1DSBA

Crystal structure of the dsba protein required for disulphide bond formation in vivo
Total Genus 69
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
69
sequence length
188
structure length
188
Chain Sequence
AQYEDGKQYTTLEKPVAGAPQVLEFFSFFCPHCYQFEEVLHISDNVKKKLPEGVKMTKYHVNFMGGDLGKDLTQAWAVAMALGVEDKVTVPLFEGVQKTQTIRSASDIRDVFINAGIKGEEYDAAWNSFVVKSLVAQQEKAAADVQLRGVPAMFVNGKYQLNPQGMDTSNMDVFVQQYADTVKYLSEK
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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publication title Crystal structure of the DsbA protein required for disulphide bond formation in vivo.
pubmed doi rcsb
molecule tags Disulfide oxidoreductase
source organism Escherichia coli
molecule keywords DSBA
total genus 69
structure length 188
sequence length 188
chains with identical sequence B
ec nomenclature
pdb deposition date 1993-05-24

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF01323 DSBA DSBA-like thioredoxin domain
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.30.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich Glutaredoxin Glutaredoxin 1dsbA00
3C8EA 4OFNA 2LRCA 4GLTA 2FWGA 4KSOA 2R5GA 2XPEA 1TDIA 4FIWA 1OC9A 2RUFA 4IHUA 2L59A 2YWNA 2C0EA 2PPTA 4HZ4A 5E59A 2CAQA 1V98A 4G10A 1DBYA 3DIEA 3H4KA 3R2QA 3UVTA 3ZZXA 2PVQA 1V2AA 1X5EA 3H1NA 2VCXA 3DVWA 22GSA 4TKYA 4QQ7A 4AJ8A 3H93A 1CQHA 3PH9A 2D2ZA 4F82A 2I1UA 4F0CA 4D73A 1X5DA 3TJFA 4IW9A 3MAKA 5DALB 2YWIA 1SJIA 1PSQA 1Z6MA 3F9UA 2JZRA 4XS6A 2PUKC 2AAWA 2LSTA 2CVKA 1SYRA 1Q4JA 2YJHA 1A8YA 4OMVA 2K8SA 3HVXA 2LRTA 4ECBA 4BWQA 5JWOB 1MDJA 2CVDA 3UEMA 1GUHA 4JR4A 2E2MA 3VLNA 1A0RP 3E3EA 5EL8A 1GTIA 5ECKB 2YPMA 1LU4A 4TW5A 2CX3A 5D9WA 2L5LA 4ISDA 2PMTA 2YWOA 2VM1A 3N9JA 1BQ7A 9GSSA 4BVYA 4NV5A 1KTEA 5CRDA 