3IHGA

Crystal structure of a ternary complex of aklavinone-11 hydroxylase with fad and aklavinone
Total Genus 164
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
164
sequence length
535
structure length
535
Chain Sequence
MNDHEVDVLVVGAGLGGLSTAMFLARQGVRVLVVERRPGLSPYPRAAGQNPRTMELLRIGGVADEVVRADDIRGTQGDFVIRLAESVRGEILRTVSESFDDMVAATEPCTPAGWAMLSQDKLEPILLAQARKHGGAIRFGTRLLSFRQHDDDAGAGVTARLAGPDGEYDLRAGYLVGADGNRSLVRESLGIGRYGHGTLTHMVGVIFDADLSGIMEPGTTGWYYLHHPEFKGTFGPTDRPDRHTLFVEYDPDEGERPEDFTPQRCVELIGLALDAPEVKPELVDIQGWEMAARIAERWREGRVFLAGDAAKVTPPTGGMSGNAAVADGFDLAWKLAAVLQGQAGAGLLDTYEDERKVAAELVVAEALAIYAQRMAPHMAEVWDKSVGYPETLLGFRYRSSAVLATDDDPARVENPLTPSGRPGFRGPHVLVSRHGERLSTVDLFGDGWTLLAGELGADWVAAAEAVSAELGVPVRAYRVGAGLTDPESAVSERYGIGKAGASLVRPDGIVAWRTDEAAADAAQTLEGVLRRVLDR
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
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publication title Structural basis for substrate recognition and specificity in aklavinone-11-hydroxylase from rhodomycin biosynthesis.
pubmed doi rcsb
source organism Streptomyces purpurascens
molecule tags Flavoprotein, oxidoreductase
molecule keywords RdmE
total genus 164
structure length 535
sequence length 535
chains with identical sequence B, C
ec nomenclature ec 1.14.13.180: Aklavinone 12-hydroxylase.
pdb deposition date 2009-07-30

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF01494 FAD_binding_3 FAD binding domain
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.30.9.50 Alpha Beta 2-Layer Sandwich D-Amino Acid Oxidase; Chain A, domain 2 D-Amino Acid Oxidase; Chain A, domain 2 3ihgA02
3.40.30.120 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich Glutaredoxin Glutaredoxin 3ihgA03
3.50.50.60 Alpha Beta 3-Layer(bba) Sandwich FAD/NAD(P)-binding domain FAD/NAD(P)-binding domain 3ihgA01
2X8HA 4Z26A 1XHCA 2C64A 5L46A 1S2QA 1CC2A 1NG3A 1PXCA 3IHGA 3AYJA 4H4RA 5EBKA 4B67A 1IUTA 5C3JA 1H7WA 5IPYA 1NHQA 4YSZA 3GRSA 2GEWA 2WPFA 1RYIA 4KPRA 2WP5A 1ZKQA 4YTPA 1GREA 3COXA 3GDPA 4A65A 2FJAA 4B66A 1KDGA 4RG4A 5FS6A 2GF3A 4BK3A 1CJCA 1GTEA 2VVMA 3NN0X 1GRTA 4J34A 1GRFA 4MJWA 4C5OA 4REKA 1L9EA 3H8IA 3NT6A 1VG9A 3VR9A 2BYBA 3DJGX 2BK3A 3ATRA 4J57A 3ZYXA 5KOWA 