2LNTA

Solution structure of e60a mutant agr2
Total Genus 20
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
20
sequence length
140
structure length
140
Chain Sequence
b'IDPFTPQTLSRGWGDQLIWTQTYEAALYKSKTSNKPLMIIHHLDECPHSQALKKVFAENKEIQKLAEQFVLLNLVYETTDKHLSPDGQYVPRIMFVDPSLTVRADITGRYSNRLYAYEPADTALLLDNMKKALKLLKTEL'
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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publication title Metastasis-promoting anterior gradient 2 protein has a dimeric thioredoxin fold structure and a role in cell adhesion.
pubmed doi rcsb
molecule keywords Anterior gradient protein 2 homolog
source organism Homo sapiens
molecule tags Cell adhesion
total genus 20
structure length 140
sequence length 140
ec nomenclature
pdb deposition date 2012-01-04

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF13899 Thioredoxin_7 Thioredoxin-like
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.30.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich Glutaredoxin Glutaredoxin 2lntA00
3D4TA 2TRCP 2YCDA 5KN1A 4HU7A 5IIZA 2HRNA 3FEUA 5DAKB 1CQGA 2WFCA 4YQUA 2TIRA 1ERTA 3O3TA 1TW9A 2L57A 3DWVA 2OJLA 2NTOA 4BL7A 1GUMA 3FKFA 2I3YA 3IR4A 1U6TA 3TRPA 3A5WA 1OC9B 2D2ZA 1B4QA 3IV4A 3C8EA 5ECPB 4KCAA 3EINA 2MMOA 1T4ZA 2LV3A 1PL1A 3GX0A 2FUG2 3HYPA 1SJZA 3IPZA 4E8HA 1M99A 2F3MA 4LLRA 4MK3A 5G5EA 3QMXA 3F4TA 4RQXA 3LYKA 4PNGA 2OBKA 3HJOA 3G7YA 5G5FA 5DJLA 4ULXA 2FWFA 1Z5YE 2E2MA 4JR6A 4OWYA 1RW1A 2GTUA 3RHCA 3UL3A 3FR6A 5AIVA 3J7Yb 1PN9A 4IP1A 1FHEA 3UJ1A 1T7PB 1TK5B 3OR5A 3ISOA 4CW9A 3GRXA 2WJUA 4J2FA 3QAWA 5G1KA 6GSUA 4TKYA 1FB0A 5A5KA 2DJ2A 4WR4A 3TJBA 5F06A 4GSSA 1V2AA 4G19A 4EC0A 4WF4A 1EV9A 1V9WA 2VL9A 1G7OA 1GSEA 4IJ3A 2YWMA 3GIXA 3GN3A 2O8VB 1ZCPA 4LMVA 