2CV4A

Crystal structure of an archaeal peroxiredoxin from the aerobic hyperthermophilic crenarchaeon aeropyrum pernix k1
Total Genus 71
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
71
sequence length
241
structure length
240
Chain Sequence
PGSIPLIGERFPEMEVTTDHGVIKLPDHYVSQGKWFVLFSHPADFTPVTTEFVSFARRYEDFQRLGVDLIGLSVDSVFSHIKWKEWIERHIGVRIPFPIIADPQGTVARRLGLLHAESATHTVRGVFIVDARGVIRTMLYYPMELGRLVDEILRIVKALKLGDSLKRAVPADWPNNEIIGEGLIVPPPTTEDQARARMESGQYRCLDWWFCWDTPASRDDVEEARRYLRRAAEKPAKLLY
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
{{ tooltip.sname }} connected with {{ tooltip.tname }} : {{qFormat(tooltip.svalue) }}
molecule tags Oxygen storage/transport
source organism Aeropyrum pernix
publication title Crystal Structure of an Archaeal Peroxiredoxin from the Aerobic Hyperthermophilic Crenarchaeon Aeropyrum pernix K1
pubmed doi rcsb
molecule keywords peroxiredoxin
total genus 71
structure length 240
sequence length 241
chains with identical sequence B, C, D, E, F, G, H, I, J
ec nomenclature ec 1.11.1.15: Peroxiredoxin.
pdb deposition date 2005-05-31

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00578 AhpC-TSA AhpC/TSA family
A PF10417 1-cysPrx_C C-terminal domain of 1-Cys peroxiredoxin
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.30.1020.20 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Antioxidant, Horf6; Chain A, domain 2 Antioxidant, Horf6; Chain A, domain 2 2cv4A02
3.40.30.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich Glutaredoxin Glutaredoxin 2cv4A01
1TW9A 4L0UA 5GAPD 4KUNA 4LA1A 4K0NA 4MH3A 2I1UA 1BAYA 1ILOA 1K0OA 3M8NA 5DAKB 2H1GA 2PPTA 1K3YA 4L5OA 4ZBBA 4X1UA 4DSSB 4EDYA 3GA4A 3CTGA 1FW1A 1XOAA 1GLQA 2XPEA 3RHCA 2C0DA 2HLSA 2PBJA 4IGJA 1B9XC 1WP0A 2GTUA 1E6BA 4RQRA 5ECMB 4ECCA 1X9MB 4HJMA 3FY7A 3VI5A 3L9VA 4GSNA 