2OE1A

Crystal structure of mitochondrial thioredoxin 3 from saccharomyces cerevisiae (reduced form)
Total Genus 36
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
36
sequence length
106
structure length
106
Chain Sequence
SSYTSITKLTNLTEFRNLIKQNDKLVIDFYATWCGPCKMMQPHLTKLIQAYPDVRFVKCDVDESPDIAKECEVTAMPTFVLGKDGQLIGKIIGANPTALEKGIKDL
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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molecule keywords Thioredoxin-3
publication title Structural and mechanistic analyses of yeast mitochondrial thioredoxin Trx3 reveal putative function of its additional cysteine residues
pubmed doi rcsb
source organism Saccharomyces cerevisiae
molecule tags Electron transport
total genus 36
structure length 106
sequence length 106
chains with identical sequence B
ec nomenclature
pdb deposition date 2006-12-28

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00085 Thioredoxin Thioredoxin
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.30.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich Glutaredoxin Glutaredoxin 2oe1A00
4XS4B 4GSNA 2CX4A 3FR9A 2L6DA 5J3RA 2KLXA 3ME8A 2AYTA 3L0HA 2YN1A 1X5CA 2WFCA 1QQ2A 2O87A 1I5GA 3GRXA 3HCZA 3TKSA 1A24A 1GULA 1YZXA 5COHA 3D6IA 4JEDA 3DIEA 4BVXA 4RI6A 1N2AA 1G6YA 1PMTA 3C1RA 3F9UA 1PL1A 2VAFA 2VM1A 2VCXA 2G0FA 3ZIVA 2FHEA 5DQSA 4ZL8A 3TKSC 2O89A 4XCSA 3RHBA 3UJ1A 5DQYA 2KOKA 6GSSA 4MLYA 1GNEA 2B5EA 3QR6A 2YPMA 4POBA 1TRWA 4KE3A 2GT6A 1HD2A 3HJPA 3IRAA 4F0CA 4XS6A 2YWOA 2GGTA 3KGKA 5A4UA 4X1UA 3CXGA 1Y25A 3L9SA 2DJ2A 1O73A 2XBIA 4DSRA 1YEPA 2M72A 1QGVA 1EV4A 2FCHA 1ERWA 2V32A 2R3XA 4MZCA 3BCIA 1EEJA 4V1Ap 1KNGA 5D9WA 1WRYA 2PN8A 2VLVA 3BOAA 5DJLA 3VWWA 2ON7A 2YOIA 2V6OA 1A2LA 4NV5A 4JR6A 3UVTA 1GWCA 1QMVA 