2XBQA

Crystal structure of reduced schistosoma mansoni thioredoxin pre- protein at 1.7 angstrom
Total Genus 32
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
32
sequence length
105
structure length
105
Chain Sequence
SELIELKQDGDLESLLEQHKNKLVVVDFFATWCGPCKTIAPLFKELSEKYDAIFVKVDVDKLEETARKYNISAMPTFIAIKNGEKVGDVVGASIAKVEDMIKKFI
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
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molecule tags Oxidoreductase
source organism Schistosoma mansoni
publication title Structural and Functional Characterization of Schistosoma Mansoni Thioredoxin.
pubmed doi rcsb
molecule keywords THIOREDOXIN
total genus 32
structure length 105
sequence length 105
chains with identical sequence B
ec nomenclature ec 1.8.1.8: Protein-disulfide reductase.
pdb deposition date 2010-04-14

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00085 Thioredoxin Thioredoxin
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.30.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich Glutaredoxin Glutaredoxin 2xbqA00
1GSYA 3P2AA 1YQ1A 2GQMA 1AUCA 1JFUA 3VWUA 4POLA 1UA5A 5IM9A 4K0GA 1OE7A 1ERUA 2NPBA 3GX8A 4DSSA 3VK9A 2GS3A 2CZ2A 22GSA 1IYHA 1F37A 6GSXA 2B7KA 3GL3A 4Q5RA 3FZ5A 5IO2A 3KZQA 4LLRA 4OFNA 1VF2A 2K6VA 1B4QA 2H70A 3F0IA 4POMA 4WEYA 5HR2A 1R7HA 2DMMA 2XPEA 3IHQA 5G1KA 1N2AA 3TRQA 4F82A 1OAZA 3IDVA 1EZKA 4PURA 5H5QA 1U3IA 5JCWA 3M0FA 4G19A 5CRWA 2L4CA 1USBA 3AY8A 1ZL9A 4ZL8A 4MH2A 4NHWA 1FO5A 3QD9A 2MMAA 3TOTA 1K0MA 2WZ9A 3HJMA 3LGCA 2H76A 3A2XA 4F03A 1NHYA 4V2MA 1WRYA 3GKXA 2IWTA 2HLSA 4KDXA 3ERGA 3GFKA 1YEPA 4IS0A 4XHMA 2IFQA 2OA7A 5DQYA 1JZDA 4PX1A 2ZUPA 5G31A 3CSHA 3GYKA 3M9KA 2R5GA 1ACVA 4O5RA 3WGEA 1WWJA 4EF0A 1MTCA 5B8AA 2AYTA 4XTSA 