2R0GA

Chromopyrrolic acid-soaked rebc with bound 7-carboxy-k252c
Total Genus 156
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
156
sequence length
527
structure length
522
Chain Sequence
APIETDVLILGGGPVGMALALDLAHRQVGHLVVEQTDGTITHPRVGTIGPRSMELFRRWGVAKQIRTAGWPGDHPLDAAWVTRVGGHEVYRIPLGTADTRATPEHTPEPDAICPQHWLAPLLAEAVGERLRTRSRLDSFEQRDDHVRATITDLRTGATRAVHARYLVACDGASSPTRKALGIDAPPRHRTQVFRNILFRAPELRSLLGERAALFFFLMLSSSLRFPLRALDGRGLYRLTVGVDTMDSFELVRRAVAFDTEIEVLSDSEWHLTHRVADSFSAGRVFLTGDAAHTLSPSGGFGMNTGIGSAADLGWKLAATLRGWAGPGLLATYEEERRPVAITSLEEANVNLRRTMDRELPPGLHDDGPRGERIRAAVAEKLERSGARREFDAPGIHFGHTYRSSIVCGEPETEVATGGWRPSARPGARAPHAWLTPTTSTLDLFGRGFVLLSFGTTDGVEAVTRAFADRHVPLETVTCHAPEIHALYERAHVLVRPDGHVAWRGDHLPAELGGLVDKVRGAA
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

molecule tags Oxidoreductase
molecule keywords RebC
publication title Crystallographic trapping in the rebeccamycin biosynthetic enzyme RebC
pubmed doi rcsb
source organism Lechevalieria aerocolonigenes
total genus 156
structure length 522
sequence length 527
chains with identical sequence B
ec nomenclature
pdb deposition date 2007-08-19

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF01494 FAD_binding_3 FAD binding domain
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.30.9.50 Alpha Beta 2-Layer Sandwich D-Amino Acid Oxidase; Chain A, domain 2 D-Amino Acid Oxidase; Chain A, domain 2 2r0gA02
3.40.30.120 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich Glutaredoxin Glutaredoxin 2r0gA03
3.50.50.60 Alpha Beta 3-Layer(bba) Sandwich FAD/NAD(P)-binding domain FAD/NAD(P)-binding domain 2r0gA01
1IUTA 1O95A 4OPDA 1E1MA 1EL5A 1L9CA 2YG4A 1VG9A 5IQ4A 2O9ZA 2OALA 2XDOA 3FMWA 1Q1WA 3NGCX 1CJ4A 2C72A 3IWAA 4KPRA 1IUVA 2BABA 4H4RA 1KNPA 4LIIA 3NG7X 4XWRA 4ZCCA 3LXDA 2JK6A 2Q0KA 4A7AA 2JKCA 3QSMA 1LJ1A 1LV0A 4X4JA 3BI4A 1X31B 2V61A 2YR6A 3S61A 2BA9A 4U8OA 1OJTA 4Y4MA 2VVMA 3ALJA 3C4AA 4C3XA 3DJJA 2XVFA 4NZHA 3NYCA 4GUVA 3SQPA 1FEAA 3UOVA 2E1MA 1IUXA 3CPJG 3OZ2A 2VVLG 4Z25A 5JCNA 1GNDA 1GETA 1PXAA 2XYOA 5JCMA 5HYMA 2WPFA 5GRTA 1F8WA 2WDRA 5EOWA 1F3PA 3VR9A 3BHKA 3GMCA 1PJ5A 2ZZCA 2YM2A 4U8JA 2ZZBA 3QVPA 1M64A 3BI5A 3AYLA 