1FOVA

Glutaredoxin 3 from escherichia coli in the fully oxidized form
Total Genus 26
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
26
sequence length
82
structure length
82
Chain Sequence
ANVEIYTKETCPYCHRAKALLSSKGVSFQELPIDGNAAKREEMIKRSGRTTVPQIFIDAQHIGGYDDLYALDARGGLDPLLK
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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publication title NMR structure of oxidized glutaredoxin 3 from Escherichia coli.
pubmed doi rcsb
molecule keywords GLUTAREDOXIN 3
molecule tags Electron transport
source organism Escherichia coli
total genus 26
structure length 82
sequence length 82
ec nomenclature
pdb deposition date 2000-08-29

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00462 Glutaredoxin Glutaredoxin
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.30.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich Glutaredoxin Glutaredoxin 1fovA00
3ISOA 4V1Ag 1DE2A 5G1LA 1FB6A 1SJZA 1SK1A 1U87A 2B1LA 5HFIA 3Q18A 3HJOA 1URMA 1EV9A 2I1UA 2TRCP 1FAAA 2HZEA 2FWGA 2L59A 1F9MA 2YJHA 4GQFA 2H0GA 2HXKA 2HSHA 3LG6A 3WT1A 1HQOA 1KTEA 1MDKA 4KSMA 2JZRA 2HLSA 3SWLA 3HKRA 2CAIA 4K0GA 2BJXA 1Z7PA 4EKZA 2HNLA 1GP1A 4V1Ap 5G1KA 4ECIA 4QQ7A 3UJ1A 3KM6A 3IDVA 2C0EA 1OYJA 2D2ZA 3CRUA 5D9WA 4IQ1A 5G5EA 1ZYQB 4HZ4A 1XVQA 2JACA 4BPYA 3L9VA 1DUGA 1EP8A 4Q5RA 1U88A 5D93A 1ERWA 2C3NA 1THXA 4EF0A 4TXVA 3UEMA 2C0GA 4K1FA 2X99A 5ECMB 3ZLPA 3TKSC 2CX3A 1YEPA 4F9ZA 3F8UA 6GSSA 1SD8A 4I8BA 4FYCA 4RQXA 1PX6A 2FNOA 3I69A 2RUEA 3EE2A 1FOVA 1SJIA 3WYWA 1S3CA 5J5NA 3LSZA 4GTUA 4LMVA 3N5OA 2DMMA 5KN1A 2WDUA 3E0UA 1M7TA 2H74A 3GKNA 2DC5A 1V40A 3P7XA 2EIQA 5CRHA 1WOUA 2R37A 2FUG2 4NPBA 2DBCA 1K0DA 2H30A 4X43A 1XWKA 3ZVJD 2GSSA 