2H73A 2OE1A 4XS6A 3QPMA 3P90A 1JFUA 4RUVA 1ZCPA 1BEDA 1SD9A 2JL4A 1VF3A 3FW2A 5D9VA 2RIIA 3RDWA 2XBIA 1T4ZA 3KH9A 3SWLA 4AGSA 3GKNA 1S3CA 3RHBA 2WULA 4J57E 3US3A 1TI1A 1EWXA 2VLUA 4QL7A 2VM1A 3ME8A 5IMCA 2FD3A 4YQUA 2MYGA 3EURA 1ACVA 2JZRA 3TKRA 3U5RE 1YQ1A 1AC1A 5D8IA 2CA8A 4AJ6A 2H71A 5CRWA 3GH6A 5B8BA 4FO5A 1YZXA 1A8LA 2C8UA 1DE2A 2OBKA 4XS1A 4XS4A 3GIXA 4MDCA 2H75A 1A2JA 2MBTA 1GWCA 1AAZA 3BOAA 4IELA 2HRNA 1PX6A 2CT6A 3HZ8A 1Z6MA 1PA3A 2ON5A 1G6YA 3I43A 1J9BA 2C3TA 1X5DA 4I2TA 3F63A 1EOGA 1TU8A 4Q5QA 4K8MA 1QK8A 4BVYA 3C1SA 2HXKA 4N10A 1GULA 5JWQB 3O3TA 3BD2A 2GZZA 1O6JA 5ELGA 3UBKA 2H1AA 4ULXA 1TU7A 4HQZA 3F6DA 4WF4A 3IE3A 9GSSA 1GTBA 5ID2B 4BPYA 4G19A 4IJ3A 1R5AA 2WZ9A 1K0CA 1QUWA 3A2VA 2LRNA 4OCFA 5IMVA 2CV4A 1SD8A 3M0FA 3BCIA 5EPFA 3EU3A 3IDVA 3LG6A 1KBNA 2KLXA 1OKDA 4ML6A 3D21A 5CO3A 3HDCA 4ECBA 4LMWA 4HS1A 3CSIA 4IKHA 2VUPA 1ZGNA 2NBSA 3P2AA 2G0FA 1G0TA 3DRNA 1HNAA 1ST9A 4RI7A 3IK7A 1NM3A 1TKDB 1HNCA 4EO3A 4IVFA 2YOIA 1XW6A 2R3XA 3NZNA 2R2JA 2L6CA 2F51A 3QOUA 3EU4A 4KDXA 3ME7A 2RUFA 3J7Yb 2M46A 4I8BA 4ZXGA 3DKSA 2K8SA 4ID0A 1THOA 2C4JA 2TRCP 3LEFA 3BJ5A 5DAKA 2R5GA 3TKSC 4KA0A 1HYUA 4WETA 4Q5RA 4KNDA 3P7XA 4PUAA 1EP8A 2D2ZA 1YF0A 2FA8A 1MDIA 2L59A 3KD0A 4OMVA 3WGXA 3QAVA 4ISDA 4IP6A 1YKAA 2LQOA 4WR4A 2ON7A 2F8FA 4K2DA 4GRFA 4IBPA 3F3RA 3ZRDA 1YF1A 4E8HA 4F9ZA 3IK9A 3W8SA 2AYTA 4MF5A 3H4KA 5FT3A 3HKRA 2LJKA 1XWCA 2VM2A 4BWQA 2MMOA 1YDKA 1ZOFA 1B9YC 2IL3A 2YV9A 2H19A 1G6WA 5FHIA 2H01A 2WGRA 3VFIA 2FY6A 1XFLA 4BWSA 2VCVA 2CVBA 3KP8A 3G9BA 4YQVA 1U6TA 2H0HA 2OADA 1A23A 1GSQA 5B7CA 1NHYA 3I9V2 3HVVA 1R26A 4PQ1A 4PXOA 3GX0A 2KOKA 3ZZXA 2DC5A 5JCUA 4PURA 1KTEA 3IV4A 1OVNA 3LFLA 6GSUA 1GTIA 3LYPA 1J08A 2FUG2 3ISOA 3K8NA 2J23A 1RW1A 3NIVA 4IQAA 3RAZA 3ZL5A 2IWTA 4JRRA 2VL3A 2IN3A 3M9JA 1PKZA 2WFCA 3KP9A 5LD0A 2JSZA 4X43A 3W8JA 4KDUA 3GL3A 3VURA 1G7EA 2LV3A 1MEKA 