1O85 | Genus

Total Genus 43

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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus	43
sequence length	143
structure length	143
Chain Sequence	GLDKYLPGIEKLRRGDGEVEVKSLAGKLVFFYFSASWCPPCRGFTPQLIEFYDKFHESKNFEVVFCTWDEEEDGFAGYFAKMPWLAVPFAQSEAVQKLSKHFNVESIPTLIGVDADSGDVVTTRARATLVKDPEGEQFPWKDA

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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Genus data interpretation

Chord Diagram

molecule keywords	TRYPAREDOXIN
publication title	Tryparedoxins from Crithidia Fasciculata and Trypanosoma Brucei: Photoreduction of the Redox Disulfide Using Synchrotron Radiation and Evidence for a Conformational Switch Implicated in Function pubmed doi rcsb
source organism	Crithidia fasciculata
molecule tags	Electron transport
total genus	43
structure length	143
sequence length	143
ec nomenclature
pdb deposition date	2002-11-25

pfam database annotations

chain	Pfam Accession Code	Pfam Family Identifier	Pfam Description
A	PF13905	Thioredoxin_8	Thioredoxin-like

Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)

cath code	Class	Architecture	Topology	Homology	Domain
3.40.30.10	Alpha Beta	3-Layer(aba) Sandwich	Glutaredoxin	Glutaredoxin	1o85A00

