3IHGA

Crystal structure of a ternary complex of aklavinone-11 hydroxylase with fad and aklavinone
Total Genus 164
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
164
sequence length
535
structure length
535
Chain Sequence
MNDHEVDVLVVGAGLGGLSTAMFLARQGVRVLVVERRPGLSPYPRAAGQNPRTMELLRIGGVADEVVRADDIRGTQGDFVIRLAESVRGEILRTVSESFDDMVAATEPCTPAGWAMLSQDKLEPILLAQARKHGGAIRFGTRLLSFRQHDDDAGAGVTARLAGPDGEYDLRAGYLVGADGNRSLVRESLGIGRYGHGTLTHMVGVIFDADLSGIMEPGTTGWYYLHHPEFKGTFGPTDRPDRHTLFVEYDPDEGERPEDFTPQRCVELIGLALDAPEVKPELVDIQGWEMAARIAERWREGRVFLAGDAAKVTPPTGGMSGNAAVADGFDLAWKLAAVLQGQAGAGLLDTYEDERKVAAELVVAEALAIYAQRMAPHMAEVWDKSVGYPETLLGFRYRSSAVLATDDDPARVENPLTPSGRPGFRGPHVLVSRHGERLSTVDLFGDGWTLLAGELGADWVAAAEAVSAELGVPVRAYRVGAGLTDPESAVSERYGIGKAGASLVRPDGIVAWRTDEAAADAAQTLEGVLRRVLDR
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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publication title Structural basis for substrate recognition and specificity in aklavinone-11-hydroxylase from rhodomycin biosynthesis.
pubmed doi rcsb
molecule keywords RdmE
molecule tags Flavoprotein, oxidoreductase
source organism Streptomyces purpurascens
total genus 164
structure length 535
sequence length 535
chains with identical sequence B, C
ec nomenclature ec 1.14.13.180: Aklavinone 12-hydroxylase.
pdb deposition date 2009-07-30

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF01494 FAD_binding_3 FAD binding domain
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.30.9.50 Alpha Beta 2-Layer Sandwich D-Amino Acid Oxidase; Chain A, domain 2 D-Amino Acid Oxidase; Chain A, domain 2 3ihgA02
3.40.30.120 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich Glutaredoxin Glutaredoxin 3ihgA03
3.50.50.60 Alpha Beta 3-Layer(bba) Sandwich FAD/NAD(P)-binding domain FAD/NAD(P)-binding domain 3ihgA01
