5IMVA

Xanthomonas campestris peroxiredoxin q - structure f6
Total Genus 49
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
49
sequence length
158
structure length
157
Chain Sequence
TDAVLELPAATFDLPLSLSGGTQTTLRAHAGHWLVIYFYPKDSTPGTTEGLDFNALLPEFDKAGAKILGVSRDSVKSHDNFCAKQGFAFPLVSDGDEALCRAFDVIKEKNMYGKQVLGIERSTFLLSPEGQVVQAWRKVKVAGHADAVLAALKAHAK
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
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molecule tags Oxidoreductase
molecule keywords Bacterioferritin comigratory protein
publication title Peroxiredoxin Catalysis at Atomic Resolution.
pubmed doi rcsb
source organism Xanthomonas campestris pv. campestris (strain atcc 33913 / dsm 3586 / ncppb 528
total genus 49
structure length 157
sequence length 158
ec nomenclature ec 1.11.1.15: Peroxiredoxin.
pdb deposition date 2016-03-07

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00578 AhpC-TSA AhpC/TSA family
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.30.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich Glutaredoxin Glutaredoxin 5imvA00
5ECMB 1ZOFA 2IMEA 1GTIA 1WPIA 4ZB6A 2FWFA 2CVKA 2JADA 3EINA 4NHWA 4YAVA 3UJ1A 1J08A 1K3OA 3QPMA 4ZL8A 2CVDA 2E0QA 4IHUA 5CRWA 4MJEA 5D9XA 2L59A 4I5QA 5CAXA 1A2JA 3TJGA 4BPYA 1WE0A 3BD2A 1JZOA 3W6GA 1SKRB 3EMXA 3IRAA 3HXSA 1X9MB 1S3CA 4K7IA 4KW6A 4N10A 4OFTA 1T7PB 1GTAA 5G5EA 4IJIA 2DJ2A 2VO4A 2M80A 3ZMLA 3UEMA 1H75A 4XS4A 4KCEA 2CQ9A 22GSA 2LRCA 4IQAA 3ZL5A 3HKRA 1O7UA 3O3TA 4I2TA 1RW1A 1TI1A 5ECOB 5FHIA 3UIWA 3A5WA 1GSEA 2HE3A 4OO4A 1OC9A 4ZL7A 1SU9A 2GSSA 1W89A 3ERGA 5JCUA 3C73A 1JLWA 1B9YC 2LRNA 1EEJA 3H8QA 1WIKA 2R5GA 5D8IA 1OE8A 2O8VB 4AGSA 1X5CA 5KN1A 2OA7A 5IMVA 1FG4A 5B6NA 2IL3A 3QAGA 4JE1A 2GSRA 2YZUA 2MMZA 1M99A 