1XW9A

Drosophila thioredoxin, oxidized, p21
Total Genus 36
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
36
sequence length
106
structure length
106
Chain Sequence
MVYQVKDKADLDGQLTKASGKLVVLDFFATWCGPCKMISPKLVELSTQFADNVVVLKVDVDECEDIAMEYNISSMPTFVFLKNGVKVEEFAGANAKRLEDVIKANI
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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molecule keywords thioredoxin
publication title Comparative structural analysis of oxidized and reduced thioredoxin from Drosophila melanogaster
pubmed doi rcsb
source organism Drosophila melanogaster
molecule tags Electron transport
total genus 36
structure length 106
sequence length 106
chains with identical sequence B, C, D
ec nomenclature
pdb deposition date 2004-10-29

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00085 Thioredoxin Thioredoxin
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.30.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich Glutaredoxin Glutaredoxin 1xw9A00
2H75A 3PGTA 4F03A 4O32A 4GTUA 4KA0A 3LSZA 3QAWA 9GSSA 12GSA 3DEXA 4KCEA 3ZIVA 3CRTA 3ZREA 5IQYA 5ABRA 3CMIA 1DUGA 3ED3A 3SWLA 2DC5A 2I1UA 3P2AA 1PX7A 2H71A 1OE8A 3TGZA 4ML6A 3KXOA 4F82A 3R2QA 3HYPA 2KOKA 4IBPA 4ECJA 4XS4B 2IIYA 1WE0A 1J08A 4OCFA 2B3SA 3SBCA 3FW2A 2H01A 3MNGA 1IYIA 2GQLA 1XXUA 3DIEA 3IE3A 5J9CA 1XW6A 4KB3A 5IMVA 1XW5A 1CQHA 4MMMA 2NTOA 4IGJA 5IO0A 3GL3A 1GRXA 4L5LA 3EMXA 2F8AA 3ME8A 17GSA 4PX1A 1B9YC 1MD3A 5DJMA 2IPAA 3TOTA 5EY6A 1S3CA 3VPTA 1TI1A 2VCXA 1VF3A 2H73A 2OJLA 1PRXA 4MA9A 1OE7A 4JBBA 3FZ4A 1G0TA 1R7HA 2P5RA 3ZTLA 2FLSA 3GTUA 1NHYA 1SD8A 5DQSA 1U3IA 3IHQA 1TRVA 1EOHA 2GGTA 2ZUPA 4D73B 2RM6A 1Z5YE 2YJHA 5ID2A 2NPBA 4E8HA 4ECBA 3GKNA 4MJCA 4MZWA 4EO3A 4KAEA 2I81A 2DBCA 1KTEA 