1A2JA

Oxidized dsba crystal form ii
Total Genus 69
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
69
sequence length
188
structure length
188
Chain Sequence
AQYEDGKQYTTLEKPVAGAPQVLEFFSFFCPHCYQFEEVLHISDNVKKKLPEGVKMTKYHVNFMGGDLGKDLTQAWAVAMALGVEDKVTVPLFEGVQKTQTIRSASDIRDVFINAGIKGEEYDAAWNSFVVKSLVAQQEKAAADVQLRGVPAMFVNGKYQLNPQGMDTSNMDVFVQQYADTVKYLSEK
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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molecule keywords DISULFIDE BOND FORMATION PROTEIN
publication title Crystal structures of reduced and oxidized DsbA: investigation of domain motion and thiolate stabilization.
pubmed doi rcsb
molecule tags Oxidoreductase
total genus 69
structure length 188
sequence length 188
ec nomenclature
pdb deposition date 1998-01-06

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF01323 DSBA DSBA-like thioredoxin domain
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.30.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich Glutaredoxin Glutaredoxin 1a2jA00
1UN2A 3GV1A 5ECNB 1GUKA 4HQZA 3UJ1A 1VF4A 3ISOA 3VK9A 2H76A 3FR9A 2B1LA 4Q5NA 3UVHA 1Z9HA 3HXSA 3D4TA 2PVQA 3APSA 1XWBA 1GSSA 3TKPA 1GTUA 2HXKA 2WDUA 1PMTA 1TKDB 2OA7A 1ST9A 1GL8A 3TB2A 3GSTA 4TXVA 3MSZA 1GTBA 2IMIA 3HZ4A 4FO5A 6GSVA 4BWSA 1M2AA 4KCAA 3ZZXA 1YQ1A 5ECRB 1XVQA 5A4WA 1EOHA 2IMEA 2AJQB 1VRSD 1XWCA 3WT1A 5HFGA 2JSYA 1K0BA 5CRHA 1WMJA 2V32A 3EU4A 1SL0B 6GSSA 1O81A 1J0FA 1T3BA 1ERTA 4NMUA 2FWFA 2KHPA 4WXTA 3EURA 4JBBA 4XS4B 3APOA 3VPQA 2P31A 4TRXA 4JE1A 1BYEA 4AJ7A 3L78A 1LJRA 5HFIA 1YKCA 2RIIA 6GSUA 1Z3EA 2DBCA 2GS3A 5IMVA 1ZL9A 4N30A 5G31A 2WFCA 4LA1A 5JCGA 4Z7XA 4EE0A 2VD1A 3WGXA 3VLNA 3FK8A 5JWQB 1M9BA 2VLTA 5JWOB 2YWIA 2QKEA 2CV4A 5IMDA 2H30A 5H5SA 1TK0B 3R2QA 