2R0GA

Chromopyrrolic acid-soaked rebc with bound 7-carboxy-k252c
Total Genus 156
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
156
sequence length
527
structure length
522
Chain Sequence
APIETDVLILGGGPVGMALALDLAHRQVGHLVVEQTDGTITHPRVGTIGPRSMELFRRWGVAKQIRTAGWPGDHPLDAAWVTRVGGHEVYRIPLGTADTRATPEHTPEPDAICPQHWLAPLLAEAVGERLRTRSRLDSFEQRDDHVRATITDLRTGATRAVHARYLVACDGASSPTRKALGIDAPPRHRTQVFRNILFRAPELRSLLGERAALFFFLMLSSSLRFPLRALDGRGLYRLTVGVDTMDSFELVRRAVAFDTEIEVLSDSEWHLTHRVADSFSAGRVFLTGDAAHTLSPSGGFGMNTGIGSAADLGWKLAATLRGWAGPGLLATYEEERRPVAITSLEEANVNLRRTMDRELPPGLHDDGPRGERIRAAVAEKLERSGARREFDAPGIHFGHTYRSSIVCGEPETEVATGGWRPSARPGARAPHAWLTPTTSTLDLFGRGFVLLSFGTTDGVEAVTRAFADRHVPLETVTCHAPEIHALYERAHVLVRPDGHVAWRGDHLPAELGGLVDKVRGAA
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

molecule keywords RebC
publication title Crystallographic trapping in the rebeccamycin biosynthetic enzyme RebC
pubmed doi rcsb
source organism Lechevalieria aerocolonigenes
molecule tags Oxidoreductase
total genus 156
structure length 522
sequence length 527
chains with identical sequence B
ec nomenclature
pdb deposition date 2007-08-19

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF01494 FAD_binding_3 FAD binding domain
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.30.9.50 Alpha Beta 2-Layer Sandwich D-Amino Acid Oxidase; Chain A, domain 2 D-Amino Acid Oxidase; Chain A, domain 2 2r0gA02
3.40.30.120 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich Glutaredoxin Glutaredoxin 2r0gA03
3.50.50.60 Alpha Beta 3-Layer(bba) Sandwich FAD/NAD(P)-binding domain FAD/NAD(P)-binding domain 2r0gA01
2BK4A 1D4DA 4CNJA 2DKIA 3CGDA 4H4YA 1OJ9A 4H2PA 1E1LA 3AE2A 4K5SA 1NAAA 3M12A 5HHFA 1QO8A 2X50A 1ZOYA 3NG7X 1YKJA 2GEWA 3P1WA 4K8DA 4A5LA 2F5ZA 1Z6LA 2GQFA 3P9UA 4YWOA 4DSGA 2XFPA 5JCNA 2XVJA 2V60A 3DJGX 4H4ZA 3S61A 3GMBA 4X4JA 2ZZCA 4YSZA 3ALJA 4KX6A 1F6MA 4U2SA 4H4PA 2YVFA 1Q1RA 