4JE1A 1A2LA 2VCZA 3KMNA 2OKAA 4KDYA 3EYTA 5ECSA 1PL2A 4PXOA 3MAKA 2NBSA 3VWXA 1TU7A 1MEKA 1OVNA 5DCHA 4GLTA 4OWYA 4MPGA 2N5AA 3DXBA 4NPBA 4YQMA 2YWMA 3HD5A 1TRSA 2X8HA 3GURA 3GX0A 3TRQA 5IMAA 5CO3A 1YKCA 2OE3A 4HEA2 4WKWA 5D93A 4N30A 4XTSA 2RUFA 5G30A 3TUEA 3M3MA 3IK7A 5DDLA 4TR1A 1OAZA 5DVBA 5KEJA 2YWNA 2XPEA 4V1Ag 3MDKA 1AIUA 2HT9A 2IMKA 4EXJA 4KW6A 2H6XA 2HRNA 4ZXGA 1R4WA 3KJYA 1T7PB 1FW1A 1SKRB 1GSEA 2YOIA 3D22A 2E2MA 2CVBA 4G19A 1G6YA 1SL2B 3NZNA 14GSA 1RQMA 4LL4B 3CBUA 1O73A 2C0FA 2JU5A 1EEMA 2CVKA 2GVPA 2HSYA 5CNWA 3RHBA 1A24A 2LSTA 2H0GA 1Y25A 4IW9A 1XFLA 2LJRA 2O8VB 2LQQA 1KNGA 1XW9A 2HI7A 2C0DA 5HFGA 3IA1A 5KN1A 1EGOA 1R5PA 2XBQA 4FYBA 4POMA 4L0WA 4OO4A 1ERUA 4I2UA 3ZFBA 1VGLA 3IBHA 4I2TA 3TRXA 5LD0A 1R26A 3P7XA 4QL7A 1YJ6A 2RIIA 3VWUA 1M0UA 5A4VA 3C8EA 5AGYA 2HZEA 2O7KA 3UBLA 2VOCA 1EV4A 2C3TA 2FY6A 3ME7A 1GLQA 2KLXA 1YZXA 2FUG2 4LL1B 3H1NA 3QAVA 4ZL7A 2MYGA 1YDKA 3HJMA 4NAXA 2L4QA 3KH9A 1T4ZA 2OACA 3Q19A 1THOA 3QCPA 5KN2A 5J41A 3M1GA 1Y6EA 3M9JA 5G1LA 4KNDA 2I9HA 1HD2A 2HYXA 1PN9A 1FHEA 4K0GA 3FRCA 16GSA 2DJ2A 1K0DA 4OO5A 1G7EA 2OBKA 2M46A 4LMVA 4J2FA 5GSTA 2CX4A 3HHVA 4DVCA 1V98A 2Z9SA 6GSVA 2MMOA 2E0QA 1TU8A 4RUVA 4WBJA 2DJ1A 4TXOB 1DE1A 1ZZYA 4Q5FA 2LNTA 4IVFA 3DD3A 1YEPA 1O8WA 1XVWA 4KH7A 3L78A 1PA3A 5F0GA 2L57A 1HNCA 2O85A 4K9ZA 3HA9A 2C8UA 2XC2A 2H0IA 4J57E 1FB0A 3M9KA 1TW9A 1GNWA 5CRDA 3EU4A 5D8IA 2VL3A 1MDIA 2KP2A 4MJEA 4K8MA 3BCKA 4HI7A 2L59A 1XWGA 2B5YA 2PN8A 2WB9A 4V2LA 4XRAA 3W8JA 5DALA 2PMTA 1BYEA 3FR3A 1PX6A 1GSQA 3UARA 19GSA 1ABAA 3US3A 2PBJA 5ECMB 3ZVJD 1ZYQB 4MF5A 4GRFA 1XOBA 3F4RA 4IELA 3G9BA 5A5KA 3L9SA 1GWCA 4POBA 1G7OA 4BWSA 1DSBA 3GHAA 3TKSE 3L9VA 4BVXA 2PGTA 2LRTA 2G2QA 3CSIA 5FT3A 22GSA 5IOWA 5B6NA 3VPQA 5HR0A 5CRWA 3LJRA 3GH6A 4JU5A 3GTUB 