4XIHA 1XCCA 2VD0A 3UVTA 2C80A 16GSA 1YY7A 2OBIA 3HYPA 2ZCTA 1X5EA 5CREA 1SL2B 5E4WA 2EC4A 3O76A 1QGVA 2B1LA 5AISA 2PERA 4KSMA 4GLTA 1K0AA 5ID2A 3CXGA 2X8GA 2QGVA 2MZCA 2LNSA 1TOFA 6GSXA 3N9JA 5HR3A 3CRUA 2GVPA 4NXIA 2VIMA 2HFDA 4WF5A 4K7IA 1TTZA 13GSA 2VCQA 3VWWA 1TP9A 3IPZA 1RK4A 4IW9A 4CW9A 2IFQB 1E2YA 2OKAA 2LS5A 1ABAA 3A2WA 4MZCA 5J9CA 1V98A 5CYYA 4NV5A 5IPHA 2R37A 1B4QA 2K8VA 4TR0A 2AV4A 3D22A 2YJ7A 1ZL9A 4EC0A 1I9DA 3HZ4A 2GZYA 3F0IA 4AJ8A 4YH2A 4AJ7A 1XIYA 4WEYA 4MF7A 2NVLA 5A4WA 3QFAC 1OAZA 4KDYA 1GUMA 2VCZA 5KN0A 1EP7A 5F06A 2DMMA 3TJFA 4EKZA 5GSSA 4V2MA 4KW6A 3IXRA 1U3IA 1SL0B 4F2IA 2PGTA 2DJJA 3VLNA 3WGDA 4OO4A 1S3AA 2VCWA 3MWHA 2O87A 4JU5A 5A4VA 1R5PA 3UJ1A 5HFIA 5D73A 4HI7A 3IHQA 2C3QA 1Z9HA 2B7JA 4K6XA 4MP4A 3F4SA 1V57A 4L0WA 3TJKA 5IPGA 4MCUA 1GSYA 1JLWA 3RBTA 2FWFA 2PVOC 2KUCA 2AB6A 3ERFA 5ELAA 1A0FA 4ZILA 2FGXA 3D5JA 4F0CA 1G7OA 2AAWA 1K0BA 2YANA 2FNOA 3GKXA 2P0GA 5B6NA 3UARA 5KN1A 4OCEA 1XXUA 1M9AA 1A8YA 1FB6A 2OACA 1JZRA 3FEUA 5IO0A 3LSZA 1PQNA 1GUHA 2OE3A 3D0ZA 1BJXA 3L0HA 1K3OA 1S3DA 2H6YA 2YV7A 4GSSA 1JZWA 1XW9A 3QAWA 4E8EA 1H75A 4Q5NA 2VOCA 5EVOA 1O81A 3A5WA 3G7YA 4DVCA 1WMJA 4EVMA 2MBSA 1OE7A 3IA1A 2VLTA 1SJZA 2L57A 5ECPB 1T3BA 2XPDA 3FYGA 1SK2A 3KXOA 2I81A 1YJ6A 2I9HA 2N5BA 3KMOA 1T00A 2DJ0A 2IJYA 3E0UA 5G1KA 3GKKA 4TR4A 4MLYA 3ZMKA 3IAM2 3J7Yk 1XZOA 5CRDA 2DJKA 5HR2A 1SK0A 1AUCA 1DUGA 5H5RA 2IMKA 2C1YA 2IPAA 1MD4A 1NSWA 5J5NA 4PX1A 1A2LA 3FR3A 1SENA 3Q18A 1PD21 4WBJA 2H1BA 4GSTA 3VK9A 3APSA 4HZ4A 2CX3A 2E2MA 22GSA 3WD6A 3DWVA 3UBLA 2ES7A 1PSQA 2MMZA 3ZVJA 4ZL8A 2B1KA 4F82A 2IFQA 1U3AA 1JZDA 1JHBA 4JR6A 5JWRB 1BQ7A 4V2NA 4P3YB 1TRVA 3CSJA 3AY8A 1O7UA 5IOXA 3GKMA 3KCMA 5ECHB 1F2EA 5G1LA 3IC4A 2AHEA 5G2ZA 4V1Ag 4NMUA 4MF6A 3F4TA 5CP1A 4KX4A 4EF0A 3GN3A 3P8WA 5COHA 2L4CA 1SYXA 1AQXA 1GTUA 5ECRB 4YQMA 5DVBA 5LCZA 2PWJA 2YJHA 2X99A 3RPNA 2LUSA 