2TRXA

Crystal structure of thioredoxin from escherichia coli at 1.68 angstroms resolution
Total Genus 32
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
32
sequence length
108
structure length
108
Chain Sequence
SDKIIHLTDDSFDTDVLKADGAILVDFWAEWCGPCKMIAPILDEIADEYQGKLTVAKLNIDQNPGTAPKYGIRGIPTLLLFKNGEVAATKVGALSKGQLKEFLDANLA
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
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molecule tags Electron transport
source organism Escherichia coli
publication title Crystal structure of thioredoxin from Escherichia coli at 1.68 A resolution.
pubmed doi rcsb
molecule keywords THIOREDOXIN
total genus 32
structure length 108
sequence length 108
chains with identical sequence B
ec nomenclature
pdb deposition date 1990-03-19

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00085 Thioredoxin Thioredoxin
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.30.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich Glutaredoxin Glutaredoxin 2trxA00
1XW9A 1B4PA 2JL4A 2LJRA 2G2QA 5F8BA 3GTUB 4G19A 1MTCA 1UC7A 2GSTA 1OVNA 1W89A 3ZFBA 3GKNA 1I9DA 1WIKA 1Z6MA 4YAPA 3CSIA 4BWQA 3H79A 4DVCA 3HZ4A 3KEBA 1BQ7A 2VCTA 5J3RA 5ID2B 2H71A 2FD3A 4IW9A 1VF2A 1WE0A 1PQNA 2RIIA 4GCIA 1GSQA 3HJOA 3D21A 4WF5A 4MH2A 5B6NA 4V2MA 4XTSA 3U6VA 13GSA 2YV9A 3ISOA 4E8EA 5ECIB 3ERFA 4MMMA 4O32A 3E0UA 4TOPA 2AB6A 1Z3EA 3TJGA 4EDYA 4F0CA 4BWSA 3LYKA 4HU9A 1T4ZA 4PQHA 2X8HA 4DSRA 3N9JA 1OC8A 1BAYA 2YWMA 3O76A 2XBQA 1ST9A 3TJJA 1Q98A 3GIXA 3LEFA 5D96A 2I1UA 4IHUA 1QUWA 3GV1A 2VCWA 2HXKA 1G6WA 5B7CA 1J08A 1U3AA 5CAXA 5HFIA 5ECOB 1OC9A 4AF2A 1GTBA 2R5GA 3IAS2 1TP9A 1XWBA 2CQ9A 4O5RA 4NMUA 1I5GA 2FNOA 4KSMA 1W4VA 2K8SA 2WDUA 3L9SA 1QK8A 4PUFC 