3APS | Genus

Total Genus 35

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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus	35
sequence length	114
structure length	114
Chain Sequence	PQASIDLTPQTFNEKVLQGKTHWVVDFYAPWCGPCQNFAPEFELLARMIKGKVRAGKVDCQAYPQTCQKAGIKAYPSVKLYQYERAKKSIWEEQINSRDAKTIAALIYGKLETL

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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Genus data interpretation

molecule tags	Oxidoreductase
source organism	Mus musculus
publication title	Structural basis of an ERAD pathway mediated by the ER-resident protein disulfide reductase ERdj5. pubmed doi rcsb
molecule keywords	DnaJ homolog subfamily C member 10
total genus	35
structure length	114
sequence length	114
chains with identical sequence	B
ec nomenclature
pdb deposition date	2010-10-20

pfam database annotations

chain	Pfam Accession Code	Pfam Family Identifier	Pfam Description
A	PF00085	Thioredoxin	Thioredoxin

Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)

cath code	Class	Architecture	Topology	Homology	Domain
3.40.30.10	Alpha Beta	3-Layer(aba) Sandwich	Glutaredoxin	Glutaredoxin	3apsA00

5F0GA 1GNWA 1VF2A 2GZZA 5AIXA 3SWLA 1YKCA 1FB6A 1A2MA 1OC3A 1PN9A 3KP8A 5DDLA 1UVZA 4EO3A 3HJMA 4F82A 1R7HA 5ECRB 1SJIA 2O7KA 3CSHA 4I2TA 1ZL9A 5ECQB 3ZTLA 3H93A 2WFCA 2H8LA 3GA4A 2YCDA 4CDOA 5J41A 2WB9A 4G2EA 1ERTA 1TK5B 2CVBA 4NPBA 1K0NA 1YF0A 4OO4A 2CVKA 3LYKA 3QR6A 4F2IA 4ULXA 1XW6A 5J3RA 2WDUA 1M2DA 3RPNA 2R5GA 3C7MA 5G1KA 4KSMA 5LNKe 2TRCP 2DJ3A 1KTEA 3IK7A 5GZZB 2FA4A 3GV1A 4L5LA 3DRNA 4IQAA 1SKSB 4F0BA 3BBYA 3PR8A 1M99A 1V57A 3K8NA 5CP1A 4XTSA 3HJOA 1XZOA 2YWNA 2B5EA 4MA9A 2MYGA 3U5RE 3VK9A 2H66A 2GT6A 4FIWA 1O85A 1WMJA 4WF4A 2F8AA 1YEXA 1AAZA 3CRUA 3CRTA 1OE8A 2AUVA 3UVTA 1SD9A 2E0QA 5CRHA 