2OE1A

Crystal structure of mitochondrial thioredoxin 3 from saccharomyces cerevisiae (reduced form)
Total Genus 36
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
36
sequence length
106
structure length
106
Chain Sequence
SSYTSITKLTNLTEFRNLIKQNDKLVIDFYATWCGPCKMMQPHLTKLIQAYPDVRFVKCDVDESPDIAKECEVTAMPTFVLGKDGQLIGKIIGANPTALEKGIKDL
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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molecule tags Electron transport
source organism Saccharomyces cerevisiae
publication title Structural and mechanistic analyses of yeast mitochondrial thioredoxin Trx3 reveal putative function of its additional cysteine residues
pubmed doi rcsb
molecule keywords Thioredoxin-3
total genus 36
structure length 106
sequence length 106
chains with identical sequence B
ec nomenclature
pdb deposition date 2006-12-28

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00085 Thioredoxin Thioredoxin
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.30.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich Glutaredoxin Glutaredoxin 2oe1A00
5CP1A 4G19A 1EP7A 4XS6A 1CQHA 2O85A 2LRNA 2YZHA 1GTAA 2H6ZA 1GP1A 1OKTA 2VL9A 1G7EA 1Z7PA 5COHA 2H6XA 1GSUA 4N0ZA 3IE3A 1M2AA 2XHFA 2H74A 4ZL7A 1A2MA 1GUMA 2IJYA 4KCAA 4POMA 2QC7A 2JL4A 3RHBA 4KSMA 5A4WA 2LJRA 3EYTA 3MWHA 1PD21 1X9MB 1FOVA 1GSDA 2EIOA 5ID2A 3H79A 2NBSA 1FO5A 3KP8A 4IW9A 1TRSA 2KUCA 4TR3A 5EL8A 5LCZA 1U87A 4LL4B 5ECMB 3H93A 3HJMA 4MA9A 4L5LA 5G2ZA 1XW6A 3TOUA 3LFLA 1XCCA 5E59A 4JE1A 3ZZXA 1ZYEA 4BPYA 2AB6A 1WPIA 3GKXA 6GSUA 2F9SA 1PN9A 4OO4A 4NHWA 1F3BA 3DEXA 4JR6A 5GSTA 3FEUA 3LXTA 4OFNA 4F0CA 3IXRA 2GS3A 3IRAA 2VO4A 3KGKA 2N5FA 4I6XA 2L59A 2K8VA 4KW6A 4NAXA 1U6TA 3HXSA 2DMLA 2IMDA 2B3SA 