2X8CA

Thioredoxin glutathione reductase from schistosoma mansoni with the reduced c-terminal end
Total Genus 173
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
173
sequence length
588
structure length
588
Chain Sequence
GTSQWLRKTVDSAAVILFSKTTCPYCKKVKDVLAEAKIKHATIELDQLSNGSAIQKCLASFSKIETVPQMFVRGKFIGDSQTVLKYYSNDELAGIVNESKYDYDLIVIGGGSGGLAAGKEAAKYGAKTAVLDYVEPTPIGTTWGLGGTCVNVGCIPKKLMHQAGLLSHALEDAEHFGWSLDRSKISHNWSTMVEGVQSHIGSLNWGYKVALRDNQVTYLNAKGRLISPHEVQITDKNQKVSTITGNKIILATGERPKYPEIPGAVEYGITSDDLFSLPYFPGKTLVIGASYVALECAGFLASLGGDVTVMVRSILLRGFDQQMAEKVGDYMENHGVKFAKLCVPDEIKQLKVVDTENNKPGLLLVKGHYTDGKKFEEEFETVIFAVGREPQLSKVLCETVGVKLDKNGRVVCTDDEQTTVSNVYAIGDINAGKPQLTPVAIQAGRYLARRLFAGATELTDYSNVATTVFTPLEYGACGLSEEDAIEKYGDKDIEVYHSNFKPLEWTVAHREDNVCYMKLVCRKSDNMRVLGLHVLGPNAGEITQGYAVAIKMGATKADFDRTIGIHPTCSETFTTLHVTKKSGVSPIV
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
publication title Mapping the Catalytic Cycle of Schistosoma Mansoni Thioredoxin Glutathione Reductase by X-Ray Crystallography
pubmed doi rcsb
molecule keywords THIOREDOXIN GLUTATHIONE REDUCTASE
molecule tags Oxidoreductase/flavoprotein
source organism Schistosoma mansoni
total genus 173
structure length 588
sequence length 588
chains with identical sequence B
ec nomenclature ec 1.6.4.5: Transferred entry: 1.8.1.9.
pdb deposition date 2010-03-08

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00462 Glutaredoxin Glutaredoxin
A PF02852 Pyr_redox_dim Pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase, dimerisation domain
A PF07992 Pyr_redox_2 Pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.30.390.30 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Enolase-like; domain 1 Enolase-like; domain 1 2x8cA04
3.40.30.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich Glutaredoxin Glutaredoxin 2x8cA01
3.50.50.60 Alpha Beta 3-Layer(bba) Sandwich FAD/NAD(P)-binding domain FAD/NAD(P)-binding domain 2x8cA02