14GSA 4AJ7A 1O8WA 2IFQA 1ZGNA 1G0TA 2TRCP 3QDNA 3TRQA 2LKUA 3UJ1A 2PBJA 2LRNA 2VD0A 2IIYA 1S3AA 2TRXA 3H79A 4IP1A 2H76A 5IMVA 2H1DA 2K6VA 3IPZA 1URMA 3D0ZA 4OO4A 2XC2A 4RI7A 2H01A 5CYYA 2P5QA 2FHEA 4BVXA 1XCCA 12GSA 4V2NA 4RQXA 1YJ6A 4L5OA 2WCIA 1GSFA 5HFGA 3TKSE 2ZCTA 5GAPD 4MF5A 2Z9SA 4EUYA 2WRTA 3WGXA 4OD7A 4MCUA 3FRCA 2PGTA 4WBJA 3TCOA 3I9V2 4J57E 3F63A 3LYKA 4ECJA 2EIOA 3ME8A 4F03A 3FZ5A 2TIRA 3Q18A 3GTUB 2XHFA 1FG4A 2N5FA 7GSSA 2DIYA 3F6DA 4O92A 1OKTA 4IS0A 4TR1B 4JE1A 3CRUA 4GQFA 1TRVA 3FR9A 1BX9A 1F6MC 6GSUA 2QGVA 4F0BA 1KEBA 1Q98A 4XCSA 4I2UA 4JR6A 1GLQA 5D93A 4IKHA 3HHVA 1X9WB 3HKRA 2WZ9A 1XOAA 1BAYA 1JZOA 6GSSA 1AC1A 1VGLA 1Y25A 1U3IA 4HQZA 1ERUA 1YZXA 4MZBA 3UAPA 1GWCA 4DVCA 4AGSA 2H6XA 1U88A 5H5SA 1B48A 1O85A 2H19A 2VLVA 3ZMLA 1ML6A 2DMMA 4HS1A 2FA8A 4NXIA 3KMOA 3KTLA 1JLWA 1FOVA 4YQMA 1OAZA 5DVBA 1QGVA 1RK4A 3ZIJA 2MZCA 2OKAA 4Z7XA 3VPTA 1TRWA 4J56E 1JZDA 5KN3A 4XHMA 5ID2A 1EP8A 4WR5A 2RUEA 1THOA 2GSQA 5AGYA 4JZQA 4XRAA 6GSXA 2H70A 3J7Yk 1W4VA 2YP6A 2GZZA 2ZNMA 2B3SA 4L5LA 3W8SA 5ELGA 3ED3A 2C4JA 2AV4A 3VK9A 1O7UA 1WRYA 2E2GA 3RPNA 4MZWA 5EY6A 3GKMA 4PGTA 4QL7A 1E2YA 3QCPA 4ZIJA 3BD2A 1OVNA 5ECNB 1GLPA 5A4VA 3ZREA 1F9MA 1M2DA 3A2XA 3L4NA 4HUAA 5EPFA 2AJQB 2JSZA 1XVQA 2HSYA 5IOXA 2CZ3A 4EF0A 2HT9A 1Z7PA 4PUAA 4N0VA 2CQ9A 2OE1A 2F8FA 3DKSA 3EYTA 1XWGA 1EGOA 2GSTA 2GVPA 4LL1B 1GSSA 1EWXA 1SENA 2E7PA 4K7NA 4PQ1A 1U3AA 4KB3A 4GRFA 19GSA 2FY6A 3V1WA 5JWQB 1QUWA 1T7PB 3GV1A 4ZB6A 3KP9A 5DQYA 3KGKA 5G31A 1BJXA 2LEGA 4O5RA 3GX8A 3A2VA 2R2JA 3E0UA 2RLIA 1HQOA 1T3BA 1MDIA 4TRXA 4TXVA 3Q6OA 4MJAA 1ZL9A 4RUVA 2DSAA 2VLTA 1O81A 2B6MA 2OE0A 2L6CA 5DJLA 3TOTA 2VLUA 3M0FA 4PNFA 3SWLA 2WDUA 1XWCA 2N5AA 6GSWA 4PNGA 2YCDA 3GHAA 3BBYA 4V2MA 3U6VA 1OC9B 3BOAA 4HU7A 3ZL5A 3SBCA 3DYRA 2PVOC 1WMJA 2QKEA 1OKDA 