5D9TA 2IMFA 3F3QA 5AGYA 5ECQB 1ZOFA 2HSYA 2DJ2A 3U5RE 2NTOA 5LCZA 3GH9A 2PERA 1V58A 4RQRA 3E3EA 3RAZA 2DJ0A 2C3NA 4L5OA 3TKSE 2O89A 3F6DA 2OACA 3MDKA 1XW6A 2J23A 4K7OA 5HFKA 5GAND 4K1FA 4I8BA 1R5AA 3ERWA 2JZRA 3APQA 5JCGA 4V2LA 5CRWA 5F05A 2YZHA 1PA3A 2H73A 2B5YA 4ISDA 4MH3A 2KOKA 2LTKA 4HJ2A 2H0IA 4K9ZA 3Q74A 5G5FA 4AJ6A 4POMA 5HQPA 3TKRA 3KP9A 4Z7XA 3WT2A 2KP1A 4ZBDA 1JLWA 3F4RA 11GSA 3KH9A 2YWNA 1U6TA 17GSA 4WBJA 4ML1A 3EYTA 2OA7A 1F3AA 1PX6A 5KN3A 2WJUA 4OFTA 2M46A 4TRXA 4WR4A 4IJ3A 2HRFA 4I5QA 1Y25A 1N2AA 2K9FA 1H4OA 1TTZA 2B7JA 2CV4A 1KBNA 2H6ZA 3W8JA 1K0CA 1LJRA 3GFKA 3RPPA 2WCIA 4MLYA 4MF5A 2CAIA 3GH6A 4Q5NA 5D9WA 1ML6A 2DJ1A 1GUHA 2JZSA 3F8UA 1G6YA 2VLTA 4IJIA 1AXDA 5ECNB 1NHOA 3D6IA 4CW9A 2VD1A 5EPFA 1X9MB 1UA5A 4ZL8A 4FYUA 1IYHA 1HD2A 5G30A 4IBPA 5LD0A 1SJ6A 2GZYA 3KGKA 1TRWA 4KH7A 4GTUA 3W8SA 4Q5RA 1PRXA 4EC0A 1SK0A 4JE1A 2JSZA 2GQLA 2P5QA 1BX9A 4NHWA 4MJBA 4HUAA 2H72A 2VD0A 4I2UA 3LSZA 3F4SA 3DKSA 1GL8A 2AUVA 2VCQA 1U87A 2VM2A 2QC7A 1ZZYA 3DD3A 4OO5A 1EOHA 2AYTA 1A8YA 1DBYA 4BVXA 3GRXA 4HS1A 4P3YB 4WKWA 3IOSA 7GSSA 3KCMA 4JZQA 4JU5A 2H1DA 3TRPA 2YCDA 2YNXA 4ZXGA 2WULA 1JZDA 3HA9A 4HJMA 3D22A 2JU5A 1EGOA 1FW1A 5DQYA 5AIVA 2GLRA 2FA4A 3HHVA 5A4WA 4L0UA 4XS1A 1WWJA 3KMNA 3KXOA 3GL3A 2FWEA 1ZMAA 4JRRA 5IOXA 2IMEA 2RLIA 3G7IA 1FG4A 2OE0A 1TKDB 5DVBA 4YAVA 2E7PA 4TN8A 2X8CA 2DJ3A 5AISA 4ML6A 4DSSB 1ABAA 9GSSA 2DBCA 2ZCTA 3S9FA 3D4MA 2YP6A 1GUMA 4XIHA 2E2GA 2PPTA 2V2GA 3EMPA 2CA8A 2CVKA 2MMOA 3KP8A 4HZ4A 3ZZXA 1EWXA 4K8MA 1M7TA 5IQYA 1M9BA 1GTAA 1JLVA 1C72A 1TI1A 1K0BA 2NDOA 2R3XA 4AGSA 1M2DA 1OKDA 5IMCA 2H19A 1ACVA 2M72A 3GURA 4MK3A 3I6AA 4IKHA 1Z7PA 2WFCA 4YQVA 3DRNA 4X0XA 3A2XA 2HZEB 3A2VA 3MSZA 3KIJA 4KCAA 1G0TA 5IMFA 3DYRA 2L6DA 1GH2A 4CHSA 