5JWQB 2HYXA 1F6MC 1ZGNA 2XBQA 1TI1A 1B4QA 4LA1A 3A2WA 3M1GA 3HY2A 3TRXA 3QFAC 2IWTA 4WKWA 3KXOA 4TOPA 3DEXA 1X9WB 2VD1A 4N10A 2GS3A 4OWYA 2I3YA 3M9JA 5CRDA 3FY7A 5ELAA 1E6BA 2YN1A 3HZ8A 3F3RA 1RQMA 1SL1B 2LTKA 1K0OA 3VI5A 2M72A 2GQMA 3WT2A 4IKHA 4XRAA 1YKCA 3FR6A 4OFTA 1J9BA 5F06A 3C7MA 2QKEA 1AXDA 5JCGA 4V2MA 2MZCA 3GKKA 4MP4A 1BQ7A 4MH2A 3V1WA 5IO2A 3DWVA 3HHVA 3F3QA 4D73B 1JLWA 2GSQA 2VCXA 3QMXA 3KH7A 3LQ7A 5LD0A 3ZITA 2N5BA 4G9HA 2PWJA 4FYUA 3RAZA 2VCWA 2GT5A 4NWYA 1M2DA 3ZYWA 4OCEA 2GQLA 5G30A 2C8UA 3RHBA 2VO4A 2K8SA 3O6TA 5DJLA 1TRVA 1A2MA 2P5RA 1QMVA 3H93A 2AB6A 3CXGA 2FHEA 2YOIA 1X9MB 3UL3A 4XCSA 5GZZB 1TXXA 2B1KA 2MMAA 2M80A 4ZB8A 2LRTA 1W4VA 1XXUA 1TOFA 5DCGA 1TDIA 1GWCA 4MJBA 4IGJA 2C4JA 1TP9A 4K2DA 1XOAA 2QC7A 1XIYA 1S3AA 1JFUA 4GSTA 3KTBA 4WBJA 1OE7A 1A23A 1R5AA 3VI7A 3AY8A 3QOUA 4JEDA 1XVWA 4KCAA 5IMVA 1PSQA 5HFKA 1VF4A 1VF2A 4ILFA 2IMEA 1AAZA 1K3YA 2I9HA 1XOBA 4TN8A 3QPMA 4LL1B 4BWQA 3PINA 2DIZA 3DVXA 3IV4A 3ZMLA 3CMIA 1NHOA 1M9AA 4ZIJA 1Z7RA 4IS0A 3US3A 2C0FA 3EWLA 4P3YB 1B9XC 3U5RE 3LFLA 1TJDA 4BA7A 4MJCA 6GSWA 5D96A 3DKSA 5G5FA 4WXTA 1SKSB 3F6FA 4HEA2 5A5KA 3ME7A 3TGZA 3CSJA 2HT9A 1ML6A 3D6IA 4OO4A 1BAYA 2IMIA 2O85A 1YKAA 2R6KA 2TIRA 2YZUA 2PPTA 1GH2A 3KP9A 2GT6A 3KGKA 4G2EA 20GSA 5DQYA 5JWRB 2PN8A 1TK0B 2VCQA 5ID2A 5L71A 4K8MA 2C0DA 2CV4A 5A4WA 3ED3A 5ECNB 4AJ7A 5JWOB 2VAFA 3C1RA 1SJ6A 3VPTA 4BVXA 1LU4A 3TRQA 4KA0A 1NW2A 1AW9A 2H1DA 3DVWA 2C1YA 4MPGA 3UMAA 3VWWA 2GDRA 3QAWA 3D4MA 4BWSA 4AJ6A 2FD3A 4K0NA 3DRNA 5F8BA 3RHCA 1G6WA 2YJ7A 4G10A 2CZ3A 5HR2A 4F0CA 2M46A 2H1AA 5IM9A 1DE1A 1ON4A 4RUVA 1WRYA 1Z6MA 2XPEA 2YCDA 2VL3A 5EL8A 5DALB 3TKSE 3U6VA 3I43A 4I97A 5KN2A 1BG5A 4OCFA 5A4VA 1MTCA 3QR6A 3FZ4A 17GSA 1Z5YE 4PXOA 3EURA 3KTLA 