5H5QA 1W4VA 5B6MA 2BMXA 2P5RA 1PL2A 2GT5A 2K18A 1W89A 3C8EA 3NOFA 3HJMA 5ECIB 3ERGA 3GRXA 3HJOA 1O73A 2CQ9A 1TXXA 1WRYA 1GSEA 4OWYA 5CRHA 3KTBA 4I5QA 2XC2A 3C71A 1T1VA 2YN1A 3UIWA 5DCGA 3FZ9A 1EEJA 5DALB 1URMA 3GURA 1GNWA 3KIJA 1RQMA 5DQSA 3R2QA 4ZL9A 4L8EA 1GLPA 1WWJA 2JZSA 2FWHA 1NHOA 3D4MA 5IM9A 4TW5A 5H5SA 4Z7XA 3HVSA 4TVEA 4EDZA 3GX8A 4PNGA 4K1FA 3TOUA 1M2DA 3GMFA 2YCDA 2L5LA 2IMFA 1PX7A 5KN2A 2H76A 2L6DA 1R4WA 3HXSA 4IP1A 3TCOA 4HZ2A 1Z7PA 1PMTA 1FB0A 4HUAA 1WE0A 3Q19A 2H66A 4EUYA 2CAQA 3IR4A 3I6AA 2GQMA 1V2AA 3QAGA 4K9ZA 1MTCA 3C73A 2REMA 5HQPA 3GHAA 3PINA 5B8AA 2GSRA 5CAXA 2B5YA 3ZIJA 5LNKe 3LXTA 1GTAA 5ECQB 1GSFA 1TK8B 4LLRA 3KH7A 3VWUA 2O89A 1ZYQB 1QXHA 4TXOA 5JCWA 3VPQA 1EZKA 5GAND 4IS0A 2YWMA 3HD5A 2F8AA 6GSWA 1SL1B 1VF4A 2GSQA 3GL5A 3TRPA 4ACSA 2B7KA 2DMLA 1U87A 3KEBA 1AXDA 1Y25A 3IRAA 1FHEA 1GNEA 2OE0A 4PQIA 3TKQA 2GQLA 4G9HA 5E59A 2EIOA 3L4NA 3WT1A 4KCEA 2DLXA 1TK0B 1J0FA 1X0RA 2O85A 2HT9A 2CZ3A 3ZLPA 2VLVA 2HZFA 5G5EA 4BVXA 3LQ7A 3VWVA 3G7IA 3QFBC 1XPVA 1HNBA 1V9WA 3GSTA 2R6KA 3ZTLA 3GTUB 3UEMA 2LTKA 3DVWA 2M72A 5C00A 2GT6A 4HQSA 3HCZA 1F6MC 4MJEA 3FZ5A 1TI3A 2ZUPA 2H30A 2VCTA 1TRWA 1VF2A 11GSA 1EOHA 5DBQA 1H4OA 5D9TA 4G2EA 2RM6A 2DJ2A 3ED3A 1DBYA 5ECLB 3CSHA 1N2AA 2HZEB 4MA9A 1F3AA 4YAVA 2XBQA 2JZTA 1YEXA 2YZUA 1V58A 3DEXA 10GSA 3MNGA 5D9WA 4TN8A 4MJCA 1K0DA 20GSA 3EINA 4POLA 3KM6A 4MZBA 4MPGA 2WCIA 2VCXA 2HE3A 4KAEA 3WYWA 1UVZA 3TOTA 1ZMAA 4POBA 1MDJA 1GH2A 1Z7RA 4ZIJA 1YKCA 3H93A 3DGQA 12GSA 1MDKA 2N5FA 4JR4A 3GSSA 4ECIA 2NPBA 5DALA 19GSA 3V1WA 1TDIA 3EE2A 1OKTA 1KNGA 2A4VA 2H70A 2WS2A 4ZB9A 2KHPA 1KEBA 1PN9A 4O7HA 3M1GA 3FZAA 5HR0A 2BJXA 3HJPA 4MJBA 1UN2A 3F8UA 4JEDA 1X9SB 2B6MA 2C0GA 3A2XA 4BA7A 2YNXA 5F0GA 5G31A 1BYEA 3LXZA 5F8BA 4L5LA 2AJQB 3KJYA 2FHEA 4NAXA 4TR1B 4JZQA 4G10A 1XOBA 4LL4B 2GS3A 1OYJA 3HVXA 2GQKA 4NHWA 4EE0A 2YWIA 4H86A 