3P7XA

Crystal structure of an atypical two-cysteine peroxiredoxin (saouhsc_01822) from staphylococcus aureus nctc8325
Total Genus 46
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
46
sequence length
166
structure length
166
Chain Sequence
GSMTEITFKGGPIHLKGQQINEGDFAPDFTVLDNDLNQVTLADYAGKKKLISVVPSIDTGVCDQQTRKFNSDASKEEGIVLTISADLPFAQKRWCASAGLDNVITLSDHRDLSFGENYGVVMEELRLLARAVFVLDADNKVVYKEIVSEGTDFPDFDAALAAYKNI
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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molecule tags Oxidoreductase
source organism Staphylococcus aureus
publication title Crystal structure of an atypical two-cysteine peroxiredoxin (SAOUHSC_01822) from Staphylococcus aureus NCTC8325
rcsb
molecule keywords Probable thiol peroxidase
total genus 46
structure length 166
sequence length 166
chains with identical sequence B, C, D
ec nomenclature ec 1.11.1.-:
pdb deposition date 2010-10-13

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF08534 Redoxin Redoxin
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.30.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich Glutaredoxin Glutaredoxin 3p7xA00
2DC5A 3MAKA 3QMXA 4TR3A 5AN1A 1YJ6A 3WGDA 2GT6A 4IP6A 4PQIA 4L5LA 2RUEA 3BBYA 3VWVA 4K1FA 4I2TA 2FHEA 2PPTA 5A4WA 3KMNA 2MMNA 4XS4A 1K0OA 3BOAA 4OO5A 4GXZA 4HZ2A 4O5RA 4EKZA 2IFQA 2YZHA 5CRDA 4FO5A 1GTIA 3EMPA 3RHCA 3G9BA 2HXKA 2F3MA 4L8EA 4IVFA 3DVXA 1PN9A 3KMOA 3GSTA 5JCUA 3KTBA 1FW1A 1TJDA 4K8MA 3RAZA 2F8AA 4MF5A 3KP8A 4POLA 2VCQA 3TJGA 1WOUA 3FZ9A 4TR1A 1EZKA 5IMAA 1QUWA 2DIYA 1AIUA 4TXOB 1X5EA 3DVWA 5E59A 1FAAA 5CO3A 2MMZA 1BG5A 3M0FA 1K3OA 5ECOB 1XOAA 1SL0B 3H93A 1XFLA 3EMXA 3IHQA 3L78A 5G1KA 4I2UA 3RPPA 3EINA 4KDUA 2RLIA 4FIWA 1ZOFA 3DYRA 1T8EB 3ZZXA 