2IIDA 2R4JA 3DGZA 3NK1X 4O5UA 2EQ6A 3QFAA 3ICRA 3L1RA 2R0GA 1H82A 1FL2A 3E1TA 4IA5A 3LADA 4YKGA 2A8XA 2B9WA 3AE2A 3UTGA 2XVEA 3NNEA 2CULA 2WU2A 1E1NA 1JNZA 2YR5A 3AB1A 4HB9A 4LU6A 3CNJA 2YR4A 3WE0A 4J56A 3P1WA 4EMWA 2PYXA 3IWAA 3CIRA 1NHSA 2WETA 5FS7A 1PS9A 2V6OA 3ICSA 2R0CA 2OLNA 3QVRA 2YVGA 5FS8A 4AOXA 2JB1A 1D4DA 4DGKA 4E0VA 2OA1A 2YAUA 2TPRA 4FK1A 3EF6A 1F8WA 1DODA 2YVJA 3AE7A 2UZZA 3CNTA 4BK2A 5M0ZA 3M0OA 3C96A 3AD8B 1E7PA 3RNMA 4B64A 1BZLA 3O0HA 3CGCA 4I59A 4H2NA 1K0LA 3LJPA 5BULA 1B8SA 1YY5A 1LQTA 3V76A 2YLSA 3NYFA 1RP0A 4EQWA 2FBWA 1Y56A 3ATQA 1JRYA 2X8GA 3UP5A 4KX6A 4B69A 1E39A 5FMHA 1PBEA 2WESA 4K7ZA 5U63A 2YM1A 1GRBA 4A6NB 3Q9TA 5JCMA 3AEDA 3T37A 5KVHA 4OPDA 1E1MA 1B37A 2GVCA 2Y6RA 2V3AA 2X8CA 1D5TA 1PHHA 4TM0A 3SGLA 4EQXA 3DJEA 3NLCA 1ZP0A 2BA9A 1S3BA 1D4CA 2BC0A 3AYIA 3G5RA 3IF9A 4I58A 4A5LA 4NTCA 1ZMDA 1N1PA 4OPIA 1DXLA 4H4XA 2C73A 2Y6QA 3AYLA 1NEKA 5HY5A 2YG4A 2VOUA 1Q1WA 1ZK7A 4OCGA 4CRTA 3L8KA 3OZ2A 1BF3A 1O94A 3ISHA 1K4QA 3QJ4A 1QJDA 2VQ7A 3FMWA 1MO9A 2C75A 2GR0A 2JB3A 2YG5A 1NHPA 1D7YA 3RP6A 4OVIA 1PJ6A 4GDPA 4U8JA 1M64A 3F8DA 1ONFA 5IQ1A 1GT8A 3B6DA 3LZWA 2BC1A 3CPIG 2O9ZA 4K5SA 3EANA 2VRMA 4EMIA 3AE3A 4OPTA 3LB8A 3DJDA 3UOVA 1ELIA 5EOWA 2GRTA 3UOZA 4YTNA 1NDAA 1EL7A 1XDIA 3NK2X 4H4PA 2GR2A 1CC4A 1TRBA 4EM3A 3I6DA 3ZDNA 2PHHA 1DOEA 2XCGA 3ADAB 1BGJA 3SM8A 4YWOA 1N4WA 4FX9A 3IC9A 1L9CA 3B3RA 1IUSA 1CJ3A 1KNRA 3CTYA 3GSIA 4NZHA 4O5QA 1B4VA 5FS9A 2GR1A 5M10A 5KRQA 4U8LA 4GR1A 3DK4A 4U8OA 1LV0A 4YSYA 3QSSA 5JCIA 2XFNA 4K5RA 2RGJA 2CVJA 2Q0KA 1N4UA 1D7LA 1KFYA 3M13A 5BUKA 4APNA 2YG6A 3ALLA 3UKQA 4J2WA 4JQ9A 3HZLA 4U2TA 1JOAA 1PBCA 3UKAA 3NTAA 3GMBA 3R9UA 4A79A 2BCGG 4YT0A 5CKUA 2YR6A 4H4YA 2J3NA 2WOIA 2ZZBA 4B63A 4PABA 4M52A 2X99A 2E4GA 2JB2A 3QFBA 4JY2A 2E5VA 4H4QA 4K2XA 4CCQA 1X31B 2C7GA 4H2PA 5HXIA 4Y4NA 3AE5A 4U8KA 1HYUA 1JRXA 1EL9A 3GDNA 2WOVA 2RGOA 1GESA 4H4WA 1GPEA 3BI5A 2YLXA 1GEUA 5JCKA 2GQFA 2GAGB 2YLWA 3UTHA 2X3NA 1IUVA 3P4PA 3QVPA 4Z24A 4WX1A 3AE8A 4XWRA 1N4VA 4BJZA 4ZN0A 2Q0LA 4Z43A 1CJ2A 4ICYA 1H84A 2EQ9A 3CPJG 2F5ZA 1H81A 4U2SA 3LOVA 2WHDA 1ZMCA 2CFYA 1FOHA 3CNPA 4NTDA 2YG3A 4OPLA 2C72A 4B1BA 4TLXA 2C70A 5GSNA 4X4JA 1KF6A 1FEAA 1GV4A 2VZ2A 3FPZA 3BNMA 2R45A 1IUUA 1CBOA 2XFOA 3GWFA 2C66A 4NEWA 