6GSSA 2B5EA 3M1GA 2IMKA 4TR1A 4MPFA 3TDGA 2JSZA 3UMAA 1HNCA 3EYTA 2HXKA 4GWRA 1TK8B 2IMDA 2BMXA 2B3SA 3VWXA 3FZ9A 3CBUA 1HQOA 2C8UA 3C71A 4ECCA 5B8BA 1TKDB 4FO5A 5E4WA 5DJMA 7GSSA 2J9HA 3K8NA 2OE0A 4OFNA 3ZRDA 1PSQA 5J4UA 5H5QA 1PGTA 2DJ0A 1NW2A 1TRUA 1NHYA 1WIKA 3IE3A 3DD3A 1YEXA 3C7MA 1SYRA 3PINA 1WE0A 4XS6A 1R7HA 4Q5FA 1QMVA 2BJXA 1X5CA 1FO5A 5KEJA 2ON7A 1XFLA 1Q4JA 3KH9A 4JBBA 3GMFA 2GDRA 3VWWA 3A2WA 1GTUA 4KAEA 2ZUPA 4PQHA 1Z3EA 4V2NA 3US3A 5EY6A 2YWNA 4K2DA 2OE3A 2DJKA 5IOXA 3GX8A 4HOJA 3JCML 3S9FA 2HRFA 1K0DA 3LG6A 4MF7A 4BA7A 4MZCA 4WBJA 6GSWA 4KCEA 2HLSA 2LNSA 5J5NA 2O89A 3HKRA 4IP6A 5KN3A 3KJYA 2L4QA 1HNBA 5ECMB 2VAFA 3D0ZA 1M0UA 5COHA 2WS2A 4ML1A 2H30A 2L6CA 4K0NA 1VF3A 2FA4A 3DEXA 3GA4A 4XS1A 5LNKe 2H8LA 1GRXA 3IC4A 2J23A 2WZ9A 1WRYA 3L9VA 2CAIA 4QL7A 2NVLA 5FHIA 5D9VA 1GTIA 3ERFA 3W8SA 3F4SA 1B8XA 1A2MA 6GSVA 2AUVA 2V41A 1ZYEA 2R6KA 1TI3A 2DIZA 4MMMA 4MLYA 3CTGA 1YJ6A 2LSTA 1HYUA 1ZZYA 3TOTA 4OCEA 1GLPA 3TB2A 3RDWA 3O6TA 3GKNA 2YZHA 4PX1A 3MDKA 2QC7A 5JWOB 4E8EA 1GNEA 2F8AA 3KTLA 4HJ2A 3SWLA 4KE3A 1U88A 5ABRA 1X9SB 1MD4A 2LRTA 3ZFBA 3BCKA 1GP1A 2H01A 5F8BA 2C0GA 1PKWA 5HQPA 4OO5A 3L9SA 5F05A 4ECIA 4MA9A 5G1LA 1YF0A 3EC3A 4POLA 1SL2B 2MMAA 1QFNA 2B6MA 3KM6A 4IQAA 4FYUA 4ISDA 4G10A 2XHFA 2GSSA 3TOUA 3D6IA 1WPIA 4POBA 2LQOA 1SKRB 4POKA 4XS4B 2IMFA 3ZLPA 2F51A 4EDYA 4ZXGA 3TGZA 3TKPA 3GH9A 1OAZA 4XCSA 3GHAA 2H1BA 3D5JA 1X9MB 4QL9A 1TP9A 4F0BA 3ZIJA 3HJMA 3WD6A 2YANA 4XHMA 2H1GA 5IMVA 2FWGA 2L5OA 5IMDA 2A4VA 4BWSA 2LRNA 1IYIA 3M0FA 3GL5A 4IJIA 5DVBA 5B6NA 2I9HA 3A2VA 3LWAA 3M9KA 5IMCA 1ZGNA 4NMUA 2M72A 3FY7A 1XWBA 4WEYA 1GLQA 5HFKA 3ZMKA 5ENUA 1EGRA 2HZFA 4AJ8A 1MDKA 2H75A 1AQXA 3FYGA 2CVDA 3Q19A 2YWIA 4EL1A 3KH7A 1GTBA 2H66A 1TDIA 1K0CA 5ECRB 4FIWA 4XIHA 3HY2A 4TW5A 1LBKA 