1ZYQB 1MTCA 2R3XA 3FY7A 5G31A 3ZL5A 1EP8A 3RDWA 1J0FA 4DSRA 4EXJA 4CDOA 5JWOB 2R4VA 3APOA 5DCGA 1AQWA 3LYKA 2K18A 4GRFA 5B8BA 1M0UA 5J3RA 2OKAA 4IS0A 6GSXA 1ON4A 4P3YB 3GL5A 4PQHA 3ZFBA 1XW5A 1SJZA 2ZCTA 1PSQA 1GSUA 5J9CA 1GSFA 1GRXA 1T3BA 1X5CA 4IJ3A 4MDCA 3TKPA 2YWOA 2FWEA 1ERUA 2MZCA 1HYUA 5IOXA 2GTUA 2ALBA 4IN0A 3ZFLA 3H8QA 1OKTA 1TP9A 3EWLA 1ACVA 3M3MA 1TRSA 5DAKB 1EEMA 6GSYA 4KCAA 3GX8A 6GSVA 2DJ1A 2HYXA 10GSA 2ZNMA 2C1YA 1A0FA 4WKWA 2VLVA 1GTUA 1GULA 2NDOA 1THXA 4KUNA 1TDIA 4PXOA 3UIWA 4YQVA 6GSWA 4WBRD 3QAGA 4NXIA 1TU8A 2FA4A 3A2VA 5B6MA 3F4RA 4EE0A 4K7NA 1YQ1A 3OR5A 2DIZA 3HVVA 3NOFA 3F6FA 4I6XA 4PNGA 2WULA 3D0ZA 2YWNA 3BJ5A 4TVEA 4ZL7A 4XHMA 4TRXA 1PGTA 6GSUA 5G2ZA 3Q6OA 1O73A 4MPFA 5GSTA 14GSA 1O81A 4OCFA 3GRXA 2H1AA 1BAYA 1R4WA 3ZMLA 2LJKA 3FZ4A 4CW9A 1XCCA 1EGOA 2LRNA 2CAQA 3HZ8A 4ECIA 3ZREA 1M9AA 2IWTA 2B7JA 3HJMA 3KIJA 2LSTA 5KN3A 4DSSA 3CSJA 5F06A 2BTOT 1AQVA 5DALA 3GYKA 3VFIA 5HR2A 3KCMA 2DLXA 4JE1A 2A2SA 1TK5B 1YEPA 1OC9B 3IAS2 5D9XA 1DSBA 1PL1A 2R2JA 3LEFA 4G10A 3ZMKA 1UVZA 3H1NA 2CQ9A 4F9ZA 4WEYA 2IFQB 3EVIA 3I43A 1GNWA 2FY6A 4TOPA 1YKAA 4RI7A 1UN2A 1QK8A 1WP0A 2DJJA 4LL1B 4MJCA 4LMWA 2LS5A 3D4MA 2IMDA 3Q18A 2IL3A 2RUFA 2VIMA 2EC4A 3HHVA 1ABAA 4HU9A 4IGJA 4X43A 1TK0B 1PKZA 2L5LA 4BVXA 3TOUA 1XVQA 4WXTA 2GS3A 3HXSA 2H6XA 4D73A 4HQZA 2CX3A 5HR1A 4EVMA 2HE3A 2RM5A 2H75A 8GSSA 3UL3A 2YP6A 2PVOC 3V1WA 2IN3A 2H0HA 2MBTA 1T4YA 3DIEA 3IK9A 1HQOA 5ECRB 4DSQA 3LYPA 1K0AA 4WF5A 5E4WA 3FK8A 1JZDA 1F6MC 1YF1A 3S9FA 2GZZA 3TRXA 2J23A 4NHZA 3L4NA 1G7EA 1GUHA 2B5EA 4V1Ap 1F2EA 2B6MA 3QOUA 2H70A 2YN1A 1U3IA 3WYWA 5CYYA 3W8SA 3EYTA 5EVOA 4G19A 4F0BA 1TOFA 4CHSA 5AISA 1GLPA 1FG4A 2H01A 3KJYA 4G9HA 5C00A 1B4PA 3LG6A 4MF6A 3C73A 3HYPA 2WGRA 4OFTA 1T4ZA 1Z5YE 3F3RA 5IOWA 1F37A 2EIOA 