5COHA 4IW9A 4WETA 4XTSA 2KP1A 1QGVA 2GQLA 2C3TA 1M2BA 1SD8A 3F63A 3LYPA 3H79A 1K0MA 1FB6A 2JADA 1Z7RA 1SJ6A 3ERWA 3IBHA 1I5GA 3TGZA 3IOSA 1RW1A 2P5RA 5CRWA 2RM5A 3VI7A 4F0CA 2HLSA 2DJJA 3GKNA 4OFMA 1PL2A 2X64A 4G2EA 1PN9A 3CSHA 3IPZA 1OAZA 2AHEA 2JZRA 1F2EA 2CVDA 2P0GA 2B7KA 5GSSA 3QMXA 4D73B 2EIRA 5ECQB 1XW5A 2LS5A 1XCCA 3D21A 2A2SA 2YZHA 3WGEA 4EUYA 1I9DA 2WULA 4OFNA 3CRTA 3JCML 4AJ6A 2M46A 1V58A 1OYJA 3F4SA 2HFDA 1BX9A 2J23A 3HHVA 1GLPA 1YZXA 2YWMA 3EINA 2PBJA 4I2TA 3D22A 4LL1B 3UL3A 2VM2A 1K3OA 1G0TA 4G10A 4K9ZA 13GSA 4D73A 1G6YA 3IV4A 5G1LA 4NV5A 3HJPA 4KX4A 5GAPD 1B4PA 1Y6EA 3AY8A 2GGTA 2G2QA 3EMXA 3KP9A 4FIWA 4K8MA 4ML1A 3L9VA 2JZSA 5IOXA 2QGVA 4PUFC 3CSJA 3DVWA 2KLXA 4DSSB 4JR6A 5A5KA 2IFQB 1ACVA 2FA4A 3C8EA 3LXTA 5INYA 3GH6A 1GLQA 1R4WA 5D9VA 1OC9B 1URMA 2RUFA 1K0DA 2I1UA 4NPBA 2HZEA 2VCXA 4CHSA 2N5FA 3GN3A 22GSA 3ZMLA 1FOVA 4O7HA 3F4RA 1UA5A 4ISDA 3CTGA 5C04A 3QCPA 1EGRA 1XW9A 1ZCPA 4DSSA 2NVLA 5F06A 1TK8B 4J56E 5LCZA 2IFQA 3CBUA 1GNEA 3LORA 2OBKA 1K0CA 11GSA 1WJKA 2MMZA 3EMPA 2VCQA 1OC9A 3CYNA 3EVIA 1XWKA 1EP8A 3FR6A 2V1MA 4ULXA 2LRCA 3KMOA 3H93A 2REMA 2FLSA 1GTAA 4ID0A 1X0RA 3IAM2 2PN8A 3UOMA 5IIZA 1OC3A 5HR2A 3QAVA 4BA7A 2CX3A 1NHYA 5FHIA 1S3DA 1PSQA 2PU9C 1NM3A 5EPFA 4HOJA 3BCKA 3EYTA 1THXA 2H1DA 19GSA 5CNWA 1TRVA 3RDWA 4X0XA 1EEJA 2FNOA 4GRFA 1V9WA 1SYXA 1AAZA 1SJIA 5ABRA 3BCIA 3KGKA 2JSZA 4O32A 3TRQA 3A2WA 1KBNA 4PNFA 4KSMA 2BTOT 1RK4A 5CYYA 2XPEA 3BBYA 4MZBA 3H1NA 4MF7A 3VWVA 5HQPA 3IRAA 4K2DA 3U6VA 4MH2A 2FD3A 4ECCA 4ACSA 1N2AA 3PINA 2DMMA 3L9SA 3FY7A 4KE3A 3TRPA 4KGIA 1VGLA 1Z7PA 4N0VA 1O6JA 1ON4A 4KAEA 1T8EB 1EWXA 5B6MA 4V1Ap 2LV3A 1F6MC 2OE0A 2PWJA 1F9MA 2DIYA 2VCZA 4EL1A 1SD9A 2R2JA 3Q74A 1TRWA 3QOUA 1JZRA 5J4UA 3ZMKA 5GZZB 4ZL9A 4V2LA 4IJIA 1WWJA 5EL8A 1TRUA 