2R0GA

Chromopyrrolic acid-soaked rebc with bound 7-carboxy-k252c
Total Genus 156
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
156
sequence length
527
structure length
522
Chain Sequence
APIETDVLILGGGPVGMALALDLAHRQVGHLVVEQTDGTITHPRVGTIGPRSMELFRRWGVAKQIRTAGWPGDHPLDAAWVTRVGGHEVYRIPLGTADTRATPEHTPEPDAICPQHWLAPLLAEAVGERLRTRSRLDSFEQRDDHVRATITDLRTGATRAVHARYLVACDGASSPTRKALGIDAPPRHRTQVFRNILFRAPELRSLLGERAALFFFLMLSSSLRFPLRALDGRGLYRLTVGVDTMDSFELVRRAVAFDTEIEVLSDSEWHLTHRVADSFSAGRVFLTGDAAHTLSPSGGFGMNTGIGSAADLGWKLAATLRGWAGPGLLATYEEERRPVAITSLEEANVNLRRTMDRELPPGLHDDGPRGERIRAAVAEKLERSGARREFDAPGIHFGHTYRSSIVCGEPETEVATGGWRPSARPGARAPHAWLTPTTSTLDLFGRGFVLLSFGTTDGVEAVTRAFADRHVPLETVTCHAPEIHALYERAHVLVRPDGHVAWRGDHLPAELGGLVDKVRGAA
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
publication title Crystallographic trapping in the rebeccamycin biosynthetic enzyme RebC
pubmed doi rcsb
molecule keywords RebC
molecule tags Oxidoreductase
source organism Lechevalieria aerocolonigenes
total genus 156
structure length 522
sequence length 527
chains with identical sequence B
ec nomenclature
pdb deposition date 2007-08-19

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF01494 FAD_binding_3 FAD binding domain
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.30.9.50 Alpha Beta 2-Layer Sandwich D-Amino Acid Oxidase; Chain A, domain 2 D-Amino Acid Oxidase; Chain A, domain 2 2r0gA02
3.40.30.120 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich Glutaredoxin Glutaredoxin 2r0gA03
3.50.50.60 Alpha Beta 3-Layer(bba) Sandwich FAD/NAD(P)-binding domain FAD/NAD(P)-binding domain 2r0gA01