5HR3A 1R5AA 2FWGA 2OA7A 1BQ7A 4BWSA 5HR1A 1LJRA 3ZLPA 4DSSA 1S3CA 2PWJA 2R3XA 3C1RA 2GSRA 3P7XA 1SENA 1FG4A 5KEJA 1QXHA 3HJOA 3F0IA 5ENUA 2R6KA 1BX9A 5IPGA 2XBIA 4ECJA 4X1UA 1TRVA 1VGLA 4ZXGA 2H73A 1M9BA 4G10A 1E6BA 3HCZA 5DDLA 2JSYA 3KXOA 1URMA 4IJ3A 1XW9A 2OE3A 3C1SA 3LORA 5IMFA 4N30A 1X5DA 1A8LA 3FK8A 1BEDA 1PL1A 2QGVA 3GTUA 4TVEA 1OE8A 2FY6A 3GL5A 5AN1A 4AJ8A 17GSA 5D93A 6GSVA 1O7UA 3LYPA 5L71A 1ERWA 3RPPA 2KP1A 4EE0A 3MAKA 2C1YA 1K0DA 3ME8A 4KDUA 4MF7A 1OC9A 4V2NA 2V6KA 2I4AA 4G2EA 4V1Ag 4JRRA 3LGCA 3HVVA 1AQVA 4HUAA 4ECIA 3DIEA 1GSQA 2CAIA 6GSSA 3M0FA 1PSQA 4KA0A 4NHZA 4IS0A 2JACA 1SL0B 3C73A 1R7HA 3IBHA 3IDVA 2FA8A 2N5BA 2C0FA 2BMXA 2YANA 1YDKA 2B7KA 1JFUA 4XCSA 4ZB6A 3C71A 6GSWA 1GNEA 2VLTA 4WKWA 4EC0A 2M72A 2O8VB 2DJ0A 5LD0A 1AQXA 5G1KA 3DWVA 6GSTA 1F6MC 1M99A 2C8UA 2L57A 3EINA 1OVNA 1SKSB 1Y6EA 3LXZA 3GKKA 3ZMLA 5IMAA 2AYTA 1XW5A 2C3TA 2V41A 3ME7A 4ZB9A 4HI7A 3GURA 2WS2A 1TRWA 5ECQB 1Z6MA 4NV2A 3F4SA 5IQYA 2GZZA 1PGTA 2YCDA 2K8SA 3KJYA 5JWQB 5F0GA 2HI7A 3TB2A 3L0HA 4WEYA 3HY2A 1FW1A 2VL2C 3QR6A 2MBSA 3I6AA 4AJ7A 2B7JA 3IPZA 2YWIA 4GXZA 3A2VA 1SL1B 5G31A 3KM6A 1PKWA 4YH2A 4F2IA 4HZ2A 3IR4A 4PURA 2HFDA 4DEJA 3NIVA 2GT5A 3ZFBA 1K0MA 3APSA 2WGRA 2QSIA 2C0DA 2AUVA 12GSA 2H1BA 4BWQA 4XRAA 3SWLA 4MMMA 3K8NA 2KP2A 3DXBA 2JADA 3TCOA 4XS1A 4MCUA 4YQUA 1PL2A 2RLIA 5F06A 3J7Yb 4MJAA 3WT2A 2GLRA 2E2MA 2PN8A 2FUG2 1VF3A 4HU7A 2P0GA 2NTOA 4RQXA 2VCWA 3EMPA 2IMIA 4PUAA 4CW9A 3TKRA 5F07A 2EC4A 3BCIA 5B7CA 2H1GA 5ECNB 4EF0A 2VCVA 4PX1A 1NW2A 1SJIA 3CTFA 3IV4A 1T4ZA 2CVDA 4JZQA 5DBQA 3ZVJD 1JZWA 2ZUPA 5A4VA 6GSYA 1K3LA 4F9ZA 3R2QA 5F8BA 4L8EA 1MTCA 4Q5QA 1MDJA 1AQWA 2MBTA 5F05A 4ILFA 3D21A 1I5GA 2LJKA 3P2AA 1WMJA 1TK8B 1F37A 2H0GA 4KUNA 4BVYA 2K6VA 2YN1A 1F3AA 4TR0A 4EDYA 2CV4A 4QL9A 