1TK5B 3RDWA 5J4UA 2IWTA 4EE0A 3M0FA 2X8GA 3ZREA 2ALBA 3FKFA 2LNSA 1VF4A 4NWYA 5IPHA 2V6KA 5DCGA 2IPAA 5F07A 2YOIA 2OADA 2K8VA 2N5AA 1K0AA 1R26A 2WB9A 1OYJA 5G2ZA 1VF1A 3TGZA 2LJAA 6GSWA 4HZ2A 4KA0A 18GSA 2C0EA 3UVTA 1WRYA 4AJ8A 1YF1A 1UVZA 3OR5A 5LNKe 3HY2A 3CTFA 3WD6A 1AQVA 4MZCA 1SK2A 4XCSA 3UEMA 12GSA 1AC1A 5J5NA 4CDOA 5GSSA 1F2EA 3GKXA 2XHFA 2P0GA 1U3IA 5GAPD 3VWXA 2LQQA 4MJAA 5COHA 1DSBA 3EINA 2HNLA 1A2LA 3NIVA 6GSYA 1GUKA 3KTBA 2X99A 4MJCA 2LNTA 3WYWA 1E2YA 4TR0A 3TRXA 1OC9B 2PUKC 4QL7A 6GSXA 1X5DA 1WJKA 4OFMA 3KJYA 1ERWA 2JZTA 2P31A 2B5EA 1XVQA 3EU3A 1OC3A 2H30A 3AY8A 4TR1A 4POLA 1AQWA 2YN1A 2B1KA 2PU9C 2NVLA 1A8LA 1XCCA 1XOAA 4L5LA 2C4JA 1XWCA 3GX8A 4K0NA 4ID0A 1NSWA 1V98A 3DVXA 4LL1B 1TXXA 5ELGA 3HJMA 3H4KA 4I2TA 5DJLA 6GSSA 2LRCA 4XRDA 4K7NA 5G1LA 3HVVA 2HE3A 3HZ8A 1FB0A 1PL1A 5JCUA 5IOWA 1FB6A 2C0FA 2YJHA 2E2MA 2I81A 2Z9SA 2B1LA 2HFDA 1KEBA 1X5CA 3DXBA 2YJ7A 1V9WA 4HI7A 2VL9A 3BBYA 1MD4A 4NAXA 2VLUA 4HOJA 2MBSA 2TIRA 2HRNA 5DAKA 3RBTA 3KD0A 3PINA 1M0UA 3WGDA 3O6TA 1PN9A 2AAWA 5IM9A 3G9BA 4MPFA 5INYA 4TXOA 2O85A 1A0RP 3LG6A 3DIEA 2G0FA 4FIWA 5A4VA 2L5OA 4OD7A 1WOUA 1T4YA 2LUSA 2CX3A 2RM5A 4QQ7A 1K3YA 1TJDA 2C80A 3ME7A 3TKQA 2WZ9A 2AHEA 4KB3A 2ZUPA 1EZKA 2HZFA 4PNFA 1B9XC 1VF3A 8GSSA 1GP1A 3O3TA 4HEA2 4IVFA 3KH7A 4G9HA 4WR5A 3M1GA 2VCVA 1GSDA 4WBRD 1AW9A 1TU8A 2L57A 1EP8A 3Q6OA 2QGVA 3TCOA 3LGCA 2CVDA 3IRAA 3EU4A 3HCZA 2J9HA 3SBCA 5CRDA 3E9JB 1EEJA 5FWGA 3GMFA 2H1AA 3TOTA 4OMVA 5B6MA 1K0NA 3EMXA 4MPGA 1MEKA 5ID2A 1GSFA 3BD2A 5IMDA 2DJJA 4LL4B 3A2WA 1B4QA 4E8HA 2VIMA 4TVEA 1Z6NA 3GSTA 10GSA 2AJQB 2IN3A 4L0WA 4EVMA 2DMLA 3QD9A 4K0GA 1GRXA 2LSTA 3EVIA 2IMKA 1EP7A 4X43A 22GSA 2EIQA 3ZLPA 5DJMA 1XBSA 1EV9A 3C1SA 1OKTA 2K18A 2I4AA 5DQSA 2PVOC 3IC4A 