2C1YA

Structure of pdi-related chaperone, wind mutant-y55k
Total Genus 71
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
71
sequence length
231
structure length
231
Chain Sequence
TCTGCVDLDELSFEKTVERFPYSVVKFDIAYPKGEKHEAFTAFSKSAHKATKDLLIATVGVKDYGELENKALGDRYKVDDKNFPSIFLFKGNADEYVQLPSHVDVTLDNLKAFVSANTPLYIGRDGCIKEFNEVLKNYANIPDAEQLKLIEKLQAKQEQLTDPEQQQNARAYLIYMRKIHEVGYDFLEEETKRLLRLKAGKVTEAKKEELLRKLNILEVFRVHKVTKTAPE
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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molecule tags Chaperone
source organism Drosophila melanogaster
publication title Structural Elucidation of the Pdi-Related Chaperone Wind with the Help of Mutants.
pubmed doi rcsb
molecule keywords WINDBEUTEL PROTEIN
total genus 71
structure length 231
sequence length 231
chains with identical sequence B
ec nomenclature
pdb deposition date 2005-09-22

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF07749 ERp29 Endoplasmic reticulum protein ERp29, C-terminal domain
A PF07912 ERp29_N ERp29, N-terminal domain
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.20.1150.12 Mainly Alpha Up-down Bundle Endoplasmic reticulum protein erp29 Endoplasmic reticulum resident protein 29, C-terminal domain 2c1yA02
3.40.30.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich Glutaredoxin Glutaredoxin 2c1yA01
3GA4A 4LL1B 4TOPA 3KZQA 1TJDA 3NZNA 2CZ2A 2A4VA 3ZFLA 1THXA 3LGCA 2IIYA 5GZZB 1GSDA 5G31A 4L8EA 4ZBBA 3MSZA 3FY7A 4KX4A 5GAND 3UMAA 5CRDA 3C1SA 3EMXA 2X8HA 4POBA 1GRXA 2LJAA 1OYJA 1OC8A 5LD0A 3GKKA 2A2RA 1X5CA 2Z9SA 4OWYA 1XPVA 1FHEA 3L0HA 1TRSA 1MDIA 4V2MA 3TKQA 4ZILA 4N0ZA 5AGYA 1YEXA 5JCWA 1SD8A 3IK9A 3M1GA 3VWVA 2P5QA 1NSWA 2WGRA 1XCCA 1GUHA 1EP7A 1SKRB 4MLYA 4ID0A 3VLNA 2H19A 2K18A 2HNLA 3KMOA 3F4RA 2XBIA 2WULA 3G7YA 