1NEKA 4B69A 2E1MA 1M64A 2PYXA 4U2TA 2VQ7A 2BCPA 2YG4A 3AE9A 1ZMDA 1BKWA 1RSGA 3NIXA 1H7WA 3ZYXA 1GOSA 1LV0A 4H4RA 1V59A 4Y4LA 4AOSA 2WOIA 4OPCA 3DK4A 3CGCA 5BVAA 1IUTA 1EL5A 1L9EA 3OZ2A 4LA1A 1TYTA 3ITJA 1KFYA 2R45A 1F8RA 3AEGA 3CNPA 4YSXA 2Z5YA 4A99A 5M10A 1ZP0A 2ZZ0A 3CTYA 1JRXA 5HYMA 2B9XA 2E5VA 1L9CA 3Q9TA 1F3PA 1VQWA 2JKCA 4GDPA 4UP3A 4O5UA 1B4VA 2DKHA 1S2QA 3LJPA 4TLXA 3NKSA 4ADWA 3B6DA 3UOVA 2R4JA 3UTEA 1NENA 3R9UA 1GRHA 2CVJA 3UKKA 3URHA 3DJEA 2XFOA 5U63A 1KSSA 4YKGA 5CQFA 4B68A 1Q9IA 4CY6A 2YWLA 3LADA 3AYJA 2IVDA 2TMDA 2XDOA 4GRTA 2YR6A 3C4AA 3KD9A 2YAUA 3AECA 1TDOA 4H2RA 1Y56B 4USRA 4OPUA 3AE4A 1MO9A 4BV6A 4H2QA 3V76A 1IUWA 1H82A 3AE8A 4B67A 4EMWA 1HYUA 3AD7B 5IPYA 2AR8A 3PS9A 3DK9A 1S2YA 1BF3A 2WP6A 3SFDA 5FS7A 5IQ1A 1DXLA 2C72A 4J36A 1YQZA 2C76A 4OPIA 1PXBA 1PXAA 4U8IA 4B64A 1DOEA 1ONFA 2A89A 3P4SA 1PBBA 4RG4A 5DBJA 4YTPA 2EQ9A 4EQXA 3ICSA 3UP4A 4JDRA 4K7ZA 3GD4A 2C7GA 2WDVA 1K0JA 1B5QA 4BURA 3ALMA 2JAEA 1YQ3A 3IWAA 4H4XA 4LU6A 3NHOX 1JRYA 1TDFA 4CBQA 3IHGA 4USQA 1RYIA 4P9SA 5J7XA 1GRBA 5GRTA 2I0ZA 3ICTA 4RSLA 1TDKA 4H7UA 3AEAA 5EOWA 3S5WA 1IUVA 2XLSA 3CGBA 4U8KA 1OJTA 3AE6A 4X9MA 3RNMA 3VQRA 2WPEA 1GALA 1M6IA 2XLRA 3GYIA 3VRAA 4UDQA 1Q1WA 5EB4A 4K5RA 4EQSA 1OJCA 2YLSA 1GTHA 1ZY8A 4NZHA 4C77A 2GQWA 4NEVA 2W0HA 1KSUA 2BABA 1N4UA 1UKVG 3FIMB 5ER0A 3UCLA 2FJEA 2NPXA 4APNA 4CRTA 1BGJA 3LZXA 4EIPA 4EIQA 1H6VA 4FK1C 4YSYA 1P2EA 5U1OA 4NTCA 3E1TA 1LQUA 1CC6A 5BRTA 1FOHA 4YXDA 5BULA 1W4XA 1S3BA 3PO7A 1L0VA 2WU5A 1RP0A 1F8SA 2R4EA 3G5RA 4ECHA 5L46A 4U8NA 3AEDA 3EPTA 1TRBA 1K4QA 4B66A 3AB1A 2EQ7A 4AT2A 4DGKA 4D04A 2B7RA 4B1BA 4BJYA 3NYCA 2GR3A 4ZCDA 3RP7A 1N1PA 2H89A 2WQYA 3O0HA 3P4PA 4REKA 3CNTA 1CJ4A 4AT0A 1CC2A 4BK2A 2XVEA 1REOA 4C5OA 2XLPA 1QJDA 1NHQA 4A65A 1PN0A 3K7QX 1CJ3A 3KA7A 2BC1A 3IC9A 2YG6A 4K22A 1N4WA 4EQRA 2BA9A 2ZZBA 2FJDA 2AAQA 1XDIA 3ATQA 4D03A 2IIDA 3CPIG 2V5ZA 1D7YA 3FBSA 1KF6A 2FBWA 2YLXA 3AE5A 5HXIA 2WOVA 2OALA 1Y56A 3IF9A 