2X8CA

Thioredoxin glutathione reductase from schistosoma mansoni with the reduced c-terminal end
Total Genus 173
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
173
sequence length
588
structure length
588
Chain Sequence
GTSQWLRKTVDSAAVILFSKTTCPYCKKVKDVLAEAKIKHATIELDQLSNGSAIQKCLASFSKIETVPQMFVRGKFIGDSQTVLKYYSNDELAGIVNESKYDYDLIVIGGGSGGLAAGKEAAKYGAKTAVLDYVEPTPIGTTWGLGGTCVNVGCIPKKLMHQAGLLSHALEDAEHFGWSLDRSKISHNWSTMVEGVQSHIGSLNWGYKVALRDNQVTYLNAKGRLISPHEVQITDKNQKVSTITGNKIILATGERPKYPEIPGAVEYGITSDDLFSLPYFPGKTLVIGASYVALECAGFLASLGGDVTVMVRSILLRGFDQQMAEKVGDYMENHGVKFAKLCVPDEIKQLKVVDTENNKPGLLLVKGHYTDGKKFEEEFETVIFAVGREPQLSKVLCETVGVKLDKNGRVVCTDDEQTTVSNVYAIGDINAGKPQLTPVAIQAGRYLARRLFAGATELTDYSNVATTVFTPLEYGACGLSEEDAIEKYGDKDIEVYHSNFKPLEWTVAHREDNVCYMKLVCRKSDNMRVLGLHVLGPNAGEITQGYAVAIKMGATKADFDRTIGIHPTCSETFTTLHVTKKSGVSPIV
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

molecule tags Oxidoreductase/flavoprotein
molecule keywords THIOREDOXIN GLUTATHIONE REDUCTASE
publication title Mapping the Catalytic Cycle of Schistosoma Mansoni Thioredoxin Glutathione Reductase by X-Ray Crystallography
pubmed doi rcsb
source organism Schistosoma mansoni
total genus 173
structure length 588
sequence length 588
chains with identical sequence B
ec nomenclature ec 1.6.4.5: Transferred entry: 1.8.1.9.
pdb deposition date 2010-03-08

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00462 Glutaredoxin Glutaredoxin
A PF02852 Pyr_redox_dim Pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase, dimerisation domain
A PF07992 Pyr_redox_2 Pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.30.390.30 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Enolase-like; domain 1 Enolase-like; domain 1 2x8cA04
3.40.30.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich Glutaredoxin Glutaredoxin 2x8cA01
3.50.50.60 Alpha Beta 3-Layer(bba) Sandwich FAD/NAD(P)-binding domain FAD/NAD(P)-binding domain 2x8cA02