5HYMA 2YR4A 5JCIA 1CC6A 4Z26A 3S61A 2Q6UA 1BF3A 3LOVA 3M12A 2AR8A 2GQFA 2OAMA 3AE9A 4Z2UA 2BS4A 2VVMA 5FS8A 4IVMB 3CNSA 2RGJA 2GRTA 4OVIA 3EF6A 3NYEA 1IUXA 1GOSA 3UKLA 1KDGA 4J57A 2GB0A 4OPUA 1TDEA 3OZ2A 4I58A 3DJEA 2BC0A 3H4KA 3GMBA 1TDOA 4J36A 3UP4A 5GSNA 4JY3A 2JBVA 1JRYA 1TDKA 4FK1C 2DKIA 3VR9A 2VVLA 3AXBA 2XFQA 3AE4A 2WPCA 2XVHA 2YLRA 4GUVA 2VRLA 4U2TA 4NEWA 3UTEA 4A7AA 4XWRA 1KF6A 3AD8B 1L9DA 3NK1X 2RGOA 2DKHA 1PXBA 3PS9A 2O9ZA 1M6IA 1JRZA 1ZKQA 1F6MA 1D7LA 1O95A 1ZY8A 2GMHA 3UKPA 4U8NA 2FJBA 2E5VA 2R45A 1Y56B 4J56A 2YLZA 4K8DA 2BXRA 2GR2A 3RP8A 2BC1A 1OJTA 3QJ4A 4GDPA 1LPFA 1L9EA 3LZXA 2Q7VA 3CNTA 4YT0A 3FPZA 4P9SA 2C72A 5LV9A 4H4XA 4Z2TA 1GNDA 1RP0A 2EQ6A 2YG4A 4C77A 3IWAA 4BURA 2C73A 2X8CA 3IHMA 4J2WA 2C76A 1Q9IA 1BWCA 1LQTA 4H2NA 1DJQA 3NK0X 3BHFA 3T37A 3UKFA 5IPYA 1CJ2A 3GRSA 2A87A 1IUUA 2VVLG 3P4QA 3ITJA 2VOUA 1Y0PA 2GF3A 4EMIA 3KPFA 1GERA 5KVIA 4TLXA 4CY8A 3KD9A 1D4DA 3I6DA 3NRNA 4WX1A 3CPHG 2TMDA 4C3YA 3RNMA 2EQ7A 5FS6A 3VRBA 2Q0LA 1BGJA 2WP9A 4H4ZA 3REDA 4FX9A 3DH9A 4N9XA 4H4WA 5EB4A 4Y4NA 3CIRA 4CRTA 2C65A 1H7XA 1IUTA 2OLNA 3CGDA 2IVEA 4U2LA 2R0PA 3C4AA 2V6OA 3II4A 2B7RA 4YWOA 3RP6A 2TPRA 1EBDA 2ARDA 2VQ7A 4AP1A 1EL5A 3UKQA 4EQSA 3DK8A 4CY6A 1FCDA 1CJ4A 1Q1WA 2R46A 4U8LA 3LB8A 4DNAA 2VZ2A 3NHOX 3AD7B 4LU6A 2WOVA 3KVEA 2ZZBA 2GAHB 3BHKA 3AE3A 5HXIA 1ZMCA 5HHFA 4ZN0A 4JY2A 2BK3A 2XLPA 3NH3X 5BUKA 3NN0X 3LADA 4H4RA 3UTGA 3BNUA 4OPDA 5KWFA 3AEFA 3NT6A 3BI2A 1E1MA 4MJWA 1GREA 2NVKX 4C3XA 1RYIA 4HA6A 2QAEA 2WBAA 2YVFA 1CJ3A 4CBQA 1IUWA 1H7WA 4C5OA 5IQ1A 3WE0A 4USQA 1X31B 1GESA 1HYUA 2WETA 3AYLA 4AOSA 1H82A 2X8GA 1BZLA 4H2QA 3Q6JA 2XVFA 4JDRA 1DOCA 3IC9A 2ACZA 4A6NA 4ICYA 1GETA 3AE6A 3F8RA 4H4SA 2AAQA 3QSMA 2XLSA 1YKJA 5M0ZA 2XLRA 1O94A 3AEAA 1EL8A 3P4SA 3V76A 5JCNA 2C64A 3CGCA 2YLSA 2WS3A 1JOAA 4U2SA 1GRTA 4C74A 1H84A 5FS9A 1B4VA 1QO8A 1IJHA 4RG4A 2E4GA 5C3JA 2APGA 3CGEA 1PJ5A 3LXDA 4IA5A 4B1BA 1O5WA 1OJCA 2R0CA 4BJZA 3DJJA 1KSUA 3B6DA 4EMWA 1GRAA 2BCGG 2YG3A 5DBJA 4U8OA 2WU2A 5KRQA 3BI4A 2A89A 4D04A 1NHQA 1DODA 4H2PA 2CFYA 4JNAA 1NEKA 4JNQA 3VQRA 1ZX9A 1VG0A 3F8DA 3UKAA 1MO9A 2PHHA 1E7PA 1K0JA 2EQ9A 3BNMA 4CNJA 4ADWA 1ONFA 1TYTA 2EQ8A 2GH5A 2WPEA 4NTEA 4DSGA 2V3BA 4Z2RA 1CF3A 4GDEA 3SFDA 