4GWRA

Crystal structure of the second catalytic domain of protein disulfide isomerase p5
Total Genus 37
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
37
sequence length
112
structure length
112
Chain Sequence
DVIELTDDSFDKNVLDSEDVWMVEFYAPWCGHCKNLEPEWAAAASEVKEQTKGKVKLAAVDATVNQVLASRYGIRGFPTIKIFQKGESPVDYDGGRTRSDIVSRALDLFSDN
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
publication title To be published
rcsb
molecule keywords Protein disulfide-isomerase A6
molecule tags Isomerase
source organism Homo sapiens
total genus 37
structure length 112
sequence length 112
chains with identical sequence B
ec nomenclature ec 5.3.4.1: Protein disulfide-isomerase.
pdb deposition date 2012-09-03

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00085 Thioredoxin Thioredoxin
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.30.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich Glutaredoxin Glutaredoxin 4gwrA00
5G2ZA 4RQRA 5D93A 1DSBA 1LU4A 4BVYA 3UBKA 5IM9A 2BMXA 1VGLA 2JU5A 1X0RA 4GSNA 2WFCA 1A24A 1GSEA 3C8EA 3DIEA 2FA4A 3WT1A 1VF4A 3TJBA 3ERGA 4RUVA 5IMZA 3GRXA 5AIXA 1ZL9A 1XXUA 2J23A 3EU3A 5C04A 4N0ZA 2V1MA 2DJ2A 1QGVA 1SYRA 5J4UA 1XWAA 5G1KA 3VWXA 5IOWA 1AC1A 3L9SA 5G1LA 3RPPA 3F0IA 3TDGA 2WB9A 3ED3A 3ZLPA 2R5GA 5A5KA 1B4PA 3KH9A 2H30A 4JBBA 2VCWA 1RQMA 1M9BA 5HR0A 5F07A 3F3QA 3LORA 1YQ1A 4OMVA 1MDKA 5B8AA 3W8SA 5D9TA 5ECHB 3LJRA 12GSA 5EL8A 4MZBA 4WBJA 2I3YA 5DALA 2V2GA 5EVOA 4TR1A 1WP0A 2HSHA 3TRXA 2C3QA 4I97A 4KE3A 1XPVA 5HR3A 2FCHA 3JCML 2L4QA 2H75A 4DEJA 3EYTA 4EE0A 2FA8A 5GSSA 4IELA 1A2MA 2FNOA 4POLA 3CMIA 1RK4A 3QAVA 4KCEA 2H0HA 3CYNA 1F9MA 3NOFA 1X9SB 4I2TA 1SD9A 4ULXA 2HT9A 2K18A 3KZQA 4F2IA 2HFDA 2GS3A 3VI7A 5JCUA 