2H6ZA 1KEBA 3GFKA 3I9V2 5JCUA 3RHBA 3D5JA 3WGDA 3KTLA 4Z7XA 2HRFA 13GSA 6GSVA 3UJ1A 2REMA 4YAPA 3R2QA 2P5QA 2KP1A 1QMVA 5L71A 3ZFBA 5FT3A 2L5LA 2K8VA 1SJ6A 3HY2A 3W8SA 3GNJA 1LBKA 1M7TA 5HR1A 3GL5A 4BVYA 4EUYA 1A24A 5C00A 3HD5A 5IQYA 20GSA 3RAZA 3FZAA 1T4YA 3C1RA 3HXSA 1ZMAA 1O8XA 1SJZA 1ILOA 1T1VA 2F51A 4OCEA 4QQ7A 1GL8A 1HNBA 1WP0A 3KXOA 2E2MA 5CREA 3LFLA 3NOFA 5GAND 16GSA 1Z6NA 1GSQA 3ZVJD 5F07A 3BOAA 2H30A 3ERFA 4V2LA 5ID2B 4KSOA 2L59A 1R4WA 2FWFA 4IS0A 4L5OA 4K0GA 2AV4A 2XBQA 1XFLA 1JZRA 5G2ZA 2P31A 1XXUA 3ISOA 4KDXA 2QSIA 1K0AA 2R3XA 5B7CA 1Z7RA 3WT1A 5GSTA 2RIIA 1UC7A 3IRAA 5COHA 3KMNA 4IQ1A 5H5QA 1W4VA 3RDWA 3NIVA 2C80A 4IVFA 2LRTA 2IPAA 4TW5A 5DALA 2YNXA 3KMOA 1OC9B 1Z7PA 2OJLA 3ZLPA 8GSSA 3VPTA 4BVXA 2EIOA 1NSWA 1KBNA 3VURA 3F4TA 2I3YA 3JCML 2PUKC 2RLIA 3TJKA 3F0IA 5A5KA 1O8WA 1WJKA 2LNTA 3TGZA 1VGLA 3Q74A 1USBA 3HCZA 4XCSA 1G0TA 2MZCA 3C1SA 4IBPA 5CO3A 5ENUA 3LEFA 5IMVA 2V6KA 2RUFA 3IOSA 3UEMA 1HYUA 3ED3A 5HR2A 2V1MA 2IMEA 4PQHA 5H5SA 2K18A 1K0CA 6GSXA 1AUCA 4XS4B 4WBRD 2O85A 2YPMA 3EE2A 1G7EA 3IDVA 2YOIA 1PSQA 4KDUA 4X1UA 4XRAA 2DIZA 2I9HA 4V1Ag 3N9JA 4WF5A 4RUVA 2JU5A 2LQOA 3F6DA 4TXOA 4ZILA 1SL0B 1VF1A 2OADA 1XBSA 3ERGA 2DIYA 4GF0A 1EEJA 5IM9A 4BA7A 3P8WA 2I4AA 1PL2A 1F3BA 2YP6A 3GTUB 1ZZYA 1TP9A 3IV4A 2MMZA 2L6CA 4EC0A 3TCOA 3FRCA 4OFTA 1PKZA 2WULA 4JEDA 3D21A 1TI1A 5JWRB 1PMTA 1Z9HA 4ZIJA 2O8VB 3W8JA 1T4ZA 4MZBA 2AB6A 2DMMA 6GSTA 1QQ2A 2IN3A 6GSYA 4NXIA 5KN3A 2H74A 1ZOFA 5ECIB 1B8XA 3VWWA 2LSTA 2B3SA 1FB0A 4FYCA 4J56E 3M9JA 5ECOB 4K2DA 1YDKA 2GSRA 2E2GA 2LJAA 1EV9A 3F3RA 3KIJA 1AQVA 4OWYA 1EP7A 4HJMA 5B8BA 4AJ6A 1GTAA 1S3CA 3MAKA 5D9VA 1M2BA 4PQ1A 1K3YA 1URMA 2DC5A 5HQPA 2VL3A 2GS3A 1GNEA 3QFBC 3IPZA 4JR4A 2CAQA 3IC4A 4GRFA 2HZEA 3TKSC 4HJ2A 2PWJA 3ERWA 2GGTA 4KGIA 2JACA 2RM5A 4JBBA 1SD8A 2X8GA 5IMDA 