4N10A 1SD8A 4WF5A 3D4MA 1U3AA 1B4PA 1T3BA 2PPTA 4GRFA 4TR4A 1AXDA 1B9YC 1URMA 2PVQA 5ECOB 1GSYA 1T00A 4P3YB 2R5GA 2H19A 5JCGA 1T4YA 1TU8A 3AY8A 2R37A 2P31A 2VCTA 3KMOA 4ECBA 3UOMA 2R4VA 2MMNA 4ZBBA 4K7IA 18GSA 1KEBA 2RIIA 3L78A 4ZBDA 5EPFA 3A3TA 1N2AA 14GSA 2KOKA 2L59A 2WCIA 1GWCA 2MBSA 3Q18A 4EUYA 1TTZA 1QUWA 3GL3A 1SKSB 5DAKA 1S3DA 1XW9A 2C3QA 3O76A 20GSA 2ZCTA 2VD0A 1XWGA 2H1DA 2MYGA 2FWHA 4CDOA 4MJCA 1SYXA 3TRXA 3GTUA 1TRSA 4ZB8A 2VLUA 4ECJA 1U3IA 5IMZA 1OYJA 5DDLA 4J57E 3N9JA 4WKWA 2H74A 1PL2A 3CSJA 1E2YA 3IK9A 4KW6A 4GF0A 2CX4A 2P5QA 5CNWA 3FR3A 4PNFA 3HD5A 3E9JB 4HZ4A 3ZL5A 1WP0A 3H8QA 1EV4A 2RUEA 3VI7A 2O7KA 1M2AA 4PGTA 4PXOA 2G2QA 4AJ6A 2HT9A 2M46A 2A2SA 3GTUB 1PRXA 2FGXA 5AN1A 2PWJA 2R3XA 1ZOFA 4F2IA 5INYA 1LJRA 4MJBA 3F6FA 3LFLA 4Q5RA 2DJJA 5CRWA 5DCGA 2JZRA 5HFIA 4KGIA 4MH2A 1FVJA 2E7PA 2KHPA 1RQMA 1SK1A 1A8LA 3SBCA 4TR0A 2H71A 3TJKA 1GTAA 4MH3A 2GLRA 3ME8A 3HXSA 3RAZA 1HD2A 3TRQA 3GSTA 3VWUA 4ZILA 3UVTA 1A2JA 3UBLA 2DMLA 4KB3A 2VLTA 2IL3A 1XWKA 2JACA 4GCIA 4MZWA 2PGTA 1FOVA 1CQHA 2FNOA 2VM1A 1MTCA 2C0EA 1O85A 2OE1A 4LMWA 10GSA 5J41A 4IN0A 3VPTA 2AHEA 1O6JA 3DIEA 4WETA 2E2GA 11GSA 4HDEA 3DMLA 3HVVA 2LRCA 2P5RA 4MZBA 1FW1A 4EF0A 1XCCA 4HQSA 3QAVA 1WWJA 1GUHA 4GTUA 2GGTA 3G9BA 2XPEA 4K8MA 1N8JA 1MDIA 2Z9SA 1AQVA 2X64A 4V1Ag 3TJJA 2OKAA 2B1KA 3GFKA 5ECKB 4JR4A 3ZZXA 4EO3A 3LYPA 1SJIA 1X9WB 1LU4A 1F3BA 3VK9A 1ACVA 3FK8A 4FYCA 4TVEA 3ME7A 1PX7A 1AIUA 3KEBA 3ZITA 3BJ5A 3TCOA 2VOCA 3DVXA 3F3RA 5HR2A 2XC2A 4OFMA 4K0GA 5AGYA 5DQYA 3PGTA 1QK8A 2DMMA 1SL1B 2HSYA 4I6XA 2VCZA 3UBKA 1IYHA 1A23A 5IPHA 3UARA 3CSIA 5HFGA 4F9ZA 3DGQA 3V1WA 4IW9A 4ZB6A 2CZ3A 1R5AA 2OBIA 2FHEA 2HNLA 1MEKA 1ERWA 5H5RA 2LNTA 4GSTA 1MD3A 1T1VA 5IMFA 1M2BA 2EC4A 3E0UA 4JZQA 4O7HA 4BVXA 3KP8A 1BEDA 1QGVA 1TRWA 