3P7XA

Crystal structure of an atypical two-cysteine peroxiredoxin (saouhsc_01822) from staphylococcus aureus nctc8325
Total Genus 46
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
46
sequence length
166
structure length
166
Chain Sequence
GSMTEITFKGGPIHLKGQQINEGDFAPDFTVLDNDLNQVTLADYAGKKKLISVVPSIDTGVCDQQTRKFNSDASKEEGIVLTISADLPFAQKRWCASAGLDNVITLSDHRDLSFGENYGVVMEELRLLARAVFVLDADNKVVYKEIVSEGTDFPDFDAALAAYKNI
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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molecule keywords Probable thiol peroxidase
publication title Crystal structure of an atypical two-cysteine peroxiredoxin (SAOUHSC_01822) from Staphylococcus aureus NCTC8325
rcsb
source organism Staphylococcus aureus
molecule tags Oxidoreductase
total genus 46
structure length 166
sequence length 166
chains with identical sequence B, C, D
ec nomenclature ec 1.11.1.-:
pdb deposition date 2010-10-13

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF08534 Redoxin Redoxin
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.30.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich Glutaredoxin Glutaredoxin 3p7xA00
2AYTA 4ILFA 3W6GA 5IMFA 2DLXA 4IKHA 3KMNA 4GQCA 2MMOA 3M3MA 4K6XA 3LYKA 4DVCA 3LG6A 3O76A 1ABAA 1OC9A 2JZRA 2WS2A 1B4QA 1EGRA 1O81A 1G6WA 3G7YA 3RPNA 4MF6A 2GDRA 1XOAA 5HQPA 1GSDA 1A2JA 3E9JB 1GSUA 4BVXA 4NV2A 2H66A 1ML6A 4RI7A 1MEKA 2AHEA 1Z7PA 2ZNMA 1A8LA 2LUSA 5LNKe 2O89A 4HU7A 3E0UA 4POMA 2HRNA 1ZGNA 1B48A 4I8BA 2AJQB 4F82A 2LTKA 5EVOA 5IMAA 4G2EA 3CRUA 1YKAA 3F6DA 3O6TA 4MH3A 3GTUA 4XRDA 1XPVA 1SYXA 5ECIB 2FD3A 4HEA2 2VCWA 2DBCA 2YNXA 1GTUA 1VGLA 2DJJA 1NHYA 4YQMA 2VLTA 5ELAA 1SL1B 4HZ2A 2IIYA 3EU4A 1G7EA 2LV3A 1M9BA 2DC5A 2H74A 5ECMB 3QAGA 1TU7A 4ZIJA 