1M2B | Genus

Total Genus 33

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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus	33
sequence length	101
structure length	101
Chain Sequence	FKHVFVCVQDRPPGHPQGSCAQRGSREVFQAFMEKIQTDPQLFMTTVITPTGSMNACMMGPVVVVYPDGVWYGQVKPEDVDEIVEKHLKGGEPVERLVISK

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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Genus data interpretation

Chord Diagram

publication title	High-resolution crystal structures of the wild type and Cys-55-->Ser and Cys-59-->Ser variants of the thioredoxin-like [2Fe-2S] ferredoxin from Aquifex aeolicus pubmed doi rcsb
molecule tags	Electron transport
source organism	Aquifex aeolicus
molecule keywords	[2Fe-2S] ferredoxin
total genus	33
structure length	101
sequence length	101
chains with identical sequence	B
ec nomenclature
pdb deposition date	2002-06-22

pfam database annotations

chain	Pfam Accession Code	Pfam Family Identifier	Pfam Description
A	PF01257	2Fe-2S_thioredx	Thioredoxin-like [2Fe-2S] ferredoxin

Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)

cath code	Class	Architecture	Topology	Homology	Domain
3.40.30.10	Alpha Beta	3-Layer(aba) Sandwich	Glutaredoxin	Glutaredoxin	1m2bA00

