GSA 4IW9A 3ME7A 3PH9A 4HZ4A 4V2MA 3TJBA 4N11A 2B3SA 3C71A 4MJCA 14GSA 3HD5A 4PUAA 2FGXA 4KH7A 3RDWA 13GSA 3IRAA 2ON7A 2C1YA 4K0GA 3D0ZA 1GSQA 4ZBBA 3DMLA 2LJKA 3LQ7A 1HNCA 5ECOB 1XOBA 5G1KA 5HR1A 1T1VA 2JACA 2QC7A 3ZITA 3KIJA 3GSTA 4OO4A 1B48A 1MEKA 1XXUA 1T4YA 2WULA 3APSA 4FH8A 4KNDA 2L57A 5LD0A 5CP1A 1OVNA 1ABAA 1Z5YE 3H79A 5G1LA 3ERGA 5J5NA 4MLYA 1N8JA 1XIYA 4Q5NA 2OE1A 5FT3A 1TI1A 1ST9A 4MPGA 6GSSA 2LTKA 1SYXA 1T3BA 1ACVA 2IMKA 2WDUA 3QAVA 4NV5A 1F9MA 3HJMA 2LV3A 4LL1B 6GSXA 1AAZA 3GYKA 1F3BA 2DIZA 3IDVA 3IR4A 3DEXA 1M9AA 5AISA 2LRTA 3IK7A 1E2YA 1QUWA 3A2XA 5ECPB 4EL1A 1U6TA 2H6YA 1SU9A 3F4TA 4ZL7A 1EV4A 3FY7A 1XFLA 1U3AA 2M46A 2KLXA 4E8HA 3GSSA 1Z9HA 3QAGA 5IPHA 3LGCA 3UL3A 4F9ZA 1KNGA 1LU4A 3CRTA 5JCGA 1GNWA 2H01A 4AJ6A 4O5RA 4XCSA 3A2WA 5EVOA 4MJBA 3F9UA 3LEFA 1YF0A 1GTUA 1Z7PA 4HU7A 1PSQA 5IOWA 1MTCA 4ZBDA 2GQMA 2VAFA 4MZCA 2IFQB 4G9HA 1B9YC 2YWIA 2A2SA 2CVKA 1JHBA 3TRQA 1C72A 4N30A 5EPFA 3KMNA 4LMVA 3A5WA 2KHPA 4YAPA 1SENA 5H5QA 2EIRA 1DE1A 2B1KA 3GTUA 3KH7A 2DJ3A 3GX0A 1ZZYA 1MD3A 2OADA 2L5LA 2G0FA 2C0DA 6GSVA 4PNFA 1YJ6A 1TP9A 3FRCA 4MZWA 3US3A 4DSRA 2REMA 3G9BA 3D4TA 4K8MA 4QL7A 4TOPA 1VRSD 4YQVA 1ERTA 1X5EA 3TKQA 4NPBA 3VWWA 2FCHA 2VL3A 1ERVA 2CQ9A 4HUAA 3N9JA 5HFKA 4MJAA 4BVXA 3GN3A 2V2GA 3FR6A 20GSA 1TRWA 2L5OA 4K7IA 2X8GA 5D9TA 2YJHA 4O32A 1EP8A 5B8BA 2KUCA 3F6DA 1R26A 3E0UA 3CTGA 2JZRA 1MDJA 2EIOA 1X9WB 2V32A 3EE2A 5IM9A 3CXGA 1PX6A 4PXOA 3Q18A 3KP9A 1EEMA 4YAVA 3EINA 1Z6MA 1AUCA 4HJ2A 5DAKA 5DALB 2DMMA 3HVXA 3F0IA 1Z7RA 3PR8A 5A5KA 2H6XA 4E8EA 1N2AA 3KTBA 1MDKA 5IPGA 4J56E 4PGTA 1XWCA 1FB0A 3CSJA 3GKKA 1U88A 3TRXA 1O8WA 4OWYA 1HQOA 4G2EA 1K0DA 2P31A 2OKAA 4ACSA 1GLPA 4TXVA 1S3AA 1BYEA 5ECIB 3EMXA 3IPZA 1FW1A 3OR5A 2F9SA 3GA4A 4G10A 1T7PB 2YJ7A 1BQ7A 4TR1B 3MAKA 3LWAA 3Q74A 3M1GA 2PMTA 3SWLA 19GSA 1JZOA 3QD9A 