5KN3A 3VWXA 5H5RA 1AC1A 3KH9A 4TR0A 3LYPA 5IMVA 4X43A 1TI1A 3TKPA 2I81A 2K9FA 1ZCPA 3ZLPA 3R2QA 5DDLA 3UIWA 3I6AA 3BJ5A 2K8VA 3L4NA 1RK4A 4I5QA 3HCZA 3IAM2 3IK7A 1B9YC 4J56E 4D73A 2YWOA 4AGSA 3ZMLA 4Q5FA 1A24A 3J7Yb 4DEJA 1WOUA 3VLNA 5DCHA 2L59A 2NTOA 6GSVA 2IL3A 3H8QA 2LJAA 1HNCA 4H86A 1J9BA 2L6DA 3N9JA 3C73A 2OE0A 4GWRA 3W8JA 4MJAA 5D8IA 1B4PA 5J41A 4MPFA 3UOMA 2B6MA 1EV4A 4KE3A 2VO4A 5G30A 5ECOB 2MMNA 2LKUA 3ED3A 2HXKA 1NM3A 2VAFA 3RHCA 3TKSE 4IP1A 4FYBA 1RQMA 2WRTA 1FHEA 4OCFA 1VGLA 4TN8A 2VLVA 1WIKA 4LL1B 6GSWA 3GH9A 2EIQA 2HZFA 1EWXA 1AQWA 1M9AA 5HR0A 5ECPB 5ENUA 5DQSA 2JSZA 1R5PA 4BVYA 3TDGA 3LEFA 1GL8A 1XW5A 3KEBA 3D4MA 3GURA 4TW5A 1O81A 2FNOA 3G7YA 5ECLB 5J5NA 2HNLA 4EVMA 3DWVA 4ZIJA 1TKDB 3F3QA 4XRAA 5EL8A 3TUEA 1BX9A 4IHUA 3VFIA 4DVCA 3IK9A 5IMCA 4YQMA 5D9WA 4QL9A 3IBHA 1WMJA 1LU4A 1WPIA 3UL3A 1GSUA 5ID2A 1SKRB 5CRGA 3WT2A 3FKFA 3UBLA 2LNTA 3TJBA 2QKEA 4BL7A 2L4QA 3KXOA 1A2JA 2I1UA 3GKMA 4IJ3A 4GLTA 3EMXA 2VM1A 2KUCA 3BCKA 4KAEA 1GTBA 1F6MC 1OC9A 4V2NA 2QC7A 4N10A 5B6NA 2HE3A 5AGYA 4NAXA 2X99A 1A0RP 3GMFA 1O8WA 2MBSA 1KTEA 1S3DA 3LYKA 1XW9A 2I9HA 2FWHA 4V2LA 1WJKA 5CREA 2HSHA 4RI7A 1WE0A 2OBIA 3SBCA 1XWBA 2H71A 4I2TA 4O7HA 2P5RA 1Y6EA 5L71A 2VL3A 2QGVA 1YEXA 3APQA 3U6VA 1K0BA 2VLTA 6GSYA 2EIOA 2ON5A 3F6DA 3LORA 3NOFA 2VUPA 4MPGA 4EO3A 1X9SB 2B5YA 2H8LA 3UMAA 1R5AA 3QAVA 2TIRA 4G10A 5LNKe 3KTBA 4JRRA 4ZILA 1XWKA 1DBYA 2YWIA 4HUAA 2PPTA 4MK3A 3BD2A 4LL4B 4IQ1A 3U5RE 2P31A 1GRXA 4ZL7A 3QCPA 4KCEA 1PX6A 3QFBC 19GSA 12GSA 3D22A 5DJLA 1B8XA 4KCAA 3D6IA 4CHSA 2PUKC 3EINA 3M9JA 2H0IA 4EC0A 1DE2A 4K7NA 2YWNA 3TJGA 3FR9A 4ILFA 4HU9A 2B5EA 2O89A 4MCUA 3VWVA 1VF1A 4KDUA 2P5QA 5HR1A 2B3SA 1SJIA 3UVTA 1A0FA 4NV2A 3H93A 3L9UA 5HQPA 1GTUA 2NBSA 2GZYA 1SK2A 1A8LA 5A4UA 2HRNA 