3TB2A 3FKFA 2FHEA 1TTZA 5IPHA 5A4UA 2F8FA 3LWAA 5DCGA 1XVWA 2L4CA 5A4VA 4V1Ap 2LKUA 2QGVA 1ERVA 1M0UA 4KB3A 3LSZA 3D22A 2FA8A 3HKRA 5LCZA 2F9SA 4TR4A 1ABAA 2KUCA 4MLYA 3QOUA 5ECLB 3TUEA 2C3NA 1VF4A 3TKQA 2GQLA 2OA7A 1ZGNA 4P3YB 1E6BA 3IAS2 1GTBA 4V2MA 2TRXA 4TN8A 2LEGA 4N10A 3GH6A 1XWGA 1SYRA 3G9BA 1GRXA 1X5CA 4IGJA 1CQGA 2VLUA 2TIRA 1OKTA 1WRYA 3TDGA 3A2XA 2K9FA 4WXTA 18GSA 1U6TA 2C0FA 1M9AA 3WGEA 2YV9A 2VCTA 1YJ6A 4DVCA 5CNWA 3Q6OA 3A3TA 4GSTA 2VCWA 3D4TA 4RQXA 4JRRA 1A8YA 4F0CA 2BJXA 4PURA 3W6GA 1S3DA 2H1AA 5CAXA 3FR9A 2HE3A 2FUG2 1TXXA 1V98A 5GAPD 2ALBA 3CTGA 4K7OA 3EVIA 3VFIA 3GMFA 1XCCA 4HZ2A 1PGTA 4OFNA 4GQFA 3L9SA 4LL1B 1DUGA 4Q5FA 3DKSA 2C0DA 4TRXA 2PU9C 3H79A 2F3MA 1F3AA 2KP2A 3C8EA 3PINA 2VL9A 4JR6A 4KE3A 2R2JA 2IJYA 4IP1A 4MH3A 1GUKA 2IMKA 2DJ2A 2FLSA 2GQKA 3ME7A 2IFQA 3GN3A 3M0FA 1DBYA 3ZMKA 1Z6MA 4GSSA 5IMCA 2NTOA 3GX8A 1GWCA 5D9XA 2WGRA 4ZB6A 1EZKA 5IOWA 3CTFA 4MMMA 4XRDA 5G30A 4OO5A 4E8EA 4NAXA 3DEXA 1XPVA 4X43A 1SK0A 1ON4A 4BWSA 3A5WA 3HJPA 3CSJA 2XPDA 1TKDB 2GTUA 5F8BA 1V9WA 3QPMA 3GSTA 2B7JA 5KN2A 2YJ7A 2RM6A 4JE1A 3EWLA 4BWQA 4J2FA 1A0FA 1TRVA 1QFNA 4MZWA 4GTUA 4POMA 4DSSA 3QD9A 5B6NA 1O73A 3DWVA 3FEUA 5DJLA 3TKRA 2H1DA 4MDCA 3U6VA 5LD0A 1ERWA 1THOA 5F05A 5HR3A 1FVJA 4IP6A 2FD3A 1I5GA 3ZITA 3GKNA 1X5DA 3H4KA 1A8LA 1Q4JA 1OKDA 4TR1A 5D93A 4ACSA 1F37A 1WE0A 2IIYA 5CYYA 2YZUA 1TDIA 1SYXA 1NW2A 3HDCA 1BX9A 1OE7A 1RQMA 3GYKA 1GH2A 3FK8A 1K0OA 4CW9A 1K0MA 1FHEA 4I8BA 1XW5A 1F6MC 3IHQA 5AIVA 2B6MA 4HUAA 5FHIA 2N5FA 4ECJA 3KGKA 4GSNA 4HZ4A 4POBA 2Z9SA 3QFAC 1H75A 4HEA2 1AW9A 2PMTA 1UA5A 4OCFA 1B4PA 3DD3A 5INYA 4MF6A 3GKMA 3P7XA 1F2EA 2LQQA 4XHMA 3TKSE 2CX4A 4WR5A 3E9JB 1TRUA 4EXJA 3QMXA 2FWGA 5CRWA 4XS1A 4D73A 5DQSA 3TRXA 5ECMB 1ZYEA 4O92A 3I69A 4J57E 5JWQB 2CZ3A 3IE3A 4PUAA 3DVXA 4ZB9A 1PX6A 4LMWA 4MCUA 3S9FA 