4NEVA 1FL2A 3EANA 3NTDA 4YXDA 1NHPA 3ABVA 4K22A 2QCUA 3FG2P 5EBKA 4EIQA 3DGHA 2WDVA 4K7ZA 2C7GA 3RHAA 3K7QX 1GRGA 2JB3A 3P4RA 4TM1A 3UCLA 1TDNA 3CGBA 5CKUA 1NG3A 1BGNA 3PVCA 1VQWA 1NG4A 1ZP0A 4K2XA 2X3NA 2YLXA 3EPTA 2VQBA 3HZLA 3CTYA 4OPCA 1Y56A 4UDQA 3NGCX 1YQZA 4CCQA 2ZBWA 4GR1A 3V3OA 2F5ZA 3JSKA 4K5SA 4X9NA 2JKCA 2GR1A 4EQWA 4H4TA 3EAOA 5HY5A 1SEZA 2Q0KA 3IF9A 3CN8A 2CULA 2IIDA 1F8RA 1PN0A 1FOHA 1N1PA 3B3RA 2Z5XA 1BKWA 2B9YA 3SM8A 3Q9TA 2WDRA 4IA6A 5U63A 4U8MA 1PBFA 4DSHA 5EB5A 5BVAA 1JNZA 1VRQB 1PXCA 3AD9B 1CBOA 3GSIA 1E1LA 3H8IA 4UDRA 2WU5A 3M0OA 3QSEA 5BULA 3DA1A 2R0GA 1UKVG 4YSHA 3CNPA 4PAAA 3AEEA 2WDQA 1DXLA 1PBBA 3GWDA 2E1MA 2V5ZA 3ISHA 3P1WA 4GCMA 4REKA 4APNA 3G5RA 2WQYA 3F8PA 2C3DA 2QA2A 1GT8A 2C66A 2R4EA 2V61A 1H86A 3ADAB 4H50A 3V3NA 1N4VA 2R9ZA 4NZHA 2W0HA 1F8SA 2JB1A 2FBWA 1Z6LA 2C70A 2V3AA 3VRAA 3GRTA 4A65A 4AT0A 4J31A 4RSLA 2ZZCA 1E1KA 3NTAA 2J3NA 1E1NA 3QFBA 3FMWA 3AWIA 4IV9A 3GYIA 4EQRA 4H7UA 1OJAA 4Y4LA 1DOEA 4GF7A 1GRBA 2BACA 3GD4A 4AOXA 3LZWA 5JCKA 5JCMA 1L9CA 3L8KA 4PABA 4UP3A 1NAAA 2QA1A 3ALMA 2WESA 2XDOA 5U25A 4JN9A 4H4VA 2C67A 5FS7A 1GRFA 2FJAA 4AP3A 4Z43A 5CQFA 1RSGA 2XVIA 2HQMA 3FBSA 1JNRA 4EM3A 3COXA 1NENA 1YQ3A 2XLTA 2BA9A 2XLUA 1DOBA 3CNDA 2GAGB 4U8JA 1GV4A 3SGLA 4EQXA 1H6VA 1QJDA 3AEGA 3NYFA 1CC2A 2A8XA 4YSXA 2GMJA 2YG6A 1KNPA 3VR8A 1FECA 2VRMA 4O5UA 4USRA 4AT2A 2YAUA 3ATQA 3K7TA 4X9MA 1JRXA 4YSYA 2BYBA 3QVRA 1LV0A 5KXJA 2YLWA 3GDNA 1LQUA 4NTDA 1XDIA 2BS2A 3KKJA 1COYA 1H83A 4D03A 4CNKA 1D7YA 4A5LA 1ELIA 2RABA 1CL0A 1K0LA 4A6NB 4YTPA 3AE5A 3AECA 2JAEA 4GRTA 4H4PA 1NHRA 2B76A 3P9UA 3DK4A 3AYJA 2JK6A 4H2RA 2B7SA 2Y6RA 3DK9A 3FIMB 3G5QA 1E6EA 1S3BA 1ZDLA 2BK4A 3C96A 4Z24A 1D5TA 3C4NA 1CHUA 1OJDA 1PDHA 4H4QA 3GWFA 1EL7A 3E1TA 5KOXA 1VDCA 3QVPA 4XWZA 1DJNA 3DMEA 1F8WA 1ZK7A 2RGHA 4KX6A 4U8PA 1V59A 3NKSA 4FDCB 2R4JA 2YM2A 3BI5A 2YG7A 5J60A 2GQWA 2WEUA 4K5RA 1DNCA 3NLCA 4FK1A 4J33A 4ZCDA 5BRTA 2GEWA 2FJEA 4A79A 