2CT6A 5A5KA 3DVXA 1B8XA 1HD2A 4MH2A 3DVWA 2I3YA 1EV9A 4AF2A 3MAKA 3L78A 2CQ9A 4YQMA 3H93A 2CVKA 4GQCA 5H5SA 2H74A 3MDKA 1ZYEA 1J9BA 3P7XA 5H5QA 4EKZA 4KW6A 2LJRA 3TKPA 4N10A 2HSHA 3ZFBA 1Z5YE 3L9SA 3H79A 3L9VA 2HT9A 5A4WA 2XPEA 3W8JA 3RBTA 2LJKA 3VPQA 1U87A 3ZVJD 4EE0A 2YV7A 4ILFA 4MABA 2BJXA 1KNGA 1GNEA 3ZVJA 3GYKA 1XWKA 1PX6A 1DE2A 4EC0A 3IE3A 3HJPA 1GSSA 2DJJA 5D73A 3FRCA 4GLTA 4XS6A 2C80A 3TJGA 1ERTA 2PWJA 2PBJA 4POMA 4ZIJA 4BWSA 2VCWA 2H76A 1ERWA 2WCIA 2DC5A 1GTIA 5B8BA 2V6OA 1TU7A 1MD3A 2YPMA 1V98A 2ON5A 1YZXA 4HZ2A 1TKDB 3HVXA 1TK0B 1SL2B 4QQ7A 3M3MA 5JWQB 2P0GA 1AQWA 2MMAA 3GURA 3EYTA 5ECLB 5ECHB 3ED3A 3CTGA 4F2IA 4WXTA 5F06A 4XHMA 4KGIA 1R5PA 1EGRA 2MBSA 4Q5NA 2IMDA 2GDRA 3I9V2 1YF0A 4KDUA 1JHBA 4ZBAA 1M9AA 2FD3A 2WFCA 1F3AA 5LCZA 2YCDA 4HS1A 4ULXA 1J08A 1TTZA 3HDCA 1OC9A 4XS4B 5IMFA 2H8LA 2OBIA 1E2YA 1DUGA 1R7HA 3PH9A 3PINA 1JLWA 3GH6A 3M9JA 1T1VA 5GAPD 2LS5A 4WF5A 3A2XA 4GSSA 1OVNA 3C7MA 2IMIA 13GSA 2IMEA 2H70A 2LQOA 3SBCA 1PSQA 3EU4A 3QAGA 1A2JA 4OMVA 5D9TA 5B6NA 3RAZA 4FH8A 1N2AA 2H1AA 3D6IA 22GSA 1AW9A 2R3XA 1M2AA 3FK8A 3HYPA 3CSHA 1YDKA 3GIXA 4D73B 4RI6A 2VCQA 1JZOA 3TOUA 4YQUA 1GNWA 3W6GA 10GSA 4QL9A 3HJOA 4CDOA 1GSYA 5H5RA 1XOBA 2GSSA 1FO5A 3HA9A 3KCMA 4F9ZA 2R6KA 2F51A 3O6TA 3F4TA 1A8YA 4K9ZA 1W4VA 3IHQA 5DAKA 5E59A 5IMAA 5HQPA 1VF1A 1MDJA 2VL2A 4MF5A 2JL4A 2FWGA 5ELAA 3I69A 2HZFA 3ZL5A 5ID2B 2LKUA 3CTFA 4XIHA 2IJYA 3TKSE 5DQSA 4XS1A 1QUWA 3IR4A 4K7NA 4IP6A 3I43A 6GSXA 4JR6A 1AAZA 3EVIA 2IN3A 4TKYA 3IDVA 3LXZA 1SL0B 5D9XA 5COHA 4IW9A 2H1BA 4JEDA 5JCGA 3DMLA 1TI1A 2PU9C 3DRNA 5ECKB 3KMNA 4IQAA 1V9WA 1X0RA 5J3RA 2MYGA 2WB9A 2GT5A 1RK4A 2YWMA 4IS0A 4EO3A 5JWOB 4EXJA 3CBUA 4Q5QA 1QMVA 2YJ7A 4JZQA 3AY8A 3APQA 4BL7A 3GSSA 4V2LA 1XVQA 2YV9A 5B8AA 4RQRA 1C72A 3DD3A 2JSZA 1XBSA 19GSA 1EV4A 4POKA 4NAXA 5CP1A 2CX3A 2DJ2A 3E0UA 1EWXA 