3.50.50.60 Alpha Beta 3-Layer(bba) Sandwich FAD/NAD(P)-binding domain FAD/NAD(P)-binding domain 2x8cA03
1QJDA 3DJGX 2I81A 4X4JA 1RK4A 3UVHA 3RHCA 2E5VA 2XVHA 5IPGA 2VVMA 3FRCA 5KVHA 2PBJA 1GWCA 2CAIA 1FVKA 3KIJA 2V60A 1MDIA 4F03A 3D4TA 3CNSA 3FK8A 2Y6RA 18GSA 3GMBA 3U5RE 1B48A 4J2FA 1OYJA 4PQHA 2R0GA 3RP8A 3DIEA 3OC4A 3AY8A 1USBA 5JCMA 1G7OA 3QVRA 4ZB9A 3Q74A 2TMDA 3GWDA 4NHZA 1ZCPA 2H74A 4NEWA 1MD3A 4V1Ag 1K0JA 4KX6A 2YWLA 3AE4A 2K8SA 4CCRA 2DIYA 3P9UA 1F3BA 2R4VA 2YLTA 3NOFA 1KTEA 5L71A 2WPCA 2TRXA 3FHKA 4JR4A 2XDOA 2V61A 2RUFA 4YTPA 4YSZA 1S3CA 2VCZA 3RPNA 1PHHA 5J9CA 4BVXA 1PJ6A 3ALLA 3TUEA 3GL3A 3CRTA 2VQBA 4K2DA 2TPRA 4IGJA 4JN9A 2RGHA 3NYCA 4FYUA 2XVJA 1GPEA 4C74A 1L0VA 1GSNA 4Z2RA 3HHVA 4HI7A 4GSTA 3BBYA 2F5ZA 2R2JA 5F07A 1Z6MA 2BK5A 4ISDA 2JKCA 1QMVA 1WMJA 2IWTA 1D7LA 1DXLA 3DRNA 1EEMA 1PJ7A 4ML1A 1OE8A 1OKDA 2BTOT 4F82A 1XWCA 2OAMA 3O0HA 4NPBA 2B5EA 5ECIB 3TJFA 1DODA 1P2HA 1DNCA 2LQQA 3VWXA 3GRSA 4B67A 1FW1A 1JZOA 2H76A 2F3MA 3ZDNA 5IMDA 1VF1A 2HI7A 2BC1A 5GAND 5U25A 2VCXA 2LNTA 4L5LA 4V2MA 3GH6A 5E4WA 4GRTA 2GT6A 2VUPA 3HCZA 4J2WA 1CBOA 2OACA 2PN8A 3GNJA 1EGRA 3GX8A 4KGIA 1H82A 2YLWA 2H89A 4EM4A 3TJJA 1F8SA 1X5DA 4GTUA 4K7NA 1TKDB 1NHSA 4GF7A 2XFOA 3II4A 3APSA 4RSLA 3Q6JA 2IN3A 4LIIA 4OPCA 4H4TA 1N4UA 3ISOA 5IO0A 2PVQA 3BI5A 2AYTA 2ON7A 2MBSA 2JB3A 4HS1A 3NT6A 3BI4A 4IKHA 1CQHA 5GRTA 1CQGA 1LTXR 4LLRA 3M12A 3IC9A 1D4DA 4AOXA 4ECCA 2CDUA 4K8DA 2YV9A 4YAVA 1K4QA 2BS3A 3UAPA 1TU8A 3UCLA 1MEKA 2V3BA 3M0OA 2BS2A 4KSOA 4ECBA 2GMHA 4DSRA 1B37A 3F8UA 1X9MB 11GSA 2GZYA 2GQWA 5IMAA 2XVFA 4IS0A 4KPRA 4BL7A 1FVJA 4JQ9A 2Z5XA 5IMFA 3NN6X 4K5RA 5KEJA 3RHAA 4ACSA 4QQ7A 3KU9A 1TRVA 3CTGA 5D9VA 3ZZXA 2C4JA 2VD0A 1GALA 2IVDA 2CVKA 2HE3A 1XWKA 4EQRA 4BWQA 3GUSA 3DD3A 4CW9A 2HZEA 2FA8A 5JWOB 4EM3A 4C3XA 2DJ0A 5ELAA 1XZOA 3EAOA 5KN2A 2YR6A 3I69A 1BX9A 1VGLA 4PQIA 4TXOA 2K8VA 3CTFA 2C3NA 1SYXA 4MLYA 1FG4A 2VL9A 3ERWA 3UOZA 3AEGA 3O3TA 3K7MX 1H7XA 3GSIA 3FPZA 2R45A 5J60A 1NHQA 1S3AA 2VD1A 1GNWA 