1A8YA 2JSYA 4J56E 1PL2A 4ISDA 1X5CA 1KEBA 5AISA 3HXSA 3TDGA 5H5RA 2KOKA 3QD9A 3G9BA 2E2MA 2F9SA 1EZKA 2JU5A 4IELA 3MDKA 3FHKA 2O89A 2WZ9A 3LWAA 1GULA 4FYBA 3CTFA 2LKUA 4TRXA 5ECSA 1A2JA 1OVNA 1SD9A 2FCHA 2GSRA 2IFQA 3D22A 5EY6A 2OE3A 4PX1A 3UARA 2H1GA 2KUCA 4PGTA 2EC4A 2HZEB 4N11A 1A2LA 1SYXA 6GSTA 4DSRA 2FLSA 3APQA 4HZ2A 3KZQA 5IPGA 1GUMA 2WRTA 1FVKA 2H76A 3ERFA 1T8EB 4PNFA 1ERUA 2N5AA 2E2GA 3TB2A 4ULXA 1IYHA 4OFNA 5IOXA 2NTOA 4ZL8A 1EGRA 3BOAA 2N5FA 4K9ZA 2RM5A 1XWAA 2YWIA 3GTUA 4H86A 5HQPA 5CRGA 1GSYA 1V57A 2OACA 1R7HA 4MLYA 2C3TA 4ZBBA 1YJ6A 1XZOA 5KN3A 3MWHA 4IW9A 3APSA 1HNAA 5ECRB 4GQCA 2P0GA 2V6KA 4HS1A 2G0FA 4KE3A 3D4TA 1AC1A 2A2SA 3LEFA 5D9VA 4FIWA 2GZPA 1DSBA 4AGSA 2LQQA 4KUNA 13GSA 1PKZA 4MPFA 2AYTA 4OO5A 1AIUA 2LUSA 4BVYA 3TJBA 5IOWA 3LGCA 4L5OA 1XWCA 1GLQA 2BTOT 1YDKA 1T1VA 3C1SA 3F4RA 2RLIA 2R3XA 3VLNA 1F3BA 3GSSA 2P5QA 2CAQA 3RDWA 3IC4A 1BJXA 2CZ2A 2ALBA 1TU8A 2YNXA 5J3RA 1SKWB 3UVTA 1Y6EA 1FB0A 2VM1A 3APOA 4EL1A 4G19A 1FHEA 3J7Yb 1Z3EA 1GSQA 1PQNA 3HD5A 2L6DA 5AN1A 2L5LA 3KH9A 1WJKA 2YZHA 1EOGA 4E8EA 3TKRA 2H1BA 4KSOA 1GTIA 2VLVA 4TVEA 3L4NA 4TKYA 3GX0A 1O8XA 6GSVA 2OE0A 3GIXA 1JZWA 2BMXA 3KMNA 18GSA 1EP7A 2LEGA 4Q5NA 4MK3A 2B5YA 4PQ1A 3QFBC 4JZQA 2YWMA 2F8FA 3HCZA 4Q5QA 5B6NA 4I6XA 2YV9A 1A24A 3GYKA 2ON5A 1WIKA 4WR4A 2IJYA 3GKMA 3IBHA 1YF0A 2IPAA 1AQXA 3N9JA 2O7KA 2YP6A 2J9HA 3ZFBA 3GL5A 3L0HA 4JR4A 1K0NA 1T3BA 5J9CA 4XS6A 2K8VA 3F4SA 3UBLA 1UN2A 2DMLA 2H8LA 2HI7A 4ZL7A 4YQVA 1GTAA 1WE0A 4KDXA 3C71A 4EO3A 2VOCA 3GRXA 4JRRA 4WR5A 2IN3A 5AGYA 3ME8A 4RI6A 3PH9A 1O73A 5LNKe 2LNTA 3IK9A 3L9SA 2I81A 1GLPA 5EVOA 3UVHA 2X64A 1GRXA 3CSHA 1G6YA 3K8NA 3CYNA 2LV3A 3R2QA 1QK8A 2IL3A 3GL3A 2LRCA 3CTGA 5IQYA 1SK2A 2VL2A 4MDCA 3ERWA 4JBBA 4CW9A 