3GKKA 3GNJA 4OD7A 3IXRA 1O73A 1SKRB 3ZIVA 3PGTA 3FR3A 1QUWA 4RUVA 1XFLA 4MDCA 4MJAA 1E6BA 2LQOA 3C1RA 1PQNA 2MYGA 2GT5A 3E9JB 2TRCP 3G7IA 5HR0A 1T7PB 5JWRB 1XPVA 1EP7A 2EC4A 4LLRA 5GAND 2MBTA 1YEPA 1U6TA 1TJDA 2VM1A 2IPAA 4GSNA 3DYRA 1XWGA 4LMWA 1R7HA 4L8EA 4EXJA 4HQSA 4AGSA 1DE2A 4HZ2A 2N5BA 2KOKA 1FG4A 3GFKA 3RHCA 5B8BA 2FGXA 1USBA 4K1FA 5IM9A 1TU8A 4MCUA 1SYRA 3WGDA 1W4VA 1RQMA 4K7IA 3I69A 4IELA 4XIHA 1M99A 1GSYA 2DC5A 1DBYA 1JZDA 4KSOA 3D6IA 1MD4A 2O87A 2NBSA 3V1WA 3GMFA 2IMKA 4IVFA 1V98A 1HQOA 2FUG2 5ECOB 1JHBA 2DJ0A 4TOPA 1U88A 4J57E 4GWRA 1MDJA 4FH8A 2PUKC 3DGQA 1V40A 2H75A 5J9CA 3QAGA 5AISA 4TKYA 1ILOA 4HS1A 4MZCA 4F82A 5DALA 4OMVA 1VF2A 1X5DA 4MPGA 3IK9A 4EO3A 4AJ8A 4WEYA 4N0ZA 5DDLA 4DVCA 4V2NA 1MTCA 1WP0A 1YY7A 2GSQA 1ERUA 5E4WA 2HRFA 4XRAA 2DJ3A 3UBLA 1TI3A 1EEMA 1WRYA 3M0FA 1R5PA 2WZ9A 4IJ3A 3TKSC 3GL5A 5AN1A 4ZL8A 2VO4A 4MZWA 4PGTA 1TI1A 5KN3A 3GX0A 2V6KA 5D73A 2QSIA 1U3IA 2K6VA 2NDOA 2AAWA 2GTUA 4JEDA 4ZBAA 1GSUA 1EZKA 1MEKA 2C0GA 1DUGA 4XCSA 3TOTA 3GKMA 4WR5A 3I43A 2B5YA 4HJ2A 5B8AA 4F0BA 3P8WA 4HJMA 2FWEA 2H0GA 5IMCA 3FZAA 2MMNA 5J41A 1A0FA 3LJRA 8GSSA 4E8EA 1A2LA 1SK0A 5KN1A 5ECIB 5H5QA 3HJOA 1QQ2A 3GH9A 3FZ9A 4MMMA 1TDIA 2JU5A 3GL3A 5DCHA 3VFIA 4X1UA 3DKSA 4L0UA 5DJLA 3E3EA 2P5QA 4IP6A 2H70A 5A4UA 20GSA 1GUHA 2ZNMA 2CZ2A 2O85A 2R3XA 1JFUA 2HE3A 3KH9A 1ZYEA 1VF1A 3HY2A 2R6KA 4ZXGA 1HNBA 3M8NA 5C00A 2AUVA 3G9BA 3BOAA 2DLXA 4EDZA 2GZZA 4J2FA 1X9MB 3NOFA 4RQXA 4BVYA 2C0DA 2L4CA 3QAWA 1O8XA 1PKWA 4TR1A 5DCGA 3RBTA 3GYKA 1THOA 4TN8A 2H0IA 4Q5FA 1WIKA 3LGCA 5KN0A 4G19A 4IN0A 5G5EA 1XZOA 4V2MA 1A2JA 1SKWB 3M9JA 1XWAA 1GWCA 2PMTA 4QQ7A 1SL1B 2E2GA 1A2MA 5G5FA 1A0RP 3MNGA 1ERVA 3A2XA 5F0GA 5J5NA 2H73A 5G2ZA 2VL3A 3C71A 4PURA 3GUSA 2FCHA 2OACA 4OWYA 3K8NA 3F3QA 2RUEA 3MDKA 