1H7XA 4GRTA 4AOXA 2FJAA 5FS9A 1OJ9A 3AD7B 3D1CA 4YSYA 3DGHA 2R46A 1E1KA 4IA5A 5KOWA 3CGCA 3SFDA 1TDOA 4C5OA 4YT0A 3UP4A 5KVHA 4P9SA 1GPEA 1GT8A 2VOUA 4APNA 2ZBWA 2DKHA 5C2TA 2GMJA 2YAUA 4ADWA 1YQZA 4U8KA 2X8HA 4A79A 3I6DA 4EQWA 3LJPA 2XVJA 4H4TA 4N9XA 2AQJA 2YWLA 1VQWA 2YVJA 4AP3A 3F8RA 1KSUA 1CL0A 1JRZA 1O94A 3EF6A 4U2TA 1VDCA 3DJDA 2YG3A 1UKVG 3AE9A 4IA6A 2BS4A 4CBQA 3AEFA 2BK5A 2GEWA 3DJGX 4IVOB 1O5WA 2BC0A 2W0HA 1BGJA 2Z5YA 2HQMA 4C3YA 1YY5A 1K4QA 2I0ZA 3NNEA 3P9UA 2C3DA 1XANA 3GRTA 2XCGA 4YSHA 1QJDA 2XFQA 4O5QA 3NTDA 4DSGA 5LV9A 2B9WA 3LB8A 1PBCA 2VQBA 3H8LA 4H4UA 3NT6A 2B7RA 2YLXA 1MOKA 2WETA 2C65A 4B1BA 2OLOA 3D8XA 4B63A 5JCLA 3P4QA 3ADAB 4H4WA 5EB5A 2R0PA 3AE4A 3DH9A 4IV9A 1ZY8A 2C76A 1GESA 5C3JA 5BULA 2CFYA 2GAHB 3F8DA 1PHHA 5M0ZA 1D5TA 3E1TA 1N1PA 1SEZA 1PN0A 4K2XA 1LPFA 1D4CA 1RSGA 2CULA 2WP9A 3LADA 4D03A 3C4NA 3H4KA 3QSSA 4JNAA 4UP3A 4MJWA 4Z2UA 3UKFA 2Y6RA 2JB3A 3IHMA 1HYUA 4A6NB 4BK1A 4H4YA 1B5QA 1ZDLA 3UKLA 3LZXA 3K7TA 4K7ZA 1CJ2A 3CPHG 1BF3A 4REKA 1GERA 4U8MA 3S5WA 1F6MA 5KVIA 1NENA 2X99A 3AE2A 2WU5A 2GRTA 1Z6LA 3BHFA 3NLCA 3AD9B 3BNMA 4USRA 3AXBA 1VRQB 2JB1A 4GDEA 1CC6A 3LZWA 2UZZA 3LOVA 3NHOX 5J7XA 4A9WA 1K0JA 2RGHA 3DA1A 4ZCDA 1EL8A 1CHUA 1B8SA 3CGDA 2R45A 5JCKA 5BUKA 4BURA 5EB4A 2BC1A 4XWZA 1LQTA 4X9NA 4CY8A 2C73A 2F5ZA 3COXA 3ICSA 5DBJA 4Z26A 5KRQA 4TM4A 4M52A 1GEUA 1DOCA 3SM8A 2QA1A 2EQ8A 2XLSA 1GSNA 4CY6A 2WOVA 2WPEA 4GR1A 3UOXA 2JB2A 3SGLA 4PAAA 5KXJA 3ZDNA 4J33A 2WESA 3EAOA 2XVHA 4B64A 1NPXA 2BCPA 1GV4A 2WP6A 1Q9IA 2WDQA 4OPIA 1JNRA 4JN9A 1DODA 1KSSA 4J31A 4AT2A 4B69A 1OJDA 4LU6A 3UP5A 3P4PA 4HA6A 4GF7A 3L1RA 1REOA 3OC4A 4K5RA 1LQUA 3GWFA 2BK4A 1YQ4A 2GMHA 1QLBA 2RGJA 3VRAA 4A65A 1CC4A 1N4WA 2C75A 1BKWA 1M6IA 3DK9A 4B66A 3GYJA 3G5RA 5KOXA 1B4VA 5U1OA 4A6NA 1JOAA 1KNRA 5L46A 4PABA 3NN6X 4YSZA 5HHFA 2WQYA 2IIDA 2C3CA 3G5QA 1L9DA 2R4JA 5GSNA 5J60A 1K0LA 2RABA 4CRTA 1ZMDA 4FX9A 1S2YA 1NHRA 3AYJA 2YG7A 3CGBA 2BK3A 4O5UA 3ABVA 3ICRA 3GD4A 3BI2A 3UOZA 1GRBA 4YXDA 1NAAA 3V76A 2J3NA 3AE8A 3KA7A 3VRDB 4UDRA 1JNZA 2YQUA 4CNKA 2H89A 2NVKX 2YLTA 3ZYXA 4E0VA 3H8IA 2YLRA 5FS8A 3R9UA 1D7YA 2BACA 2YG6A 1MXTA 1D4DA 2FJBA 2X50A 3NIXA 2Q0LA 2XFPA 5FS7A 2AAQA 4KX6A 1L0VA 4BV6A 3KVEA 