3W6GA 4KUNA 3Q19A 4V2NA 4F2IA 3UBLA 1TRUA 4MDCA 4V1Ag 3IHQA 3QAWA 1G7OA 3C71A 1R4WA 4AJ7A 5HR0A 1J9BA 1TK0B 2VCXA 2ZNMA 2GQMA 1X9SB 3BOAA 3VI5A 4KX4A 1SK1A 3LJRA 1XFLA 2YPMA 2HYXA 2OJLA 5F06A 5D8IA 2VL2C 3TB2A 1YZXA 3CRTA 4TW5A 4I6XA 1EOGA 3QOUA 2TRXA 1VGLA 3BCKA 1URMA 2H01A 2OKAA 4D73A 4K6XA 4MZWA 2K6VA 1M99A 3GA4A 3M8NA 2ES7A 3DEXA 5J9BA 2PMTA 1GTUA 2GZPA 5J41A 4FH8A 2ON5A 1XWAA 4TKYA 3US3A 3KTLA 2NPBA 1F9MA 1ERVA 2PGTA 2L6CA 3UJ1A 1FVKA 2O87A 2P5RA 2V32A 4KDUA 5HR1A 3WT1A 4J56E 4IP1A 1GLQA 1B9YC 3ZL5A 3QDNA 2BJXA 4ZL9A 4WETA 3ZRDA 4EXJA 16GSA 4XHMA 2XPDA 3GN3A 1V40A 3QAGA 4JR4A 14GSA 3PR8A 2FWGA 5ECKB 3VK9A 2DIYA 3M9JA 3KM6A 5HR3A 4HQZA 4PXOA 2MBTA 2XPEA 5HR2A 3ZTLA 1MDKA 1T7PB 3WGEA 2V1MA 2GS3A 4XS4B 4ECBA 3F3RA 2LKUA 2I3YA 4LA1A 4N30A 1BYEA 2IFQA 2VO4A 1T1VA 1SYRA 4PX1A 2KP2A 1Z9HA 1K3OA 3FK8A 3UOMA 2H70A 4N0VA 3LXZA 3K8NA 1R7HA 4F9ZA 3IV4A 4EUYA 4PGTA 5L71A 2C3QA 2FWFA 3FZ9A 3IK7A 2CVBA 3P2AA 1GSEA 1JZRA 1TW9A 1LU4A 3PH9A 3TJKA 4OCFA 3IBHA 5JCWA 3TRQA 4MP4A 3VWVA 2FLSA 5EY6A 1QQ2A 2O7KA 1AUCA 1YDKA 2VUPA 3CMIA 3FZ5A 3EURA 2GVPA 2HT9A 5GZZB 4MF7A 3P90A 2I9HA 1PGTA 3DWVA 3QFBC 3FR9A 4IGJA 4HDEA 1FOVA 1ZGNA 4ECJA 1SKRB 5B8BA 1YY7A 4NPBA 1XZOA 2R4VA 2B7KA 1KNGA 20GSA 2JACA 2HLSA 2IMIA 3C1RA 4GF0A 3UL3A 2VM1A 2JSYA 2F8FA 4LMWA 5CNWA 3I43A 3VWUA 1A2JA 4YQUA 2B3SA 1PX7A 2H74A 1B8XA 5EL8A 4ULXA 3FRCA 3HYPA 1K0DA 4KGIA 1V2AA 1GLPA 4K2DA 2GDRA 4JEDA 2DC5A 1PSQA 3QR6A 5G5EA 1WPIA 2N5BA 2F3MA 1GULA 1USBA 1THXA 3V1WA 2EIRA 2KHPA 2MMNA 1SJIA 2GQKA 2LRTA 3PGTA 3F6FA 4ZBAA 5DAKB 3F0IA 3NZNA 4GQFA 1OE7A 1SU9A 1EGRA 2DLXA 1OAZA 3CXGA 5ECRB 1G7EA 3VI7A 4RUVA 1TK8B 1O6JA 4FO5A 5KN1A 4IELA 5CRGA 4RQXA 5G1KA 3APSA 2YV7A 4I97A 1NHYA 5FHIA 2C3TA 3CBUA 3VWWA 3IAM2 1F37A 