5HHFA 3AE7A 4WX1A 4CRTA 1EL7A 4IVMB 1Q1WA 1B5QA 3UKHA 2HQMA 4PAAA 2C3DA 3SFDA 5HXIA 2JK6A 3ITJA 4NEVA 3H8LA 5IPYA 4JQ9A 2GQWA 2QA2A 2X8CA 2ZZCA 1JNZA 3P9UA 1LQUA 3BHFA 4TM0A 1Y56A 2OLNA 4BJYA 4EQSA 3ZYXA 3QSEA 2WU5A 1H7XA 1IUWA 4H4TA 4U2TA 3AE6A 4AT2A 1O94A 2XVIA 1KNPA 4TM1A 2C75A 4YTNA 2BS2A 2V61A 4YSXA 1BKWA 2X50A 5FMHA 3URHA 3NN6X 5JCNA 3RNMA 4Z44A 4H2RA 3KPFA 2C76A 4K7ZA 3CNPA 4NEWA 3CNDA 1D7LA 2EQ6A 2YQUA 3FIMB 1XDIA 2WDRA 3NKSA 4H4PA 3BI2A 1Q1RA 1PBBA 3OC4A 4B67A 1JOAA 4NTEA 1PS9A 2E1MA 3L8KA 4TM3A 4CNJA 1F6MA 2YG5A 3M0OA 3P4PA 2VVLG 3Q6JA 1IUSA 2XFOA 2GAGB 4HB9A 4X9NA 2V3AA 2R4EA 3IWAA 3AWIA 3UOVA 1OJDA 4ECHA 4CCRA 4JY2A 1M64A 1REOA 1D4EA 1Z6LA 5IQ1A 5BULA 1KSSA 4OPIA 2XVJA 1L9DA 3AYLA 2BS4A 3EANA 3NT6A 2J3NA 4EQWA 4KX6A 1FECA 2R0PA 4H4QA 4LU6A 1RP0A 1S3BA 2BCGG 4LA1A 1N1PA 5IQ4A 1CJCA 4EMIA 2FJDA 1S2QA 2CULA 4JNQA 4OPGA 2GQFA 3ATRA 3RHAA 1Q9IA 3CGEA 1GRAA 1V59A 2JBVA 1KFYA 2XFQA 1EL5A 3NGCX 2AAQA 1H7WA 3AE1A 4UP3A 4JDRA 5U63A 2PYXA 4DGKA 4OPCA 2R0CA 2O9ZA 2FBWA 2RGHA 4FK1C 3WE0A 3K30A 3UOZA 1F3PA 2V5ZA 1PBDA 2WP5A 2F5ZA 1ZOVA 4OVIA 3UTGA 4NZHA 4B63A 4E0VA 1VDCA 3DH9A 3UP5A 1QO8A 2XLPA 2Q6UA 4YKGA 1KNRA 1O5WA 4CY8A 3ALLA 3ALMA 4O5UA 1IJHA 1NG3A 1TRBA 1GOSA 1GRFA 1JNRA 4H2PA 1YY5A 4A5LA 3GYIA 1LJ1A 1OJCA 2YVGA 3UKPA 5J7XA 2YLTA 4GDPA 3GMCA 1ELIA 1NPXA 1RYIA 2Q7VA 1B37A 1PN0A 2C64A 2ZZ0A 3K7QX 1GPEA 2GVCA 2Q0LA 4J36A 4BK3A 1IUTA 2C72A 2GV8A 1YQ4A 2C3CA 2E5VA 3LOVA 3ADAB 1ZMCA 3QFAA 4PABA 1NHRA 3CGDA 3AEBA 1TDKA 2FJAA 4OPDA 3CTYA 1GRHA 1GRBA 2XLRA 4EQRA 2GH5A 2VRMA 3DJGX 4UDPA 1KSUA 3AE3A 2R0GA 3SGLA 1BWCA 4B64A 3LZWA 5U25A 3GMBA 4RG4A 1W4XA 3NHOX 3ATQA 4XXGA 2BK5A 4H4UA 3B3RA 4YTMA 3BNMA 4GCMA 4P9SA 1JEHA 2VOUA 3AB1A 5FS8A 4CY6A 2XLTA 2VQBA 2R9ZA 2V3BA 2YLXA 5U1OA 2BACA 4H4RA 4K5SA 4IV9A 2FJEA 4HA6A 1X31B 2BABA 2WOVA 2YVFA 2AQJA 3P4QA 1CJ4A 1L9CA 1TDEA 2YG4A 1GREA 2Y6QA 4H7UA 3CNJA 1JRYA 1K0LA 1JRZA 4ICYA 3L1RA 4C3XA 3AD9B 4APNA 2H88A 5EB4A 1LVLA 4IA6A 3F8PA 1CL0A 3QVPA 3CNTA 3D8XA 2YLRA 2C70A 3KD9A 4EQXA 1P2EA 1YKJA 2WOWA 2WPEA 2YWLA 4Z2UA 2YVJA 3RP7A 1NHSA 1DXLA 2XYOA 2GMHA 4AP1A 3NNEA 4J56A 1F8RA 2EQ7A 3NRNA 1CC4A 