4LMWA 3QFAC 4BVXA 4MF7A 3FZ4A 2XBQA 3IBHA 4WBRD 2LEGA 5JCWA 2VL9A 3UVTA 1Y6EA 2K6VA 3F4RA 1M2DA 2HXKA 4JU5A 5DDLA 1CQGA 3GNJA 1XBSA 1B8XA 3U6VA 2CA8A 4QQ7A 5ECLB 4NMUA 1XIYA 1OYJA 2YZHA 1ILOA 1M0UA 2V6OA 4OCEA 1AQWA 2IMKA 1XVQA 1ZYEA 2JL4A 1A2MA 3VWXA 1TP9A 2QC7A 3RHCA 1JLVA 2YV9A 1ERWA 3LGCA 1QXHA 3F6FA 2CT6A 5HR0A 1THXA 3KCMA 4O32A 2H8LA 4PUAA 1E2YA 1JZRA 4WETA 2B1KA 3TKSE 3DWVA 3FY7A 4EO3A 3CSIA 4GXZA 5D93A 4EF0A 3HHVA 6GSTA 1ML6A 1XWBA 2N5AA 2H76A 3NOFA 1Z7PA 3A2XA 5IM9A 2A4VA 2AYTA 5CYYA 3A2VA 2F3MA 2OBKA 1Z3EA 3GA4A 3M9JA 1KBNA 1BG5A 3CYNA 1M2BA 2IN3A 3N5OA 4EDYA 3GN3A 1GH2A 4FYBA 1TI3A 2AJQB 5D9TA 4O92A 5H5RA 5ECQB 3GL3A 2H1AA 1VRSD 1EP8A 5ID2B 2O7KA 4GWRA 2GZYA 1OKDA 1S3DA 5DAKA 1OE7A 1AC1A 2WCIA 4N0ZA 3ZFBA 2PGTA 3QCPA 5IMCA 2ALBA 4OCFA 2RUFA 4TRXA 2OJLA 3F4SA 3Q18A 3E0UA 1N8JA 3GX8A 2L57A 1T3BA 3ME7A 3APOA 1TOFA 5A5KA 4V2NA 3QDNA 3QR6A 2FD3A 3O6TA 3BJ5A 2GS3A 2B6MA 3MAKA 5HR2A 1XFLA 4ML6A 5ELGA 9GSSA 4YQVA 5IPHA 4IVFA 2X8CA 4V1Ag 1ZL9A 3GUSA 1O73A 4TXOA 3CRUA 1VGLA 2VCQA 2IMIA 2ON5A 2KUCA 2IPAA 5JWRB 4WEYA 4ZB9A 1EGRA 3TKQA 2ES7A 4WR5A 1ERVA 4ACSA 4EKZA 1USBA 2X64A 4NPBA 3TKRA 1V58A 1FVKA 1O81A 3TJKA 1XXUA 1TRWA 3C8EA 4IQ1A 5F0GA 2C0EA 1S3AA 2AB6A 2LQOA 5G2ZA 18GSA 1XWKA 5E4WA 2L6CA 4ZB8A 3TB2A 4KH7A 1J0FA 1X9WB 2YWMA 3LORA 4ULXA 3WD6A 5IO0A 2LNSA 3KMOA 5HR1A 2WB9A 3IA1A 3L0HA 3UL3A 3I9V2 4HEA2 2C0DA 1UN2A 5H5QA 1ST9A 2GGTA 5H5SA 1PRXA 3LJRA 1M9AA 1GWCA 1OAZA 2NBSA 3AY8A 3D21A 4WXTA 3F6DA 5C00A 4WR4A 3KTBA 1ZCPA 4DSRA 3GX0A 1XWGA 2H70A 2A2SA 2WGRA 1EWXA 4OWYA 5G5FA 4FH8A 3F0IA 4K1FA 1PL2A 1TJDA 1FVJA 2FWEA 2IMDA 2GSQA 5G30A 4F0BA 5HQPA 2VOCA 1B48A 2LUSA 3FZAA 1W4VA 2QSIA 2YANA 4GSTA 3ZYWA 4HU9A 2VCZA 4HUAA 1AXDA 14GSA 5IMFA 1B4QA 2H1DA 3DD3A 3D6IA 1Z6MA 2B7JA 4FIWA 3C1RA 