4L0UA 3WYWA 1QK8A 4RI7A 4HU9A 1B4QA 3EMXA 5ECKB 3IA1A 1Y25A 4TKYA 2ON5A 2B5XA 5EVOA 4NV2A 17GSA 1OAZA 3WGXA 1CQHA 3C73A 1B9XC 2VCVA 3EU3A 2DLXA 3FZ9A 3LORA 2GSTA 4G19A 4Q5RA 3EC3A 4PX1A 1YY7A 5EY6A 4PNFA 1TI3A 4KNDA 5ECNB 5HFKA 1A23A 5J9BA 2B7KA 4GXZA 3M9KA 4MK3A 3D4MA 3ZRDA 1HQOA 1YKAA 2JZTA 2J23A 2DJ0A 4N30A 3VPQA 2X8HA 3RHCA 2LJRA 5DBQA 4YQVA 3KCMA 3M3MA 2HFDA 3ZMLA 1X0RA 3ZIVA 1YF1A 1G6WA 4AGSA 4POLA 2H71A 5DALB 1T7PB 3DYRA 1HD2A 3I6AA 3HZ4A 1FO5A 4LL4B 3UBKA 1XW9A 3MSZA 2IMIA 2G2QA 3Q18A 4IJIA 4EE0A 5D9TA 1LU4A 4NHWA 4YQUA 3ZREA 1N2AA 1UN2A 3M1GA 1DE1A 4ZL7A 2OBKA 5IMAA 5HFIA 4H86A 5AGYA 2H76A 3UBLA 1YZXA 1GLPA 3ZIJA 1TW9A 2DJJA 2LUSA 1G6YA 4XS6A 2K6VA 3UARA 2LTKA 1X9MB 3DGQA 2ZCTA 2CAIA 2GVPA 3TKPA 1XWAA 1NM3A 3BD2A 2H70A 3IBHA 2IMFA 3CYNA 3VWVA 5G1LA 2WZ9A 2YJHA 2VCZA 2NBSA 3H8QA 1TU7A 1K0BA 4PUFC 5ELGA 4HQSA 2GSQA 3FR3A 2VOCA 3KP9A 4FH8A 3VWUA 2R37A 6GSSA 1FOVA 1Z3EA 3L9UA 4TXOB 2DJKA 3MNGA 3WD6A 5IIZA 1FVKA 3TKSA 1PD21 3SBCA 2CT6A 2VM2A 3IAM2 1XWKA 2YN1A 4HDEA 2MBTA 3VLNA 2N5BA 4AF2A 1SENA 5C04A 2O89A 1AQWA 19GSA 3F9UA 4ZBDA 4ZL8A 1X5EA 2YV7A 1DE2A 1EGOA 2OE1A 5DAKA 2VD1A 4KH7A 1MD4A 2P5RA 1Q98A 2B5YA 1A2JA 2YWOA 1JZWA 3GSSA 2PVQA 3KJYA 2VCXA 4I6XA 2VL2A 1IYHA 1H4OA 4IELA 4FYBA 2MMAA 1AIUA 3O3TA 3C71A 2AAWA 2QKEA 3E0UA 1PRXA 3L4NA 2L4QA 1GSYA 4FO5A 3KD0A 3L9VA 5G5FA 3BJ5A 4LLRA 3N5OA 3EMPA 5HR0A 1MEKA 2X64A 4GCIA 3RPPA 2XC2A 3F4RA 3P90A 3KTBA 2R4VA 1K3LA 1XWBA 5EL8A 4NHZA 4K9ZA 2LJKA 2C8UA 2HZEB 3VWXA 2VUPA 1F9MA 4AJ8A 2C0EA 2CQ9A 4TOPA 5DVBA 1V58A 3IXRA 2OBIA 2LS5A 2JSYA 4HU7A 4L8EA 2I81A 4NWYA 2VIMA 1QGVA 1PQNA 5AN1A 4MF5A 3TJJA 1AXDA 2VAFA 4YH2A 4EDYA 3WT2A 2CA8A 4HI7A 4K7IA 10GSA 5AISA 4ID0A 1MD3A 1TK0B 2PN8A 5ELAA 2VLVA 1PKWA 3CMIA 3CSIA 4OFMA 4MPGA 3UOMA 2BMXA 1GLQA 2ZNMA 3FZ4A 1C72A 5ECPB 12GSA 1XIYA 