3IHGA

Crystal structure of a ternary complex of aklavinone-11 hydroxylase with fad and aklavinone
Total Genus 164
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
164
sequence length
535
structure length
535
Chain Sequence
MNDHEVDVLVVGAGLGGLSTAMFLARQGVRVLVVERRPGLSPYPRAAGQNPRTMELLRIGGVADEVVRADDIRGTQGDFVIRLAESVRGEILRTVSESFDDMVAATEPCTPAGWAMLSQDKLEPILLAQARKHGGAIRFGTRLLSFRQHDDDAGAGVTARLAGPDGEYDLRAGYLVGADGNRSLVRESLGIGRYGHGTLTHMVGVIFDADLSGIMEPGTTGWYYLHHPEFKGTFGPTDRPDRHTLFVEYDPDEGERPEDFTPQRCVELIGLALDAPEVKPELVDIQGWEMAARIAERWREGRVFLAGDAAKVTPPTGGMSGNAAVADGFDLAWKLAAVLQGQAGAGLLDTYEDERKVAAELVVAEALAIYAQRMAPHMAEVWDKSVGYPETLLGFRYRSSAVLATDDDPARVENPLTPSGRPGFRGPHVLVSRHGERLSTVDLFGDGWTLLAGELGADWVAAAEAVSAELGVPVRAYRVGAGLTDPESAVSERYGIGKAGASLVRPDGIVAWRTDEAAADAAQTLEGVLRRVLDR
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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publication title Structural basis for substrate recognition and specificity in aklavinone-11-hydroxylase from rhodomycin biosynthesis.
pubmed doi rcsb
molecule tags Flavoprotein, oxidoreductase
source organism Streptomyces purpurascens
molecule keywords RdmE
total genus 164
structure length 535
sequence length 535
chains with identical sequence B, C
ec nomenclature ec 1.14.13.180: Aklavinone 12-hydroxylase.
pdb deposition date 2009-07-30

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF01494 FAD_binding_3 FAD binding domain
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.30.9.50 Alpha Beta 2-Layer Sandwich D-Amino Acid Oxidase; Chain A, domain 2 D-Amino Acid Oxidase; Chain A, domain 2 3ihgA02
3.40.30.120 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich Glutaredoxin Glutaredoxin 3ihgA03
3.50.50.60 Alpha Beta 3-Layer(bba) Sandwich FAD/NAD(P)-binding domain FAD/NAD(P)-binding domain 3ihgA01
2ZBWA 2YLXA 2RGJA 5FMHA 2BC0A 5M10A 4GDPA 1SEZA 3AE6A 3SFDA 4YKGA 2V61A 4YWOA 1DJQA 2WPEA 2YM2A 5JCIA 1VQWA 4C77A 2YQUA 3FG2P 2VRMA 4H2NA 1GOSA 2YLSA 4YT0A 1GRGA 3AE1A 4KX6A 3QSEA 3G5RA 4O5UA 4TM0A 3GRSA 3REDA 1N4UA 2YR6A 4WCTA 1XPQA 1E39A 2C3DA 3P4RA 5JCKA 2C70A 2I0ZA 2R4JA 3CGBA 4AT2A 1NG4A 2UZZA 1PHHA 1TYPA 2YAUA 1EL7A 1DOBA 1NEKA 2VVMA 4U8OA 3DK8A 