5IMVA

Xanthomonas campestris peroxiredoxin q - structure f6
Total Genus 49
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
49
sequence length
158
structure length
157
Chain Sequence
TDAVLELPAATFDLPLSLSGGTQTTLRAHAGHWLVIYFYPKDSTPGTTEGLDFNALLPEFDKAGAKILGVSRDSVKSHDNFCAKQGFAFPLVSDGDEALCRAFDVIKEKNMYGKQVLGIERSTFLLSPEGQVVQAWRKVKVAGHADAVLAALKAHAK
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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publication title Peroxiredoxin Catalysis at Atomic Resolution.
pubmed doi rcsb
molecule keywords Bacterioferritin comigratory protein
molecule tags Oxidoreductase
source organism Xanthomonas campestris pv. campestris (strain atcc 33913 / dsm 3586 / ncppb 528
total genus 49
structure length 157
sequence length 158
ec nomenclature ec 1.11.1.15: Peroxiredoxin.
pdb deposition date 2016-03-07

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00578 AhpC-TSA AhpC/TSA family
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.30.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich Glutaredoxin Glutaredoxin 5imvA00
3IOSA 1N2AA 1NW2A 3CSJA 4EE0A 3FRCA 4PQHA 3G9BA 5J9CA 4FO5A 5KN2A 1GTUA 3D6IA 1GTIA 5DJLA 1GRXA 2GZYA 5CAXA 2L5OA 3GL3A 4RQRA 4N10A 3TOTA 4J56E 4ECBA 4XS1A 2H1GA 1FVJA 4I97A 5DAKA 4POLA 3CSHA 1JZOA 3M9JA 4V2LA 1PD21 3EU3A 1FOVA 2P5RA 3HVXA 2IMEA 1NHYA 1QQ2A 1YDKA 3DEXA 3W6GA 4MZWA 3DVWA 1VF2A 5ENUA 5DCHA 4TR0A 1GSEA 3GV1A 3GYKA 3ZMKA 3C71A 3E0UA 4KSMA 3EWLA 3KZQA 3GSTA 6GSWA 5A4UA 1DE1A 3TUEA 3ZL5A 4WEYA 3IAS2 3KM6A 2CZ2A 1YF1A 1ZL9A 4Q5NA 3IA1A 2V41A 4X1UA 1JFUA 3A2WA 4ZBBA 1OC3A 1WOUA 4YQMA 1USBA 1GNWA 3QD9A 4MH2A 5JWQB 4I2TA 3H8QA 4XHMA 2H70A 2L6CA 1BYEA 1VGLA 2OE0A 2QC7A 1HD2A 2ZUPA 4ZB6A 1EV4A 2V6OA 