5IM9A 3Q18A 1ZOFA 4ZB8A 4ZXGA 1WWJA 1B48A 3VURA 4I5QA 2H72A 2PMTA 2YN1A 2FGXA 3D4MA 2LRNA 4IP1A 3UVTA 1M0UA 1GLQA 3TGZA 2LRTA 1XWGA 3KP8A 1G6WA 1XW6A 4XTSA 5G1KA 4BVXA 1YJ6A 5AIVA 2OJLA 4DVCA 3ZMLA 4LL4B 3C1RA 4PNFA 5G1LA 2LV3A 3UIWA 2G2QA 1JZRA 1S3CA 3CSIA 1Y6EA 4TR0A 3DEXA 1BEDA 1I5GA 4DSRA 3NOFA 4O92A 3F3RA 3WGDA 3GL5A 3IC4A 2VD0A 1Z7RA 1I9DA 2H75A 2F8AA 3IOSA 4OO5A 3EWLA 3IV4A 1M99A 2KP2A 2XPDA 2DIZA 3CRTA 1XW9A 1OE7A 3IAM2 1MTCA 1OAZA 1YY7A 3LYPA 5G30A 2OE3A 2RUEA 2GZPA 3ERWA 3EC3A 4ZL9A 3FZ9A 4IVFA 4AJ6A 3DKSA 2NVLA 4L5OA 2CAIA 3K8NA 2EIRA 2B3SA 3ZLPA 1ML6A 2J9HA 1JZWA 3UOMA 2H0IA 4PNGA 5B6MA 1A0RP 1CQGA 1XVWA 4MJBA 3FHKA 2H71A 1F9MA 1CQHA 2CAQA 4GF0A 3A5WA 5JWRB 3HVVA 1K0BA 4IJ3A 3HZ8A 4I2TA 5J9CA 3D5JA 3CYNA 2GQMA 3VI5A 5GSSA 3FZ4A 3A3TA 1PKZA 1M2BA 5J4UA 4QL7A 4Q5FA 2HRNA 2R37A 3TB2A 2YNXA 1V58A 2PVQA 5KN1A 3VWUA 2VUPA 4EF0A 1TXXA 2V2GA 1LU4A 4N30A 1SK0A 2WZ9A 5CO3A 1HNAA 1Q98A 2L59A 11GSA 5F05A 2K8SA 4TVEA 5DDLA 1YQ1A 4GSTA 8GSSA 3UVHA 1V40A 1U88A 5F07A 3LEFA 5ABRA 4V1Ag 4NHWA 1QQ2A 3TOTA 1HYUA 1TI3A 2VIMA 1SYXA 2MMOA 2VCZA 1FW1A 2BMXA 16GSA 4TXOA 2YJHA 3U6VA 3KM6A 2H6XA 3PGTA 3QFAC 1VF2A 2MBTA 1SK1A 1Z7PA 1ST9A 2I1UA 4HDEA 3FYGA 1ACVA 4F82A 3ERGA 1Z9HA 5GSTA 1U6TA 2LQQA 2DSAA 1ZL9A 3VFIA 1K3LA 3KEBA 3TKSA 4NXIA 3RHBA 4V2NA 2JSYA 1AUCA 1TRUA 2GZYA 3QPMA 4IELA 4K2DA 1G7OA 5CYYA 1ZYQB 3FEUA 4ZB9A 2LTKA 1URMA 2IFQA 4YAVA 5JCUA 1WIKA 2VM2A 6GSSA 1PL1A 2H0HA 4ZL8A 3LYKA 1T4YA 2OE1A 2G0FA 3TJKA 1NM3A 5CAXA 2FWHA 2LNTA 1Z3EA 2HRFA 3MNGA 2YANA 1F6MC 4OFTA 2CZ3A 1OE8A 2K9FA 2QC7A 2C3NA 5FT3A 2JZSA 1G6YA 4N11A 1PQNA 2P31A 2QSIA 2NBSA 2JACA 2DMLA 3HVSA 1SL1B 4V1Ap 2JZTA 2M46A 1ZMAA 2LRCA 2VL2C 3GL3A 20GSA 2H6YA 2D2ZA 1BX9A 3LQ7A 5D93A 2FCHA 1XZOA 2ES7A 5KN0A 4HUAA 1X5DA 1JZDA 2IWTA 1Y25A 3FR3A 5IMZA 5IPHA 1XFLA 1QGVA 4MJEA 4L0WA 3RPNA 