3H8IA 4EM4A 2Y6QA 2O9ZA 1X31B 5JCLA 4EM3A 1PBFA 2R46A 5FMHA 3GDNA 2GF3A 1NPXA 4HB9A 2XLUA 2WP5A 4WCTA 3DMEA 1FCDA 3AXBA 2BACA 1VDCA 3H8LA 4B65A 4I59A 5KOWA 4IVMB 3GWDA 1PHHA 3DK8A 4KPRA 2B9YA 3AE3A 4I58A 2B9WA 1JU2A 1DJNA 1KNPA 2TPRA 3ABVA 1EL7A 3QSEA 2XFQA 1VG9A 3AE7A 3AYLA 3T37A 2APGA 1NG4A 1PBCA 4A7AA 2YLRA 3OC4A 4MJWA 2BK5A 4FK1A 5IQ4A 2BS4A 3GRSA 1CF3A 3CGEA 1NDAA 2C75A 3VRBA 1EL8A 4N9XA 3DGZA 4Z25A 5LV9A 1LPFA 2OLOA 3DJDA 3NYEA 1DODA 2Q0KA 2JBVA 3D8XA 2X8CA 4OVIA 3L1RA 4U8JA 4TM3A 1PDHA 3GYJA 4Y4NA 5M0ZA 3VR8A 2FJAA 1FEBA 4GR1A 5CKUA 4EMJA 4Z2TA 2WS3A 2XFNA 4H2NA 5FS9A 5U25A 4XWZA 2QA2A 4OPLA 4UDRA 1LJ1A 1S3EA 4A79A 3LB8A 1OJAA 1E39A 1SEZA 3F8PA 1GEUA 2B7SA 5GSNA 4U8MA 3VR9A 3QVPA 1LQTA 2R0GA 5JCIA 4NTEA 5KVIA 1F8WA 1CJCA 2XVFA 3KPFA 3PVCA 3RP8A 1CC4A 5JCMA 1GESA 2R0PA 1H81A 1GRTA 3NK1X 1GNDA 4J31A 2WEUA 1P2HA 2GMHA 4IA6A 1PJ7A 4H4QA 2WHDA 3BI5A 3QSMA 2YG3A 3QJ4A 2GAGB 1E1KA 1GETA 2FJBA 4FDCB 4H50A 3AEFA 3BHKA 3UKFA 3NH3X 2BS2A 3IHMA 4B63A 2R9ZA 3VRDB 1GRAA 4GUVA 4H4VA 4IVOB 2YVJA 2GH5A 3JSKA 3NK0X 4EQWA 4NTDA 2BC0A 2RGOA 5KXJA 3B3RA 3II4A 2B76A 3AD8B 3RP6A 1JOAA 3AEEA 3AYIA 3LZWA 4TM0A 1E6EA 2YR5A 2BXSA 5FS6A 1IUXA 4ZCCA 2RGJA 4OPDA 1N4VA 4ICYA 2YG7A 4C3YA 4Z26A 2C73A 1K0IA 3I6DA 3LXDA 4H4SA 2CFYA 2V3AA 2WPFA 3ATRA 3GD3A 4AOXA 2C64A 1PBEA 1ZX9A 3V3OA 3CN8A 4H4WA 1LVLA 2VRMA 4AP1A 1E1MA 4UDPA 2EQ6A 3K7TA 3EAOA 4BK3A 1L9DA 1H7XA 3K30A 5KRQA 2GRTA 1O95A 2BCGG 2Q0LA 1D4CA 1PBDA 1H86A 3GDPA 2GR1A 4GCMA 3HZLA 4PAAA 4YKFA 1CHUA 5FS8A 4A6NB 4BJZA 3LOVA 4GDEA 2IVEA 2VOUA 3ALLA 1NHRA 1FEAA 2BK3A 1K0LA 1D7LA 3F8RA 2UZZA 3FMWA 3UTGA 4J57A 1ZKQA 2VQBA 4LIIA 3UOZA 3L8KA 4C74A 4E0VA 4Z2UA 2XFUA 3G5SA 3SGLA 4U8PA 2V6OA 4CNKA 1GV4A 1EL9A 4Z43A 1GRFA 3D1CA 4C3XA 3H4KA 3SQPA 4O5QA 4GF7A 1Y0PA 2JB1A 3ICRA 4Z44A 4J33A 5EBKA 3GWFA 4TM4A 4AP3A 1O94A 2C70A 4RG3A 1IUUA 3NTAA 4CCRA 2CULA 1JEHA 1GRGA 3FPZA 5KVHA 4PABA 2Q7VA 4CCQA 1QLBA 1H84A 1KNRA 2WDQA 2XVIA 