4JRRA 1YKCA 4MA9A 1ZCPA 3GKNA 1X9WB 3EU4A 2LS5A 4KX4A 5J3RA 3I43A 2MYGA 4PQIA 3HJMA 2YWNA 3N5OA 2DJJA 4KNDA 1KEBA 4ECCA 1PMTA 5ECQB 1ERVA 6GSXA 1TRVA 1SJ6A 3HD5A 1V98A 17GSA 3KH9A 4TVEA 1G7OA 1R5PA 3J7Yk 1FO5A 4GCIA 1XFLA 4ECIA 1WIKA 2VLUA 1JHBA 5B8AA 5AISA 1THOA 1RK4A 2RUFA 4KDUA 2X8CA 3IV4A 2I9HA 3IDVA 5E4WA 2WCIA 4MPGA 1O6JA 1DBYA 4FYBA 4DSQA 5F05A 3A2VA 4F9ZA 3C73A 3I69A 1TXXA 1GWCA 2C4JA 1ABAA 20GSA 2IFQA 2H0HA 3APQA 4I6XA 2HFDA 11GSA 4LL4B 2H74A 4EF0A 1SKWB 2LNSA 3IR4A 1HNAA 2VLTA 2HE3A 1NHOA 4TOPA 2H01A 1EGOA 2CX4A 4GQFA 1WPIA 4PNFA 3BD2A 4OMVA 4KE3A 3IK7A 2OJLA 3GFKA 4N0VA 4KUNA 3D4MA 5D9TA 2FD3A 3DXBA 3TGZA 3TB2A 3VWVA 5L71A 19GSA 1Z6NA 4JR6A 1AUCA 2DLXA 3G7IA 3HYPA 1K0DA 3RAZA 2L4QA 2YWMA 2A2RA 2GQMA 4RQXA 2JZSA 2QKEA 3ZVJA 3Q19A 2NVLA 1SYXA 3BOAA 4MPFA 1O8WA 3TDGA 4N0ZA 1ERWA 5COHA 2E2MA 2H1AA 6GSVA 3US3A 1F3AA 3QPMA 4OFNA 3TKRA 3O3TA 3DD3A 5AIXA 2VCWA 1O81A 4IELA 2LJKA 1KTEA 3WT1A 2HI7A 1GL8A 1B4PA 2MMNA 3UIWA 1GSSA 1TRWA 4FYUA 4AGSA 3QOUA 1EGRA 2PBJA 1JZRA 4OD7A 1JZWA 4KDXA 2C1YA 2EIRA 1FW1A 1XWKA 3L4NA 2H0IA 3CMIA 3ZIVA 3KP8A 1AQWA 2JZTA 3EMPA 3RPNA 2RM6A 3UVHA 5CP1A 4GXZA 3LYKA 1ZYQB 5ID2A 3ERGA 1PGTA 4NXIA 3VURA 1N8JA 1PQNA 1S3CA 5DQYA 4ZB8A 5CREA 4L0UA 5ID2B 3ISOA 2TIRA 4HOJA 3FZAA 2H76A 2P31A 2H30A 3TJBA 5D93A 2OBKA 4HQZA 3VWWA 4L5LA 5ECOB 5IPHA 2O87A 2EC4A 5IMVA 1BG5A 1MD4A 1R5AA 3KTLA 3CRUA 1FB6A 3UEMA 4ECJA 2YV9A 1OYJA 3QDNA 1BX9A 1O8XA 1ML6A 2VL3A 3LEFA 1PX7A 2Z9SA 1YY7A 4PUFC 3FYGA 1JLWA 2JSZA 3GRXA 4EO3A 4MK3A 3TOUA 1J0FA 4MZBA 3Q74A 1K0AA 2R3XA 3MSZA 3TJGA 4ID0A 4O92A 2K6VA 3D5JA 2BTOT 4FIWA 1O85A 5ECIB 2P0GA 4V2MA 4ZL8A 1V9WA 2OBIA 4XS6A 3KP9A 3GKMA 2BJXA 1EWXA 1R7HA 2B5EA 3AY8A 2GSSA 2L6DA 2N5BA 2PWJA 3QAVA 4MDCA 5GZZB 3FZ9A 2KOKA 2GSRA 