4WBRD 1G7OA 5CRGA 4POLA 2L6DA 2H01A 1EZKA 2PPTA 1PL2A 3DYRA 4ZILA 1EOHA 2Z9SA 2OE0A 2WZ9A 1A0RP 1J08A 2NPBA 2M46A 4XS1A 2B5EA 5J4UA 1O73A 3GH9A 3FZ4A 4TR0A 4NAXA 3TKSA 3UIWA 3GKNA 3W8SA 3RBTA 4IS0A 3ZFLA 1I5GA 3HCZA 2OADA 1QQ2A 3JCML 3RHCA 1KEBA 4P3YB 4IW9A 5JWQB 1R5PA 2LNTA 5C04A 1TI1A 4AF2A 2RIIA 4IP1A 6GSWA 2C3TA 2RLIA 2C0FA 4TR1B 2XPDA 2H1BA 2X8CA 5HFIA 4KCEA 5CYYA 4K0GA 2HI7A 8GSSA 4AGSA 2PUKC 3PR8A 1K3LA 1X5EA 1KBNA 5HR0A 2ZUPA 4GLTA 4OCEA 4HUAA 4POBA 2A2SA 4F0CA 9GSSA 4TR4A 4GXZA 1FB0A 2K8VA 5H5RA 1M0UA 5FHIA 3C71A 3GKMA 3IA1A 1RQMA 2VM1A 1PD21 5LD0A 3IAS2 5F07A 5CRWA 1WP0A 3FZ9A 5LCZA 4JU5A 2FWFA 3DIEA 2FUG2 1ERWA 1T1VA 3C1RA 5ABRA 4TKYA 3L78A 1JZDA 3EYTA 3KZQA 2PMTA 3QDNA 1EGOA 3KMOA 4GTUA 3WGXA 3HD5A 2E7PA 4FO5A 1F9MA 4ZB6A 19GSA 1YF0A 1FAAA 1F6MC 2H70A 4ZBBA 3IRAA 5ECQB 3FEUA 4XS4B 1YY7A 1PN9A 2FWEA 4V2MA 1M99A 4DSSB 4ZL7A 1SL0B 4LL4B 3FY7A 1S3DA 2LJRA 2G2QA 1JZOA 1UA5A 3LYPA 2WRTA 3VWVA 1GP1A 4KDUA 2OBIA 3DVWA 5IPHA 1UVZA 1YDKA 1QGVA 1MD3A 2OJLA 2ES7A 4ULXA 1AQVA 4MJCA 2XPEA 4KX4A 1QK8A 1Y25A 2GZYA 1K0OA 3F4SA 4MH2A 6GSVA 3GV1A 1GTIA 3ZMKA 1ERTA 1SJ6A 2VM2A 4FYUA 4J2FA 4G10A 2CAQA 1ZOFA 1ZZYA 2VL2C 4GSSA 3VPTA 3NZNA 3L9SA 4KH7A 3M9JA 5GAND 2VO4A 1VF1A 1M9AA 2EIRA 4NXIA 2H1GA 3IAM2 2C0DA 4MLYA 3LWAA 1F3AA 2GS3A 2I81A 3VURA 2I1UA 3FZAA 5J9CA 3D4MA 2WJUA 3GN3A 3H79A 2FA8A 3CSJA 2A2RA 2V32A 5KN0A 3KH7A 3UOMA 4CW9A 2H30A 5CP1A 2CX4A 2R3XA 2HLSA 3IK7A 22GSA 2KLXA 4OMVA 1ZCPA 4OWYA 3HA9A 4K7IA 2RM5A 3F8UA 1QMVA 2GSRA 1Y6EA 1X0RA 2HE3A 2BJXA 2LSTA 2XHFA 3L9VA 3ME7A 4AJ7A 3H1NA 4QL9A 4DEJA 4IN0A 2H8LA 2LRNA 2H73A 2LS5A 4EDZA 3ERWA 4V1Ag 3LEFA 2OKAA 1H75A 3ZFBA 3EU3A 2B7JA 2JU5A 3A2VA 1T3BA 2NVLA 3FYGA 4MABA 3EWLA 2DSAA 3PGTA 4NV5A 3Q6OA 4MZWA 4GSNA 1HNBA 1OYJA 4PQHA 3GFKA 3CRTA 