3.50.50.60 Alpha Beta 3-Layer(bba) Sandwich FAD/NAD(P)-binding domain FAD/NAD(P)-binding domain 2x8cA03
1FO5A 4LIIA 3ADAB 4EMIA 2YVJA 4NEWA 1UKVG 2J23A 2IVEA 2E2GA 1NHQA 2P31A 3AYLA 2IL3A 13GSA 1SENA 1UN2A 3EU4A 3LEFA 1DE2A 5M10A 2WP6A 3LB8A 4Y4MA 2H1DA 4K7OA 1H83A 1EWXA 1EL9A 2AAQA 3GRTA 1B8SA 3NT6A 2CVJA 1PXCA 2GT6A 3IHQA 4F03A 2VVLG 4H86A 2RABA 1YF0A 3EANA 3IC9A 2LV3A 11GSA 5LCZA 2F8FA 4OPDA 3C8EA 1Y0PA 3L78A 1IYHA 1SKSB 1H86A 2PUKC 2BABA 1P2EA 4H2RA 3GRXA 5J4UA 1KNPA 4QL9A 1R26A 2KOKA 3HJOA 3DJJA 2A2SA 5GSNA 1VDCA 1EP7A 4KSOA 1KFYA 2GZPA 3QOUA 2VVLA 2MMOA 2RLIA 3GSSA 3LZXA 1COYA 3T37A 2GV8A 4JRRA 2LRCA 4H2PA 5CNWA 6GSXA 2JK6A 4KPRA 1K3YA 1ZDLA 4KAEA 3KZQA 1XWKA 3ZIJA 1YDKA 5ECOB 2I1UA 1AC1A 5G5EA 1G6WA 1WIKA 3CTYA 2X8GA 4I8BA 1FCDA 1F8RA 1EBDA 4ZL7A 1Q9IA 2C3DA 1GLPA 3C7MA 3SM8A 4I59A 4HJMA 2JB1A 1O73A 1GSDA 2Q7VA 1THOA 3HYPA 3RBTA 2H1AA 1T7PB 3FR6A 3ZFBA 1AW9A 1VGLA 2DBCA 4K5RA 3VRAA 1OKDA 1HNBA 2IMDA 4TOPA 5ECRB 3UJ1A 1BJXA 3FW2A 1M99A 1WMJA 6GSWA 2AB6A 2RM6A 5ECPB 5HFKA 3C1SA 5A4UA 5B8BA 1O8WA 1YZXA 2WU2A 5L71A 2BS4A 3NGCX 3AE1A 4TM1A 3VR8A 2LJKA 1AQXA 3I6DA 1TOFA 2MMNA 1E6BA 3UL3A 1BWCA 3GMCA 1KF6A 4A7AA 4GSSA 1TDEA 2YM2A 4AT2A 5E4WA 1SJZA 4HOJA 3HJPA 2V2GA 1S2YA 1K0MA 2H73A 4PQ1A 3GURA 3D5JA 4KUNA 1VQWA 3PH9A 3QJ4A 3LQ7A 4X0XA 1O94A 5J7XA 2PWJA 1HNAA 1QMVA 2MBTA 1DODA 3NK2X 4J33A 1GRTA 2GRTA 3W6GA 3W8JA 4H50A 3D4TA 4EUYA 2MBSA 4YSZA 1Z6MA 4ILFA 2OBIA 1XCCA 4K0NA 4IHUA 3LJRA 4MZBA 2VQ7A 1YKCA 1JNRA 2EIQA 2ES7A 3FY7A 4D03A 3KIJA 3AD9B 2ZZCA 3DMLA 4JNQA 3TJKA 5ELGA 4G9HA 1AQWA 2O9ZA 3M0OA 2XFPA 4EDYA 3VWVA 1QLBA 4K7IA 2GQWA 4X9NA 1MOKA 1JHBA 1VG0A 2V61A 1GTIA 4ACSA 3AE6A 4E0VA 1PGTA 1B4VA 1CJ2A 4YQVA 2GR3A 3VWXA 4IELA 1ZY8A 3IC4A 2VL3A 3L4NA 5LV9A 4ECJA 2GR0A 3AEBA 1DNCA 2V3AA 3DK9A 3SQPA 3EMXA 4RI6A 2L6DA 4LU6A 1O6JA 1YY7A 2B7KA 4CHSA 3UP4A 4XIHA 4D73A 5A5KA 5AISA 1Y56A 1N2AA 3BNMA 5HR1A 2YVGA 4TXOB 2VVMA 1TRUA 5JWOB 2IIYA 1L9CA 3K7QX 3MWHA 5DAKB 2BYBA 8GSSA 3RP8A 4J36A 2L4QA 