3IHGA

Crystal structure of a ternary complex of aklavinone-11 hydroxylase with fad and aklavinone
Total Genus 164
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
164
sequence length
535
structure length
535
Chain Sequence
MNDHEVDVLVVGAGLGGLSTAMFLARQGVRVLVVERRPGLSPYPRAAGQNPRTMELLRIGGVADEVVRADDIRGTQGDFVIRLAESVRGEILRTVSESFDDMVAATEPCTPAGWAMLSQDKLEPILLAQARKHGGAIRFGTRLLSFRQHDDDAGAGVTARLAGPDGEYDLRAGYLVGADGNRSLVRESLGIGRYGHGTLTHMVGVIFDADLSGIMEPGTTGWYYLHHPEFKGTFGPTDRPDRHTLFVEYDPDEGERPEDFTPQRCVELIGLALDAPEVKPELVDIQGWEMAARIAERWREGRVFLAGDAAKVTPPTGGMSGNAAVADGFDLAWKLAAVLQGQAGAGLLDTYEDERKVAAELVVAEALAIYAQRMAPHMAEVWDKSVGYPETLLGFRYRSSAVLATDDDPARVENPLTPSGRPGFRGPHVLVSRHGERLSTVDLFGDGWTLLAGELGADWVAAAEAVSAELGVPVRAYRVGAGLTDPESAVSERYGIGKAGASLVRPDGIVAWRTDEAAADAAQTLEGVLRRVLDR
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
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publication title Structural basis for substrate recognition and specificity in aklavinone-11-hydroxylase from rhodomycin biosynthesis.
pubmed doi rcsb
source organism Streptomyces purpurascens
molecule tags Flavoprotein, oxidoreductase
molecule keywords RdmE
total genus 164
structure length 535
sequence length 535
chains with identical sequence B, C
ec nomenclature ec 1.14.13.180: Aklavinone 12-hydroxylase.
pdb deposition date 2009-07-30

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF01494 FAD_binding_3 FAD binding domain
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.30.9.50 Alpha Beta 2-Layer Sandwich D-Amino Acid Oxidase; Chain A, domain 2 D-Amino Acid Oxidase; Chain A, domain 2 3ihgA02
3.40.30.120 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich Glutaredoxin Glutaredoxin 3ihgA03
3.50.50.60 Alpha Beta 3-Layer(bba) Sandwich FAD/NAD(P)-binding domain FAD/NAD(P)-binding domain 3ihgA01
2A87A 2GV8A 1H81A 5CKUA 1EBDA 3E1TA 3IC9A 4OPIA 2JB3A 2Z5XA 4H7UA 4DGKA 1VQWA 2BK3A 3LZXA 2WP6A 2GMJA 3G5QA 1K0IA 4GCMA 4AP3A 1GREA 2TMDA 4TM3A 2GR0A 3NK2X 2A8XA 1D4DA 1LV0A 3RNMA 4ZN0A 2VQ7A 4B63A 2Q7VA 5M0ZA 4U8KA 3KU9A 2VOUA 1V59A 2BC1A 3AD8B 4FK1A 2VVLA 2WESA 2RGOA 1LPFA 2UZZA 3NGCX 3I3LA 1ZY8A 3DJEA 3NRNA 4JDRA 2R0CA 1BZLA 1GESA 4JQ9A 3CNDA 1AOGA 