3IHGA

Crystal structure of a ternary complex of aklavinone-11 hydroxylase with fad and aklavinone
Total Genus 164
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
164
sequence length
535
structure length
535
Chain Sequence
MNDHEVDVLVVGAGLGGLSTAMFLARQGVRVLVVERRPGLSPYPRAAGQNPRTMELLRIGGVADEVVRADDIRGTQGDFVIRLAESVRGEILRTVSESFDDMVAATEPCTPAGWAMLSQDKLEPILLAQARKHGGAIRFGTRLLSFRQHDDDAGAGVTARLAGPDGEYDLRAGYLVGADGNRSLVRESLGIGRYGHGTLTHMVGVIFDADLSGIMEPGTTGWYYLHHPEFKGTFGPTDRPDRHTLFVEYDPDEGERPEDFTPQRCVELIGLALDAPEVKPELVDIQGWEMAARIAERWREGRVFLAGDAAKVTPPTGGMSGNAAVADGFDLAWKLAAVLQGQAGAGLLDTYEDERKVAAELVVAEALAIYAQRMAPHMAEVWDKSVGYPETLLGFRYRSSAVLATDDDPARVENPLTPSGRPGFRGPHVLVSRHGERLSTVDLFGDGWTLLAGELGADWVAAAEAVSAELGVPVRAYRVGAGLTDPESAVSERYGIGKAGASLVRPDGIVAWRTDEAAADAAQTLEGVLRRVLDR
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
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molecule tags Flavoprotein, oxidoreductase
molecule keywords RdmE
publication title Structural basis for substrate recognition and specificity in aklavinone-11-hydroxylase from rhodomycin biosynthesis.
pubmed doi rcsb
source organism Streptomyces purpurascens
total genus 164
structure length 535
sequence length 535
chains with identical sequence B, C
ec nomenclature ec 1.14.13.180: Aklavinone 12-hydroxylase.
pdb deposition date 2009-07-30

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF01494 FAD_binding_3 FAD binding domain
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.30.9.50 Alpha Beta 2-Layer Sandwich D-Amino Acid Oxidase; Chain A, domain 2 D-Amino Acid Oxidase; Chain A, domain 2 3ihgA02
3.40.30.120 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich Glutaredoxin Glutaredoxin 3ihgA03
3.50.50.60 Alpha Beta 3-Layer(bba) Sandwich FAD/NAD(P)-binding domain FAD/NAD(P)-binding domain 3ihgA01
1FEBA 2WPFA 1OJTA 4H4TA 3UKLA 2J3NA 3VQRA 3R9UA 2NPXA 2XFPA 3CNTA 1M64A 3RNMA 1GV4A 5EBKA 4Y4MA 4EMWA 2JBVA 1UKVG 3OZ2A 1LJ1A 4H4UA 3BI2A 2XFQA 4A65A 3DK9A 3S61A 3UKQA 3CNJA 2YLSA 3NNEA 4OPDA 2XDOA 3FMWA 2VVLG 2WPEA 4NEWA 4X9MA 3E1TA 3V3OA 1Y56B 4OPTA 1PXBA 3Q9TA 1NAAA 4GCMA 4H4RA 2BXSA 2BS2A 1KNPA 3AE1A 4U8PA 2BA9A 3K7TA 1NHRA 3RP7A 2IVEA 1LQUA 1YQ3A 