2XLTA 3UTHA 1ZK7A 2V61A 4NEWA 3CIRA 2VVMA 2BS3A 4CY8A 2WETA 5BUKA 2JB2A 1MXTA 1JNRA 1D4EA 1GSNA 2X3NA 2WOWA 3CNDA 5JCKA 3BHFA 4J34A 4J56A 5TR3A 3ZDNA 1ZMCA 2GB0A 4FX9A 1GREA 3GRTA 2YR4A 1PXCA 4M52A 2YG5A 2XCGA 3ADAB 3QFBA 3UKQA 5C3JA 3QFAA 1FL2A 2GMJA 3G5QA 1O5WA 2BYBA 3BNMA 1IUSA 2OLNA 3NYFA 2VVLG 1CL0A 3COXA 5J60A 1AOGA 1B8SA 2HQMA 3REDA 3QSSA 3BI2A 2A8XA 5KWFA 3P4QA 5EB5A 2C67A 4JNAA 1YY5A 2C66A 4U8OA 1ELIA 2R0CA 1GT8A 4YTMA 2YM1A 1LTXR 3NN6X 2OA1A 2ACZA 2GAHB 1MOKA 2A87A 3UKAA 2GVCA 3KLJA 1OJDA 3NTDA 2YLTA 1ZOVA 1GTEA 3DH9A 4XWRA 4HA6A 2XVHA 5KOXA 4U2LA 4JN9A 4WX1A 4IA5A 4OPTA 2YQUA 2JB3A 1EBDA 4DSHA 3UTFA 4IV9A 3F8DA 2E4GA 1BZLA 4YTNA 2YLZA 3ISHA 3AEBA 3NN0X 2JK6A 1E1NA 3C96A 4X9NA 3NRNA 3EANA 4J2WA 3UOYA 4OPGA 3CPJG 4JY3A 1NHSA 3P4RA 4JQ9A 1PS9A 1JNZA 2GR2A 4TM1A 3KKJA 1TYPA 2WDRA 3V3NA 1XPQA 1IJHA 4YT0A 3UKLA 3C4NA 2Z5XA 3BI4A 3RHAA 4A6NA 1TDNA 4ZN0A 2C65A 2ZBWA 1DOCA 4BK1A 2X99A 2AQJA 1DNCA 3I3LA 1PJ6A 1D5TA 2RGHA 4OCGA 2VZ2A 2Y6RA 3WE0A 1JRZA 1B37A 2H88A 3GMCA 3K7MX 2XYOA 2YVGA 3FG2P 4K2XA 2OAMA 1GPEA 2X8GA 1NG3A 3BNUA 1KDGA 1H83A 3UOXA 1XANA 2GR0A 1E7PA 3NLCA 3NT6A 2C3DA 3AD9B 3QVRA 2QA1A 4H4UA 2NVKX 1COYA 2VRLA 2WPCA 2C3CA 1DJQA 1GXFA 4Z2RA 3UP5A 4A9WA 1CBOA 3KU9A 1BWCA 2WU2A 1TDEA 4U8LA 4JY2A 2GV8A 3DA1A 4YSHA 2EQ8A 4JNQA 1ZDLA 3GSIA 2V3BA 3UKPA 3DGHA 4Y4MA 1BGNA 3M0OA 1FECA 2VVLA 2WESA 3CPHG 4DNAA 3Q6JA 2YM2A 3M13A 3CNSA 1GERA 3DJJA 2QCUA 3NK2X 3SFEA 5HY5A 2BXRA 1DOBA 4Z24A 4XXGA 1VRQB 2WBAA 3NGCX 3KVEA 4H4TA 2Q6UA 2X8HA 3CNJA 1YQ4A 3AE1A 2YLWA 3NNEA 3AWIA 2RABA 1PJ5A 1CJ2A 2ARDA 3EF6A 3SM8A 3UKHA 2WP9A 4EMIA 2PHHA 5C2TA 1XHCA 2J3NA 1NHPA 4TLZA 1VG0A 2QAEA 2CDUA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
