3IHGA

Crystal structure of a ternary complex of aklavinone-11 hydroxylase with fad and aklavinone
Total Genus 164
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
164
sequence length
535
structure length
535
Chain Sequence
b'MNDHEVDVLVVGAGLGGLSTAMFLARQGVRVLVVERRPGLSPYPRAAGQNPRTMELLRIGGVADEVVRADDIRGTQGDFVIRLAESVRGEILRTVSESFDDMVAATEPCTPAGWAMLSQDKLEPILLAQARKHGGAIRFGTRLLSFRQHDDDAGAGVTARLAGPDGEYDLRAGYLVGADGNRSLVRESLGIGRYGHGTLTHMVGVIFDADLSGIMEPGTTGWYYLHHPEFKGTFGPTDRPDRHTLFVEYDPDEGERPEDFTPQRCVELIGLALDAPEVKPELVDIQGWEMAARIAERWREGRVFLAGDAAKVTPPTGGMSGNAAVADGFDLAWKLAAVLQGQAGAGLLDTYEDERKVAAELVVAEALAIYAQRMAPHMAEVWDKSVGYPETLLGFRYRSSAVLATDDDPARVENPLTPSGRPGFRGPHVLVSRHGERLSTVDLFGDGWTLLAGELGADWVAAAEAVSAELGVPVRAYRVGAGLTDPESAVSERYGIGKAGASLVRPDGIVAWRTDEAAADAAQTLEGVLRRVLDR'
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
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molecule keywords RdmE
publication title Structural basis for substrate recognition and specificity in aklavinone-11-hydroxylase from rhodomycin biosynthesis.
pubmed doi rcsb
source organism Streptomyces purpurascens
molecule tags Flavoprotein, oxidoreductase
total genus 164
structure length 535
sequence length 535
chains with identical sequence B, C
ec nomenclature ec 1.14.13.180: Aklavinone 12-hydroxylase.
pdb deposition date 2009-07-30

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF01494 FAD_binding_3 FAD binding domain
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.30.9.50 Alpha Beta 2-Layer Sandwich D-Amino Acid Oxidase; Chain A, domain 2 D-Amino Acid Oxidase; Chain A, domain 2 3ihgA02
3.40.30.120 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich Glutaredoxin Glutaredoxin 3ihgA03
3.50.50.60 Alpha Beta 3-Layer(bba) Sandwich FAD/NAD(P)-binding domain FAD/NAD(P)-binding domain 3ihgA01