1Z7RA 2VLUA 1TYTA 1HYUA 2VVLG 3C96A 1K0IA 4AP1A 3F6FA 1G6WA 1JRYA 1SL1B 3VURA 3M8NA 4WXTA 4KE3A 2GRTA 3TCOA 4I2UA 3AE9A 1LVLA 1XBSA 3UTGA 4FK1A 5KOWA 1A0FA 4K22A 3TKSC 3FY7A 3HZLA 2R4EA 5AIVA 4Y4MA 5KRQA 1F3PA 4PURA 4O92A 2LNSA 3JCML 1NDAA 2BC0A 2YVJA 4CHSA 1TK8B 4TR0A 1M99A 3GWFA 1WP0A 1GERA 1SJZA 3DGQA 4CCQA 1AOGA 1QK8A 3VR8A 2X8CA 4F0BA 1Q9IA 2HRNA 2Q0LA 2C1YA 2C73A 2H73A 3C8EA 1YKJA 2DLXA 4YQUA 5IQ4A 2GR2A 4EIQA 3C73A 1OJTA 2R0CA 1ZYQB 4HUAA 3GKKA 5FS7A 1PQNA 2R6KA 4K9ZA 2VCVA 2AQJA 3TOTA 4RQXA 2JK6A 2A2SA 4DSSA 2VO4A 3GYKA 4NTEA 1PRXA 4DSHA 1K3YA 4AP3A 1NHRA 3LADA 4EQSA 3EVIA 4B68A 2YZHA 1SK0A 3VPQA 3UBKA 1F6MA 3ERGA 1SJ6A 3CMIA 2VIMA 1GSUA 1BZLA 3LXTA 3ZL5A 3BOAA 4H4UA 3LFLA 2LS5A 4E8HA 3GMCA 3HA9A 3CNTA 4HDEA 1NAAA 2VOUA 5CRHA 3C7MA 2IFQA 2K9FA 2LKUA 3WT2A 1NHYA 1UN2A 3GTUA 4X0XA 2GQLA 1WPIA 2WRTA 1O5WA 2F9SA 4YTNA 5LNKe 5FS6A 2APGA 1MD4A 5G5EA 2V41A 3ZYXA 2JACA 3M0FA 1VRSD 4IA6A 4Z2UA 4ZN0A 3IE3A 4X1UA 5H5QA 1NG4A 2ZNMA 1J9BA 2VVLA 4A7AA 1PBFA 3AECA 3LXDA 3UKAA 4BJYA 2CAQA 2JB2A 1F8WA 1S2QA 2GS3A 4PNFA 1GNDA 2FJBA 2YG6A 4AJ6A 4KA0A 5CYYA 1YQ3A 3FIMB 1GLQA 1ONFA 2HSHA 5J4UA 1G6YA 5DCGA 1ZKQA 2KUCA 3EURA 4NWYA 2FA4A 4IP6A 2OBIA 3CNPA 1ERUA 1GTIA 1H75A 2L4QA 4UDQA 5TR3A 4POBA 4HA6A 4POMA 3KEBA 5DAKA 3A5WA 1ILOA 2CT6A 1EGOA 4ZB6A 2FHEA 4DSSB 2JSYA 2X3NA 4U8PA 2YG7A 4U8NA 4Q5QA 2YQUA 3QJ4A 4IQ1A 2LJKA 1O7UA 2PVOC 2R5GA 4B65A 2WBAA 1PX6A 1DSBA 1SK1A 2E7PA 4NV2A 1GSSA 4LMWA 3NYEA 1JLVA 4GRFA 3RNMA 4GXZA 4IV9A 3RP6A 4K6XA 3D22A 3VWUA 4JR6A 5F0GA 1KF6A 2BACA 2ZZCA 4WEYA 2GR0A 1PJ5A 4NXIA 4EE0A 1AXDA 1GXFA 4YKFA 4MMMA 2WOVA 1ZMAA 2GQFA 4U8KA 4IHUA 4EL1A 2YWOA 3HD5A 1ZGNA 2IFQB 2PYXA 2O7KA 1YKAA 5EL8A 3GTUB 1XFLA 4TXVA 1OC9A 1GUMA 2HT9A 3LGCA 4AT0A 3AE2A 4N30A 3KH7A 3O6TA 3EPTA 4K5SA 3LZXA 3E0UA 1LBKA 3A2XA 6GSYA 3GURA 5IOWA 1YY5A 3HKRA 5B6NA 3HJMA 1TDIA 2IJYA 3GKXA 5A5KA 1KNPA 1NHOA 5ECQB 2VRLA 4KSMA 1AQXA 2C0DA 3HVVA 5G2ZA 3M13A 1U3IA 1F6MC 4J36A 3UOVA 2YVGA 3S5WA 1WE0A 3GH9A 1GETA 