5DDLA 2B7JA 3O3TA 2BJXA 2YZUA 2OJLA 2X8CA 4ZBAA 1PMTA 3E9JB 5D9XA 3ERGA 2NPBA 5F06A 1DE2A 2A2RA 3WT1A 3KJYA 2IMKA 4Q5NA 4JU5A 1GTAA 5INYA 2CV4A 1PL1A 2OADA 2NTOA 3GIXA 4MK3A 4D73B 1T00A 4ZILA 1THXA 5ECIB 4POBA 3IK7A 1B4QA 2C3NA 5ECHB 3O6TA 3LORA 4DEJA 5G2ZA 2O8VB 2EIQA 1PD21 2LV3A 2B5XA 5EVOA 3ERWA 4Q5FA 1FAAA 2DMLA 4HJMA 3GH6A 2AB6A 2VUPA 4MH3A 3TOUA 3UBKA 4K0NA 3VFIA 1ZCPA 2R3XA 2LNSA 5LCZA 2HI7A 3HZ4A 2FWEA 3APQA 2YZHA 1HD2A 3ZFLA 2H73A 2PU9C 5ECSA 2JZTA 3HJPA 2LJKA 4V1Ap 4NHWA 3CYNA 3TUEA 3ZTLA 2C3TA 1XW9A 4MA9A 6GSTA 1T1VA 2JU5A 3D6IA 1JHBA 4X43A 2DJ0A 3HZ8A 1TRSA 2B7KA 1SL0B 1ACVA 1SD8A 2LJAA 1EP7A 2IMEA 4GCIA 2IMIA 3L9SA 3IC4A 1R7HA 4QL9A 2OBKA 3I6AA 3UARA 3L0HA 1PA3A 3D4TA 5CP1A 2LNTA 2L4CA 1G6WA 5HR1A 4DSRA 5KN1A 5JWRB 2GZYA 2IFQB 2GQKA 2KOKA 4KX4A 5KEJA 4X0XA 2C1YA 3KZQA 5ECMB 5ABRA 3ZYWA 1PGTA 3GL3A 3C1RA 1QQ2A 3GN3A 3G7JA 1F3BA 1V9WA 2HXKA 2L57A 3UIWA 3FKFA 1PN9A 2H30A 2V2GA 2YJ7A 1XXUA 3KCMA 3F3QA 3WYWA 4ZB8A 3EMPA 4I6XA 1VF4A 4KE3A 1JZRA 1K3YA 1A24A 4BWSA 1CQGA 1Z5YE 2F51A 2IMDA 2M72A 3LXTA 3M8NA 2X64A 4ZB9A 4HZ2A 1G6YA 3M9JA 3S9FA 4Q5QA 3QAWA 2VM2A 4IVFA 1DE1A 4EKZA 3ZVJD 1PRXA 4MF6A 1H4OA 3OR5A 3ZITA 2ZUPA 3NIVA 3IV4A 5G5EA 2YANA 4PURA 3TJBA 2JACA 4HDEA 3HD5A 4NWYA 1TW9A 3F4SA 3H8QA 5GAND 2YWMA 2F3MA 2WULA 5B8BA 4KW6A 3IAS2 5C04A 4JBBA 4MJCA 5IMAA 3KM6A 2H1AA 3ZFBA 1EV9A 2JL4A 1ON4A 1OC3A 2C0FA 4MP4A 5G5FA 2KUCA 5DCHA 3TKSC 2MYGA 4L0UA 2V41A 1TU8A 3ZMKA 1K0NA 1PKWA 1V58A 5A4WA 4TR3A 3HVSA 2MBSA 1SKSB 1DUGA 2DJ1A 3MDKA 1PX6A 4DSSA 2GZPA 2WB9A 1R26A 1XFLA 3DVXA 1X9MB 2VAFA 1BEDA 1O8XA 4FH8A 3HXSA 2DJKA 3NOFA 3TKRA 4NMUA 1XVWA 5L71A 3W6GA 1OE7A 3BJ5A 5G1KA 5ID2B 4KCEA 4KH7A 3C71A 1TI1A 2GQMA 3EINA 3LQ7A 1HNCA 2H6YA 4PQIA 4EVMA 1M0UA 3BCIA 3TKQA 3GKXA 5CAXA 5ECRB 3DRNA 4K2DA 3VI7A 