2C0GA 1R5AA 1V40A 2L6CA 4ULXA 1XCCA 3EURA 4Q5NA 3L0HA 2F51A 2PVQA 1BEDA 3GIXA 3LXTA 1IYHA 4OCEA 4AJ6A 3I6AA 5IPHA 2VM2A 5ID2B 2O87A 5GAPD 2ZCTA 1SJ6A 4ACSA 4IP1A 2VLTA 1NSWA 20GSA 4GQFA 3ZL5A 3TKSA 1OC8A 4I97A 1M7TA 2B1LA 1U87A 1TDIA 2H1AA 3C1SA 1HYUA 5CAXA 1TKDB 1PKZA 4HS1A 1ZCPA 4P3YB 2L5OA 4CHSA 3QFBC 5GSSA 2MBTA 3GL5A 5ELGA 5HFIA 4TR1B 1GH2A 1OC9A 3G7YA 3LQ7A 3E9JB 2IN3A 2C1YA 2YN1A 3IK9A 4I5QA 5H5SA 2G0FA 2FA8A 3D21A 3A3TA 2P31A 4LMWA 5JWQB 4F0BA 5COHA 2K18A 2CT6A 1J9BA 1UC7A 3UVTA 3EVIA 1X5DA 1B48A 4L5OA 1HQOA 3WT2A 4EDZA 3UJ1A 1I9DA 5DAKA 3TDGA 3F9UA 2FWEA 3KP8A 3C7MA 5AN1A 2GLRA 1RK4A 1NM3A 1AW9A 5IMCA 4L0UA 3ZLPA 1K3YA 2V6KA 1GTBA 3LEFA 2QC7A 5E59A 1ZOFA 1M99A 2AJQB 4N10A 1SU9A 3IDVA 3HCZA 3GNJA 3EINA 5JCUA 1FOVA 4MDCA 1GSDA 4I6XA 2JSZA 2LNSA 3LFLA 5KN0A 1B9XC 2LKUA 2L6DA 3E3EA 3J7Yk 2WDUA 4HZ4A 1JZWA 2FA4A 2X64A 2RLIA 3UAPA 4IJ3A 2R37A 3FZ5A 4FIWA 4JRRA 2HZEB 3TJJA 1QK8A 4ZB6A 5G5EA 1SYXA 3APOA 1YEXA 2DJKA 3A2VA 1AAZA 5L71A 3KCMA 3CSJA 5C04A 4EDYA 8GSSA 1ZYEA 5GAND 3C71A 5JWRB 2K8VA 2YCDA 1EZKA 1MDJA 1EGRA 1B4PA 5IOXA 2GSTA 3VURA 4OD7A 2QGVA 3VI5A 2JL4A 5B8BA 1TI3A 1FO5A 2D2ZA 2LTKA 1M9BA 3ZVJA 2B7KA 1MDKA 2K9FA 5H5QA 1T3BA 2H30A 4K2DA 1XVQA 2PWJA 4BA7A 3KM6A 2V32A 2KHPA 2H1BA 1K0OA 1G6WA 2HSHA 2H76A 1PD21 4TN8A 2CAQA 4NWYA 1XWCA 2CV4A 2TIRA 1XWAA 2LUSA 4XRDA 5A4UA 2VO4A 2VD1A 3DGQA 3KZQA 3GKKA 4Q5RA 2MBSA 1FVJA 1SKWB 2WGRA 2FD3A 3KTBA 2DIZA 3RDWA 5ECQB 4HU7A 1ZL9A 1TK0B 4AF2A 4ZIJA 2L5LA 1VRSD 4AJ7A 2DJJA 1BJXA 1QUWA 3M0FA 3M8NA 2YP6A 1KEBA 4OFMA 2GT5A 3DVXA 5DALB 3FR6A 2GDRA 4HDEA 4H86A 3A2WA 2H19A 4PGTA 13GSA 3GX8A 4NV5A 2ALBA 1HNBA 2GQKA 4TR4A 2LRNA 1ERTA 4QQ7A 4HU9A 3A2XA 1TRWA 2N5BA 3F3QA 4LLRA 2YJ7A 4WF4A 1MD4A 1HNAA 4ISDA 2J9HA 4KE3A 5ENUA 4YAPA 3QD9A 2GQMA 