4O5RA 5D93A 3H4KA 4DEJA 1VGLA 1BG5A 2FA8A 4L0WA 3QCPA 5J9CA 2AAWA 4O32A 3WGXA 3CYNA 4ZL7A 1OC3A 2KLXA 4MCUA 1W4VA 2AYTA 3IRAA 2B7JA 3I9V2 1QXHA 3DYRA 4HEA2 1BAYA 2GSQA 3KCMA 2LJRA 2PERA 3EU4A 3H79A 5J9BA 3M9JA 2FD3A 4FYBA 2V32A 2YOIA 5KN0A 2XPDA 16GSA 1K3LA 5DQSA 1VF4A 1B48A 2B5YA 3HZ8A 2CAQA 1O8XA 5HR3A 4F03A 1GSSA 1A0FA 1YZXA 4ACSA 5CO3A 1Z6MA 3EU3A 2E0QA 4NV5A 5J3RA 4LA1A 4JEDA 4EDZA 4K7NA 3KGKA 3HJPA 1DBYA 3F4RA 2YV7A 3Q74A 5ECQB 1AC1A 1ZL9A 2IPAA 5GSTA 1F3AA 5IPGA 4K7OA 4I8BA 4YQVA 4GXZA 2XBQA 2TRXA 3N5OA 2JADA 5D9TA 3ERWA 3ZTLA 3C1RA 3J7Yk 2H6ZA 2IFQA 4KUNA 2YP6A 1M9AA 2YPMA 3NIVA 4KDXA 1TI1A 5CYYA 2IWTA 2VCWA 4MJAA 2OACA 4ZL9A 2V6OA 1HNAA 2VCQA 3WT1A 2KUCA 4XS4A 4ML6A 2LKUA 5F0GA 5HR1A 4NWYA 4J56E 1R26A 1H75A 1GL8A 1ERUA 1JLWA 1R5PA 1XBSA 4MPGA 3W8JA 5CRGA 5CAXA 3F9UA 1DE2A 1XW5A 1WMJA 3F8UA 5C00A 4ZIJA 1DSBA 1K3YA 1UC7A 2LEGA 3MSZA 4TOPA 4RQRA 4Z7XA 1A2LA 2IFQB 13GSA 5DBQA 1UA5A 2MBTA 2K18A 3RHBA 4I2TA 2DJ1A 5IM9A 5JCWA 1YDKA 1OKTA 5E59A 1TRVA 5GSSA 4OD7A 1DUGA 1JLVA 3BBYA 1W89A 2H70A 1Y25A 1K0BA 1FG4A 3FZ4A 5FT3A 3D22A 2LJKA 3U6VA 4DSQA 3EWLA 4V1Ap 4HUAA 3MAKA 4XRDA 3LJRA 2VM2A 4L0UA 4KSMA 4K6XA 5D73A 2LTKA 4FH8A 2VL2A 5LD0A 5B8AA 3BD2A 2ALBA 2LS5A 3MNGA 4I2UA 2PMTA 3QDNA 2CX3A 1R4WA 5FWGA 2X8GA 2GT5A 2IN3A 1YQ1A 3VPQA 5ECLB 1EZKA 2N5FA 1YY7A 2DIYA 2WULA 12GSA 4KA0A 1O81A 4IS0A 2PN8A 3PR8A 4WXTA 2DLXA 2GQMA 4NV2A 2YNXA 3UIWA 3C73A 3QR6A 1K0AA 3HDCA 3TJFA 2XBIA 4G2EA 3TJGA 3VFIA 9GSSA 3GUSA 4GQCA 3H93A 1OE8A 1XWCA 1BJXA 2VUPA 3HHVA 3GKXA 4JE1A 3IAS2 2JL4A 1U87A 3CXGA 2CVKA 1PMTA 3KIJA 4BVYA 4ID0A 4IELA 3L0HA 1K0MA 3EURA 2O85A 3FRCA 3FZ5A 1V98A 2IIYA 5JWRB 1O7UA 5AISA 2RUFA 1GSQA 3NZNA 1J9BA 3LSZA 3WYWA 3I69A 4GLTA 4X0XA 1PX6A 3FZAA 3E3EA 2GQLA 4PQ1A 1Z9HA 3ZYWA 6GSTA 1JHBA 