4QL9A 1Z6MA 2AUVA 1GLQA 3IBHA 3LJRA 1ST9A 1XBSA 1X9WB 1O8WA 3BCIA 3TRQA 3MNGA 3UEMA 2VD0A 3IR4A 4BWQA 1EP7A 4I5QA 2NVLA 1HNAA 3IK7A 5AIVA 19GSA 2M80A 3FEUA 1B9XC 2ON5A 2VOCA 3HJOA 4HU7A 3FZ5A 5HR0A 4FYBA 3HZ4A 5IM9A 5KN1A 3ZTLA 4IBPA 3APSA 3IRAA 4EO3A 1AW9A 3KP9A 4ULXA 3VI7A 3HJPA 1JZWA 1VGLA 5EL8A 4XS6A 1NSWA 1E2YA 5IO0A 4TN8A 1K0BA 1M9BA 1ERVA 4V1Ag 2VL2A 2IJYA 4RQXA 4KE3A 1DBYA 2MYGA 5F07A 1M2BA 1XWAA 5IMVA 2F9SA 5D9TA 4JRRA 4O32A 1TI3A 2E2MA 4MH2A 1EWXA 1PA3A 3IC4A 4DEJA 2G0FA 1PD21 2DBCA 3GTUA 2X99A 1O7UA 2KUCA 2JZRA 2XBQA 3IDVA 3SBCA 1X9MB 4TR4A 4ZB6A 3UMAA 5DALB 3FR9A 1WPIA 1JZOA 2H30A 3US3A 1ML6A 5F8BA 3LWAA 1GSSA 2N5FA 2BJXA 5DVBA 4KW6A 1SL2B 4OMVA 4K6XA 3WD6A 1H75A 4HOJA 2FUG2 5CRWA 3GH9A 17GSA 4N0ZA 1OKDA 1GL8A 1A8LA 1A24A 4RUVA 1TRVA 2VM2A 3CYNA 1PQNA 1S3CA 3SWLA 4EC0A 1U88A 1YY7A 5AGYA 2P5RA 5DQSA 2QGVA 3IA1A 1ZCPA 2M72A 3ERWA 3GSSA 2JZTA 3UBKA 3VWXA 4MABA 2CZ2A 2YV7A 1EEJA 4IP1A 5D96A 4RQRA 3FW2A 4D73B 4PGTA 2HRFA 4HEA2 3C1RA 1ZYEA 1S3AA 2O8VB 4ZIJA 4NHWA 3HVXA 4FYUA 5ENUA 2N5AA 2VCTA 1EV4A 3A2WA 4ZL8A 5H5RA 2C3NA 3UVTA 4NAXA 2DJ2A 1OC8A 4BPYA 4ZL9A 1LBKA 2PGTA 3KH7A 1N2AA 2R6KA 2L6DA 1IYIA 4Q5RA 4K7OA 4N11A 22GSA 4FYCA 3GUSA 2WCIA 2H6ZA 2C0GA 3TOTA 5IPGA 4IKHA 1PMTA 2GZPA 1Q4JA 2V6KA 2H1GA 2CVBA 5ECMB 1XW9A 5IMZA 5HFKA 4AGSA 2R5GA 4J2FA 2AYTA 4GQFA 2VL2C 2VUPA 1WE0A 3TJBA 2H72A 3FRCA 1KEBA 3D4TA 3LFLA 4WBJA 1C72A 3DGQA 3CTGA 4MF7A 3TCOA 1PRXA 1UC7A 4XRDA 2TIRA 4KNDA 5C04A 2GZYA 5ECLB 4BL7A 1AC1A 2KP1A 3DMLA 2X8GA 1XWBA 1K0NA 1SK0A 2GQKA 1V98A 4AJ8A 3F4SA 1Z7PA 1XWGA 3HY2A 3TKSC 1Y25A 2CV4A 1H4OA 1SD8A 7GSSA 5CP1A 1R7HA 5GAND 3HA9A 3UBLA 3Q19A 4K0NA 2I9HA 3CMIA 3Q74A 2ES7A 1MDKA 1R5PA 4WETA 1NHOA 1CQHA 5ELGA 2V2GA 3KGKA 4K0GA 1WMJA 2OBKA 1HNBA 5DJLA 4JR4A 1N8JA 2VAFA 1RW1A 