3TKRA 2NDOA 5GAND 2B5XA 2DJ1A 1JLVA 1GLQA 2R3XA 4BWQA 4KSOA 4NXIA 3HXSA 1CQGA 4XS6A 4IW9A 4F0BA 4HOJA 2CX3A 2WB9A 4MABA 2YV9A 2LTKA 3ME8A 1EOGA 1PD21 2H74A 1G7OA 5A5KA 2YP6A 2PGTA 2YOIA 3FZ4A 3PR8A 1YF1A 4ISDA 2OADA 1K3LA 5D9XA 1EGRA 1R26A 2H6ZA 1O7UA 1XVWA 2MZCA 2H0GA 1QFNA 3FRCA 1ERWA 2X8HA 4XRDA 3EE2A 3G7IA 3KM6A 3Q18A 5CRDA 4K7OA 5KN1A 1DSBA 3I43A 1XCCA 4HZ2A 2OBKA 4FO5A 4AJ6A 4YAVA 2I3YA 5DAKB 1TP9A 1PKWA 4FYUA 2H6YA 1FOVA 4BA7A 2TRXA 1OKDA 3CTGA 1OC8A 1R4WA 3C1RA 5AIXA 1OVNA 3A2VA 3E0UA 4IJIA 1XWGA 1Q98A 1ERVA 3FY7A 3MDKA 4PNGA 4XS4B 2C3NA 3PINA 2DLXA 4JE1A 1GSEA 1TOFA 1V58A 5JCGA 1U6TA 3EU3A 2JU5A 3ZREA 1XVQA 4ULXA 5HFKA 1T4YA 2G2QA 5GSTA 2H6XA 4ZB8A 2LQOA 4MLYA 2O85A 1FB0A 3OR5A 4TR3A 5F0GA 5C00A 5EVOA 2DJ0A 2FWEA 1O8XA 1XPVA 4AJ7A 4NMUA 2CVDA 2PN8A 4EUYA 2C0EA 2HSYA 2OKAA 2LRCA 3ZIJA 2YCDA 4GF0A 2BMXA 1UC7A 5F07A 2IMFA 1BQ7A 4ZBBA 1K3YA 4J2FA 2ES7A 3KCMA 5E4WA 4IP6A 3O6TA 3M3MA 3F8UA 3QPMA 4KGIA 2V6KA 2FUG2 1X0RA 4ECCA 1EP7A 1K3OA 2MBTA 3C8EA 4XCSA 3ZVJD 2FWFA 3F9UA 2E2MA 3D21A 2O7KA 5IOXA 5LD0A 1SKWB 1DUGA 4EDZA 1JHBA 1W89A 1QK8A 3US3A 4K8MA 5J9CA 3EWLA 1V40A 1BJXA 4MZBA 3DVXA 3L9SA 3ZTLA 5J4UA 3F3RA 2B1KA 4ECBA 2YJ7A 2GT5A 1FVJA 3FZAA 1NHOA 1SK1A 4K1FA 2F8AA 5DVBA 1EP8A 5D9VA 5G1LA 2GQLA 5EPFA 4KA0A 4WF4A 2JADA 1YJ6A 3LFLA 4HU7A 4PUAA 1FB6A 5ECHB 4MF7A 4WF5A 1PKZA 2MYGA 4I6XA 4F2IA 2VL2C 4F9ZA 2FWGA 3GHAA 3KMNA 1AW9A 3C1SA 3DD3A 1X5EA 3DKSA 2O8VB 2G0FA 3IC4A 2OJLA 2FA4A 4MZWA 4ML1A 2XHFA 4OD7A 2DIZA 3VURA 2CVKA 3RBTA 1I5GA 1TRWA 3MWHA 3TOUA 8GSSA 3CRUA 3O3TA 3ZFLA 1SL1B 3GRXA 5ECQB 2CVBA 2C80A 3HD5A 1O73A 1BEDA 4HI7A 1K0AA 1GTIA 4WR4A 4WKWA 3GV1A 5JCUA 3WD6A 2C3QA 1XFLA 3HY2A 4KX4A 2PMTA 1TW9A 1EEMA 2H1GA 5IMAA 3FR6A 2GSRA 2Z9SA 3CTFA 4EL1A 3APOA 1B9XC 