5IIZA 3FEUA 1F2EA 3WD6A 4NHZA 3G9BA 1M9BA 2X8HA 5GSSA 5ECOB 2GT5A 2YV9A 4ZL7A 3ZVJA 3EWLA 2KHPA 5LD0A 3P7XA 1EZKA 2V6OA 3ZIVA 4XIHA 3DEXA 1SJZA 1A0FA 3DWVA 1GNEA 4WBRD 1SL2B 2K18A 2C0DA 2DIZA 1SU9A 5IM9A 4WF5A 5JCWA 2P5RA 1QFNA 4GTUA 3GYKA 5COHA 2VL3A 4CHSA 1TI3A 2HRNA 4V2LA 4LMVA 3FR6A 2FWHA 16GSA 1XWBA 5DAKA 1U87A 2B1LA 2MMOA 4RQRA 1TU7A 2AHEA 5ENUA 4EO3A 4FO5A 1GSUA 4IN0A 3VI5A 1B9YC 4K7IA 5J3RA 1QXHA 4MABA 2FUG2 3F0IA 3GMFA 3LGCA 1FO5A 1A2MA 4J2FA 5JCUA 2E0QA 4GQCA 4ZL8A 3RDWA 2JZSA 4BL7A 2HE3A 4OCFA 3CSIA 2HNLA 4WETA 2O85A 1QK8A 1E6BA 3W8JA 1OYJA 1XPVA 5IMDA 2F8AA 3UL3A 4K1FA 4HQSA 1Z3EA 4I5QA 1WPIA 2FGXA 4GWRA 1XZOA 3C7MA 1YKAA 1GULA 2P31A 2MBTA 5F0GA 1SK1A 3LEFA 4P3YB 5CRHA 1PQNA 2K9FA 1NSWA 4KUNA 3O76A 1F3AA 1Z9HA 4O32A 5KN2A 1K0CA 3TJKA 4MF7A 2WGRA 3D21A 2VL2A 1M99A 1GSEA 1ERVA 2DLXA 4NAXA 2QSIA 5ELAA 2REMA 3PR8A 3KP8A 1GRXA 3M3MA 3FR3A 4PX1A 1TK5B 1NW2A 2H66A 2R4VA 1VRSD 2X8GA 1R4WA 3EURA 2ON5A 1WOUA 5CO3A 4DSQA 4KNDA 1TK0B 5D8IA 3QMXA 3QAVA 3GKNA 3Q74A 4KAEA 4IJIA 4L0WA 5JCGA 1R5AA 3JCML 1GSYA 5DCGA 1I5GA 3QR6A 3QFBC 5DBQA 2C8UA 3QOUA 4MDCA 1ZOFA 4N10A 1UN2A 1JFUA 4K9ZA 5B8AA 3HA9A 5D96A 3LYPA 1YY7A 1YF0A 2CA8A 5J9CA 3GSSA 4TXOA 3RBTA 1K3OA 5IO0A 2DJ3A 4POLA 2GTUA 3GURA 5CRGA 2HZEB 4ULXA 3DXBA 4KCAA 1TXXA 1JLVA 5FWGA 1O73A 2HSHA 1TP9A 3A5WA 2GDRA 1DSBA 5IMZA 5LNKe 4AJ6A 2X99A 4XS1A 2VO4A 2FCHA 2IJYA 2P0GA 4ILFA 3QD9A 4TR4A 3HYPA 2A2SA 2GQLA 1T4YA 3PGTA 3J7Yb 1GUKA 3I69A 1K0OA 1HYUA 2I9HA 4F9ZA 3CTGA 1LBKA 4TR0A 3LJRA 4E8EA 4NPBA 1F37A 4ACSA 3L78A 3WGDA 3GUSA 2H1GA 5HR2A 13GSA 4ML1A 1EOHA 4BA7A 4IELA 4WXTA 1GSQA 5GSTA 2WJUA 1YEXA 2CVBA 2ES7A 3RHBA 1AW9A 3APSA 2FWFA 1X5CA 4K7OA 2I81A 3TKSA 3IDVA 3KEBA 2B5EA 3LSZA 1S3DA 3L9VA 1AQWA 2L5OA 3N5OA 3EC3A 2FNOA 4TVEA 1YEPA 1U6TA 4E8HA 4YAVA 