3BCIA 2HI7A 3MWHA 1XOBA 2VL2C 2C3NA 2GSTA 5GAND 1F37A 2C1YA 1F2EA 4ILFA 4GQFA 2QSIA 4HU9A 2RM5A 4YAVA 1DE1A 2IMIA 1XZOA 1EWXA 3FR9A 2DJ3A 4MABA 2GVPA 4BPYA 3IHQA 1M7TA 1YEPA 1GSFA 3LGCA 3LXZA 2K8SA 2L5LA 3DKSA 4IGJA 4KDYA 3GKKA 1KTEA 3ZVJA 1NSWA 4PURA 4BWQA 3VI5A 4L8EA 4NPBA 2OA7A 2GQKA 1BQ7A 4V2MA 2VO4A 4V2LA 5JWQB 1C72A 3ZFLA 3F6DA 4POMA 4PQIA 1GUKA 1VF2A 2R2JA 1VF1A 2AV4A 4DSSA 4ZL8A 3RBTA 5IO0A 4X43A 5D9XA 5CRDA 2N5AA 1USBA 2CZ2A 2NDOA 1SENA 1A0RP 3M3MA 4OCFA 4MF5A 1EP7A 2EIOA 3P2AA 4TN8A 1EOGA 2GZZA 4JU5A 2A2RA 1OKDA 1Z7PA 1YKAA 2VCVA 2K9FA 3GH6A 4EXJA 4N11A 3HCZA 2M80A 3FHKA 1FB6A 2BTOT 2IMEA 1ABAA 2K8VA 3KTBA 5IQYA 3P8WA 3TKSE 5G2ZA 5CRHA 3F63A 4DSSB 1YKCA 2GZYA 3UEMA 1J0FA 1JZRA 1S3AA 3ZREA 2PBJA 4YAPA 2JSYA 2WDUA 3L4NA 3I43A 4H86A 17GSA 4YQMA 1XVQA 1OE7A 3ED3A 3CRTA 1Z7RA 2ES7A 2N5BA 2AJQB 1I9DA 2NBSA 2K6VA 2ON5A 5EL8A 1YF1A 1TU7A 1PD21 1MDJA 4WR5A 5EVOA 2I4AA 4IHUA 4AGSA 1ON4A 2C0FA 4D73A 2RLIA 4TR3A 3U5RE 2OADA 1AUCA 4HS1A 2C4JA 1JZDA 2V6KA 1K0OA 2MMZA 3QAGA 3IAM2 4I97A 5ECHB 2HYXA 1F6MC 5ECSA 4RI7A 3LORA 2YWOA 3KD0A 1EGOA 3R2QA 3G7JA 5CREA 1Z6NA 1O73A 3TKSA 4NAXA 2YV9A 4NXIA 5A4UA 1WOUA 1XXUA 2H0HA 2GS3A 4DSRA 2FWEA 3C1SA 2V1MA 3ZMLA 2CVBA 4IVFA 4XTSA 4TXOA 1PKZA 5DALA 5ID2A 2GSRA 3GURA 2LUSA 4D73B 4PUAA 4HQZA 1EEMA 4G9HA 5F07A 1S3CA 3VURA 1K3OA 4MF6A 1V58A 2X99A 2CQ9A 4TR1B 1FAAA 2YN1A 2CA8A 5IMAA 5JCUA 5L71A 3APOA 1A8YA 1TOFA 5A4VA 1SL0B 2H6XA 4OO4A 2PVOC 1PQNA 3QOUA 4OFTA 2O87A 3WT2A 1GNWA 1ML6A 4TXOB 2B5XA 5DALB 5ID2B 1V57A 4L5OA 1X0RA 2VCXA 1M2DA 1SU9A 1UN2A 22GSA 4RI6A 4LL1B 1XWAA 2CV4A 4K9ZA 19GSA 2LQQA 4YH2A 4ZBAA 4ZB9A 5IOWA 1AAZA 2H6YA 2X8CA 2RM6A 3APSA 2ZNMA 4KNDA 1KNGA 3GSSA 4XRAA 1X5DA 5DCHA 2C3TA 4EVMA 3G7IA 2FY6A 2VIMA 3EMXA 3HVXA 8GSSA 3GNJA 1T8EB 5B7CA 4TRXA 