2O87A

S. aureus thioredoxin p31s mutant
Total Genus 27
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
27
sequence length
103
structure length
103
Chain Sequence
AIVKVTDADFDSKVESGVQLVDFWATWCGSCKMIAPVLEELAADYEGKADILKLDVDENPSTAAKYEVMSIPTLIVFKDGQPVDKVVGFQPKENLAEVLDKHL
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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publication title The conserved active site proline determines the reducing power of Staphylococcus aureus thioredoxin
pubmed doi rcsb
molecule tags Electron transport
source organism Staphylococcus aureus
molecule keywords Thioredoxin
total genus 27
structure length 103
sequence length 103
ec nomenclature
pdb deposition date 2006-12-12

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00085 Thioredoxin Thioredoxin
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.30.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich Glutaredoxin Glutaredoxin 2o87A00
3EURA 4ZB8A 4MZWA 2MBTA 5FT3A 3FK8A 3GN3A 3G9BA 1T4ZA 2LUSA 3HZ8A 6GSUA 1U3AA 2KOKA 2VAFA 3GUSA 10GSA 1GP1A 4JR4A 1B4PA 5IMAA 4F03A 4RI7A 2WZ9A 2YP6A 3TB2A 1ACVA 3ISOA 2O8VB 1ZL9A 2VLUA 2LRNA 4TR3A 2A2RA 1SKWB 3WGEA 2N5BA 2GT6A 3KEBA 4ULXA 3VWUA 4ZL9A 4WF4A 3CSJA 1B4QA 1PMTA 2B1KA 4V2NA 1LU4A 1BG5A 1TRUA 4JE1A 4XRAA 1GSUA 2K9FA 1M7TA 2VL2C 3VWWA 5ELGA 3W6GA 3TKSC 3IDVA 3LJRA 3RPPA 2QSIA 1TTZA 3MAKA 1PKZA 2LKUA 3N9JA 3KGKA 4MH3A 2JZTA 1DUGA 1E6BA 2LS5A 4K0GA 1FVJA 3ZREA 3C73A 3QFAC 1AUCA 2JSZA 3FZAA 2V41A 2OACA 5H5SA 3TKSE 2VO4A 3ZFLA 5H5RA 1XCCA 3TKQA 1OC9A 2AB6A 3FRCA 2IFQB 3KZQA 4L8EA 5ECLB 3D21A 1TOFA 3HJOA 2R3XA 1KEBA 5HFIA 4N30A 5ECOB 1HNAA 1DBYA 3SBCA 1GUKA 2NVLA 2OBIA 5GZZB 4TR0A 3ZL5A 2B7JA 4MJEA 1FB6A 2PN8A 