4LMWA 5IMCA 2ALBA 5CNWA 18GSA 1J08A 1A8LA 4KDYA 4HJ2A 1XBSA 2HFDA 2VL2C 4KDUA 5IPHA 1QMVA 4PXOA 2IPAA 3F4TA 4GSTA 5G1LA 1BYEA 1XWKA 3GNJA 1AIUA 2H1BA 4EDYA 4KA0A 2H75A 4I2TA 3F8UA 5H5RA 3DD3A 3TJJA 1ERTA 3ERFA 2G0FA 2HZEA 2LQOA 1EEMA 3EVIA 4IBPA 5HQPA 1K0BA 1O6JA 4K0GA 2NDOA 4YH2A 10GSA 1IYIA 3GFKA 1SJ6A 4DSSB 2VCQA 4I8BA 2HLSA 4ZL9A 3GSTA 3D22A 4RI6A 5F8BA 1OE8A 3VWWA 3F6FA 5AIXA 1SYXA 2O7KA 1ABAA 3C1SA 3NZNA 2PWJA 2JSYA 5FHIA 17GSA 5B6NA 2C80A 1ZYEA 4EE0A 3GH9A 5CRWA 1OC8A 3AY8A 2O87A 3FW2A 1UVZA 1M2AA 1B9XC 1MTCA 3GRXA 3HJOA 5KN0A 2VCVA 1SD9A 3GL5A 3US3A 4GF0A 3TGZA 4MH2A 1M7TA 1B8XA 4G19A 2H8LA 1FB0A 4WR4A 5AISA 4PUFC 1AQXA 3HCZA 4IJ3A 3EE2A 4OCEA 2AYTA 2DBCA 4EDZA 3KH9A 5IPGA 2V32A 2HRFA 4MZCA 4MPGA 1BG5A 1X9SB 5AIVA 4IP6A 8GSSA 3WGEA 2XBQA 1W89A 2RIIA 4WF4A 1FW1A 1VF2A 2A4VA 2GS3A 3DMLA 3TKPA 4GXZA 4JEDA 2EC4A 2ON7A 1FVKA 3FK8A 2V1MA 2HYXA 1V57A 4MJEA 1PKZA 1T8EB 5DAKB 2OACA 3GX0A 4HEA2 4ZXGA 1YDKA 1UC7A 5J9BA 1XW5A 1JZWA 2H71A 4ZBDA 2GSRA 1K0AA 3EU4A 5FT3A 1MDKA 2WS2A 1GSDA 1HNBA 2L4QA 4EXJA 2R6KA 4N0ZA 2B5YA 4LLRA 2PN8A 3ZLPA 3A3TA 1K0DA 3IOSA 3VWUA 3TB2A 2NVLA 1MEKA 2CZ2A 1X0RA 3P8WA 1J9BA 5H5QA 2I3YA 1N2AA 4KGIA 2GGTA 3IAM2 1WWJA 4TOPA 1C72A 2M46A 3IA1A 3PINA 3TRXA 1A23A 2M80A 2CT6A 3ZRDA 3KIJA 3C73A 4PQHA 1TOFA 2V6KA 5IQYA 1XW6A 1AUCA 1PL2A 3M1GA 1ZMAA 2B1KA 3EMXA 3FHKA 2LUSA 5J41A 5DALA 5HFKA 2HZFA 1WIKA 1RQMA 4AF2A 20GSA 2R37A 3LXZA 5CREA 2RM6A 3VPQA 3KTBA 1SL1B 4MLYA 1USBA 3P2AA 3UMAA 1Y6EA 3F4RA 3QPMA 4HU9A 3QFAC 4TXOB 1ERWA 4XS4B 4MMMA 2FD3A 3D4MA 1EEJA 3CBUA 4ID0A 2IL3A 4H86A 1FB6A 1MD3A 2WFCA 1SK2A 1KNGA 4XTSA 3HVVA 5IO2A 2J9HA 4N11A 2YN1A 4OO5A 4KSMA 3RPPA 2AUVA 4FYBA 2JADA 1Z7RA 3IK9A 3IR4A 2IMFA 2VL9A 3EU3A 1EGRA 1EV4A 1ZYQB 3TJGA 6GSVA 1G7OA 2N5BA 3FZ9A 4L8EA 2VIMA 4X1UA 