3IHGA

Crystal structure of a ternary complex of aklavinone-11 hydroxylase with fad and aklavinone
Total Genus 164
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
164
sequence length
535
structure length
535
Chain Sequence
MNDHEVDVLVVGAGLGGLSTAMFLARQGVRVLVVERRPGLSPYPRAAGQNPRTMELLRIGGVADEVVRADDIRGTQGDFVIRLAESVRGEILRTVSESFDDMVAATEPCTPAGWAMLSQDKLEPILLAQARKHGGAIRFGTRLLSFRQHDDDAGAGVTARLAGPDGEYDLRAGYLVGADGNRSLVRESLGIGRYGHGTLTHMVGVIFDADLSGIMEPGTTGWYYLHHPEFKGTFGPTDRPDRHTLFVEYDPDEGERPEDFTPQRCVELIGLALDAPEVKPELVDIQGWEMAARIAERWREGRVFLAGDAAKVTPPTGGMSGNAAVADGFDLAWKLAAVLQGQAGAGLLDTYEDERKVAAELVVAEALAIYAQRMAPHMAEVWDKSVGYPETLLGFRYRSSAVLATDDDPARVENPLTPSGRPGFRGPHVLVSRHGERLSTVDLFGDGWTLLAGELGADWVAAAEAVSAELGVPVRAYRVGAGLTDPESAVSERYGIGKAGASLVRPDGIVAWRTDEAAADAAQTLEGVLRRVLDR
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
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molecule keywords RdmE
publication title Structural basis for substrate recognition and specificity in aklavinone-11-hydroxylase from rhodomycin biosynthesis.
pubmed doi rcsb
source organism Streptomyces purpurascens
molecule tags Flavoprotein, oxidoreductase
total genus 164
structure length 535
sequence length 535
chains with identical sequence B, C
ec nomenclature ec 1.14.13.180: Aklavinone 12-hydroxylase.
pdb deposition date 2009-07-30

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF01494 FAD_binding_3 FAD binding domain
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.30.9.50 Alpha Beta 2-Layer Sandwich D-Amino Acid Oxidase; Chain A, domain 2 D-Amino Acid Oxidase; Chain A, domain 2 3ihgA02
3.40.30.120 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich Glutaredoxin Glutaredoxin 3ihgA03
3.50.50.60 Alpha Beta 3-Layer(bba) Sandwich FAD/NAD(P)-binding domain FAD/NAD(P)-binding domain 3ihgA01
