4Z2UA

Crystal structure of 2-hydroxybiphenyl 3-monooxygenase r242q from pseudomonas azelaica
Total Genus 191
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
191
sequence length
581
structure length
563
Chain Sequence
AETDVLIVGAGPAGAMSATLLASLGIRSLMINRWRSTSPGPRSHIINQRTMEILRDIGLEESAKSLAVPKEYMGEHVYATSLAGEEFGRIPAWASHPQAHAEHELASPSRYCDLPQLYFEPMVVSEAALRGADVRFLTEYLGHVEDQDGVTARLLDHVSGAEYEVRAKYIIGADGAHSLVAQNAGLPFEGQMGIGDSGSINIEFSADLSSLCEHRKGDMYWMFVAALQMIRPWNKWICVWGYITKEEAKKIIHEIIGTDEIPVEVGPISTWTINQQYAVRNTSGRVFCMGDAVHRHTPMGGLGLNTSVQDAYNLAWKLALVLKGTAAPTLLDSYDAERSPVAKQIVERAFKSLSTFPPVFEALSLPPAPTESEMAEALVRLKDASEEGAKRRAALRKAMDATIIGLGGGHGVELNQRYVSRAVFPDGTPDPGFVRDQEFFYQASTRPGAHLPHVWLTENQRRISTLDLCGKGRFTLLTGLSGAAWKHEAEQVSQSLGIELKVCVIGPGQEFVDTYGEYAKISEIGESGALLVRPDMFIAFRAKDASREGLEQLNVAVKSILGR
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

molecule tags Oxidoreductase
molecule keywords 2-hydroxybiphenyl-3-monooxygenase
publication title A crystal structure of 2-hydroxybiphenyl 3-monooxygenase with bound substrate provides insights into the enzymatic mechanism.
pubmed doi rcsb
source organism Pseudomonas nitroreducens hbp1
total genus 191
structure length 563
sequence length 581
chains with identical sequence B
ec nomenclature ec 1.14.13.44: 2-hydroxybiphenyl 3-monooxygenase.
pdb deposition date 2015-03-30

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF01494 FAD_binding_3 FAD binding domain
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.30.120 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich Glutaredoxin Glutaredoxin 4z2uA03
3.50.50.60 Alpha Beta 3-Layer(bba) Sandwich FAD/NAD(P)-binding domain FAD/NAD(P)-binding domain 4z2uA01