2X8GA 4HU7A 1JZWA 2FA8A 4NXIA 4DSQA 5AGYA 5ECLB 4NHWA 2NPBA 3QR6A 3DVXA 1GSEA 2VL2A 3TUEA 4ZIJA 4IQAA 4ZL7A 4LMVA 1DE1A 1Z6MA 1WOUA 1OVNA 5IQYA 3S9FA 5DQYA 2H6ZA 5HR3A 2H66A 1O85A 1GUMA 5D9WA 2H1AA 1A23A 3HCZA 2HZEB 3MAKA 1KNGA 3SWLA 4K0NA 4TW5A 1G7OA 3A3TA 1R26A 3ZITA 2PVOC 1CQGA 2DJ1A 2V2GA 1XOBA 1BAYA 3ED3A 2L5OA 3KCMA 3WYWA 3VPTA 2VCVA 2GZPA 2H72A 5F8BA 2F51A 2IJYA 5CRDA 1HD2A 2WCIA 2HSHA 1M7TA 1FHEA 5IPGA 2ZUPA 2DMLA 1GSQA 1TOFA 5ELGA 9GSSA 1QFNA 4I6XA 2LJAA 2BJXA 4TXOB 4OCEA 2VCWA 3GRXA 3D0ZA 4YQUA 1TK5B 4K7NA 4YH2A 1EV4A 3N9JA 1HYUA 4NWYA 3KJYA 5L71A 3O6TA 4POLA 3M1GA 3PH9A 4PX1A 2PERA 4L0WA 1QK8A 1LU4A 4OCFA 4L5LA 4GQCA 2Z9SA 3DXBA 4TXOA 3HVSA 1FAAA 2CAQA 4RQRA 3CTFA 1ZOFA 1X9WB 2IMDA 4BL7A 1ZMAA 12GSA 2B7JA 3Q18A 18GSA 3HDCA 2HT9A 3P90A 4PQIA 4GF0A 3C7MA 3FHKA 4KB3A 1EV9A 3FYGA 4NV2A 4GSSA 2OJLA 4XRDA 4Q5RA 3KH7A 4JR4A 5JCWA 3EWLA 3OR5A 3ZVJA 3FKFA 3HA9A 1S3CA 3KMNA 5E59A 16GSA 4WBRD 3US3A 4GSTA 3HYPA 5DBQA 10GSA 4FYBA 2A2RA 2MZCA 3FW2A 4POKA 3IA1A 4ML6A 2G0FA 1M9AA 1HNAA 3F6DA 2PPTA 1OE8A 3TJKA 3W8SA 5DJMA 3TJGA 1AXDA 2E0QA 1F3AA 7GSSA 5AIXA 5D93A 1F37A 4KH7A 2XBQA 3IR4A 3LYKA 4PQ1A 4ZB8A 14GSA 2YV9A 2HZFA 3ERFA 2ZCTA 4K0GA 3KXOA 2E2MA 1PX7A 2WGRA 2C8UA 4EF0A 2MBSA 3H4KA 2JACA 5G30A 2QC7A 4MLYA 1BJXA 3J7Yk 3ZFBA 2YOIA 3TCOA 3GTUA 5AIVA 3IHQA 3VWUA 3C1SA 3HVVA 3EC3A 3M9KA 4G9HA 2LRTA 1YEXA 3QFAC 3F6FA 1B9XC 3TKQA 2CT6A 4FYCA 2HYXA 5G1KA 3UMAA 1FVKA 2R4VA 2GZYA 1GSFA 3RHBA 3G7JA 4CW9A 5IOWA 3KD0A 1AQVA 1AQXA 3DEXA 1ZZYA 2MMAA 3U5RE 3DIEA 4WR4A 2K8SA 5DVBA 5H5RA 1K3YA 2L6CA 3UIWA 4GXZA 3TOUA 4KNDA 1PL1A 2K18A 5LNKe 2C1YA 1O8WA 5FT3A 2JZTA 4ZILA 2H6YA 2K8VA 2BMXA 1JLVA 2L4QA 2XBIA 3HZ8A 3J7Yb 5CREA 5A4VA 5LD0A 5GSTA 2X8CA 2VD0A 3ZL5A 2VAFA 2YP6A 4MF6A 2YCDA 4KW6A 4KDUA 3W8JA 