2AAWA 1A0FA 2VO4A 4I5QA 2LV3A 2MBTA 3GHAA 1T7PB 1SD8A 3U6VA 3UOMA 4O32A 1TK8B 1V58A 1EEMA 1CQHA 1PRXA 1MDIA 5KEJA 3C8EA 1YF0A 4KAEA 1TRUA 4TXOA 1WRYA 2PGTA 4HZ2A 1JZDA 1X5DA 1EZKA 2VL2A 2X99A 1G6WA 2VCVA 1Y25A 2YV7A 5HFGA 1MEKA 2YOIA 4GQCA 3TJJA 2HRNA 3BJ5A 5JWRB 1V2AA 2HRFA 3TKQA 2IL3A 5ECMB 5LD0A 1LU4A 1OVNA 3FEUA 1SU9A 4Q5QA 4HEA2 2LJAA 6GSYA 1ILOA 3Q18A 2DIYA 2YWOA 2M72A 3GMFA 2ALBA 4DSSA 2GSQA 3GH9A 1SKRB 4IJ3A 4KGIA 2FCHA 2FLSA 2H66A 2NDOA 1QUWA 1SK2A 1WWJA 5HR3A 2OKAA 5KN0A 1LJRA 2XPEA 2DC5A 2LQQA 4MZCA 3HKRA 4ILFA 3QAGA 2RIIA 4E8EA 1NM3A 1ZMAA 2VCZA 3ZFBA 1XOBA 3N9JA 2H6ZA 2WZ9A 2P5QA 4QL9A 4KH7A 2RUEA 5H5SA 4EDYA 3VWUA 3GNJA 3ERWA 2YN1A 3QMXA 3RHBA 2GQKA 5CYYA 4HI7A 1MD3A 2VM2A 1B48A 1THXA 2FNOA 2JADA 18GSA 3NIVA 3KXOA 1XW9A 4GWRA 5AIVA 1WE0A 1GSDA 4CHSA 2O7KA 1TI1A 3HJOA 2JZRA 5KN1A 4ZL9A 3HJPA 5HR2A 3LG6A 1H75A 1M99A 4GF0A 3A5WA 1Z5YE 3EC3A 3TJFA 3GSSA 3GX8A 2PN8A 3RHCA 4ZXGA 3DIEA 3ED3A 1DSBA 10GSA 3BBYA 2C3TA 2ES7A 1PKZA 2DJ2A 1K3OA 1ST9A 2ZNMA 2HLSA 1ON4A 4YAVA 3ZIJA 1GSUA 5A4VA 2M46A 1AQXA 4TR1B 2CV4A 1AQVA 4OCFA 4HDEA 2F3MA 3H93A 2VD0A 2A2SA 3O76A 1Q4JA 1GH2A 2GT6A 3I6AA 2VL2C 1M9BA 2C3QA 2FWHA 3L9SA 3PH9A 1M9AA 2ZCTA 3ZYWA 1IYHA 1ERUA 2OACA 5EVOA 5ECKB 2B5YA 1XW5A 1Y6EA 5ABRA 1EV9A 2DSAA 1XZOA 5EPFA 4K1FA 3CRTA 5G2ZA 2J23A 3HVVA 2L59A 1EOGA 3ZRDA 1E6BA 4BWQA 1OE8A 3ZLPA 7GSSA 2A4VA 2FHEA 2FWEA 2WFCA 5CRWA 3VI7A 2YNXA 2FGXA 2G2QA 3UAPA 2H6YA 4RUVA 4TW5A 1EP8A 3KD0A 5IMZA 1C72A 3A2XA 4OFTA 1A24A 1Z7RA 3J7Yb 3LJRA 3DMLA 5GAND 3DVXA 5ECNB 3VPQA 1FG4A 3FR3A 2WS2A 3KEBA 1Q98A 3WGXA 3EVIA 2WDUA 5DCGA 4K7OA 4BPYA 1SKSB 4N11A 3RDWA 5IMAA 2IMIA 1UC7A 2GSTA 3WT2A 1YEXA 5FT3A 1GLPA 4WXTA 2B5XA 1T4ZA 1HNBA 2ON5A 4MF5A 3SBCA 4WF5A 2AYTA 2AHEA 3TKPA 3FKFA 3RBTA 