3IHGA

Crystal structure of a ternary complex of aklavinone-11 hydroxylase with fad and aklavinone
Total Genus 164
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
164
sequence length
535
structure length
535
Chain Sequence
MNDHEVDVLVVGAGLGGLSTAMFLARQGVRVLVVERRPGLSPYPRAAGQNPRTMELLRIGGVADEVVRADDIRGTQGDFVIRLAESVRGEILRTVSESFDDMVAATEPCTPAGWAMLSQDKLEPILLAQARKHGGAIRFGTRLLSFRQHDDDAGAGVTARLAGPDGEYDLRAGYLVGADGNRSLVRESLGIGRYGHGTLTHMVGVIFDADLSGIMEPGTTGWYYLHHPEFKGTFGPTDRPDRHTLFVEYDPDEGERPEDFTPQRCVELIGLALDAPEVKPELVDIQGWEMAARIAERWREGRVFLAGDAAKVTPPTGGMSGNAAVADGFDLAWKLAAVLQGQAGAGLLDTYEDERKVAAELVVAEALAIYAQRMAPHMAEVWDKSVGYPETLLGFRYRSSAVLATDDDPARVENPLTPSGRPGFRGPHVLVSRHGERLSTVDLFGDGWTLLAGELGADWVAAAEAVSAELGVPVRAYRVGAGLTDPESAVSERYGIGKAGASLVRPDGIVAWRTDEAAADAAQTLEGVLRRVLDR
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
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molecule keywords RdmE
publication title Structural basis for substrate recognition and specificity in aklavinone-11-hydroxylase from rhodomycin biosynthesis.
pubmed doi rcsb
source organism Streptomyces purpurascens
molecule tags Flavoprotein, oxidoreductase
total genus 164
structure length 535
sequence length 535
chains with identical sequence B, C
ec nomenclature ec 1.14.13.180: Aklavinone 12-hydroxylase.
pdb deposition date 2009-07-30

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF01494 FAD_binding_3 FAD binding domain
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.30.9.50 Alpha Beta 2-Layer Sandwich D-Amino Acid Oxidase; Chain A, domain 2 D-Amino Acid Oxidase; Chain A, domain 2 3ihgA02
3.40.30.120 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich Glutaredoxin Glutaredoxin 3ihgA03
3.50.50.60 Alpha Beta 3-Layer(bba) Sandwich FAD/NAD(P)-binding domain FAD/NAD(P)-binding domain 3ihgA01
3V3OA 3H4KA 3NRNA 5LV9A 2YM1A 1DJQA 2WHDA 2FBWA 4IA5A 3ICSA 2VOUA 2WU2A 2GR2A 1L9DA 5HHFA 2F5ZA 3AEGA 3G5RA 2BCGG 3EANA 3NK1X 3RNMA 2XVHA 2YLWA 4Y4NA 1F8SA 1D4DA 1Q1WA 4GCMA 1V59A 2YLSA 1FOHA 2X8GA 4U8IA 1NEKA 4O5UA 2NVKX 3DJGX 3PVCA 2WP6A 4Z26A 1DXLA 1LPFA 3CGEA 4GDEA 1CL0A 2V3BA 5TR3A 3CPJG 4TLXA 4YTMA 2XLSA 2AQJA 2X99A 1JU2A 1O5WA 1M64A 4E0VA 2RABA 1KSUA 1IUUA 5FS7A 3GSIA 