3UL3A 1H4OA 2XBQA 3DWVA 3CXGA 4TR4A 3TJBA 3D4TA 3F8UA 1AXDA 1OVNA 3IK9A 4F0BA 1O73A 3IBHA 3UVHA 3LYKA 3VPQA 1M9BA 1F6MC 3DRNA 3TB2A 1A8YA 2H1AA 10GSA 2NBSA 4FYCA 4KUNA 2IMKA 4MH2A 2ALBA 1A0RP 4FH8A 4IP1A 3GHAA 2KOKA 6GSWA 2J23A 3CTGA 3TRXA 4IS0A 4MA9A 3C71A 1M99A 7GSSA 2G0FA 4WR5A 6GSTA 4BPYA 4ZILA 2NPBA 1FG4A 3DD3A 1YEPA 3QPMA 2I1UA 3GH9A 2WFCA 4EKZA 1QXHA 2X64A 2Z9SA 3HJPA 4Q5FA 2PU9C 4XRDA 4MCUA 1PKZA 5EY6A 3VK9A 4PXOA 1MD4A 3I9V2 5ELAA 3GRXA 3D5JA 2XC2A 4MDCA 3EMXA 3F4SA 1MEKA 1Q4JA 3A5WA 5ECKB 2DBCA 3E0UA 4TRXA 1XWGA 4XRAA 1N2AA 1N8JA 3E3EA 4L5OA 2YPMA 5ECMB 4YAVA 4GCIA 5DQYA 4K7NA 5G5FA 2TRXA 5IIZA 2JZRA 3EWLA 13GSA 1AC1A 2REMA 1EEMA 3F63A 4TVEA 4BL7A 4H86A 3H93A 3MDKA 1JZDA 3U5RE 3VWWA 4K0GA 1SJZA 1PGTA 1X5EA 2QC7A 4HU9A 1WIKA 1R4WA 1ZMAA 3I6AA 1XCCA 4V1Ap 2C3TA 3H1NA 3DYRA 1ZGNA 2B5XA 2MZCA 3J7Yb 3KJYA 1BQ7A 3GIXA 2AUVA 1OKTA 2YANA 2C0EA 2JZSA 4KCAA 5HFGA 3HXSA 2VLUA 2CT6A 5IMZA 1TW9A 3GTUA 4N0ZA 1K0MA 3FZ9A 2VCXA 1NW2A 4K2DA 5HR1A 1XIYA 2LJAA 4NMUA 3RHBA 4ZB8A 3EU3A 1WE0A 4IGJA 4XIHA 3UJ1A 1GTAA 2B5YA 3CBUA 3LJRA 1FB0A 3VLNA 3QR6A 4ZB6A 4MLYA 5J9BA 4X0XA 3WGXA 3CMIA 4OO4A 3TKSE 2OBKA 3HHVA 3HA9A 4DSSA 2DMLA 4G10A 4K0NA 5CO3A 2X8GA 3H8QA 2OBIA 4MH3A 2YNXA 5D9TA 2DJKA 3RPNA 1YZXA 1KTEA 3L0HA 2M72A 3KM6A 4IVFA 2RUEA 3QAVA 2WCIA 3KXOA 4N0VA 5LNKe 3LGCA 1K0CA 4YH2A 2AB6A 5AIXA 1M0UA 2OE1A 5D9XA 2LSTA 1ILOA 2L6DA 1TI1A 2L59A 5GAND 4LL1B 4D73B 1G0TA 1IYHA 4LMVA 2FNOA 2GT6A 4EVMA 1LBKA 2LKUA 5D93A 1FHEA 2GSRA 3PGTA 3LEFA 3JCML 1JHBA 3MAKA 2IFQB 4ZBAA 4ZL9A 1B8XA 4YAPA 5IOWA 3ZVJA 4RI7A 4BVXA 2C0GA 2F8FA 3ZL5A 1DE2A 2DJ2A 1Z9HA 1EP8A 4OD7A 2FY6A 3HZ4A 3TKSA 5DVBA 2H6XA 2MBTA 2VO4A 5E59A 4IQ1A 3GX8A 1TOFA 4TN8A 1V2AA 1S3DA 1BX9A 2YP6A 3DKSA 1GL8A 1R5PA 2X99A 3P2AA 5DALA 1U87A 2R37A 4L5LA 4LLRA 2LJRA 3LQ7A 5CNWA 3IXRA 2H6YA 4PNFA 1B4QA 5DAKB 1OKDA 3C8EA 2CV4A 4ZXGA 4CHSA 2DIZA 1NM3A 2H73A 1J0FA 1OC8A 1CQHA 3HD5A 3V1WA 4HUAA 1LU4A 2JU5A 1OE7A 