4WF4A 1KBNA 1GLQA 4GSTA 2LNSA 3PINA 3I6AA 1V58A 5G31A 3TJFA 1OE8A 4XTSA 3U6VA 17GSA 4PUFC 3UAPA 22GSA 4KDYA 2FNOA 1R4WA 4K9ZA 5ELAA 4CHSA 1QK8A 3DWVA 4GWRA 4POBA 2PERA 5A4VA 2AV4A 2HSYA 4F0CA 3H8QA 4RI7A 2X99A 5GZZB 5CREA 5DJLA 3DVXA 2VO4A 4BPYA 4KB3A 3HDCA 3LXZA 3WT2A 11GSA 3QFBC 4D73A 3TOTA 1AXDA 1YEPA 5AN1A 2DLXA 2PN8A 4POMA 1NM3A 2FWHA 1VF4A 4XIHA 4K6XA 3UVTA 5HR0A 1AQVA 5IO2A 2H74A 2L59A 4BL7A 5IMAA 1SK2A 3F4SA 2N5BA 1GTAA 3J7Yk 4KSMA 1K0OA 1GTIA 4MZBA 1GP1A 3N5OA 3R2QA 5COHA 3O76A 4Q5RA 2DC5A 3HCZA 2H70A 4DVCA 1SJZA 1JLWA 9GSSA 2FY6A 2CT6A 4ZL9A 3IAM2 1Q98A 4XS4B 2H76A 2DJ0A 4ML1A 1ZMAA 3TKRA 4GCIA 2PUKC 3HA9A 3DKSA 1A0RP 4EO3A 2K8SA 2H71A 1W4VA 5GSSA 1TRVA 1SJ6A 5B7CA 4J57E 4HOJA 1F6MC 5E59A 1G7OA 4YH2A 2E0QA 1QMVA 3VWUA 2YV7A 1GUMA 3S9FA 5DBQA 1CQGA 2R4VA 2G2QA 1Z3EA 3EMPA 3QFAC 3AY8A 4MP4A 3GUSA 3GX8A 4TN8A 1Z6NA 2BTOT 1OC3A 2IJYA 3TGZA 4RQXA 1SL2B 3EVIA 2YP6A 2RM5A 3TOUA 4AJ8A 3HVVA 5ECNB 2MMNA 4HU9A 1PL2A 2VOCA 2YZHA 3F3RA 2LUSA 1M99A 4MJEA 1WWJA 4BWSA 1U87A 5KN0A 1UN2A 3P2AA 3D4MA 5ECMB 1M2BA 3ZRDA 1XW6A 4NHZA 1ON4A 4IVFA 4EDZA 3ZMLA 3O3TA 5ECSA 4DEJA 5IQYA 3UBLA 1A0FA 2RIIA 4HZ2A 5ID2A 4GXZA 3C73A 4IJ3A 4K2DA 5GSTA 1GUKA 5KEJA 3WGDA 3NIVA 5HFGA 4V2LA 2C0GA 2XPEA 4I2TA 1DSBA 2IL3A 1A23A 3LYKA 2OA7A 3KD0A 4JBBA 2HYXA 1XBSA 1OKDA 2WRTA 2F51A 2MBSA 4KE3A 3ZL5A 1UC7A 1O73A 4MABA 3BCIA 2BMXA 2EC4A 5L71A 1XWAA 1RQMA 3KTLA 2OBIA 1OKTA 3HZ8A 3HKRA 3EURA 3DIEA 2IPAA 5C04A 2HXKA 4ECJA 4P3YB 5DCGA 1J08A 4Q5FA 2ES7A 4MF5A 2I4AA 2MMOA 1EV9A 2IMIA 5DQSA 5JCUA 4HQSA 4L5LA 4XRAA 2MMZA 3BOAA 2DIYA 3IC4A 1SK1A 4IJIA 4TR0A 2VCZA 3C8EA 2QGVA 1ZGNA 1ILOA 1OC9B 5ECHB 3U5RE 3W8JA 4DSSA 4QL9A 4J2FA 4ULXA 1VF2A 4F2IA 3EU4A 3ERWA 3F8UA 3DD3A 5CO3A 1B4PA 3APOA 5CRDA 5ECLB 2H0IA 1O6JA 1GL8A 2FWEA 2V6OA 2F8FA 1XZOA 2DJ1A 3UOMA 2GT6A 3M9JA 