5IQ1A 3NN0X 3SGLA 3AE1A 2BCPA 3AECA 3KU9A 2VVLG 2XLUA 5JCMA 4ZN0A 4U8LA 4U8OA 4WX1A 4YWOA 4FDCB 2QCUA 4Z2UA 4C74A 1H83A 3OC4A 4KX6A 2TPRA 4KPRA 4OPGA 4Z25A 2VQ7A 1KNRA 1VQWA 2VVMA 4FK1C 3NH3X 2I0ZA 1B5QA 2PHHA 2BS2A 1IUTA 2BYBA 2GR3A 5CQFA 3AE2A 3UP5A 3P4SA 3AEEA 4J56A 1F8WA 3ATRA 1YQ4A 5ER0A 1ZK7A 3G5SA 1K0LA 4A6NA 3RHAA 4D04A 5IQ4A 3EPTA 4I59A 3ALMA 3NK2X 3AWIA 1E1NA 2BA9A 3FPZA 2C3DA 3AEBA 1REOA 3IHGA 2CVJA 3SQPA 2OLNA 3T37A 2DKHA 1TDOA 4A7AA 1PBEA 4H4VA 4EQXA 4YSXA 4B64A 1DOEA 1XHCA 4APNA 1GRTA 4AOXA 5KOXA 1H82A 4H4SA 1K0JA 3UKKA 2GH5A 3QSSA 5KWFA 1OJCA 5FS8A 3AE7A 3CGCA 4H2RA 3QVPA 2YAUA 1E7PA 3KPFA 4OPDA 5M10A 3DJEA 3DK4A 2IVEA 4OPTA 1TYPA 1EBDA 1CBOA 2JAEA 3CNSA 1CC4A 3H8IA 3H8LA 2CDUA 1D4CA 4USQA 2WESA 3AB1A 5BUKA 4A6NB 4NEWA 4BK1A 3DJDA 1YQZA 5HY5A 4IVOB 3AEAA 3CNDA 2AAQA 3ICRA 4J34A 3UTGA 1IUXA 4OPUA 1CJ4A 1DODA 4JY3A 4YSHA 5IPYA 2CFYA 1BKWA 1LTXR 4XXGA 2AR8A 2YG5A 1P2HA 2R0GA 4YTPA 1HYUA 1YQ3A 2IVDA 3V76A 2X50A 3LB8A 1JOAA 4Z2TA 2XFUA 5HYMA 2FJEA 4H50A 1PBBA 4EM3A 3CGDA 1OJTA 2WDVA 1N1PA 2FJBA 5KOWA 4OVIA 1PBDA 2B9XA 3K7QX 3NLCA 3CNPA 3G5QA 2VZ2A 2XFPA 4OPLA 3P4QA 1LV0A 1FL2A 4J57A 1XPQA 3F8RA 3GD3A 4NTEA 4A5LA 4B69A 1PXBA 5C3JA 2R9ZA 5EB4A 3L1RA 5KVIA 3UOXA 3NYCA 3DGHA 1JRYA 1LQTA 4A79A 1COYA 1OJAA 1ZDLA 2CULA 4C3XA 2NPXA 3RP8A 1PDHA 2WBAA 3NNEA 4HB9A 3UTHA 3NYFA 2GEWA 5HXIA 1CF3A 2B7RA 5CKUA 3O0HA 1F6MA 3AD8B 3DA1A 4H2NA 5M0ZA 2R4JA 1BZLA 4GR1A 2OA1A 1P2EA 2BACA 4Z2RA 2A87A 2B9WA 3ALLA 3CTYA 2C66A 3KLJA 5KXJA 2XVIA 1Y0PA 1TDFA 2WP5A 1NAAA 3GWDA 2E4GA 3BI2A 3KKJA 4CNJA 3ATQA 2WPEA 5U63A 2WQYA 3GMBA 3UKAA 1D7LA 4EMIA 1VDCA 1MXTA 2X8HA 5U25A 3IWAA 4DNAA 2Q0LA 3C4AA 3URHA 2YG6A 1EL9A 2YR6A 2C67A 4JDRA 1NENA 4EIPA 4U8NA 4N9XA 2XVJA 1MOKA 3GD4A 2Q0KA 3AE5A 1F8RA 3UKQA 4NEVA 5U1OA 2DKIA 1CJ3A 3RP7A 2JK6A 4JQ9A 2YVFA 4B63A 1B4VA 3B3RA 3UP4A 1B8SA 1IUVA 1ONFA 2GRTA 2WOWA 2YLXA 5JCNA 2H89A 2WU5A 3NTAA 2VQBA 2YLRA 3QJ4A 3GDPA 3NTDA 5EBKA 2WPFA 5L46A 2A8XA 4XWRA 4CNKA 2B76A 3ITJA 3GMCA 3OZ2A 1DNCA 2QA2A 1AOGA 1CHUA 4K7ZA 3E1TA 2XCGA 3DJJA 2WDQA 4X9MA 1ELIA 2YLTA 2GB0A 2Y6RA 4PABA 4CRTA 3EAOA 2GAHB 4TM0A 1LVLA 1H7XA 1H6VA 2EQ7A 2V61A 3CNTA 2Z5YA 1RSGA 3CNJA 3QVRA 1GT8A 4BV6A 3EF6A 1CJCA 1D4EA 2OAMA 4K22A 1GOSA 1ZP0A 2RGOA 1ZOYA 4H2QA 