4MJBA 1YY7A 1T1VA 3A2WA 1ST9A 3RBTA 2J9HA 3DXBA 5H5RA 5FT3A 3APOA 3D21A 3BCKA 4OMVA 3L9UA 5JWOB 2OA7A 1WP0A 2P5QA 3UOMA 2DJ0A 2K18A 5D8IA 1TK0B 3GL3A 4PQ1A 4KDXA 3GURA 5DJLA 3N5OA 2IMDA 5GAPD 2X8HA 4JEDA 3SWLA 3GKMA 4KCEA 2HSYA 2VAFA 3BCIA 3KH9A 4HI7A 1EGOA 3H79A 1NHYA 2F51A 4BVYA 1ABAA 3AY8A 2N5BA 4PNGA 3F9UA 3O3TA 3LYPA 3FR9A 2B1LA 1TI3A 3IAS2 1V98A 5HR3A 2BMXA 3GMFA 1WOUA 2ZUPA 3DVXA 1M2BA 1XWCA 2GSTA 4MZWA 2GT5A 1TRVA 2HRNA 5E4WA 1X0RA 4FYBA 1QK8A 1I9DA 4RI6A 3RAZA 1Z5YE 3FHKA 5DCGA 4ZB9A 9GSSA 1HNBA 3FW2A 3HVSA 4EC0A 3QAWA 4F82A 3L9SA 6GSSA 5A4WA 5ECHB 4PGTA 1Q98A 1QQ2A 4GXZA 3KCMA 5ELGA 5CAXA 2VL2C 3DMLA 4XHMA 4RQRA 2XBIA 2DMMA 5DQSA 2DSAA 3GYKA 3U6VA 2AHEA 3GA4A 1GNWA 2C3QA 3DIEA 2ES7A 3GNJA 1S3AA 3KP9A 1V58A 4KH7A 4MF5A 3TGZA 5C00A 3QFAC 3ME7A 3HDCA 4OFNA 2YJ7A 2L5OA 1R5AA 1XWAA 1PN9A 4TXOB 1GTBA 3CSJA 5IOXA 4MP4A 3ZMKA 1SKSB 3LSZA 2O89A 5DJMA 1K3LA 1A24A 2GVPA 2IMEA 1XBSA 1PSQA 3NZNA 5D96A 4J57E 4TR3A 2VL9A 4ZIJA 2B5EA 2M46A 3P8WA 4NV5A 1G7EA 1EEJA 2I9HA 1LJRA 1SK1A 2VCZA 3M1GA 2WS2A 4JBBA 4LMWA 5J5NA 2RLIA 3ZIJA 4I8BA 1PRXA 2O8VB 2H71A 3FZAA 2CZ2A 1MDJA 5EVOA 4AJ7A 1O7UA 1ZL9A 2C0FA 3VWXA 4POBA 2MYGA 1XOBA 1M7TA 2H76A 1ZYQB 4RQXA 3M3MA 1O8XA 2YCDA 2LRTA 4PUAA 1VGLA 3I43A 2DIYA 2H8LA 2JADA 4AJ6A 2F9SA 2EIQA 3GSSA 1MD3A 3F3QA 2HSHA 3UBKA 1HNAA 3ERFA 3LWAA 5D9VA 3WYWA 4POLA 2XPDA 4PQHA 2RUFA 3I69A 5D9WA 3EVIA 1FOVA 4KSMA 1AW9A 2VD0A 5LD0A 3Q19A 2LJKA 1YQ1A 3E9JB 3EC3A 4NV2A 1FO5A 2AYTA 1F9MA 1XFLA 1XXUA 5J4UA 2FWFA 3QCPA 1GTIA 2CVBA 5CRWA 4KW6A 1S3CA 4GQFA 3GFKA 2LEGA 3QD9A 1PKWA 5HR2A 2PWJA 3G7IA 3IPZA 2H1BA 1FAAA 1AUCA 5EPFA 1X9MB 2FUG2 3IDVA 2B1KA 5COHA 2B6MA 4DEJA 2FGXA 3P90A 3QOUA 5G5EA 5J3RA 4JR6A 5B6MA 4K1FA 4AJ8A 2OKAA 4LA1A 2ZCTA 1GSSA 1WMJA 4PUFC 1A2MA 1BAYA 3IAM2 1B4PA 3O6TA 3GV1A 2KUCA 4K7OA 2OACA 4ID0A 5F0GA 3TRPA 1T4ZA 5DBQA 1SKRB 1W4VA 5IQYA 4OWYA 2VLTA 1DSBA 1Z7PA 4ZBBA 4G19A 2GZZA 1YEXA 1RW1A 1OE8A 1K0NA 2CQ9A 