5U25A 4AT2A 5J60A 3VQRA 1TYPA 4C3YA 3F8PA 1CJ4A 3UKPA 2EQ7A 2V3BA 4GRTA 4UP3A 4JNQA 2Q6UA 4GF7A 3QSEA 4AP1A 2YLRA 3V3OA 4J33A 1NENA 1XANA 3RP7A 3P4SA 4H2RA 2C3DA 3S5WA 2B7SA 4DSGA 3OC4A 3AE6A 2QA2A 2YLZA 4UDRA 1PN0A 3KU9A 2XFPA 5KWFA 5JCNA 3DMEA 3DK9A 1ZY8A 3DJJA 3SFEA 4U8IA 2VRLA 1KNPA 3G5SA 1PDHA 2IVDA 4XWZA 2GB0A 4A9WA 2GMHA 2AQJA 2XVJA 2R46A 3LZXA 2XVIA 2RABA 3UTFA 2XYOA 5KVIA 1W4XA 1PXBA 4C3XA 4OPGA 4ZCCA 1GTHA 1LPFA 1IUWA 3CN8A 4H4UA 2R9ZA 4Z25A 1UKVG 5TR3A 4Y4MA 1ZOYA 4CNKA 3DGHA 4H4ZA 5IQ4A 1F6MA 5KXJA 5U1OA 1NG4A 1H86A 5ER0A 3H4KA 2ACZA 2WEUA 1TDFA 2FJBA 1XPQA 1FCDA 4PAAA 4LIIA 2XVFA 3NG7X 3UKFA 4USQA 1QO8A 2WP6A 4N9XA 1V59A 3UKLA 2H89A 3GWDA 3AEEA 1GERA 3KD9A 4BK1A 2WS3A 1LTXR 1NHRA 3VR8A 4A7AA 4IVMB 4ADWA 5JCLA 4A6NA 3DA1A 4TM4A 1GRAA 3KLJA 4UDPA 4NTEA 3IHMA 2V5ZA 2W0HA 3VRAA 1JU2A 4Z2UA 1GNDA 1OJAA 3DK8A 2WQYA 3G5QA 2XFQA 4HA6A 1CL0A 2BS3A 4CNJA 1KSSA 3II4A 2B7RA 3EPTA 4TLZA 3NYEA 1JRZA 4EMJA 5DBJA 2BK4A 3BI4A 1Y0PA 1L0VA 3NHOX 4FDCB 3VRDB 4RSLA 1ZDLA 2R0PA 1IUXA 2Z5XA 1TDEA 2GH5A 5J7XA 2APGA 2GV8A 2YG7A 3NK0X 4JNAA 4GDEA 1E6EA 2B9XA 3AWIA 2JBVA 2DKIA 3UOYA 4EM4A 1LJ1A 2V60A 4H4SA 1E1KA 3CGBA 2Q7VA 1O5WA 2C76A 2A87A 3P9UA 3K7MX 5HYMA 2BK5A 2BXSA 3M12A 2R4EA 3NRNA 4NEVA 1OJCA 1YKJA 1DOCA 1GXFA 4OPCA 3KKJA 1O95A 1YQ3A 2YQUA 2JK6A 3QSMA 3P4QA 4EQRA 1GRHA 2C3CA 4P9SA 1DJNA 3NTDA 2QAEA 4USRA 1TDOA 3K7TA 3BHFA 2XLTA 1H6VA 2WP9A 5C2TA 3K30A 5LV9A 2B9YA 2VVLG 2V61A 2FJDA 5CQFA 2YM2A 4K8DA 2OLOA 3BHKA 4GCMA 2HQMA 2WBAA 1MOKA 1PXAA 2X50A 4X9NA 3NKSA 4J31A 3AE1A 4AP3A 2B76A 4B65A 2NVKX 2WDVA 3VRBA 4GUVA 4H7UA 1PBDA 1GRGA 1TYTA 1PBFA 2XLUA 4A99A 3ALMA 3KVEA 4CY8A 1YQZA 3UOXA 3PVCA 2BCPA 4WCTA 4IA6A 1YQ4A 1LQUA 2GMJA 4EIQA 2OAMA 4Z2RA 1DOBA 3GYJA 1F8SA 2VQBA 1LVLA 4K22A 3AD7B 1F8RA 1P2HA 4IVOB 3UKKA 2CDUA 3BNUA 4JN9A 4H4VA 4Z44A 4JY3A 3GD3A 4C77A 3C4AA 1VG0A 3AEGA 3DH9A 1Q9IA 1PBBA 4DSHA 3H8LA 5HHFA 3JSKA 1OJTA 4OPUA 3K7QX 1VQWA 3GD4A 2XLSA 5EB5A 4AOSA 3S61A 3V3NA 1TDNA 3I3LA 2XVHA 1BWCA 1H7XA 1E1LA 1L9DA 2H88A 1EL5A 1SEZA 2A89A 2JKCA 2XLPA 4CCRA 4U8PA 3UP4A 2C65A 3D1CA 1CHUA 4UDQA 2JAEA 3ALJA 3ITJA 4H4TA 1P2EA 1F3PA 2AR8A 1RSGA 2ZZCA 2BACA 2YLTA 3ABVA 1OJDA 2XDOA 3ICTA 1GOSA 3URHA 4YXDA 2XFUA 1VDCA 1BGNA 2QCUA 1ZOVA 4U8NA 