2GVCA 1P2HA 3FG2P 5KOWA 2B7SA 3SM8A 2YAUA 4Z2UA 3I3LA 2YWLA 4UP3A 2BXRA 2VVMA 3AE9A 3DJDA 2X8GA 3UTHA 4X9NA 3WE0A 4CBQA 1HYUA 4C3YA 1JNZA 4GDPA 1D7YA 3UOXA 4Z24A 2GEWA 1EL5A 4J56A 2GR0A 4IVOB 3UTEA 2WDVA 3V3NA 2FJDA 3K30A 2WETA 3RP8A 2XVIA 2R46A 1OJ9A 4CY8A 2B9XA 4J2WA 2JB2A 5JCLA 3C4AA 3AEBA 4YWOA 2WU5A 4OPGA 3KPFA 2QA2A 1SEZA 1PXCA 2WDQA 3ZYXA 3ICRA 4IV9A 1REOA 4H2NA 3BHKA 2BABA 1VRQB 3LJPA 2I0ZA 1VG9A 1GOSA 4JNAA 2B7RA 1TDKA 2XFQA 2B9WA 3CPJG 1FEAA 1M64A 2YLWA 1CJ2A 5HHFA 4EM4A 5FS7A 3NG7X 2XCGA 2GQWA 4EIPA 1KDGA 3NIXA 2WP6A 1PBDA 4JNQA 3GD4A 3NH3X 4U2SA 1LTXR 3LADA 2BK3A 1MXTA 3VRBA 1K0IA 3NYCA 2JAEA 1GESA 2VVLA 2O9ZA 3AE7A 1H82A 2C66A 3SFDA 1FEBA 1PDHA 3ALLA 2VQBA 3CNJA 2BXSA 2VQ7A 2R4EA 2WOWA 4B1BA 1DJNA 1TDFA 1FCDA 2FBWA 1CF3A 1TDNA 2QCUA 2VRLA 2YLXA 3ALMA 3PO7A 2C73A 3DJGX 3GMCA 3UP5A 1BGNA 1YKJA 4EQWA 1XANA 2XFOA 1OJAA 2WPFA 3CIRA 3HZLA 1S3BA 3DJJA 4BJZA 3NGCX 1EL9A 4WX1A 4NZHA 2XFUA 4AP1A 3AE3A 4U8OA 5M0ZA 2BS3A 4A99A 2AQJA 2V6OA 3ADAB 3GYJA 4BK1A 1YQ4A 3AE8A 3AEEA 1E1MA 3EF6A 3H8LA 4BJYA 4D03A 3IF9A 4U8PA 3AEDA 2WHDA 1E1LA 2BACA 1DOBA 2X8CA 1PBBA 4H4XA 3IWAA 3T37A 4YKGA 3UCLA 4B67A 4OPIA 5IQ4A 1ONFA 1L9CA 5IPYA 3LB8A 4H4PA 4LIIA 1B4VA 2YLSA 4H4SA 1DODA 1GALA 2V3AA 4C3XA 3P9UA 4YTMA 1X31B 1LJ1A 3DK4A 1K4QA 1TDEA 3CGEA 2APGA 3ATQA 1MOKA 3I6DA 2GV8A 2XFPA 4Z2TA 4A6NB 4GR1A 2XDOA 3QSSA 3P1WA 1F8WA 4K8DA 3D8XA 1TYTA 2JK6A 2WESA 1DXLA 4FK1A 1CC4A 4TM3A 2RGJA 3P4RA 1M6IA 2X99A 2Z5YA 4JQ9A 3E1TA 2E5VA 2C3DA 2FJAA 3RHAA 3UKKA 1H6VA 3CNTA 3DA1A 4B69A 1JEHA 4CNKA 4B63A 2AAQA 2B9YA 4H4YA 3QVRA 1O94A 5GRTA 1ZP0A 3CNSA 2Q0LA 4J57A 1N4WA 1BWCA 2YG5A 3RNMA 4EMWA 4DSHA 1GPEA 2OLNA 1IUXA 2EQ6A 3SGLA 3NKSA 3GMBA 1Z6LA 3DK9A 4CY6A 4LA1A 4ZCCA 2BK5A 4EQXA 1KSSA 1GTHA 4JDRA 1NG4A 1K0LA 2Q0KA 2Q7VA 2X50A 1GRAA 3CNDA 1ZK7A 3AE5A 3NYEA 4PAAA 4HA6A 2GAGB 3CPHG 1KSUA 1E39A 3L8KA 4GF7A 3UKLA 3GYIA 4C77A 1IJHA 4K5SA 1H83A 3BI5A 3DK8A 3NK0X 4UDPA 1XHCA 4XWRA 4H4RA 2DKIA 1KNRA 4K22A 4B66A 4YSZA 3H4KA 5L46A 1O5WA 5EB4A 1YQZA 1OJCA 2R45A 1NG3A 1GTEA 2FJEA 2XFNA 4E0VA 1F6MA 2RABA 2WS3A 4APNA 4BK2A 3AEAA 2E4GA 1Q1RA 4ICYA 4EM3A 1QLBA 1QO8A 4O5UA 1KNPA 1H7XA 1PS9A 2ZZBA 3VRDB 2YVFA 1E1KA 4B64A 4H4UA 1TDOA 