3E0UA 3HCZA 2KUCA 4GXZA 2EIRA 4NV2A 3TGZA 4MH3A 3F4RA 2GSSA 1SK1A 3UMAA 2H70A 4IS0A 4L5LA 4D73A 4CW9A 1V40A 1XCCA 4EKZA 5JCWA 2X8HA 1THXA 1PX7A 4PUFC 5ECNB 4AJ6A 2YJ7A 2Z9SA 5JCGA 1X5EA 2FWGA 3IA1A 4LA1A 1HD2A 3SBCA 5IIZA 2R2JA 4GSSA 3A3TA 2FD3A 2VCZA 1A23A 2HI7A 2BJXA 3QFBC 4QL7A 2O85A 1AIUA 4HEA2 5AGYA 5ABRA 3TRPA 3GN3A 2WDUA 4EDZA 3ZRDA 3G7JA 3J7Yk 4F0CA 3BBYA 1OKDA 4HQZA 2LTKA 14GSA 3F4SA 4X43A 1GTUA 5G30A 1URMA 1K0DA 4TXOA 4E8EA 2RM6A 5ECIB 2IMIA 4MA9A 5G31A 5HQPA 1DE2A 3F6FA 2YWMA 2PVOC 5IOXA 4F9ZA 1XWBA 3M9JA 2B5YA 3EINA 5DCGA 1H75A 2X8GA 5F0GA 2BTOT 1XW9A 5CAXA 6GSYA 5JWRB 4DSSA 3CSJA 1GLPA 4K7OA 4FH8A 1ERTA 4IJ3A 3QD9A 1YF1A 3QMXA 4IQ1A 3I6AA 1T4YA 1WMJA 3HA9A 2PUKC 3C73A 1PSQA 1F37A 2MMAA 3EC3A 4PURA 2DJ3A 5J41A 3LWAA 4WETA 2CAQA 4WKWA 3IR4A 2M80A 2VM2A 2JL4A 4NPBA 4HZ2A 3GHAA 3KM6A 3QDNA 2OKAA 5IPHA 1TDIA 3Q19A 1BX9A 5ENUA 4WR4A 2J9HA 2GSTA 1G7OA 3U5RE 4I6XA 1FB0A 3DD3A 2DIZA 1TRUA 1M2BA 2CX4A 2B7JA 1X9WB 3L9VA 4QL9A 2E0QA 2A2RA 1MDIA 4MPGA 4YH2A 5B6MA 2P0GA 3A5WA 2V32A 5DCHA 4GSTA 4K9ZA 3EWLA 5AISA 1GSUA 2RM5A 3GH9A 3O6TA 4GWRA 1A0RP 1GRXA 1U6TA 1W4VA 1MEKA 4O92A 3D6IA 1O6JA 3EVIA 1Z3EA 2HRFA 1K0NA 4LL4B 2VLTA 4PQ1A 1IYHA 1LBKA 2L5LA 2NDOA 4MP4A 2E7PA 2ZNMA 1EP7A 3ZIJA 5IMFA 2OBKA 1OC9A 4L0WA 4V2MA 1T1VA 2GQLA 2LQOA 2FGXA 6GSXA 2A4VA 3GMFA 5DJMA 1GUMA 1TW9A 4JE1A 2LJKA 4HZ4A 1YKAA 1XIYA 1TRWA 17GSA 5H5RA 2L6DA 3LEFA 2PU9C 1O73A 3GX0A 2MZCA 4FYBA 3FZ9A 4O32A 4MZCA 1GNWA 4ZBDA 2AAWA 2PERA 1M9AA 2YWIA 2RUFA 2D2ZA 2VIMA 3TKSE 1A8LA 1MTCA 4V2LA 4DSQA 3KP9A 3Q74A 1U3IA 3HVSA 5IMAA 2I81A 1K0CA 4YAVA 4EC0A 3TKQA 3GKNA 2LUSA 2CX3A 1ERWA 2CAIA 1Z6MA 4F82A 5DAKB 4PUAA 2XHFA 5ELGA 4V1Ag 16GSA 3I43A 2DJJA 1K3OA 1WJKA 3AY8A 3FR9A 6GSTA 1GTBA 