1H4OA 2C3NA 3IK9A 2IIYA 2XPDA 1TRSA 3PGTA 1GSDA 1WIKA 4WR4A 2ON5A 1RK4A 3O6TA 1TU8A 1LBKA 1DE2A 2WFCA 1YQ1A 3VWVA 1PQNA 1JLVA 3BD2A 1XW5A 4TR4A 1K0CA 3E9JB 4I2UA 3CSIA 2GZYA 5GAPD 4HQZA 2PPTA 5D96A 2JZSA 3GL3A 1Y25A 1YKCA 1HYUA 2FWFA 12GSA 5CRHA 4EF0A 3GH9A 4XS6A 4X1UA 1M0UA 1XWKA 4BVYA 2KOKA 2GVPA 5JWOB 2O7KA 6GSUA 1SJIA 2H1DA 3ERFA 5IOXA 2J9HA 4I6XA 3A3TA 5G5FA 3ZREA 1TKDB 5H5RA 1B8XA 1V2AA 5GAND 2IMEA 2IN3A 4QQ7A 3FZ4A 3VPTA 4TXOB 2JSZA 4ZB6A 4AGSA 4YQMA 3IOSA 10GSA 1YDKA 1GULA 3CMIA 2M80A 2JU5A 3LSZA 4MF7A 3IA1A 1XWGA 3W6GA 3M8NA 5D9VA 1GSSA 2GS3A 2H30A 1WPIA 1G7EA 3DYRA 4EC0A 1AIUA 2LQQA 1THOA 2WS2A 4ECIA 1ZOFA 2GSTA 1X5DA 1BAYA 5FHIA 4IHUA 4IQAA 4AF2A 2C0FA 2L4QA 1Y6EA 3E3EA 2NVLA 3TJKA 3MSZA 4EUYA 3SBCA 1A2LA 2O85A 4TKYA 1SKRB 3KJYA 5AGYA 4XRDA 2GLRA 1PL1A 3L9VA 3IE3A 5EL8A 4HJMA 2GDRA 2X8CA 3FZAA 4KSOA 2YWNA 2Z9SA 3NOFA 3QCPA 1HD2A 1K0BA 4HS1A 2VM2A 1OE7A 2K9FA 4OFMA 2VCTA 3D22A 1HNBA 5ECRB 3L78A 4JEDA 2OACA 3LXTA 4ECBA 2VL2C 3GKMA 3GMFA 2GGTA 1J0FA 2GT5A 1G6YA 4PURA 5HR3A 5JCWA 3ZFBA 3FYGA 1XVWA 2H19A 4GTUA 5A4UA 4TRXA 2MMAA 4KCEA 3RHBA 1JZWA 1IYHA 1R7HA 3F4RA 4OCFA 2CZ3A 1VF1A 2H6ZA 5B6NA 2PGTA 1CQHA 5F0GA 3LJRA 1BJXA 2X8HA 4IKHA 1PRXA 1X9SB 3TKSC 3GKXA 2B5YA 1EOGA 2LRNA 3UVHA 2HFDA 2HRFA 2YCDA 3NZNA 4N10A 3JCML 2L6CA 1T00A 2ZNMA 1GUHA 4LLRA 3L9UA 2GZPA 2R2JA 4ZILA 1I9DA 3IAS2 3CTFA 4CW9A 3TDGA 4KX4A 4WF5A 2XBIA 4GQCA 2FD3A 3HVSA 2B5XA 1PKZA 3BJ5A 1M2DA 1WP0A 2P0GA 1DBYA 2L6DA 2TIRA 2AYTA 5INYA 1TK0B 3RBTA 1EZKA 2V41A 4TW5A 3G7IA 3VLNA 7GSSA 2GSQA 4EDYA 1YY7A 3G7YA 2QKEA 3FZ5A 1FOVA 3WGXA 6GSYA 1SL1B 1OC8A 2WJUA 4JRRA 1GNEA 1A8LA 2HSHA 2H66A 3DXBA 2LSTA 2N5AA 3ZZXA 2YV9A 3KH9A 4OFTA 1GSEA 1ZYQB 1K0MA 2NBSA 5J4UA 2HLSA 1O81A 1GRXA 2RLIA 4JR4A 3C7MA 3VI5A 1V98A 4WBJA 5DDLA 4KDXA 4OO5A 1TRUA 3MDKA 2RM6A 3ZIJA 5A4WA 2L4CA 