3VK9A 3FZAA 3L4NA 3JCML 3F4SA 5G31A 3A2WA 2CA8A 3FR9A 1JHBA 2HZFA 4KGIA 2K9FA 5IMVA 4IGJA 3IA1A 4ZBAA 3GX0A 2BJXA 5F0GA 5G5EA 5HR3A 1MD3A 1X9SB 5ABRA 5CP1A 4BVXA 3QOUA 5KEJA 2HE3A 3I43A 1XOAA 2OA7A 3RHBA 1V40A 3GMFA 2E2MA 2A4VA 2LJAA 2MMZA 4LLRA 2H71A 5DALB 5EVOA 4YQVA 2LRCA 2IPAA 3ZMLA 1OE8A 6GSWA 4DEJA 1F3BA 3IAM2 3RPNA 3D22A 5KN3A 2OE1A 1TI3A 3CTFA 5B8BA 1XW6A 2GVPA 5G5FA 22GSA 4RQXA 1Z5YE 5F8BA 4WF4A 4X0XA 5ECMB 3AY8A 1N2AA 1PRXA 12GSA 4HEA2 1SU9A 4GQCA 3TKRA 2CZ2A 5GAPD 4GXZA 5ECQB 2RM5A 3D4MA 5D8IA 2XHFA 1TXXA 4FO5A 5ELAA 1R7HA 1MEKA 1GLPA 4IHUA 1JLVA 2LEGA 2JSZA 3EU3A 1M9AA 5CAXA 3GX8A 2YWMA 2DC5A 2V41A 2CX3A 2B7KA 1K0OA 3VFIA 2VLTA 3I9V2 3C71A 4L0WA 2IJYA 1GTAA 1ZOFA 3FY7A 1NHYA 3M8NA 4KDYA 4ML1A 2R37A 4K2DA 2LTKA 2EIOA 4Q5FA 3GTUA 3H93A 1NSWA 4AJ8A 5G30A 5IO2A 4CW9A 5ECRB 1M99A 5AGYA 5IQYA 2VOCA 4IJ3A 1BAYA 4I2TA 2FA4A 3WGXA 4POBA 4GSNA 4N11A 18GSA 4XS4B 2WB9A 1R5AA 3IK9A 1GSDA 1PSQA 3QFBC 1VGLA 2KOKA 5D93A 5FT3A 1UN2A 4TR1A 1S3DA 5IMCA 1JZOA 5IOWA 2R2JA 3M3MA 1XPVA 1ABAA 4L5OA 1IYHA 4F82A 1O7UA 4KDUA 3NIVA 3N5OA 1TK5B 1U87A 4ECIA 4KCEA 3LYPA 3D0ZA 3D6IA 4KW6A 4ECBA 3QAGA 2MMAA 3BCKA 5G1LA 5A5KA 1JZWA 4PX1A 4TW5A 3FYGA 2J23A 4NWYA 4TN8A 3VLNA 1YKAA 2B1KA 1ERVA 3APQA 1B4QA 2VCZA 3FK8A 3QD9A 2V32A 2H6XA 1ZGNA 2M46A 4J57E 5G1KA 1X0RA 4IQAA 3US3A 4KSMA 2DJJA 3G7JA 2AB6A 2CVKA 4GQFA 5E4WA 4WR4A 1YEXA 1AQWA 1HYUA 5ECIB 4D73B 3TOUA 1FVJA 1EEJA 3F8UA 1R26A 3HCZA 3QFAC 2YN1A 1TRVA 5AISA 1WE0A 3KH7A 2DSAA 2PU9C 4PUFC 3M9KA 5H5RA 2I4AA 3LXTA 5JCWA 4LMVA 3GH9A 2X99A 3KP9A 2LV3A 4O92A 4EC0A 3OR5A 3HJMA 4IP6A 2H0HA 4EDZA 2DLXA 3GURA 5J9CA 3HA9A 2JU5A 1CQHA 1XIYA 5J4UA 1YEPA 1WOUA 2HSHA 1TRWA 4K6XA 4J56E 2DIZA 4LL4B 4ZB9A 1GSEA 1XFLA 3A2XA 1B4PA 3EINA 3ZMKA 4QL9A 4ML6A 4EF0A 2B5EA 1DUGA 2YV9A 5E59A 2DBCA 2H0GA 2H01A 2N5AA 1ST9A 1TKDB 2IMDA 4V2MA 3ZVJD 4K1FA 4KDXA 3ZRDA 5CNWA 1TTZA 1THOA 4LA1A 1W89A 2K8SA 3IOSA 1TRSA 1WRYA 1ZZYA 3GRXA 4JE1A 5AN1A 