3K8NA 4RI6A 4KGIA 3KEBA 4G10A 1WJKA 1WWJA 4GWRA 2BMXA 3ZYWA 2OADA 3LORA 2WJUA 5ECPB 4MF6A 4F2IA 2LEGA 1J0FA 4EVMA 3TOUA 5INYA 1OC3A 1N2AA 1SD9A 3GMFA 4FYUA 4DSRA 1X9WB 3WGEA 1SENA 3WGXA 1YY7A 1A2MA 4WXTA 1BAYA 2E2GA 1A8YA 3N5OA 5CREA 4G2EA 2H1DA 4ZBDA 5GZZB 3RPNA 3O3TA 2AV4A 4GCIA 4DSSA 4HJ2A 1JHBA 5IMDA 2DLXA 1SK0A 1ERVA 1TOFA 1GTAA 4JR6A 2B5EA 4KUNA 4XHMA 3TB2A 1LU4A 2EIRA 5JCWA 1XZOA 3PH9A 1AUCA 1ST9A 2M80A 1DBYA 1UA5A 4GQCA 4ILFA 4MP4A 1GTIA 1PL1A 3CYNA 3GN3A 3IAM2 4L8EA 1EP8A 4WR5A 5DQYA 5B8AA 3GH9A 1X9MB 3Q74A 3O6TA 4BL7A 3MSZA 5D9TA 4PQIA 4TR0A 3CTFA 1GUKA 4IHUA 2CX3A 4N0ZA 4PQ1A 2PVOC 1OC9B 3WGDA 2KP1A 2VLVA 1K0NA 3F63A 5ECKB 3QDNA 1JZOA 1Z7RA 2X8GA 2GZYA 1S3DA 1F9MA 1AXDA 5ECHB 1B8XA 1NW2A 1SKSB 2VCVA 4N0VA 1GSYA 3BCIA 2AUVA 1M2BA 2K8SA 2YWOA 1Z9HA 3LWAA 6GSSA 5CRGA 1USBA 5DAKB 1LBKA 3DVWA 2DIYA 1EWXA 4K7IA 4HOJA 2IMIA 1TP9A 1AQVA 3KH7A 1PMTA 4V1Ap 1YF0A 2NVLA 3LYPA 3HKRA 2B6MA 4MH2A 3IPZA 5J9BA 2JADA 3Q6OA 4K7OA 1VF2A 1YKAA 2MMNA 3QAGA 2H74A 2R4VA 3Q18A 4EE0A 2HXKA 1RW1A 3TJGA 2OE1A 3VLNA 3FYGA 2CVDA 2MMAA 3IRAA 3TKQA 4EKZA 1F2EA 3KTLA 2WULA 1EEJA 2IL3A 1PKWA 2HE3A 3HXSA 2X99A 3H4KA 4K7NA 2ZNMA 1O85A 2XPDA 2R2JA 4WETA 3TJFA 2V1MA 5LCZA 2FNOA 2WS2A 4V2NA 2RUEA 1GUMA 3QOUA 2A2SA 2VLUA 1N8JA 4DEJA 2WZ9A 3NIVA 3HJOA 4POLA 2GS3A 2VCTA 2ON7A 2IFQA 3HY2A 4LA1A 1GL8A 18GSA 1SYRA 1O8XA 4MZBA 3KMOA 3IOSA 4V2MA 4MPFA 3F6FA 1OKDA 3DYRA 2CA8A 2VM1A 3NOFA 3FKFA 4IS0A 5ECOB 3LXZA 4KDUA 5D9WA 3D0ZA 2MZCA 4WEYA 2EIQA 1SL1B 4BVYA 4NMUA 2OA7A 3GV1A 3PR8A 6GSTA 4MJBA 3BOAA 3FEUA 4GF0A 4IN0A 1BX9A 3H79A 4X43A 4GSSA 3P90A 1O81A 2R5GA 2FHEA 4WBRD 2FWHA 3UMAA 1Q4JA 3CXGA 3UEMA 4KCAA 4PURA 1GP1A 3U6VA 1EOGA 1V2AA 4KSOA 3FY7A 1V9WA 4JZQA 2VL2A 4X0XA 3F4SA 4FH8A 1XPVA 4ZBAA 2GSQA 1FG4A 3HZ4A 2B7JA 