2RM5A 1GH2A 3KD0A 4CDOA 1A2JA 3CTFA 1GNWA 2OA7A 2GT6A 2EIRA 1SKRB 4CW9A 5ECLB 1K0MA 2IN3A 3UVHA 2XBIA 11GSA 2VCZA 5J4UA 2DJ2A 2CX4A 1GTUA 2CAIA 1J0FA 3P90A 3IRAA 5J5NA 3QAGA 4IQ1A 1RW1A 5G30A 4BPYA 3UBLA 5A4UA 2H0GA 1TJDA 5AN1A 2H0IA 2KLXA 4MPFA 5ECPB 3UOMA 2J23A 4OFMA 1ILOA 4FYUA 3FY7A 2NBSA 1KBNA 1AXDA 1SK0A 2MMAA 2G2QA 4LL4B 3HDCA 4ML6A 1FHEA 3D5JA 2IWTA 4XRDA 1GUMA 1TTZA 2MMZA 3GTUA 2QC7A 4ZBBA 1LJRA 4G9HA 1ST9A 4POMA 1SKWB 3WT2A 1A2LA 4Q5RA 1Z6NA 4HOJA 4TR1A 5HR3A 3IHQA 2XPDA 1AQVA 1B4PA 2DC5A 3MWHA 1NHYA 5D9TA 4YQUA 4XS4A 2BTOT 3I43A 4JRRA 2YNXA 4F2IA 4OWYA 2PERA 3CMIA 2YV7A 2H74A 1MD4A 3L9UA 3BCKA 3CRTA 3G7YA 5D9VA 1S3CA 1PX7A 4FYCA 1V40A 3RAZA 3U5RE 4ECCA 3MSZA 2YOIA 4G2EA 3K8NA 3ISOA 4ECIA 1EOGA 1VF3A 2C0GA 2C3QA 3ME7A 1XIYA 3LG6A 2LTKA 3LWAA 3F3RA 2FA4A 5HFIA 3VWVA 2LQQA 5B7CA 3M9KA 4O7HA 1GL8A 1WE0A 3CSHA 2KP1A 1T4ZA 2FLSA 4KDXA 2GLRA 3CSJA 1NHOA 3GKKA 2L6DA 2MMNA 1IYHA 1VF1A 1WJKA 4N30A 2BMXA 4K6XA 2OE3A 1XOBA 5C00A 3G7IA 5E4WA 3A2WA 5DJMA 3VWXA 1TKDB 4WKWA 2K8VA 3CXGA 4EL1A 5HR0A 2LJRA 2H72A 5GZZB 4YQVA 4IGJA 3VURA 2OBIA 3RHCA 3APOA 1XWAA 3KMNA 3LFLA 3MNGA 5IOWA 2F9SA 1R5PA 1N8JA 4GSSA 4POKA 4YAPA 1ZZYA 3FZAA 1YQ1A 3TRPA 4OFTA 2LS5A 2VOCA 1M9AA 2KP2A 1GP1A 3FZ4A 1FVJA 4WEYA 4V1Ag 1TRUA 5ECQB 3HJMA 5D73A 4K8MA 1GTBA 2VCWA 4LA1A 1YKCA 3HY2A 4I97A 3IE3A 3GA4A 2H6ZA 1YF1A 1NM3A 2GSSA 1M2BA 1HNAA 3KH7A 1UA5A 2DJJA 1I9DA 1AAZA 4GSNA 5F05A 5B6MA 5DQSA 1G7EA 1WP0A 3KXOA 4EC0A 2VD1A 3DGQA 3IXRA 4IQAA 2O89A 2H0HA 4NV2A 4TN8A 6GSYA 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chains in the Genus database with same CATH superfamily
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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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