3L9VA 3S9FA 4POLA 4KDXA 2GGTA 5CO3A 1EEMA 4ULXA 1R5PA 4L5OA 5ECIB 2LKUA 1FVKA 3PR8A 3M1GA 4XRDA 4XS4A 1GRXA 3ZRDA 4L0WA 4TR4A 2RUEA 1ST9A 3NOFA 3ZIVA 2RM5A 2V1MA 2JSZA 5JCWA 1A2LA 3CXGA 5FT3A 2EIQA 2PGTA 4LMWA 4OD7A 4Z7XA 3UVTA 2GSSA 2V6OA 3A5WA 3WGDA 3EVIA 4TW5A 3VPQA 2G0FA 3FZ5A 4IGJA 2YJHA 2ZCTA 5D9TA 5IM9A 4D73A 1SU9A 3CTGA 5CREA 5G1LA 4O5RA 4QL7A 5IMVA 1LBKA 1YEXA 2LS5A 1H4OA 4EO3A 1UN2A 4QQ7A 4XIHA 3GH9A 1GSYA 1A24A 3DMLA 1JLWA 5KN0A 4OMVA 2J23A 4IBPA 2MMNA 1MDKA 2M80A 1NHYA 3CRTA 2C80A 4JU5A 1K3YA 4GSTA 5DQSA 1OAZA 5D8IA 3VPTA 4FO5A 2REMA 1YKAA 3DYRA 2PVQA 1ERVA 2VM1A 4EXJA 3ZREA 2H75A 1DSBA 1O6JA 3ZTLA 1PA3A 1TI1A 3GMFA 3W8SA 4N11A 1PMTA 2YZUA 2DSAA 1QK8A 4MZCA 4K6XA 2AJQB 4IHUA 1DUGA 3QPMA 3M9JA 4KGIA 4TN8A 1ACVA 2JZSA 1B48A 2QKEA 4LLRA 3DVXA 2JZTA 1FB6A 1PKZA 2P5RA 2OE1A 4FYCA 4OCFA 2R4VA 5GAND 4POBA 1SKRB 3LG6A 2FA4A 4PQ1A 1EZKA 1YF0A 4ML1A 5HR0A 4NXIA 3F9UA 2GQLA 3IK9A 2XPDA 3KH7A 3L9UA 3HZ4A 1GTBA 5JWOB 3E3EA 4I2UA 1EOHA 3TGZA 1SL2B 2L5LA 2OADA 4HOJA 4IJIA 1V57A 3GYKA 2FLSA 1V2AA 2DLXA 2ON5A 3UIWA 4MJEA 1TW9A 3EU4A 2AHEA 5ECKB 2E7PA 1PQNA 1SYXA 5J9CA 3DD3A 1CQGA 1K0BA 5ECRB 2GZYA 1TTZA 3UOMA 1SK2A 2JU5A 2GTUA 2O89A 6GSXA 1EGOA 1QUWA 3FHKA 3GUSA 1BJXA 5A5KA 4I97A 1BYEA 3IAM2 1IYHA 1AUCA 1HNBA 1TJDA 2CQ9A 2JZRA 1X5CA 1ZOFA 1MD4A 1JZRA 3TKSC 2MYGA 5EVOA 2DJKA 4J2FA 4GCIA 2AAWA 4RI6A 4MJCA 1Z3EA 1T7PB 3BCKA 3HVSA 2XPEA 4HZ4A 2X8CA 4V2MA 1EOGA 5D73A 2CZ3A 4GWRA 4H86A 2HT9A 3APOA 3FZ9A 3QD9A 3RAZA 1FB0A 3A2WA 5IOXA 4NMUA 5CAXA 4JBBA 2GSQA 5D9VA 1A0RP 1E2YA 7GSSA 4F82A 4F0BA 1SK0A 2PMTA 3TKSE 1GLQA 4K9ZA 4TKYA 1FVJA 4MDCA 2LRCA 4ZBBA 3GRXA 3WYWA 4POKA 4XTSA 4MK3A 1GH2A 4J56E 4AGSA 2NDOA 2NVLA 2B1LA 3QMXA 1SD8A 3VLNA 3UEMA 4ACSA 5HFKA 5CYYA 4J57E 4MPFA 2GT6A 2VCQA 4TRXA 