3URHA 5FMHA 1EL9A 3S5WA 1B37A 4OPTA 4DGKA 4RG3A 1GEUA 2IVDA 5KOWA 1PJ7A 2XFPA 2BK5A 4TM4A 3DJDA 1TDFA 2YM1A 4IVOB 4O5QA 3GD3A 4OCGA 3KLJA 1PBEA 1K0IA 2CVJA 2GV8A 1VG9A 1TRBA 2WOWA 3O0HA 2YR6A 1PJ6A 3D1CA 2YVGA 4M52A 2WHDA 4YKGA 3NIXA 2X8HA 1LVLA 2CDUA 2X99A 3UKHA 3UP5A 3AEDA 1GSNA 2OLOA 3GMCA 3UOVA 4BK3A 4A9WA 2GR3A 3ICRA 3OC4A 4KPRA 4LA1A 1D4EA 5EOWA 2WPFA 3DJGX 2I0ZA 3QSSA 4Y4MA 2AQJA 1XANA 1B5QA 1CJCA 1QLBA 2YG5A 5JCLA 5KVHA 4H4YA 3NG7X 5GRTA 1MOKA 4B65A 1NPXA 2WP6A 1F3PA 3UKKA 2Y6QA 1PBDA 3D8XA 2XYOA 4EMJA 3UOXA 1LTXR 1JU2A 3CNJA 2V60A 1YY5A 1AOGA 1M64A 2Z5YA 4EIPA 2YQUA 2XFOA 3AYIA 3NN6X 4H4UA 3KA7A 4BV6A 1NHSA 3CPJG 2UZZA 1CC4A 3AE2A 4J34A 3H8LA 1NDAA 4TM3A 1IUSA 1FEBA 3AEBA 4LIIA 5L46A 1JEHA 4A99A 3GDPA 1S3EA 1H81A 3K30A 1IUVA 1E39A 5ER0A 3NNEA 4B64A 1LJ1A 1KFYA 3IHGA 3AB1A 1XHCA 1GTEA 3ICSA 5U1OA 1KNRA 2BCPA 3UTHA 1K4QA 2H89A 4CCRA 2YWLA 3L1RA 4BK2A 4YKFA 2C3CA 1ZOYA 1ZOVA 2WOIA 1N4WA 1P2HA 1GXFA 3P4PA 3UTFA 4X4JA 2JB2A 3AE1A 4TLZA 3ALLA 4TM0A 4Z44A 1MXTA 4BK1A 2B9XA 2FJDA 1S2QA 4U8IA 1GPEA 4U8KA 3DGZA 2YLTA 2C75A 4B63A 2GR0A 2BS3A 2XFUA 5IQ4A 1L0VA 3AE7A 1Q1RA 4OPGA 3ZDNA 3ATRA 3LJPA 4E0VA 1PHHA 3SFEA 3NK2X 4YSZA 2X50A 3UOZA 1N4UA 3GYJA 2ZZ0A 4YTNA 4ZCCA 1B8SA 1XPQA 3AE8A 3M13A 1D4CA 2XVEA 2YR5A 4WCTA 3UOYA 4EM4A 2XFNA 3VRDB 1GRHA 4B69A 1FEAA 4B68A 2XVJA 3CPIG 4B67A 2NPXA 5M10A 1TYPA 5C2TA 1GALA 4OPLA 4ECHA 3ALJA 1KSSA 2PYXA 4XXGA 4Z25A 1OJ9A 1PXAA 2B9WA 3KU9A 3ZYXA 3SQPA 2GVCA 4OPIA 3ICTA 1YQ4A 2BABA 3NYCA 2H88A 4NTCA 1S2YA 4HB9A 4B66A 4BJYA 3RP7A 3PO7A 4I59A 1REOA 1ZMDA 1W4XA 2OALA 4JQ9A 1PBCA 5J7XA 5TR3A 3I3LA 2YVJA 3R9UA 1P2EA 2WP5A 4UDPA 3G5SA 4YTMA 2BXSA 3K7MX 1GTHA 3QFAA 1PS9A 2XCGA 2OA1A
chains in the Genus database with same CATH superfamily