2BA9A 2GLRA 3FMWA 1BZLA 2H74A 1N8JA 3LADA 4JE1A 4Z7XA 1NPXA 1DOBA 3P7XA 3GDNA 1NDAA 3HHVA 5G30A 4I2UA 3TOTA 2FWGA 1YY5A 1L0VA 2CAQA 2XLSA 4B68A 1UC7A 4EMWA 2JSZA 4OFTA 3LOVA 2H0GA 2OE3A 3LWAA 5HYMA 2C8UA 4FYCA 2H30A 3PINA 1GERA 2RIIA 2XPDA 3LFLA 1XIYA 2NTOA 4HZ4A 1ST9A 3P2AA 2NDOA 2HZFA 2R2JA 2VCWA 2YR4A 4USQA 2E2MA 1K0IA 1Z3EA 4HZ2A 2WP5A 4KDYA 4BPYA 1X9MB 2VOCA 1FB0A 3PO7A 4B66A 4H4UA 3O0HA 3AE3A 2WFCA 2VLVA 4XRDA 2DKIA 4PQHA 2BS3A 5EOWA 1KEBA 2GT5A 1YEXA 2G2QA 1X9WB 2YZHA 4RG4A 1R4WA 3FYGA 5HR2A 1T1VA 4I97A 3F0IA 3F4SA 2YLWA 1B9YC 1XPQA 3L8KA 5EVOA 1OC9B 3VI5A 1PMTA 3FR9A 4U8KA 4PUAA 2GZZA 1YQ1A 1FB6A 2PYXA 4L5LA 2EQ9A 4MA9A 4YWOA 2B9YA 4Z2TA 4PXOA 5IMZA 1VRSD 2DLXA 4IGJA 5CRWA 5ECHB 2JZSA 1ZMAA 4YAPA 4IN0A 4NEVA 3HY2A 3AY8A 1PKZA 5IMCA 2C3CA 4I2TA 4TR1B 3I9V2 3R9UA 2YWNA 5B7CA 2LS5A 5GAPD 2DJ2A 3D0ZA 2C1YA 2I3YA 1GP1A 3B6DA 1CBOA 3RHAA 4K6XA 2LRNA 4JY2A 5BRTA 1F37A 2CVKA 2H0IA 4X1UA 1W4VA 2HNLA 3K7MX 4HQSA 2DJ3A 5BVAA 5DQSA 3FEUA 4GF0A 1QK8A 2B5EA 2YCDA 1G7EA 2R4VA 2GSRA 4YT0A 1LV0A 2EIRA 2LJAA 3GL3A 4DSSB 2Q0KA 3IF9A 2QGVA 3NTDA 3QFBC 1SL0B 4J34A 2YWOA 4YTMA 3GYJA 1JZOA 3ZLPA 4K8DA 2MYGA 3VQRA 4Y4LA 3ZITA 2YLXA 3A3TA 2AJQB 1OJCA 4ZBBA 1I5GA 1V98A 1SYXA 3KLJA 3ZIVA 2WBAA 5DDLA 1M64A 4H4YA 2VL9A 6GSSA 2AHEA 2XVJA 3P90A 4GLTA 1JLWA 2G0FA 3C73A 2H8LA 5JWQB 1GL8A 4C5OA 3CSJA 4KSMA 2DMMA 4EQRA 3E3EA 3ZTLA 3RPPA 3UOVA 1T4YA 5ECNB 4EQXA 19GSA 2F3MA 2VQBA 1PRXA 2C70A 4ML1A 3FK8A 3IOSA 2YPMA 3LSZA 3ALMA 1PL2A 2VD0A 1D5TA 5EB5A 1XWAA 2A4VA 3HZ4A 4KDUA 3UTFA 1F3AA 3AEDA 4ZB6A 3ZRDA 2HE3A 2YWMA 2N5AA 4DSQA 1OJ9A 3NK0X 4TXOA 5IO0A 4TM4A 1R5PA 4MCUA 3P4RA 5DAKA 3NTAA 1JZRA 4RG3A 3DGQA 1L9EA 5E59A 4ICYA 1PHHA 5JCWA 1M2DA 1FG4A 1NHRA 1URMA 4YQMA 5G5FA 4ECIA 5CO3A 4EIPA 1GV4A 3QFBA 4POBA 4C77A 1OJTA 2BXRA 4IVFA 2VL2C 2XVFA 3DD3A 3VPTA 4MK3A 1U6TA 4NPBA 3GWFA 3L9VA 2M46A 2F5ZA 1FEBA 4GRFA 3AEAA 2HSYA 2B5YA 1AOGA 1ZCPA 3CTGA 4M52A 3Q19A 4NV5A 4BK3A 4N0ZA 2HI7A 1Y6EA 4PNFA 4CCQA 1J08A 1PN9A 2IWTA 