1THOA 4FIWA 4HU7A 3PR8A 2GSTA 5DQYA 3CMIA 5DCHA 4OO4A 2RUFA 1K0AA 4ACSA 3ZYWA 1AC1A 4MMMA 4KDXA 1PMTA 2IL3A 2DJ1A 1EEJA 3ZREA 4NHZA 3APOA 1YKAA 2N5FA 5J9BA 2B7JA 5ECNB 4J56E 1OKTA 4YH2A 4AGSA 4KSOA 2DMMA 4LA1A 1FB6A 2A2SA 2H1DA 2DJKA 3TRXA 1PN9A 3TRPA 1FOVA 1HNBA 4F0CA 2B5YA 1ZGNA 2FA8A 1SD9A 4EUYA 2C1YA 5ELGA 1EEMA 1UA5A 4KNDA 3WYWA 1GSEA 2IFQB 4G19A 2WDUA 3BCIA 3LXTA 3VPTA 1GSUA 3FR6A 2R4VA 3M9KA 5AISA 3F4SA 2PN8A 1T4ZA 4MJAA 3DIEA 4YQVA 1B9XC 1WRYA 4EDYA 5IMVA 4MA9A 1H4OA 1GH2A 2V32A 3IBHA 4XRAA 3FR9A 1KTEA 2VCVA 1K0NA 3QFBC 4ECIA 2H1GA 5ECOB 2AV4A 2EIQA 3C8EA 4TR1A 4XRDA 4BPYA 4I8BA 1IYIA 4ECCA 4MZWA 4TR3A 5L71A 2AB6A 4ML1A 1AQVA 4GXZA 1TDIA 1GULA 2WRTA 3V1WA 1FAAA 2F8FA 3LJRA 1A24A 1J0FA 2GGTA 4J2FA 3TKRA 2AAWA 1A23A 1SJIA 1GP1A 3GNJA 1R26A 2V6KA 2EC4A 3NIVA 2O7KA 2PERA 4GWRA 1SU9A 4L5LA 17GSA 2PPTA 5ENUA 5HR2A 4MP4A 4N0VA 1VF4A 2X99A 1NHYA 1LJRA 1S3DA 3FZAA 4HU9A 3GH9A 2L5LA 2ON7A 3TRQA 3VWWA 1O7UA 1TU8A 1OC9B 2K6VA 4HI7A 1AXDA 1XWAA 2VL9A 1HQOA 6GSTA 2CX4A 3HCZA 4XCSA 2I81A 4WBJA 4IN0A 3S9FA 1JLVA 4I97A 2RM5A 5C00A 3BD2A 1B4QA 1T00A 2O87A 2AYTA 2IMFA 1EZKA 4G10A 4OFNA 4PQ1A 4MZBA 2N5BA 2X64A 5D9WA 2OA7A 4PQIA 3KD0A 4MH3A 1TK8B 4O5RA 2H73A 3IXRA 2GQLA 1FVJA 1KBNA 12GSA 2ZNMA 3D21A 4OCEA 2YP6A 2RM6A 3WGEA 3BBYA 3HD5A 4KH7A 1F3BA 3QOUA 2JADA 3F3QA 1ON4A 2L4QA 3VI7A 4MZCA 3LFLA 2I4AA 4HZ4A 5DAKB 2NDOA 2QGVA 1SKSB 2JU5A 3GHAA 5DJLA 4HEA2 3R2QA 5ECMB 2B6MA 2AJQB 1NW2A 5ECSA 1B9YC 1BQ7A 1WPIA 3VK9A 3UEMA 1WE0A 3KXOA 2KOKA 1DBYA 3F9UA 3IPZA 3RHCA 5E4WA 4HJ2A 2L57A 5J41A 5HFKA 2VOCA 3RPPA 5AIXA 3TKSC 5CNWA 5D9VA 3JCML 1GTAA 1G7DA 4IGJA 4K6XA 1GTBA 4TW5A 3GSTA 1GUKA 2O89A 3QMXA 1XOAA 2OACA 2ZUPA 3G7IA 3U5RE 1PKWA 3QAVA 1R4WA 1KEBA 5C04A 2LUSA 3P8WA 2H66A 5IMCA 2M66A 1UN2A 1EP8A 3EURA 4DSSA 3Q74A 5A4VA 3QCPA 4J57E 2IPAA 3FZ5A 3IAS2 1SJZA 2ZCTA 