3E3EA 2A2RA 4PNFA 4KGIA 1OC9B 2HI7A 3ZFLA 2CX4A 3UMAA 3H79A 2F9SA 1Y6EA 1M0UA 4OFMA 2WJUA 3ZMLA 3MSZA 4CHSA 1ERTA 1AQVA 5GZZB 5CNWA 2L5OA 1MD3A 3Q74A 4EL1A 3M9KA 3TJJA 3IAS2 1T7PB 2VD1A 5ECKB 1FO5A 4FYUA 4OFNA 3UVHA 4X0XA 2DBCA 3D4TA 2GGTA 4XTSA 2EIRA 2WRTA 4V2LA 1B48A 4MPFA 1V40A 1XVWA 4J2FA 3GUSA 2H72A 1A2MA 4HDEA 4KE3A 2QSIA 4MK3A 4HU7A 1T4YA 2P31A 4NWYA 1X5CA 3E9JB 4EXJA 2RUEA 4ZB6A 4ZL7A 1F3BA 3VWXA 2CVKA 2RM5A 5IO2A 7GSSA 3GTUA 2CVDA 4NHZA 3KGKA 3ZVJD 2HRFA 4TRXA 2K6VA 2CAIA 5CRGA 3CBUA 5AGYA 1TRSA 2C0EA 4ML1A 1QQ2A 3WGEA 1M2AA 3S9FA 2V2GA 1OC8A 1SKWB 2JADA 2Z9SA 4QQ7A 3SBCA 1EGOA 2R4VA 2HZEA 4OD7A 1QFNA 4ZBAA 2PMTA 3F9UA 3TGZA 4NPBA 2YWNA 3DMLA 1NW2A 2ALBA 4OO5A 4TXOB 5A5KA 3FHKA 5IMDA 3GYKA 5ABRA 3H1NA 4IHUA 3IBHA 1FVJA 2GSSA 4V1Ap 2B5EA 4O92A 4KSOA 5D9XA 1EEMA 4F03A 5J4UA 1Q4JA 2LRCA 1JZOA 3OR5A 1ERVA 3TKSE 1M99A 5ECSA 4KH7A 2X8CA 1EV4A 3FR9A 3I69A 1OE8A 2L4QA 5HFKA 4TXVA 4MZWA 2PN8A 2IMIA 1PGTA 4TR3A 2B3SA 3DD3A 1LJRA 4POKA 2VL9A 2DIZA 3F4RA 3KTLA 1USBA 4XCSA 2YWOA 1VF1A 2H1DA 1SJ6A 1Z3EA 2H8LA 1SKRB 5HR1A 4LMVA 3O6TA 2QKEA 3LORA 3PR8A 4KB3A 3BBYA 3DXBA 1GL8A 6GSSA 3EMXA 3ZREA 2C3NA 1VRSD 3TB2A 1Q98A 1UC7A 5L71A 2G2QA 3EVIA 5DJMA 2JU5A 2OA7A 6GSYA 1PRXA 3L9SA 4HJ2A 2M80A 2KP2A 4TR1A 2RLIA 3LYKA 2VL2C 1XWBA 2V32A 3N5OA 1C72A 4GTUA 2O7KA 5ENUA 4GXZA 4DSQA 2B5XA 1FG4A 1T8EB 3GNJA 1M7TA 4I2UA 4NV2A 8GSSA 1LU4A 2JACA 3D6IA 1OC9A 1JLVA 1XWAA 3GH9A 2V41A 2J9HA 5IQYA 1FAAA 1QMVA 5G30A 3W6GA 18GSA 4D73B 4POMA 4LL1B 3ZITA 1CQHA 1HD2A 4YAPA 3DYRA 2OJLA 2KP1A 4GCIA 2PVQA 3KZQA 4FYCA 3EYTA 2YPMA 1CQGA 5J9BA 4JBBA 2TIRA 3UAPA 2IMEA 4O5RA 2YZHA 5KN3A 4WXTA 5DCHA 1THXA 4HOJA 1GSSA 2C0FA 4F0BA 3TRQA 3M3MA 2F3MA 1SK1A 2CZ2A 4KCAA 4N11A 3UL3A 2XHFA 1Z5YE 4WBRD 1O85A 2GZPA 3QMXA 1WJKA 5J3RA 1WOUA 1SYRA 5IOWA 4ZB8A 2DJ1A 4DEJA 3MAKA 1R7HA 3GV1A 3Q6OA 3EC3A 5DDLA 1PL1A 4XHMA 