4H2QA 3Q6JA 4H4SA 2BC1A 3GYIA 1E6EA 2X3NA 2WOIA 4APNA 1K0IA 1RP0A 4B68A 3UP4A 1D5TA 1JRXA 4EM3A 4GUVA 2YG7A 2GVCA 3BNUA 4CRTA 2FJEA 2WP9A 4NZHA 3CPIG 3SQPA 4CY8A 2R0PA 4J56A 3ALLA 2JK6A 2WOWA 2BXRA 3UKKA 4JQ9A 3AXBA 4X9NA 4CBQA 4YSZA 3GD4A 4OPGA 2R9ZA 3NYFA 2QAEA 2XYOA 4YTPA 2WDQA 2JAEA 4EQWA 3K30A 2R4JA 4ECHA 3CNPA 1YY5A 3II4A 2RGHA 3DA1A 4H4YA 4YSHA 3DH9A 1CBOA 4U2LA 4XWZA 3EANA 3BHKA 1GERA 5FS9A 3G5QA 1E1NA 1N1PA 1GPEA 2GAGB 2GMHA 2BYBA 1PXCA 1CC2A 2XLPA 1CC6A 4AT0A 2C73A 2BK5A 4H4ZA 1PHHA 4Z26A 2A8XA 4TM3A 4EMIA 3AE9A 4BK1A 2XLSA 3RP8A 4H2PA 5KOXA 4UDRA 3NK0X 1BKWA 2BK4A 2PYXA 4K8DA 5KOWA 4AP1A 3LB8A 4DGKA 4YKGA 1FCDA 2YR4A 5JCMA 4H2NA 4C3YA 3F8RA 5FS6A 2YVFA 1ELIA 1NEKA 2E5VA 2VVLA 3CNSA 3SM8A 1KNRA 4XWRA 1H82A 1JNRA 2QCUA 1JU2A 1GSNA 4J36A 5KRQA 1E1MA 2TMDA 4PAAA 5C3JA 2Z5XA 3AE3A 2VZ2A 3DJJA 2EQ7A 2V6OA 5M0ZA 4B1BA 1GALA 2JB3A 4TLXA 4J57A 4Z2UA 4UDQA 3SFEA 2AQJA 3IWAA 4EQSA 3AB1A 2GR0A 1IUSA 3NG7X 1ZMDA 2B9WA 2B9YA 3I3LA 2Y6RA 3UKHA 2YG6A 1DJNA 3S5WA 1VDCA 1ZK7A 3QVPA 1F3PA 4JDRA 4U8NA 4U8IA 1TDOA 2V61A 3QSMA 1EL9A 4EQRA 2ARDA 2O9ZA 1Q1RA 2XVFA 4I59A 4N9XA 3FIMB 4A7AA 4BJZA 1YQZA 5FS7A 4D04A 5BRTA 1D4EA 1NENA 4ZCDA 1K0JA 3G5SA 3KD9A 1AOGA 2BK3A 3AE5A 1PJ7A 1GXFA 1DODA 2E1MA 3V76A 3AD8B 2BACA 4LIIA 2YQUA 1CL0A 1TRBA 3JSKA 3NT6A 1GTHA 3NN0X 5JCNA 1JRZA 3KKJA 3ABVA 1KSUA 1KSSA 3KPFA 4BK3A 5FMHA 1GRGA 1N4VA 3AEFA 3B3RA 4OPIA 3EAOA 2VQBA 3NRNA 4YXDA 3NK1X 4IVMB 4ICYA 3KA7A 1GESA 2XVEA 3UTFA 1OJCA 3AEBA 4J31A 5TR3A 2GR3A 3QJ4A 1NHSA 1NG4A 4Z24A 2WPCA 3P9UA 1VG0A 2CVJA 2ZZ0A 3M13A 4YSYA 3IC9A 3C96A 4WCTA 1GETA 3UKFA 4A6NA 3DGZA 5BULA 5KWFA 1EL8A 2WU2A 3H8IA 1F8RA 1N4WA 4GDEA 4JNQA 1KFYA 4USRA 4K2XA 1O5WA 4YT0A 4ADWA 1S3EA 1Z6LA 1PXAA 1IUVA 2W0HA 3UCLA 3AWIA 4BV6A 4ZN0A 1ZMCA 2YR6A 2GB0A 1HYUA 2BCGG 4WX1A 1FOHA 1QO8A 3NHOX 1CHUA 2X8CA 2NVKX 4K5RA 2WP5A 1GNDA 1LPFA 3BI5A 3KU9A 1B8SA 1XHCA 3CGCA 1OJDA 3FBSA 4C5OA 2ZZCA 5IPYA 2R45A 3D8XA 1D4DA 2YLZA 1L9CA 1L9EA 1QLBA 2UZZA 4UDPA 1L0VA 1H84A 2WESA 1V59A 3BNMA 2YWLA 3AE8A 3GRTA 4H2RA 2B76A 4JN9A 3ALJA 2H89A 2WHDA 1D4CA 4BJYA 1DOEA 3PO7A 5KXJA 3KLJA 3L8KA 2A89A 1OJAA 1IUTA 4O5QA 2WDRA 3GDNA 2WQYA 4RSLA 3V3NA 3NTAA 3P4QA 2FJBA 4Z2TA 2WU5A 3NGCX 1NDAA 1ONFA 4A79A 