1SK2A 4OWYA 2IPAA 1M7TA 4JZQA 1YY7A 1GL8A 3R2QA 3TUEA 2QKEA 2CZ3A 4MJAA 2B5EA 3ME8A 1PQNA 3ZFLA 5ECSA 2YCDA 1QFNA 1CQGA 4TW5A 1ON4A 2JZSA 1V57A 1SK0A 2IMDA 2VL9A 4NHZA 3P8WA 1EZKA 1G0TA 1PMTA 2K8SA 2VCXA 3KH7A 4IN0A 2F51A 4K0GA 5ECQB 3GFKA 1U87A 3WGEA 1TK5B 4EVMA 2WULA 5KEJA 3QAGA 4TRXA 2OACA 1F6MC 3KTLA 3ERFA 2L5OA 2G0FA 2CA8A 1H4OA 2FUG2 5DQSA 2KP1A 4LLRA 2GZPA 2CVBA 3SWLA 3IC4A 3ZIVA 3EU4A 4OCEA 4X1UA 3TOUA 4ML1A 1TI1A 4FYUA 1GH2A 1T4ZA 3IE3A 3GA4A 2H1AA 1U3AA 1K0MA 4L5OA 3FRCA 1PX6A 1ZMAA 2H66A 2VM1A 4OFTA 1SJ6A 3N9JA 4KCAA 4RI7A 3TJJA 1K3LA 1YZXA 4NHWA 2IWTA 3ZTLA 3A2VA 3CSHA 1MD3A 2VD1A 2RLIA 1W89A 5GZZB 5G5EA 2LEGA 20GSA 2H0IA 5D96A 1WE0A 2H76A 1AQWA 2MYGA 1EP8A 3BCIA 3CRUA 5J9BA 5D9VA 1EEMA 1E6BA 4X0XA 2HE3A 2WJUA 3KIJA 4KB3A 3H93A 3CBUA 2B5XA 2F8FA 3K8NA 2VUPA 3DYRA 3L9UA 2DJKA 1VF3A 2O7KA 3MWHA 4IGJA 3VURA 1ZGNA 2N5FA 1QUWA 4MCUA 4Q5QA 3HZ8A 3DXBA 4NV5A 2LS5A 4EUYA 3VPQA 3C1SA 4WF5A 2EIQA 4BWQA 4TVEA 2H0GA 1SL0B 5DQYA 1VF1A 3KMNA 3TRQA 4RQXA 1BQ7A 4IVFA 3TCOA 4IW9A 3QPMA 3IV4A 2PN8A 2ZUPA 2GTUA 4MLYA 4I5QA 1SU9A 5CO3A 1S3CA 1Y6EA 2O8VB 2PBJA 2H71A 3VI5A 3L78A 3LFLA 3C71A 2H1GA 1K0OA 1F3AA 3IRAA 3MAKA 2LJAA 3RBTA 5ECPB 4KNDA 1V58A 1JZRA 4I8BA 4MMMA 1R7HA 2H01A 4JRRA 5ECMB 4ZL8A 1E2YA 1JHBA 3FR6A 1OKTA 2I1UA 2NVLA 4GLTA 4PX1A 4MZWA 4FO5A 1FVKA 2R3XA 1EOHA 2H72A 3D5JA 3LSZA 1EWXA 4DVCA 3LXTA 2CT6A 4XTSA 5C00A 2ALBA 3HVVA 3BOAA 2H6YA 1Z6NA 5KN3A 4V1Ap 3F8UA 5ECRB 4NXIA 3F4TA 5CP1A 1Z7PA 3GL3A 1JZDA 2JZRA 2HNLA 2C3TA 3ZZXA 5DDLA 4FIWA 11GSA 4ZL9A 3WD6A 4K0NA 2GSRA 2DSAA 4IP6A 4ML6A 4MDCA 1Y25A 4MF7A 1AW9A 2E2MA 4OD7A 2JACA 1YEXA 3KMOA 4HI7A 4NMUA 3GV1A 13GSA 2YWOA 1EV4A 2V41A 3HVXA 4MJCA 2DMLA 3BJ5A 4ECIA 2HRNA 3ZVJD 3HHVA 5ELAA 4Q5FA 