4Y4MA 1H7XA 3AD8B 3S61A 1B4VA 4J36A 4USQA 3URHA 3FG2P 2FBWA 4P9SA 1IUTA 1OJ9A 1CC6A 1D7YA 5M0ZA 1GTEA 3K30A 4C3XA 2C72A 4YTNA 1H83A 2WQYA 1GRGA 4OPUA 3DJGX 2V60A 2C65A 2XVJA 1OJAA 2YLWA 3CGCA 4M52A 1F8SA 3UOYA 3BI5A 3DJDA 2B9YA 3AYLA 4Z26A 1GEUA 4EMJA 2BS2A 4EMWA 2R0PA 3NN0X 1L9CA 2EQ7A 2WPCA 3GMBA 3P4QA 2BA9A 1E1NA 2QA1A 2GMHA 2F5ZA 4XWZA 4AP1A 3F8DA 1ZX9A 4B63A 1YQ3A 4TLXA 3L1RA 3AE5A 1H86A 2ZZ0A 3BNUA 4BK1A 3CTYA 1DODA 4BV6A 4NZHA 4GUVA 3EPTA 1H84A 3VR8A 2IVDA 4D03A 1YY5A 1GERA 1D4CA 2C67A 2XLSA 3PVCA 2XFUA 1S3EA 2YR4A 3VRBA 3FPZA 1FECA 3E1TA 3D8XA 4JNQA 5EOWA 4JNAA 4O5UA 3ICSA 3H4KA 1OJCA 2ARDA 4CY8A 2YLZA 3BHFA 3UKHA 2XDOA 2R4EA 1PXAA 4KX6A 4BK2A 1PXBA 4J34A 4K5SA 5EBKA 3NN6X 1Q1RA 4C74A 3UCLA 3ALJA 3UTFA 4YKFA 4B66A 1L0VA 3IHGA 5IQ4A 4CBQA 3WE0A 2A87A 4TM3A 2GR3A 4OPIA 2WEUA 3D1CA 2EQ9A 1VG9A 2TPRA 3C96A 4GRTA 1L9DA 4AOXA 2WPEA 3AE4A 2FJDA 1DJQA 1KNRA 2OLNA 2XLPA 2QAEA 4U8OA 2E4GA 5JCLA 2Y6RA 3PO7A 2YVFA 2XCGA 4WX1A 4C3YA 4CRTA 1ONFA 4H4VA 2C73A 4DGKA 1D5TA 1JU2A 2V3AA 1CF3A 3UTEA 1GSNA 4AP3A 1E6EA 1IUUA 3KA7A 2Q0KA 4H4XA 3ZYXA 2BK5A 2RGOA 1KSUA 1ZMDA 2HQMA 1PS9A 2V61A 3JSKA 4U8KA 3GSIA 2IVEA 4UDPA 2Y6QA 4H2NA 4A9WA 5JCMA 2XVHA 1RP0A 2GR1A 3CNDA 1CBOA 1PBFA 2TMDA 1P2EA 2A8XA 4EQWA 3NG7X 1N1PA 2W0HA 1BWCA 4IA5A 1NAAA 3K7QX 4Z24A 4A7AA 3LB8A 1JOAA 4U8JA 1GT8A 4YSYA 5KWFA 3V3NA 1W4XA 5BRTA 3BI2A 1LPFA 1PBCA 4H4RA 4TM4A 4ZCDA 4A6NB 4EMIA 4OPGA 2X99A 1COYA 3ALMA 3QJ4A 5JCIA 3DA1A 5TR3A 4AT0A 1EL9A 4J2WA 4PABA 1RYIA 2AR8A 3AECA 4Z2RA 4ICYA 4JY2A 3ALLA 2YG4A 1DJNA 1TDFA 1F6MA 4GR1A 4EIQA 2XFPA 3G5RA 2XLTA 2C7GA 5HY5A 4XWRA 5KVIA 1D4EA 2VQ7A 1Z6LA 5GSNA 2FJAA 1LV0A 1NG4A 1ZOYA 2AQJA 4IVOB 1ZDLA 4JY3A 1TYTA 2YVGA 3AE2A 4H4YA 3DK4A 5BULA 3IC9A 4GF7A 1H6VA 1KNPA 4GDEA 4A5LA 3F8RA 2JB1A 4YSZA 3ISHA 3BNMA 3UKAA 2EQ8A 2YLXA 1GXFA 3P4SA 1Y0PA 3FIMB 1JRZA 4GCMA 4MJWA 2C66A 3UKPA 2WU5A 3DGHA 4NTDA 1XHCA 2CVJA 4OPCA 3K7MX 1FEBA 4C77A 4H4WA 2DKIA 1PBEA 4IV9A 1O94A 1QO8A 3UKFA 3NKSA 1S3BA 1PXCA 3B3RA 3PS9A 2WDRA 1TDKA 2E1MA 3AEBA 3AE8A 3CNSA 1CJ4A 2O9ZA 4H50A 1KFYA 4HB9A 4YSXA 2C75A 3LZWA 3LADA 4X4JA 5KOWA 2WP9A 3GRSA 4U2LA 3IHMA 2B7RA 4CCRA 1GESA 1YQZA 1YQ4A 2QCUA 