1VG0A 1GETA 3BI5A 5KOXA 2WDRA 4IA6A 3UP4A 4CBQA 3RP6A 1GV4A 1VRQB 3VR9A 5KRQA 2XLPA 2AAQA 2ARDA 3AEAA 5IQ4A 2V6OA 2BK4A 1YQ3A 1FECA 4YTPA 1D4EA 3G5RA 1P2HA 1S2QA 4UDPA 3SFEA 3QJ4A 3NNEA 2DKIA 1K0LA 2GH5A 1ZK7A 3CPHG 3NN6X 3QVPA 1YQ4A 4H4QA 1GRAA 1VG9A 2WPCA 4H4PA 4K22A 1LQUA 2JK6A 3CIRA 3GDNA 4GR1A 1DOCA 3T37A 3UKPA 1GSNA 3VQRA 1LQTA 1LVLA 1N4WA 3COXA 2FBWA 1XHCA 2GVCA 4B63A 2YR6A 2GAGB 1TYPA 2C75A 3B6DA 2ZBWA 3OC4A 3NYCA 1GRGA 3PS9A 1UKVG 2JBVA 1BGJA 2C64A 3NKSA 4GRTA 1E39A 2WOIA 3L8KA 1QJDA 3FG2P 3NRNA 1GNDA 3IHGA 3KPFA 4YSYA 4USQA 2VQ7A 1GREA 3GSIA 1Y0PA 3FPZA 1PN0A 1LV0A 1ZOYA 2CULA 3LZXA 3EF6A 1L9CA 5U63A 4RG4A 3ABVA 5FS9A 1PHHA 5CQFA 1H81A 3G5SA 3GRTA 4JDRA 4TM3A 3NH3X 2Q0KA 4X4JA 1E1MA 1PXCA 3LXDA 3JSKA 5BULA 4J31A 2I0ZA 2WU2A 3O0HA 4K5SA 4TLZA 1Q9IA 2RGHA 1OJCA 2Q6UA 1LTXR 2WDQA 4A5LA 1ELIA 5KXJA 3KU9A 4LU6A 4UP3A 2Y6RA 2WHDA 3BNMA 3PO7A 3H8LA 4BURA 4Z2UA 2WPFA 1H84A 3M13A 3C96A 5EOWA 4YSHA 5IPYA 4Z43A 3LOVA 3UKAA 3RP7A 4YKGA 4PABA 4H2NA 1NPXA 5JCIA 4APNA 2ZZ0A 2Q0LA 2UZZA 2OA1A 2C76A 3UKHA 4CCRA 1TDNA 1H6VA 1K4QA 4D04A 1NAAA 4CY6A 3F8RA 2YVJA 1XPQA 2H88A 3VRAA 1H86A 2ZZCA 2B9XA 2GB0A 3C4AA 2YAUA 1FOHA 2GF3A 3FMWA 2CVJA 2ZZBA 2EQ8A 4EQXA 3AEDA 4OVIA 3K7QX 4J36A 1QO8A 4B65A 1NHSA 2GR3A 1B8SA 2BC0A 3RHAA 2C7GA 3P1WA 3UTHA 2YG5A 5HHFA 4U8JA 1N1PA 1OJAA 1FEBA 3G5QA 2Z5XA 4U8NA 3SFDA 3AE8A 5FS8A 3UKLA 4ECHA 2JAEA 4FK1A 4C77A 5KWFA 2YG3A 1RYIA 3UTGA 2X3NA 2B7SA 2BS4A 2BCPA 2GR1A 1Q1WA 3P4QA 1XANA 1E7PA 4H4TA 1CC2A 4CY8A 4H4ZA 5C3JA 1PBCA 4NTCA 4EQSA 4BJZA 1BZLA 4I58A 3UKQA 5KVHA 3WE0A 4GDEA 2H89A 4UDQA 4DNAA 4H4VA 3NHOX 1Y56A 3F8DA 3NTAA 1CJCA 2YG6A 2R46A 2V61A 3CNDA 4EMJA 3V3OA 5C2TA 3M0OA 2VZ2A 4J2WA 1O94A 4Z26A 3P4PA 1E1KA 1ZMDA 3FIMB 3C4NA 2FJDA 2APGA 5DBJA 2EQ6A 4YSXA 3UOYA 2XLRA 2XLSA 4AOSA 3GD3A 4OPDA 4EM3A 3AEEA 3RNMA 4EMWA 1L9DA 4U8KA 4KPRA 2YWLA 3URHA 1CF3A 3GWFA 2YLRA 1JRYA 1DXLA 5EBKA 2OAMA 3II4A 1F8RA 3CPJG 3QFBA 4H4XA 4Z2RA 4O5UA 2CFYA 2E1MA 1CJ3A 3LB8A 2GAHB 4N9XA 1EL5A 2BABA 2GRTA 2XFOA 1PJ7A 3IF9A 1ZP0A 2IIDA 4OPGA 2YR4A 4JNQA 3KKJA 3IHMA 1H82A 1W4XA 1KF6A 5FS7A 3VRBA 3AE7A 3NT6A 4EQRA 2C3DA 1SEZA 1KSUA 