1XWCA 3APOA 4KDXA 4TXVA 5DVBA 2V6OA 4J2FA 3CTFA 1FW1A 2N5BA 2DC5A 3EMXA 2P5RA 3G7IA 1K3YA 2IMKA 3APSA 3NIVA 1PN9A 5CYYA 2H74A 1VF2A 4L8EA 3GYKA 2MBTA 2CVDA 5F05A 1M99A 1PL1A 3GKXA 4EF0A 5DAKA 2VCVA 4K2DA 1K0BA 3KXOA 2G2QA 1J9BA 5B8BA 4FYCA 3W6GA 2L57A 3ERWA 3LXZA 5H5SA 2GSQA 3N5OA 4HUAA 5J3RA 18GSA 2R4VA 1ZYEA 3KP8A 2LRNA 4KW6A 2GVPA 1AQVA 3TJKA 1ERUA 1M2AA 3GNJA 4GCIA 2REMA 4WR5A 2LKUA 1LJRA 3W8JA 5B7CA 1USBA 1X5CA 1N8JA 3EE2A 1HNCA 4TR0A 3CSIA 4XRAA 4NWYA 2A2SA 3WGXA 2WRTA 3DEXA 1JLVA 2MMOA 4KDYA 3M8NA 4I2UA 4IKHA 1SENA 2MBSA 5IQYA 1F3BA 2C1YA 4KSOA 1FG4A 3DMLA 1C72A 4ZBBA 2H73A 4PGTA 5J5NA 1OE8A 2GGTA 1R5PA 4POBA 3UARA 2CV4A 3A2XA 2B1KA 1K0AA 1PD21 4MABA 1OC8A 2L4CA 3FZAA 2KHPA 1EEJA 3RHBA 4K1FA 3L4NA 4ZBAA 2NTOA 1R5AA 2GZZA 2XC2A 2GT6A 3GSTA 5EY6A 1RW1A 1BEDA 1NM3A 1AAZA 4ID0A 4POMA 5KN2A 1KNGA 1O81A 2MMZA 1KEBA 2C8UA 1JZOA 2C4JA 2AHEA 1R4WA 6GSSA 5IMCA 1FHEA 2VCQA 2ZCTA 3HXSA 1FVJA 4ISDA 2XBIA 2DBCA 4MPFA 2GZYA 3GH6A 4EL1A 3D0ZA 4BL7A 1GSSA 1TU7A 1YF0A 4HS1A 1SKRB 3TKPA 3DWVA 2VL3A 3EMPA 4XRDA 4PNGA 3KD0A 1T8EB 1A8YA 4G9HA 3CRTA 2C0EA 2IMEA 3HJPA 3LYKA 4BVXA 3D4MA 3FHKA 3TKSC 5ID2A 5FHIA 5J9CA 2GQMA 2NPBA 1A0FA 4HJMA 4IP1A 3GX8A 5ECLB 1G7EA 4GRFA 4KX4A 1SKSB 1GSYA 4TN8A 5F8BA 2TRCP 3OR5A 4ZILA 1THOA 3P7XA 1NHOA 2YOIA 5DJLA 4H86A 1SYXA 1O8WA 1V98A 1SL2B 4ACSA 2P31A 5D8IA 3DRNA 3TKSA 1MD4A 3DKSA 3F9UA 2DMMA 1OAZA 2AB6A 1AUCA 3MSZA 3D21A 4OO5A 4K7IA 4EO3A 1BG5A 2B1LA 1TI3A 3C1RA 5EPFA 2DJ1A 3LGCA 5CREA 4ZL7A 4N11A 1DBYA 3E3EA 2LSTA 3US3A 4BA7A 3H4KA 4WBRD 5A4WA 5LD0A 4G19A 8GSSA 2H19A 4ILFA 2VO4A 2VD0A 1BAYA 4HU9A 3KEBA 3UIWA 4ECJA 2OA7A 4J56E 4JU5A 4MJEA 3HY2A 1G6WA 1GNEA 3M1GA 5CRDA 3S9FA 2K8VA 3DVXA 5B6NA 2OBIA 1Q4JA 2RIIA 1IYIA 1XWGA 