2XBQA 1TRVA 4HEA2 4O92A 2AJQB 3EMPA 2V1MA 4IHUA 4TR1A 3ZMLA 4I5QA 3F3RA 4ZB8A 2EC4A 1Z3EA 3M0FA 5G5EA 1ZYQB 3FZ5A 1CQGA 1QK8A 5CRDA 1GTUA 5F07A 2H0GA 4YAVA 1SKWB 1WJKA 3MDKA 3GX8A 4BWSA 3WT1A 5ECQB 3RBTA 3KM6A 1O8XA 5CRGA 2H74A 3D4MA 2IMIA 3EU4A 5G1LA 5EL8A 3FW2A 1XWBA 2TIRA 2PVOC 2C8UA 1F9MA 1GSSA 3GL3A 3PH9A 3FEUA 2KUCA 2L59A 2VCQA 3PR8A 4X43A 5DAKB 4LL4B 2MYGA 2B1LA 1C72A 3ZMKA 4KAEA 4MZBA 2A4VA 2TRCP 1OYJA 3GSTA 1B48A 2H6ZA 4X0XA 3LORA 2FA8A 4MP4A 2A2RA 1S3AA 1G0TA 1SL2B 2JADA 4AJ6A 4BL7A 2EIOA 4IW9A 1IYIA 4QL9A 5HR1A 2VUPA 3APSA 2OJLA 3QCPA 4OD7A 3IK9A 6GSVA 3D5JA 1MDIA 3Q18A 4KCAA 1PGTA 3A3TA 3P2AA 5DVBA 3KP8A 2GSTA 3G7JA 3DVWA 2CAIA 4IJ3A 2E0QA 4FIWA 3MWHA 3RHCA 1F37A 1ZMAA 1GLQA 4LLRA 1GUHA 2H75A 1TK8B 1DBYA 4IGJA 1WE0A 4KSOA 2YWMA 4I8BA 1QFNA 3L4NA 1XPVA 1GSQA 5HR0A 2GZPA 3VWUA 4KX4A 2KP2A 4GRFA 1THOA 4POMA 1Z6NA 2M80A 1Z6MA 2I4AA 4YQMA 4IBPA 3ZYWA 1K0MA 1VF3A 3KEBA 2LRCA 4O5RA 4JZQA 5AISA 1SYRA 4WR5A 4V1Ag 5ELAA 2MBSA 3RAZA 2GT5A 3MNGA 4N0VA 1DSBA 1H4OA 4MK3A 3PGTA 1FAAA 22GSA 3LWAA 4JRRA 5H5SA 3GMFA 1WPIA 1Z7RA 5HFIA 4EO3A 1RK4A 3F8UA 2PWJA 4KDXA 1TK0B 1OAZA 2XHFA 1TJDA 6GSXA 1SL0B 2OE1A 3P8WA 1TOFA 2GQLA 4K6XA 5B8BA 1KEBA 5FWGA 1H75A 2LQQA 1ZCPA 2IIYA 5GSSA 1XCCA 5LCZA 4GSSA 5J5NA 1GH2A 4EC0A 1RW1A 4FYBA 2VD1A 5IMCA 4ECBA 2FWEA 1BG5A 2IJYA 2H72A 2K9FA 3LGCA 2H01A 4OO4A 2F51A 2B3SA 1FHEA 4LL1B 4HJ2A 1TI3A 1YEXA 11GSA 1X9WB 3ERWA 3TJKA 5JWQB 4ID0A 4BA7A 2K8VA 4L0UA 2HZEA 2H76A 1YKAA 2KHPA 1UN2A 3KH7A 3GN3A 1DE1A 1SKSB 4OFNA 3LYPA 1PQNA 4L5OA 1MD3A 2LS5A 4KSMA 3LFLA 4K9ZA 4L8EA 4HI7A 3LYKA 4AGSA 1W4VA 3GKMA 1AW9A 4D73B 5JWOB 5DCHA 4ZL7A 4NHWA 2JSYA 4K1FA 4J2FA 3ME7A 5ECIB 3QMXA 3IDVA 4TR3A 3APOA 3EURA 3G9BA 4HZ2A 3CTFA 4IQAA 3QAGA 1ERVA 5IPHA 2VCVA 2NDOA 2DJ0A 1M0UA 4CHSA 5JCUA 1Z7PA 