1GNDA 2OA1A 4JY2A 3GRTA 4A9WA 4BK3A 3CNPA 5HXIA 3UOYA 2ACZA 3REDA 4DSGA 2BK4A 2GMJA 3GD3A 4BV6A 1JU2A 2J3NA 1RYIA 5JCMA 3AEFA 3H8IA 3CGBA 4H2RA 5IQ1A 1DOEA 2WBAA 4TM1A 4U8MA 2C65A 1IUVA 5CKUA 2XVJA 2Y6QA 2GAHB 3DGZA 1GEUA 3AECA 4GUVA 4H4VA 2X8HA 4YTPA 3LOVA 2C7GA 1PBFA 1D4DA 2CVJA 3EAOA 3NLCA 3KLJA 1KF6A 1PBCA 1D5TA 2R0PA 2QAEA 3AD8B 4UDQA 4ECHA 4OPLA 5FS8A 4Z43A 2C75A 1B37A 2GF3A 5BVAA 3L1RA 5U63A 2WPCA 1VDCA 4XXGA 4ZCDA 3CPIG 2WDRA 1CC6A 1L0VA 4I58A 4H4ZA 3AYJA 2F5ZA 4K2XA 1S3EA 2EQ8A 2GB0A 5JCIA 2BS4A 3NNEA 1IUUA 4H4TA 1FL2A 4K7ZA 4C74A 4EMJA 3KA7A 1CHUA 4DGKA 1NENA 3K7QX 2OALA 3UKHA 3EPTA 4U8LA 3QJ4A 2YG4A 4OPCA 3RP6A 5EOWA 1NHRA 1D4EA 4FK1C 1PXBA 1GRBA 4NTDA 3NHOX 1GREA 1Y56A 3UOZA 4Y4MA 5TR3A 3QSEA 4Z25A 4NEVA 3GWFA 3QVPA 2XVHA 3AXBA 4AT2A 1PJ5A 3OZ2A 2WOIA 5BUKA 2FJBA 1IUTA 4AT0A 5C2TA 4Y4LA 2XVEA 4KX6A 1IUWA 5FMHA 1DNCA 4I59A 3GWDA 1Y56B 1BGJA 2YR5A 1CL0A 1OJDA 4U2TA 1LQTA 4A6NA 2E1MA 3P4SA 3UKAA 5KVHA 4J31A 2Q6UA 1GXFA 4OVIA 3JSKA 2QA1A 3AEGA 1TYPA 3AE4A 4J34A 1ZOYA 4U2LA 5ER0A 3KVEA 3NYFA 3ISHA 1ZX9A 3KU9A 3SQPA 1K0JA 3GRSA 4AOXA 2YVGA 1PHHA 2YG6A 1Q1WA 5HY5A 3RP7A 3QFAA 3AE6A 3UKQA 5J60A 1CC2A 3S61A 2BCPA 3G5SA 3ITJA 4A79A 3GDPA 4YTNA 4U8KA 2ZBWA 3BNMA 2CDUA 3K7TA 1COYA 1D4CA 2HQMA 4CCRA 1W4XA 4ZN0A 1PJ7A 3AWIA 1S2QA 2WEUA 2YG7A 4OPDA 4RG4A 4B68A 3VQRA 1TRBA 1XDIA 4HB9A 4X4JA 4ADWA 1JRZA 4RSLA 3BI4A 3B3RA 4D04A 2YR6A 3CN8A 3V3OA 3P4PA 3BI2A 1ZMDA 2DKHA 3FPZA 3NK1X 5FS6A 2R0GA 4RG3A 2BS2A 2OAMA 1VG0A 3AD9B 3IHGA 2VRMA 4GRTA 3BHFA 1B5QA 4H4QA 3CGCA 3FMWA 2WP5A 2GH5A 1PXAA 5LV9A 3UKFA 3SFEA 2R9ZA 1KFYA 5JCNA 1EL8A 4P9SA 3KKJA 3AE2A 1AOGA 4A7AA 4AP3A 5KOXA 1GETA 4YSXA 3D1CA 4TLZA 3V76A 4YSHA 3F8PA 5KXJA 5KVIA 2Z5XA 2C64A 1YQ3A 4O5QA 4REKA 4CRTA 3K7MX 2Y6RA 3GSIA 3Q9TA 3NN6X 2IIDA 2XLUA 5KWFA 4H2QA 2GQFA 5M10A 1F8RA 4EIQA 3PVCA 3DGHA 2V61A 2VVLG 1CBOA 3UKPA 3UP4A 2CFYA 2H88A 1OJTA 2JB3A 2R4JA 3II4A 2V5ZA 1BF3A 1LPFA 5DBJA 2C67A 3URHA 4J36A 2X3NA 3EANA 2ZZ0A 