2QAEA 2CVDA 1XOBA 4JY3A 4CDOA 1PBEA 1LU4A 1RW1A 3D4MA 1GSFA 1QUWA 3TOUA 2IIDA 5J9CA 1Y25A 4RUVA 2GMHA 2GSTA 1AQVA 4O5RA 3ZVJA 4B65A 2V41A 3BD2A 6GSVA 1TK8B 3K7TA 2RUEA 3VWUA 3UKKA 4ML6A 5KEJA 5IMVA 1EOGA 3LXZA 1OC9A 3ZDNA 3CNSA 1LPFA 1EV4A 2GDRA 1U88A 3P4PA 4QL7A 2KUCA 2J9HA 1ON4A 3F4TA 3KP9A 2VCXA 2YR6A 2H88A 4AOSA 3F6FA 3DGHA 1K0OA 3WT2A 3V3OA 3IRAA 3F9UA 5TR3A 5G1LA 1CC2A 3NKSA 1YQZA 4TLZA 2YG3A 4OFNA 2YR5A 4ZIJA 4XWZA 1SK2A 4OO5A 3TUEA 3GNJA 4DEJA 2C3NA 5CKUA 1XVWA 2K8VA 3IAM2 4TR1A 5D9TA 2H6XA 3CMIA 2VOUA 3ICSA 1GRHA 3TB2A 3MNGA 2OLOA 1TK5B 2CX4A 2VCZA 3WGXA 5DJMA 3NHOX 2BJXA 3BI5A 1C72A 2VL2A 2V6OA 1EL5A 3M3MA 3NK1X 3Q18A 1A2LA 3KKJA 2R0GA 2FHEA 3E9JB 4NHZA 3H93A 1DJNA 4O5UA 1XWCA 3QDNA 3V76A 4DSSA 1ZYQB 3DWVA 2Z5XA 5DBJA 2H19A 4EXJA 2NVKX 1SD9A 1U3IA 1SKRB 2DJJA 1GNDA 3GH9A 1OJAA 4U8IA 4Z24A 5IM9A 3ZMKA 3G5QA 5D9WA 4JQ9A 1TDOA 1S3CA 2TRXA 5JCGA 3DKSA 3COXA 1WRYA 1XANA 3OZ2A 1ILOA 4BJZA 2CV4A 5U63A 4K1FA 1GTBA 4ZB9A 1GSNA 4EE0A 2FJAA 4G19A 2XLTA 4BWSA 1CC6A 2WHDA 3IK9A 1FVJA 3NN0X 4MF7A 3UVTA 4YSYA 2L59A 5GRTA 5KRQA 4LA1A 1H75A 2GQFA 5HFGA 1LTXR 3P8WA 1RQMA 3HZLA 3HA9A 4H2NA 4IW9A 2LSTA 5J41A 1E39A 2C4JA 5FS6A 1CC4A 2R5GA 4KX4A 3FZ9A 4MZCA 1XXUA 4OPGA 5F06A 1WP0A 1F6MA 2V1MA 4F82A 2RGJA 3HVSA 3KMOA 2XDOA 3AE2A 2H72A 1QJDA 3IDVA 1K0DA 2IJYA 2REMA 3GKKA 5JCIA 4B69A 16GSA 5EBKA 3NLCA 5BULA 1A2JA 1SYRA 1NHSA 3CXGA 5DALB 5ECQB 1K3OA 1PD21 1XZOA 2XBIA 1KBNA 1ELIA 3GA4A 1CQGA 2QA1A 2V6KA 4ECHA 1S3DA 5FWGA 1W4XA 2F8AA 4IJ3A 5DQYA 4BVYA 3ALJA 1TRSA 3EINA 4P9SA 4TRXA 2A87A 1E1KA 4HB9A 2PN8A 2FBWA 2O85A 3F8DA 1TDFA 2L4CA 5A4VA 3NH3X 1FAAA 1Q98A 3L9SA 4C74A 1OE8A 4KB3A 1F9MA 4WF4A 4XXGA 1BAYA 3SFEA 3QCPA 3Q9TA 3SWLA 3WT1A 4PGTA 3A2VA 4CRTA 5C2TA 3J7Yk 2JU5A 3DXBA 5CRGA 2FGXA 3DA1A 3UAPA 4EMJA 4H4WA 2GGTA 4UP3A 4X9MA 1K0AA 4JU5A 3DJDA 4LL4B 1KDGA 2YLSA 4TN8A 2DJ0A 3NYFA 4K2DA 2IN3A 3NIVA 1PN0A 2R0PA 2LRTA 5IMDA 1M2BA 1GULA 4GSTA 3GL5A 4DNAA 4KGIA 2Z9SA 1PDHA 5KVHA 2XVIA 1H4OA 1EL8A 5JCKA 