2VVLA 5M0ZA 5HY5A 1BF3A 1DJQA 3CGDA 4I59A 3UKKA 4EIQA 2WP5A 4FDCB 4IVOB 4ZCCA 5LV9A 1PXAA 1NDAA 3ICTA 4K5RA 3P4RA 3DJDA 2YVGA 4K8DA 5EB5A 4A6NB 1KSSA 2V60A 3K30A 3CNSA 4YXDA 1ZKQA 3AYLA 1CHUA 3SQPA 3NYEA 2FJBA 3CTYA 4TLXA 1H7WA 1GXFA 1F6MA 4TM1A 2XFNA 3NK1X 4H7UA 5GSNA 3NIXA 2W0HA 2WP6A 3CNJA 4AT2A 1VDCA 1JNRA 2YVFA 4H50A 2QA2A 2NPXA 1Q1RA 2YM1A 3NK2X 4Y4LA 2YM2A 1AOGA 3IC9A 4YWOA 4AP1A 4C74A 3BHFA 1CJ4A 1PDHA 2O9ZA 2V5ZA 3ATRA 1GTHA 2C67A 2JB3A 4A7AA 4Z2TA 2A8XA 4B67A 1L0VA 1DOEA 3GWDA 4A99A 1S3BA 3DA1A 4XWRA 3KVEA 2C3CA 3PVCA 4BJYA 3SGLA 4OPLA 4OPIA 1NENA 4NTEA 3M12A 1GRTA 2TPRA 1E1LA 3AE4A 5HXIA 2B7RA 2BK3A 4K7ZA 1TDEA 3LJPA 2GQWA 3DJGX 2C72A 3I3LA 2R4JA 2RGOA 5KVIA 2AR8A 3ATQA 1ZX9A 1ZMCA 2WESA 1IUSA 2GR2A 3E1TA 3GMBA 3I6DA 3K7TA 4U8IA 5BVAA 1F8SA 2E4GA 3UCLA 4Z25A 2J3NA 4ADWA 4BV6A 2WU5A 1JU2A 2WOWA 2XVEA 2C66A 4Z24A 2GMJA 1FL2A 1N4VA 4UDRA 3KLJA 1GRBA 1F8WA 2YG4A 1D7LA 4EMIA 2JKCA 1LJ1A 1B4VA 3DMEA 3UOZA 1KNRA 3BNUA 4RG3A 1GPEA 3P4SA 2CDUA 3DK8A 4Y4MA 1NG3A 4H4SA 2GQFA 3EANA 4YKFA 3R9UA 3DJEA 2FJAA 1D4CA 3NTDA 2WETA 3QVRA 4CNJA 1PJ6A 2BC1A 3QSMA 4U2LA 2WPEA 4Z44A 3BI2A 3KD9A 3CPIG 1NHPA 2GMHA 4EM4A 1NEKA 1E6EA 3IWAA 1DJNA 1GTEA 1CC6A 2PYXA 3NLCA 1B5QA 2BCGG 1MOKA 1K0JA 1PBEA 2QCUA 2Z5YA 4M52A 3GRSA 2B76A 3H4KA 3F8PA 3QSSA 3GYJA 1S2YA 4JY2A 1QLBA 4H4WA 3CNPA 4CCQA 1BGNA 1M6IA 1YQZA 3DGZA 3CNTA 3NG7X 3QSEA 3AYJA 4GDPA 2XFPA 1YKJA 2VOUA 3ICRA 2NVKX 3DGHA 5EB4A 3L1RA 1JRZA 1LPFA 1EBDA 1Z6LA 2BK5A 4PAAA 2C73A 1CJ2A 3V76A 4YTNA 1IUTA 4B68A 1E1NA 3AE9A 2WOVA 4JQ9A 1PBFA 3AWIA 1IUWA 5KOWA 2XDOA 3ISHA 5FS6A 3D8XA 1IUVA 4KX6A 3Q9TA 4FK1C 3AD9B 3ADAB 4MJWA 4NEVA 4A9WA 1CC4A 4WCTA 4A79A 3AEFA 3VRDB 1TDKA 2R0CA 4X9MA 5ER0A 1BKWA 4YTMA 1EL9A 1DOBA 2XFQA 3AYIA 4B69A 4C5OA 1GERA 4YSZA 5JCNA 2XYOA 2B9YA 1YY5A 1GEUA 3BI4A 1D4DA 1ONFA 2HQMA 4GCMA 4DSGA 5BRTA 1Y56B 4H2QA 2PHHA 3H8IA 5HYMA 1VQWA 2Q7VA 3AD8B 4AP3A 2X99A 2YR5A 4J34A 2R9ZA 3V3NA 2BXSA 1COYA 1D7YA 2OLOA 4BK3A 3ALMA 1PXBA 3CGCA 3FBSA 3LADA 5GRTA 