1GSUA 4PGTA 2DLXA 3I9V2 4K7IA 1IYHA 1JFUA 4YQUA 4TR0A 1U87A 2JZTA 2DSAA 3H79A 1PSQA 3IPZA 1XIYA 1NSWA 4LA1A 2TRXA 3ZFLA 2V41A 4HQSA 1RQMA 1ZZYA 2AV4A 3NIVA 3ZRDA 3I69A 2HSHA 4N10A 1FVKA 1A8YA 2DBCA 2H1GA 4MPGA 4H86A 3TJJA 3ZLPA 4N30A 3F63A 6GSWA 1JHBA 3HD5A 3HXSA 5G1KA 2F8AA 4GLTA 3SBCA 4XS1A 4PQHA 4MH3A 2WCIA 4PNFA 4FYUA 1XWGA 5H5QA 3QPMA 4HOJA 3CTGA 3FK8A 3G7IA 4KB3A 1R5AA 3KXOA 1SKRB 1XXUA 2X99A 3M3MA 1V2AA 4PQIA 4K0GA 2H70A 1PD21 4N11A 4G9HA 2OKAA 4PNGA 4HQZA 5EY6A 2YV7A 3GKKA 5KEJA 4KGIA 2PPTA 3QFAC 1VRSD 3KZQA 2DIYA 5ABRA 1U88A 4TXVA 2R37A 2I3YA 4G10A 3FHKA 2H66A 2AHEA 4I6XA 4HDEA 3VLNA 3EU3A 1ML6A 2YANA 2HNLA 3KP9A 2HRNA 4OWYA 1SJIA 20GSA 3DMLA 5GAPD 1OE7A 3IA1A 3DWVA 5A5KA 2ES7A 5CAXA 4CW9A 2ZUPA 19GSA 1AC1A 2ZNMA 4ECJA 1TRSA 1K0CA 2XPDA 4ILFA 2MBTA 2BJXA 4YQVA 1SJ6A 4K7NA 1HYUA 2EIRA 2FWHA 1O6JA 5DAKA 5CRHA 3EE2A 5J9CA 4GWRA 1S3CA 2OE3A 5IM9A 2RIIA 4AF2A 1NM3A 4CDOA 2IFQB 1GUKA 2KP1A 4DSSB 3CSJA 5JCWA 1K0NA 3RDWA 2DJ1A 5CNWA 4XHMA 4TN8A 3LJRA 4MH2A 3DGQA 4GF0A 2I9HA 1EOHA 4DSQA 1PKWA 2CX3A 5EVOA 2DMLA 3GURA 3AY8A 4F0BA 1A2JA 4MDCA 5ECLB 2RM5A 1K3YA 4O7HA 3GTUB 1THXA 2AUVA 1X9SB 2GSSA 2K6VA 1JZRA 1GUMA 4Z7XA 1ZYEA 4F82A 5DALB 2LNTA 4ZL9A 1Z5YE 3TKQA 5J41A 1HNAA 1AQXA 1UC7A 1NHYA 2YNXA 3EWLA 2NVLA 5CYYA 4IVFA 1EOGA 4TW5A 1VF4A 4WR4A 2H1DA 2ON5A 1WWJA 3GV1A 2IWTA 5D93A 4JU5A 2HXKA 3VWVA 1YJ6A 2VOCA 1XOBA 2H19A 5CRWA 1PRXA 8GSSA 1G7EA 3GKNA 1O7UA 3ZFBA 3OR5A 4F2IA 4IJIA 5AIVA 3O76A 17GSA 4V2MA 4PXOA 4K2DA 2CVKA 1WIKA 3A2VA 4I2UA 1SK2A 1X0RA 1M2AA 1YF1A 1VGLA 3IBHA 1XOAA 2BTOT 4TR4A 2GSRA 2DIZA 3LG6A 4HU7A 4Q5NA 2HRFA 2LJRA 2RLIA 3ZIJA 3R2QA 2G2QA 2R2JA 5ECNB 2GLRA 3FZ9A 2V2GA 5FT3A 4XRAA 3CSIA 3M1GA 4POLA 2LJAA 1VF1A 1FW1A 3FRCA 2PUKC 1PX6A 2B6MA 5C04A 3I6AA 1M9BA 1XBSA 2CZ3A 3GYKA 4K0NA 