1EL7A 1BWCA 1PJ7A 1ZY8A 4H4ZA 3LZWA 4RG4A 1N4WA 3ABVA 2UZZA 4FX9A 4I58A 4B65A 3KA7A 3KVEA 3GDNA 3UKLA 5JCIA 2C76A 1TYTA 4K8DA 3SFDA 2OLOA 1GREA 3BNUA 3UOVA 3II4A 4CY6A 3Q9TA 1GRAA 2J3NA 1GPEA 2BABA 1NHRA 3CPHG 4PAAA 2XFNA 1D7YA 1L0VA 4ECHA 1YY5A 3AE8A 1H86A 1X31B 2PYXA 1PS9A 2Z5XA 3K7TA 5EB5A 1KSSA 1FEAA 1PJ6A 1VRQB 4X9NA 1E39A 2YLZA 4H4YA 3UKPA 1PHHA 1PXCA 4REKA 4CY8A 4M52A 4ADWA 4ZCCA 1VG0A 2YR5A 5JCKA 1Y56A 4P9SA 1OJDA 4DSGA 1CC2A 4BJZA 1GTHA 2GF3A 4U2TA 4GRTA 4CCRA 4WCTA 2W0HA 1JRZA 4H4PA 4RSLA 4J2WA 1JNRA 3V3NA 1GRBA 1NHPA 5FS6A 4AOSA 2GV8A 1SEZA 4H2PA 2C75A 3GWFA 1M6IA 1NDAA 4DSHA 4YXDA 2EQ6A 2YG4A 3B6DA 1GXFA 2XLRA 3FMWA 1L9CA 2WETA 4U8MA 1DJNA 3I6DA 1H7WA 4JN9A 3P4RA 3PO7A 1Q9IA 2VRMA 2C7GA 1GSNA 2TMDA 3FG2P 5DBJA 4UDRA 3S5WA 3BI4A 3VR9A 2V60A 2YG3A 3UOYA 1IJHA 1H84A 2EQ9A 1E6EA 4EM4A 4OPCA 1KF6A 2JKCA 4LIIA 1ZMDA 2BS3A 2XLPA 4C3YA 2C64A 4EMWA 1TDKA 3SM8A 1NPXA 2YVGA 1NHQA 2X8CA 2R0PA 1DOCA 1Y56B 3NGCX 2JB1A 1L9EA 2C65A 1XDIA 2WPCA 1LQUA 3DGZA 2JBVA 3LOVA 3UTEA 1RP0A 2B9YA 3JSKA 2RGJA 1Q1RA 3AXBA 3DH9A 1JEHA 2ZZBA 1ZOVA 4OPIA 4H4TA 1GTEA 3DMEA 1LJ1A 2V5ZA 1NG3A 5EOWA 4Z44A 3M12A 3HZLA 3UKFA 4BURA 3QSEA 1K4QA 2BK5A 1CJ2A 1O94A 3NG7X 4Z43A 1VG9A 1GERA 1S2YA 1MO9A 3S61A 1ZX9A 1F3PA 3AYLA 1O95A 3AEDA 3AD7B 1KFYA 2C73A 3K7MX 1GESA 2GQWA 2XFOA 4BJYA 2ACZA 3VQRA 2QAEA 3M0OA 1S3EA 4EIQA 5BRTA 3CN8A 4UDQA 1GV4A 4OCGA 3L8KA 1JNZA 2EQ8A 2BK3A 3NHOX 3C96A 2YM2A 2YR4A 3AYIA 2Q6UA 1JRXA 4H4WA 2E1MA 3REDA 2WOVA 3FBSA 4IVMB 1B37A 3AE3A 2C72A 1Z6LA 2B7SA 5FS9A 2H88A 3LADA 4B1BA 4YT0A 1ZKQA 1KNPA 2XLTA 2XDOA 2YG7A 1OJ9A 2JB3A 2WEUA 4TLZA 4B68A 3AEFA 3RP6A 1E1KA 3BHFA 3BNMA 3IHMA 3P4PA 4YKGA 3DK8A 3F8DA 2WP9A 2BS4A 2A89A 1D5TA 3VRDB 1IUSA 1QO8A 1PN0A 1PXAA 4J36A 4J33A 4U8JA 2O9ZA 2FJAA 5BULA 4NTDA 2XVFA 4YKFA 2YWLA 3M13A 4H4RA 3VRBA 4UP3A 4XWZA 1NG4A 3QFAA 2C70A 4A9WA 2XFQA 1QJDA 3F8PA 3P1WA 3FIMB 5GSNA 4B67A 1QLBA 3Q6JA 3P9UA 1GRGA 2GMHA 2WOIA 2GQFA 3GRSA 5FMHA 3QFBA 3ZDNA 4U8PA 4ICYA 1BGNA 3CIRA 3UTFA 1FEBA 1PJ5A 2BC0A 3D1CA 3GRTA 1GNDA 2APGA 4H4XA 4YSZA 1EL5A 3C4NA 1BF3A 2OALA 3NT6A 3VR8A 2WS3A 3ALJA 3ZYXA 4RG3A 3BHKA 4J31A 1XANA 1YKJA 5KRQA 3ISHA 1N4UA 1GETA 2IIDA 2RGHA 1IUWA 3NYEA 4YSYA 4Y4LA 4A65A 2VRLA 4IV9A 1E1MA 4DGKA 3KD9A 3LXDA 2YVJA 2GVCA 