3CBUA 4GRFA 4WEYA 3U5RE 3FY7A 1YF1A 2L6CA 2L4CA 1PA3A 3KH7A 3WYWA 1S3AA 2LRTA 1THXA 4NHWA 5F05A 4EVMA 2HSYA 3J7Yk 1ERTA 2OKAA 3IA1A 4O92A 3HZ4A 4BWSA 1HYUA 2TRXA 2VLTA 1TXXA 1JZOA 4MJCA 3FZ5A 5CRWA 1QFNA 2H71A 1GSEA 5IPGA 2DJ1A 3LXTA 5JWRB 3DGQA 4XTSA 4IGJA 1Y25A 1EV9A 2C4JA 2YV9A 1TKDB 4ZBAA 3VWXA 1VF4A 1ZYQB 4QL7A 1HD2A 1K3OA 2MZCA 2KP2A 2HFDA 2MMZA 4PQIA 1FAAA 2DJKA 5D9WA 2C0GA 4MPGA 1K0BA 3GTUA 4MF5A 5CAXA 4OMVA 19GSA 2VIMA 2GZYA 4MMMA 4EDYA 5KN3A 3W8SA 2LSTA 1M0UA 2JU5A 3GSSA 3WD6A 4HJMA 3LEFA 1XW9A 3P8WA 1O73A 1PX6A 2RUFA 1K3LA 4FYCA 4IKHA 4GSTA 3KJYA 1C72A 2PWJA 4YQUA 4MJBA 5IMDA 3IK7A 2R6KA 2RIIA 1F37A 2L6DA 1ST9A 1WOUA 3GURA 1OVNA 3DVXA 4JZQA 1MD3A 1XW6A 2RM5A 5D9VA 5JCUA 2CVDA 4WETA 2AJQB 2V2GA 3IR4A 1QGVA 3IBHA 1XWAA 4XRDA 3BCIA 5H5QA 2FWFA 4MF6A 3F6FA 1A2LA 4HQSA 3DD3A 2X8GA 2X8CA 2H66A 22GSA 2YOIA 1TU7A 1V58A 2H0IA 3TOTA 2B5XA 4G19A 4KDYA 3D0ZA 2RLIA 1X5CA 2B7KA 4Q5QA 8GSSA 3CXGA 3J7Yb 2FWEA 4AJ8A 2F9SA 4K1FA 4K6XA 4ECJA 6GSXA 5G2ZA 1U6TA 2VOCA 4BL7A 3HA9A 3EU3A 2R2JA 5D9TA 3UL3A 2YJHA 2VCWA 5F06A 1E2YA 2OE0A 1EEMA 2H6YA 3GKNA 4I6XA 3CSHA 4O32A 2HRNA 5DVBA 2GS3A 3KP9A 2HNLA 3F4SA 4EL1A 2C3NA 5G31A 4HDEA 2PUKC 2K8SA 3V1WA 2P31A 2HRFA 2MMNA 2IWTA 4V1Ap 5D93A 4NAXA 4IQ1A 1I9DA 1YKCA 3VPQA 1J08A 4EUYA 1XWCA 3EU4A 1A2JA 1SYRA 1FHEA 1F6MC 2DIZA 4OCFA 5LNKe 1HNBA 4IBPA 3M1GA 4GQCA 2XPEA 5ECMB 5B6NA 1Z9HA 1GTBA 1ZGNA 3TRPA 2P0GA 3VI5A 4KCEA 1K0MA 1S3CA 1Q98A 1OC3A 3EINA 4JBBA 5AN1A 4ZBDA 5G5FA 2H73A 5GSSA 3CRTA 4POBA 12GSA 4KSMA 4TXOA 3QR6A 3O6TA 3D4MA 4Q5RA 4AJ7A 4MA9A 2C0DA 4O5RA 2F3MA 1GLQA 4K9ZA 1SYXA 4NHZA 5E4WA 1K0OA 5DBQA 3US3A 3KD0A 2VCQA 3EMPA 2DSAA 1EEJA 1UVZA 3M3MA 5CREA 4K8MA 1K0DA 4OCEA 3APOA 16GSA 2L57A 4BA7A 3MSZA 2H76A 3GNJA 2H1AA 