2R0GA

Chromopyrrolic acid-soaked rebc with bound 7-carboxy-k252c
Total Genus 156
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
156
sequence length
527
structure length
522
Chain Sequence
b'APIETDVLILGGGPVGMALALDLAHRQVGHLVVEQTDGTITHPRVGTIGPRSMELFRRWGVAKQIRTAGWPGDHPLDAAWVTRVGGHEVYRIPLGTADTRATPEHTPEPDAICPQHWLAPLLAEAVGERLRTRSRLDSFEQRDDHVRATITDLRTGATRAVHARYLVACDGASSPTRKALGIDAPPRHRTQVFRNILFRAPELRSLLGERAALFFFLMLSSSLRFPLRALDGRGLYRLTVGVDTMDSFELVRRAVAFDTEIEVLSDSEWHLTHRVADSFSAGRVFLTGDAAHTLSPSGGFGMNTGIGSAADLGWKLAATLRGWAGPGLLATYEEERRPVAITSLEEANVNLRRTMDRELPPGLHDDGPRGERIRAAVAEKLERSGARREFDAPGIHFGHTYRSSIVCGEPETEVATGGWRPSARPGARAPHAWLTPTTSTLDLFGRGFVLLSFGTTDGVEAVTRAFADRHVPLETVTCHAPEIHALYERAHVLVRPDGHVAWRGDHLPAELGGLVDKVRGAA'
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

molecule keywords RebC
publication title Crystallographic trapping in the rebeccamycin biosynthetic enzyme RebC
pubmed doi rcsb
source organism Lechevalieria aerocolonigenes
molecule tags Oxidoreductase
total genus 156
structure length 522
sequence length 527
chains with identical sequence B
ec nomenclature
pdb deposition date 2007-08-19

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF01494 FAD_binding_3 FAD binding domain
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.30.9.50 Alpha Beta 2-Layer Sandwich D-Amino Acid Oxidase; Chain A, domain 2 D-Amino Acid Oxidase; Chain A, domain 2 2r0gA02
3.40.30.120 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich Glutaredoxin Glutaredoxin 2r0gA03
3.50.50.60 Alpha Beta 3-Layer(bba) Sandwich FAD/NAD(P)-binding domain FAD/NAD(P)-binding domain 2r0gA01