5ECLB 3GX0A 4KW6A 1MDKA 2CAQA 1K3LA 4V2NA 2XHFA 1R26A 14GSA 4WR4A 3P8WA 2KP2A 4XCSA 2XBQA 3F0IA 1U3IA 2K9FA 4MABA 3GKKA 5F0GA 2FUG2 4I2UA 4PQ1A 1K3YA 1YKAA 3M1GA 3D0ZA 3E9JB 1PL1A 3QFAC 2NPBA 1Z7PA 3GUSA 4WETA 4PURA 2B1KA 4H86A 3CBUA 4ULXA 2JL4A 1DUGA 5HR0A 4OO5A 2C0GA 1TP9A 1ZGNA 3KCMA 4WR5A 3APOA 1OC8A 2B7JA 2J9HA 3G7JA 2KHPA 5F06A 4NWYA 4Q5RA 2R4VA 2DJ1A 3OR5A 1SENA 4X0XA 4YQUA 2CVBA 1PL2A 5HQPA 3MNGA 2O89A 3HCZA 3QAWA 2LQOA 5ECPB 4POBA 5CRGA 5EL8A 3CTGA 3ZMLA 1Z6MA 1XCCA 3E3EA 5FHIA 2H1BA 2RM5A 4EUYA 4KDYA 2LJRA 4XRAA 4MCUA 4JR4A 2EIOA 5B6MA 4V1Ag 4ML6A 1A2JA 4PUAA 4LMWA 3F9UA 2C0FA 3DGQA 2K8SA 5J4UA 2F9SA 1J9BA 2KP1A 3FY7A 3L9UA 3MWHA 4F2IA 1PSQA 3A3TA 4XS4B 1GUMA 2H71A 2I3YA 5ELGA 4NV5A 3KIJA 4Z7XA 1WMJA 2PMTA 5JCUA 4RI7A 1O73A 2X64A 2X8HA 4BL7A 3HVSA 4KB3A 3EE2A 4ACSA 3KTBA 4EDZA 1SK1A 4AF2A 1XW6A 4MJCA 4PX1A 2KLXA 4L0WA 2DBCA 1FVKA 3PR8A 2MMOA 2H1DA 4G2EA 2DJKA 4MLYA 2FA4A 4IBPA 2WRTA 3P7XA 1VF4A 4FYCA 3GL5A 4ZL7A 3ME7A 3UMAA 1SJZA 5IO0A 1MDJA 1B8XA 1T4YA 1XVQA 2O85A 3L9VA 5E59A 2GDRA 2PUKC 4HZ4A 3GTUB 1B9XC 3TRPA 4OWYA 4J57E 2B7KA 2EIQA 2VM1A 5G5FA 3L78A 5AGYA 2N5FA 1K0MA 2XPDA 4IGJA 1TU7A 3KH7A 2V1MA 4P3YB 4J2FA 1GUHA 1U6TA 4D73A 13GSA 4ZIJA 2CA8A 3U5RE 5IOWA 5C00A 2H8LA 4IQ1A 1XBSA 2YPMA 4PXOA 4D73B 1SYRA 1YJ6A 4MMMA 3M0FA 3MAKA 4YQVA 1TK0B 2V2GA 3CYNA 1GSQA 5EY6A 2LRTA 2OE3A 5G31A 1EOHA 4MJAA 4IKHA 3Q6OA 1JLVA 2D2ZA 3BCKA 2DMLA 4XTSA 3WGDA 2VCTA 3CXGA 5F8BA 3DKSA 1G7EA 1RW1A 3ME8A 4IP1A 1A2MA 2CX3A 2VLVA 5B7CA 1W4VA 3TKSA 4TR4A 1X0RA 2GS3A 12GSA 4FH8A 5ECHB 3GA4A 3F6FA 2WGRA 4MH3A 3MDKA 3F4TA 5IMDA 4GSSA 5G1KA 2FY6A 2K8VA 4TN8A 4XRDA 4GLTA 4ZILA 4K9ZA 1URMA 4F03A 2IMDA 5IMFA 2JU5A 2CQ9A 2NBSA 2OADA 1M2BA 4OFMA 2DJ0A 1E2YA 4G9HA 5DJMA 4NMUA 2AUVA 4K0GA 