4K1FA 4EKZA 2I81A 2H73A 3UVHA 2JZTA 3KXOA 2WGRA 3TKSC 2G0FA 1Y6EA 4Q5QA 1WJKA 2L4CA 2LJAA 1G6YA 1H4OA 3M8NA 2QGVA 3WGDA 3QFBC 3WGEA 3KP9A 1KBNA 1GULA 3NOFA 2H72A 4NHZA 2JU5A 2FLSA 3IOSA 1XW6A 3L9UA 2VL3A 2IJYA 2C0DA 4TXVA 1SD9A 3F3QA 3KMNA 3GYKA 2JZSA 4N0ZA 5LCZA 3ZVJD 3HVSA 1THXA 3W6GA 3CTFA 4KX4A 5B6MA 1ST9A 1SK2A 1A24A 3LEFA 3I6AA 2H1AA 4IKHA 4OMVA 1XPVA 1XOAA 5A4WA 2P0GA 3TUEA 1EOHA 3BOAA 4L5LA 4WBRD 4N0VA 4MP4A 3P7XA 4IBPA 3ERGA 5D9WA 3QPMA 5AIXA 1SKWB 1ERVA 4QQ7A 1O8WA 1JFUA 5CP1A 1B9XC 1FVKA 2C80A 3D21A 2YZUA 3DRNA 1E6BA 2V2GA 2WRTA 2REMA 2MZCA 2B1LA 2EIQA 2FCHA 5ELAA 4DVCA 1JZWA 2VLVA 5D8IA 3LXTA 4HZ2A 1G6WA 1X5EA 2QKEA 2EIRA 6GSXA 4LL4B 3VWVA 2PUKC 2L6DA 4Q5NA 1G0TA 2HZEA 3FW2A 5ECNB 3DVWA 4JRRA 1M9BA 4I5QA 5G30A 5GAPD 3APQA 1OVNA 3TKQA 3IK7A 2DSAA 5GZZB 3KZQA 1EP8A 3A2XA 1GSDA 1BYEA 3RPNA 1Q98A 1UVZA 4AF2A 1SK0A 1I5GA 1V40A 2HSHA 4X1UA 4EE0A 3UAPA 1GSUA 5IO2A 3DXBA 2AB6A 2H0GA 3CSHA 2H0IA 4KDUA 2HFDA 3GKMA 1BX9A 3IBHA 1AQWA 1RK4A 1XVWA 2DC5A 3CRUA 4HJMA 2KP1A 1NHOA 2HZEB 4CHSA 4KSOA 2B7KA 1VRSD 3PH9A 4RUVA 1AW9A 4KH7A 1G7EA 1QQ2A 5ELGA 2PU9C 3F0IA 1ZYQB 3ZIVA 2F9SA 4F0CA 1THOA 3HZ4A 2X8HA 3LQ7A 2GT6A 1ILOA 4O92A 2HE3A 3HA9A 5G31A 1NM3A 1TJDA 3GV1A 3QFAC 1OC8A 3EE2A 2DBCA 4PUFC 4NHWA 4MJEA 2YJHA 4IQ1A 2NPBA 3P90A 3IA1A 4GSNA 5KN2A 1EEJA 3IDVA 5D96A 1J08A 3Q6OA 2GZPA 3VLNA 3H1NA 4MDCA 4N30A 1GH2A 5C04A 2WB9A 2CT6A 1JZOA 3RPPA 2KP2A 3TKRA 1K0NA 6GSYA 3EMPA 3CMIA 2YJ7A 1SJ6A 1XIYA 4AJ7A 2VD1A 1TK0B 1F9MA 1OC9A 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chains in the Genus database with same CATH superfamily
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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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