3ALLA 4H2QA 5KVHA 1Q1RA 3ICSA 1NEKA 1BGNA 1NHPA 2A87A 2GV8A 2WU2A 3PO7A 4HB9A 3NRNA 3LZWA 3DK9A 3NK0X 1OJTA 1E39A 2JKCA 4OCGA 4Z2RA 1PJ5A 2GMHA 4RG3A 3QVRA 1Z6LA 1PDHA 2B76A 3H4KA 4ICYA 4EQXA 1F3PA 2FJDA 3UTHA 2PYXA 4U8KA 1REOA 3AEAA 2WQYA 4UDQA 4K2XA 4BK2A 4FX9A 1D4DA 3F8RA 3UKFA 1DJNA 2Q6UA 4P9SA 4A79A 3P4QA 4ZCDA 5TR3A 2R0GA 2AR8A 3G5SA 5HXIA 4GR1A 2AAQA 3ADAB 1O5WA 2YG5A 5JCMA 3CNPA 3K7QX 1PJ6A 4PAAA 3GRTA 3HZLA 4U2LA 4H4YA 1DOBA 3E1TA 1D5TA 2B9WA 3P4SA 1O94A 2APGA 4TM0A 1E1MA 1LPFA 4K22A 1DOCA 2C65A 5U63A 2BA9A 1B8SA 3B3RA 4UP3A 1NHRA 4H4VA 4I58A 1PJ7A 1TDNA 3NT6A 4X9NA 3SFDA 4K7ZA 2X8GA 2DKHA 3VR9A 3ZYXA 1PBFA 3KA7A 2WS3A 2GF3A 1GRBA 1TDFA 2NPXA 2WBAA 2YVFA 2XLSA 1KF6A 3Q9TA 4I59A 3KKJA 3AD9B 4EIPA 1N4UA 4TM3A 3NYCA 5HYMA 1Q1WA 4GRTA 2YLZA 1GRGA 1B5QA 1E1LA 5C3JA 3ITJA 4A6NB 1JEHA 2WEUA 3CPJG 1MOKA 2EQ7A 4H2RA 2YQUA 3QFBA 3FBSA 3CGBA 5BRTA 1V59A 4BJYA 2WETA 3PVCA 3F8PA 2WESA 1BF3A 4DSHA 3FPZA 5HHFA 2Z5YA 4XWRA 1CJ2A 4ZN0A 1QO8A 1XHCA 2ZZ0A 1ZMCA 1M6IA 1IUWA 2WPCA 1GRHA 2C64A 3NN0X 2XLUA 1DODA 2XVJA 2BACA 2C67A 2YR5A 3VRAA 1JRZA 2QCUA 3NYEA 1OJ9A 3VR8A 4C3YA 5KXJA 4B67A 3IF9A 1B37A 1N4WA 3SQPA 5GRTA 2WP6A 4GUVA 1TDEA 1EL9A 1TRBA 3KVEA 4H50A 2E1MA 3K7MX 4U8NA 3IC9A 4J33A 3RNMA 1ZOYA 4TM1A 3AECA 4JDRA 1L0VA 5HY5A 4GDPA 1JRXA 1SEZA 5U25A 4AOSA 1D4EA 2I0ZA 4CY8A 4J31A 4APNA 2BYBA 4K8DA 1X31B 3B6DA 1K4QA 1S2YA 1NHQA 5KOXA 1PS9A 2FJEA 2Y6RA 1PXBA 4YXDA 3AEDA 3CGDA 1ELIA 1FEBA 3CNSA 4KX6A 2GR1A 3BI2A 4YWOA 4H4PA 3M13A 2B7RA 2WDVA 1EBDA 4CNJA 5GSNA 5JCNA 1P2EA 1ZP0A 4YKGA 1K0JA 3NG7X 1ZX9A 2XFPA 5IQ4A 5JCIA 3CNTA 1GV4A 3COXA 3NLCA 4B64A 3GRSA 3R9UA 1FL2A 2JB3A 4Y4NA 4YSHA 4CRTA 1AOGA 2YG6A 4H4SA 3V3NA 4Y4MA 2A8XA 1TDKA 3D1CA 1YQ4A 3BNUA 3UKLA 3UP5A 2GEWA 4RG4A 1EL7A 1Y56B 3P4PA 4NTEA 2C70A 2R45A 2R9ZA 3GMCA 3NYFA 4H4RA 3FG2P 2BCGG 1GSNA 1LVLA 3CIRA 1F8SA 1OJDA 1XPQA 2XVEA 3ATQA 3ATRA 3P9UA 1K0IA 4U8LA 3UTFA 4YSXA 2XLRA 2GMJA 3CN8A 1BGJA 1GXFA 2XVHA 3DMEA 1RP0A 5BUKA 2CULA 5L46A 4A5LA 1ONFA 1FOHA 4LU6A 2RGOA 3UKQA 1CC6A 3QSEA 4BK1A 1H84A 3AB1A 2YR6A 2VVLA 3GDNA 3UP4A 3DK4A 4D03A 2XVIA 4YTNA 1EL5A 3CNDA 1GTEA 1D7LA 2C66A 3OZ2A 3SGLA 4RSLA 4TLZA 4U8JA 3AYLA 1E1NA 1H7XA 2JB1A 3FMWA 1QJDA 2TPRA 3P4RA 1MXTA 4WCTA 5CQFA 1CF3A 