4JU5A 3D0ZA 3ZZXA 2M80A 3FW2A 1HNCA 2H1GA 3L0HA 2PBJA 3HVVA 4K6XA 2N5AA 5FWGA 4HS1A 2KOKA 1V2AA 2HZFA 2XPEA 2RUEA 3VI7A 1VF3A 1TRSA 4EL1A 2H75A 1SU9A 2VLTA 2NPBA 1AC1A 2YWMA 2XHFA 2HI7A 3EYTA 2DMLA 5DCHA 2J9HA 5B6MA 4YQMA 1R26A 22GSA 4KW6A 3GRXA 5IPGA 4ISDA 4MF7A 5CRDA 1ERUA 2L6DA 3LXZA 5G5EA 3HZ8A 1GULA 1J9BA 2JL4A 2LRCA 2IMDA 3US3A 4L0WA 4FYUA 2H0HA 2M72A 3EU4A 5IMFA 1V40A 9GSSA 3FHKA 1HNAA 1TOFA 4KCEA 1EV4A 5D96A 1J0FA 2G0FA 2AJQB 1NHOA 2GZPA 2FGXA 2ES7A 1SL2B 1FG4A 4IW9A 1ML6A 3F6FA 3QAGA 1B48A 6GSUA 4EVMA 2DBCA 1BG5A 4MJBA 3VI5A 2HYXA 4GQCA 3HVSA 1AQXA 3PH9A 1EOGA 5G31A 3EURA 2H0GA 3M8NA 3QDNA 2VD0A 4HQZA 4ZBAA 1XOAA 3AY8A 6GSWA 2CV4A 1W89A 1X9SB 2V6OA 1YEPA 3HA9A 4RI6A 4NMUA 3LGCA 1ACVA 4KAEA 1FW1A 4N11A 1TRWA 5J4UA 5IO2A 1GTIA 2E7PA 4I97A 2IFQB 3ZYWA 4WR4A 3LYPA 2FY6A 1GSDA 3GL3A 1G7OA 2B1LA 3GURA 4G9HA 5E4WA 4EF0A 2ZUPA 3G7JA 2O87A 1JFUA 3Q19A 2HSHA 4K7NA 4WEYA 1SKRB 3O6TA 1T8EB 1B9YC 2LV3A 3KEBA 3RBTA 1WIKA 2JZSA 4G10A 5ID2A 1NHYA 4ML1A 3IK9A 1WWJA 3I43A 2MMNA 2JSZA 1GSUA 1M2AA 4IHUA 4WBJA 1WPIA 2L57A 3GHAA 3V1WA 3CXGA 4MH2A 1ST9A 7GSSA 1Z5YE 4ZL9A 1JZDA 3IR4A 3H1NA 3F3QA 2IWTA 2FCHA 1WOUA 3LXTA 2AHEA 4DSSB 3QCPA 3FZ5A 2EC4A 2FWHA 5DQYA 1MTCA 1XVQA 3NZNA 1XWCA 3APOA 5H5RA 2X8CA 2R6KA 4O7HA 3KZQA 1KNGA 1M9BA 3O76A 3CBUA 2PPTA 1ZCPA 4MJEA 2YWIA 4KDYA 4TR1B 1OC9A 2DSAA 5ABRA 2V32A 1A2LA 1XOBA 4LA1A 3J7Yb 5JCGA 1U3IA 3ZFLA 3F8UA 3GKKA 4MJCA 5CRGA 1QXHA 2WJUA 4POKA 1OVNA 3GIXA 5JCWA 3A2VA 5D73A 3TJBA 4O5RA 1RK4A 1TJDA 1X9WB 3QAVA 2A2RA 1O7UA 4ZBBA 1O6JA 4N0VA 3APSA 3BCIA 2JZRA 3F63A 1GSEA 2ON7A 2LNSA 3UVHA 2OACA 4K1FA 4F03A 3LJRA 4EDZA 4I5QA 4KCAA 2EIRA 2WRTA 4TXVA 1BQ7A 4WKWA 1I9DA 2HLSA 4XS4A 4KX4A 4WETA 3TOTA 3ZL5A 4N0ZA 4Q5NA 2L5OA 2HXKA 4MPFA 2GT5A 4BPYA 2PERA 1SK2A 1BAYA 4QL9A 4D73B 1A0RP 2FNOA 3GH9A 2V41A 4OMVA 