1G0TA 1G6YA 3LXTA 3EMXA 1M2AA 1XWCA 1AIUA 3W8SA 3ZTLA 3FK8A 1LBKA 3TJKA 4JBBA 2E0QA 2VCXA 2E7PA 2V32A 3NOFA 5IOXA 3CSIA 2C8UA 1UVZA 5C04A 2BMXA 5DALB 1S3AA 2TRXA 2M80A 4NV2A 4HU7A 16GSA 5D9XA 2B6MA 2CT6A 2GLRA 5G1LA 5J5NA 5GAPD 2HYXA 3D22A 2F8AA 5HFIA 4WKWA 1V40A 5IPGA 2H0GA 2H75A 3PGTA 2GZPA 1M2DA 2WJUA 1GLQA 4TRXA 2HNLA 3HZ8A 4G10A 4HS1A 1TKDB 2IMKA 2YZHA 4IJIA 3F3QA 5IQYA 1K0BA 4F0BA 3DYRA 3WYWA 1IYIA 2I4AA 3TRQA 3PINA 2DMMA 2PPTA 2X8GA 8GSSA 3H1NA 5INYA 2RLIA 3IXRA 2LTKA 2FA8A 4LLRA 2FWFA 4JE1A 3FR6A 3IHQA 1O7UA 2VAFA 3GN3A 2QSIA 2REMA 2VOCA 1Z9HA 2C3NA 4WF4A 1QXHA 1A23A 1F9MA 4TR1A 1SL2B 4TKYA 1B4QA 2VUPA 2LKUA 4EKZA 1SL0B 2LNTA 5DAKB 4AJ7A 2L4CA 2R5GA 4N30A 3TKSC 3F63A 4WBJA 4E8HA 1GSFA 1ZOFA 1ACVA 1OC9A 3IAM2 1K0CA 2QGVA 1AW9A 3R2QA 3GIXA 4K6XA 2H19A 4BWSA 4Q5FA 3LGCA 1U87A 4L5OA 2CAIA 3UBKA 4KCAA 1PA3A 4IQAA 2B1LA 1OC9B 3W8JA 4MJBA 1X9MB 1XWBA 4O5RA 5GSSA 4I8BA 4YH2A 3UJ1A 1HYUA 2I81A 3G7YA 1F6MC 1KNGA 4ML1A 1HQOA 1VF1A 4IS0A 1SK0A 4AJ6A 4CDOA 3S9FA 3IC4A 1GSYA 4X43A 2L57A 3HA9A 1OE7A 4YAPA 3UARA 2IPAA 1A8LA 3ERFA 2HSYA 3DRNA 1B9YC 3UL3A 2XC2A 1R4WA 2MZCA 3KMOA 3L0HA 4K8MA 3F4RA 4KCEA 1T00A 5IIZA 6GSSA 4QL7A 3VPTA 4ZB9A 3JCML 2F51A 1H4OA 3FHKA 3QFBC 2IIYA 4NHWA 1TK5B 5FWGA 3GURA 4IW9A 1TTZA 4IP6A 1I9DA 4MF6A 5LCZA 1V57A 1U88A 1XPVA 1UA5A 1X5CA 2HZEA 4LA1A 2AB6A 1BQ7A 5IO2A 1YEPA 2DJ3A 4HQSA 1F37A 2YWIA 3GH6A 2HZEB 4DSRA 1UN2A 3KJYA 4MP4A 3FZ4A 3O6TA 3LORA 1GUKA 3D4TA 1SL1B 2YZUA 5D9WA 1PX6A 4IHUA 4NPBA 2HZFA 2OE1A 1EEJA 4LMVA 4DVCA 3F4SA 9GSSA 2VCQA 3LFLA 5DQSA 2N5AA 1MTCA 4TR3A 3F6DA 5G5EA 1YQ1A 2R2JA 2IFQB 1QMVA 4HJ2A 2R6KA 2JACA 4F0CA 1AXDA 2LUSA 3CTFA 5A5KA 3C1SA 1KBNA 2GZZA 1XWGA 3HZ4A 3VFIA 2HT9A 2LRNA 1ZZYA 5H5QA 3EYTA 3HY2A 2C0DA 4BA7A 5IMCA 2PVOC 