1F37A 4YQUA 2FCHA 2LTKA 2A2SA 4MZCA 3IE3A 3TJGA 1QUWA 4E8HA 1QFNA 1TU7A 4ECIA 2PBJA 4TXVA 1PA3A 1T8EB 3DEXA 1BEDA 1GUHA 1AIUA 3VI5A 4G9HA 3KZQA 1EV9A 4O7HA 2OE0A 2M80A 2K9FA 3EE2A 4D73A 5IM9A 5ECRB 4PX1A 2IIYA 4Z7XA 1BG5A 1AQVA 1XPVA 4IQAA 1GLPA 1ZYEA 1W89A 4OFTA 1GRXA 2C1YA 3QMXA 3FY7A 3M9JA 4LL4B 2IFQA 3APSA 1X9WB 1YF1A 3EINA 2IJYA 3TKSC 2VLVA 2LQOA 4OFMA 2YN1A 4WR4A 5F07A 3WD6A 6GSYA 4TR0A 4KSOA 4IP6A 3KMNA 2XHFA 5B7CA 1G7OA 2R3XA 1TTZA 3A2XA 5KN1A 4FYUA 2VM1A 1MTCA 1UN2A 4JU5A 4QL7A 1U88A 1GWCA 1HD2A 2MMAA 1AQXA 4ECCA 1SYXA 4V2MA 4JZQA 2FD3A 2GDRA 3GL5A 4KAEA 1UVZA 3FK8A 5H5SA 2HNLA 1EGRA 4IJIA 4ZBDA 2MMZA 2AAWA 5G2ZA 4EL1A 3RPPA 1J08A 4HQZA 5DAKA 4IHUA 5ECOB 4Q5QA 3GKKA 2P0GA 1X9SB 3EYTA 2YWIA 1TRSA 2K8SA 3F3RA 3FKFA 1A2JA 4EF0A 3LXZA 1ON4A 4O32A 1VF3A 1O6JA 4GSTA 2VOCA 3IOSA 3RDWA 2DC5A 4O92A 3UEMA 2FWGA 3UMAA 3ZFBA 5IMVA 2LRCA 4QQ7A 5HFIA 2DJ3A 1EP7A 5CRHA 4E8EA 3MSZA 2RM5A 5C04A 6GSUA 3F4RA 1MDKA 4Q5RA 1SK2A 5HR0A 4DVCA 2V32A 1Z6NA 3GH6A 3APQA 1PD21 2FA8A 5G31A 1JLVA 4WETA 2O7KA 3CSHA 5ID2B 2ON7A 4FIWA 1YDKA 3FZ5A 1T4YA 2VCTA 2FHEA 2N5AA 4MJAA 2KP1A 4PQIA 3TOTA 4IKHA 1PL1A 2LQQA 4V1Ag 3GN3A 1OYJA 3PR8A 3GKNA 2OJLA 2P5RA 2H74A 1SL1B 1FVJA 5IMCA 3G7JA 4GLTA 1HNCA 1ERVA 1FVKA 1BYEA 2R4VA 3G7YA 2FA4A 3PH9A 1GUMA 4XS1A 2H70A 5A5KA 3L4NA 1JZRA 4XS6A 3TUEA 3S9FA 5CYYA 1O8WA 1B48A 4EUYA 2CVKA 3OR5A 2OE3A 1KNGA 4GRFA 3KMOA 2R2JA 4I2UA 2KP2A 4GTUA 4ISDA 2VCQA 4YQVA 2K6VA 4L0WA 4HDEA 4HZ2A 1THOA 1X5DA 4EDZA 1TJDA 3SBCA 4F9ZA 5HQPA 4WF4A 5GSSA 3ZMLA 3HYPA 4POMA 1R7HA 4KB3A 3HVXA 1OC3A 4ZL8A 4XS4B 1SK0A 1TXXA 4HJ2A 22GSA 1U3AA 3C1RA 5IMAA 1U6TA 4NXIA 1NSWA 1V9WA 2LNSA 3D22A 2ON5A 4JRRA 3TKRA 2JSZA 3HY2A 3VWVA 2H19A 2DJJA 5KEJA 3A3TA 1EZKA 3CSIA 5KN0A 3EMPA 1NHOA 1PL2A 2H66A 4ZL7A 5A4VA 1FB6A 1SJIA 4J56E 4AGSA 2IPAA 1F3BA 2CAIA 5FHIA 4TXOA 5JWRB 5D73A 3TKQA 3DGQA 4KDYA 1Z6MA 3VFIA 3ZIVA 3KIJA 1GSEA 1SKWB 3ED3A 4ILFA 1F2EA 3US3A 4EXJA 4HZ4A 2GZPA 