4XS6A 1K0DA 5G5FA 2Y6QA 3DK9A 2RLIA 3ITJA 2K6VA 4TRXA 1LU4A 3FKFA 5CAXA 2KHPA 4H4VA 2L6CA 5J5NA 3EANA 4KDYA 4WX1A 5DAKB 5H5RA 2OALA 4IN0A 1TRSA 2EQ8A 1T00A 1ZY8A 4A99A 1CL0A 5DBJA 2GR3A 4PGTA 1B4QA 1V59A 1WWJA 2YLXA 2OE3A 4KCAA 2OLNA 4ECJA 2DMLA 3CGDA 3BD2A 1CJ2A 2YZUA 4G10A 1PGTA 2DMMA 2C75A 3RBTA 2WDUA 3AD9B 1V9WA 2BXRA 2H19A 3UKLA 3ME8A 2HXKA 2VOCA 2BABA 4YQMA 5E59A 3UKPA 3RDWA 4G2EA 3KLJA 2Q7VA 4A79A 2BXSA 1WIKA 5ABRA 4OVIA 3LORA 1LPFA 1SEZA 5KOXA 3I6DA 3EU4A 2C67A 2CA8A 4RI7A 2NBSA 5ECMB 4AJ7A 1OC9B 4F9ZA 1U87A 1PMTA 3GDNA 1TJDA 3TJKA 4Z44A 1I9DA 4OO4A 1ZMCA 1ZYEA 1Z3EA 3AE1A 4WCTA 2DBCA 2WDVA 4BVYA 1B4VA 3J7Yk 2H72A 1EOGA 2LEGA 4JDRA 2KP1A 1MOKA 1IYHA 1NEKA 1WOUA 3PR8A 1J0FA 1AC1A 3QSSA 1NM3A 3MNGA 1T8EB 4V2LA 3UKHA 3GSTA 1R5AA 3E1TA 2BK3A 5CRGA 3ZFLA 2PHHA 1LV0A 3CRUA 4KUNA 2M80A 3GV1A 2XCGA 1A23A 1O95A 3NK2X 1AIUA 5ECSA 2VL2A 1T1VA 5GSNA 1VRQB 2ARDA 3IV4A 3VRDB 3AEDA 5COHA 1I5GA 1TTZA 2JSZA 2XBIA 4CNJA 5B7CA 3D8XA 1MDJA 1YQ4A 1ZP0A 5HYMA 1GESA 2YWIA 1JEHA 2J3NA 5J9BA 5EVOA 5KVIA 1F37A 1K0NA 2FWGA 4CY8A 4FYBA 2C3CA 1M2DA 1DE2A 1XW9A 3UBLA 2B7RA 4U8LA 2IIYA 1BYEA 1DOEA 2C76A 4Z25A 3BHFA 4L5OA 5U1OA 5FMHA 1G0TA 1IUXA 2B7SA 1VF4A 3AEAA 1NG3A 1GEUA 1PKZA 1ZZYA 1KFYA 1XOAA 1W4XA 2P31A 2LJAA 3TKRA 4G19A 22GSA 3UVTA 5EOWA 1AQWA 3QPMA 1PXAA 4DGKA 1TW9A 1M9BA 4H86A 2GV8A 3GFKA 4G9HA 4OPTA 1E1NA 1GUKA 2IIDA 5U63A 3QFAA 2E0QA 2GLRA 1CJ4A 2V2GA 2LRNA 3QAWA 1SL0B 1X9WB 2VCQA 4MJBA 2NVKX 3CNJA 2P5RA 2GH5A 1GREA 5ELGA 5HY5A 4TW5A 3CSJA 3MDKA 3HJPA 2J9HA 3NIVA 3NKSA 3VWWA 1YKCA 1ERVA 3HY2A 1R4WA 5ECNB 4BV6A 4HU9A 3L9UA 4FH8A 3I3LA 2H8LA 2NDOA 3APOA 3AYIA 2A8XA 2IVEA 5DVBA 1YF1A 1TDEA 1T4ZA 3KMOA 5JCUA 1GSYA 1QXHA 2XLRA 3AD7B 5ECKB 2DSAA 2JU5A 4HJMA 3B3RA 1SYRA 3QD9A 3AYLA 5BRTA 4IQAA 1MO9A 2JBVA 4U8JA 2YPMA 2BS4A 2FWEA 5ECLB 5JCIA 2AAWA 3IOSA 4N0VA 2YCDA 4MP4A 1E1MA 2C64A 1GRFA 4ZBBA 3QCPA 2B7JA 1PBDA 5HHFA 3I43A 3F4SA 1Y0PA 4OWYA 2ZCTA 2KOKA 2FD3A 4GUVA 1QQ2A 4XS4B 2VL2C 3KZQA 2DKHA 1GTEA 