3GD4A 3VR8A 4E0VA 2XVIA 3UTEA 3UKFA 3ALJA 1B37A 1RP0A 1N4UA 2GV8A 3NGCX 1CL0A 2VRLA 2X8GA 2A89A 2GEWA 2QA1A 5U1OA 1KFYA 5JCKA 3HZLA 4J57A 4ICYA 3ICSA 1IJHA 1HYUA 3B3RA 2BS2A 1CBOA 4USRA 4YT0A 1PJ5A 1GRFA 5U25A 4OPTA 2BA9A 1PS9A 2XVHA 4J56A 4JN9A 2YQUA 4H2PA 2DKHA 1JOAA 2C70A 2XLTA 4IA5A 4HB9A 4OPUA 4NEWA 4REKA 1P2EA 3CGEA 3K7MX 3AE1A 4X9NA 4IVMB 2OALA 2FJEA 4GF7A 2IVEA 5FMHA 1OJTA 3AD7B 3ZDNA 4C3YA 1DNCA 3ALLA 2EQ7A 2A87A 5BUKA 3REDA 2R0GA 5M10A 5J7XA 4B66A 1M64A 1TDOA 3BHKA 3RP8A 4AOXA 4BK2A 1X31B 2X50A 3DH9A 3AB1A 4TM4A 3SM8A 4IV9A 3UOVA 1K0IA 4D03A 4J33A 4H4YA 1GALA 2B9WA 2VQBA 3DK4A 1TRBA 3Q6JA 1IUUA 2BXRA 3AEGA 1KNPA 2R0PA 1GT8A 1TYTA 1NHRA 2F5ZA 2ACZA 2V3BA 1JRXA 4EQWA 5JCMA 3CN8A 1H83A 3S5WA 4OCGA 4WX1A 3DK9A 1TDFA 3CGBA 2R45A 1PBBA 3KA7A 2YLTA 2IVDA 2YLSA 4GUVA 4H4UA 5TR3A 5L46A 3GYIA 2YLXA 4LA1A 2YLWA 2RABA 4U2SA 4RSLA 4C3XA 2AQJA 1NHQA 1KDGA 4AT0A 3NYFA 4XWZA 4DGKA 3AXBA 4OPCA 2YLZA 2C65A 1L9EA 4U8MA 1ZY8A 2BYBA 1REOA 1GOSA 4FX9A 1GESA 2X8HA 4EIPA 2XCGA 4TM0A 4U8LA 2GR0A 4K2XA 3NK0X 1FEAA 1F3PA 2TMDA 2WP9A 3UOXA 3AEBA 4H4RA 5J60A 2R4EA 1V59A 1IUXA 3GDPA 3UTFA 1BWCA 2XVFA 3NN0X 4ZCDA 2EQ9A 2JB1A 1PBDA 1NG4A 3OZ2A 1MXTA 2WDVA 3AE6A 2BACA 3GMCA 3D1CA 1H7XA 2V3AA 1D5TA 4LIIA 4CRTA 2XLUA 4U8OA 4DSHA 3AE5A 4ZN0A 2Y6QA 3LZWA 4B64A 3EPTA 2VVMA 2WQYA 1JEHA 4H2RA 2X8CA 4P9SA 3ZYXA 2VVLG 2JB2A 4HA6A 4JNAA 4B1BA 4O5QA 2BS3A 4U8PA 1MO9A 1O5WA 5JCLA 5IQ1A 2YG7A 2VRMA 3QFAA 3UP5A 2E5VA 4Y4NA 3S61A 4JY3A 2XFUA 1EL7A 1S3EA 1O95A 1DODA 1RSGA 3P9UA 4U2TA 1OJDA 1EL8A 4A65A 4NZHA 2WBAA 3AE2A 1OJ9A 2OLNA 2WEUA 1FCDA 4NTDA 4XXGA 2QAEA 1XDIA 4BK1A 3AE3A 4A6NA 3AECA 2RGJA 3ITJA 2WS3A 1JNZA 3DJJA 1ZOVA 2XVJA 3EAOA 1GRHA 1ZDLA 5CKUA 4CNKA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