5COHA 2VAFA 3S9FA 1XCCA 1YQ1A 4MJBA 1JLWA 6GSTA 5ID2B 12GSA 3IK9A 1GSSA 3TUEA 5ECSA 4OD7A 4MCUA 1QUWA 3KCMA 2CZ2A 5AN1A 1MD4A 1YZXA 2IN3A 4HQSA 1DE1A 1VRSD 1VF2A 3U6VA 1G6YA 3UBLA 5F06A 1R4WA 4BWSA 3J7Yb 5CO3A 3WD6A 4XRAA 2IMIA 2HNLA 5ECPB 3C73A 3KP8A 4MA9A 4ML1A 5IMVA 1YKCA 4H86A 2H6XA 4G9HA 3TOTA 17GSA 4MMMA 2L57A 2H71A 1GSFA 3GH6A 2KP1A 3FKFA 2R6KA 2M72A 3F4TA 4ECJA 1FW1A 3KD0A 1V57A 2GZZA 3IC4A 16GSA 4QQ7A 3P7XA 2KOKA 4TW5A 1GUKA 2P5QA 3D21A 2DIZA 2H0IA 3APQA 5CNWA 2HXKA 3FRCA 4K2DA 2HSHA 2K9FA 3Q18A 2YPMA 5D93A 1Q4JA 1HQOA 4BWQA 1EP7A 2VUPA 2C3NA 2VIMA 4CHSA 2PN8A 1YJ6A 2O85A 4FIWA 1OKDA 3HVSA 2RUFA 1SKSB 5E4WA 4X0XA 5EL8A 5CRDA 3TDGA 4MF7A 2BMXA 5D8IA 4I2TA 1I9DA 4ZB9A 2IMFA 1BQ7A 4FYCA 3CTGA 3EMXA 4F2IA 5IO0A 2VL3A 4ZXGA 4KCAA 3VI5A 1EOGA 1PX6A 4KB3A 3LXZA 2CZ3A 4BPYA 2DIYA 3F3RA 1AQWA 3SWLA 2F3MA 3WGDA 2GLRA 3KIJA 3HYPA 5ECOB 1T4ZA 2F9SA 5C00A 1O7UA 5IMZA 3QAVA 4NMUA 4QL7A 3ZIVA 2B3SA 2VOCA 2YZHA 1TU8A 4MPFA 4KGIA 4BL7A 2F8AA 5GSSA 3HVVA 5AIVA 3TCOA 3ZTLA 1PX7A 1T4YA 1F3BA 4ID0A 4GQFA 1O8XA 4MPGA 1K0NA 1ZL9A 2EIOA 1PKZA 3TKPA 3MSZA 2DJKA 2ON5A 5EY6A 1RW1A 1SKWB 2B6MA 2G0FA 3P90A 4NHWA 4JE1A 1CQHA 3UEMA 4PX1A 1JZRA 5D96A 5IIZA 5GZZB 5ECRB 4TVEA 4BA7A 1B4PA 1PGTA 2H75A 2YV9A 5A4VA 1NSWA 2LKUA 1XW9A 4HJ2A 5FWGA 5B6MA 5F8BA 1GRXA 4DSSA 5DAKA 4GCIA 4HI7A 5HR3A 3DWVA 1HYUA 2PVQA 2PVOC 1GTBA 4V1Ap 3LFLA 1DBYA 4NHZA 1THXA 3TOUA 4V2LA 1XWGA 1GNWA 3M9KA 3GX8A 5IPGA 2H0HA 4TXOB 5GSTA 2L4QA 4BVYA 1FVKA 3A2WA 3RPPA 1LU4A 3ME8A 4WETA 5GAPD 5KN1A 3IDVA 1BYEA 2V6KA 2VLVA 3G9BA 3U5RE 1U3AA 3N9JA 1PSQA 1V2AA 5B8AA 3HDCA 4D73A 5DCGA 3K8NA 1OVNA 3ZMLA 5IOXA 1K0BA 3TRQA 4RQRA 5ECLB 2B5YA 2CV4A 1DE2A 4LMVA 3UAPA 3TJGA 2MYGA 20GSA 4K7NA 2X8HA 2X64A 3KGKA 2AV4A 4N30A 3L4NA 2VL9A 5E59A 3HJOA 3DEXA 4HU9A 