5IIZA 5IMFA 2H73A 2AB6A 4L0WA 1GULA 2KP1A 4FYCA 1XOBA 1H75A 5CNWA 3HDCA 1TRVA 3UVHA 3H1NA 1NSWA 3KH7A 2DMLA 3L78A 2DJKA 2MMOA 1TU7A 5CP1A 4HQZA 2AAWA 1F3AA 2VL2A 2HFDA 5FWGA 2CAIA 1OC3A 14GSA 4WBJA 5IOWA 1T3BA 2FLSA 1GWCA 4OWYA 3CYNA 4PXOA 4RQXA 4GQFA 2KOKA 3IE3A 3CSJA 4GXZA 3KP9A 4ZL9A 1Y25A 1ON4A 1ILOA 1OYJA 4GSTA 2PVOC 3MAKA 4HZ4A 1G7EA 5GAPD 4WXTA 3LG6A 2NVLA 3LSZA 4K7IA 2FGXA 3F6FA 4E8HA 1T00A 2LQQA 1BG5A 1S3CA 2IMEA 2H01A 4BVXA 1EV9A 1OKTA 20GSA 5D73A 3HZ4A 4YQVA 3A2WA 2E2GA 4LMWA 1SYRA 2GSQA 2F9SA 5JWQB 3FK8A 1AQXA 1Z7PA 3IOSA 2LJRA 2DJ3A 2M80A 1TRSA 4N0ZA 4AJ8A 5F8BA 4JR4A 3TKSC 2GZZA 4JR6A 4G2EA 1MD3A 1YZXA 1WP0A 4XS4A 1JZRA 1TK5B 2JZRA 3LXTA 5HFGA 1MD4A 4CDOA 1FAAA 11GSA 2PBJA 1PGTA 1AQVA 2LEGA 1BAYA 1J0FA 3DXBA 3DGQA 1UVZA 4GSSA 1HNAA 4OFMA 4PQHA 3QR6A 1Z6NA 4MA9A 4Z7XA 2AV4A 1YKCA 2WGRA 2GQKA 3TRXA 4IKHA 5DBQA 2CX4A 3NIVA 3F4TA 2DSAA 4ECJA 1HNBA 13GSA 1K0DA 16GSA 3W6GA 5IPHA 1PL2A 2RM5A 1F9MA 1FW1A 2OE3A 3EU4A 4KNDA 2ALBA 3L0HA 3EURA 5ECKB 3H79A 2C3TA 5ECNB 3D0ZA 3TKSA 3ZRDA 3FZ9A 4OCEA 3BOAA 4K2DA 4Q5NA 3NZNA 4D73B 2O87A 5IMDA 3W8SA 2VL9A 1MDKA 1BYEA 3A5WA 2VCQA 2JACA 3ME7A 4FIWA 5B8BA 3E3EA 1NW2A 3CBUA 3GX0A 1EEJA 1XWAA 3WT1A 7GSSA 4POKA 4TXOB 1ABAA 3A3TA 3QAGA 3VI5A 1G6YA 2C4JA 1G6WA 1ZMAA 1M2BA 5E59A 2RUFA 2HZEB 2R2JA 2R6KA 1JZWA 3UAPA 4GSNA 1ZYEA 2WCIA 1A2MA 3QMXA 4WBRD 3ZZXA 2FCHA 2L6CA 5H5SA 3E9JB 2C0GA 3KGKA 2VCVA 3EC3A 3MSZA 1KNGA 3ERWA 2GSTA 3HVVA 4KB3A 4KH7A 3M8NA 1TJDA 1XWCA 1VRSD 2I4AA 3TGZA 5ECSA 1T8EB 2M46A 2EIRA 1W4VA 1JZOA 5B6MA 2HI7A 1Z6MA 2VOCA 3S9FA 1QUWA 4IQAA 5CYYA 4GRFA 3IPZA 5JWRB 4YH2A 4I2UA 3GIXA 2H75A 2IPAA 4XS1A 2F8FA 4K0NA 3WGDA 1A8YA 2KP2A 3GKNA 5D93A 1HD2A 4DSRA 4HDEA 4QL7A 1K0NA 3QAWA 4L5OA 2YJHA 1SJZA 2CQ9A 1PL1A 2XBIA 2YZUA 