3UBKA 3ERFA 2VLTA 3F63A 4IHUA 2VCXA 2VO4A 4KA0A 1BAYA 1R5AA 3MWHA 6GSVA 3EMPA 4IJIA 4LMVA 3GMFA 1X9MB 5HR0A 2VAFA 5ECIB 1E6BA 2GT6A 2RIIA 2KLXA 2HSYA 2RLIA 4MCUA 4FYBA 1Q4JA 5A4UA 3H4KA 3O76A 1K3YA 4RI7A 2OADA 1K0MA 3GTUA 4E8HA 1X9SB 3ZIVA 1TOFA 4Q5RA 1O8WA 4EDZA 6GSWA 3A2WA 2MZCA 3ZZXA 2MMZA 2GQKA 4I2UA 1ZZYA 3L9UA 4JRRA 1WOUA 3G9BA 3M0FA 4PUAA 3HHVA 4CW9A 2YWNA 1UVZA 4DEJA 5KN2A 3GKMA 2AHEA 1YKCA 2C0EA 1WJKA 1N8JA 2QKEA 3UAPA 1A2LA 2YZHA 1ZCPA 3DGQA 4DSQA 2GS3A 2V1MA 2M72A 4JE1A 4KAEA 1B4PA 4KDYA 3KJYA 5IO2A 3GV1A 2E7PA 2KP1A 1PX7A 3Q6OA 1QK8A 2XC2A 1T7PB 2B5EA 4XS4A 4MPFA 2GSQA 4NV5A 1K0CA 3BOAA 2FNOA 1T8EB 18GSA 3TUEA 2L6DA 2HLSA 3UJ1A 1EGOA 2B1KA 1SKWB 2O85A 1XWBA 1S3AA 4IQ1A 1XIYA 2YZUA 1SYRA 3UBLA 5B7CA 2FA4A 5DBQA 3GUSA 3KH7A 4JBBA 1BG5A 4WR4A 3KTLA 1DSBA 1G7EA 2FLSA 2O8VB 4TRXA 2V41A 5ECPB 4BA7A 5KN3A 3ME7A 1A8LA 4OD7A 4WR5A 1MDKA 3ZTLA 4LLRA 1ERVA 3A2VA 4MF6A 4D73A 4G2EA 3EU3A 1TW9A 4JR4A 2VM1A 4DSSB 1PL2A 3P2AA 3ZITA 3KP9A 3LWAA 2KUCA 3TCOA 4GQFA 2GSRA 3VWXA 3D0ZA 3IA1A 2VCTA 3J7Yb 5INYA 1GSFA 5G5EA 5IOWA 2C3TA 3M8NA 2H01A 1H75A 3APSA 1W89A 2R2JA 3DYRA 4GTUA 4I6XA 4K0GA 2E2MA 6GSUA 3TJBA 1BYEA 4WEYA 1NHOA 2C0GA 3GTUB 5ID2A 2GVPA 14GSA 1QFNA 3C71A 1SK2A 2R5GA 2F3MA 3WT1A 3N9JA 2AUVA 4FYUA 4RQXA 3W8SA 3DXBA 4PGTA 1GSQA 1EOHA 1GUMA 1YF1A 5DJMA 4CHSA 3KH9A 1GWCA 1OC3A 3KGKA 3O3TA 2JZRA 2K8VA 3F8UA 1O6JA 4TXOB 4WETA 2E0QA 5DALA 4MJCA 3E9JB 1VRSD 2FWFA 1FVKA 5DVBA 4X43A 4K8MA 1EOGA 4O32A 3HY2A 4X0XA 1M9BA 2XHFA 4H86A 5CRHA 2FWEA 3IK7A 3CXGA 3GX8A 4Z7XA 5CRGA 3DWVA 4K1FA 5CREA 4POLA 1K3OA 4PQHA 1TRVA 5HR1A 2YWOA 3HXSA 4HOJA 5FHIA 5IOXA 3N5OA 2NPBA 3TJJA 2HZEA 5IQYA 2PUKC 3ISOA 1Z6NA 2BTOT 3C73A 3D22A 5J5NA 2LNSA 2VLUA 2C8UA 4BWQA 3F6DA 4KCEA 2H6ZA 4ML6A 1X5EA 2KHPA 4NV2A 1O73A 3GKNA 5DCGA 1F2EA 2FHEA 1XWCA 1USBA 7GSSA 4HJMA 2C3QA 5EY6A 