2APGA 3UKHA 4H4YA 2NVKX 3JSKA 3BHKA 4TM4A 1YQ3A 1CC4A 2WDQA 1VDCA 4NEVA 3QVPA 2VRLA 1CJ4A 3DGZA 2R0PA 1SEZA 3RP6A 3SQPA 2WU2A 4A6NB 4M52A 3CIRA 1X31B 4IVMB 2VVMA 3AWIA 2C64A 4BK3A 3Q9TA 3V76A 4BJYA 2XVEA 2YM1A 3AEAA 3QJ4A 3NN6X 4EQSA 2X99A 1W4XA 1ZKQA 3GDNA 3ICRA 3CGEA 1GRFA 2BK5A 2VRMA 2X8GA 2XCGA 2WP9A 3AEFA 4H50A 4Y4NA 4Y4MA 1ZP0A 2GRTA 1ZK7A 3VQRA 2YLSA 4B66A 2B76A 2V3AA 2XVIA 3P4QA 3ZYXA 4REKA 1GTEA 2A89A 4BK1A 4Z26A 2R0GA 1E7PA 3KA7A 3LB8A 4B65A 1GALA 1ZMCA 2R45A 1FL2A 2YG6A 1JNRA 1GNDA 1OJCA 3KPFA 4NZHA 3ALLA 2XLTA 4BV6A 2GR3A 2V6OA 2GAGB 4OPLA 4AOSA 2RGHA 4J57A 1FCDA 1PXBA 3M12A 1D4EA 1EL5A 3AB1A 3O0HA 4DSGA 5GSNA 1IUXA 4H2QA 4OVIA 2FBWA 1IUSA 3IF9A 3D8XA 1DODA 2YR4A 4A7AA 1IUVA 1KSSA 3NT6A 4EIQA 1Q9IA 3UKAA 1N4VA 3COXA 3VR8A 4USRA 1GRTA 1TDFA 2XFPA 4GDEA 4A79A 3EPTA 2AAQA 3RHAA 1K0LA 2FJBA 1H6VA 3GYJA 2WOIA 3IHGA 4O5QA 3ADAB 2O9ZA 3ALJA 4NTEA 4CBQA 1GTHA 1B4VA 1F8SA 1QO8A 2B9XA 1OJAA 2EQ9A 1TDOA 3NNEA 2R4EA 1H84A 2XFOA 1PXCA 3DJJA 3P9UA 3KLJA 2OALA 1TDNA 1LVLA 2EQ6A 2JKCA 1GOSA 2OLNA 2H88A 1F6MA 3M0OA 3SGLA 3UKKA 5BULA 1BGJA 5KRQA 5FS9A 3CGDA 1GEUA 4IA5A 1PXAA 2Q6UA 4U8PA 4U8MA 4RG3A 1NHPA 5C2TA 5JCKA 4RG4A 3PS9A 3SM8A 4UDPA 4TLXA 2YVFA 1PDHA 1ZX9A 2BABA 2ZZCA 3LXDA 4NTDA 4PAAA 4U8OA 5JCIA 3VRAA 3GMBA 3OZ2A 1K4QA 3UKLA 1BKWA 1DXLA 1Q1WA 1JRYA 3NTDA 3NYCA 3R9UA 3GD4A 1GT8A 3AE9A 2NPXA 2DKHA 4UDQA 3AYLA 4B68A 1H7XA 4Z2TA 2XLPA 1P2HA 3C4AA 4PABA 3UKQA 3LJPA 2XFQA 3K7MX 3GRSA 2Y6QA 1B8SA 2ZZ0A 4YTMA 3FPZA 1GXFA 4J31A 2WQYA 3P4RA 1NENA 2Z5YA 3GRTA 3NTAA 5EOWA 4CNKA 1M64A 3NHOX 3DK8A 4JNQA 1N1PA 2W0HA 2C72A 2FJAA 2CFYA 2GR2A 2WHDA 4Y4LA 2DKIA 4H4WA 4RSLA 3EAOA 3ICTA 1MXTA 4O5UA 3CNPA 3NKSA 3WE0A 4EMJA 4XXGA 4YTPA 3H4KA 2YG5A 2YLXA 3LADA 5IQ4A 3L8KA 3P1WA 4JNAA 2YR5A 3OC4A 2GQWA 2GAHB 1XANA 3AEBA 3RP8A 3DK4A 3AEEA 1NHSA 1CL0A 3VR9A 1PJ5A 3CPJG 3LZWA 4H2NA 2JAEA 4C3YA 2IVDA 1EL9A 2WDVA 3UTEA 3F8RA 1PJ7A 1K0JA 1NPXA 1XPQA 4GUVA 4H2RA 2V61A 1EL7A 2WPEA 3GYIA 1Y56B 1FEAA 1VG9A 2QAEA 1D7LA 2FJEA 4NEWA 1DNCA 2WP5A 5C3JA 3QVRA 3FMWA 2IIDA 2RGJA 1S2YA 3AE2A 3BI5A 1Q1RA 1CC2A 3B3RA 4CRTA 2E4GA 1RYIA 3CPIG 1PBDA 2YVGA 3GD3A 2I0ZA 5KOXA 4OPUA 3M13A 3AEGA 1S2QA 2JK6A 4YT0A 4H2PA 1KF6A 1H83A 3K7QX 4H4XA 2B9YA 2C65A 