1NSWA 3ZZXA 3LQ7A 4BVXA 4JZQA 2IN3A 3VLNA 1PN9A 2H72A 3LSZA 4IVFA 1AAZA 4POMA 3LXZA 5D96A 4G19A 5F07A 1K0OA 4POKA 1HNCA 1QFNA 1OAZA 2YJ7A 4HJMA 1OKDA 3ZFLA 4O7HA 1AC1A 3M3MA 1GP1A 3D21A 5KN3A 3KMNA 22GSA 1J08A 3QR6A 1T3BA 2VL9A 4XS4A 3IRAA 2C0EA 2MBSA 4HU9A 4K2DA 1QK8A 5CO3A 2LSTA 5ELAA 3P90A 4JU5A 3FW2A 2YJHA 2WB9A 3K8NA 5A4WA 4EL1A 4MJEA 2NTOA 4JEDA 3C7MA 5HFKA 3HXSA 2K18A 3EINA 3M9KA 1XXUA 1BAYA 1CQGA 3ZVJD 3TKSE 5DDLA 1TI3A 1TOFA 4GSTA 4KA0A 2R37A 3F3RA 3H4KA 3EURA 2CVDA 4L8EA 1XVWA 3GTUA 2GQLA 1XOAA 2YCDA 5GSTA 4AJ8A 4EVMA 1TU8A 1QGVA 2MMZA 5IM9A 4GSNA 3ZITA 1FAAA 3F8UA 5J9BA 1DE2A 1A8YA 5CRDA 2IWTA 1A0RP 5JCWA 1GTBA 2C80A 2KUCA 3HDCA 4GRFA 1T8EB 2ON7A 4PNGA 2FWGA 5B6NA 1XWAA 2PU9C 2GVPA 3BCIA 2IMFA 4XIHA 1SJIA 2VD1A 4HUAA 1FB0A 5B8BA 3GKXA 2YANA 4EXJA 2HSHA 3FZ5A 1WP0A 1BEDA 2G0FA 2HXKA 3LYPA 5JCGA 3V1WA 5HR1A 2CZ3A 1SD9A 4DEJA 1OKTA 1F2EA 4EC0A 1GTAA 3SWLA 4ISDA 1EP7A 5CNWA 2JSYA 1K0NA 1Z3EA 5CRHA 5DBQA 1TW9A 2VIMA 3QCPA 6GSUA 3HHVA 5G30A 4NHZA 5AN1A 4K7IA 4LL1B 1GNEA 3IE3A 1ERTA 2AJQB 2OA7A 5ECRB 4WBRD 3C1RA 1S3DA 2LRCA 4BVYA 3IPZA 1X5EA 3I9V2 4NAXA 4V1Ap 2IJYA 1TRSA 2PVQA 3TCOA 5H5RA 2WULA 1A2LA 2GT5A 2GTUA 1GULA 3VK9A 2I1UA 2YP6A 2XBIA 1VRSD 3IBHA 4TXVA 1F3BA 3UBLA 3VWXA 1TJDA 3H79A 4F82A 1U3AA 2F8FA 3APSA 3UVTA 3WD6A 1RQMA 1W89A 4ZBAA 4PGTA 1YZXA 2DIZA 2CVKA 1I5GA 1M0UA 4TXOB 5DVBA 1T1VA 1XIYA 2H73A 2L5LA 5D9VA 1TDIA 5DALA 3VI5A 5J41A 2GGTA 1X9SB 4GTUA 1PKWA 3DWVA 1ZYEA 3P2AA 4KSOA 2LEGA 4K0NA 3TRXA 4ZBDA 1M7TA 1FHEA 2MMAA 4QQ7A 2O8VB 4CW9A 3LWAA 2TRCP 5LNKe 2AV4A 4RI6A 5D8IA 1WJKA 5D73A 3FR9A 3KGKA 4IN0A 4OCEA 3IK9A 4DSSB 3ZREA 3WGEA 3RPPA 3M8NA 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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