1KBNA 1WJKA 3GA4A 5G30A 5DAKB 4HEA2 1O8WA 2B6MA 3F3RA 4DVCA 4MJBA 1ILOA 5IMDA 1ZYQB 3GKNA 1UA5A 5DQYA 4P3YB 2WDUA 3BJ5A 4KNDA 2FNOA 3TJFA 5IIZA 3HHVA 1TDIA 5B8AA 2OJLA 1VF4A 4PQHA 4HJ2A 3GN3A 3D0ZA 1ERTA 9GSSA 2FWHA 1VRSD 4PUFC 2LEGA 3G7IA 2BJXA 1MD3A 1F2EA 2B5YA 2IIYA 5DAKA 1X0RA 3RPNA 1THXA 2YWOA 2HE3A 3UL3A 4I5QA 3LJRA 5C00A 1AC1A 1GSFA 3KH9A 4BVXA 19GSA 3ZYWA 2F8FA 5ECSA 3PINA 2PUKC 1GUHA 4HQSA 2HNLA 2B1KA 3PH9A 3FR3A 3CRUA 1U3AA 2X99A 20GSA 3EC3A 2FD3A 3CSHA 4K7OA 1AW9A 4K0GA 5D96A 3GX8A 3KP9A 2KHPA 1DBYA 1EV4A 2C0GA 1KTEA 3GX0A 1ZZYA 5B6MA 4WR5A 4IN0A 3U5RE 2GQMA 5H5QA 3G7JA 1BG5A 1HNAA 1K0CA 1Z7RA 2KOKA 4HDEA 2GVPA 4ID0A 5AIXA 3HYPA 3HDCA 2YPMA 4L0UA 1G6YA 1BAYA 2GSTA 2HLSA 2YWNA 4FYUA 4MLYA 5CNWA 1EP8A 2PPTA 3O6TA 1NSWA 2H72A 1N8JA 3TRPA 4LMVA 4YAPA 4TR1B 1YKCA 4CHSA 4EL1A 4OWYA 1HNCA 4X0XA 4MZBA 1Z5YE 5KN2A 4TOPA 3D4MA 4MH2A 3CSIA 1M0UA 2E2GA 3FY7A 5DCGA 4G9HA 3KTLA 1XOAA 3O3TA 5G5EA 2GQKA 4GSNA 5ECLB 3EURA 2TIRA 3F8UA 5ECOB 1PX7A 4O7HA 3MSZA 1PRXA 2IFQB 4KX4A 2VLVA 3M8NA 2VLUA 1T3BA 1W89A 3TJGA 4K1FA 2CX3A 4PQIA 3TJJA 2MMZA 1HQOA 3H1NA 2HRNA 4TR1A 1T8EB 3RHCA 2PVOC 4ZBDA 3FZAA 1C72A 5DVBA 2WJUA 4ML6A 4RQRA 3GSSA 2IMKA 3W6GA 1TI3A 1EV9A 5EPFA 1GLPA 2C0EA 1ZMAA 5GSSA 5ECPB 1PX6A 1GSEA 2C4JA 2VD1A 4K8MA 2WFCA 3E9JB 2OBKA 2H0HA 1F9MA 1Q98A 4JEDA 1FHEA 2LRTA 5INYA 4V2LA 3ERGA 5CRDA 3J7Yk 4IQAA 3AY8A 4K7IA 1YEPA 3VI7A 1WWJA 4ZILA 4FIWA 4OO5A 2LNSA 5CRGA 2N5AA 4HU9A 3BBYA 3UMAA 2CVBA 5CRWA 5AGYA 2G2QA 3EU3A 1OC3A 2OACA 1V9WA 2H19A 3FR9A 1OC8A 4PNGA 3KEBA 4O92A 2R2JA 3GIXA 1ZGNA 1M2DA 2J9HA 3UVHA 1Z6NA 2B5XA 3ZFLA 4WETA 1ML6A 4JR4A 3BD2A 3TRXA 3M3MA 2F8AA 3Q74A 3F3QA 2ZNMA 1A8YA 4WXTA 3U6VA 1Y25A 3TKPA 4BA7A 4RI7A 3KTBA 3I43A 4K2DA 1H75A 3MNGA 1O73A 1T1VA 2HSHA 2VUPA 