3DEXA 2HFDA 4KUNA 2FUG2 3CYNA 2HE3A 1TK5B 1EEMA 1SK0A 4ZB9A 3TRQA 1MDKA 3H93A 3TOUA 1B4QA 2FGXA 3DRNA 4KA0A 1OKTA 3DKSA 4KDUA 3U6VA 1G6WA 1Q98A 4ZBDA 4GTUA 2CT6A 2VL2A 4TOPA 2AAWA 5IIZA 3ZL5A 2VCTA 1ILOA 1PN9A 1BJXA 2MMZA 1BYEA 1GSEA 2GZYA 2X8GA 2IPAA 1F3BA 5LD0A 5E4WA 1PX7A 3PINA 3D4TA 2H73A 2GQMA 4ECIA 1B9XC 1SK1A 2MMAA 1T00A 2LRTA 1SJZA 5D8IA 2WJUA 1YY7A 1OC9B 1JZOA 4IP1A 1V57A 4D73A 5B6MA 3C73A 1SD9A 3K8NA 3L9VA 3P7XA 3ERFA 5CO3A 1GSFA 3BBYA 3JCML 1E2YA 3A2WA 3GUSA 5AGYA 4MF7A 3HVXA 1A23A 3EVIA 3FZAA 5D96A 1GSYA 2GQKA 4HS1A 2WZ9A 2IN3A 3F6FA 1AUCA 1JLWA 4HU9A 2DMMA 2O85A 3EMXA 1B4PA 1PKZA 2Z9SA 2YP6A 2HSYA 1GRXA 3TCOA 5AN1A 3H4KA 1O8WA 3A5WA 3HJMA 4IKHA 2REMA 4GQCA 3CRTA 4EUYA 1V58A 3KCMA 2J23A 2RUFA 3H8QA 1KBNA 3ZVJA 2LNSA 4OCEA 3SWLA 3WT2A 2HT9A 2HZFA 3E9JB 2C0FA 1XWCA 4F03A 2P31A 3F4RA 1ZOFA 1GTBA 1NW2A 4WXTA 5DDLA 2WDUA 5ECMB 4HZ4A 1MTCA 4TKYA 2FLSA 1TI1A 5J4UA 5HFKA 2QKEA 2YCDA 2CQ9A 1I9DA 5D9XA 3EYTA 3CRUA 3H1NA 3UEMA 3CMIA 5ECRB 4RQRA 3IR4A 4POKA 5ENUA 4IS0A 3FZ4A 2WB9A 3UBLA 1FOVA 5DJMA 4QQ7A 4BPYA 4XTSA 5AIXA 1GSDA 2P5QA 3DXBA 3F4TA 2DJ3A 3ERGA 1GLPA 1ZGNA 4FO5A 2YWIA 5ECSA 2F3MA 2F8FA 2N5FA 1EV9A 2B1KA 1X9MB 5CP1A 4KNDA 2BMXA 14GSA 5G5FA 5JWRB 4XS4A 4MA9A 4IELA 1TDIA 5G31A 4MPFA 3TKRA 2GTUA 3ZITA 1QXHA 4I97A 10GSA 1J9BA 1T1VA 2PMTA 3VK9A 5INYA 2GVPA 2E2MA 2HLSA 3GKXA 4ZB6A 3KTLA 4GCIA 2M46A 4EKZA 1OC3A 3N9JA 3NOFA 1JZWA 1K3OA 1XWAA 3TKSE 18GSA 1GL8A 4FH8A 4EDZA 3S9FA 4MJCA 3FY7A 3APQA 1M2BA 2WULA 3J7Yk 3TJGA 1K0BA 1EGRA 3U5RE 3F6DA 1K3LA 3L78A 3Q19A 3UVHA 5IMDA 1OVNA 3VI7A 2IMEA 3ZZXA 1ERTA 3TJFA 1SL1B 4MZWA 3ED3A 2L5LA 2H8LA 4EDYA 3HY2A 1O81A 4G19A 4ZBBA 1HNBA 2P5RA 2CZ2A 4BVYA 3GFKA 4TXOB 2ALBA 1K0OA 1JLVA 3ZREA 4DSSA 2LKUA 1WOUA 1ERUA 1S3DA 1A0RP 3KD0A 3W6GA 1J0FA 5H5RA 