4TR1B 1GSUA 2HT9A 1ZCPA 1K0OA 2HZEB 2KHPA 1CQGA 1M2AA 2RM6A 1E6BA 1URMA 3D0ZA 1ACVA 3C1SA 2L5LA 2DLXA 2JACA 1TK5B 2C0DA 4IBPA 5HFKA 3C73A 3FYGA 3LORA 3EU4A 4P3YB 1TRWA 1GTUA 4G2EA 4K9ZA 5AN1A 5KN2A 3C7MA 5F05A 2GLRA 1EOHA 3HZ8A 3M8NA 4ECJA 1B9YC 1QMVA 1K0DA 1IYIA 1JFUA 5JCGA 2AV4A 2C4JA 2VM2A 1AAZA 4QL9A 4GQCA 4MABA 4V2NA 2HLSA 2NDOA 3BOAA 3J7Yk 1TDIA 2IWTA 3TJFA 1J9BA 2YZHA 1K0BA 2V1MA 2VIMA 8GSSA 5EL8A 2CVDA 5AIVA 2XPEA 2E7PA 2E0QA 2EIRA 5KN3A 3EURA 1FW1A 3BBYA 2PVQA 2PERA 2G2QA 3KD0A 3G9BA 4J2FA 1JZWA 5FWGA 1DE1A 3TJKA 2H30A 3D6IA 1SL2B 5L71A 4MJCA 2DJ1A 3RHCA 2H75A 5JCUA 4WXTA 1TRUA 2BTOT 3QFBC 4IN0A 1VF1A 3HVVA 1USBA 1YF0A 5IPGA 2QSIA 3NIVA 2CX3A 3ZITA 1Z3EA 3LFLA 5IPHA 2I81A 5ECNB 5ECLB 4IJ3A 3HKRA 1XOAA 2HYXA 1WJKA 1H75A 1RK4A 6GSXA 4IELA 2GSQA 3BD2A 1QGVA 3FR6A 4MK3A 4L0UA 4TW5A 2L6CA 2A4VA 1OAZA 1XWBA 3F0IA 2YJHA 2GZYA 1GSFA 2MMNA 3ZTLA 1K0AA 1O85A 4IW9A 1R26A 3N9JA 2YOIA 4WKWA 2V6OA 2H1GA 5AGYA 5IMDA 4N11A 1HYUA 1SL0B 2HXKA 4EE0A 2CA8A 2FWHA 3ME8A 2HFDA 3ZREA 5JWQB 1AQWA 4K6XA 3DVWA 4L8EA 3TJJA 4MF6A 4K7IA 5CREA 2WDUA 3IC4A 5IMFA 2GTUA 2AJQB 2I3YA 4GSNA 3HJOA 3ZFLA 12GSA 1GNEA 1GP1A 1K3YA 5J41A 2H72A 4BA7A 3TCOA 2CZ3A 2VCWA 2IMIA 3FRCA 3Q18A 2PVOC 1V40A 2V2GA 3BJ5A 5AISA 1X5CA 2H0IA 4MPGA 4AF2A 4YQMA 2HRFA 1EV4A 1UA5A 1YKAA 4Q5NA 4DSQA 2F3MA 4GF0A 2IMFA 1T00A 2H01A 3KTLA 5ECQB 2PMTA 2WULA 2H6ZA 1A0FA 2YV7A 1VF4A 5ECPB 4KA0A 3FZ4A 2WZ9A 4JE1A 3TDGA 2H1DA 1GH2A 4NWYA 1E2YA 1GSYA 3IR4A 2FWEA 3LG6A 3Q6OA 2LRNA 1EWXA 4MJEA 3M0FA 4DSRA 3GTUB 3IHQA 5F8BA 5CP1A 4ML6A 3FR3A 3VPTA 3ZLPA 4OCFA 5A4UA 1XVQA 3L9VA 2MMOA 2GS3A 3WGDA 5CRDA 3ZVJD 2YWNA 4KX4A 1JZOA 2OADA 5IO0A 4O5RA 5IO2A 1TK8B 11GSA 4ACSA 4DSSB 3ERWA 2QGVA 3UBLA 3F6FA 5ECIB 5J9CA 5GSTA 2PGTA 3KH7A 2TRCP 1XWKA 2IN3A 1PQNA 4V2LA 3UVTA 2L4CA 2X8CA 3IK7A 3CRUA 4EDYA 1O81A 2C80A 2R6KA 4WF5A 4OCEA 1M9AA 3P7XA 5LCZA 1ERTA 2YZUA 1OC9A 1PX6A 3ISOA 5B6NA 1K3OA 1GUKA 1Y6EA 4KNDA 2D2ZA 