4IKHA 4QL9A 1XWBA 3JCML 1KBNA 4ZB8A 3S9FA 2QKEA 5IMZA 1BQ7A 5JCGA 3TCOA 3ISOA 3C1RA 2PPTA 5D9VA 4X1UA 1BG5A 5A4WA 2FGXA 1YF1A 2R6KA 2LV3A 3VFIA 3W8SA 1OYJA 6GSYA 4HQZA 1K0AA 5J4UA 1O7UA 3TKRA 3AY8A 3I69A 1TXXA 1QFNA 3LYKA 5HFKA 1Z6MA 5DCGA 3RBTA 1ML6A 3FK8A 3LG6A 5G5FA 1X5EA 3FHKA 4CDOA 2BJXA 1SJZA 3A5WA 4PUFC 1A0RP 5AIVA 2VD0A 2H72A 1U88A 3ERWA 4YQVA 3EWLA 2JSYA 4OMVA 3W6GA 4WF5A 1VF4A 5D9XA 3WT1A 4PUAA 1U3AA 4EL1A 5F06A 1WRYA 5J3RA 1XBSA 3BD2A 3OR5A 1SK1A 1FVKA 2P0GA 3TKPA 3P8WA 3ZFLA 2PU9C 6GSUA 1JZRA 1GULA 1V58A 5KN3A 5IPGA 1M2AA 3UVHA 3I9V2 4BPYA 4GSTA 3HZ8A 3APSA 4DSSB 3CTGA 1C72A 3IAS2 3GUSA 4EF0A 4MH3A 2VUPA 4MLYA 3APQA 5CYYA 2ON5A 1F3AA 2VL9A 3H8QA 3I43A 1JLWA 3TJKA 2H70A 3DKSA 5ECNB 5HR2A 4Q5QA 2H0HA 2B1KA 5HQPA 1MTCA 3DWVA 3QFAC 3U5RE 1JFUA 1T4YA 1LJRA 3EE2A 5IIZA 2F8FA 4NV2A 2RM5A 3HDCA 4HZ2A 5F05A 3RAZA 2TRCP 5H5RA 1Z7PA 4BWQA 4IP6A 4OFNA 2AB6A 4TXVA 3RPPA 2A4VA 1W89A 1X9SB 2PUKC 1AC1A 2JZSA 2DJ0A 3E0UA 1EV9A 2YANA 2DMMA 3L4NA 2CQ9A 3HVVA 1K0MA 3D5JA 1K0CA 5F8BA 1CQGA 5EPFA 3TRPA 5FWGA 2FWGA 3IV4A 3HVSA 1XIYA 5CP1A 1A2JA 2IWTA 2WFCA 4NHWA 5EVOA 2CZ2A 3H93A 4TRXA 1ILOA 1THXA 3EC3A 4EC0A 4K6XA 1FB6A 2IJYA 1DE2A 2E7PA 3GYKA 5F07A 2VIMA 1VF1A 3KGKA 1GSUA 5G2ZA 1WOUA 2IMEA 1PSQA 1TRUA 5ECLB 4Z7XA 1A0FA 4NXIA 3GSSA 3FR9A 1GSSA 1K3LA 1GUHA 4MABA 2H1GA 2CZ3A 2DMLA 2X8CA 4IQAA 4YQUA 4HJMA 2C80A 3L9UA 5DJLA 4O92A 1JZDA 4FO5A 1V57A 4KSMA 2V6OA 1T1VA 3ZITA 4XS1A 2JACA 2KUCA 4E8EA 1ON4A 1GSFA 4TR3A 3UOMA 1SL0B 2YZHA 2IFQB 4XCSA 11GSA 5DBQA 2AYTA 1SJIA 1O6JA 3D4TA 4GXZA 1TK8B 1T00A 4K0NA 4XS4A 2FWFA 2YV9A 5JWOB 3VI7A 3VWVA 4ECIA 4IJIA 3QMXA 2J23A 3HJPA 3F8UA 1WPIA 1ZMAA 3ERFA 3GKMA 3GSTA 1JLVA 3F0IA 5IO2A 4RQRA 3MWHA 5HR3A 3G7JA 2QSIA 3QPMA 4POKA 1QMVA 2XHFA 1QQ2A 1WMJA 4TW5A 