4HS1A 1OVNA 5DJLA 3LORA 1ZYEA 3E0UA 1ERUA 5DJMA 5ID2A 2B7JA 3GKKA 1T4YA 5LNKe 4GSTA 3L78A 2GGTA 1MD4A 2HRNA 2R5GA 1QK8A 2OE0A 4WF5A 3H4KA 1Z9HA 4KCAA 1FHEA 3V1WA 1SJZA 3C73A 1G7OA 1G6YA 2R4VA 2K18A 2VLUA 3RPPA 1A8YA 5F05A 2CQ9A 1X5EA 3DVWA 5J5NA 2AUVA 1TJDA 6GSVA 5D9WA 3UBKA 3LSZA 1A24A 3FW2A 4Z7XA 2FNOA 4GSSA 1T4ZA 3BD2A 1J0FA 1YY7A 4HQZA 3TRPA 2J9HA 2WZ9A 3EYTA 2B5YA 5CRGA 5F06A 1ML6A 4TXOA 2H8LA 2MYGA 2HZEA 2V6OA 1GSUA 4MZWA 1SL1B 2K6VA 3KCMA 3CRUA 2IWTA 4K7IA 5JWRB 1NW2A 3KIJA 4XRAA 5IMZA 3ZFBA 4POLA 3U5RE 3KM6A 2VCVA 5ENUA 3I69A 4NHZA 2AHEA 3KXOA 3TJBA 3WD6A 5GZZB 4F03A 2PGTA 5HFKA 3DYRA 3TKSC 4IJIA 3DKSA 1LJRA 2LNSA 4DSSB 3DEXA 1XWAA 1SKRB 4K9ZA 1JZDA 3ZFLA 2H1DA 4EL1A 1ILOA 1X5DA 2JZRA 4MPGA 1X9WB 3QR6A 3ZTLA 2JZSA 4F9ZA 3I6AA 3VWUA 1PL1A 3F0IA 2JACA 5ECLB 2EIRA 2GDRA 2CAIA 1XW5A 3S9FA 3O6TA 4OD7A 2GZZA 1HNAA 5AIXA 1XVWA 3CMIA 1SD9A 4NPBA 3UBLA 5C00A 4EO3A 2LQQA 4AJ6A 2H75A 3IV4A 2CVDA 2I3YA 1K3YA 1A2LA 2QC7A 4OO4A 2FWHA 2WULA 2PUKC 1KTEA 2YV7A 2CV4A 4GCIA 2H19A 1U88A 3E3EA 2RUFA 4MP4A 3NOFA 2ZNMA 4TXVA 2CAQA 3LEFA 4IKHA 3H1NA 1B9XC 2XPDA 1I5GA 3TJKA 2CVBA 6GSSA 1FB0A 3FR3A 3G7IA 4PQ1A 2QGVA 3TGZA 3TRQA 4OWYA 3EMXA 3VI7A 2WCIA 1XOBA 4HQSA 3TJGA 5KN0A 3CRTA 3CSJA 1QMVA 3IDVA 3EVIA 1XWGA 3CSIA 4PNFA 1HD2A 1TU8A 1Z3EA 2NDOA 2R6KA 2EC4A 4K7NA 1RQMA 1AQXA 1HNCA 1OC9A 3ZVJA 3BCIA 1Y6EA 1V57A 2C80A 2H70A 2C8UA 1V58A 2YNXA 2LQOA 3M1GA 2I1UA 2DJ1A 3N9JA 3F63A 2VD0A 1U3AA 1B8XA 3BOAA 2LRNA 2YZUA 1A2MA 1UA5A 4TOPA 2WJUA 3C1RA 5HFGA 3R2QA 3RDWA 4NV5A 4K7OA 1MDKA 3KMOA 3NZNA 3GTUB 5DALA 3P8WA 3KJYA 1Q4JA 3QMXA 2CX4A 3GHAA 3ZREA 5DAKB 4TVEA 3ZITA 4IW9A 1T1VA 2LJKA 3APOA 5D9TA 3KTBA 4ZXGA 4BA7A 4L5LA 5IPGA 4GWRA 4WKWA 2REMA 2PPTA 3CXGA 3IE3A 3ED3A 2HXKA 1WMJA 2X8HA 4MJEA 4MJBA 5LD0A 3MDKA 3ZL5A 1OC8A 2V2GA 5DBQA 1GNWA 1XW9A 4PXOA 2H76A 3SWLA 3VURA 2B5XA 4MABA 3F3QA 5DVBA 1AC1A 3C7MA 3PR8A 4PQHA 3ERGA 1UVZA 3IXRA 2YPMA 1TOFA 1GUKA 1YF1A 3Q18A 1KNGA 