5J4UA 4PXOA 3QCPA 5IMZA 4WF5A 14GSA 4DSRA 1I9DA 5DCHA 2DJ1A 1YQ1A 3VWVA 3ZITA 5LNKe 2LV3A 3LSZA 2WRTA 3L78A 1B9XC 4N0VA 4NV5A 1M2BA 1Z9HA 2VCTA 4Q5FA 1NM3A 1U3IA 1T00A 5FHIA 4EDZA 4AJ6A 4KE3A 4OCEA 3V1WA 3GH6A 1XFLA 3F4TA 1OYJA 2CZ2A 3GL3A 4KCEA 3TUEA 3QFBC 3G7YA 3HKRA 4KDYA 4GF0A 2CAQA 2A4VA 1V98A 3Q19A 1XWBA 3OR5A 4ZL9A 2I81A 1M7TA 1ABAA 4Q5NA 4MZWA 2IMEA 2YOIA 3NZNA 3TKQA 1LU4A 5ID2B 1UC7A 3EWLA 2VIMA 3ISOA 3QAGA 3WGEA 2D2ZA 3EMXA 3VWUA 1J08A 2XBQA 2DJ2A 4GLTA 4YAVA 2O7KA 2X8HA 1O81A 2VL3A 4KSOA 1IYIA 3CBUA 2ALBA 3ERFA 1G7OA 3TDGA 1TU7A 4IP1A 5IOWA 1TP9A 1MEKA 2IMFA 2LUSA 4FYBA 5EY6A 3TJBA 3IHQA 2DMMA 2LTKA 1A23A 2F51A 1TK5B 2VAFA 2EIRA 3APQA 4I8BA 1X5EA 3ERWA 5AIVA 1EGRA 3QAVA 2H0IA 2A2SA 4DSSB 1AXDA 3A3TA 2O87A 1GL8A 2DJ3A 4MPGA 2BTOT 4KB3A 1GSSA 3VK9A 4BL7A 3VURA 3LQ7A 1WIKA 3DRNA 3F6FA 2VD0A 2M46A 4IELA 4WR4A 4HJMA 2CVKA 1GULA 4TXOB 1QQ2A 3F4RA 4HQZA 1TKDB 4NPBA 1TOFA 4E8HA 4YQVA 1VF1A 1S3DA 4KH7A 4MH3A 2FGXA 4CDOA 3LWAA 4MABA 11GSA 2RUFA 5B6NA 1JHBA 2KLXA 2VCXA 1VF2A 2PBJA 2MZCA 5HFIA 2DJJA 3GTUB 4GQFA 3C8EA 3HD5A 2H66A 5J41A 2VL2A 4RUVA 3FKFA 4TXVA 2HZEB 3TJKA 3GFKA 2RIIA 1J0FA 2IPAA 1YZXA 5A4UA 3UBLA 3KD0A 3KMNA 4TXOA 2IN3A 2H8LA 4F03A 1OC9B 2CT6A 1X9SB 4MF5A 4E8EA 5FWGA 4MF6A 4DSQA 2K9FA 2LQQA 2E0QA 2P5QA 5J9BA 1XVWA 5C04A 1TU8A 3P90A 5B8BA 3US3A 1ERUA 4AF2A 2YNXA 3FRCA 2HYXA 2HZFA 1GWCA 1B4PA 1XXUA 3D22A 1THOA 2C3NA 2HXKA 2YV7A 1B4QA 1ON4A 5E4WA 2HZEA 5HQPA 4I2TA 2DIYA 2DIZA 4HS1A 1Q4JA 2TRCP 1XWKA 3HVXA 3MDKA 5IPHA 3ZL5A 1SJ6A 3VFIA 3Q18A 2WULA 3KZQA 18GSA 1XBSA 2OBIA 2X64A 3CMIA 3IK7A 2FWFA 2H6YA 3N5OA 1ZCPA 5JCUA 4MP4A 5DJMA 1G0TA 3UARA 1GNWA 1M9AA 3A2XA 1SKWB 3BOAA 3ZMKA 10GSA 3IA1A 3KMOA 2Z9SA 2AV4A 3TRQA 4NWYA 5D9XA 2FWEA 2PERA 3F63A 4K0NA 1QGVA 3E0UA 3F6DA 