3UKHA 4YKFA 3AEAA 3AEFA 2YVFA 3D8XA 2IVEA 1EL8A 2WPCA 5KOXA 4TM1A 1M6IA 1BKWA 4D03A 2NPXA 2EQ8A 1CF3A 3CNSA 2DKHA 3PS9A 4J36A 1DNCA 4Y4LA 1COYA 1PJ7A 3NN6X 2ZBWA 3CGEA 5EB4A 3P4RA 1DJQA 3UCLA 3BI2A 2WU5A 4D04A 2BS2A 2C67A 3NGCX 3NIXA 4XXGA 1TDKA 1GALA 4RG3A 4C74A 3FBSA 2QA1A 1JEHA 4U8MA 1S3EA 2ARDA 1NAAA 1K0JA 1KSUA 3SFDA 3UTEA 2XLRA 3GRTA 3REDA 2Z5YA 4AT0A 2AAQA 5BRTA 2BS4A 4IV9A 2BABA 1S2YA 4CBQA 3KA7A 2VVLA 3PO7A 4DNAA 1B5QA 1OJ9A 4X9MA 1EBDA 1QLBA 2WDQA 3RHAA 1GSNA 3AD9B 4LA1A 2I0ZA 4BV6A 3NYCA 4CY6A 3FG2P 1Z6LA 4FK1C 1VRQB 1ZX9A 5BVAA 1IJHA 3GYIA 3AXBA 1REOA 4JDRA 4ECHA 1Y56B 1FECA 2GAHB 2OALA 1FEBA 2GQWA 2WOWA 5GRTA 4EIPA 2E1MA 4YSHA 4BURA 2YWLA 1GETA 4H50A 3KPFA 3Q6JA 1CC6A 1H83A 3CPHG 3CNDA 2FJEA 1Q1RA 1AOGA 3GMCA 3CGDA 2BXRA 2ZZ0A 4Z2TA 3AE4A 4BJYA 1PJ5A 4ZCDA 4YSXA 2GR3A 3RP8A 4YTMA 2TMDA 3FIMB 4EQSA 3AE9A 2WPEA 3EAOA 1MXTA 3LXDA 1JNRA 3AEBA 2RGHA 1K0IA 3C4NA 4H2QA 4B68A 2WDRA 3AECA 3NH3X 3F8RA 1NPXA 1D4EA 3SQPA 4U2LA 4TM3A
chains in the Genus database with same CATH superfamily
4TVEA 4NPBA 2FGXA 2C64A 1CC2A 1YDKA 3IHGA 1M0UA 5EBKA 1IUTA 3Q18A 2OA7A 2GEWA 5IO0A 2C0FA 3VLNA 1ZKQA 4A65A 3BBYA 4PQIA 5J41A 5FS6A 3IHQA 3FZ9A 1A2MA 2P0GA 1GTEA 2C3QA 4MJWA 4E8HA 2DJKA 4MP4A 2YWNA 1F3AA 3ZYXA 2BK3A 5IMFA 2YWIA 3DGZA 4DSRA 3NK1X 2EQ6A 1GRXA 3FY7A 3US3A 4IA5A 1O6JA 4PUFC 3ZVJD 2XPDA 2X49A 3UTGA 5KMRA 2CULA 1K0AA 1C72A 4L0WA 2YR4A 4L5LA 3P1WA 1PS9A 4KUNA 3EE2A 3TDGA 4BVXB 2YVGA 1H75A 4OMVA 4AOXA 4E0VA 2OA1A 2C3TA 6GSVA 4NHZA 1UN2A 4L5OA 2CT6A 3CNTA 3VI5A 3RNMA 3M0OA 3C96A 1E7PA 1K0BA 3D22A 1BZLA 3CGCA 1FVJA 2WCIA 1XWGA 4YQUA 1B8SA 2FY6A 3G9BA 2GLRA 4ZB6A 1JRYA 4OO5A 4G6GA 5CO3A 2HSMA 4GWRA 1M2DA 4A6NB 1GRBA 3Q9TA 1OC9A 2DMMA 3IR4A 4OPDA 2V3AA 4TM0A 4EQXA 2I1UA 5B8BA 1ZP0A 2BA9A 4NTCA 4KCAA 2BRYA 1N1PA 1DXLA 4H4XA 2Y6QA 5ECOB 1Q1WA 1DE2A 1BAYA 4QQ7A 1O94A 3A5WA 3QJ4A 1B4PA 4ML6A 1GSSA 2GR0A 1D7YA 4OVIA 1SL2B 4KX4A 1KEBA 3F8DA 1ONFA 5IQ1A 1GT8A 1XFLA 2BC1A 3QAVA 3FW2A 2O9ZA 3EANA 3AE3A 3UOZA 3LB8A 2HLSA 1ELIA 2GRTA 4YTNA 1EL7A 5GZZB 3NK2X 4YJFA 1N8JA 4EM3A 2LRTA 3SM8A 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chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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