5F05A 2O87A 5GZZB 1X0RA 4LMVA 2N5BA 5A4UA 1FVKA 3MWHA 3G7JA 3VPTA 4ECCA 5G5EA 3ZIVA 1A2MA 2D2ZA 3C8EA 2AHEA 5D9VA 4ZBDA 2A4VA 2WJUA 3P7XA 1FO5A 1QMVA 3WGXA 1XZOA 2V6OA 3TKQA 3ZITA 3QR6A 2JL4A 4HJ2A 2X8HA 3F6DA 5D73A 4YAPA 1FVJA 1VF4A 1A2JA 3LQ7A 2AJQB 5HFIA 2P0GA 3QFAC 2GSTA 5ECPB 1OYJA 3M9JA 2RM6A 1TI1A 3GTUB 4XTSA 3IPZA 4HQSA 3KTLA 3GKXA 5H5SA 3GFKA 2DSAA 2FGXA 2GGTA 2L4CA 2LJAA 2K9FA 3O6TA 4JBBA 4F82A 2OADA 4MJBA 2JSZA 2I1UA 2YZUA 1EOHA 1PL2A 2HT9A 4J57E 3DEXA 2NBSA 1WIKA 4Q5QA 1AQXA 3N5OA 3LORA 4MZCA 5ID2A 2H73A 1TKDB 2AAWA 1IYHA 2GSSA 1Y6EA 3GMFA 4L0WA 4GCIA 4Q5FA 2VCVA 2C8UA 3ISOA 5ABRA 4XS4B 3J7Yb 4GQCA 3QDNA 2HRNA 1YDKA 2O89A 3A5WA 5FHIA 3C7MA 1GSQA 3E0UA 2XPEA 4ID0A 1MD3A 2OE1A 2YANA 2PVQA 2CA8A 4OO4A 1ZMAA 5GSSA 4NMUA 1JLVA 2B7KA 2HZEA 4XRAA 4GF0A 2LQQA 2JZSA 3D5JA 1B9YC 1R26A 4TR1B 4O92A 3IAM2 2C80A 3L9UA 2LRCA 1GWCA 2C3TA 1VF1A 5ELAA 5DCHA 2K8VA 4KCEA 2YWMA 1SJIA 5CNWA 3ED3A 2DJ0A 1TU7A 5HFGA 1GSDA 1SENA 2FCHA 6GSSA 3CXGA 2MBSA 1G7OA 1RK4A 2H76A 1W4VA 2PN8A 5KEJA 3GN3A 2IMFA 2OE3A 2L59A 1V57A 1BX9A 1Z3EA 2J9HA 2H71A 4I8BA 2HSYA 3GNJA 5FWGA 4TXOA 4PUFC 1WJKA 3N9JA 3NIVA 4MZBA 3VI5A 4HJMA 4ISDA 3VLNA 3IOSA 2IMEA 3O3TA 5INYA 13GSA 1Z6NA 1ILOA 2I81A 2C3QA 2HI7A 2AV4A 3H4KA 20GSA 4IJIA 2GVPA 2E0QA 2IMIA 3DWVA 3HD5A 4MJAA 5IPHA 2YWIA 2OA7A 4AF2A 4O7HA 5ECIB 1KNGA 3E3EA 2H8LA 3E9JB 3KXOA 4AJ6A 2FWFA 1U6TA 4IQAA 3I69A 2Z9SA 5J9BA 5ECNB 5JWRB 2VD1A 3P2AA 3ZYWA 4ACSA 3GIXA 4ZBBA 5L71A 5IQYA 1SJ6A 1X9SB 1TW9A 1DE2A 1SYRA 2VLTA 2PBJA 5B7CA 3TRPA 4EUYA 1HNCA 4AJ7A 4YAVA 4KGIA 3LXZA 4GSSA 1GUMA 4WR5A 3CSHA 3HDCA 5JCGA 3KEBA 4V2MA 4OWYA 1YEXA 2L4QA 1K0MA 1RQMA 2JU5A 2VLUA 5DAKA 4ML6A 4PQ1A 2E2GA 2EIRA 1LJRA 2YJ7A 5D93A 3MDKA 4YH2A 4POMA 2LV3A 1SU9A 1U87A 1TK8B 1KBNA 3PGTA 3A3TA 1XXUA 