3NT6A 4XXGA 2Q0KA 1K0LA 1LV0A 1S3EA 1DOEA 4B64A 4UP3A 2RABA 3II4A 4Z2UA 2BA9A 2YWLA 1D7LA 4H4QA 2WQYA 2BS2A 1GXFA 1GESA 3AD9B 4I58A 4GRTA 4C5OA 4GF7A 4AOXA 2C65A 4Z44A 1JEHA 1GRBA 2Z5YA 3DJEA 3SGLA 3H8LA 3BHKA 3F8PA 3QFAA 1F3PA 4UDRA 1CF3A 1QJDA 4J34A 2V6OA 4BJZA 3NTAA 1XHCA 5KOWA 3DJDA 2XFPA 4H4TA 3LXDA 3URHA 2DKIA 3LJPA 1PXAA 5EB5A 2RGHA 1NHQA 2XLTA 2ZZBA 3ZYXA 2XVHA 3LB8A 1DOCA 4O5QA 4EQRA 4U8IA 2C7GA 3M12A 1DJNA 1CC2A 2NVKX 3CPHG 4AT0A 3ICRA 5JCLA 2C66A 3BHFA 1PBBA 3KD9A 1BGJA 2RGOA 4YTNA 2QA1A 2VVLG 3NK2X 3QVPA 5CKUA 1O95A 4Y4NA 3GYIA 1LJ1A 5FS9A 3CNPA 5HXIA 2C67A 3AYIA 1ZP0A 3NKSA 1IUVA 4NZHA 4REKA 1EL5A 1MOKA 1V59A 3T37A 4A99A 4CRTA 3FMWA 3IC9A 1VG0A 2E4GA 4NTEA 4M52A 2BCGG 2WPCA 2BS4A 3RP6A 2JB2A 4NTDA 1JOAA 2OALA 2XVFA 3ADAB 1RP0A 5KWFA 1XDIA 2WP9A 2A8XA 4OPDA 1KF6A 4EMJA 1GNDA 5TR3A 2W0HA 1AOGA 1BF3A 1GRHA 4K7ZA 2WU5A 3JSKA 4USRA 4EM3A 2XLSA 2BK4A 1CC4A 2R46A 3FPZA 1B8SA 2BC1A 3K7MX 1PXBA 1UKVG 2XVIA 4ADWA 4C3YA 1OJAA 2YLRA 3RHAA 3AWIA 4BK1A 1D4CA 4ZCDA 4PABA 2FBWA 2GR1A 2R45A 4GCMA 3S61A 1JRZA 3BNUA 5IQ1A 5LV9A 4OPIA 4JDRA 5KVHA 4B66A 1TRBA 3CNJA 2FJDA 3EAOA 1Q1RA 3D8XA 5C2TA 2VRLA 3DJGX 5JCMA 1H7XA 3H8IA 2XFNA 2R0CA 2IIDA 2V3AA 1D4EA 2YR4A 3CNSA 1ONFA 2E1MA 1CHUA 3CGCA 4GUVA 4A7AA 4ECHA 4C3XA 2B9WA 4YSXA 1LPFA 2HQMA 2WOIA 4CCQA 3P4PA 2XFUA 2QA2A 3F8RA 2WP5A 3VRDB 4JNAA 1H81A 4CNKA 4H7UA 1K0IA 1TDFA 2Q7VA 2XDOA 3FBSA 3F8DA 2X8CA 3NYCA 4ZCCA 3ALMA 4H2RA 4NEVA 3NHOX 4J2WA 3SFEA 3EF6A 1PXCA 3UKLA 4D04A 3GYJA 2WDQA 1F8WA 2WOVA 1NHRA 1F8RA 3COXA 2DKHA 4K5RA 1E1LA 3KKJA 1CBOA 3KVEA 4YTMA 2JB1A 2BXSA 3GWDA 5U63A 3VQRA 3ATQA 3ITJA 3RP7A 4B1BA 4RSLA 1D4DA 4FX9A 4Z26A 2APGA 3NTDA 1P2HA 4FK1A 5HHFA 2WP6A 4U2TA 3GWFA 1GV4A 4A5LA 1PBFA 1GRTA 3UOYA 1IUXA 3AYLA 4CBQA 3CN8A 4U8PA 3VR9A 1H84A 2YVFA 3S5WA 4U8JA 4TLZA 1S2YA 2CULA 3AEBA 3CPIG 1KDGA 2CFYA 3GMCA 2TMDA 1IJHA 2CDUA 4DSHA 4OPCA 3QSMA 2GAGB 4K8DA 1VRQB 3I3LA 4TM1A 1X31B 4Z2TA 1GETA 1YQ4A 3E1TA 1ZMDA 3CNTA 3K7QX 1PBCA 5KOXA 1TYTA 1LQUA 3EANA 3CIRA 4NTCA 1OJTA 3CPJG 3EPTA 4EIQA 3BNMA 2OA1A 4U8MA 1H86A 3ISHA 2V5ZA 2YG7A 2X99A 1IUSA 3ABVA 3GD3A 4U2LA 4EQWA 2X50A 4YTPA 1EBDA 3V76A 4A6NB 3DK4A 3LZXA 4U8NA 2V3BA 1L9EA 2JAEA 2B7SA 3D1CA 3OZ2A 3P4SA 2Z5XA 1PBEA 5J60A 