4PGTA 1JZOA 3GKMA 2H30A 4OFMA 3FYGA 1XIYA 4ZB8A 2WZ9A 3L4NA 2YJ7A 3QOUA 1W4VA 1SD9A 2PU9C 4LA1A 2CX4A 4OFTA 2X8GA 4EVMA 3WGXA 2C3QA 2R37A 3LEFA 4ZIJA 1AAZA 3FW2A 5ELAA 5KN3A 2P31A 2LNTA 3EE2A 2H71A 3UBKA 5HFGA 1NHOA 1X9WB 2OKAA 3I69A 1RK4A 2VCZA 3IOSA 2LQOA 1QFNA 3D5JA 3UJ1A 1SK1A 4Q5RA 3FZ4A 3D4TA 4IKHA 1QMVA 4ZL8A 1XWAA 5JCGA 2L6DA 3LYKA 1WOUA 1TXXA 1G6WA 3CYNA 1GUKA 3ZIJA 3L9SA 2HRFA 2F3MA 1S3AA 4X43A 5ELGA 1GTIA 1V40A 4EUYA 1AIUA 22GSA 13GSA 3VI5A 1TRUA 5IO2A 1SJZA 3DVWA 4KAEA 3ZVJA 2FHEA 3GNJA 5DALB 3UAPA 1JZDA 3P8WA 1RQMA 1YF1A 1JLVA 2L5OA 4ECCA 5H5RA 3RBTA 5ABRA 3VWWA 3DKSA 2DC5A 3QFAC 5GAPD 2H1AA 4FH8A 2GZPA 2TRXA 4GQCA 3RDWA 3QDNA 3I9V2 1HD2A 1WE0A 1WRYA 2WB9A 1R26A 3GSTA 3KCMA 1WP0A 4K7NA 5IMCA 1KEBA 5DALA 3W8JA 3N9JA 4N10A 1USBA 1XWCA 2H76A 1XZOA 1K0OA 2RM6A 3IAS2 3TOTA 1RW1A 3O76A 3HJPA 1KNGA 3H8QA 2R5GA 4XS4B 3D6IA 3M9KA 1T4YA 2MMAA 2NPBA 1OE7A 2XC2A 5G5FA 4WBRD 1YJ6A 3G9BA 1O85A 2IFQA 3C7MA 2I1UA 1V58A 5J3RA 1SYRA 3H4KA 1ZL9A 1TK0B 3Q6OA 2H01A 3ED3A 2L4CA 3DGQA 2A2RA 16GSA 4D73B 4EKZA 4ZBAA 2VM2A 2IWTA 4WF4A 5H5SA 5JWRB 2ES7A 2H1DA 2CA8A 1DE2A 2IL3A 5AISA 2K18A 4V1Ap 1K0NA 2I3YA 3HZ8A 4GRFA 1GTUA 1OKDA 3GHAA 2ON7A 2YP6A 4YQMA 1EEJA 1FAAA 1J9BA 1B9YC 1HYUA 3KIJA 4ECBA 4LL1B 1A0FA 2MMOA 4WBJA 1YY7A 2OE0A 1U88A 5GZZB 1XWGA 5IO0A 1K0AA 2B5EA 5D9WA 2YV9A 3QAWA 4IQ1A 1O8XA 1N2AA 4IP6A 1A2JA 1XVQA 5HR2A 3JCML 5J5NA 2L4QA 2VOCA 4IVFA 2V2GA 3PGTA 3TKSA 3IC4A 2H70A 2GDRA 1K3OA 2LSTA 5CRHA 5DJLA 8GSSA 3SBCA 1UVZA 1MDIA 2YWMA 2L6CA 2I9HA 4XHMA 1DE1A 3CSJA 1EWXA 2LJAA 5ECHB 2HSYA 4PNFA 3HA9A 4GTUA 2V32A 4ISDA 3FR6A 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chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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