3REDA 5DBJA 3II4A 3F8DA 5EBKA 4C5OA 1H86A 5M10A 3NHOX 3RP6A 1E6EA 1KFYA 2C76A 3H8LA 5EOWA 1JRYA 4BJZA 3GWFA 4OPLA 1LQTA 1LTXR 1GREA 2YLXA 2V60A 1CC4A 4H4QA 3UKKA 2BS3A 4IA5A 3SFEA 4IA6A 5BVAA 2NVKX 4Z26A 1D4CA 2Q7VA 2C7GA 1YKJA 2PHHA 3AYJA 1NG3A 3AE9A 1IUUA 4GF7A 2IVEA 3CPIG 2E5VA 1PBCA 2ZBWA 3CGEA 2GQFA 3AEGA 3L1RA 4KPRA 1CL0A 1PHHA 2Q0LA 3EF6A 1GALA 4OPTA 1H83A 1YQZA 1L9DA 1NG4A 1KNRA 3UOXA 1ZMDA 1D7YA 5FS9A 3V76A 4OPUA 4EQSA 2XLPA 4Z25A 4B1BA 4Z44A 3AE6A 5KWFA 4GCMA 1S3EA 2XFQA 2GB0A 1IUXA 5JCKA 2UZZA 1ZK7A 4X4JA 4EIQA 2FJBA 1O95A 1GRFA 2VOUA 3DA1A 1NPXA 4YSYA 1DOEA 4U2TA 5IQ1A 4J36A 4B68A 4D04A 4C74A 2VRMA 3IWAA 4U8OA 1DJQA 2V6OA 3AE4A 4A99A 1NENA 4OPGA 3S61A 4U8PA 4B69A 2GQWA 2WP5A 1YY5A 4AOXA 4AP3A 1E1KA 2WPEA 1K0LA 3UOVA 2Y6QA 4USRA 2YVJA 1GETA 1GNDA 3ICTA 4YTPA 4CNKA 4K5SA 3LXDA 5EB5A 3NN6X 1CJ3A 1BKWA 2J3NA 3CNJA 3VRBA 1Y0PA 1KNPA 3AE2A 5BULA 1LV0A 2RABA 1TYPA 4JN9A 3BHFA 1CC2A 1GTHA 2VQBA 3WE0A 4JNAA 3C4NA 2GVCA 2R4EA 2WDQA 4REKA 2H88A 3V3OA 3M0OA 1QLBA 1W4XA 2Q0KA 4B63A 4CBQA 1F6MA 3AE8A 1TYTA 3AEBA 4B65A 2X99A 3GD3A 2B9YA 1UKVG 3UKAA 2F5ZA 3O0HA 1VG9A 3DGHA 2FJAA 4HA6A 3VQRA 1HYUA 1PBBA 3AWIA 1JOAA 4NZHA 2R0CA 2BK5A 1H7WA 1LJ1A 2X50A 1PN0A 3DH9A 3IHMA 3KD9A 3PS9A 1VQWA 3NK2X 2WOIA 1DXLA 2BC0A 3H8IA 3GWDA 4H2NA 2CVJA 3CTYA 4LA1A 4DNAA 4TLXA 4H2PA 3UKHA 3ALMA 1KSSA 1B4VA 3AD7B 4NEWA 2IIDA 1L9EA 3DJGX 3NKSA 1IUTA 1ZOVA 3EAOA 4PABA 2YM1A 2YLRA 4YSZA 4U2SA 2Z5XA 1E7PA 5KOWA 3LADA 4U8MA 4OVIA 1H82A 3ICRA 4ADWA 3UTEA 2JBVA 3P1WA 1IUSA 2V61A 3OC4A 1PBDA 2VVLG 2BXSA 3ISHA 4NTCA 2QAEA 2BS2A 3VRDB 2CFYA 3LJPA 5FMHA 1FCDA 3KU9A 2R0PA 3IHGA 2QA2A 3KLJA 3BI5A 2QA1A 3LOVA 4JQ9A 3UCLA 4C3XA 2RGJA 4H4WA 3QJ4A 2YM2A 2O9ZA 2BS4A 2XVFA 1YQ3A 2WOVA 5FS7A 2OALA 1LQUA 4JY2A 5EB4A 1VRQB 2JAEA 2EQ8A 1JNRA 1RSGA 4H4ZA 3NGCX 3L8KA 2VVMA 3AE1A 2GR0A 2XFOA 5J7XA 4OPCA 2YVGA 1EL8A 3AEFA 2R4JA 3RP7A 2EQ6A 2BCPA 2B7SA 2WOWA 2C3DA 1CJ4A 4DGKA 3QVPA 3DJJA 1Q9IA 3AE7A 