3IBHA 2IMDA 2K6VA 1B4QA 1SK0A 5F05A 3P90A 5J3RA 2LRCA 2B7KA 3J7Yb 2X64A 4PQ1A 1JZDA 2IFQA 1V40A 3FK8A 1RW1A 2V6KA 4PQIA 4JU5A 1PN9A 2LJAA 2LS5A 2MYGA 1BEDA 1X5CA 4L5OA 5DJMA 5DQYA 5IMDA 1WOUA 1TTZA 3QAWA 3UBKA 1FVJA 2I3YA 5D8IA 1PA3A 4KCAA 1SKWB 4I8BA 4OD7A 3KP8A 4TXOA 4CDOA 1O8XA 2I81A 5J9BA 3ZFLA 2JADA 4NMUA 3GTUB 1FO5A 1TW9A 1BX9A 3TJJA 4EKZA 4ID0A 4K0NA 5IMVA 5G30A 2DJ2A 3MNGA 2EIQA 5LNKe 2CVDA 5F8BA 3I69A 3GNJA 2YZUA 2VD1A 4F03A 3EYTA 3RHCA 4Z7XA 2YWOA 1W89A 2XBQA 2NTOA 2WZ9A 4L0UA 3A2VA 2FUG2 3Q6OA 2P5RA 4FO5A 2RUFA 5H5SA 3UEMA 5C00A 1F3AA 4GF0A 1V9WA 4ZB8A 5KN2A 1USBA 4GLTA 3QMXA 1SD8A 1NHYA 5DALA 2AUVA 3ZLPA 3HZ4A 4F82A 2TRXA 1MD4A 1XW9A 3F3QA 5D73A 3L0HA 1EGRA 4PNGA 4ZIJA 4ZL8A 2QSIA 2VLUA 2K18A 3KGKA 4HEA2 3CBUA 1XVQA 4KW6A 3H93A 2E2GA 2GQLA 2H72A 3V1WA 5IMFA 5B8AA 2GSSA 3MWHA 4NV2A 2HE3A 2AB6A 5ECQB 1WJKA 1A2JA 1AW9A 1ZYEA 3FR9A 3GRXA 2DSAA 3FKFA 1QFNA 4RUVA 4TR1A 4NHWA 3TRPA 1UA5A 2F8AA 1IYIA 1A8YA 5CRGA 4X0XA 2PWJA 1U3IA 5IO0A 1G6WA 3M0FA 1ZCPA 2GSRA 5G5EA 3ZVJD 3GFKA 4ML6A 3QDNA 2XHFA 1YF1A 1J9BA 2B7JA 3ZYWA 2R3XA 4NWYA 2YWMA 2NDOA 5B6MA 2O89A 4KA0A 2VD0A 4MH2A 5IMZA 5KN3A 1V57A 2HNLA 1K0AA 3VI7A 4JR6A 2HT9A 1XPVA 1NW2A 3ED3A 2R37A 2CX3A 3TKSE 3P8WA 3IV4A 1K0NA 3HYPA 2CVBA 2CZ2A 2JZTA 4V1Ap 1BG5A 3TKPA 4IQ1A 4K7NA 2FHEA 5CAXA 1TK5B 4TVEA 5D9WA 6GSTA 4Q5QA 4D73B 2D2ZA 3QPMA 2PBJA 1GSFA 1NSWA 1ZL9A 1X0RA 1TJDA 3VK9A 3TJGA 3H4KA 2CV4A 1JFUA 2LKUA 1YKAA 4WBRD 1SYRA 4ISDA 2C3TA 5F06A 3M3MA 4TR3A 5IMCA 1A24A 4WR5A 3I9V2 1UVZA 2XC2A 4XS4A 5F07A 3UARA 1KEBA 2IMFA 4GSSA 1S3DA 1XOAA 4HDEA 1VGLA 1EWXA 3WD6A 2CX4A 1FHEA 4N0VA 1YZXA 1PMTA 2J23A 3D5JA 1TU7A 3DVWA 3F6FA 4JZQA 4O7HA 1GSYA 3UIWA 4IP1A 3L9SA 3HY2A 4ZXGA 2M72A 3TUEA 4YQUA 2E2MA 18GSA 5AIXA 4KUNA 4PX1A 2B1LA 1A2MA 3IHQA 4KDUA 3C1SA 4FIWA 1FVKA 2PU9C 6GSWA 1LJRA 3GIXA 