4LIIA 2JBVA 4B69A 4BV6A 3ICTA 3LZWA 2YM1A 1OJDA 3DGHA 3V3NA 5BVAA 4A65A 1BZLA 1MXTA 3UCLA 4YKFA 3ATRA 4IA6A 1N4WA 2B9YA 4J56A 2R4EA 1DXLA 1NHPA 3AE4A 2BACA 2PYXA 2B9XA 1PDHA 2CVJA 4XWZA 4E0VA 3NLCA 1NPXA 4X9NA 2BXRA 2YVGA 3Q6JA 2J3NA 1OJ9A 1PJ7A 3DJJA 4CNJA 4AOSA 2R9ZA 2EQ8A 4EMIA 2X8HA 2WDRA 3GDNA 3UKFA 1VDCA 2XVEA 3VRAA 1BKWA 3R9UA 1ZDLA 2NPXA 4N9XA 4FK1C 4X4JA 1CJ2A 2WBAA 2AR8A 5M0ZA 2XCGA 1OJCA 4OPUA 1D5TA 1ZKQA 4LA1A 1O94A 1Y0PA 3L1RA 3IWAA 4A9WA 4H4XA 2IVDA 4YSZA 5IQ4A 3AEDA 2WOWA 2VOUA 4YSHA 3PS9A 1NHSA 2FJAA 2YVJA 3M13A 3UKHA 2GR2A 2JK6A 3KA7A 1PBDA 3NG7X 4OPGA 4CCRA 1H7WA 1B37A 4BJYA 3NGCX 4USQA 4CY8A 1JRXA 2BCPA 2F5ZA 3AEGA 2B76A 3UTFA 1RSGA 2C72A 2OLOA 3M0OA 1BWCA 2C3CA 3UOVA 4H4PA 1YQ3A 4ICYA 2GR0A 2GQWA 4A79A 1O5WA 5EBKA 1CJ3A 2WETA 4B68A 3DA1A 1LQTA 2Q6UA 2GRTA 3SQPA 5HYMA 5L46A 3CGDA 1KSSA 1XANA 2JB3A 2GB0A 3AD8B 4J57A 4J36A 4B67A 3OC4A 1GRAA 4IVMB 2FJEA 5BUKA 2GH5A 3QFBA 2C76A 1CC6A 3B6DA 1ELIA 3PO7A 5HY5A 4EIPA 2ZZ0A 3ZDNA 4IV9A 4JN9A 4K2XA 1H6VA 1KNRA 3AEAA 3AXBA 1FECA 3NK1X 3GDPA 2TPRA 1COYA 3IF9A 1M64A 1ZOVA 4WX1A 2VVLA 4YSYA 2Y6QA 3NYEA 1K0JA 4EM4A 1NENA 4U8KA 2GV8A 2WEUA 5DBJA 1KSUA 1NDAA 1LVLA 1YKJA 2WHDA 4Z2RA 3VRBA 1K4QA 4GDEA 4Y4LA 3NN0X 4B63A 1PN0A 3UP4A 3AYJA 5FS8A 3KU9A 3UTHA 1NG3A 2YG4A 1F8SA 3PVCA 3K7TA 3G5SA 4CY6A 3AEEA 4ZN0A 3P4QA 2VQBA 1DNCA 4HA6A 4OVIA 5KRQA 1Y56B 4H4WA 2OLNA 4H4UA 3I6DA 3AE5A 2FJBA 3IHMA 4RG3A 1B4VA 1GEUA 2AQJA 5EOWA 3KPFA 3AE3A 3SM8A 3AE2A 5C3JA 1CJ4A 5U25A 3ICSA 4H4ZA 1HYUA 1E7PA 1GTHA 2WPFA 2GF3A 3GRTA 2E5VA 2XFQA 3ALLA 2EQ7A 1Y56A 4DGKA 2A89A 1W4XA 3ALJA 4X9MA 3DMEA 4AP3A 1PJ5A 3UKAA 4B65A 4JNQA 4JY3A 1B5QA 5FS7A 4H2PA 3VR8A 3CNDA 1N4VA 1QO8A 3AECA 4H50A 3GMBA 2H89A 4K22A 2R0GA 3C96A 3GSIA 2WS3A 3AE9A 1FOHA 1E1NA 3GD4A 3QJ4A 4APNA 2Y6RA 4FDCB 1ZOYA 2IVEA 3KLJA 1VG9A 3Q9TA 1N1PA 2B7RA 1PJ6A 1ZK7A 4Z43A 2A87A 3LADA 1L0VA 2YLWA 4DNAA 4BK2A 3C4NA 2XYOA 1EL8A 4RG4A 1GT8A 2GVCA 1GSNA 1EL9A 4A6NA 2YG5A 1H83A 3B3RA 3UKQA 4I59A 1TDKA 2BYBA 1L9DA 2C75A 4IVOB 5KVIA 4BK3A 3NH3X 3IHGA 1JNZA 4OPTA 5U1OA 5GRTA 3H4KA 4TM4A 1MO9A 4MJWA 2ZZCA 3RNMA 1QLBA 3UOZA 4U8LA 2R0PA 5JCNA 5FS6A 3UTGA 1FCDA 1E1KA 2GQFA 1FEAA 3AB1A 3NRNA 3QVRA 4UDPA 4Z24A 2ACZA 3RP8A 3UKKA 1NAAA 