1PX7A 1QGVA 3KP8A 4KUNA 1SU9A 5IO0A 3TKQA 4E8EA 3GH6A 2FA8A 1GUHA 5G2ZA 4X1UA 1THOA 4FH8A 4OO4A 5COHA 2B7JA 2V41A 1PN9A 3VWWA 4YAPA 5JWOB 1O85A 2DC5A 1X9WB 5J3RA 3UEMA 2LNSA 2AUVA 2LSTA 3ZFBA 3Q19A 4L5LA 1M9BA 1U87A 3RDWA 3KJYA 2JL4A 1PMTA 5KEJA 5AISA 3FW2A 5LCZA 1I9DA 5IPGA 3DVWA 4RI6A 2LJKA 2V32A 2LV3A 4X0XA 2N5FA 4HQSA 4N30A 1K0CA 3JCML 1SKSB 3DEXA 3HVSA 3QFAC 5ELAA 1E2YA 5J9BA 2M72A 2A4VA 1ZOFA 1XOAA 2L57A 4IELA 3I69A 1F2EA 4IBPA 2VD1A 2H1DA 2GDRA 3WGXA 1ERTA 2YANA 4ZB6A 4RQRA 5A4VA 1M0UA 4JEDA 2FHEA 4IGJA 2H1AA 6GSTA 2L5OA 1QMVA 3UBKA 5KN2A 4NV5A 5A4WA 4MJBA 1TK0B 3MNGA 3KMOA 2XPDA 2CZ3A 4LA1A 4PQIA 2C0DA 4POBA 4RUVA 1V57A 3TJKA 3HYPA 3P90A 4MH3A 3EYTA 2QSIA 2XBQA 5ECIB 3VPQA 3N5OA 4N0VA 1JLWA 5HFIA 2R4VA 3O76A 4GCIA 1X5CA 1GNEA 4PGTA 2IMIA 2DJJA 4V1Ag 1GSDA 2OE1A 5GSSA 2GLRA 2LS5A 2ON7A 1ST9A 3GTUB 3Q74A 1KEBA 2H0HA 1ZGNA 4K9ZA 1M2AA 4TR4A 1E6BA 1TK8B 3TB2A 2VCTA 3V1WA 1GSFA 2VIMA 4MZCA 1THXA 4TRXA 2BJXA 2H1BA 5GZZB 4HJMA 4TR1B 1LBKA 5ELGA 2R37A 3IAS2 5IQYA 2VLUA 4ACSA 1YKAA 1XZOA 3GNJA 1SD9A 2GT6A 3LWAA 5C04A 3IV4A 3HKRA 1A2LA 1MEKA 1ML6A 4EDYA 2F51A 10GSA 1N8JA 2JZTA 2V1MA 2YV7A 2TRCP 2N5AA 4PQ1A 3CSIA 1Z3EA 3DRNA 4EXJA 3J7Yk 1U3AA 2ZCTA 3CRTA 1Z7RA 5DJMA 2A2RA 2WULA 2E0QA 2HRFA 3FHKA 1GSQA 3DIEA 1SJ6A 3GSSA 4JZQA 1Z9HA 1XW6A 2HT9A 2KLXA 2VM2A 3WYWA 2V6OA 4TOPA 3KD0A 4ECIA 3VPTA 1HYUA 4V1Ap 3PH9A 4O92A 2DBCA 3SWLA 2HYXA 3HA9A 1V98A 3ZMKA 4P3YB 4TXOA 2PU9C 1SD8A 5DALB 1CQHA 4I8BA 4CW9A 4TVEA 2HZEA 2K18A 2AHEA 2AJQB 1XXUA 2C1YA 3EMPA 2EC4A 3CMIA 1TU8A 4MMMA 1PSQA 5F06A 5ECMB 3QOUA 1TDIA 5D96A 2C8UA 4MF6A 5ABRA 2YPMA 1S3AA 3L9VA 5AN1A 1GNWA 5DCGA 5EY6A 2D2ZA 1URMA 4KSMA 4EKZA 3F4SA 1SYXA 5CO3A 3F63A 2PWJA 1UN2A 2KHPA 2RUEA 1XBSA 2CV4A 5AIVA 2GVPA 4IN0A 4EE0A 3CXGA 