4U2SA 2YR5A 1IUUA 3RP7A 1H81A 2GR2A 3M0OA 5FS6A 3UTFA 4U8IA 1BGNA 3KD9A 2WOIA 1FCDA 4U8LA 2XLTA 4USQA 2WS3A 1KFYA 3CPIG 3FG2P 2VVLA 4H4XA 1DNCA 2EQ6A 1S2QA 4FDCB 3K7MX 3AD8B 1DXLA 1BWCA 3UKHA 4H2RA 4AP1A 1TRBA 3CNPA 4X9MA 2GQFA 2IVDA 3AEAA 2NPXA 5IPYA 3AEGA 2AR8A 2C66A 3NKSA 2ARDA 2BS3A 4NTCA 3GSIA 1GTEA 3UKAA 1ZP0A 5U63A 2GAGB 3GRSA 2V6OA 1GXFA 3UOYA 5BRTA 1IJHA 4AOSA 2R0GA 2VRLA 4B67A 3HZLA 1JU2A 2YG5A 1E7PA 1TYPA 3IC9A 1Q1RA 1DJNA 4WCTA 2WBAA 4ZN0A 4EMJA 4H4ZA 1XHCA 1GRTA 4AT0A 2GR0A 3FPZA 3GD3A 4OPGA 4J57A 2B9XA 4K5SA 3AE7A 3SFEA 3JSKA 2GQWA 1ZKQA 3AEBA 3P1WA 4I59A 1GRGA 3RP8A 3UKPA 4FK1A 4OPUA 1DOEA 2EQ9A 1IUWA 2VRMA 1NEKA 5CKUA 5IQ1A 1S3EA 2R4EA 1QO8A 4HB9A 3PVCA 3K7QX 1FL2A 3EPTA 2V60A 2GR3A 3AWIA 4EM4A 2X8CA 4EIQA 2BYBA 1H83A 4H2QA 1D7LA 4U2LA 3NTAA 1TDNA 2DKIA 2YLWA 1GRHA 4GCMA 3NRNA 1PBEA 2EQ7A 3M13A 3AYIA 2C67A 2PHHA 3GYIA 3NK2X 2FJDA 3GWDA 4TM1A 4EQSA 2YVGA 4TLXA 3B6DA 4BJYA 1GREA 3KKJA 3FBSA 4NEWA 3CNDA 4Z44A 3REDA 2V3AA 4OVIA 3T37A 1ONFA 2E5VA 1NDAA 1L9EA 1S3BA 2APGA 3BNUA 2CDUA 4WX1A 3V3OA 2FJEA 1N4VA 4YKFA 1PBBA 3UTGA 1PXCA 4J36A 3VRBA 4BK2A 1LTXR 2YLZA 2WPCA 4H4VA 4NTDA 4D04A 5BVAA 1IUSA 1EL9A 2X3NA 1XPQA 1VG0A 2XFUA 1CF3A 3CTYA 2TPRA 4UDQA 2X8GA 4C74A 4GDPA 2ACZA 1Y0PA 2E4GA 2XFNA 3GDPA 1XDIA 2YM1A 1CJCA 5KWFA 4H2PA 3KLJA 3QVRA 3FIMB 2XLPA 1BZLA 2YVFA 2GB0A 1F8SA 3ALMA 1RYIA 3KU9A 2JBVA 4YKGA 4C77A 3CN8A 3IHGA 2Z5XA 3G5SA 1YKJA 3NYEA 3NK0X 3QJ4A 4LA1A 3UKKA 4B68A 4A99A 1JEHA 2C64A 3ALLA 1NHPA 2Q6UA 1N4UA 3WE0A 3II4A 2OA1A 4H2NA 2XVEA 4TM3A 1B37A 2GV8A 3RNMA 1PXBA 4JY2A 3DMEA 1LVLA 4FK1C 1ELIA 2GF3A 3QSEA 2VZ2A 4XXGA 1GRFA 3AEEA 4OPTA 4H7UA 1GALA 2B9YA 2R9ZA 3ATRA 4JY3A 2A89A 4J56A 2XFOA 3AE5A 4IVMB 3IF9A 3K30A 3CIRA 5TR3A 1E1NA 1PJ6A 2YR4A 1DJQA 3ISHA 3CGEA 4U8PA 5M10A 2IVEA 1NG3A 1PJ7A 4RSLA 1DOBA 4YTPA 3DK8A 1W4XA 2V5ZA 4ICYA 2QA2A 3KPFA 5JCIA 1JRYA 3AE3A 1H6VA 1TDFA 4YSXA 3PO7A 1TYTA 2B7SA 3UTEA 1GRAA 3DK4A 1P2EA 1TDKA 4YWOA 3L8KA 1MO9A 4CCQA 2A8XA 4K8DA 3QFBA 2JAEA 4EMWA 3V3NA 4OPLA 1PBDA 1CJ3A 1V59A 2YLSA 2C70A 2QCUA 3DJEA 4OCGA 3UCLA 2FBWA 4Z2TA 5U25A 1ZX9A 1GOSA 1K0IA 2BCGG 3AE1A 2ZZ0A 5HXIA 1Y56B 2GVCA 4EQRA 2OAMA 3NYFA 3PS9A 2XLRA 2A87A 2TMDA 3P4SA 1KF6A 2WHDA 