1G7OA 1PKWA 2VM1A 2H75A 4ACSA 4ID0A 3ME8A 4BPYA 4N11A 4ILFA 1YF0A 1N2AA 2GQKA 5CRHA 3RPNA 1TK8B 3GHAA 2E2MA 3U6VA 2B5EA 1TRVA 4LA1A 1XXUA 5IIZA 3EWLA 2L4QA 2HE3A 4DVCA 3IPZA 5ECSA 1GSFA 2QGVA 3H93A 1O8WA 2XBQA 2CZ2A 2DMLA 3ZMKA 1ML6A 2A2SA 1PRXA 1BYEA 4MJAA 3QDNA 1DE1A 3DRNA 1SL2B 4OO4A 5J41A 4XHMA 2M72A 2YWIA 2WRTA 1JZDA 3QMXA 5C00A 6GSYA 5ENUA 2TRCP 2X99A 4MP4A 4KDXA 2VCVA 2MMAA 1RK4A 4MF7A 4ML6A 2HLSA 1QQ2A 2B3SA 2OE1A 2P5QA 2E2GA 4TOPA 4YAVA 3GX0A 2LTKA 3EMXA 1G0TA 3KM6A 4GQFA 4IJIA 4IN0A 3IK9A 5DCGA 3TRXA 1Q4JA 4HEA2 1M9AA 1ON4A 3KMNA 2O85A 3GIXA 4ZILA 1OE7A 2IL3A 3QAWA 3NZNA 4NV5A 2JSYA 4NMUA 4EKZA 1FW1A 4ISDA 3GKMA 3ZTLA 3R2QA 1JLWA 3HDCA 4IQAA 3N5OA 2L5LA 4QQ7A 1XZOA 5GAPD 2EIRA 1X9SB 4PUFC 1Y6EA 1M9BA 5D9XA 4WBRD 4TN8A 1WIKA 1V9WA 1TRWA 5C04A 5IM9A 4FH8A 4ECBA 3I6AA 5HR2A 2H01A 2VCZA 5ID2A 1AQVA 6GSVA 2C3QA 4H86A 2FUG2 2LEGA 1RW1A 3LQ7A 5E59A 4CHSA 2G0FA 1YQ1A 2N5FA 2YZUA 3BOAA 3HYPA 1URMA 4NPBA 1OAZA 2ALBA 4RI6A 1EP8A 3TOUA 4PURA 5A5KA 3UOMA 2HI7A 2H74A 3M0FA 2GT5A 3RHCA 2JADA 1VRSD 3DMLA 4X1UA 3NOFA 2G2QA 3QAVA 4EF0A 4WXTA 4L0UA 5EPFA 4DSRA 2IMKA 3LFLA 4PQ1A 3ERGA 2GQMA 2PGTA 5COHA 3F9UA 4F9ZA 3D6IA 2FY6A 3VURA 3F3QA 2OA7A 2H1DA 1SKSB 1GUHA 3TKPA 3HD5A 2GTUA 1SKRB 1KNGA 4J56E 1GTUA 2J9HA 1W4VA 2L5OA 3IC4A 1YY7A 3P90A 4D73A 2H70A 1GTIA 3VFIA 2HZEA 1WE0A 3MDKA 5DAKB 2IMFA 2VCTA 4O7HA 3VK9A 1X0RA 2O7KA 1J9BA 4HOJA 3ZFBA 1Z3EA 3PINA 2J23A 2IN3A 5DALA 1YZXA 1JZWA 1KTEA 4GSSA 1XPVA 4WR5A 1BX9A 2I9HA 1Z6NA 1QUWA 1O85A 3HXSA 5CNWA 1EP7A 4ZB9A 1KBNA 3E3EA 2C3TA 1ZCPA 3M9JA 4J57E 5L71A 2O87A 1WP0A 4DSSA 4K7OA 1YEPA 3M8NA 1H4OA 4ECIA 1U88A 1O8XA 5ECNB 2V1MA 4GLTA 3UBLA 3UMAA 3IAM2 5ECIB 1Z7PA 4KE3A 3FR9A 4YH2A 2F8AA 3IRAA 2PPTA 3GMFA 4PGTA 1O7UA 2EIQA 