1A0RP 2IMDA 3M8NA 5H5QA 5ELGA 1MD4A 1Y25A 2J23A 1CQGA 6GSUA 5IMZA 1FW1A 2ZNMA 4F0BA 6GSYA 7GSSA 3Q74A 1QFNA 3IK7A 3VK9A 1O8WA 2F51A 4MH3A 3ZREA 2H72A 4TW5A 4F2IA 1YY7A 4OD7A 1JZOA 4K7NA 4L8EA 2GSTA 5DCHA 2MMZA 1EOHA 2REMA 2H01A 5FWGA 2PVOC 4ML1A 1BYEA 4I5QA 1GL8A 2WS2A 4XS4A 2WB9A 5CRWA 3DGQA 3GMFA 1ZL9A 3F63A 3GN3A 3I6AA 2R2JA 2YWOA 3TCOA 4MF7A 4KDUA 2A2RA 1PRXA 5ID2B 2OJLA 16GSA 4DVCA 2LQOA 2V1MA 4J2FA 2VCZA 1ILOA 1YZXA 4PURA 3IA1A 2V32A 4PNGA 2H0IA 5J9BA 3J7Yk 1KNGA 5CO3A 3KMOA 3EMXA 4AJ8A 2ON7A 2L5OA 3GURA 3Q6OA 1SU9A 4EXJA 4TR0A 2JL4A 1YEXA 1LBKA 1OC9B 5A4UA 4POLA 1XWBA 2B3SA 4V2LA 3NOFA 3GV1A 2X8CA 5HR1A 1GSEA 1X0RA 5CREA 3TKSA 3VPQA 5IMCA 1G7EA 5B8AA 2XHFA 1ST9A 2CX4A 4WETA 2NVLA 1DBYA 3IPZA 5GAND 5ECOB 6GSXA 4NHZA 1B4PA 2LSTA 4HDEA 2MYGA 3EU4A 1OC3A 1U3AA 3O76A 1GTUA 4TR1A 1LJRA 2YANA 4Q5FA 2P31A 3P2AA 8GSSA 1K0AA 2DLXA 2LNSA 1J08A 14GSA 2Z9SA 4KGIA 3M9KA 2VCVA 1GUKA 2HRFA 2IFQB 1Q4JA 5DAKA 3GKXA 3TOTA 1HD2A 3FZ5A 4Z7XA 1X5DA 3QAVA 2FWHA 5E4WA 4F03A 4I2UA 1UC7A 3DMLA 2MBSA 1M9BA 3EC3A 1C72A 2E0QA 3C73A 1OC9A 2ES7A 1USBA 2OE1A 4XS1A 3EU3A 5HFGA 2AUVA 2PBJA 4XIHA 4RQRA 4WF4A 1R26A 3TJKA 3KCMA 4IP6A 1TW9A 2TRXA 4HJ2A 1THOA 1SL0B 1K0BA 1RK4A 3IE3A 3L78A 2IMFA 4ECCA 1JLVA 3GH9A 3GTUB 4ZB6A 2DJ1A 5DQSA 1TU7A 3BCKA 3LYKA 4TR4A 3LXTA 3WGEA 3RPNA 4J57E 2R4VA 3UOMA 5DBQA 5B6MA 1GTBA 4NV5A 1EEJA 4IHUA 1YF1A 2WGRA 3GH6A 3KP8A 2C3QA 4MJAA 1B9YC 4YQMA 2H66A 5CYYA 5J4UA 3HA9A 5GAPD 2PU9C 1G0TA 3TRPA 1K3OA 1TRWA 3FZ9A 4JE1A 1ACVA 2MBTA 4IBPA 3G7YA 2L6CA 2WULA 3LYPA 2OKAA 3BCIA 2NBSA 4HU7A 4YAVA 3H4KA 4HU9A 4MZWA 1HNCA 5IMDA 4EE0A 5G2ZA 2CT6A 1ZMAA 1IYIA 1WPIA 1AQWA 4DSSA 4N30A 3CRTA 3O3TA 4PQHA 1AQVA 1OC8A 1R5PA 4YAPA 3KD0A 1J0FA 1SK0A 1YQ1A 4E8HA 2B6MA 