5LD0A 3BI5A 4K8MA 4CBQA 1EOHA 4YQUA 1SKRB 3GL3A 1T4ZA 3TCOA 3RP6A 5KRQA 4G9KA 2AAQA 4V2NA 5IQ4A 1M99A 1N2AA 4QQ7A 3RPPA 4POMA 3EU4A 2GH5A 1K0LA 1ZMAA 4HUAA 3VWXA 1YQ4A 1ABAA 1GRAA 1VG9A 3ZNQA 1HNBA 2C3NA 1GSDA 3ZVJD 1LQTA 1LVLA 1I5GA 3DVWA 3F4RA 4HDEA 1TYPA 3L0HA 3B6DA 3FYGA 1MDIA 1BGJA 1T00A 4GRTA 3M3MA 2WOIA 1QJDA 3MDKA 4I2TA 5J5NA 2MYGA 3FPZA 1LV0A 3W8JA 3JCML 3GHAA 1A8LA 3ABVA 5FS9A 2LV3A 1PHHA 2PBJA 5H5SA 5CQFA 4PQ1A 6GSWA 3SZWA 4JDRA 1GP1A 4X4JA 4POBA 3KD0A 3LXDA 3WT1A 1K0CA 2I0ZA 4TLZA 3O0HA 4K5SA 3ED3A 2HRNA 1OAZA 4ZXGA 2QGVA 4AJ8A 1S3RA 4N11A 1ZGNA 3HYWA 3KZQA 3GN3A 3C7MA 2WPFA 3C96A 4Z43A 4MK3A 1T1VA 4PQIA 4YKGA 2YWIA 4AF2A 2LUSA 3QAGA 2XBQA 4EDZA 5KN2A 4KA0A 1TDNA 3GMFA 2E2MA 1K4QA 1FG4A 5AIXA 1XPQA 3K8NA 2X64A 2ZZCA 4WEYA 4PNFA 4BVXB 1B8XA 1VF1A 2V32A 4ULXA 1LU4A 3FEUA 3HY2A 2H76A 3AEDA 2MBSA 1G0TA 2C7GA 3Q18A 3UVTA 1SL1B 4WR4A 3GX8A 2Z5XA 3IPZA 4U8NA 4ECHA 1AIUA 4FK1A 3UTGA 2GR1A 4ZB9A 3M1GA 1E7PA 3TJBA 2QKEA 5KVHA 4LLRA 3HHVA 3MYDA 4H4VA 1Z6NA 4FH8A 3HJMA 3ZIVA 3NHOX 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1NEKA 3IWAA 1XW6A 2FY6A 4NHZA 5A5KA 1GTEA 3NLCA 1ZYNA 1X9SB 2QCUA 2Z5YA 1GUKA 2KUCA 3HZ4A 3UEMA 1S2YA 1M7TA 2YZUA 4H4WA 2RUEA 5FHIA 3DGZA 4HJMA 3NG7X 3ZL5A 1JLVA 3AYJA 2A4VA 4EF0A 5EB4A 2EIOA 4I6XA 3KXOA 4N10A 3WGDA 1EBDA 2MBTA 4DSRA 1CJ2A 2C73A 3V76A 1IUTA 1G7EA 2V2GA 2HSYA 1E1NA 4IJ3A 3E0UA 4V1Ap 3AE9A 3KMNA 2F9SA 2WOVA 2HT9A 1PBFA 5KN1A 1EZKA 2YOIA 1SYRA 3ZFLA 4KAEA 4EKZA 5G5EA 1B4QA 5FS6A 4G2EA 5ELAA 3VLNA 3ADAB 5G1LA 2A2SA 4NEVA 3R3EA 1CC4A 4WCTA 3UIWA 3VRDB 1A2MA 1O85A 4X9MA 1UVZA 4OCEA 4L5LA 4YTMA 2XFQA 1GERA 3G7IA 4JZQA 4ZL7A 3BI4A 1R4WA 1M2AA 2HYXA 5BRTA 1OE8A 1S3AA 3CBUA 1F37A 3U6VA 3AD8B 2YANA 2DMMA 4YQVA 3KM6A 1XCCA 4KB3A 3V3NA 2BXSA 1COYA 1D7YA 3HXSA 3CTGA 22GSA 1AQXA 3M8NA 3LADA 4ACSA 2FWEA 1OC8A 2WFCA 3PR8A 4PGTA 4L5OA 2O87A 3QFBC 2B1KA 5DQYA 3GA4A 4KF9A 2A89A 4DSQA 1GTUA 4ICYA 2BS2A 2H72A 1CBOA 4YT0A 1PJ5A 2L59A 3LEFA 17GSA 1PS9A 3VWVA 4JN9A 3ZMLA 1DDOA 4MZCA 3CMIA 4H2PA 1XVQA 2YJHA 2IMDA 2ES7A 3QAVA 4OPUA 5DALA 5FT3A 2E7PA 4REKA 3K7MX 3AE1A 4HSCX 2OE3A 4QFDA 1UN2A 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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