2YG3A 3JSKA 4Y4NA 1E7PA 4B1BA 4K8DA 2BXRA 5GSNA 2X8GA 2WP9A 1S3EA 2YG7A 3GYJA 2APGA 2ZZBA 1GEUA 3RP8A 1LV0A 5KXJA 1B8SA 3VRDB 2WQYA 2XVEA 5CKUA 1D7YA 1NENA 4JNAA 3EF6A 5ER0A 2QA1A 3SFEA 3V76A 1CJ3A 1PJ7A 2BCPA 4H4ZA 4Z25A 4ZCDA 2YM1A 4O5QA 3GWFA 1F8SA 1IUVA 5FS7A 4H4VA 4J57A 1LTXR 4IVOB 1L0VA 1H86A 3ZDNA 1FCDA 1JU2A 3CN8A 4USRA 4BURA 2V6OA 2YLWA 1EL9A 2XFNA 3AEAA 3BI5A 2NVKX 4Z2TA 3GD4A 4H4YA 1NDAA 3NTAA 2XFPA 4U8LA 1IUUA 2EQ8A 1MXTA 1BGNA 3ICTA 4Z26A 4GF7A 1XPQA 3LADA 5KOWA 3NK0X 3I3LA 2WDVA 4OCGA 4A9WA 3FPZA 1PHHA 3AYIA 3DGHA 3ICSA 2ARDA 4UDQA 4CBQA 1XANA 3UOXA 3F8DA 2AR8A 4IA5A 4N9XA 4BV6A 4K2XA 4MJWA 4AOXA 1IUXA 1NHPA 4J31A 4J33A 3QJ4A 4YXDA 4AT0A 5KOXA 1Y0PA 1DOCA 4K22A 4U8JA 5M0ZA 3NK1X 2W0HA 4A6NB 2WDQA 3AE4A 2X8HA 4A65A 4EIPA 3DK4A 1QJDA 2H89A 5EOWA 5TR3A 4OPTA 2OLOA 3UKQA 3AEDA 1GETA 1NEKA 4BJZA 1TDOA 3G5RA 4EM4A 2C65A 3GRTA 4BK1A 3ICRA 2C7GA 5HY5A 2QAEA 2B9YA 3CGCA 1PBCA 2Z5YA 3E1TA 5EBKA 2JB3A 1VQWA 2UZZA 3NIXA 4RG3A 1GERA 1DJQA 3PS9A 5LV9A 1JRXA 4A99A 1D5TA 1ZX9A 1RSGA 2GRTA 4DSGA 3KVEA 4XWRA 4K5RA 2XLSA 1D4DA 2VRLA 4GDEA 1MO9A 1FOHA 1CF3A 2GR0A 1Y56B 2CFYA 3REDA 5KWFA 3F8RA 3VRBA 3AECA 4B66A 1VRQB 1PXCA 2GMJA 1N4WA 4FDCB 2B9XA 1ZDLA 3GD3A 3LXDA 4FK1A 3COXA 1QLBA 2FJBA 3GDNA 3UP4A 1BGJA 1KDGA 1ZOYA 3AE5A 4CNKA 4DSHA 2JKCA 4D03A 2GEWA 4Z2RA 3CNSA 1GTEA 1K0JA 3NYCA 3AE2A 1SEZA 4TLXA 3CIRA 1ZP0A 1GALA 3UKFA 3EPTA 1TYPA 4YSHA 3IHGA 4B68A 4U2SA 1O95A 1VG9A 2WU2A 3I6DA 3GRSA 3VRAA 1E1NA 2B9WA 5J60A 3BHKA 3QVRA 2YR5A 3KLJA 4U8IA 3LJPA 4Z24A 1UKVG 3M12A 1OJTA 3AEGA 3CPIG 2WBAA 1BF3A 5FS9A 3CPJG 3ALJA 1TDFA 3D1CA 2VQ7A 1NG4A 2GF3A 3AEEA 2YG6A 3ISHA 2I0ZA 3UOYA 5L46A 3ABVA 4YT0A 5JCLA 1H81A 1DODA 1DOBA 1NAAA 3LB8A 4J34A 4EIQA 2BK4A 2WP6A 2DKHA 4BK2A 3P1WA 3C96A 4U8OA 3VR8A 1OJ9A 2DKIA 3NK2X 4U8KA 3O0HA 1NHQA 3AEFA 1H6VA 2XLUA 3NTDA 1MOKA 3QSMA 3C4AA 2Y6RA 3DGZA 2X99A 2B7SA 3UTHA 4EMJA 1GT8A 3DJEA 3HZLA 1P2HA 4H2QA 4YTPA 1E1LA 2XVFA 4GR1A 1GV4A 2C66A 2B7RA 3EAOA 2XFUA 4ZCCA 4H4SA 3UKAA 4AP3A 