2FY6A 3C7MA 5ENUA 3VLNA 4JBBA 4IQ1A 3UBKA 3Q18A 1QFNA 4ZB6A 1M2AA 2KLXA 1NM3A 3L9UA 1TOFA 2C0DA 4PUAA 1O8WA 2GT5A 4LLRA 3M3MA 1T8EB 2EIOA 2B5XA 3GKKA 2C0GA 2RM6A 1PKWA 5AN1A 1HNCA 2WRTA 3QMXA 1HQOA 5E59A 4GSTA 5CO3A 2H75A 2MMAA 2LJKA 1YKCA 4ILFA 1B48A 1S3DA 2IJYA 2GTUA 2HZEA 1XW5A 2IIYA 3I9V2 5ECSA 2BTOT 2D2ZA 2OBIA 2O8VB 2PN8A 3UMAA 3TKSA 4Q5QA 2L59A 4WF4A 2FWHA 1JFUA 1THOA 3ED3A 3VURA 1IYIA 4ZBBA 5D9XA 1SL0B 3UARA 1Z5YE 3FEUA 4YH2A 2A4VA 2BMXA 2C1YA 4TXVA 3EE2A 4H86A 1O85A 3TDGA 1XWKA 2F51A 4TR3A 5DCHA 1FVJA 2JADA 2YWIA 5AIXA 3HDCA 4X1UA 2WS2A 4POKA 3ZIVA 3SWLA 2DSAA 1XOBA 5CREA 1FO5A 5KEJA 1FAAA 5ECLB 5DALA 3F9UA 5J9CA 2H1GA 3HKRA 3ZMLA 4DEJA 1SYXA 4JR6A 1M2BA 3ME8A 1VRSD 3ERGA 1Z7RA 2H1BA 4GRFA 3IE3A 2H76A 2RUEA 1RQMA 3IK9A 1BJXA 1SD8A 3TJFA 4GQCA 3ZIJA 1H75A 2KUCA 1AIUA 3GTUA 1YKAA 2GSRA 1EEMA 3A3TA 4D73B 4PNGA 1F3BA 5ECHB 3G7JA 5JWOB 1ZL9A 1YEPA 1TRVA 2WGRA 4DSQA 4F82A 2VCZA 1R5PA 1TRSA 3QCPA 3UIWA 3QAVA 2DMMA 3H8QA 3F63A 3IR4A 3CSJA 3MAKA 1F6MC 5IO0A 3FY7A 1A24A 2V6OA 1XPVA 5IO2A 2R6KA 3D5JA 4MABA 2VL3A 2H6XA 3EWLA 1SD9A 1GWCA 3LXTA 4KSOA 4MCUA 3VFIA 1XIYA 1T3BA 3TUEA 1BEDA 1YEXA 2H0GA 1ZCPA 5D93A 2V41A 1K3LA 5H5QA 1SJZA 3D4TA 3TKPA 3GSSA 5CRHA 4G2EA 3L9VA 4G10A 2F9SA 1E6BA 3VPTA 3DVWA 1O8XA 2OBKA 3QPMA 3ZYWA 6GSVA 2N5FA 3IA1A 4FYBA 1RK4A 1K0OA 5DDLA 4NXIA 2L4QA 3MWHA 3FR6A 2QSIA 2CZ3A 3CRUA 2IFQB 4EO3A 1LBKA 5ECPB 3D0ZA 3GHAA 4KAEA 4ZL7A 1SKSB 4KE3A 3RHCA 3UVHA 5EVOA 4IS0A 3L4NA 5A4UA 3LORA 2R2JA 5DBQA 4F0BA 1YJ6A 2FUG2 4ZILA 2FHEA 2FGXA 3IXRA 4N11A 1X0RA 4ZB8A 1GSUA 4WXTA 4ACSA 3EC3A 5D73A 4IN0A 4HU7A 3BCIA 4F03A 1DE1A 4PURA 2HI7A 2L5LA 1QXHA 4L8EA 3GL5A 4WEYA 5H5SA 1S3AA 1XXUA 4GWRA 4BPYA 4RI7A 1TDIA 4OWYA 4EKZA 2VL2A 4IQAA 3CTGA 4XRAA 4QL9A 