1EZKA 5DJMA 1A23A 3DVWA 3WT1A 2NDOA 3FZ9A 2DLXA 2GZZA 2XPDA 4G2EA 4WBJA 3F4TA 5DDLA 4KNDA 4I8BA 4ZIJA 3H79A 1FOVA 1THOA 3LORA 1SJZA 3GH6A 5AIXA 2CX4A 4YQMA 4N0VA 1JZRA 4KX4A 4E8EA 6GSWA 5KN2A 1G6WA 1R7HA 5IOWA 3GRXA 3I9V2 1AC1A 1GULA 1TW9A 3HY2A 3IHQA 1WJKA 2YWMA 1TJDA 4I5QA 4L5LA 1GSDA 2PBJA 1F2EA 5EY6A 2H0HA 3CRUA 1YDKA 2IJYA 3HHVA 2GVPA 1N8JA 1I5GA 1XWBA 3F3RA 4F0BA 1IYHA 1V2AA 2N5AA 2CA8A 2C8UA 3O3TA 3TCOA 3WGDA 1A24A 3C71A 5IO0A 2D2ZA 5DQYA 2VD1A 1SENA 1SJIA 5IMCA 3GH9A 4HQZA 1EGOA 2CAIA 2GDRA 1ZMAA 4TR1A 3GA4A 3HJMA 4OO5A 5B8AA 5A4UA 3AY8A 5A4VA 1GWCA 3PGTA 5G1KA 1B48A 1USBA 17GSA 2FWHA 1TK5B 1GSSA 2IIYA 2PVOC 2ES7A 3GKKA 2FA4A 1GSYA 2CVBA 4P3YB 2O89A 1MDJA 3C7MA 4IHUA 2KUCA 3DWVA 1M2BA 4XIHA 4GCIA 3Q18A 3KXOA 1H75A 2JACA 3JCML 1YEXA 1AW9A 4HZ2A 7GSSA 2IFQA 1WWJA 5KEJA 4KH7A 2FCHA 3VI7A 11GSA 1F3BA 5HFKA 1AXDA 3I69A 5IMZA 4WR4A 4EDZA 5ECKB 2BMXA 2R4VA 4OWYA 4CW9A 1WRYA 3Q6OA 2LJAA 4F82A 2DIYA 1EWXA 1PN9A 1OC9B 3C8EA 5GSTA 1MEKA 2V6KA 5DJLA 2GSQA 1ABAA 3ED3A 2REMA 2R37A 4BWQA 5IQYA 2I3YA 5DQSA 2YNXA 3IE3A 5INYA 3FYGA 4V2LA 1NSWA 4KB3A 1JFUA 2LJRA 1DE2A 2TIRA 1ZYEA 2H72A 3RDWA 4QL9A 4K7IA 1MDIA 2B6MA 2DJ2A 3KTBA 2ZUPA 5G5EA 2FNOA 3L0HA 4MZBA 2NTOA 1F9MA 3QD9A 2LV3A 1X9MB 2HXKA 5F0GA 4PXOA 4D73B 5J5NA 4EO3A 3F63A 2KP1A 5ABRA 4AF2A 4OFNA 2HZEB 4I97A 1PGTA 1R5AA 2B1LA 3IOSA 3FEUA 1TI1A 1EV4A 1NW2A 3BJ5A 1ERVA 3H4KA 4MK3A 4XS4A 5J4UA 5DALB 2H30A 4Z7XA 1S3DA 3P2AA 1XBSA 5B7CA 3TJJA 3GTUB 4ZL8A 4EE0A 18GSA 2PMTA 1QMVA 3DYRA 1ERUA 4ML1A 5KN0A 3MWHA 4ZBBA 5ECPB 1XVQA 4DSSB 1VGLA 1T8EB 4JR6A 4POMA 3CSIA 3FR3A 1A8LA 2NBSA 5HR0A 1G6YA 1NHOA 3Q19A 2CX3A 4TKYA 4KGIA 4JU5A 2VCXA 1YJ6A 1GRXA 3CMIA 2DJ0A 1OKTA 3QAGA 2FWGA 1LJRA 4ZL7A 2ZCTA 3EC3A 2A4VA 3UJ1A 3RAZA 