2TRCP 1YQ1A 3G7YA 5KEJA 1PD21 4ID0A 3HZ4A 2H19A 1PMTA 4GF0A 3ZVJA 4WF5A 3ZIVA 3GL5A 5FWGA 4YQMA 2VL2C 4F82A 2LS5A 3C1SA 4HI7A 2TIRA 3DGQA 1AIUA 3CSHA 3F3RA 1R4WA 1UVZA 4J56E 2V1MA 1TTZA 3WGDA 2BJXA 2LTKA 2WS2A 3FW2A 4XS6A 3M9KA 1TXXA 4OFNA 1GSSA 3FRCA 1RQMA 3LG6A 5DBQA 5CRGA 3ZRDA 1GUMA 1V98A 3NZNA 2RM5A 1MDJA 4V2LA 1QUWA 3RDWA 3WYWA 2VCVA 2VCWA 1WMJA 4G10A 2C0FA 3UBKA 5B8BA 2OE0A 3GFKA 3FHKA 1U87A 4Q5FA 2R3XA 2YP6A 3H93A 2KOKA 1FOVA 2NTOA 3K8NA 5KN2A 4HDEA 2IFQB 2J9HA 2ZUPA 2MYGA 12GSA 2EIRA 4J2FA 3F8UA 2HSHA 2KHPA 3GYKA 4F2IA 1HNCA 2PUKC 1JZDA 2VLTA 1XW5A 1CQHA 2R37A 4L0UA 5AIVA 1EZKA 2OACA 2WFCA 3C71A 5HFKA 2X8GA 1SKWB 2WDUA 4MJAA 1BAYA 2CX4A 3APQA 4KAEA 4MF6A 2FWHA 2F8AA 5DQSA 3A2WA 4Q5NA 1ZMAA 2PBJA 3GSSA 3ZTLA 3HJPA 2YNXA 1GNWA 3FZ9A 2DJKA 5AISA 4D73A 3M1GA 3KXOA 1PSQA 4XHMA 4RI7A 1B9XC 2D2ZA 3GTUA 1OC8A 4I6XA 2C3NA 2GZPA 3KEBA 2L4QA 4KSMA 3DEXA 4E8EA 3UARA 2TRXA 5B8AA 3C7MA 3IHQA 4ISDA 4RI6A 4HZ4A 4JEDA 3F4TA 4PXOA 2LJRA 3UAPA 3EURA 3VWWA 2K18A 3M8NA 1QK8A 1Q98A 1PX7A 1PKWA 4TR1A 1EP7A 4DSQA 1Z5YE 2C3TA 3VI5A 20GSA 1AW9A 2XC2A 4ECBA 1SYRA 2EIOA 2PVQA 4NV5A 1R5AA 4WBJA 4DVCA 3ZFLA 2L6DA 3IR4A 1A0RP 2C1YA 1LU4A 1Q4JA 2HNLA 4MLYA 3IE3A 2C8UA 2XHFA 1G0TA 3VWUA 2HRNA 2HT9A 2B3SA 2VL3A 5IPGA 2C0GA 3KH9A 3FR3A 4LL1B 4HZ2A 4KNDA 1TW9A 1GTBA 1NHOA 1R7HA 4XCSA 2WRTA 2N5BA 4X1UA 3HY2A 3TDGA 3EMPA 1A2LA 3CSJA 1H4OA 2OKAA 4G19A 3MWHA 2JZRA 3G9BA 3BOAA 3TJBA 4O5RA 2HYXA 2BMXA 2GT6A 3HA9A 2H1GA 4E8HA 4KA0A 2H6YA 6GSVA 3A3TA 4RQXA 4FO5A 4I2UA 3VURA 5IOWA 4KUNA 2MZCA 2H74A 4JBBA 3WT2A 3ISOA 5IQYA 2CZ2A 1E6BA 2X8HA 5D96A 5EPFA 2H72A 5L71A 4I97A 3WGXA 5LCZA 1AUCA 2AV4A 3ZZXA 5A4VA 1FAAA 4NHZA 4TR3A 4MH3A 2L5LA 1SD8A 2MBSA 3KTLA 3QFBC 3EVIA 1YEXA 6GSWA 3GURA 4IN0A 4ZL9A 3KMNA 4IS0A 1BYEA 2LRTA 