1XVWA 1DUGA 1FG4A 2C3NA 2IL3A 1YF0A 1PA3A 1ZL9A 4Q5RA 1K0DA 3IAM2 4WKWA 2NBSA 3GTUA 2B7KA 2YWNA 2QSIA 5D9VA 2OADA 1YDKA 1MEKA 3QAWA 3I43A 1HQOA 5KN1A 5B7CA 4EF0A 3CBUA 4WF5A 1M9AA 5DALA 3O3TA 1U3IA 1X5EA 3F4SA 2A2SA 2HYXA 5L71A 3LXTA 2OE0A 5IMAA 1EGOA 3KMNA 3A2XA 4E8EA 2L6CA 5ECKB 1XWKA 2AB6A 3F0IA 3IHQA 2XC2A 3IAS2 3IXRA 4OFMA 3KIJA 5LNKe 4RQXA 4MJBA 2B5YA 2QGVA 4MJEA 2B5XA 4L0WA 2H1BA 2VIMA 1R26A 3G7YA 2E2GA 3WGEA 2R5GA 3WYWA 3FR6A 1AQWA 1XW9A 5HR2A 3QAVA 9GSSA 2VL9A 5EPFA 4V2LA 4AJ7A 5ID2B 3W8SA 1FVJA 1EP7A 3TUEA 2C3TA 1LJRA 1BX9A 4IN0A 4XIHA 2JACA 4OO5A 5ECOB 1OKDA 2VLTA 4Q5FA 3QD9A 1LU4A 2JL4A 4EXJA 3TKPA 5FHIA 4KW6A 4ML6A 4L5LA 3RPNA 5B8AA 3US3A 3QFBC 1K0AA 3VPQA 2PVQA 5IO0A 1WP0A 2JU5A 1XZOA 2X8CA 2JSZA 4OFTA 3TOTA 1USBA 3HVSA 2C0DA 1SYXA 4PUAA 5KN2A 1JZDA 1AAZA 1F3AA 2B7JA 4DVCA 4EL1A 3C8EA 1AQVA 3NZNA 2I81A 3KH9A 3CSHA 3HJOA 5IMZA 3HVVA 2LV3A 1Q4JA 3C71A 5A4VA 4PQ1A 4ZBAA 4G2EA 4IQ1A 1R5PA 3UL3A 5HR3A 1TRUA 2OBKA 2P0GA 2I1UA 3E0UA 4ISDA 1J08A 4MCUA 3C7MA 3HZ8A 3J7Yb 4PUFC 4AJ8A 1OC9A 3UMAA 4WBJA 5C00A 2YZUA 5G30A 2YZHA 3BCKA 5D73A 3UOMA 3HZ4A 3RPPA 1SU9A 3BD2A 1BAYA 5DCGA 3GH6A 3HHVA 4OMVA 6GSTA 3UARA 2K8SA 1V40A 2C0GA 3UAPA 1HNCA 1Y6EA 2VL3A 1AXDA 1GTIA 3DYRA 2DC5A 5DBQA 5F06A 2OBIA 4MJAA 1EWXA 3GH9A 1GP1A 5A4WA 1U3AA 2ZCTA 1M7TA 2FY6A 3TGZA 1ACVA 3F3QA 4NXIA 4J56E 4ZIJA 1OE8A 4HJMA 2OA7A 3ISOA 2C0EA 1SD8A 4DEJA 3KJYA 2C1YA 2PBJA 5B6NA 2OACA 4KH7A 4WF4A 2H30A 4MF5A 4JBBA 1X5DA 4P3YB 2VD0A 1NHOA 4ULXA 5J9BA 12GSA 4ZILA 3HDCA 1W89A 1TKDB 2GZZA 2C3QA 1T7PB 2IMDA 2HI7A 2LEGA 4MF6A 1TP9A 5IMVA 1V9WA 2IMFA 1O85A 2CAQA 2VM2A 2F9SA 1U6TA 3GHAA 3QDNA 5KN0A 1AIUA 3GSSA 4LMWA 3WD6A 3TJBA 1ON4A 1UVZA 2VL2C 2VO4A 5F0GA 2WRTA 2GSQA 4TR1B 2L4CA 2MMOA 2FNOA 4PX1A 2O7KA 3TB2A 3UIWA 2CA8A 4NV2A 5GAND 