2IMFA 5HFKA 3G7YA 1XFLA 3KGKA 4QQ7A 2WZ9A 3UBLA 4K7NA 2AUVA 5D73A 5G5FA 3C7MA 3O3TA 1TP9A 4XS4A 4MJBA 4ZXGA 2NBSA 4PQHA 1V2AA 1OE7A 3TJFA 1M0UA 2IL3A 4YQMA 3V1WA 5FWGA 4NAXA 2H1BA 1O7UA 4HOJA 5ECOB 3IBHA 4HQSA 1TU8A 3IDVA 1SD8A 5D9XA 3WT2A 9GSSA 2LRCA 2C80A 2HZFA 1YEPA 2L6CA 1OYJA 4JR6A 3VFIA 2C0FA 1ERVA 5FT3A 4N10A 1ML6A 1GLQA 3IK9A 2DLXA 2YWNA 4Q5RA 1QMVA 5CRHA 2M46A 2TIRA 1GUHA 2FWHA 4MF6A 2DIYA 2VL2C 5ID2B 1TXXA 2LRTA 1CQHA 3I69A 3GURA 1AQXA 3TKRA 1XW6A 1T3BA 2LNTA 1FOVA 2I4AA 5L71A 1PL2A 1TRVA 5HR2A 5CRWA 1O8XA 1OC3A 1TK0B 4GTUA 1YJ6A 3VPTA 1ACVA 2CVKA 3DVWA 19GSA 3F6DA 1X5DA 3FYGA 2X8CA 1S3DA 2VL2A 3RHCA 1ZZYA 1HQOA 4KH7A 3TB2A 4O7HA 3VK9A 3M0FA 2I9HA 1Z7RA 2FWFA 3BD2A 3APQA 2WS2A 4KAEA 1ABAA 4G2EA 4YQVA 3ZYWA 2IFQB 2C0DA 3I9V2 2XPDA 2CQ9A 4OFNA 1UC7A 1GULA 2IIYA 4F03A 3DGQA 2YZUA 5A4UA 1GP1A 2F8AA 4XHMA 3GKKA 2O89A 1U88A 2FY6A 1WPIA 5GAPD 2VLUA 1TOFA 3L0HA 3ME7A 2YPMA 2YZHA 5GSTA 1B8XA 3RPNA 2B6MA 1PKZA 1ZYQB 3UVHA 2FLSA 3PGTA 3IPZA 3UL3A 4GQCA 2HXKA 2GQKA 5IO0A 2ON5A 1ILOA 4GQFA 4ZIJA 3F3RA 2K9FA 4IHUA 4KDUA 2YV7A 1GTAA 1SJIA 3GTUB 1DE1A 3H79A 4XS4B 1O85A 4HU7A 3IXRA 3QR6A 1F2EA 5KN1A 3D22A 3RDWA 3GKMA 1KBNA 1TTZA 2B7KA 5A4VA 1TKDB 22GSA 3HKRA 1BYEA 2ES7A 4N0VA 4LMVA 2GT5A 3ZVJA 5IO2A 4KUNA 3U6VA 2FHEA 1QK8A 1XWKA 1J08A 1AXDA 1HNBA 2KOKA 1G6YA 5DBQA 2KLXA 1ST9A 3KCMA 3LYPA 4F0BA 2R37A 3ZL5A 3FZ5A 1SL1B 7GSSA 1ZOFA 1EV9A 1TK8B 4TR4A 2HZEB 4TOPA 1NW2A 4V2NA 2QGVA 3H8QA 4MF5A 1XVQA 1I5GA 1GWCA 4P3YB 1ZCPA 4WF4A 4Z7XA 1GTIA 2PGTA 6GSUA 1XBSA 5IPGA 2JSYA 2JZTA 4IBPA 4AF2A 1WOUA 5COHA 3CXGA 3FW2A 5JWOB 2FWEA 3P2AA 4EDYA 3FK8A 2YP6A 4TR3A 3WYWA 3ZFBA 4JR4A 2YNXA 3RAZA 4XS1A 5IMVA 4ZB6A 1WRYA 2QSIA 1GSDA 3UJ1A 1M2DA 4OO4A 3VWWA 2PWJA 3VWUA 