9GSSA 1PQNA 2J23A 3LXZA 2VCWA 4PUFC 4WETA 3FYGA 2IMKA 1VF3A 4DSSB 3QDNA 2CT6A 2DJ2A 3ZIVA 1SENA 1QXHA 2DIYA 2H72A 4L8EA 2K8SA 5G5FA 5DAKA 2X8GA 3KTLA 1XIYA 3H4KA 2OACA 4OFTA 1HQOA 3D4TA 2REMA 2LUSA 2WJUA 3ZVJA 2X8CA 4HS1A 2PVQA 1GTAA 2YWMA 2IIYA 1RW1A 4XIHA 1TXXA 2WDUA 4OMVA 3ZYWA 1Q4JA 2BTOT 3GN3A 2RIIA 1GLPA 4KW6A 3HVXA 3I9V2 3RPPA 3RPNA 4TKYA 4ZBDA 4N11A 2GZPA 4ZB9A 2H30A 1T7PB 6GSUA 3ISOA 6GSSA 3P7XA 1A23A 3ZITA 1V9WA 3DMLA 1FG4A 2IFQB 4MJEA 3PGTA 1GSSA 3LJRA 3GL5A 2F3MA 2H66A 2IN3A 1GP1A 2VCZA 2ZNMA 3P8WA 5D9TA 2RM6A 1M2DA 1MDJA 4LMVA 4BWSA 5ECRB 3BBYA 5CRHA 1SK0A 2X64A 4JBBA 1AXDA 4Q5QA 2RLIA 3TCOA 1C72A 2FY6A 5KN0A 3EVIA 1J08A 3APSA 1OE8A 2VCXA 4ID0A 2MMZA 4NPBA 3HHVA 1TRUA 1IYIA 3ZL5A 2IMDA 3GA4A 1EGOA 1V2AA 2GGTA 1GUMA 3D5JA 3IXRA 5INYA 3C7MA 1FVKA 1AAZA 3LQ7A 3BCIA 3HZ8A 1X9MB 1O6JA 1SL2B 4AF2A 3VI7A 3Q6OA 2C0FA 3GTUA 3TRPA 1KBNA 2GTUA 2YNXA 1GUKA 1SL0B 3K8NA 1PRXA 3G9BA 3IA1A 4MP4A 1F3BA 2E7PA 1TI3A 4PNFA 3RAZA 3TJJA 3RHBA 3DYRA 4GQCA 1TTZA 3ERFA 1ZZYA 1YY7A 4TR1A 4MDCA 4NHZA 4K6XA 4MF5A 2CA8A 2FD3A 5G5EA 5B7CA 2P0GA 1QQ2A 4L0UA 3UJ1A 4IVFA 3C71A 4O32A 2A2SA 1PA3A 4HJ2A 1Z5YE 4YQUA 1K0OA 4WR5A 1GH2A 2WS2A 4I97A 3FR3A 4J57E 2GSSA 3HJPA 2H19A 1YF0A 4TXVA 4GTUA 2L5LA 4ZBAA 4G9HA 1ZYQB 3IRAA 3M1GA 5HR3A 18GSA 4ML6A 3G7JA 17GSA 1YDKA 2JZSA 3HJOA 4DSQA 5F05A 5ID2B 1X5DA 2YN1A 1DE1A 4NWYA 1M7TA 2YZHA 3GSTA 2J9HA 4BPYA 2WFCA 3F4RA 1AIUA 5DALA 4ZXGA 2CAQA 5CAXA 1G0TA 3IR4A 4JU5A 3UARA 1B48A 1U88A 1LJRA 2VD0A 1MDIA 4F0CA 1OC9B 1H4OA 5FHIA 1M99A 3TJFA 2N5BA 2PERA 5FT3A 4HEA2 2LRNA 2B1LA 4OO5A 1T4ZA 3GKKA 2IJYA 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chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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