3ZFLA 2FWFA 2NPBA 1W89A 4TXOA 4KB3A 2PUKC 5IPHA 2H71A 2B5EA 1WP0A 1K0CA 2F3MA 5FT3A 4NMUA 1QGVA 3H79A 4ZB9A 3HDCA 3L9UA 4JU5A 1NSWA 1O6JA 3F9UA 1PL1A 4EDYA 2H19A 1SYRA 5C00A 5CAXA 2CQ9A 3TJGA 1ABAA 2KLXA 5C04A 2GVPA 5ECLB 5GSTA 4L0WA 4GLTA 2LRNA 2H70A 1Z9HA 2EIRA 1BEDA 3MAKA 4WBRD 3GX8A 4XHMA 1O85A 3E3EA 1XPVA 2VIMA 2CVBA 2K6VA 4LMWA 1CQHA 1EV4A 3EMPA 3ERGA 3ZZXA 1TK5B 1PX7A 1U6TA 4IN0A 4LL4B 2DJ0A 1X5EA 2AV4A 4WF5A 5FHIA 3M0FA 4ZL9A 2H6YA 1K3LA 3W8JA 1XFLA 3MSZA 1XCCA 2VL9A 4YH2A 1EGOA 4NHWA 2WCIA 1TTZA 2L4CA 2PMTA 5ECIB 3ZTLA 2XPDA 3TUEA 2KP1A 5H5SA 1F37A 4OFMA 4V2NA 2GZYA 4ZILA 2DIYA 3H1NA 2HZFA 4MF5A 3LORA 2H73A 4GCIA 3E9JB 5ECQB 2G2QA 3WD6A 1OKTA 2CVKA 4HUAA 1Z6NA 2CVDA 2B7KA 4KAEA 3A5WA 2O8VB 2ZCTA 1GSUA 3LJRA 1GSDA 1ZCPA 3IR4A 3A2XA 1TK8B 4NXIA 4EVMA 1FVJA 4X0XA 4AF2A 4LLRA 4POMA 2B7JA 4EC0A 1MEKA 1R4WA 4KX4A 2FA4A 2GQKA 2K9FA 4IP1A 2GLRA 2JZTA 1GNEA 1GUHA 4TR3A 2VLTA 1PGTA 3EINA 4CHSA 3M3MA 2FA8A 2AAWA 4POKA 2F8AA 1ZOFA 3GSTA 3ZIVA 4DEJA 2RIIA 1WWJA 4PQIA 1JZRA 1K0MA 3BBYA 1PMTA 3ZMKA 2WJUA 1NHYA 3W6GA 4JR6A 5ECKB 4XS4B 2I4AA 2VLUA 1MD3A 4POBA 1QQ2A 5IIZA 5JCWA 2H6ZA 4ECJA 3F4TA 3KJYA 1XW5A 5HR3A 1PKWA 3PR8A 1JZDA 2XBIA 2E7PA 2K18A 5EPFA 2DJKA 3W8SA 1QXHA 1A0FA 3FKFA 12GSA 3FW2A 1FO5A 5CNWA 3C8EA 5AIXA 3NZNA 3S9FA 1T4YA 4OMVA 19GSA 1F2EA 3FZAA 2YPMA 3ZL5A 3A2VA 1AUCA 2VD0A 4MZBA 4N0VA 3D5JA 3HZ4A 4EUYA 5J41A 1VRSD 5CP1A 1G7OA 3VWUA 2L4QA 3P8WA 4ECBA 3EVIA 3BD2A 2WFCA 4KNDA 3G7IA 3NIVA 3QAGA 2JSZA 4X1UA 1PA3A 4RI7A 1ZYEA 4KH7A 2QGVA 3G7JA 1MDJA 1I9DA 3IHQA 1H4OA 3IRAA 2LJKA 2HE3A 2V6OA 2RUFA 1SENA 3FR9A 1V98A 1ERVA 3VURA 4QL9A 3TJJA 4TR1B 4YQUA 2OBIA 2A4VA 2GTUA 1Q98A 4IJIA 5GSSA 2HFDA 5HR0A 3FEUA 2CA8A 3HJPA 3HYPA 3DD3A 3QCPA 1TKDB 4IQAA 