2XHFA 1M2DA 2NPBA 3LXZA 4PNGA 2VL3A 5FHIA 1U87A 1A2MA 3KP8A 3UEMA 4KCAA 4IW9A 1R5PA 3GV1A 3A2XA 2R5GA 4POKA 4BVXA 1RQMA 5LD0A 4PNFA 2V6OA 3IV4A 4EC0A 3KTLA 4GF0A 3L9VA 3EVIA 6GSTA 2MYGA 1WPIA 2PVQA 3QCPA 4FYUA 3E9JB 3I43A 2LNTA 3HVXA 2DJ3A 3LG6A 2H8LA 5AISA 3LYPA 2LQQA 4X0XA 1TI3A 1VF3A 2I4AA 3GKXA 2HYXA 3D22A 4KW6A 4GWRA 3HVSA 3FKFA 2WULA 3TUEA 2WJUA 2YCDA 3S9FA 3GSTA 3ME7A 4GXZA 2VL9A 3QFBC 3D5JA 5G30A 3KMOA 1T3BA 2VLVA 1GLPA 4MH2A 4MPFA 3H1NA 3G7IA 3F4RA 3A2WA 4PUAA 5D96A 2IPAA 9GSSA 3IAS2 4WF5A 3TJGA 4TR1B 3MNGA 5IOXA 2EC4A 2ZNMA 1TRSA 5D73A 3QOUA 4V2MA 1BQ7A 4NXIA 2LQOA 1XOBA 1K3YA 4L0WA 3TKRA 4KA0A 3QPMA 2YN1A 5D8IA 1V98A 3GL5A 3WT2A 2PERA 2H6XA 2C80A 4XS1A 4XS6A 3LYKA 4RQXA 3ZITA 1A8YA 2H1BA 2K18A 5CRDA 2PU9C 2VUPA 1TDIA 2QKEA 2X8HA 3H8QA 5HQPA 1CQGA 1SJ6A 4IS0A 5IMVA 1SD8A 3W8JA 4TR4A 1MTCA 3UVTA 2AUVA 2IMDA 1XIYA 4FO5A 3VLNA 1FB0A 1PL2A 5HR3A 5B6MA 5AIVA 4HS1A 5CYYA 1U3IA 1XW5A 1T4YA 3BCKA 4LL4B 4BVYA 2FLSA 2AHEA 2GSTA 2MBSA 1XOAA 1GSQA 2CVKA 2GGTA 1A0FA 1XVWA 2LNSA 1R4WA 4WKWA 4TXOB 1X5DA 3A3TA 1OKDA 3WGXA 1VF1A 4IP1A 4N0ZA 2XBIA 4YAPA 3ZVJA 4ZXGA 5GAND 3KH9A 4OFMA 1SL0B 3UIWA 2K6VA 2H1GA 5EVOA 3F8UA 5HFGA 3HVVA 1R26A 3DKSA 1OYJA 3ZLPA 4KSOA 2YWNA 1OC8A 3UAPA 1PL1A 1TU8A 1FG4A 4GTUA 1Z7RA 3ERFA 4K7NA 5B8BA 4JEDA 1ERWA 3C1SA 3D4TA 1UN2A 4Q5NA 4X43A 1AIUA 4I2UA 4MLYA 5LCZA 1T00A 1K0NA 1EGRA 2V32A 1TK0B 3GL3A 4K0NA 1EOHA 4KUNA 1VF2A 5ECHB 2FHEA 1OE8A 3G7JA 5ECRB 4E8HA 1PD21 4CDOA 2WDUA 1X5EA 2HZFA 4TRXA 3EE2A 4XS4B 1HQOA 4NV2A 3GYKA 4ECCA 3SWLA 1ZOFA 2JZRA 3ZIJA 2JZSA 2WFCA 1O81A 4RQRA 1J0FA 1PSQA 3TGZA 1O6JA 2VM2A 5JCGA 2YPMA 2E0QA 1MD4A 4HUAA 4IJ3A 14GSA 1Z5YE 3O76A 5JCWA 3VWVA 3UVHA 2FA8A 3L78A 2C1YA 3UBKA 3IXRA 4HZ4A 1F3AA 3Q74A 2I1UA 2WS2A 