2RLIA 4O5RA 3HD5A 2GT6A 2M80A 3HJMA 4HU9A 2M72A 1XBSA 2K9FA 1V2AA 1X5EA 2HI7A 2X99A 2H71A 5F05A 3NIVA 2AYTA 3W6GA 5IMZA 2GLRA 5DALB 2L57A 4MJEA 3QD9A 4KA0A 3KP8A 2H1BA 1K0AA 4F2IA 1KTEA 2ALBA 4MJCA 3A2VA 5CAXA 2DJ2A 3I6AA 3D5JA 2N5AA 3UVTA 3ZFLA 5J3RA 3O3TA 2YZUA 2CQ9A 5IMAA 2EIQA 4IKHA 4N10A 2IMFA 3GSSA 4K7OA 4GQFA 4JU5A 1Z6NA 3N5OA 3HVXA 4MP4A 2JL4A 2KP2A 2A4VA 2LJKA 5DAKB 1JZOA 3L9UA 2I9HA 3QPMA 4GTUA 2RM6A 2H8LA 3MWHA 1U87A 1V57A 2LUSA 4H86A 1ABAA 4RI6A 1SJZA 1K3LA 1VF3A 5KN2A 3FZ4A 1YF1A 1TU7A 3CSIA 1B48A 2C3NA 5DAKA 2H0HA 3KIJA 4MF5A 4L5OA 4ECJA 3UEMA 1SK1A 1TTZA 3LQ7A 4OO4A 1AUCA 5CO3A 2VOCA 2GVPA 2OE3A 2B6MA 1EGOA 1SKSB 1YF0A 5HFKA 4BPYA 3Q6OA 2AV4A 3DD3A 3I9V2 4PXOA 2LNTA 1QMVA 2DIZA 4MK3A 4EC0A 3RPNA 2LKUA 1NW2A 2H01A 2ON5A 3TKRA 4K6XA 1XXUA 5D8IA 2H1GA 4ILFA 3O76A 2R5GA 4POMA 2O7KA 4I2UA 4TR1B 1K0OA 4QL9A 4ECIA 4IQ1A 4AF2A 3UAPA 3GURA 3FZ5A 1OKTA 2V41A 2FHEA 2VIMA 4MH3A 5ECHB 4JRRA 3RPPA 4XS4A 4PUAA 2FWHA 3CXGA 1B9YC 4P3YB 4I8BA 3BD2A 4IHUA 3WD6A 4YQMA 2C3QA 2PGTA 2VL9A 3KM6A 2XPDA 4OFTA 1YDKA 4V1Ag 2FY6A 5IO2A 5IO0A 2KUCA 3UARA 1NSWA 3TKSE 4XHMA 3IDVA 3VURA 1H75A 4HZ4A 1R5AA 1FO5A 3F8UA 4XS6A 4EDYA 1ML6A 2O8VB 4IS0A 4HEA2 2F9SA 2IL3A 1Y25A 4TR0A 3LG6A 1T1VA 1XIYA 1C72A 1YJ6A 1A8YA 1MDIA 1WE0A 1GP1A 5ID2B 1DSBA 1UC7A 2LEGA 2EIOA 1MD3A 3DWVA 3CRUA 4ECBA 1Z5YE 3VWXA 5ECKB 1PX6A 1FW1A 3G7YA 5EY6A 1M2DA 3GHAA 1OKDA 3NZNA 4MPFA 4IGJA 4X43A 2OBIA 5D96A 1G6WA 4TVEA 5ID2A 4FYUA 3KTLA 5ECSA 1BEDA 4TR3A 3ZIJA 1X9SB 3ME7A 1M0UA 2ON7A 1IYIA 2GSTA 1GULA 2C0EA 1Q98A 1XOAA 6GSXA 5FWGA 2XC2A 5ECPB 3CMIA 4MJBA 3P2AA 2HRNA 2D2ZA 1WPIA 2B5EA 3IE3A 1G7EA 3GX8A 3L4NA 4IBPA 3F9UA 2J9HA 1TXXA 3LSZA 4I97A 1PRXA 3H8QA 1Q4JA 2B1KA 5B7CA 3ZREA 2YJHA 3FRCA 3ME8A 17GSA 2C80A 5DQSA 2L6DA 4O92A 3KZQA 