4AJ6A 3KH7A 4HJMA 4KDUA 4MZCA 6GSXA 1JZWA 4EUYA 4Q5RA 2M72A 1TU8A 4AJ7A 4GQFA 4FYUA 1GSFA 1PKZA 2OADA 1EEMA 5ENUA 1SJZA 5ECPB 3EU4A 5JCGA 2XBIA 2FA8A 1F2EA 1V40A 3WT1A 1UC7A 5GSSA 1PQNA 1SL2B 3E9JB 5ECKB 4MPFA 4N30A 3ZMKA 2K8VA 3J7Yb 2IIYA 3M3MA 5GZZB 3GKMA 2H30A 2AHEA 4K0GA 1TRSA 1PL1A 3KGKA 2KP2A 1I5GA 3VLNA 3LSZA 5AN1A 2B5YA 1AQXA 5LD0A 3UOMA 4RUVA 2DC5A 3VI7A 1A23A 3IDVA 1X5EA 1ERUA 1V9WA 1QGVA 4QL9A 1RK4A 2DSAA 2PVOC 2GQKA 3I43A 1MDIA 2KLXA 2GDRA 3J7Yk 2HRFA 5IIZA 4PQIA 1XZOA 3HCZA 3GRXA 3IK7A 4AJ8A 2FGXA 7GSSA 1DE1A 1C72A 3ZITA 4KSOA 1ACVA 5GSTA 2GVPA 3LXTA 3HJMA 1DSBA 1YDKA 1JFUA 4LA1A 2B1LA 6GSUA 5ECNB 5F05A 1TRVA 5CNWA 2VLUA 2JACA 5J3RA 4HS1A 1SJ6A 1HNBA 2HZEB 3TKPA 2WULA 5ID2A 5IMAA 3VPQA 4YAPA 2ZNMA 2J23A 4IELA 4KCAA 2H0GA 4HOJA 2H73A 3LYKA 1R26A 2B7KA 2DMMA 4IP6A 4EC0A 4ZBAA 1M2AA 5IMDA 2MMNA 3LQ7A 2PMTA 1K0AA 2O87A 3RPPA 2LQQA 5DJMA 5G1LA 1PX6A 2YN1A 4PNGA 4CHSA 3TRQA 3VPTA 1MD3A 1YEPA 2O89A 2C80A 3D4TA 3HJOA 2NVLA 4NXIA 1U3IA 1LJRA 5LNKe 2MMOA 4G2EA 4KDYA 2I4AA 3KZQA 4RQRA 4XTSA 3TOUA 10GSA 2E7PA 4KGIA 4L0WA 3UBLA 2DMLA 3DVXA 3W8JA 1NM3A 1BX9A 2WJUA 4GRFA 1VF3A 1GLPA 4DSSB 3DKSA 3GH9A 4BWQA 2PU9C 3QAVA 2I81A 4H86A 1F6MC 1GSYA 2GQLA 2LJKA 5DALB 1XW6A 3KP8A 2FHEA 2H01A 1XOBA 3Q6OA 2G0FA 2K9FA 4TVEA 1FW1A 1V57A 1DE2A 3PH9A 3UVHA 1PGTA 3BCKA 2I1UA 2YWOA 2K8SA 2PWJA 5EY6A 2VAFA 5J4UA 2GLRA 4MJCA 4MA9A 1YJ6A 2REMA 1A8YA 1K0OA 4L8EA 3TJFA 1HD2A 3HZ8A 2VIMA 1WWJA 3NIVA 3H79A 2L4CA 4GLTA 1R5PA 2CV4A 2R6KA 2H71A 3ERFA 5JWOB 5D73A 4JZQA 1U88A 1XCCA 1J9BA 3FZ5A 3HVXA 5GAPD 1YZXA 3L4NA 3KM6A 1U3AA 2L5OA 2GT5A 4ZIJA 1SL1B 3KP9A 1SKSB 5DCGA 5B6MA 4WF4A 5HR3A 3L9UA 2MMAA 4Z7XA 5ECRB 2DLXA 3DMLA 2C3QA 5CRHA 5D9VA 1BJXA 2R4VA 2FLSA 3I6AA 4EDZA 2IMFA 4MZWA 2H6ZA 3GV1A 4L5OA 4MJBA 3WGEA 