3CSHA 3L9UA 2YWMA 2GSSA 1W4VA 2H19A 1PL1A 1W89A 2WULA 1ZMAA 1TJDA 1U88A 1EP8A 4DSQA 1MTCA 3BCIA 3TJBA 4Q5FA 1EWXA 2WB9A 2VCQA 4KNDA 2XBIA 5ECKB 3IOSA 4JRRA 4ML6A 1FB6A 3CYNA 2LEGA 2PU9C 3ZZXA 3KM6A 3F6FA 5B8BA 3DVXA 2JADA 4I2UA 2D2ZA 5JCUA 4GWRA 3I9V2 2ZCTA 5G5FA 3FR9A 2WFCA 2EIQA 3US3A 4IJIA 4IP6A 4PUAA 1Z6MA 1NHOA 2IFQA 4EC0A 2LJAA 3CMIA 4TXVA 3TJFA 4N0ZA 3GTUB 4IGJA 3QR6A 4WKWA 3HJMA 1ACVA 4ZL8A 3D0ZA 1U6TA 1AC1A 1MDKA 2H6ZA 4YQUA 5AGYA 2WCIA 3EE2A 3QAWA 4RQXA 3DXBA 1XWKA 5A4WA 3E3EA 2LRCA 3N5OA 2CX3A 1G0TA 2IMKA 5DVBA 1A24A 3H8QA 2KP2A 2V41A 1V9WA 3HHVA 3KTBA 4L0WA 5CREA 3GKKA 5D9WA 5IO2A 2KHPA 2DMMA 3IHQA 4ACSA 1SJIA 6GSSA 1X9WB 2LRTA 3QFAC 4GSTA 1TTZA 1AAZA 3ZL5A 1K3YA 3RDWA 1X5DA 1S3AA 1OC8A 3D22A 3HVXA 1TW9A 1UC7A 5AISA 3SBCA 5DJMA 2R4VA 4KUNA 1SK1A 4I6XA 3H4KA 1A2LA 5D9VA 2DJ1A 2BTOT 2JSYA 3BBYA 3F3QA 1TRWA 4JEDA 1TI3A 1F37A 1SD8A 4YH2A 5F05A 5F0GA 2P31A 3VK9A 3Q19A 5JCWA 1V58A 4J57E 2DMLA 4KAEA 1DSBA 4PGTA 5G2ZA 2RM6A 4JR6A 3D4TA 5DALB 1OE8A 1BJXA 3TB2A 4Q5RA 1FVJA 3QMXA 3KH9A 3OR5A 1TK8B 4EVMA 1CQGA 3WT1A 1WIKA 5D73A 2J23A 5B7CA 2HZEA 1S3CA 4AJ6A 3D5JA 3ZYWA 1F2EA 5G31A 4XHMA 2VD0A 4YQVA 3GMFA 5D9TA 2E0QA 3VPQA 2P5RA 3IV4A 2AAWA 2ON7A 5IQYA 5G1KA 3CSIA 4WF5A 1FHEA 3UBKA 2FLSA 1MDIA 2L5OA 6GSUA 4Q5NA 4LA1A 4ZBDA 2M80A 5KN3A 3GX0A 3FR6A 4O5RA 1M7TA 1AW9A 2H6YA 4N11A 4IBPA 2IWTA 4HJMA 5ECNB 3TKSC 2YN1A 3VLNA 2TRXA 3LXTA 1SK2A 3FR3A 2IMDA 1JLVA 1A2MA 4X43A 1IYHA 3AY8A 4TRXA 2GQMA 4IQAA 2L5LA 4OCFA 3L0HA 4PQ1A 6GSXA 2GZPA 1DUGA 1SENA 3I6AA 4HQZA 3IR4A 2TRCP 4ECBA 3M1GA 1TP9A 3F0IA 5H5SA 3ERFA 4PNGA 3VFIA 1Z6NA 1JFUA 3F63A 2VCZA 2YCDA 4RUVA 3LGCA 3G7IA 13GSA 1PQNA 1YEXA 4PQIA 1FOVA 1GWCA 1TXXA 4KSOA 3NIVA 4K0NA 1R7HA 5G30A 2PWJA 5H5QA 1GLPA 5AIXA 1GSEA 5INYA 2RUEA 4HDEA 2CVDA 