5KVHA 4EM3A 3PVCA 4ADWA 3C4NA 2R45A 5EB5A 2E4GA 3VR9A 1DOEA 2BA9A 3AXBA 3DJDA 2OAMA 4EMWA 3VQRA 5KRQA 3S61A 3DJJA 3NH3X 1TDNA 3UKLA 1LPFA 4U8MA 3FBSA 2Q0KA 2WEUA 3QSSA 4Z43A 1YQ3A 1PJ6A 1E6EA 3II4A 5HYMA 1ZMDA 1D4CA 1B4VA 1PXBA 1L9EA 2RGJA 1GSNA 5JCMA 3R9UA 2WS3A 1ONFA 2YR6A 3NLCA 4YSZA 2A8XA 1GRGA 2WPFA 2XCGA 3CPHG 1YQZA 4U8NA 3IF9A 2WPCA 4X9MA 5CQFA 2A89A 4RSLA 2BYBA 2QCUA 5GRTA 3G5QA 3GDPA 1ZK7A 5BRTA 3GSIA 4I58A 2OALA 3FG2P 2GR1A 1GRTA 2R46A 4H4WA 1GNDA 3NYEA 3DK9A 4UDRA 4AOSA 2C67A 2X3NA 2JAEA 1K0IA 1DNCA 4FX9A 2B76A 2XDOA 3LZXA 2NPXA 3KA7A 1DJNA 1VG0A 4GUVA 4Y4LA 1ZKQA 4DNAA 2WOIA 1OJAA 2GR2A 5JCIA 2VZ2A 3BNUA 4YSYA 2ACZA 2XVHA 5BVAA 3RP6A 3IC9A 3NYFA 2IVEA 3K7TA 1BZLA 3H4KA 4C77A 2CDUA 3UKKA 4M52A 3V3OA 4C74A 1LQTA 4X4JA 1H84A 3BI4A 1PBFA 2BS3A 1FEBA 1XHCA 2RGOA 5KVIA 4USQA 2IIDA 2BK3A 1FEAA 2TMDA 2WESA 3DK8A 4Y4MA 2JB1A 4A79A 3KU9A 2TPRA 1EBDA 3M13A 3DA1A 4ZN0A 3AYJA 4H2NA 4YKFA 3G5SA 1H83A 4B65A 4JN9A 3GWDA 2VVLA 3P4SA 1HYUA 3CGBA 2EQ9A 2CVJA 2YM2A 4NTCA 4OPLA 3B6DA 1CHUA 1GTHA 1M6IA 1TYTA 4TM4A 5FS6A 3AD8B 3OZ2A 2BC0A 3UTEA 3AE9A 4B69A 1S2YA 5DBJA 4JY3A 4YWOA 2JB2A 5BUKA 3NN0X 1CJ2A 2YLZA 3SQPA 5C3JA 2WETA 2RABA 2V60A 3NG7X 3KKJA 2GR3A 4NTDA 2BC1A 2R4JA 3SM8A 4U2LA 1N4UA 4U8PA 4XWZA 1K4QA 2IVDA 1COYA 1ZY8A 2YLSA 2YAUA 3K7MX 1KF6A 2GAHB 3PO7A 2ZBWA 1E1MA 4CCQA 3UCLA 1CC6A 3P4RA 3FMWA 1E39A 1GESA 1PXAA 3Q9TA 4C3YA 4LIIA 3H8IA 4OPUA 4C5OA 4D04A 5JCKA 3S5WA 3IHMA 2PHHA 2WHDA 4REKA 3QFBA 2OA1A 1CC2A 4I59A 4A6NA 1PBEA 4WCTA 1F8WA 4TLZA 3V3NA 3T37A 4J2WA 1FL2A 1CBOA 2VVMA 2Z5XA 2GB0A 1E1KA 1AOGA 1PDHA 1PJ5A 4GRTA 5C2TA 3AD7B 2BXSA 1EL8A 1H82A 3UTFA 2C73A 4A7AA 3DMEA 2A87A 3AE8A 4KPRA 5M10A 2YR4A 1N4VA 4H4XA 4H50A 1GXFA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