2GR2A 3GD4A 5BVAA 4Z2TA 4B67A 2Q0LA 2XFNA 2A89A 4REKA 4EQRA 1AOGA 3I6DA 4JN9A 4ADWA 2BCPA 1DOCA 1QLBA 2XVFA 3CPIG 5ER0A 3NHOX 4B65A 2YWLA 1JRXA 1ELIA 3DJEA 2WS3A 2Q7VA 3M0OA 5U1OA 1MOKA 1ZK7A 3UOXA 4LA1A 4WCTA 1DOBA 3UP4A 2BS3A 3P4PA 3AEAA 3GDPA 3AYIA 3S5WA 3SFDA 5LV9A 2BACA 3AYJA 4K5RA 3ITJA 4U8LA 1V59A 4K7ZA 5BUKA 2YLTA 3EANA 2YM1A 2XLRA 2WESA 3M12A 2RGHA 2X50A 1B8SA 1H82A 1PBDA 2WOIA 3V76A 2X3NA 4OCGA 5FS8A 3NT6A 1PDHA 2YG5A 4EQSA 2X8GA 2R45A 2APGA 4J33A 2JKCA 3C4NA 3P9UA 2B9WA 3OC4A 3P4RA 4UDQA 3VR9A 4U8MA 2DKHA 1FOHA 3CN8A 3AD9B 3KPFA 3CPJG 4YSHA 4AT2A 2C70A 1HYUA 3H8LA 2XFQA 1GETA 1GREA 3AE6A 4LIIA 4H4SA 1ZMCA 1EL5A 1XANA 1ZOVA 1VRQB 4A6NA 3CGBA 2GRTA 1O5WA 3DK8A 4NEWA 4EQXA 5M10A 3NYEA 3AE7A 2VVLG 2YG6A 3CIRA 5DBJA 5J60A 5JCKA 1IUSA 3AEGA 4CNKA 4Z43A 3AD7B 1DOEA 1L9EA 4J56A 4APNA 1K4QA 2YG7A 3AXBA 1CJ3A 2GH5A 1VG0A 3REDA 4Y4LA 4OPDA 1K0LA 4OVIA 3FMWA 2BC1A 4RSLA 4U8IA 2VZ2A 3K7TA 1KF6A 1PHHA 2WETA 4U8NA 1KDGA 3VRDB 4B69A 4H4ZA 1Q9IA 1N4WA 2GMJA 3NYFA 5J7XA 2E5VA 3SFEA 3I3LA 4FK1C 1GV4A 2YLRA 3VRAA 3DK9A 2Q6UA 3G5QA 3GYIA 1MO9A 3AE9A 3GMCA 3R9UA 2J3NA 2V3BA 2OLOA 1GRBA 1TDNA 2JK6A 2YVJA 4N9XA 1OJDA 5GRTA 2GF3A 1RSGA 3CPHG 1DNCA 4A99A 1DXLA 4FX9A 2FJEA 2C3CA 5L46A 1D4DA 4BJYA 3H8IA 4O5QA 2JB2A 1GOSA 3KKJA 4TM1A 1IUWA 2EQ6A 1PJ7A 1M64A 2GAGB 2WP6A 4H2RA 1PN0A 2GEWA 2YAUA 4BURA 1OJTA 2OALA 1BGNA 1GALA 1O95A 4H4UA 4ECHA 3OZ2A 3QSEA 3GWFA 5EB4A 5HYMA 4UDRA 1CHUA 3NGCX 2BS4A 1IUVA 2V5ZA 3KD9A 2BCGG 2R9ZA 3NYCA 1ZY8A 4TM0A 2FJBA 1SEZA 1S2QA 3LOVA 2UZZA 1REOA 2C3DA 2VRMA 2H89A 4RG3A 1CJCA 5KXJA 1FCDA 2GQFA 3NK0X 1PBBA 2BXRA 1F8WA 4K2XA 3CNPA 3UOVA 5CKUA 1B37A 2Z5YA 4BK3A 2CULA 1CC4A 1VDCA 4YTPA 1FL2A 4K22A 2B7SA 2WHDA 3NK1X 1GPEA 2VOUA 4TLZA 4BJZA 1ZP0A 2V6OA 1IUXA 4USRA 3C4AA 4U2SA 5U25A 2PYXA 3LXDA 4C5OA 3DH9A 1CJ2A 1TDEA 3GD3A 4YTMA 2GV8A 3O0HA 3LZXA 4Z2UA 2XFOA 5JCNA 2GB0A 2X8CA 3ABVA 4X9NA 2WOVA 2ZZBA 3AE1A 4B64A 3QSSA 4A79A 2WP5A 3F8PA 5U63A 3B6DA 1TDOA 1LJ1A 3ADAB 1E39A 2AAQA 5CQFA 2WDQA 3UTHA 1GRTA 