2CVBA 1U3AA 3KTBA 5EVOA 2OE1A 2YJ7A 4ZB9A 1SL2B 6GSYA 4BWQA 1GNWA 2VL2C 3F3RA 3F0IA 2CVKA 4IP1A 5JCUA 4POBA 5F07A 1O7UA 2VCTA 1UVZA 1J08A 2B5XA 3C73A 1PKZA 2I81A 1TP9A 4KDXA 2F8FA 2OKAA 2TIRA 1ZGNA 4EVMA 2X8HA 3HKRA 1YKAA 3Q19A 1XW6A 1MDKA 4JZQA 1SU9A 3TJJA 1H4OA 1GRXA 4YAVA 2HSYA 2L59A 3FEUA 2O89A 2FWGA 2DSAA 4EKZA 3TDGA 2GSSA 3DMLA 5ELAA 3QFBC 4DSRA 3DRNA 1FVJA 4WKWA 4MA9A 4ZB6A 3PR8A 1GH2A 3LEFA 3M3MA 2GDRA 3TJBA 1B8XA 1A24A 1T00A 6GSTA 2LQQA 2YWOA 3ZVJD 4LL4B 2VLVA 3ZLPA 4CDOA 2LSTA 3ZYWA 4KCEA 4F9ZA 3GTUB 1NHOA 3APQA 3L0HA 1T4ZA 4F03A 4E8HA 3A5WA 5J9BA 1FB0A 1X5CA 2YANA 2WRTA 5CP1A 3EU3A 4WF4A 5D9TA 4YQVA 2HNLA 2E7PA 4HI7A 4Q5QA 2ES7A 1GTIA 3VI5A 3TJFA 2MMOA 1B4QA 2YPMA 1AIUA 2LRNA 5IPHA 1E2YA 4RI7A 3F4TA 2IN3A 3BJ5A 1PD21 3KEBA 3LFLA 4KDYA 4HUAA 1A8LA 1K0NA 2GQMA 2YNXA 1T4YA 3TRXA 1JLWA 5ECMB 2V6OA 1PGTA 3LWAA 4WBJA 1ERWA 2C0FA 1EOGA 1OC8A 3RAZA 1IYHA 1AQWA 1SK2A 2R37A 1LBKA 1J9BA 3WT2A 4YAPA 1QXHA 2CZ3A 2GSRA 3D4MA 4WF5A 2YWNA 1XVWA 2F3MA 4HDEA 4NAXA 6GSWA 1OE7A 2GQKA 2IWTA 3EE2A 4BVXA 3E0UA 4XS1A 2XHFA 1KEBA 1PA3A 1F3BA 2TRXA 2LNSA 2LJRA 3LXZA 2NTOA 4I5QA 1CQHA 2YN1A 3UBKA 4NHZA 2CAIA 1W89A 5ENUA 3ERGA 3GA4A 5CRGA 2B3SA 1N8JA 4N11A 3GKXA 2VUPA 2WJUA 1TW9A 1HNCA 2LTKA 3IAS2 5HR1A 3TKSA 2H19A 4QL7A 1AW9A 2AB6A 3IK7A 2I4AA 5KEJA 2WB9A 1AC1A 1ZYQB 4PNGA 2DJKA 2YV7A 2L5LA 2WS2A 5D9XA 1S3AA 4OO5A 1TRSA 3ZTLA 4ZBBA 4ZBDA 3IC4A 1SENA 2OADA 3VWWA 3P7XA 3SBCA 4DEJA 2H6XA 4KUNA 4PQHA 5B6NA 3GIXA 3QDNA 1BG5A 4MABA 2C4JA 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chains in the Genus database with same CATH superfamily
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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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