1GALA 4JNQA 3IC9A 3LZXA 3AE6A 4U8KA 5JCLA 5C2TA 4AP3A 4YTNA 4GF7A 3K30A 1W4XA 2ARDA 4GUVA 2C3CA 4IA6A 2GAGB 5GRTA 3I3LA 4B66A 5J60A 3AE4A 2XVEA 1K0IA 4EQRA 3UOZA 4JNAA 1TRBA 2BC1A 4LA1A 2ZZ0A 2R4EA 3NN6X 4Z24A 4AP1A 2R0CA 1N4VA 3LJPA 1PBCA 2VVLA 4H4UA 4H7UA 4U2LA 2ZZCA 3UKHA 2BXSA 3WE0A 4K5RA 4FK1A 1RYIA 1E1LA 1NHSA 1TDEA 3NIXA 1GEUA 4K5SA 3AYJA 4EQWA 3GYIA 1S2QA 4USRA 4AT2A 4AT0A 2GR0A 2Q7VA 4H4QA 1H81A 3D8XA 3PS9A 4TM3A 3R9UA 2X3NA 2ZBWA 4O5QA 4Y4MA 2FJDA 1KDGA 4EQSA 1S3BA 4K2XA 1ZMCA 2XYOA 1FECA 2HQMA 4TM1A 3NKSA 4JY2A 5J7XA 2QA1A 1UKVG 1TDNA 1GRHA 3ICTA 4TM4A 3AE9A 1EL8A 4U2SA 4EMJA 3VRAA 2V6OA 1BGJA 4C77A 2R45A 3IF9A 4UDPA 3SFEA 4CBQA 4A99A 5KVHA 3UCLA 3GYJA 2GR1A 3ADAB 2JB2A 2E5VA 5BVAA 2GMJA 4C5OA 4BK3A 1PBFA 2BXRA 1FCDA 2Y6QA 3BI5A 4GDPA 4LU6A 4NTCA 3CGBA 4X4JA 2BK4A 2YQUA 4HA6A 4ZCDA 2WDRA 4BK2A 3COXA 2R46A 3NK0X 3CPIG 3QSMA 1GRFA 2V3AA 4MJWA 4D03A 1CC6A 3DK9A 4NZHA 4CCQA 3AD9B 1DOBA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
3V3OA 1K3LA 5DALA 4EC0A 4HS1A 3QPMA 3KM6A 3H1NA 5B7CA 4IA5A 4HZ2A 5D93A 3QR6A 3ICSA 4TR0A 1XOBA 1ZYQB 1EGRA 2BCGG 3QFBC 3NZNA 1Y25A 2AUVA 3F6FA 4O5RA 2YLSA 1FG4A 2OBKA 2WP6A 4Z26A 1M7TA 5HFIA 3RHCA 1OE8A 4NV5A 4YJHA 3ZNOA 4ZL8A 2X99A 1M64A 2CVDA 5ECKB 1T8EB 3ZMKA 5IQ1A 3F8UA 3T2YA 3BBYA 3RHBA 5JCMA 4ZN0A 4U8OA 6GSSA 5B8BA 4Z2UA 3PGTA 2CVKA 3N5OA 4OPGA 4KW6A 5DALB 2VQ7A 2LQOA 1J9BA 4FK1C 3VWXA 2C8UA 3UP5A 1WPIA 2C1YA 2OE3A 3AEEA 5IQ4A 1YQ4A 1K0LA 4D04A 3RHAA 3EPTA 4XCSA 1XVWA 2QC7A 3M1GA 2K9FA 3GHAA 3QOUA 5KN3A 2OLNA 1TDOA 4EQXA 4B64A 1DOEA 1XPVA 5IO2A 4YJHB 3G7YA 4MK3A 5HR2A 4EF0A 1K0JA 4TR4A 2QGVA 3UKKA 2O85A 5FS8A 4GF0A 3AE7A 4H2RA 3IRAA 4L8EA 5F07A 2LRNA 3DJEA 1X5EA 1F37A 2LTKA 4GSNA 1CBOA 2HE3A 1ZYEA 1X9WB 3VWVA 2GQLA 1DE2A 2E7PA 1O85A 3IXRA 4FYBA 3H8LA 4DEJA 4IW9A 2MYGA 4YQVA 3WGEA 5D9WA 1PKZA 4J34A 3APQA 1UC7A 4ZBAA 4YSHA 3EU3A 5IPYA 1SD8A 2OE1A 1TRUA 2CV4A 4ML6A 1Q98A 1X5DA 3EC3A 2WZ9A 2VL2C 3V76A 20GSA 2HFDA 4Z2TA 5HYMA 3ZL5A 1PBBA 3W8JA 3CGDA 2WDVA 2FJBA 3GA4A 1C72A 1GWCA 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chains in the Genus database with same CATH homology


 
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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