1R7HA 4ZXGA 2FWFA 2N5AA 3LEFA 3FR3A 1R4WA 2FWGA 5IPGA 4BWQA 5E59A 1URMA 4K7OA 1BEDA 2QC7A 1N8JA 2H71A 6GSUA 2K18A 3BJ5A 3GX0A 1ABAA 3DD3A 1M2DA 2L4QA 7GSSA 1KTEA 1TTZA 3ZTLA 1MDJA 3LSZA 4WEYA 16GSA 3VURA 2YJ7A 2LRNA 1EP8A 4NMUA 4ECCA 3C1SA 4QL7A 4F9ZA 2JZRA 4TVEA 4V2NA 2L5OA 1VF2A 3KMOA 3HKRA 1TXXA 2XPEA 4ML1A 3M9KA 4TRXA 13GSA 3LXZA 4GSTA 3Q74A 4TXOA 4I2TA 2FA4A 2O8VB 1TU7A 4JR4A 1WMJA 3HYPA 5IMFA 3MAKA 2EIQA 1ST9A 3N5OA 1T4YA 4OCFA 2L57A 3VI5A 2JZSA 1F2EA 1YQ1A 4J57E 2LJKA 2LTKA 1G7OA 2X8HA 6GSYA 5IOWA 1FO5A 1T8EB 2DJKA 2GDRA 2H0IA 3VFIA 2WS2A 1GTAA 3M9JA 5ELGA 5HFGA 3TRXA 1EZKA 4YH2A 3TRPA 2LSTA 3O6TA 1M99A 3LQ7A 2H6YA 3EINA 2MZCA 1F6MC 2N5BA 4KCEA 2GS3A 3VPTA 3WGDA 1A2MA 3IC4A 3M8NA 1B8XA 1CQHA 2LUSA 2E7PA 3E3EA 1DE2A 1MD4A 2LQOA 1FB0A 3VWXA 3FYGA 4NHZA 5IO2A 3UBKA 2C80A 1T3BA 2R4VA 2RM6A 3IOSA 5GZZB 3TDGA 2RUEA 3D21A 4GQFA 2H0HA 2J9HA 3HA9A 2CVBA 1GNWA 5ECHB 1UA5A 2PU9C 1Z9HA 2X64A 1XVQA 5ID2A 4KDYA 4EVMA 1FB6A 2DJJA 2R6KA 5G2ZA 4JE1A 5HQPA 5IQYA 1LBKA 2NPBA 5CREA 5D9TA 4EE0A 2FD3A 2NTOA 1SENA 1XW5A 3IV4A 5GSTA 2PERA 4XRDA 4Q5QA 3L9UA 2IFQA 2IMKA 2MMNA 3FKFA 3GA4A 3GNJA 1OC8A 2YV9A 4MMMA 1PL2A 4NWYA 2PGTA 3EC3A 3KTBA 5F05A 5IOXA 4E8HA 4ACSA 2D2ZA 3DVXA 3GIXA 4GXZA 4IP6A 2HZEB 3MSZA 2H1AA 3IK7A 4NAXA 1YKCA 2YJHA 1TW9A 4WETA 3WGXA 4FYCA 4YAPA 1E6BA 4MABA 5ECPB 4K8MA 1XFLA 3D22A 3D0ZA 3P90A 4PURA 1B9YC 2VCWA 2C4JA 2CV4A 5KN3A 4NPBA 2CVDA 2V6KA 2WGRA 4N0ZA 1T4ZA 3QOUA 4HUAA 1BQ7A 3GL5A 2VLUA 4LMVA 5JCGA 3Q6OA 4RUVA 3IE3A 4WBRD 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chains in the Genus database with same CATH superfamily
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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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