2JZSA 3IOSA 4N0VA 4CW9A 2LSTA 2RIIA 16GSA 4K6XA 2H6XA 3HDCA 2P31A 2N5FA 4HQZA 2V41A 1JHBA 2VUPA 4F0CA 2FUG2 5DQYA 2HLSA 1HNAA 3HYPA 4ZBBA 1V2AA 4ECCA 4IKHA 4ZXGA 4KE3A 1SK0A 3ZLPA 4NV2A 3GHAA 1ERTA 1TKDB 2QGVA 1K0BA 1SYXA 1Z7RA 4N11A 3KJYA 3Q19A 4K7OA 3TKSA 3H4KA 5E59A 8GSSA 2OBIA 3LWAA 4XRAA 3FR6A 1ZGNA 2PERA 4MH2A 2PN8A 1T4ZA 4PURA 2EC4A 5HFGA 4XS4B 2FWGA 3F3QA 5A4UA 3ME8A 2GZZA 4OFMA 1XOAA 2IFQA 2LV3A 2DIYA 3CRTA 5IMZA 4K9ZA 2HI7A 2AUVA 1G7OA 3O76A 5AIXA 4MPGA 1EV9A 1SENA 1TU7A 4OMVA 1XWCA 1OC9B 2A2RA 4V2MA 2FCHA 1DUGA 1MD4A 2PPTA 4XRDA 1GSDA 5G31A 4GSSA 1A8LA 1SK1A 3GSTA 1FB6A 1U6TA 1AAZA 1FO5A 3P7XA 4POBA 2YOIA 1YF1A 4LL4B 4BL7A 2HFDA 3DIEA 1XVWA 5FT3A 1A0FA 2DJ3A 3JCML 1K0DA 4LMVA 1GSQA 1WOUA 3GKXA 4LLRA 3EE2A 4PGTA 4BWSA 2R2JA 4CDOA 1TK0B 1M9BA 4ECJA 3G7JA 1VF2A 3QAWA 1YKCA 1PA3A 3P2AA 3DVWA 2IJYA 4MMMA 3FEUA 3GKKA 3UMAA 3N9JA 4GQCA 4XIHA 4TXVA 1ON4A 2E2MA 2F8FA 4JR6A 2FNOA 1GLQA 5KN3A 1EV4A 4POMA 1OVNA 4K0NA 2O85A 2F51A 1SL0B 3U5RE 4P3YB 2RUEA 4MZBA 4HJ2A 3I69A 1URMA 1F3AA 4TR0A 1GL8A 2KP1A 4MP4A 2JZTA 4KDXA 1HQOA 1IYIA 3LYPA 4V1Ap 2DJ0A 1FHEA 3HVVA 3DRNA 2DJJA 4IBPA 2V32A 2IWTA 2VL2A 3IAS2 2G2QA 2LKUA 1G6YA 6GSYA 3D0ZA 2VD0A 4F9ZA 1WRYA 1ABAA 4PQ1A 3TGZA 1TRUA 2VCTA 3EWLA 1LBKA 5J5NA 4MF5A 2DBCA 1T4YA 4K2DA 4ECIA 4EXJA 4K7NA 5ABRA 1SJIA 1T00A 3W8SA 2LJAA 1XW9A 4OO5A 2NDOA 4MK3A 3E3EA 1EOGA 2ZCTA 1IYHA 3TOTA 3GMFA 2H1BA 3EYTA 4TW5A 3L9VA 5DAKB 3P8WA 2HZFA 3ED3A 3FK8A 4NAXA 1YY7A 2DIZA 1FB0A 3LXZA 1WJKA 4IGJA 1EOHA 3BBYA 3L78A 4AF2A 1X5DA 2DJ1A 2OE3A 4Q5QA 2EIQA 3ZVJD 3IV4A 1T8EB 3KIJA 2QKEA 2RM6A 1K0MA 1KTEA 2H0HA 3MDKA 2I3YA 3QD9A 1O8WA 5DVBA 1TK8B 4GSNA 3EC3A 2VCXA 2H66A 4TXOB 2CAQA 2GQMA 3IC4A 1K3LA 3LEFA 3MSZA 4IW9A 2V2GA 2YJHA 5CREA 3SWLA 4F03A 1K3YA 2YJ7A 4EE0A 1O6JA 