4HU9A 2C0DA 2FGXA 2VCQA 1VF1A 2DJ0A 5D9VA 4YH2A 3Q74A 5FHIA 4CHSA 1WJKA 3TKSE 1ACVA 1GSQA 3DGQA 2KUCA 2PERA 1OC3A 1T3BA 5GSSA 1G6WA 4HJ2A 1YQ1A 3F6FA 4FYBA 1TP9A 3LWAA 1O8XA 3IC4A 4G10A 4ECJA 3HZ4A 3ME7A 2YWOA 1VF4A 1Z7RA 5C04A 5ECOB 2L57A 1Q98A 3TOTA 2MZCA 4XS4A 1AXDA 5B6MA 4O32A 1OKDA 3W8JA 4HJMA 1EV4A 4PQIA 2IFQB 4YQMA 3KP8A 4ZL9A 4HI7A 1T00A 5A4WA 3WT2A 4KAEA 4L8EA 1URMA 1SK1A 5IO0A 14GSA 1EWXA 1BG5A 1OKTA 5JWQB 3CYNA 17GSA 4N0ZA 6GSXA 1J08A 3P90A 4BL7A 2HFDA 4GF0A 1O85A 4MJAA 3EU4A 3UVHA 2FA8A 1A23A 1G7EA 2E0QA 3QDNA 3CSHA 2FUG2 1LBKA 2PN8A 3HY2A 5AIVA 3VWWA 2GT5A 4GRFA 4K0NA 13GSA 1V98A 3HVXA 1GP1A 4EDYA 4MDCA 1WIKA 2FY6A 2VCXA 3E9JB 3IAS2 2H1BA 4YAVA 1JFUA 5COHA 2CT6A 1USBA 4N30A 4NMUA 4I2UA 3IR4A 2N5BA 4K8MA 4XCSA 1F6MC 3F9UA 1TK8B 3QPMA 4RUVA 1EOGA 2C0EA 3UOMA 2YANA 5HR0A 2MBTA 1EGRA 4D73A 5KN1A 2I81A 4FH8A 11GSA 2GSTA 5CO3A 1U6TA 2LNTA 4Q5NA 3FKFA 1BEDA 2LKUA 3LG6A 1PMTA 4BVYA 4F2IA 3FZ5A 3U6VA 1K0NA 3TUEA 2Z9SA 1Z6NA 3ERWA 1TU7A 1AW9A 1TW9A 1PKWA 1UC7A 4I97A 5H5QA 4RI7A 2IMKA 1M2BA 4WETA 4QQ7A 4JZQA 1GL8A 1H4OA 1YDKA 3FR6A 3M0FA 4G2EA 4FIWA 4ZL8A 3GNJA 20GSA 2FCHA 5CYYA 2O85A 1AUCA 1AQVA 1MDJA 2PMTA 16GSA 1GUHA 2GZYA 3EURA 2JZTA 2YWIA 1GH2A 1ZL9A 2X64A 3G9BA 3A2VA 2DMLA 2H6YA 6GSTA 2RUEA 4MLYA 4NHWA 4GLTA 2P5QA 4EVMA 3Q19A 1A8LA 1FAAA 5ECSA 1HQOA 2ZCTA 1CQGA 2KP2A 4AGSA 1X5CA 2VIMA 3IHQA 1IYIA 3VWVA 2O8VB 3HD5A 2C4JA 1GTBA 4IELA 4TXOB 2FD3A 2TRXA 4L0UA 1S3CA 2NTOA 4NAXA 1K0AA 2DJKA 3J7Yb 2CZ3A 2H6ZA 4N10A 2AAWA 2OJLA 4WBJA 2F51A 3HJOA 1A0FA 3C8EA 5GAND 4G19A 4ZB6A 2HYXA 2A2RA 3ZIJA 5DQYA 2NVLA 4ACSA 1Z7PA 2GSRA 2GQKA 1GLQA 5J9BA 2K8VA 2H73A 4IS0A 4OFTA 5DDLA 4TKYA 6GSYA 3GA4A 3BJ5A 4ZBBA 1SKSB 4ECCA 4MPFA 4K0GA 1F2EA 4TR4A 4MCUA 2XC2A 4PGTA 2YP6A 3VI5A 1THXA 4YAPA 2PVOC 2WRTA 3TKQA 3BBYA 3UVTA 1EV9A 1GNEA 1I9DA 1QXHA 2I9HA 2O89A 1FVKA 2VL2A 4IN0A 1SJIA 1EOHA 1ON4A 5IMDA 1ZMAA 3O76A 3ZLPA 4HDEA 3DVXA 5JWOB 1DBYA 3PINA 2VM1A 3TCOA 