5HHFA 3KCMA 5EPFA 3UKHA 4PAAA 3I43A 1EOGA 3HCZA 3SFDA 2PPTA 4K8MA 2WDUA 1G0TA 1Z6MA 2GSRA 3O76A 3P9UA 1LQUA 1B48A 1H7XA 1Q98A 2C75A 4NV5A 3TJBA 2BS2A 4YSXA 1BKWA 2HNLA 2ALBA 3QD9A 1DE1A 3EURA 2C76A 1SJIA 3IHQA 4NEWA 2V41A 3VWWA 1OYJA 3HHVA 1Q1RA 2YG5A 4AJ6A 3P4PA 2VVLG 1M7TA 4HB9A 1HD2A 4X9NA 1QFNA 4BIKA 2R4EA 4AJ8A 3IWAA 4ECHA 4IJIA 1D4EA 1Z6LA 1KBNA 1L9DA 2GZZA 4RQXA 3AYLA 4KX6A 4GRFA 4POBA 3ZRDA 4H4QA 5HR1A 1RP0A 5CRHA 4D73B 1N1PA 5IQ4A 1Z6NA 4EL1A 2A2RA 4EMIA 2YJHA 4DSSB 4EXJA 5D8IA 1F2EA 1NHYA 3ATRA 4NMUA 4LL4B 4YJGB 3SWLA 4J56E 1E6BA 4XTSA 1U3AA 2GSTA 2J23A 2LV3A 1H7WA 4L5OA 4JDRA 3CUKA 2ZUPA 4DGKA 2H6YA 3MSZA 5F8BA 2O9ZA 3SYIA 4FK1C 2RGHA 2NVLA 4F2IA 3WE0A 3K30A 3W6GA 3JCML 1ZOVA 2F5ZA 4ZBBA 1BJXA 4XS1A 3UP5A 3M1GA 1Q4JA 1RW1A 2H66A 4J57E 3KPKA 1YQ1A 5INYA 1SD9A 1IJHA 5IQYA 2FA4A 3UKPA 3CTGA 1V9WA 2VLVA 4L0WA 1GWCA 2C0GA 3KH9A 2ZZ0A 4GQCA 2GVCA 2XPEA 1SYXA 5AGYA 3EVIA 1S3DA 4AF2A 1SL1B 2E5VA 2JADA 1EP8A 1NHRA 2A2PA 3OR5A 3AEBA 4OO5A 1LBKA 1FG4A 2VRMA 3DJGX 3A3TA 3ZLPA 3AE3A 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3LXDA 2L5LA 3COXA 2RIIA 2KP1A 1MDKA 1FAAA 2H75A 1NW2A 3CIRA 4JEDA 3CBUA 1GALA 2P5RA 1YF1A 2NDOA 4I8BA 3D0ZA 2H6XA 2C4JA 2VLUA 3IHGA 1JZWA 1O95A 4RI7A 3GRSA 1E1NA 1JZDA 2YR5A 3VPTA 3KLJA 4Z24A 1UKVG 3I6AA 3CPIG 3ALJA 2GF3A 3F0IA 1NAAA 5ELAA 2KLXA 3C7MA 2AAWA 2BK4A 4BK2A 3C96A 4U8OA 2IWTA 4DVCA 4ZL9A 1OJ9A 3NK2X 1H4OA 2AUVA 3AEFA 4IVFA 3GTUA 3C4AA 3DGZA 2YV7A 4GWRA 1I9DA 2X99A 4F0CA 2B7SA 1GT8A 2GS3A 2BJXA 3UARA 4GR1A 2OBKA 3W4IA 2O89A 2J9HA 5KVHA 4AP3A 4PUAA 3SXIA 1WOUA 2XHFA 1MEKA 4IW9A 2L5OA 4ZBAA 2E4GA 3HJPA 2MBTA 1TJDA 3DJDA 3EMPA 3VQRA 3QAWA 2VD1A 3FBSA 2WEUA 2DIZA 4Z43A 2O85A 4MMMA 3M3MA 5HYMA 1TI1A 3RHCA 2CQ9A 3CSJA 1GSNA 5JCMA 2WS3A 1ONFA 3NLCA 1GRGA 2XCGA 2C8UA 2IMEA 2KOKA 3CPHG 5CQFA 2QCUA 5CO3A 5GSSA 1GSYA 1ZK7A 3ERFA 2C0DA 1GNDA 2VCXA 2DIYA 4MDCA 3UAPA 1GLPA 1K0IA 1K0NA 1TRWA 3SZWA 2XDOA 3LZXA 2F51A 4NV2A 1ZKQA 3EC3A 4JU5A 5JCIA 4YSYA 4GLTA 3IC9A 3GHAA 5B6MA 4C77A 5H5RA 2PERA 1GULA 3KEBA 1TXXA 4G73A 3H93A 1EEJA 3IAS2 1FEBA 3UIWA 3U5RE 1SL0B 1X5CA 1YDKA 3MWHA 1NM3A 3L9VA 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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