3BCKA 2VLVA 1VGLA 5ECQB 4IBPA 2HFDA 2WJUA 1PRXA 4NMUA 3TDGA 5ECRB 2H0GA 4WKWA 1M2DA 1TP9A 4MDCA 1M7TA 4L0UA 2E2GA 4ISDA 5EL8A 3QR6A 1QXHA 4BVYA 4PUFC 1GL8A 4FO5A 2F9SA 3EE2A 4PXOA 4EVMA 4X1UA 4YAPA 4F03A 3F6FA 1JFUA 5HFGA 3ME8A 2I9HA 2TRCP 5HFIA 2EIOA 1VF3A 3GFKA 1BJXA 3F0IA 3ZIJA 4G9HA 4K7OA 3H1NA 4KE3A 4E8EA 2WS2A 4ZB6A 4LMWA 9GSSA 2LEGA 2M80A 2DJ3A 3GKXA 4NWYA 4OFMA 1U3IA 1K0OA 3UARA 1F37A 1WMJA 3H8QA 1FG4A 2YWIA 2FY6A 2PGTA 1A0FA 2X8CA 2TRXA 2P5RA 5IO0A 3J7Yk 5LNKe 1OKDA 6GSYA 2CV4A 1ABAA 5FWGA 3LORA 2HE3A 1O8XA 2OKAA 5CRWA 5DALB 1RQMA 4HQSA 1SENA 3IRAA 1WP0A 1TK5B 2MMNA 4K7IA 1MEKA 3WT2A 2DBCA 3FKFA 1ILOA 2VL3A 4HQZA 3WD6A 3CSJA 1X9WB 2C0DA 3HZ4A 3KIJA 2ALBA 4PX1A 4IKHA 5KEJA 4OCFA 5AN1A 2DIYA 3HJMA 1AQXA 1PD21 2GZZA 2PVOC 2XBQA 2B7KA 1RW1A 1PA3A 2HZEB 2REMA 4KCAA 5D96A 2CVBA 3GN3A 1G0TA 2IMKA 2L4CA 3ZMKA 1TRWA 3CRUA 1XXUA 1FB0A 5EVOA 1K0DA 5G2ZA 4K0NA 3D4TA 4AJ7A 1LBKA 5D8IA 2B1LA 2J23A 2C4JA 1MD4A 4TXVA 5F8BA 4ZL7A 4NPBA 5F0GA 5EPFA 1O81A 3HKRA 2H30A 4ECJA 3TJFA 1XW5A 3GRXA 2B5XA 4GSNA 4KUNA 3L4NA 3Q19A 1A2MA 2L5OA 2N5AA 2OE0A 1SJ6A 2YOIA 3E3EA 2HI7A 4KB3A 4TR4A 3LSZA 3QDNA 2GTUA 3OR5A 4TR1B 1GLPA 3QAWA 1YEPA 4P3YB 4FYCA 4WF4A 3KTBA 2FUG2 4ECBA 5HR3A 2X8GA 3RDWA 2DJ0A 4F0BA 4PURA 3BJ5A 2CVDA 1Z6MA 4O7HA 3WGXA 2DLXA 2NTOA 2HYXA 3P90A 4JU5A 3UL3A 3LG6A 3EINA 3G7JA 1DE1A 4RUVA 4GCIA 4AJ8A 2OBKA 5IPGA 2C0FA 2CA8A 1V57A 1T3BA 1PGTA 4MPGA 4TN8A 4MK3A 2GLRA 1U3AA 4EL1A 1ERUA 1V2AA 1HNCA 4GRFA 2HXKA 3I6AA 3FW2A 1AIUA 5IIZA 4ZBDA 4KSMA 1GTUA 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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#similar chains, but unknotted
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#similar chains in the pdb database (?% sequence similarity)
...loading similar chains, please wait...
How to cite