3GKNA 1F37A 1F3BA 4POKA 4BA7A 5EVOA 3VK9A 11GSA 1GRXA 1NSWA 2B5EA 3TKSC 4PX1A 1Z6NA 5GAND 1B4PA 3M0FA 3FR9A 1X0RA 2P5QA 5F8BA 3TRXA 1X9SB 3F9UA 2CAIA 4JRRA 2FA4A 5HFIA 3OR5A 3V1WA 3TCOA 2JSZA 3MNGA 2YWIA 3CMIA 4J57E 1GNEA 13GSA 3CTGA 19GSA 1GUHA 5J9BA 1K0CA 2E2GA 1UA5A 2YV7A 1XWAA 2I9HA 3IK9A 3TJJA 5IOXA 2VM1A 4KB3A 2B5XA 5COHA 1OKTA 3KD0A 1O85A 2VD1A 3TUEA 1OC3A 3S9FA 2X99A 1GULA 1GSUA 1TDIA 1KEBA 4YH2A 4ZBDA 4I8BA 2CVBA 2M46A 17GSA 3PR8A 2VM2A 2HSYA 2F9SA 4PUFC 5ECHB 1BEDA 2HZEA 1O8XA 3CBUA 4PNFA 4MCUA 1NW2A 5JWQB 3HD5A 5ELAA 3FKFA 4K8MA 2H75A 5DCHA 3PGTA 1M7TA 5CO3A 1HYUA 3R2QA 4X43A 1TK5B 4O7HA 3US3A 3P90A 1VF4A 2MBTA 1Z9HA 5CP1A 5F06A 3LFLA 2CZ3A 5INYA 4NWYA 1BQ7A 3D22A 4L5LA 3RBTA 2RLIA 3HVSA 4IJ3A 3D4MA 1T1VA 3TRPA 1MEKA 3PINA 1I9DA 3H1NA 1AQVA 4IP1A 3ZREA 3SBCA 5EL8A 5ECIB 3IAM2 3VWVA 4DEJA 4EL1A 2YWNA 1SD9A 4ZILA 3Q74A 1Y25A 4MDCA 2XPDA 1K0NA 3G7IA 2FY6A 2H0IA 2LNTA 1VF1A 3BCIA 5DJLA 1PN9A 4EVMA 3QMXA 1KNGA 3DXBA 4PQHA 1WP0A 2NPBA 3IXRA 2YPMA 3VFIA 6GSSA 2JSYA 3DYRA 5C04A 4HU7A 1MTCA 3QOUA 4TN8A 2CX3A 4BVYA 1G6WA 4G9HA 1ZYQB 2Z9SA 1QFNA 4DSSA 5J41A 2C4JA 2V6KA 1EGOA 4ML1A 2P0GA 4X0XA 4XS1A 5F07A 5DALA 2VLVA 1N2AA 1DBYA 1SK2A 4KX4A 1GUKA 2AAWA 5G1KA 3RPNA 3ZIJA 1XPVA 3GIXA 5A4WA 2XPEA 4GTUA 1GTUA 3GH6A 2GTUA 1NHYA 3D5JA 4TKYA 5AGYA 3APSA 4ILFA 5D9WA 5ECSA 5B7CA 3RAZA 4YQUA 4D73B 3RHBA 2P5RA 4WKWA 4JR4A 3GTUB 1YKAA 2YCDA 4OD7A 4POLA 1F9MA 3CXGA 1G7EA 3F63A 1QQ2A 5CRDA 5KN0A 2JU5A 3CTFA 1A24A 4FYCA 5J9CA 1MDKA 4GCIA 5IO2A 4HQSA 2BTOT 4TR1B 3L9SA 3FYGA 2ON7A 3ERWA 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chains in the Genus database with same CATH homology


 
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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