4MJEA 1M0UA 3JCML 3DYRA 2LJAA 4K7OA 3ZIJA 2MMOA 1GSSA 5DAKB 3DXBA 5IMFA 1BX9A 2GGTA 1OKDA 1S3DA 1A8LA 5ECHB 22GSA 1H75A 1B8XA 5DDLA 2HRNA 3GUSA 3FR3A 2OADA 3VWVA 5ABRA 4K7IA 4XRDA 4GSNA 2LS5A 3FRCA 3OR5A 2O87A 3ZVJA 3F0IA 1T4ZA 4I2TA 4D73A 4ID0A 2X8HA 1VF1A 1U3IA 1EWXA 5D9XA 2RM6A 3WGDA 1KBNA 2DJ2A 4HI7A 1EEMA 3HVXA 3IOSA 1ZZYA 4PUFC 4L0UA 4N0ZA 4GSSA 4KDYA 3Q19A 2JZSA 4DSQA 3GNJA 5D8IA 1TRUA 4MA9A 2AHEA 5DJMA 3UIWA 1RW1A 2YWNA 1XBSA 1SL2B 3GHAA 4K6XA 4MABA 3H8QA 4XTSA 4O5RA 4QL7A 2YV7A 3HVSA 5D9TA 4WEYA 4FH8A 1F3AA 1FG4A 3FK8A 2DJJA 3IAS2 3GA4A 3I9V2 5JCUA 5DVBA 2ZUPA 4MF6A 4MZCA 5AIVA 2C80A 2XC2A 3FYGA 1PD21 5ENUA 4EDZA 1O7UA 2PGTA 11GSA 4GF0A 4NV2A 3DIEA 3BJ5A 3GFKA 5KN0A 1XW6A 1OAZA 3PGTA 5E59A 3RBTA 1HNBA 3D0ZA 4O7HA 4DSSB 2B5XA 9GSSA 5F0GA 3SBCA 2L57A 2R5GA 4HOJA 1B48A 1E2YA 3F6DA 4MMMA 4ZXGA 2IMKA 1JHBA 5B8BA 10GSA 1GNWA 5B7CA 3KEBA 4TXOB 2FGXA 3VFIA 3HVVA 4NAXA 5IMAA 3LXZA 3A3TA 2AJQB 1T7PB 3HJMA 1VGLA 2HSYA 1X9SB 2PVQA 2OBKA 5COHA 5F05A 1TI3A 1I5GA 4IJ3A 1VF3A 1M2AA 2QSIA 2H75A 2EIOA 1N2AA 3UAPA 2H6XA 3QDNA 2IIYA 3IXRA 3TKQA 4ZBDA 1UVZA 4ACSA 4FO5A 1M99A 3D21A 4ZBAA 2DJ3A 2H0HA 5D73A 5INYA 2GZZA 4PUAA 1WMJA 3KIJA 1V2AA 2KP2A 1PN9A 4BL7A 2VCTA 5LCZA 1T00A 4O92A 4MCUA 3WGXA 4GWRA 3UBKA 4L5LA 1M2BA 3TOUA 2DSAA 5KEJA 1HYUA 2VUPA 1UA5A 4F82A 1GSFA 3CBUA 3TJFA 3EYTA 5IO0A 4HQZA 5G31A 1XWGA 3IAM2 4KW6A 2FWEA 4CDOA 3TKPA 2X8GA 2KHPA 3P90A 1O81A 1QUWA 2NDOA 2OA7A 2VL2C 2MMNA 3CSIA 5F07A 1ERTA 5DALA 4GRFA 1NM3A 1TRSA 1OE8A 1V58A 3VWXA 4HJMA 1SKRB 3RPPA 4IVFA 2V41A 4GXZA 4KCEA 2LJRA 2VM2A 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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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