4IP6A 3UARA 2DBCA 4I2TA 5EL8A 1B8XA 3APSA 1IYIA 3APQA 4DEJA 4AJ6A 2H6ZA 1SL1B 5ECQB 1T7PB 3GFKA 2OBKA 4JRRA 4MABA 1GL8A 3L9UA 3TJFA 1WMJA 3LWAA 4YQVA 1AAZA 4PQHA 1SU9A 4DSQA 3NIVA 5F07A 2I81A 4IVFA 2XC2A 2IMEA 1V57A 1QXHA 1NM3A 5IPHA 5A4WA 1UC7A 1LBKA 3HJPA 4FIWA 5HR1A 2YZHA 1BEDA 4KAEA 4IELA 2GSSA 1T1VA 4AGSA 2BJXA 4XCSA 1XFLA 4G10A 2AAWA 2C0EA 2F51A 2ON5A 3RBTA 2CZ3A 5CP1A 3A2VA 3FR6A 2KHPA 2WGRA 1SD9A 3ZZXA 20GSA 1EOGA 2FD3A 1Z6MA 5IO2A 1GTAA 3L4NA 3RHBA 4LMWA 5FWGA 1ILOA 3TRQA 3CYNA 4MCUA 2DJJA 2CV4A 1QK8A 3ZMLA 5ID2B 4ZB6A 1XWGA 2ON7A 3VPTA 2WB9A 2GQLA 2H19A 4Q5FA 1FO5A 5J3RA 5DCHA 4LLRA 3L9SA 4G9HA 2DC5A 2VD0A 4PX1A 5AGYA 3G7YA 3DEXA 1ZZYA 3BD2A 4MDCA 1B9XC 1DSBA 2FGXA 2MMOA 1XWKA 3F6DA 4GSNA 3CTFA 4OFTA 2YV7A 1M99A 3HCZA 2OJLA 13GSA 4TXVA 3FZ4A 3K8NA 2GZPA 2E7PA 2AV4A 3ZVJD 5ELAA 3DXBA 5CRGA 4J2FA 1AQXA 2F8FA 4HJ2A 3EYTA 4TW5A 4N10A 4LL1B 1NHYA 4MZCA 4F2IA 1K0AA 2VL2A 3TKSA 1A0RP 2X64A 6GSSA 1UA5A 3LGCA 5DAKA 1AQWA 2GSRA 4HU9A 1PQNA 2RUEA 3KCMA 2LRCA 1JLVA 1GNEA 5IMFA 3BBYA 3A5WA 5CO3A 1B9YC 1CQHA 1PX7A 1FVKA 3LSZA 3F0IA 1GNWA 1M2AA 1GUMA 4FYBA 4POLA 2LJKA 3PR8A 2HT9A 4K2DA 1HNCA 1SK1A 3DIEA 5J9BA 2EIOA 2YWOA 4RUVA 2YANA 3KIJA 2WCIA 2QC7A 2KLXA 3FW2A 2M80A 3ZYWA 2JL4A 1TP9A 3ZRDA 3PH9A 4L5OA 2CT6A 4KDUA 1SK0A 2Z9SA 3TJKA 5G1LA 5F8BA 3GX8A 2H0GA 1SK2A 1YKAA 1X9WB 4TVEA 1K0CA 2AYTA 2DMMA 2OADA 2CAQA 2IMIA 1BJXA 5JWQB 3TDGA 4F0CA 3M9KA 1G7EA 3E0UA 2BTOT 4OD7A 5J9CA 1V40A 3CTGA 4EXJA 2HSHA 2K8VA 3HKRA 1GH2A 2C0FA 4NWYA 2YJ7A 3OR5A 3C1RA 1W89A 2B5YA 2P5RA 5JWOB 4HI7A 4V1Ag 1BAYA 2GLRA 1JHBA 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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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