2TIRA 1Z9HA 2V2GA 2OE3A 1QFNA 3BD2A 1T7PB 3TJJA 3GHAA 2GSTA 1GULA 2ALBA 1WJKA 1TRVA 4PNFA 1E2YA 2YANA 1GUMA 2HT9A 1SKRB 2MMZA 1XXUA 3GSSA 1J0FA 1A8YA 3KEBA 4XS6A 2JSZA 4JZQA 4ZB8A 2LNSA 1HD2A 2FGXA 3NOFA 5G1LA 4OFTA 1O6JA 4L8EA 4HOJA 1OE7A 4MP4A 2PERA 1A23A 2GT6A 4IHUA 3GRXA 2YJ7A 2HZFA 4KSMA 3HJPA 2GQLA 2CA8A 2K6VA 2H1DA 4FYBA 5L71A 1WOUA 1MDJA 5J41A 1K0AA 3VWXA 3WT2A 2NTOA 2A4VA 2X99A 1R26A 4TR1A 4RI6A 1XVQA 1QXHA 5KEJA 2VCTA 5JWOB 2WGRA 3IXRA 2E2GA 5IMDA 1KNGA 3MWHA 1Q98A 1B9XC 3GURA 3RAZA 5D9XA 4HS1A 1TKDB 3HZ4A 2QGVA 2YP6A 1V40A 3UARA 3MDKA 1V98A 4NWYA 1SU9A 4WR4A 2YWOA 4O7HA 3WGEA 1C72A 2VL2A 3UVTA 4ZL9A 2DJ3A 3PH9A 5DJLA 3I69A 3UJ1A 2FY6A 2H0GA 3UMAA 4EE0A 3D6IA 2YZUA 3GNJA 4MF5A 1K0DA 3VWUA 1BAYA 1SD9A 1T00A 5G5EA 3FW2A 2GSQA 2DJ0A 2C1YA 4E8EA 2F51A 2FHEA 5HR1A 3DGQA 2YJHA 5DQSA 1M2BA 1JZWA 4FH8A 3G7JA 5ELGA 2H72A 2IJYA 3O3TA 2O8VB 4YAPA 2MBTA 3KXOA 4K8MA 1TK0B 4Q5QA 4XS4A 1H4OA 2GTUA 4ZBAA 2IPAA 4JBBA 5HR2A 4F9ZA 3CTFA 1T8EB 11GSA 18GSA 1EEMA 2OE1A 3LQ7A 1O85A 1J9BA 1UN2A 3H93A 1FG4A 4L5OA 3Q74A 1Z3EA 1XOBA 4GRFA 3ZLPA 2I3YA 2K8SA 1ERUA 6GSYA 3BJ5A 1AIUA 2WDUA 1AXDA 3FHKA 3C1SA 2N5AA 2LQQA 5IMCA 4OFMA 1YF1A 5JWRB 3KJYA 3FK8A 3M8NA 3BOAA 4ECIA 2OACA 2N5FA 1O8WA 3C8EA 3ZREA 4EKZA 3BCKA 2F8FA 2H1AA 1ZYQB 2J9HA 1N8JA 1Z5YE 1TDIA 3EURA 2B1LA 3ZIJA 2P0GA 1LJRA 1OC9B 2VD1A 1WWJA 3KP9A 1ON4A 2L6CA 3GKXA 4ISDA 1EEJA 2PBJA 3PINA 4O92A 3ZVJD 4J56E 1RK4A 1GLQA 4MZCA 2CQ9A 2FNOA 3CXGA 5DALA 4K9ZA 3W8JA 1XZOA 5CRHA 3DD3A 3QD9A 2KUCA 2XC2A 3WYWA 4DSRA 4MZBA 1X5CA 4IVFA 4TR3A 1NM3A 3KTLA 3IE3A 2VLUA 4N10A 3RHBA 4AJ8A 3UVHA 1GH2A 5J5NA 1BX9A 1E6BA 2HSYA 2V6OA 3TRPA 2C8UA 2C80A 4TN8A 3EVIA 10GSA 3APSA 1TRUA 3FZ5A 1K0MA 4IELA 1TRSA 2REMA 1EV9A 2YV7A 2R5GA 1XWBA 4MDCA 3EINA 3TRXA 2VCVA 3GSTA 