3L8KA 3GRTA 3QVRA 1N4UA 1VQWA 2XVIA 1D7LA 4JQ9A 4EM3A 1B5QA 4Z25A 1NHSA 3AEFA 4DSHA 2RABA 3AB1A 5HHFA 3NIXA 4CNJA 2YG3A 3UKKA 3FBSA 1Y56B 3UKQA 5KRQA 2OA1A 5FS6A 1BGJA 1QJDA 4YWOA 4YKGA 4YXDA 3IWAA 3NLCA 2GVCA 3NNEA 2BK3A 4ZCCA 2CFYA 1JEHA 2I0ZA 2XVEA 3KVEA 3NTDA 3DJJA 4XXGA 1GRFA 1NHQA 1F3PA 3ATQA 3KU9A 1EL7A 2NPXA 4PAAA 5C3JA 5FS9A 3V3OA 5FS7A 4UP3A 2ACZA 3BHKA 4JDRA 1E1LA 5KVHA 2BXSA 2R4JA 1BF3A 4DNAA 1BKWA 1NHRA 3NK2X 3CGDA 1E1MA 2WOWA 2BABA 1NPXA 4RG4A 1IJHA 3Q6JA 4Z44A 2BK4A 4NEVA 2VRLA 1K0IA 3QSMA 1NENA 4CY6A 1LVLA 4IA6A 1KSSA 3AWIA 5FMHA 2GR0A 1M6IA 1P2HA 2GAHB 4DSGA 3AE3A 3QFBA 1XDIA 2H88A 3NH3X 4K8DA 2BYBA 2GQWA 1GRAA 2VVLA 3COXA 1NDAA 2C76A 1S2YA 3DMEA 4U2TA 3RHAA 4E0VA 1K0JA 5KOXA 1CC2A 2NVKX 2PHHA 3ICTA 3QFAA 1H81A 4H2QA 2VQBA 1GTHA 1YKJA 4H2PA 1F8RA 4ZN0A 3CNJA 2YLSA 1X31B 1N4VA 3M13A 3ICRA 4X9MA 3SGLA 2YR5A 2XLUA 4OPLA 2JAEA 4AOSA 2WDVA 4J31A 2R0CA 2B76A 4H4QA 1XPQA 4D04A 1PJ5A 4GDPA 4IVMB 2BC0A 3GYJA 3ATRA 3IF9A 2OAMA 2QA2A 4KPRA 2R46A 4EIPA 2B9XA 3RNMA 1LTXR 3Q9TA 1LQUA 1NHPA 3CNTA 3EAOA 4FDCB 4U8PA 4OPTA 3SQPA 4EM4A 1FEAA 1EBDA 1NEKA 1Q1WA 3GWDA 3SM8A 3UKLA 3UTGA 5EB5A 4HA6A 3BI4A 2X8HA 1E1KA 2IIDA 1LQTA 1BZLA 3EF6A 3DGZA 5C2TA 1TYPA 4NTCA 3RP7A 3CGEA 3KLJA 1TRBA 5IPYA 3QVPA 3T37A 5IQ1A 2XYOA 4H7UA 3II4A 3GDNA 1GNDA 2WPFA 2R0GA 3UOZA 1UKVG 3ZDNA 2WBAA 4B68A 2ZZCA 1JRYA 2YR6A 4LU6A 3NRNA 2YQUA 2WU2A 3AEEA 1E7PA 4H4TA 3HZLA 3G5SA 2CDUA 3AEDA 2VVMA 3LJPA 2C64A 1EL8A 2Z5XA 1CL0A 1JNRA 3RP6A 3NTAA 3RP8A 1PJ6A 4A65A 2JB3A 4YT0A 2RGJA 1MXTA 1NG3A 3P1WA 5HXIA 2ZBWA 1H7WA 1Y56A 4NTEA 2YM2A 4Y4NA 4I59A 4B1BA 2JBVA 3VQRA 1ZKQA 4FK1A 4I58A 4CCQA 4J57A 3UP5A 1GRHA 1JNZA 4H4PA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