1H82A 1YQZA 1NHQA 4LIIA 1TYPA 5KXJA 2XVFA 2WS3A 3HZLA 2BCPA 5KWFA 1E1KA 4E0VA 2E1MA 3ICSA 1IJHA 4CY6A 3ALMA 4LU6A 1TDEA 3F8PA 4A65A 1RSGA 3V3OA 5JCMA 1L9EA 1JOAA 1HYUA 3IHMA 1FECA 5EB5A 2F5ZA 2EQ8A 3FG2P 1REOA 1KFYA 1L0VA 2YQUA 4C3XA 4GF7A 1CBOA 2C7GA 3REDA 4TM1A 4J2WA 3QSEA 1PS9A 4Z24A 4D03A 3K30A 3DGHA 1E1NA 1Y0PA 5BVAA 1LJ1A 1JRXA 3D1CA 1PHHA 1F3PA 1IUTA 1PBBA 1OJ9A 2C67A 1B37A 2PYXA 2R46A 1QLBA 4YKFA 3AD7B 2WBAA 2J3NA 5KVHA 2WOVA 4EQWA 4UDRA 4B1BA 1GSNA 4BK2A 5U63A 3AE4A 5L46A 2H89A 1L9DA 3CGBA 3AEDA 4FX9A 4H4VA 4U8JA 5J7XA 1S3BA 1S3EA 4JY3A 3NIXA 3LOVA 2WETA 3GWDA 4ZCDA 1NDAA 3UOXA 2B9WA 2OLOA 1UKVG 3G5RA 4U8NA 2CVJA 2ARDA 3BHFA 2GR1A 1VRQB 1Z6LA 1KNPA 3UCLA 3SFDA 2JBVA 4B67A 4AOXA 4OPCA 3H8LA 1DOBA 1LQTA 3G5SA 3AD9B 3NK0X 2C3DA 3ABVA 2GH5A 1YKJA 2Y6RA 3GMCA 1CJ3A 4X9NA 4ICYA 3CPHG 2B7SA 2C75A 1ONFA 4CY8A 2V60A 3DMEA 2CULA 4ADWA 2R4JA 5LV9A 4C74A 1BGNA 4GRTA 4YWOA 2BK4A 1OJDA 3C4NA 1YQ4A 2WOWA 3BI2A 4XWZA 1RP0A 2JB2A 2YG3A 4FDCB 4EIPA 4H4UA 2JB1A 4EM4A 1CC6A 1PN0A 2WU5A 2XFNA 3ATQA 4YXDA 1ZMDA 2GVCA 2XDOA 3BNMA 5KVIA 5U1OA 4YKGA 4HA6A 4CNJA 1VG0A 1NAAA 1TDKA 4ZCCA 4B64A 2ACZA 4U8IA 2YVJA 4JN9A 4I58A 1ZOYA 1LTXR 2C70A 2IVEA 4GR1A 1PBEA 2GEWA 1XHCA 3S5WA 1CJCA 3NK1X 5FS8A 1ZOVA 2YLRA 4A6NA 3P4SA 4XWRA 4USQA 5GRTA 1PJ6A 3URHA 3UTGA 4I59A 3GWFA 1O95A 4IVOB 1CJ2A 1F8WA 2X8CA 2C73A 2YG7A 4C77A 2XLUA 2BS2A 2VVLG 2BA9A 3CNTA 4OCGA 3F8DA 3S61A 1DJNA 2OA1A 2V5ZA 1M6IA 1KNRA 1H7WA 4U2SA 1O5WA 4GDPA 3PVCA 1N4UA 2GQFA 1O94A 4U2LA 4U2TA 2GF3A 4DSHA 2YWLA 5M10A 1CF3A 2YAUA 3Q6JA 3CN8A 3DK9A 4KPRA 4LA1A 5FS7A 2OAMA 4MJWA 2PHHA 4J34A 3AE8A 4K5RA 1FOHA 1KDGA 4EQRA 3K7TA 1YY5A 2YM2A 4BURA 1N4WA 4YSHA 4K22A 4DNAA 1E6EA 2X50A 3FBSA 1GPEA 4YSYA 4EMWA 3DA1A 4H4RA 4HB9A 4AT2A 1DOCA 2HQMA 2X8HA 3L1RA 4X9MA 4AP1A 4N9XA 5ER0A 1KSUA 5DBJA 4A9WA 1F8RA 4U8LA 1LQUA 5HHFA 4CCQA 5J60A 3RP7A 3DJGX 1GRBA 3QSMA 1L9CA 1D5TA 4Z2RA 3KKJA 2QA1A 2BXSA 2E5VA 4Z44A 3T37A 1IUUA 3II4A 3NYFA 3UTFA 2C76A 4YSXA 4Z25A 3NH3X 5JCLA 3SFEA 4K5SA 4EMIA 4WCTA 3BI4A 4EQXA 3PO7A 3AE5A 4J33A 3UP4A 2WPFA 4B69A 1COYA 5EB4A 5HY5A 2C3CA 2QCUA 2X3NA 2XFUA 3ATRA 4UP3A 4Z43A 4FK1C 3I6DA 4C5OA 3ISHA 4P9SA 2VZ2A 2FJDA 1MOKA 2Q0LA 3AE1A 3GSIA 3AE7A 2Q0KA 1JEHA 1NG4A 1GRGA 