1TRSA 4OFMA 2B3SA 1FO5A 2AV4A 1FAAA 5HFGA 4IJIA 3FEUA 5LCZA 4AGSA 4JEDA 2LQQA 2IJYA 2MMNA 3GIXA 2F9SA 3QAWA 2AYTA 4XIHA 2JSZA 4PXOA 4YAPA 4K6XA 4KSMA 3NZNA 3LQ7A 4XCSA 2VAFA 5H5QA 2WCIA 1GUKA 2X99A 3QFAC 1EGOA 1KTEA 4MK3A 3IK7A 1PKWA 1UVZA 1NHYA 3MNGA 5DALB 1B4QA 4TR1B 2IN3A 2YN1A 4OCFA 2H6XA 3KJYA 2GLRA 2PVQA 4WEYA 3UAPA 2XPEA 3F63A 1N2AA 2N5AA 1XW5A 2HLSA 4MH2A 1QXHA 5AIVA 4ECBA 3ZREA 1FB6A 4YQUA 2DJ0A 3PR8A 10GSA 6GSWA 1Z5YE 1UA5A 3FY7A 4HDEA 3HDCA 5HFIA 6GSVA 4ZB8A 3D4TA 3M3MA 1VRSD 1PRXA 5GAND 1J0FA 4D73B 1B48A 3P90A 2HYXA 1GSQA 2EIOA 3HJMA 1T7PB 1R26A 4LL1B 5INYA 1EGRA 5D9WA 4K8MA 1GSFA 5ECKB 5E59A 2WGRA 2V6KA 4ECCA 1PGTA 3IHQA 5HR1A 3UVTA 3FZ4A 3LG6A 1JLWA 3M9KA 2H1DA 1JFUA 4BWSA 1HYUA 2ON7A 5AN1A 2KP2A 1B9YC 1MDJA 1HNAA 2PPTA 2H8LA 2P5QA 1YDKA 3ZMKA 4AJ7A 5IMDA 3GSSA 1SJZA 4TXOB 2E2GA 2IFQA 4GF0A 1Z9HA 3FKFA 2M72A 1TJDA 4DSRA 4BPYA 3QCPA 2LV3A 1WWJA 4ZB9A 4EXJA 5CNWA 2R6KA 2CZ2A 3IOSA 4AJ8A 5LNKe 4CHSA 1NSWA 1JZWA 1QQ2A 4DSSB 2VLVA 1EOGA 2TRXA 4KGIA 3UEMA 3IAM2 4KA0A 4PQIA 1T00A 2OE3A 2H6ZA 3EURA 1BJXA 1WIKA 1SKWB 2YANA 3ZMLA 2O87A 2XBQA 3O76A 5CRGA 2L59A 1XZOA 1B9XC 2LNSA 1V9WA 3MDKA 1XVWA 5F06A 3Q6OA 4N30A 2X64A 2VOCA 2AJQB 3PINA 3UOMA 4XS6A 4CDOA 1UN2A 1A2JA 3J7Yb 3GTUA 2OE0A 1YKCA 3GUSA 3IAS2 3GL5A 4WXTA 3HD5A 3VWVA 3HZ4A 3ZITA 2JADA 2YV9A 3ISOA 4E8HA 5KN0A 3QOUA 2PMTA 2C3NA 4O5RA 3H1NA 3A2WA 2F3MA 2VCTA 1DUGA 1S3AA 4POKA 1OVNA 2QC7A 1Q98A 2GDRA 2YJHA 5E4WA 3HYPA 4L0UA 3CTGA 3PH9A 4IQAA 4LMWA 3G9BA 4G10A 4Q5NA 4TKYA 3KTBA 4RI6A 2LJRA 1A2LA 5JWQB 3Q18A 1XOBA 4HJ2A 2OE1A 2HZEA 2HSYA 4J57E 1X9MB 1PA3A 2RUEA 3HJOA 2K6VA 3TOTA 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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