1BYEA 5ECHB 2VM1A 5GSSA 2GQMA 5IMZA 1U87A 4TVEA 1SKWB 2CX3A 2BTOT 4MJAA 4ECCA 1DSBA 2VO4A 3J7Yk 2GZYA 4BL7A 3UAPA 2V2GA 2XBIA 4O32A 3OR5A 3GTUA 2OKAA 1N8JA 5ECSA 3QAWA 1EEMA 5E59A 2D2ZA 5F06A 2HT9A 1EGRA 1O81A 4OD7A 2HRNA 4MP4A 2NDOA 1QUWA 2H6XA 4PQIA 2GSSA 1PA3A 2H1BA 1BEDA 5J9CA 4LMVA 2MMOA 1THXA 1OC8A 3L78A 1JZOA 5KEJA 4ILFA 4DSRA 1JLWA 4I2UA 4DEJA 2VCQA 4ZB8A 2KLXA 4IN0A 1EWXA 2C3QA 2K8SA 3MWHA 4JZQA 3TOUA 2WCIA 1IYIA 4MABA 1T00A 2FWEA 3APQA 4KUNA 1S3AA 1OYJA 4GLTA 2JADA 4NV5A 5D9WA 2YANA 1EP8A 2C4JA 3EINA 1GP1A 1U3AA 1U88A 3LQ7A 14GSA 3HVXA 2C3TA 3FYGA 3A2WA 3FY7A 2A4VA 1K3OA 1K0DA 2M46A 3P2AA 3DVWA 1FAAA 1R5PA 5J5NA 1TK8B 2PVOC 1JLVA 4IJ3A 1EOHA 2AYTA 2H6YA 3F4SA 4E8HA 1PL1A 2H0IA 2CVDA 3KH9A 2HSYA 4YAVA 1PX7A 2HNLA 3G7YA 2OE0A 4PNGA 1MDIA 4Q5QA 1T3BA 2DJ1A 5DJMA 2C0GA 4ML6A 1SL1B 2KHPA 5EPFA 1BJXA 4V2NA 2LRNA 4XIHA 2I1UA 1ZYQB 4RQRA 3TJGA 3GX0A 3UIWA 4X0XA 2IL3A 5HFGA 4IKHA 4ECIA 2H72A 4TR3A 3BCKA 3MDKA 5JWOB 2P0GA 1J08A 4KA0A 4MZCA 2X99A 3PGTA 1JHBA 4CHSA 5KN0A 3E3EA 4HOJA 2YZHA 1E2YA 4K0NA 2C1YA 1VRSD 5IO0A 5D8IA 3TRPA 2OE3A 1Y6EA 1LJRA 3G7IA 3DIEA 3ZVJA 3LG6A 4DSQA 1TU8A 5DAKB 1GUMA 1GSSA 4F9ZA 1GSFA 1GUHA 3ME8A 2NVLA 2H19A 5KN1A 11GSA 4EKZA 1YQ1A 3DXBA 4PXOA 4QL7A 4ECBA 1GTUA 3TJFA 3FR6A 2H01A 2EIQA 1MDKA 2H73A 3DMLA 2B1KA 2A2SA 3KH7A 5IOXA 4TR0A 2PGTA 2WS2A 4K8MA 2VL2C 3TRQA 5A4WA 1SK1A 3GKXA 3HHVA 1MDJA 3UMAA 3GUSA 3D6IA 2QC7A 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chains in the Genus database with same CATH superfamily

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chains in the Genus database with same CATH homology

#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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3APSA

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