1GNEA 3HVXA 4RI6A 4N0ZA 1GSSA 2EC4A 4BA7A 1HNAA 4BL7A 4EF0A 3FZAA 2H66A 4PQ1A 4ZIJA 6GSTA 4GXZA 4NV5A 4KDYA 4ECIA 3J7Yk 2DIZA 2X64A 3I69A 5KN0A 3A5WA 2HSHA 4K7IA 4IP6A 4XS6A 1HYUA 4ECCA 2NBSA 4MF6A 3HVSA 1V57A 1J0FA 5IPGA 4KCEA 1O7UA 1UN2A 5B8AA 3MNGA 1QGVA 3IDVA 1FHEA 3LQ7A 3TJBA 1KTEA 4EL1A 2L4CA 3HJPA 1PMTA 4ZB9A 1HNBA 5IMVA 4PQIA 19GSA 2IMDA 3RPNA 2PVQA 2PWJA 3TOUA 4KW6A 2MMZA 2PBJA 1RW1A 3H1NA 2IL3A 3CYNA 5C04A 1Q4JA 5IMZA 2YZUA 3P7XA 1BG5A 1EV4A 4MA9A 2XC2A 1N8JA 2LQOA 5KN2A 2C8UA 3R2QA 1YF0A 3WGXA 3LFLA 3H93A 3J7Yb 3ZVJA 1GSYA 3GUSA 4OFNA 1TU7A 4GSSA 1JZWA 5JWQB 1GTIA 1Y6EA 2OE1A 2YANA 2FA8A 3LYPA 2XBIA 1A0FA 4BVYA 1WP0A 2QKEA 1DE2A 3QFAC 1SL2B 1ERTA 1O81A 4TR1B 2ON7A 1ILOA 3FR3A 3NOFA 3N5OA 1WMJA 2GSSA 1O73A 3KMOA 2B6MA 1U88A 4KDXA 3FHKA 5A5KA 3UAPA 3GNJA 1QMVA 1CQGA 3GKMA 1AQXA 4LMVA 1ERUA 3HD5A 2CX4A 2A2SA 5E4WA 2MZCA 3HXSA 3L0HA 4V1Ap 3IPZA 5FT3A 3L78A 2CAQA 1SKWB 2LS5A 4Q5FA 2GGTA 2OE3A 1M9AA 5IIZA 1JZOA 6GSUA 1PL2A 4POBA 5ECMB 1JHBA 1PD21 3ZFLA 4TR4A 2VOCA 1NW2A 4N10A 3FW2A 1SENA 3P8WA 5CP1A 2F8AA 1TI3A 3M9KA 5D9VA 3VPQA 3DMLA 2A2RA 5IMAA 3LWAA 2LEGA 1A2MA 1ZYEA 1AAZA 1YQ1A 3GYKA 3APOA 3FZ4A 1K0MA 1MDJA 2M80A 1DUGA 2RUFA 2VLVA 4FYCA 4J57E 3CSHA 4NV2A 3DGQA 4XS4A 5C00A 2MYGA 4O92A 2DJKA 4GLTA 2YWOA 3C8EA 4J2FA 3GX0A 3C73A 2LRNA 5JWRB 2E0QA 1XVWA 3FYGA 3F4TA 4KNDA 2FCHA 1MDIA 4OCEA 4GSNA 1X9WB 5ABRA 2REMA 4NHZA 2LV3A 4TXOB 2GT6A 4O7HA 4DSSA 5GSTA 2H6YA 5CYYA 4MZBA 1T00A 1GNWA 2H0HA 1A23A 1MD3A 2H8LA 2VAFA 3RHBA 5DALB 1S3CA 3ZVJD 5HFGA 5G31A 3ZMKA 3BJ5A 1XWGA 4YQMA 1ZYQB 1ON4A 1SL1B 3JCML 5H5RA 3ZITA 4OO4A 1X5EA 2GSQA 3KZQA 2R37A 2AV4A 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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