1FB0A 3MSZA 5ID2B 1EV9A 4NPBA 4DSSB 3PR8A 3I6AA 4GSTA 3M1GA 4X1UA 2PWJA 5JCWA 4XCSA 3A2XA 1JLWA 5DDLA 1QXHA 3FHKA 2H66A 1SK1A 5DJMA 3FYGA 3M9KA 1ZL9A 3DD3A 2GQLA 5CREA 5F0GA 1XIYA 2A2RA 1GNEA 1SD9A 2WZ9A 3RPNA 1F9MA 2FWGA 3O76A 2WFCA 2HZFA 5LCZA 2LQOA 3ZIJA 1CQGA 4KH7A 4GLTA 4KX4A 1F3BA 1NM3A 2RIIA 2YJHA 4Z7XA 2PUKC 4KDYA 1NW2A 2V32A 2B5XA 3ZVJA 4K9ZA 3EU3A 1TRWA 1VRSD 3M8NA 2B3SA 2HZEB 1SKSB 3C1SA 1OE8A 3P90A 3UARA 3QCPA 4RI6A 1ERTA 1URMA 2OJLA 2P31A 5COHA 5IIZA 1OC9A 1V40A 3KZQA 3P8WA 4ECBA 3TKSE 2PU9C 3TUEA 4XIHA 1Z9HA 4OFNA 3GURA 3RBTA 3VWUA 2JACA 1A8YA 4E8HA 3ME8A 4DVCA 2LUSA 2XHFA 2YPMA 3QAWA 3UOMA 5A5KA 2WDUA 2DMLA 3ERFA 2WS2A 3C71A 5IMCA 1AUCA 1ZZYA 4N30A 1XW6A 1GP1A 2EIQA 2LNSA 4V2NA 3F63A 5LD0A 1BJXA 1SL1B 4ZB9A 1XWCA 2NPBA 5HR3A 1E6BA 1XWKA 5G1LA 3F3QA 4IELA 2HFDA 3VURA 1MDJA 2WRTA 4EDZA 2VCZA 4TXVA 2LEGA 5ECQB 3L9SA 5H5QA 1T7PB 3TGZA 3W6GA 3GL3A 4IHUA 5ECKB 4K7IA 2YV9A 3J7Yk 4LA1A 3FR3A 2JADA 2LTKA 3BCKA 3GA4A 2REMA 1KTEA 4BWSA 1S3DA 4JEDA 1GTBA 4LL4B 2MMAA 1ZGNA 3D6IA 4KAEA 3QFBC 2YOIA 5EPFA 3TB2A 1HD2A 3H79A 1F3AA 1BQ7A 3PINA 2IIYA 1B4QA 1G0TA 3WGEA 4IQ1A 1PKWA 2I4AA 1THOA 1WRYA 4ZXGA 2L6CA 11GSA 3D22A 4JZQA 5EY6A 1K3LA 5CAXA 2FLSA 2H74A 1B8XA 3G7IA 1K0CA 2KP2A 4K2DA 1MDIA 2GSQA 3HVSA 3VK9A 18GSA 3TJKA 4OCEA 5IMDA 2I3YA 1PX7A 5DQYA 2AB6A 4NV2A 2YNXA 4HI7A 4PURA 2HNLA 3FKFA 3FR6A 1JHBA 4PX1A 1OAZA 3WT1A 4ZBAA 2CVDA 4L0UA 1G6WA 9GSSA 2H1BA 2X8CA 5IO2A 3KD0A 4IW9A 1I5GA 2PMTA 1FHEA 5D9WA 2K6VA 3GX0A 4JU5A 4N0VA 1USBA 4HZ4A 1QQ2A 2C0FA 1O8XA 5IMFA 4Q5NA 2HSHA 2GQMA 2ON7A 3TJJA 3U6VA 1T00A 1XVWA 1EGRA 4KDXA 4XS1A 1GUKA 2CX4A 2LKUA 2C0DA 2F8FA 2CZ3A 3BD2A 1K0DA 5LNKe 1J08A 2QSIA 1DE1A 12GSA 5HQPA 2KHPA 3QD9A 5B6NA 1XOBA 4J56E 3K8NA 4KA0A 5B8AA 4EF0A 1M2DA 4HS1A 4WF4A 2VCXA 