2LSTA 1X9MB 4BPYA 1R4WA 1PD21 5JCGA 4MF6A 1O81A 4WEYA 2O87A 3C1SA 3DMLA 3GFKA 3D21A 1K3LA 4OCEA 4POKA 3KGKA 1BYEA 3IPZA 2P5RA 3QAWA 2HNLA 3GL5A 1QGVA 3GUSA 1TI1A 1YKCA 3TJJA 2LRTA 3MWHA 3L0HA 5B6NA 4N0VA 1HNBA 3LGCA 1XVQA 4KE3A 2XBIA 2C0GA 2ES7A 3KEBA 2H66A 3UIWA 4DSSA 2XPEA 2B3SA 2FWEA 1N8JA 2L59A 1SK0A 5ECNB 5CRWA 1FW1A 2BTOT 5CRHA 1TDIA 3H79A 1SKWB 5L71A 1SD8A 2G2QA 1T7PB 3LYKA 3DIEA 4KX4A 2MBSA 4JEDA 2A2SA 4OFMA 4E8EA 1GRXA 5B7CA 2HT9A 4GTUA 2YJHA 3HHVA 5IMFA 1OC9B 2RIIA 2RLIA 1PN9A 1NM3A 2VAFA 1B48A 3UJ1A 1DSBA 5HR1A 3WGEA 3HJPA 1SK2A 1F3AA 2C3QA 2KP1A 1ERWA 1A0RP 3F4TA 1K0DA 3W8SA 2C1YA 1YF0A 3ZYWA 1MDIA 1LU4A 2PWJA 1E2YA 2VD1A 2ON5A 1GSFA 1EP8A 2OKAA 4NXIA 3GKMA 1OE7A 2H30A 6GSUA 2QSIA 4I6XA 5INYA 2VL2C 4E8HA 2JSYA 1O73A 2P31A 2F9SA 2L5LA 3MAKA 4LMWA 5LCZA 3FEUA 1GTUA 2LUSA 3G7YA 3LQ7A 5J3RA 1XXUA 2YCDA 4I8BA 1Z6MA 2C3NA 1GTIA 3SBCA 5FWGA 2MMNA 1OYJA 1M2DA 5KN2A 3M9JA 1JZRA 4HU7A 1EEMA 2H1GA 3KH9A 2VO4A 5D73A 4G9HA 4F0BA 4IP1A 3PH9A 3TRXA 3IRAA 4AF2A 2OADA 2VCWA 3HDCA 2KHPA 3LJRA 1BX9A 1XWKA 4PURA 4KA0A 5ELGA 5ECKB 4TR1B 3DWVA 1M7TA 3P2AA 3UAPA 3UEMA 2GS3A 4MH2A 5DAKA 1MTCA 5CREA 4ZL7A 1JLWA 4HOJA 1K3OA 4JBBA 4KNDA 2IN3A 3FZ4A 4XS1A 2GSQA 4Q5QA 1WWJA 2FHEA 4XRDA 9GSSA 3O3TA 4MZCA 1DE2A 2GLRA 3P7XA 3DXBA 19GSA 2NBSA 1SYRA 3D5JA 2DJ2A 2OBIA 2GSSA 4KB3A 3HKRA 2X8GA 3TDGA 5HQPA 1WP0A 4H86A 2L4QA 2KLXA 5F07A 1QQ2A 3RHCA 1W4VA 1EP7A 1PL2A 1U3IA 2NPBA 3MNGA 4MH3A 1SENA 2GZPA 4HZ4A 7GSSA 1GWCA 2VL3A 4ISDA 5D9XA 5IPHA 1S3AA 2H72A 1O6JA 3HXSA 4BWQA 2WGRA 3QAVA 4HZ2A 3RBTA 4JR6A 4ZIJA 4XS6A 1XWCA 2M72A 3CBUA 2GTUA 1XWBA 3TB2A 4IVFA 2B6MA 4O5RA 1V2AA 4MJCA 4JR4A 3DRNA 3L9VA 3FHKA 2VUPA 1FB6A 1K0CA 2ALBA 3LXZA 3WYWA 3ZIVA 1DE1A 10GSA 3LFLA 4BWSA 4LL1B 5A4VA 2B1LA 2IFQA 2YJ7A 4TRXA 4ULXA 1PKZA 4XTSA 5J41A 5B8AA 3VPQA 2JADA 1FO5A 4V1Ag 3IBHA 4MA9A 1A2JA 2H74A 2F3MA 2L5OA 4X43A 1BJXA 4TR0A 2PVQA 2IIYA 4XIHA 4MZBA 1M0UA 2HLSA 4EE0A 2DIYA 2P0GA 2LJRA 