3DWVA 4V2LA 2H0IA 3SZWA 2Z9SA 4TOPA 5C04A 1IUTA 1OJ9A 1CC6A 2DMLA 1GTEA 3K30A 2C72A 5DCHA 4YTNA 2NDOA 5BUKA 4F82A 2F8FA 4OPUA 3EVIA 4IW9A 3O3TA 1F8SA 5CP1A 2B9YA 3DIEA 4EMJA 2BS2A 2H0GA 4EMWA 4YQVA 2R0PA 2GMHA 4AP1A 1ZX9A 4HQSA 1N2AA 3AE5A 3GKMA 4BK1A 1M0UA 1K0BA 4GUVA 4XRAA 4MH3A 1EEJA 4O92A 3IC4A 4K6XA 1GNWA 5AGYA 5IO2A 3CXGA 2R3XA 4OO4A 3PVCA 2XFUA 3FR6A 1GSFA 3F0IA 4POLA 3D8XA 4JNQA 3K8NA 1K0MA 3UKHA 1T1VA 3A2WA 5EBKA 2IMFA 1WOUA 1Q1RA 3UCLA 2VD1A 2VM2A 3VI5A 2DJ2A 1PFOA 4WF5A 3WE0A 2FD3A 2R37A 4IKHA 4NHZA 4TM3A 1L9DA 2PBJA 3FK8A 4MPFA 1MDIA 2XLPA 3MYDA 3GH9A 2E4GA 3ZFBA 3GNJA 3HZ8A 3O76A 3GRXA 3HVSA 4C3YA 1ZYQB 1ONFA 4CRTA 3TJBA 2V6KA 2DJ0A 2PGTA 1Y6EA 4RUVA 3UTEA 2OJLA 1EV4A 2BK5A 3M9KA 2HQMA 2GZZA 3JSKA 4UDPA 3R3EA 2XVHA 5DJLA 3CNDA 2GR1A 5EPFA 4G73A 1VF4A 7GSSA 1N1PA 4IA5A 2C8UA 1BWCA 3K7QX 4A7AA 3LB8A 1LJRA 1GT8A 1ZYPA 2C3QA 4ECIA 3ERGA 5HFGA 5BRTA 1LPFA 4H4RA 4EMIA 5B6MA 2X99A 3QJ4A 5JCIA 4V2MA 1O73A 3GV1A 2VLVA 1R26A 3VI7A 4Z2RA 2KP2A 1C0LA 2YWOA 5ID2A 4GR1A 1F6MA 1SKWB 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
 3DWV A;  4V2L A;  2H0I A;  3SZW A;  2Z9S A;  4TOP A;  5C04 A;  1IUT A;  1OJ9 A;  1CC6 A;  2DML A;  1GTE A;  3K30 A;  2C72 A;  5DCH A;  4YTN A;  2NDO A;  5BUK A;  4F82 A;  2F8F A;  4OPU A;  3EVI A;  4IW9 A;  3O3T A;  1F8S A;  5CP1 A;  2B9Y A;  3DIE A;  4EMJ A;  2BS2 A;  2H0G A;  4EMW A;  4YQV A;  2R0P A;  2GMH A;  4AP1 A;  1ZX9 A;  4HQS A;  1N2A A;  3AE5 A;  3GKM A;  4BK1 A;  1M0U A;  1K0B A;  4GUV A;  4XRA A;  4MH3 A;  1EEJ A;  4O92 A;  3IC4 A;  4K6X A;  1GNW A;  5AGY A;  5IO2 A;  3CXG A;  2R3X A;  4OO4 A;  3PVC A;  2XFU A;  3FR6 A;  1GSF A;  3F0I A;  4POL A;  3D8X A;  4JNQ A;  3K8N A;  1K0M A;  3UKH A;  1T1V A;  3A2W A;  5EBK A;  2IMF A;  1WOU A;  1Q1R A;  3UCL A;  2VD1 A;  2VM2 A;  3VI5 A;  2DJ2 A;  1PFO A;  4WF5 A;  3WE0 A;  2FD3 A;  2R37 A;  4IKH A;  4NHZ A;  4TM3 A;  1L9D A;  2PBJ A;  3FK8 A;  4MPF A;  1MDI A;  2XLP A;  3MYD A;  3GH9 A;  2E4G A;  3ZFB A;  3GNJ A;  3HZ8 A;  3O76 A;  3GRX A;  3HVS A;  4C3Y A;  1ZYQ B;  1ONF A;  4CRT A;  3TJB A;  2V6K A;  2DJ0 A;  2PGT A;  1Y6E A;  4RUV A; 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#chains in the Genus database with same CATH homology
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