3PH9A 4EL1A 2P5QA 1QGVA 3HCZA 2M46A 2G2QA 4MK3A 3EC3A 2ZUPA 4QL7A 1MEKA 3F9UA 2NTOA 1SK2A 4MA9A 5KN2A 2O85A 1PX6A 2H6YA 2X64A 2VO4A 16GSA 2XC2A 2H1DA 5CRGA 4MPGA 4GWRA 1SKRB 3VPQA 4MH3A 2H0IA 2GDRA 2VL9A 3IE3A 3KH9A 4G2EA 4EDYA 1ERWA 1LU4A 4L5OA 1QFNA 3GKMA 3EU4A 4MZWA 4QQ7A 4N10A 1EOGA 1U3AA 1K3YA 4ZB8A 3NZNA 1Z7RA 5D8IA 5KN0A 4JR6A 1GH2A 3D21A 1GTAA 4YQMA 5CRHA 1GSEA 3I9V2 4V2LA 3DKSA 2DMMA 4TR0A 3CRUA 5G30A 3TDGA 1NHYA 2C4JA 5J5NA 1TXXA 2LNTA 4ILFA 1O85A 3HKRA 2VL3A 3CSIA 3AY8A 1XPVA 3G7YA 1Q98A 2QC7A 1W89A 2V41A 3JCML 1M2AA 1VF2A 1YZXA 2H19A 1FB6A 2QKEA 3GKKA 2VM1A 2B1KA 2TRXA 4H86A 4MCUA 2TRCP 1OE7A 1OC3A 2YCDA 2BMXA 3U5RE 4PNFA 1TRUA 1I9DA 3CTFA 4MLYA 2IPAA 1UA5A 5AIXA 3W8JA 6GSTA 2L57A 3F8UA 4ML1A 2PERA 5FT3A 2GSRA 1OVNA 2FA8A 3GH6A 2OE0A 1TTZA 1WWJA 4YQUA 3UAPA 3ZVJD 3RHBA 1BEDA 2V1MA 4OD7A 3IXRA 2XBIA 4POKA 4FH8A 3QPMA 3F4TA 2C0EA 3UJ1A 3DRNA 4MMMA 4POBA 2F51A 3EURA 1DUGA 2B1LA 1V9WA 4NWYA 3ME7A 2OBIA 4TW5A 5JWQB 4F03A 3GKNA 2GT5A 5G5FA 3ERGA 1V2AA 3EE2A 5DBQA 1GSYA 4MJEA 3WT2A 3GV1A 5ECSA 2R37A 2FD3A 1R5AA 1JFUA 4KSMA 2FNOA 4I97A 5GAPD 2H0GA 4ZILA 1B48A 2KLXA 3KM6A 4TKYA 3R2QA 1YKCA 3L0HA 1JZRA 4NV5A 2DJKA 4BA7A 4LLRA 4PUAA 3TKRA 4GTUA 3LSZA 3CRTA 1G6YA 3FZAA 2CVKA 2OACA 1AXDA 3VWWA 1YF0A 2XPDA 1SYXA 4GSNA 1SKWB 1MD4A 5J41A 3IV4A 3DXBA 2FWHA 2GLRA 4E8EA 3QAVA 2DJ3A 3LGCA 3GHAA 4HDEA 2KOKA 1A23A 2MMOA 2CAIA 1FOVA 2L5OA 1BYEA 1AAZA 2WB9A 1J9BA 4F0CA 1V58A 2IMKA 4MP4A 1A2LA 5ECHB 3L9VA 1O6JA 4KSOA 3TJFA 2VCWA 4HUAA 4BVYA 4F2IA 4ECJA 3CBUA 2JSYA 3ZRDA 1A0RP 5J4UA 5A4VA 1M7TA 3TKSA 2K8SA 1VF3A 2E7PA 2O7KA 1X5DA 3APQA 4WR4A 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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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