1WIKA 3CTGA 2PERA 2DKIA 1W89A 2C4JA 3M12A 2A2RA 4ZL7A 2VOCA 2GEWA 3P1WA 4K8DA 4A5LA 3UVTA 3G3EA 2GQFA 4XS4B 1SKWB 2XFPA 4H4ZA 1U3IA 3GMBA 1ZYEA 2H1DA 4U2SA 4H4PA 1Q1RA 1M64A 2KP1A 4KSMA 1RSGA 3ZYXA 1A24A 1GOSA 5J9CA 3TB2A 5BVAA 4NXIA 3DK4A 2CX3A 3BOAA 3CGCA 1IUTA 5HQPA 4LMWA 3ITJA 3F6DA 2B7KA 2C1YA 3L9UA 3GH6A 4PURA 3CNPA 2Z5YA 5M10A 2ZZ0A 1PL2A 1SYXA 1JRXA 4IW9A 3W4IA 1I5GA 3PINA 4ECIA 3F8UA 3FR6A 4GDPA 4K1FA 2WCIA 4UP3A 2R37A 1B4VA 2DKHA 1YY7A 3VWUA 3LJPA 3T2KA 2AYTA 3SYIA 3CSIA 4ADWA 2QKEA 3GNJA 1O8XA 1U6TA 3B6DA 4II2A 3UTEA 2DIYA 5HFIA 3G7JA 3DJEA 2YV9A 2XFOA 1KSSA 3KP8A 3ERWA 1A2LA 1TI1A 3FR9A 2XDOA 3C4AA 4NPBA 3WT1A 1TDOA 4IQ1A 4I6XA 5H5SA 3AE8A 2FWFA 1ZL9A 4HOJA 2M80A 2AR8A 5AN1A 1BF3A 1RQMA 4ISDA 1DXLA 2C72A 4TR1B 1YQZA 1PXBA 3DWVA 4U8IA 4B64A 1DOEA 2WGRA 1TU8A 1B9YC 4O7HA 4TKYA 4DVCA 1F6MC 2LUSA 4YTPA 4GWRA 3UP4A 3IC4A 4K7ZA 1G7OA 1B5QA 4FH8A 4BURA 3IWAA 1V40A 2RM6A 4CBQA 3NHOX 3RPPA 1TDFA 2PBJA 1RYIA 4P9SA 1W4VA 1XWAA 1Z7RA 5KMRA 2I0ZA 1R4WA 3FR3A 5LD0A 3S5WA 1IUVA 1GSEA 4U8KA 1OJTA 3VQRA 3RNMA 2QGVA 2R2JA 4K8MA 3KH9A 1M6IA 4IP1A 2XHFA 1K0NA 2JADA 2V2GA 5EB4A 4K5RA 4G2EA 5D9WA 5ECSA 2GQWA 5F8BA 4KX4A 1SL1B 4L5LA 1N4UA 5ER0A 3FIMB 2FJEA 1ZYQB 4EIPA 4MH2A 3M8NA 1P2EA 3A5WA 5F06A 3CUKA 3O76A 1S3BA 3N9JA 4OD7A 3HVVA 1FAAA 2JL4A 1F8SA 1TRVA 1QGVA 1A0RP 1OE8A 2IMEA 1GL8A 1TU7A 2PMTA 3AEDA 4FIWA 1K4QA 5IMZA 4NMUA 1BAYA 4AT2A 4D04A 3NYCA 5D9XA 2FNOA 3W8SA 2GQKA 3CNTA 3TJFA 1CJ4A 1REOA 4K0NA 4PQ1A 3TKPA 3CRTA 2BC1A 3GUSA 5A5KA 5KN0A 1GUKA 4POBA 1FG4A 3TCOA 1XDIA 3VLNA 2VL2C 2V5ZA 4EF0A 3TRPA 2H8LA 2NVLA 3A2WA 1DBYA 2YLXA 3IF9A 2LQOA 2GDRA 1LU4A 4QL9A 1JFUA 1TK0B 2TIRA 1GUMA 3GTUB 5DDLA 3H93A 4KGIA 1S3RA 3TJBA 3ZMKA 5FHIA 1UVZA 4WCTA 3DMEA 2BACA 3H8LA 2OA7A 5KOWA 4TR1A 3GWDA 3KH7A 1VGLA 4KPRA 2B9WA 2TPRA 2APGA 1VRSD 2B5XA 3QAVA 1Y25A 2YLRA 1S3DA 3VRBA 3H1NA 4N9XA 4Z25A 5F07A 1DODA 2YJHA 5M0ZA 1XIYA 3GYJA 4GR1A 5H5RA 2XPEA 3APSA 2WS3A 3WD6A 2XFNA 5FS9A 4OPLA 4UDRA 4A79A 4QQ7A 1A23A 2B1KA 3LB8A 5DBQA 3C71A 3UOMA 3F8PA 6GSTA 2CAQA 5G5FA 3BBYA 5JCIA 2YZUA 2ZCTA 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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