1H84A 3AB1A 3B3RA 3ITJA 1OJAA 2H88A 1CBOA 3P4RA 4U8NA 4Y4NA 1PBFA 4A5LA 1H82A 4CCRA 1E6EA 4UDPA 2B76A 1GTHA 4JNQA 5HY5A 1PDHA 3CNTA 1AOGA 2V3BA 3ICTA 1D4EA 5CQFA 3M12A 1E39A 1CC2A 3AE6A 3C96A 4YTMA 3RHAA 4DSHA 3NK1X 1ZOYA 1E1LA 3ATQA 5ER0A 1F8RA 2GH5A 3NH3X 3Q6JA 2BS2A 2OLNA 1COYA 2XLUA 3GDNA 4Y4LA 4DGKA 1JRXA 2GR1A 4OPCA 3AEDA 2CVJA 4EM3A 3VQRA 2Y6QA 2WOWA 1OJCA 4K22A 2WDVA 1PS9A 3EANA 4YTNA 2BXSA 4Z24A 1ZOVA 4H4PA 4B65A 2XVIA 4TLZA 3UKQA 1FECA 4TM0A 1ZK7A 2BXRA 2C7GA 3CNJA 1EBDA 3F8PA 5EBKA 4J34A 4NTEA 3QFAA 2WEUA 4RG4A 5FMHA 4EQXA 3I3LA 1NHSA 2WU2A 3NN0X 4ECHA 1FOHA 4Z43A 2WP5A 4I58A 3RP6A 3CNSA 3O0HA 2R0CA 4EIPA 3VR8A 1KDGA 1P2HA 4JQ9A 2RGOA 3URHA 4Z2RA 4J2WA 1TDEA 1H7WA 3DGZA 1NG4A 3UTHA 4DNAA 1RP0A 4BJZA 1FEBA 4EMIA 1H86A 4H4QA 1ZMCA 2PYXA 4NEVA 1Y56A 1EL7A 3GMBA 4H4SA 4RG3A 4BK3A 3AECA 4H50A 4CNJA 2Q7VA 2VQ7A 2QAEA 3Q9TA 4JDRA 1NHQA 1YQ3A
chains in the Genus database with same CATH superfamily
4JRRA 4POMA 4L0UA 4V1Ap 4ECJA 4YJFB 2O9ZA 2HRFA 2OALA 5B6MA 3NGCX 1CJ4A 1YJ6A 4HQSA 3QSMA 4AJ6A 1LV0A 2V61A 4U8OA 1OJTA 2VVMA 2MMAA 2AHEA 4NZHA 2DBCA 4I8BA 3G3EA 3CPJG 2VVLG 5JCNA 3SZCA 1GUMA 3MNGA 5GRTA 2H73A 1F3PA 3WT1A 3DGQA 1TU8A 5J5NA 2AYTA 2YZHA 2YM2A 2ZZBA 4MH2A 3QR6A 4EF0A 3BI5A 1ZYQB 1H7XA 1WE0A 2HZEA 4MZWA 1K0AA 3VURA 4NHZA 3AD7B 3DGHA 2NBSA 4C5OA 4PUAA 1ERWA 3DEXA 1TDOA 1TTZA 4IGJA 5KVHA 4P9SA 2VOUA 2H6XA 3A2WA 4U8KA 4A79A 3I6DA 2LTKA 2WJUA 4H4TA 1X5CA 2FUG2 1VQWA 3D22A 2YVJA 1KSUA 1CL0A 3KP9A 2TRCP 4BVXA 3KH7A 5HR1A 1JRZA 1O94A 4YAVA 1VDCA 4GAPA 3AE9A 3TJFA 2BS4A 3LYKA 3DJGX 4IVOB 5CRGA 3GL5A 4JBBA 3FRCA 1YY5A 3RAZA 4GRFA 4YSHA 4DSGA 4O5QA 1PQNA 1SK0A 2VQBA 3NT6A 5J9CA 1F3AA 1J9BA 4F0CA 2FLSA 3D8XA 2JZTA 3HVNA 3P4QA 3IK9A 2LQOA 1ML6A 3N9JA 3DH9A 3DMLA 1GESA 2C76A 3QAWA 2FWHA 3ERWA 3F8DA 1N1PA 4BL7B 3H8QA 3ZNPA 1AAZA 3VFIA 1TXXA 3IC4A 4TR1A 3C4NA 2GDRA 4JNAA 5F0GA 4EO3A 1XOAA 4Q5NA 3IHMA 2JB3A 1PFOA 4A6NB 3SXIA 1ZDLA 1XXUA 4XS4B 3GL3A 3K7TA 3LZXA 1CJ2A 3CPHG 3MIXA 1GERA 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chains in the Genus database with same CATH homology


 
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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