5BRTA 2WDRA 2YLZA 5KOWA 4J56A 2CDUA 3BNUA 2XLSA 4TM0A 2QA2A 4BJZA 4K8DA 3NYEA 1IUWA 1CHUA 3VRDB 2AQJA 3UOZA 4EM3A 3AYIA 5EBKA 1D7YA 2R9ZA 3NG7X 4J36A 5FS6A 4H4QA 3ZDNA 5JCNA 1EL8A 4YSZA 1JNZA 2XVHA 3GDPA 4YTNA 1P2EA 1Y56A 4JY2A 4CCRA 1BWCA 3CNJA 3EF6A 1ZDLA 1DJQA 2ZBWA 5IQ1A 4Z2UA 1E1MA 1GERA 3VRBA 4H4PA 3UP5A 2YLTA 4NTCA 3V3NA 4D04A 3H8IA 4K7ZA 4KX6A 3P4PA 5HXIA 1XDIA 4A99A 1QJDA 2AR8A 4IV9A 4OPTA 1NHRA 2BACA 3UKPA 4OPGA 1GV4A 3CNSA 4IA6A 1GETA 2WEUA 4WX1A 3QFAA 5CQFA 3B6DA 2BCGG 3UOYA 2GB0A 1PBCA 3C96A 1OJTA 4OPDA 1PBFA 2YG4A 2XYOA 2V3BA 2BC0A 4TLZA 2EQ7A 1TYTA 4H4ZA 1B5QA 2YR6A 4H4SA 4A5LA 1DOEA 1H86A 5FMHA 1MO9A 3IWAA 3AE3A 2BS4A 3KVEA 5IPYA 2XVJA 2BS3A 4K2XA 2BYBA 1GRHA 2XLRA 2C66A 2WPCA 3KD9A 3NN0X 1NEKA 4H4TA 3NLCA 3AE6A 3UTHA 2ZZBA 1ELIA 2TPRA 2VQBA 4AT0A 3QFBA 3QSSA 1E39A 3DH9A 4X4JA 3UKFA 1NG3A 3CTYA 3ITJA 5TR3A 5BUKA 2RABA 1JU2A 3AYJA 5U25A 1FEBA 5HYMA 4APNA 3EANA 3AXBA 3FIMB 3AECA 1E1LA 4ECHA 1BF3A 3DJDA 2B7RA 1JRZA 1TRBA 3CGCA 3UOVA 2GMHA 2BXRA 2YLWA 1GRAA 1D4CA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
1TXXA 1QMVA 2RM5A 4O5RA 1H81A 3CRTA 1EBDA 2WP6A 3G5QA 2DSAA 4KA0A 2CVKA 4AP3A 2F51A 1XZOA 2PERA 2IPAA 3RNMA 1D4DA 4L5LA 4AJ8A 2E49A 4B63A 19GSA 3HXSA 2Q7VA 5M0ZA 3WYWA 5ECLB 4O92A 1ML6A 2CT6A 2RGOA 2UZZA 1LPFA 3DJEA 3IV4A 4YAPA 1BZLA 1GESA 4JQ9A 5KMRA 2FY6A 3UKHA 3FEUA 4TM4A 1YQ3A 4IQAA 3GFKA 3LJRA 4IELA 4I2UA 2VRLA 1CJ4A 3DGZA 1DE2A 2R0PA 1NHYA 1SEZA 4TKYA 1ILOA 3SQPA 2WU2A 5IPGA 4M52A 2LEGA 1X31B 3EMPA 1UN2A 2O8VB 5J5NA 3AEAA 3F9UA 3QJ4A 2X99A 2IMDA 1GUHA 1W4XA 4KGIA 2XCGA 2KOKA 2WP9A 3AEFA 1GSSA 4REKA 2A89A 1GTEA 2DIYA 2R0GA 2YV9A 1XXUA 2WRTA 2VCTA 1FAAA 4PQIA 1FL2A 2F8FA 4K0NA 2FUG2 1GNDA 3KPFA 3ALLA 4MF6A 3MSZA 3PPUA 2GR3A 2GAGB 2RGHA 4CDOA 3OR5A 5AGYA 4DSGA 2X4AA 3FW2A 4OVIA 3IF9A 1IUSA 2MMNA 3WD6A 2YR4A 2V41A 1MDIA 3COXA 2LSTA 1GRTA 3O6TA 2XFPA 3EPTA 1K0LA 5IO0A 2FJBA 3VPTA 3GYJA 2WOIA 2VCZA 3IHGA 2O9ZA 4NTEA 3ZVJD 2R2JA 4PNFA 1B4VA 4YQUA 3DMLA 1X5CA 3QD9A 3NNEA 1H84A 1PXCA 3DJJA 3KLJA 3MAKA 3L9UA 1B9YC 1XVQA 2JKCA 4HQSA 2OLNA 2K8SA 2H88A 2X49A 4PNGA 5FS9A 5JWQB 3TRXA 4U8PA 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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