5KN2A 2N5BA 1X9MB 4CDOA 5ID2A 1Z7RA 2C0GA 4KA0A 2FWGA 3GYKA 1GL8A 5EPFA 1OKTA 1GSYA 5B6NA 2HYXA 3ED3A 2DJ2A 3ZITA 3EC3A 1GNEA 1THOA 1GTAA 3VI7A 4MK3A 1K0CA 1IYIA 4ECCA 1B9YC 7GSSA 1ILOA 3UL3A 3APOA 3I43A 5DAKB 2K18A 4L0UA 2QSIA 3TKQA 5A5KA 2MMNA 5ENUA 1XIYA 1N2AA 2AB6A 1EV4A 2JL4A 4IQ1A 2HFDA 1SL2B 2YOIA 3QCPA 2YWNA 3GUSA 3ERGA 1BG5A 2B5XA 1WE0A 3J7Yk 4D73B 1ST9A 3TJKA 2L4CA 3A5WA 2QC7A 2CVBA 5A4UA 2C0EA 4IJ3A 2FWHA 1ZYEA 4XIHA 1VF3A 3A2XA 2GT5A 1U87A 4I5QA 4EUYA 3ZVJA 1SJZA 4OO5A 3QPMA 2IMEA 4PURA 4GF0A 3GL3A 1XW5A 1TOFA 4LMWA 3M0FA 4WEYA 2MZCA 4KE3A 4X1UA 2H76A 3DKSA 3LJRA 3P2AA 3F9UA 3VWWA 3TKRA 2NBSA 3EMPA 2LJKA 3GA4A 1XFLA 2OBKA 4YAVA 4Z7XA 3MAKA 5IOWA 3A3TA 2GGTA 4KDXA 2IL3A 2V1MA 2AUVA 3QFBC 2NDOA 3HKRA 5ECHB 4K1FA 5FT3A 2C4JA 2R37A 1GSQA 1PMTA 3DMLA 1KTEA 5HFKA 2R2JA 4WF4A 1OC3A 2JACA 2IFQB 1OAZA 4OFNA 4PUFC 1XW6A 4EF0A 4LL1B 3QOUA 4PXOA 2LQOA 5DQYA 2FCHA 2EC4A 3P8WA 4EL1A 4F03A 4TOPA 5DBQA 4F0BA 4LLRA 2JZTA 4G19A 4XTSA 2C3QA 3HXSA 1M2DA 5JCGA 2GQKA 2XBQA 4V2NA 4HZ4A 3HZ8A 2YWIA 1X9SB 1ERVA 1USBA 1A0FA 3C7MA 2GVPA 1AUCA 2I4AA 1BEDA 2CT6A 4XCSA 1R5AA 4O32A 2MBSA 1M2AA 1WMJA 3LSZA 4JR4A 1HNAA 1GUHA 3R2QA 1NW2A 2E2MA 3LORA 4EXJA 4WBJA 5DDLA 1B8XA 4MJAA 1URMA 2B7KA 1JHBA 5DCHA 2B1KA 1PRXA 4WXTA 1XBSA 2PGTA 2HRFA 2CAIA 3IPZA 4NPBA 5J9BA 5HFGA 1U3IA 14GSA 2O87A 1XWAA 2CVKA 3IBHA 4POKA 3CBUA 1PKWA 2L59A 1K3OA 3ZRDA 1AQXA 1VF4A 1PA3A 4WR5A 2MMAA 2OA7A 2VCXA 1SK0A 1XWCA 4OO4A 4KW6A 1WRYA 3DRNA 3GIXA 4N0VA 5J3RA 2FA4A 3GL5A 4TXOA 2O7KA 1XVWA 1FO5A 1SYRA 2QKEA 4L5LA 3TGZA 1LBKA 4KDYA 4MJEA 2I9HA 1YEPA 4I97A 4E8HA 3ISOA 4EO3A 3MNGA 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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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