2VM2A 3FMWA 1TRUA 4X43A 1LQTA 2B5YA 4QL7A 6GSSA 1ZK7A 3DMEA 3L78A 2YAUA 2GSQA 4JEDA 4ZCDA 3ICTA 2JADA 5HR3A 3UP4A 4HQZA 1GLPA 5EPFA 3CN8A 3CBUA 4XHMA 1L9EA 1VQWA 4PAAA 2C70A 5AN1A 1F9MA 2YP6A 4NHWA 4XS1A 3BCIA 3DGZA 4BA7A 2WULA 6GSVA 4OPDA 2WFCA 3L1RA 4PNGA 1HNAA 3D21A 4MK3A 1S3BA 4MA9A 1XPQA 3CSIA 1QFNA 1QLBA 3CSHA 1OVNA 2N5FA 1YY7A 3L0HA 2B1KA 1TI1A 3MAKA 3V76A 3ATQA 1NSWA 3F6DA 3F8DA 4K8MA 5ECOB 4YXDA 5DALA 5CQFA 3KD0A 3LOVA 2HZFA 1GRBA 4I6XA 3UMAA 2H0HA 2P5QA 1B8XA 5BVAA 2C0GA 2LRCA 3ZLPA 1CJCA 4Z43A 4GWRA 5D9WA 2R4JA 2RABA 1JZWA 1ZOVA 1PX7A 2YNXA 1DUGA 5J7XA 1VDCA 3IAS2 1VF2A 1AW9A 3M3MA 4DNAA 2VL3A 1Q1WA 3GN3A 1XOBA 4IVFA 2CV4A 2RM5A 2XVIA 1YEXA 3ERFA 4FIWA 4TN8A 4JU5A 4HU7A 1KEBA 2B7KA 1IUSA 4ECIA 3Q9TA 1BQ7A 1HNCA 2GSSA 4TM1A 3CGCA 2TIRA 4ZB8A 3HDCA 4TVEA 1B5QA 1D5TA 3VRAA 2XBQA 2DJ3A 1Q1RA 3N9JA 4FO5A 4A65A 2I0ZA 2C3QA 2WCIA 3CPIG 4EMWA 4EQWA 4IP1A 2L59A 5A4WA 3ICSA 2EQ7A 3F0IA 3VI7A 3UJ1A 3FZ4A 1M9AA 3I6AA 2C72A 4EF0A 1EP7A 2I4AA 1X5EA 4MJWA 5G30A 3EWLA 2YM2A 4REKA 4DSGA 5J41A 2VLVA 3R9UA 4YSHA 2BMXA 3GKMA 2B76A 2L5LA 4JNAA 2CX3A 5FWGA 2XLUA 2N5BA 2YV7A 1SENA 1W4VA 2B9WA 3DJDA 2V6OA 3UKQA 2A2RA 1OJ9A 2WU5A 3KP9A 2EQ6A 3KMNA 4B69A 3H93A 4J56A 1GRGA 2ZBWA 4EVMA 2H6YA 2WJUA 4APNA 1JRZA 4ZBDA 2H88A 1A0RP 2K18A 4KB3A 3UOYA 2KLXA 5DALB 4IA5A 2AV4A 1FB6A 2E2GA 1THXA 1A2LA 5IMVA 4DVCA 3LG6A 4N0ZA 1OC3A 3DK4A 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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 2AR8 A;  1VF3 A;  6GSX A;  4J57 E;  3KTL A;  4H4S A;  2JZS A;  3JZU A;  3KH9 A;  1OC8 A;  1ZMD A;  2OZT A;  2H70 A;  4GF0 A;  1PDZ A;  2Z9S A;  3WGX A;  1TZZ A;  1O8X A;  1EP8 A;  3SBC A;  1MNS A;  1QGV A;  3BHK A;  4HEA 2;  1O73 A;  3ED3 A;  2X99 A;  3K30 A;  4TLX A;  4P3Y B;  1D7Y A;  4K0N A;  3VFI A;  2C4C A;  2OLA A;  2POZ A;  4ZA0 A;  3DML A;  3V5C A;  2FJE A; 
#chains in the Genus database with same CATH homology
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