3TJBA 2YR4A 4BVXA 1PN9A 4Z26A 2Q6UA 3SZWA 4JZQA 4KW6A 5CRDA 1VF1A 3AE9A 5INYA 2HT9A 2VVMA 5FS8A 1AUCA 2R4VA 2VM2A 3CNSA 4OVIA 3ZRDA 3NYEA 2P5QA 1GOSA 3CTGA 5A4UA 1A2LA 2IMDA 1T00A 3G7IA 3H4KA 3ISOA 2JBVA 1TDKA 5IO0A 1SJZA 3IC4A 2LEGA 1ZGNA 3AE4A 4ECIA 1G7EA 1PMTA 4MF6A 3LFLA 4XWRA 3P7XA 1L9DA 3NK1X 1PXBA 1XFLA 4MABA 1D7LA 4NV2A 3GTUA 2R45A 2E5VA 5KN0A 2H1GA 2NPBA 5EY6A 4MJAA 2CX3A 3LYKA 1NW2A 5D9XA 2Q7VA 1FAAA 3CNTA 2FHEA 3T2KA 1RP0A 1GNDA 1F3AA 2LUSA 4NV5A 4AGSA 5G30A 1S3AA 2FGXA 2WDUA 1LQTA 4H2NA 1I5GA 2ALBA 1DJQA 3NK0X 3GKXA 5HR2A 1K3YA 1XCCA 3UKFA 3W4KA 2B1LA 3FEUA 4GWRA 3GRSA 2GF3A 2HSHA 5D93A 3I6DA 4MF5A 1OC9A 3TOUA 3F3RA 3CPHG 4XS6A 3DGQA 1K0DA 3PH9A 3VWUA 5EB4A 3SWLA 3CIRA 1GTIA 4MJEA 1H7XA 2OLNA 4QL9A 3IDVA 3C4AA 3II4A 4YWOA 2VQ7A 1TKDB 1WWJA 3UKQA 3DK8A 3GX8A 3QOUA 4KCEA 4U8LA 4GQFA 1TRUA 5J9BA 1OAZA 3UL3A 2FY6A 4G10A 5B6NA 4LU6A 3BHKA 4MF7A 1ZMCA 1RW1A 3HYVA 4JEDA 2BK3A 3NH3X 5BUKA 2WULA 4XRDA 3GX0A 1GH2A 2QC7A 2VLUA 2MMAA 5FT3A 4J2FA 4K2DA 3BI2A 4MJWA 4C3XA 1RYIA 5A4WA 3ZIJA 2WBAA 4YAPA 2YVFA 1A2MA 5F06A 5CRHA 4TW5A 1SD8A 2RUEA 3WE0A 1M9BA 1HYUA 2GLRA 5A4VA 2HRNA 3AYLA 1BZLA 2MMZA 2V2GA 4LMWA 2XVFA 1E2YA 3KPKA 3L4NA 4ICYA 2M72A 1R5AA 3EU4A 4N30A 2XLSA 1YKJA 2H70A 2V41A 2B7JA 3KGKA 4K0GA 2XLRA 3P4SA 5M0ZA 3V76A 3A2WA 5IPHA 4IELA 2HFDA 2E4GA 1B48A 3CGEA 4IA5A 1OJCA 2R0CA 4QL7A 1KSUA 2E48A 4U8OA 5DBJA 3EU3A 4GAPA 1DODA 2WJUA 4II2A 5D8IA 2CFYA 4JNAA 4KDUA 1DBYA 2H0IA 2MYGA 3TKPA 1R5PA 3F8DA 7GSSA 1MO9A 1E7PA 4ADWA 2C4CA 16GSA 1FG4A 4NTEA 4G74A 4POLA 2VCVA 4NEVA 4YXDA 3F3QA 2O8VB 1EP8A 2VCTA 4K7ZA 1MDKA 1GRGA 2DIYA 2JB3A 1O7UA 2MMNA 1TDNA 3P4RA 4TM1A 3HVVA 1NG3A 1BGNA 2QSIA 3LORA 1C0LA 1WPIA 2P31A 3HZLA 3CTYA 1Y56A 3NGCX 1YQZA 4CCQA 2OA7A 3JSKA 3TKSE 2V1MA 1MTCA 3ZLPA 3P2AA 2JACA 1ZCPA 4H4TA 3EAOA 4RI6A 2UZ8A 4GSNA 3IF9A 3VWXA 4OD7A 1F8RA 2VL2C 3MSZA 1BKWA 3SM8A 3APOA 1PBFA 2V32A 2DJ0A 3D5JA 2H0HA 2WU5A 1M2BA 3QSEA 3NOFA 3DA1A 3AEEA 2WDQA 2L5LA 2C3NA 3ISHA 3P1WA 4GCMA 5EL8A 4XTSA 2QA2A 3IXRA 4ZBBA 3R2QA 3CMIA 1XIYA 1ZYNA 2CZ2A 4AT0A 1M99A 3MAKA 2FA4A 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