2VCWA 3LGCA 4I8BA 1T8EB 2K6VA 2V41A 6GSWA 2GTUA 1E2YA 4ZB9A 1Z3EA 2WCIA 2LQOA 1FAAA 2GT6A 1M2DA 3D4MA 2BTOT 4O7HA 2YV7A 2HZFA 3ZMKA 7GSSA 4GSNA 4CW9A 2WRTA 4O5RA 3IR4A 5G31A 1TJDA 2HLSA 3FZAA 3QR6A 3TJBA 2C0EA 1ZGNA 2EIOA 2OBIA 4AJ8A 3UL3A 1PQNA 5AISA 3ZIJA 3GRXA 4D73A 1XWKA 1E6BA 4HQSA 5AIXA 3C73A 3KIJA 4ID0A 2TRXA 2NDOA 5E4WA 1K0BA 1YQ1A 2B5XA 4HUAA 4ZILA 1PGTA 3WD6A 2LJAA 3BJ5A 2IMDA 2LRCA 2H6YA 1F6MC 2DSAA 3ERGA 5CRHA 1B4QA 1URMA 3PINA 1SK2A 3N9JA 2GZZA 2HFDA 3ZZXA 1EP7A 3EU3A 4PNFA 2JZTA 4DSQA 1W4VA 3ZMLA 2AHEA 3IXRA 1NHOA 2H6ZA 1AQXA 5G1KA 2REMA 2V2GA 2YNXA 2GSSA 1S3AA 1TTZA 5D73A 5ECRB 1Q98A 1Z6NA 1QXHA 3GKXA 3FZ9A 4PQHA 5ELAA 3KD0A 5D96A 6GSXA 1M9AA 4ML1A 3WYWA 2H8LA 3EMPA 2M72A 3J7Yb 1GNEA 4YH2A 3UBKA 4YAVA 1I5GA 4KX4A 4G9HA 1QGVA 2I4AA 1WP0A 4MCUA 3V1WA 2ES7A 3UIWA 2O89A 4F9ZA 4RQXA 3DRNA 4EUYA 1OKTA 4ZBBA 4N11A 3CSHA 2N5FA 2LS5A 2CAIA 4MJAA 1H75A 1UN2A 4ECCA 2I3YA 3VWWA 4WR4A 2EC4A 2LJKA 5IM9A 4ZL8A 2XBIA 3GA4A 2HNLA 1F37A 4J56E 3GFKA 1UVZA 5LNKe 3TKSC 4TVEA 5FHIA 2L4CA 2YZUA 3O76A 3HVXA 2MMZA 5IMFA 1GLPA 2C4JA 4AGSA 4JR4A 1X5CA 4MK3A 4JEDA 2IMFA 4XS6A 2FCHA 3VK9A 4MZCA 2H66A 1GTUA 4F0CA 1A23A 2VL2C 3KP9A 1XOAA 4TOPA 3IC4A 2A2RA 3DMLA 5HR1A 4OFTA 2F9SA 4KDXA 2JZRA 2OE0A 2YWIA 3F4TA 2YPMA 5B7CA 2HRFA 4PNGA 2C3NA 3G7IA 2R3XA 3BBYA 4RI7A 1K3OA 3D6IA 1TK5B 1A8LA 4XIHA 1H4OA 1U6TA 2GZPA 4ZL9A 4K1FA 5EL8A 2AAWA 4NHZA 1F3BA 2P5QA 3ZRDA 4MF7A 5B6MA 2DJ3A 3F6DA 1X0RA 5J5NA 2F3MA 2PERA 1ACVA 4TKYA 5C00A 5ECIB 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chains in the Genus database with same CATH superfamily
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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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