4H4TA 4A65A 4BURA 1GEUA 3BHKA 4EMJA 4GDEA 5KVIA 4Z2TA 2TMDA 3RP8A 1GT8A 3LZXA 3K30A 4Z24A 3DJEA 1FECA 4LIIA 1H81A 2YG4A 1VDCA 1F8RA 4EQRA 2OA1A 4OPDA 2W0HA 4J56A 2CDUA 4AT2A 3ALJA 4ECHA 4E0VA 3AE5A 2WPFA 4XXGA 3UKPA 2A89A 2B9XA 4EM4A 3CPHG 3EANA 4JY3A 2BK4A 5FS8A 4IVOB 2AQJA 4UDRA 2V5ZA 4ZCCA 4B66A 5C2TA 3AD8B 4O5QA 1OJAA 1N1PA 4J57A 3M12A 4YT0A 2BXRA 3EPTA 1OJCA 4IVMB 2BK3A 1N4VA 2YLSA 4DSGA 1TDOA 2XDOA 2ARDA 1JU2A 2JK6A 4A9WA 1MO9A 3ABVA 1FEAA 1NHSA 3GYIA 2H89A 1P2HA 2YWLA 3DGZA 1IUVA 1BZLA 3G5QA 2DKIA 1VG0A 3QSSA 4H7UA 4CCQA 2VZ2A 2OLOA 1GOSA 3G5RA 4Y4LA 4A6NA 3NIXA 3NTDA 3DK8A 3T37A 2X3NA 3GDPA 1ZDLA 2OLNA 4BV6A 4N9XA 2VRLA 4Z2UA 2IVDA 2GR3A 3GSIA 2V3BA 3CGCA 2YR4A 2VQ7A 1S2QA 4FK1A 2XFNA 4FK1C 4H4UA 1NAAA 1KDGA 4O5UA 3GYJA 5KRQA 2JB2A 3BI4A 3GD4A 1XANA 1GERA 2XCGA 5CKUA 3NNEA 5ER0A 4J34A 3SM8A 2C73A 3FIMB 3I6DA 4M52A 1NDAA 3AEEA 4MJWA 2X8HA 3ZDNA 2BABA 4OPIA 4AT0A 4BK3A 1L9CA 1IJHA 4CCRA 4K5RA 1GRAA 2C72A 1BWCA 3JSKA 1CBOA 2YG7A 4U8IA 2C3CA 4TM4A 3AE3A 3NH3X 2GAGB 1PXAA 2OAMA 2BC1A 4EMIA 3C4AA 3C96A 1CJCA 3NK1X 4USQA 2V3AA 3UOYA 5FS6A 4AP1A 4C77A 5J60A 2ACZA 2YAUA 4XWZA 4CY6A 2GH5A 2YLTA 4J2WA 1ZY8A 2GAHB 3QFAA 2ZZCA 2WHDA 4UDPA 4EMWA 5IPYA 2XFUA 5LV9A 4JNQA 5M0ZA 1ZKQA 1PBEA 3GMBA 3I3LA 2R46A 2YG3A 1GESA 4YTMA 1KSUA 4IV9A 2GR2A 2FBWA 3URHA 3UOZA 4FDCB 5JCLA 2XLTA 3K7TA 1COYA 4A7AA 2X8CA 1S3BA 2WP9A 1M64A 1GRTA 3NTAA 4NEVA 4Z43A 1DNCA 3BNMA 2GRTA 2HQMA 1Y56A 4WX1A 3UTGA 2YLWA 2RGHA 4NTDA 4X9MA 3RHAA 2ZZBA 3AYIA 1F8WA 1CHUA 1PXCA 4YKFA 3KPFA 1H6VA 3AXBA 1XDIA 2C75A 3LB8A 3QSMA 4EQWA 3Q6JA 2EQ9A 3DJDA 3S5WA 4H4XA 4EM3A 2WDRA 1GPEA 3D8XA 2XYOA 1RYIA 1JNZA 2WU5A 5U1OA 2E4GA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