2WCIA 2B5EA 1AQWA 1G0TA 2AHEA 3RPPA 5CRWA 1GWCA 3K8NA 2IWTA 2H1BA 4POKA 2VCWA 4DSQA 2YPMA 1H75A 1T4ZA 2HZEB 1AQXA 4WKWA 4EE0A 5G2ZA 2AAWA 4IELA 1M9BA 4MH3A 3LG6A 5DVBA 1EEJA 1QQ2A 2LJRA 2RUEA 5ABRA 3GHAA 3FEUA 2AJQB 4I5QA 3DGQA 1FG4A 2VLVA 4RQRA 4FYUA 2V1MA 4MF6A 4IP6A 2I1UA 4I97A 3GL5A 2C8UA 2HI7A 2I9HA 4MDCA 3LYPA 2VL2A 2H75A 2VLTA 1QXHA 2H1AA 4K1FA 2YOIA 5CNWA 2PVOC 4FYCA 5JWRB 1TOFA 2FLSA 2H1GA 1K3YA 2WB9A 2ZUPA 5ID2B 5LCZA 1ML6A 1NHOA 5ECKB 1HNAA 1MDIA 4L0WA 2MBTA 5ENUA 2CAIA 3TKSA 2VM1A 2LEGA 2VUPA 1SL0B 2H0GA 2H0HA 1S3CA 1AC1A 4POLA 4NAXA 5KN1A 3M9KA 5HQPA 1GSUA 1M7TA 3RAZA 4RI6A 4K7OA 4O92A 2VCVA 3WYWA 1PKWA 2OJLA 2B6MA 2CA8A 1OYJA 5ELGA 4ZBAA 2DMLA 2LNTA 3WGEA 5JWQB 1PX7A 2DBCA 3C1RA 4KGIA 4XS1A 5D9XA 1SD9A 2GTUA 4AJ7A 2LQOA 4EXJA 3KZQA 5J41A 4L8EA 2C4JA 4FYBA 2VCQA 3CSHA 4ILFA 3KEBA 3F63A 2YANA 2VCXA 3VURA 1OC9A 5D93A 3ZIVA 5FWGA 1K3LA 1EOHA 4ECCA 1M2AA 1TDIA 3HJPA 3TCOA 3D6IA 1WE0A 2OE0A 4V2NA 4LL4B 2KP2A 1WMJA 4PQHA 4LA1A 4MA9A 1DUGA 4DSSB 4BWQA 4F0BA 2N5FA 4OCEA 3CRUA 1TK8B 1XWBA 3KMOA 1YEXA 4WEYA 4OMVA 4MCUA 4BA7A 3LFLA 3HXSA 2O87A 2A2RA 3VFIA 3FW2A 3LORA 1Q4JA 3QR6A 4G19A 1F37A 2KP1A 3UJ1A 2DJKA 2FA8A 5HFIA 4WETA 3TB2A 2JL4A 1TXXA 2PVQA 2A4VA 1T8EB 4IBPA 2VIMA 4IN0A 4IS0A 5HR2A 3EC3A 1PD21 3WT1A 5EY6A 1XCCA 3ME8A 4WXTA 4NXIA 4MK3A 1QGVA 3EU3A 3ZMKA 4OFNA 3ZTLA 1O85A 2WGRA 2YNXA 5E4WA 2H73A 3Q19A 3CYNA 3EWLA 1B9XC 4X43A 3L4NA 3UMAA 2O8VB 1E6BA 1R5PA 3VWXA 3G7JA 2C3QA 3FHKA 1ERUA 3APQA 4GSNA 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chains in the Genus database with same CATH superfamily
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chains in the Genus database with same CATH homology


 
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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