4U8OA 3IHMA 4EIPA 4NTDA 5HYMA 2YG5A 1COYA 1E7PA 1ZOVA 3LOVA 3PS9A 2QA1A 3UTHA 4YWOA 4JY2A 4GR1A 5BVAA 4HA6A 1KF6A 1DOBA 2XLTA 2QA2A 1CJ2A 3BI4A 3KVEA 4A5LA 5IQ4A 1K0LA 2CULA 3L1RA 1H7XA 3LXDA 4FK1C 3CGEA 1IUWA 4XXGA 3UOYA 4AP3A 4KPRA 2YVGA 2WBAA 5BUKA 5U63A 5J60A 1PBCA 1F8WA 2C70A 2XLRA 4CNKA 2AR8A 2ACZA 2VOUA 2XVIA 3F8DA 4P9SA 4B65A 4LU6A 3UKAA 3H8LA 2VRLA 2R0GA 3NKSA 3IHGA 3CNDA 4YTNA 2Z5YA 3H4KA 1D7YA 4H4PA 4B64A 4Z43A 2OALA 2GF3A 2E4GA 3GWDA 3GSIA 4CCRA 1Y0PA 2YAUA 4C74A 4ZCCA 2YLWA 2BS4A 5GSNA 2Q0LA 1OJ9A 3QSSA 2YLRA 4IA6A 1RYIA 1PBFA 1VG9A 2YVJA 1NHQA 3NK2X 1CJ3A 2PHHA 3ATRA 2IIDA 1P2HA 1CF3A 2JKCA 2WETA 5KVHA 4U8MA 1W4XA 1GRFA 1NG3A 4H4VA 4REKA 1IUUA 3UOZA 4E0VA 1CC4A 2WS3A 4K5SA 4TM4A 4Y4NA 2A87A 3IF9A 1MXTA 3DJEA 3FG2P 4I58A 3GMBA 2DKHA 3NN6X 4UP3A 3AE6A 3P4PA 2EQ9A 3ITJA 1GREA 3QFAA 2APGA 4BK2A 2R0CA 3VRDB 2GV8A 2CDUA 1TDFA 2DKIA 2C64A 2YLXA 4TM1A 3T37A 2C7GA 2Q7VA 2XFUA 4EIQA 3NIXA 3UOVA 3DK8A 2GQWA 4PABA 3ICTA 1Q9IA 4H50A 3DMEA 3NH3X 3QVRA 1H86A 4BURA 3O0HA 2RGJA 1JNZA 1P2EA 5J7XA 1M6IA 3CGBA 3GRSA 4IV9A 4U2SA 4DSHA 3GYJA 3DJDA 3CN8A 3NLCA 2GH5A 3AYIA 5U1OA 2IVDA 2C72A 3SFDA 5JCIA 1L9DA 3M12A 1XPQA 2VQ7A 3EPTA 4Z2RA 4YTMA 3AD9B 2V60A 4IA5A 1NPXA 1GRHA 1E1LA 2Y6QA 2Q0KA 4RG3A 4TLZA 2YM2A 1PBEA 3UTEA 4B63A 1ZP0A 2GRTA 5EB5A 4EQXA 3AE7A 1JRYA 5IQ1A 3K7MX 3LJPA 2Q6UA 1N4UA 1O94A 2RABA 5EOWA 4B66A 1H6VA 2EQ8A 4GF7A 1TDEA 2YG4A 4H4WA 5GRTA 1CJCA 4AT2A 4H4QA 4J2WA 1IUXA 1BF3A 3CTYA 1H81A 2GQFA 5CKUA 4EMJA 1E1KA 4KX6A 2X99A 4IVOB 2R46A 1YKJA 3AEEA 3F8PA 3LADA 1B37A 1K4QA 4RG4A 4U8KA 1ZY8A 2OAMA 4J33A 1Y56A 3ICRA 1TDNA 2RGOA 4LA1A 4TM0A 2YLTA 3UTGA 1IJHA 2GMJA 3VRAA 4JY3A 1FECA 3CPJG 3D1CA 3BHFA 3HZLA 4U2TA 4OPLA 1GEUA 2X8GA 1GRAA 1BZLA 1S3BA 1ZX9A 3NYCA 4B67A 4Z25A 1RSGA 1JOAA 1ZDLA 1D7LA 1GTEA 3GDPA 4M52A 4K22A 3K7QX 4C3XA 1BGJA 2BABA 2FBWA 4YKFA 3AEAA 2C67A 4OCGA 1F6MA 4JNAA 3UOXA 3SGLA 4EM4A 1TDKA 3ALMA 1PJ5A 4HB9A 3AYLA 1VRQB 5C2TA 3PVCA 3VRBA 1DNCA 1PJ6A 2VRMA 1YQ4A 4FK1A 4K7ZA 3LZWA 1XDIA 1GRBA 2X50A 1QJDA 4H4XA 4O5UA 4DNAA 2C66A 2XVHA 3G5RA 1CJ4A 2B9XA 1TYPA 1JEHA 1B4VA 2CFYA 5U25A 4NTCA 2XFNA 3DGHA 3FPZA 3UKPA 3M0OA 4B69A 3OC4A 3VR9A 3ZDNA 3WE0A 4DSGA 3AEGA 1BGNA 1MO9A 2B7SA 5HHFA 1O95A 4OVIA 1FEAA 