3ALLA 1TU8A 4H2QA 1YEXA 2VCXA 4IW9A 3ICSA 2GV8A 5A4VA 4JE1A 1E39A 2BRYA 5CRWA 2MMOA 4Z2RA 1PJ5A 18GSA 3QVRA 4TXVA 1PDHA 2B76A 2C3QA 2FJDA 3UTHA 4HQZA 1D4DA 2H1AA 2H0HA 2N5AA 2R0GA 3FRCA 1K0OA 2B7KA 5JCMA 3K7QX 4PAAA 2H74A 3CTGA 1SU9A 4H4YA 1JHBA 2B9WA 1O94A 2APGA 1XXUA 3QAVA 5U63A 5HR3A 3N9JA 1B8SA 2LSTA 5ECSA 3L78A 3MAKA 3TCOA 4K7ZA 6GSUA 4BWSA 2DKHA 2L5LA 5LCZA 3VR9A 4MF6A 3ZYXA 2VUPA 3EYTA 2GF3A 3E3EA 1PMTA 1GRBA 1TDFA 2NPXA 2WDUA 5DQSA 4JU5A 7GSSA 3NYCA 2VLTA 2H70A 1SKSB 1GRGA 1R5PA 2HSMA 1B5QA 1E1LA 2OE3A 2WB9A 3TRXA 2YQUA 3QFBA 5DCGA 2E2GA 3GH6A 3CQFA 3GKMA 3ED3A 2GQKA 3SZFA 3W4JA 1XHCA 1ZMCA 5GAND 3FKFA 5IPGA 2XLUA 1U3AA 3VR8A 4B67A 3ZIJA 4G2EA 2WP6A 2C3TA 5C00A 2O8VB 4Q5QA 3ZTLA 4G10A 4YQVA 5IMVA 4GXZA 3ZFBA 2X4AA 4JDRA 2YP6A 1JRXA 3HVVA 1SEZA 2PPTA 2RLIA 2I0ZA 1C0KA 4ZBAA 4CY8A 1U6TA 3CMIA 1AQWA 4HOJA 1NHQA 3QFAC 2LJRA 2FJEA 4IQAA 3FR9A 3CGDA 4JR6A 1DDOA 3M9KA 1EBDA 4WXTA 3FZAA 3VWVA 4MP4A 3UEMA 1Z7PA 4YKGA 3F8UA 3NLCA 1GV4A 3MYDA 4BL7A 1F2EA 4K9ZA 4YSHA 1E2YA 2CZ3A 3RHBA 5D9WA 1PX6A 3V3NA 2A4HA 5CREA 5H5QA 2C70A 2R45A 3GMCA 2BCGG 1EVIA 1MD4A 3UJ1A 2XVEA 1OC9B 3ATRA 3P9UA 4YSXA 1B9XC 2YZHA 5JWQB 3LSZA 1RP0A 3VLNA 1ZOFA 3DKSA 4NPBA 2CULA 2RGOA 1OKTA 3LYKA 6GSYA 4KNDA 1XW9A 1ACVA 2C3NA 4V2MA 1OAZA 4D03A 2XVIA 4YTNA 4G9KA 3IE3A 2C66A 3SGLA 1M9BA 1X5CA 4XS6A 4TLZA 3AYLA 1E1NA 4KX4A 3FMWA 4HJMA 2TPRA 3WYWA 1LU4A 5H5RA 1CF3A 3REDA 3G7IA 2YJHA 3F8DA 5EBKA 1E6EA 1KFYA 3GWFA 11GSA 2IJYA 4OO5A 1GREA 2V60A 1CC4A 5EVOA 2HSHA 4H4QA 4IA5A 4LMVA 3SFEA 4WEYA 5DCHA 2FWFA 5C04A 3UBKA 1UN2A 4OFNA 3PINA 3AYJA 4GF7A 2GT5A 4XS4A 3GYKA 4KUNA 3W6GA 3L1RA 3E0UA 5ELAA 4KPRA 1A2MA 4MJBA 4J2FA 4OPTA 1YQZA 4NAXA 1KNRA 1QUWA 1T3BA 4TKYA 5ELGA 4EQSA 2P0GA 3AE6A 5F07A 5IO0A 1S3EA 2PUKC 2GB0A 4PNGA 5G1KA 2UZZA 3FW2A 4X4JA 10GSA 2FJBA 4HSCX 1NPXA 2XPEA 1DOEA 2NPBA 3A2VA 1FOVA 3T0KA 1A2JA 2HZEA 4C74A 3ZL5A 1DJQA 3S61A 1O81A 5COHA 1BG5A 4USRA 3H8QA 4F82A 2FY6A 1GNEA 3HZ8A 3M1GA 5G2ZA 4K5SA 5D96A 1MD3A 1BKWA 4X1UA 2J3NA 3CNJA 2GTUA 3TJKA 5BULA 3AE2A 1R26A 2RABA 1TYPA 3IA1A 1GTHA 3TB2A 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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