5INYA 2LRTA 2V6OA 3LWAA 2E2GA 4DSSA 3MDKA 4O32A 3ZYWA 2LEGA 2X8HA 2MMNA 4I6XA 5A4UA 1ZYEA 3QCPA 5HFGA 3CTFA 3A3TA 3H8QA 5FWGA 4ECJA 4RI6A 4PUFC 1F9MA 3C7MA 4I97A 5IIZA 3PGTA 1XWKA 5DQYA 1SKSB 2TRXA 2FA4A 5ECOB 5JCGA 2H6XA 2DJ3A 5IMAA 4N0VA 3CRTA 5AIVA 5JWOB 3ERWA 3QD9A 3EMPA 2FLSA 1IYIA 1ON4A 4RQXA 1EGRA 4J56E 3QDNA 2NTOA 5G5FA 4GF0A 4WR5A 3F3QA 2P5QA 6GSVA 2GDRA 3PH9A 2H0IA 2LJAA 2IIYA 4Q5FA 2FWEA 2LNTA 2LSTA 1LBKA 4PGTA 5F07A 1M2BA 4GQFA 4PQHA 1K3LA 4IQ1A 1TK5B 1SU9A 5C04A 1SJIA 1A0RP 4ZBDA 3VPTA 2I4AA 5KEJA 4AF2A 4K0GA 2H6ZA 3APQA 1B4PA 4CDOA 2FWGA 4IJIA 1XWGA 2LQQA 2JSYA 4MABA 4BL7A 1VGLA 3WT2A 4GWRA 2QC7A 4K7OA 2GLRA 1BX9A 3UOMA 2A2SA 2ZNMA 2PU9C 1U88A 4ILFA 4MH2A 4MMMA 5AIXA 3ZIVA 1YEPA 1O8XA 4FH8A 3LJRA 1WPIA 2VL2A 1EV9A 17GSA 2V6KA 4GQCA 1FOVA 4N30A 2FCHA 3TRXA 3VI7A 2WDUA 4MJAA 1I5GA 1M9BA 3EWLA 4HU9A 1F37A 1DE1A 5IMZA 1N8JA 1GUKA 3ZFBA 3F6FA 2PUKC 1K0MA 4D73A 4OFTA 6GSTA 3HHVA 5ECNB 2EIQA 2NDOA 1K0NA 1WIKA 1TJDA 1B8XA 4K7NA 5AN1A 2H0GA 3LGCA 3U6VA 14GSA 1ZZYA 2GSTA 1HQOA 4XRDA 1TRUA 1AIUA 3TKPA 3APOA 4TOPA 4WKWA 1GRXA 1AW9A 2E7PA 3L78A 4XS4B 5D93A 2DSAA 1A24A 5EY6A 2WB9A 2HSHA 2HNLA 3FZ4A 4N0ZA 3L9UA 1ML6A 4QL9A 2LKUA 3TDGA 1XBSA 1UA5A 2E0QA 3CYNA 1IYHA 1GSDA 1X9WB 5F05A 3QR6A 5D96A 1ERWA 2V1MA 2I3YA 1PKWA 2IMDA 5IMFA 4TKYA 5GSTA 2MMAA 2N5AA 3DIEA 3BCKA 3TUEA 3TKSA 1ERUA 3GFKA 1DSBA 3HA9A 1GSUA 3IOSA 1GP1A 5EL8A 5DJLA 2VAFA 4JE1A 1O8WA 2LJRA 2YP6A 2HYXA 4HEA2 4DSRA 3TJBA 3HY2A 3C1RA 2AUVA 2H74A 1OC3A 4FIWA 4XRAA 1BG5A 4IN0A 3FR6A 5J41A 2O8VB 3FK8A 3G7JA 3FKFA 1Z6NA 2X64A 1FVKA 1XW5A 2BTOT 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chains in the Genus database with same CATH superfamily
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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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