2QCUA 3DH9A 3NN6X 3K30A 5CQFA 1GERA 2XLPA 4H4RA 2YG3A 3AE8A 1E1MA 1FEBA 1REOA 3UTEA 4EQSA 1ZMCA 4XWRA 3CGEA 2GAHB 3P9UA 4JQ9A 1GTEA 1Z6LA 2JKCA 1RYIA 2VQ7A 2XLUA 4KPRA 1E6EA 4K5SA 2YLZA 4EQXA 1KNPA 1GRFA 2BS3A 4U2SA 1H82A 4D03A 1CL0A 1TDNA 2AAQA 1GALA 4LU6A 2GR3A 3FIMB 3UOXA 2GEWA 1D7YA 3P1WA 4J33A 2Q0LA 1LTXR 1CJCA 4Y4MA 3AEFA 2OAMA 2XLRA 4C74A 3L8KA 3UP5A 4GR1A 2C73A 3NNEA 2GMJA 3O0HA 2O9ZA 4NEWA 4H2QA 2EQ9A 3UKPA 1PS9A 2YR5A 1GREA 3QSSA 1JRYA 2BK3A 2X8GA 1KFYA 3NYFA 4BURA 4TM3A 1GPEA 4OCGA 3C4AA 3BI4A 2XVJA 2WDVA 3BI5A 4UDQA 1S3BA 1TDOA 1P2EA 5BRTA 1ZX9A 2V60A 2VZ2A 3DGZA 2H88A 4IA5A 4TLXA 5EB4A 4HB9A 4PAAA 1M6IA 2YG6A 5GSNA 5KXJA 4J31A 1YQZA 2YLTA 3HZLA 1JNRA 3NK0X 2GMHA 1Q1WA 3CTYA 3AD7B 3DK9A 4H4SA 3V3OA 1FL2A 1Q9IA 4EMWA 4AP1A 2BABA 3BI2A 2C64A 5J7XA 2X3NA 3AE7A 1IUTA 2QAEA 1S2QA 2WESA 3NIXA 4H4YA 4OPLA 1TDEA 1IUWA 1F6MA 1YY5A 4H4VA 4DSGA 2PHHA 1ZY8A 1BGNA 2ARDA 3WE0A 5IPYA 4YXDA 4P9SA 2EQ6A 2XFOA 1JU2A 4JY2A 5ER0A 2BK5A 1L9CA 3LOVA 4Z25A 3G5QA 1IUUA 1DODA 5BULA 2WU2A
chains in the Genus database with same CATH superfamily
2ZBWA 2CT6A 3SFDA 5M10A 4YKGA 2V61A 4YWOA 2WPEA 4YJFA 2YM2A 1XW6A 1TP9A 4YT0A 1E2YA 3R2QA 3UL3A 2MBSA 3WD6A 3REDA 3W8SA 2BMXA 3APSA 4JRRA 3CGBA 4AT2A 4WBRD 1GTAA 3APOA 1GUMA 1PHHA 2YAUA 3W6GA 3DK8A 2YWMA 2Q0KA 1TOFA 1J9BA 1GULA 2H1BA 2HLSA 3MYDA 3WGTA 1O8XA 4GLTA 2RABA 2VD1A 4ZILA 4POBA 2WQYA 3AD9B 1GESA 1GXFA 4I58A 1IYIA 1SD8A 2C65A 1VF3A 1GRBA 3SGLA 1WWJA 4WETA 1MD3A 4BJZA 3UBLA 2N5FA 1CF3A 1QJDA 4J34A 1XHCA 2RLIA 3DJDA 4PQ1A 2VIMA 5D9WA 3D6IA 4Q5FA 1PX7A 3QMXA 3URHA 3KEBA 3OR5A 5EB5A 2ZZBA 1DJNA 5A4WA 3CPHG 3HYWA 4Q5RA 1M0UA 2IJYA 3Q18A 1PBBA 1YEXA 2RGOA 2CV4A 4G9HA 4IELA 3F9UA 5CKUA 4YTNA 2GT6A 2LNTA 1TJDA 2HFDA 3KH7A 1TKDB 3QCPA 3GYIA 1LJ1A 3TKQA 4KH7A 4HI7A 3GRXA 3HVSA 4REKA 1V59A 2G2QA 3FMWA 3FRCA 4XS6A 3GL5A 2EC4A 1WIKA 4NTEA 4NTDA 2REMA 4FYUA 3ADAB 2DU8A 1JOAA 2XVFA 5KWFA 4EMJA 2IMFA 4NXIA 3IC4A 2C0GA 1GRHA 2L57A 2XLSA 2FWEA 2HT9A 3K7MX 1PXBA 3IDVA 2M72A 3UJ1A 3KCMA 3IRAA 2C3TA 1UKVG 2L5LA 1A23A 2HZEB 3F3QA 2I9HA 2YPMA 4BK1A 1D4CA 3ZNQA 5IMCA 3UIWA 2DJ0A 4ML6A 3S61A 2R45A 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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