3AWIA 2R3XA 4KW6A 2YVFA 1AXDA 3L1RA 2DIYA 2EQ8A 2HZEB 4EVMA 5AIXA 3EURA 2XFNA 4IV9A 5ID2B 1A8LA 3DEXA 2XYOA 1QGVA 4H4TA 3QPMA 3HJMA 2XVEA 1H6VA 3ERWA 5ECMB 4OWYA 2ALBA 3V1WA 1S3EA 1WPIA 4YXDA 3TDGA 4RQXA 4IQ1A 1ONFA 1PQNA 3APOA 1DXLA 1MTCA 1TYTA 1RSGA 2YLRA 2GH5A 2TRCP 2DC5A 4U8NA 2PVQA 5C04A 5F07A 1GXFA 4H2QA 3G7IA 5INYA 4X43A 4MZWA 1JU2A 3M13A 1GRFA 4U8MA 2I4AA 4TLXA 3CYNA 1TI3A 1NAAA 5JCLA 3FR3A 4FDCB 4FYBA 4HA6A 1ZGNA 4IS0A 4A9WA 1SJ6A 5G31A 1K4QA 2APGA 4O32A 4NMUA 2CDUA 2B7RA 1LVLA 4WKWA 2DMLA 5FHIA 2C66A 1D7YA 5GSSA 5D9VA 1EEMA 1ZK7A 3MSZA 3QFAC 2WP9A 5D9XA 1ERVA 1HYUA 1SL1B 1X5EA 3M12A 4OO4A 2VD1A 5D73A 2YG4A 5IQYA 1MDKA 2H0HA 2YM1A 1PX7A 2KLXA 2RGHA 3O6TA 4GF7A 4PUFC 1E1MA 3DK4A 2O89A 1ZYEA 3TRXA 1BG5A 3QR6A 4JR4A 3FG2P 1BQ7A 1XDIA 1ERWA 4MF6A 4APNA 1EV9A 2LTKA 4LMVA 4RI7A 1RYIA 2CAIA 2WDQA 1GSQA 4KNDA 3VI7A 2HXKA 1OE7A 1XW6A 4Y4NA 4FH8A 4MABA 5HQPA 5JCMA 2BCGG 3UKAA 1TJDA 2C7GA 5FS7A 1V58A 5FT3A 2X8HA 1ERUA 3AE8A 3EMPA 1YJ6A 2WULA 2HRFA 2L6CA 5J9BA 2DJ1A 4KCEA 3N9JA 3RP6A 2F9SA 3CPJG 4HQZA 1TI1A 3VURA 4H4XA 3IHGA 5CREA 5DALA 4GQFA 1V2AA 2R37A 1JRZA 4POMA 2QCUA 1JOAA 2H1BA 1NENA 4HJ2A 1M2AA 3M0FA 2H01A 1U87A 2BXSA 2C67A 4J2WA 2IFQB 3F63A 2R4JA 1ZP0A 1PBBA 2WZ9A 4MH2A 5KVIA 2C72A 4XWRA 3NYCA 4KCAA 1FEAA 2WRTA 1XHCA 1F3BA 2CA8A 4KX6A 1IUSA 3UKHA 4MPFA 3BCKA 4A5LA 2B6MA 3QFAA 3QAGA 2PPTA 2A89A 1BGNA 4WEYA 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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 1JNZ A;  4EQS A;  2PGW A;  1NG3 A;  4GTU A;  2RDX A;  2FD3 A;  4FX9 A;  3M1G A;  1KSS A;  3ATQ A;  1T3B A;  3S61 A;  3PWI A;  3KPK A;  4FK1 A;  2LJR A;  2XFO A;  3BHF A;  2VM1 A;  2VRL A;  2GEW A;  1H2I A;  1ERT A;  3F3R A;  2YOI A;  2WEU A;  3IC8 A;  2CX3 A;  3E0U A;  3ISH A;  4YAV A;  2FJB A;  1NHO A;  2OE0 A;  1FOH A;  1OJD A;  3QD9 A;  2P5R A;  3P4S A;  3SBF A; 
#chains in the Genus database with same CATH homology
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