3NTDA 1F8SA 1MOKA 1PN0A 5DBJA 4YSXA 5LV9A 3UP5A 5JCLA 2C3DA 1EBDA 1LVLA 1PDHA 1ZOYA 3I6DA 4NTEA 4OPCA 4CY6A 1H7WA 2XFOA 3C4AA 2WEUA 2BS3A 2FJAA 3DK4A 1BWCA 4MJWA 3VR8A 4X4JA 1X31B 3GD3A 2HQMA 3ADAB 5EB4A 4Z44A 4U8JA 4A99A 3AYJA 2FJDA 2H88A 1FL2A 2C3CA 1DJQA 2JB2A 4J34A 3QSEA 4GDPA 3URHA 1TYTA 4GRTA 1Q1WA 4AOXA 2YM1A 2V5ZA 2WOVA 1EL5A 1LV0A 2XLUA 4H7UA 1KDGA 4FDCB 3AECA 3ICSA 4D03A 2XCGA 5L46A 3AE4A 2GR1A 2OLNA 3LZXA 3CIRA 2OLOA 3CGDA 3NYEA 1ZKQA 2F5ZA 1EL7A 1PS9A 1GT8A 1REOA 2V3BA 4OPUA 4C77A 3DJGX 4Y4LA 2C65A 2GAHB 2EQ6A 1PBBA 5CQFA 3ZYXA 2GR2A 2X8HA 4A9WA 2XVJA 3GMCA 2I0ZA 5FS8A 4CNJA 3EF6A 2TPRA 1DXLA 4NEVA 3P1WA 4USQA 2YR5A 3REDA 2JB1A 2R4EA 3COXA 2B7RA 1B5QA 2ZBWA 2ZZBA 1VQWA 1XANA 3CPHG 5HY5A 5JCKA 2C75A 5KVIA 4U8LA 3QFBA 2GEWA 1GRTA 2AAQA 2OA1A 3RP6A 2YG3A 5ER0A 4CCQA 2WDVA 2BCPA 4AOSA 1E39A 1LTXR 3P4RA 5M10A 3P4SA 3AD7B 3ATQA 3B6DA 3C4NA 4A6NB 2V3AA 2VVMA 2WP6A 1LQTA 3RHAA 5HXIA 1DOCA 1H83A 3AEDA 3ISHA 1NHPA 3GWFA 1PBDA 2BC0A 4FX9A 2C76A 3AE2A 1SEZA 1S2YA 1S2QA 1GOSA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
4WEYA 1OJTA 3VQRA 2PMTA 2XFPA 1M64A 1GV4A 3UIWA 4EMWA 2L57A 1PL1A 1U3AA 4WETA 1G7OA 3CNJA 3V3OA 5J5NA 1SYRA 5CRHA 4O92A 1M3JA 4EXJA 1NHRA 3RP7A 2IVEA 4H2QA 1XXUA 2BC1A 1XFLA 4APNA 4YJHB 2H30A 4N11A 1RP0A 3KH9A 3IA1A 4EM3A 1Q98A 1OKDA 1K0OA 4G0LA 3ALLA 1E6BA 1EVIA 2OBIA 2JK6A 3UKKA 4L5LA 2O87A 3LJRA 4X9NA 2OKAA 1A24A 4CBQA 3DKSA 2CV4A 2WDQA 4G2EA 2LSTA 3II4A 2P5QA 4YSHA 4XWZA 1CBOA 4U2LA 1GTBA 3EANA 1A2MA 1GERA 5FS9A 1N1PA 2GAGB 1SKSB 2NPBA 3F63A 1CC2A 4AT0A 2BK5A 1TI1A 4Z26A 3EINA 2A8XA 3GH6A 4BK1A 2XLSA 1EOHA 3GUSA 3NK0X 1TK8B 3HVVA 5KOWA 3LORA 1M2AA 4C3YA 3F8RA 2NVLA 3SZWA 1ELIA 3SM8A 2E5VA 4BVYB 2RLIA 2H0HA 4GQCA 1H82A 2QCUA 5J3RA 3KZQA 1JU2A 1GSNA 5ID2A 3A5IA 2LNTA 2H1GA 5M0ZA 2EQ7A 4MZBA 4YQMA 1GALA 2JSZA 4J57A 4JEDA 4EQSA 3HCZA 1XWKA 2YV7A 4E8HA 2B9YA 1LBKA 4L0WA 2YNXA 1DJNA 4HZ4A 3QVPA 1XWBA 1EGOA 2CZ3A 4N9XA 2KOKA 1OKTA 1X5CA 1AUCA 1NENA 5LCZA 3IV4A 3KMNA 3SZCA 3HD5A 3V76A 4NV2A 4LIIA 4FIWA 1E2YA 2HSHA 5IO0A 5GSSA 1G0TA 3KPFA 1NW2A 4AF2A 1GRGA 4ZBDA 5HFGA 5AGYA 2YWNA 3EAOA 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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