3UARA 2WRTA 4HS1A 2K8VA 3GX0A 4F0CA 2ZNMA 3WGEA 5DCHA 1TU8A 3F4TA 3Q74A 4BWSA 2MBSA 3TOUA 2RIIA 3H4KA 1Z7RA 3WT1A 2B7KA 1OC9B 2IL3A 2GQMA 4KGIA 2LNTA 4CDOA 3W6GA 3W8SA 2VUPA 5ID2A 4NHWA 1C72A 1SD9A 2TIRA 2BJXA 1SU9A 3MWHA 2LV3A 2EIOA 5G1KA 4I2TA 3VWUA 4POKA 1SENA 2WGRA 2NVLA 3TKPA 14GSA 4XTSA 2E2GA 3GSTA 4ECBA 1XZOA 4PURA 5DALB 2NTOA 1VRSD 4X43A 1DUGA 5F06A 3M9KA 4GSSA 2HE3A 1XW6A 1SJ6A 3K8NA 2N5FA 1A8LA 1EOGA 1HQOA 2VCVA 5G1LA 1G6YA 3VURA 3A2VA 4NPBA 1KBNA 20GSA 1KEBA 1V57A 2VL3A 2YV9A 1GULA 1BJXA 2PN8A 4HJMA 1GSDA 2EC4A 2LS5A 1XVWA 4K8MA 3PINA 3GUSA 1WRYA 4KDUA 1JLWA 4F2IA 2F8AA 5JCWA 2O87A 3CYNA 4KE3A 2GSSA 4X1UA 3FEUA 3KP8A 2JZTA 1VF2A 3KGKA 1G6WA 4TOPA 3VI7A 5G30A 4XS4A 1ZZYA 4RUVA 3HJMA 2A2RA 2JL4A 4I6XA 1T7PB 1XW9A 5GZZB 1PX7A 2JSYA 2CAQA 1SD8A 3WT2A 1TP9A 2E2MA 4EO3A 5ABRA 1F3AA 2GQKA 1XW5A 18GSA 2B7JA 3CTFA 17GSA 2GGTA 3KEBA 1PMTA 2WB9A 4MPFA 2H0GA 2LUSA 4N30A 1A2LA 4WEYA 2YWMA 3ZRDA 3R2QA 2O85A 4HU7A 3O76A 3ERGA 1ML6A 1B9XC 2I4AA 2KLXA 2B3SA 1GLQA 2L4QA 4TR1A 5ECSA 2HZFA 4HEA2 1DBYA 4OO5A 2C8UA 2HI7A 2HZEA 1Y25A 3KTBA 1UC7A 4HQSA 4HOJA 2V41A 1YJ6A 4TKYA 5CRGA 6GSVA 1MDIA 4MMMA 3F6DA 2FLSA 2P31A 4NHZA 1ZOFA 3HCZA 2CX4A 4CW9A 5H5QA 3L78A 1A23A 3QDNA 1ERUA 1SYRA 2VD1A 1T3BA 2C3NA 4N10A 2VL2A 1ERWA 2H0HA 4NAXA 1GSQA 1M2DA 3NOFA 3LXTA 5B8AA 5DDLA 1RQMA 2GQLA 3D4MA 3IA1A 4GWRA 4XCSA 4I5QA 1THXA 3QAGA 4BWQA 1TKDB 5B8BA 3IV4A 1U3IA 2L57A 2WJUA 4ULXA 2YWOA 16GSA 1I5GA 3UAPA 3GKXA 2V6KA 5INYA 1WWJA 2PUKC 4FO5A 2PPTA 4MZBA 3IRAA 1YKCA 4MF7A 3ZZXA 4JR4A 3UIWA 2QKEA 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chains in the Genus database with same CATH superfamily

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chains in the Genus database with same CATH homology

#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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1O85A

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