1QFNA 2H0IA 2VLVA 4PUAA 2WS2A 5DCHA 4JRRA 4WBRD 3GV1A 3MSZA 4FYCA 3W6GA 3GSTA 4ZBDA 2YWNA 2N5FA 1RK4A 5HFIA 4ILFA 5CRDA 2O7KA 4V2LA 2DMMA 1TK0B 4CDOA 4FYUA 5ID2B 3TKSA 2L6CA 1K0MA 3A3TA 1E6BA 1PX6A 2ON7A 5EY6A 3TJFA 2F8AA 1SJ6A 1V9WA 4KH7A 2TRCP 1M9BA 4EKZA 1NHOA 1ZCPA 4WXTA 2G0FA 4NV2A 3HZ8A 3GYKA 5EL8A 1AAZA 3KTLA 1SYXA 3FRCA 4MF5A 1YZXA 4MMMA 5A4UA 1SL2B 4WR5A 3HVSA 1XCCA 2DJ3A 1PX7A 2D2ZA 8GSSA 4X1UA 4QL7A 2EIQA 3HYPA 3RAZA 2HZEB 2AYTA 2IMEA 2WDUA 4ZB8A 3WGDA 3Q6OA 3QCPA 3A5WA 5GSTA 1T8EB 5IOXA 2MMOA 4V2NA 2FWFA 1H75A 4RQRA 1ZYQB 3ERFA 1R5PA 3HVVA 4P3YB 2QKEA 3F6DA 1EGOA 4POMA 4RI6A 2V6KA 3EMPA 1PA3A 4EXJA 3FZ9A 4OCFA 4MF7A 2FLSA 2RM6A 1VF3A 2HSYA 3WT1A 3GH6A 1F37A 1YJ6A 2HRFA 3GKXA 4PNGA 1M2AA 4JU5A 2AJQB 4IQ1A 3APSA 1C72A 2IMIA 1QUWA 3F4RA 1OAZA 4TR3A 5G2ZA 2VL9A 2YOIA 5ECHB 3DD3A 3ZZXA 3PGTA 2C0FA 5ECPB 2LS5A 3KZQA 1XZOA 1GUMA 3VPTA 3TKPA 2XBQA 2JL4A 3EE2A 1SL0B 4V1Ap 1ERTA 3J7Yk 3L9SA 2M80A 4XHMA 4IBPA 4DSRA 3VWXA 1Y25A 2GQMA 4ID0A 1AIUA 1GSYA 4OMVA 3UARA 2R3XA 5IM9A 1WPIA 4EUYA 1EZKA 1PQNA 1PGTA 5H5SA 5HR2A 3GIXA 5DQSA 2BMXA 4KSOA 3ISOA 2IMFA 3EWLA 1J9BA 4ZILA 4YQUA 3KMNA 2IL3A 1VRSD 1F9MA 1G0TA 2FWGA 3GN3A 3D4TA 1FOVA 2PBJA 4F0CA 1GULA 5JCUA 4I5QA 4Q5RA 1TRUA 1BQ7A 2TIRA 4DSQA 2VM2A 2C3TA 2OACA 1FG4A 3EC3A 4OFNA 1VF2A 1K0BA 4AJ7A 5IIZA 3UL3A 3K8NA 3GL3A 2E2GA 5DCGA 1KBNA 3CTGA 1KEBA 2OBKA 2OE3A 3GKNA 2AV4A 2L6DA 3KD0A 2GQLA 1B9YC 1RW1A 3UMAA 4KUNA 1XBSA 4J2FA 1O8WA 2X8CA 2GT6A 3F3RA 2H1AA 4HUAA 3ME8A 2YZHA 2VCTA 1GSSA 3L9UA 2L4CA 4MK3A 4DVCA 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chains in the Genus database with same CATH superfamily

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chains in the Genus database with same CATH homology

#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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Chain Sequence

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