4H50A 2UZZA 2NVKX 3C96A 5J7XA 4OPTA 4A65A 2WQYA 4YT0A 2EQ9A 3ABVA 4OPUA 2ARDA 1FOHA 1GT8A 2C72A 4NTCA 2RGOA 3ICSA 3KD9A 2GMHA 2GRTA 2WP9A 2XYOA 2YR4A 3VRAA 4K5RA 1PN0A 1N4VA 1YY5A 3FBSA 1FECA 3LZWA 4LU6A 4EMIA 5KRQA 2IVEA 2WPEA 3C4NA 3AB1A 2GR1A 3FIMB 4KPRA 2TMDA 3DMEA 3LXDA 5U1OA 3LZXA 2A8XA 2GR2A 1BZLA 4CCQA 2XVFA 2BC1A 2EQ7A 4DNAA 2YLTA 3NTAA 4AOSA 3GDNA 4B65A 2W0HA 1Q9IA 2VZ2A 3S5WA 1F8SA 4FDCB 5JCKA 1CJ4A 1VQWA 3AYIA 2A89A 3UTGA 3QSMA 2CULA 1CJ3A 2C70A 4U8JA 2PYXA 1PJ6A 2XLPA 2WU2A 4JY3A 1L9EA 1H81A 1GSNA 4JN9A 1P2EA 1IUSA 1NHSA 2B76A 3VR8A 1GRHA 5HYMA 1QJDA 4Z2RA 1CJCA 1NDAA 2JKCA 2XLRA 2YQUA 2BYBA 2YVJA 4FX9A 1ZY8A 4U8NA 1GRTA 3IC9A 1NPXA 4X9MA 2IVDA 4IVMB 1GRFA 4XWZA 2OLOA 3OC4A 5EB5A 4YKFA 3IHMA 5FS9A 1NAAA 1GERA 4MJWA 4N9XA 4GDEA 2RGHA 1DJQA 5GSNA 1GRGA 1S2YA 4UDRA 2JB1A 3G5RA 3G5QA 4CNJA 1PBEA 4PABA 5C3JA 4USQA 4H4WA 4YSYA 1JRXA 3ZDNA 3Q6JA 4YXDA 4NEWA 4TM4A 2VOUA 2PHHA 3ICTA 4J33A 2XLSA 2WOVA 3O0HA 3NK2X 1H7WA 2XLTA 2H89A 1NEKA 1ZMCA 1UKVG 2YLRA 2YM2A 3ATRA 1N1PA 5CQFA 3AE1A 4GCMA 1L9DA 4IA5A 1E6EA 4USRA 3UOVA 2YG3A 3M12A 3NTDA 4A5LA 1NHQA 1LQUA 2JBVA 1ZOVA 4OCGA 1F3PA 1E1NA 2C76A 4C5OA 1EBDA 4Z26A 2BCGG 1JOAA 1LVLA 2BA9A 1RSGA 3DH9A 5BULA 1RP0A 2AR8A 1DOCA 2YLZA 3CGDA 3DJEA 4U8IA 4Y4NA 2A87A 3B6DA 1ZKQA 1GV4A 4WCTA 4BURA 3M13A 1V59A 1D7LA 1ELIA 1NHPA 4EQRA 2ZZCA 3NRNA 3UTFA 1N4UA 3VR9A 3BNUA 2GR3A 3F8DA 3PS9A 1ZDLA 1EL7A 3NN0X 1E7PA 3CTYA 4TLXA 4Z44A 1JRYA 5BRTA 3ALJA 3QFBA 4NTEA 4TM0A 5U25A 1JNRA 3M0OA 1H84A 1XPQA 4IA6A 2NPXA 4H2PA 1O95A 1MO9A 1LV0A 3COXA 1B8SA 2BC0A 2V3BA 2C3CA 3AYLA 3NT6A 4M52A 3P4QA 2TPRA 1Y0PA 3F8RA 2R0CA 2V60A 5EBKA 3AD7B 3R9UA 1BKWA 1H86A 4EQSA 4H7UA 2YM1A
chains in the Genus database with same CATH superfamily
2GVCA 1P2HA 2V2GA 3FG2P 2B7SA 4MLYA 3IC8A 3I3LA 5KNLA 2LEGA 3UTHA 3WE0A 2R5GA 3UAPA 4Z24A 1AQXA 4ZBBA 5H5RA 3GHAA 2GR0A 5EL8A 4IVOB 3I9V2 2DLXA 2R46A 3C7MA 4OPGA 2QA2A 2DIYA 2LSTA 3DGQA 3HJOA 1REOA 2R4VA 1M2DA 4IP6A 4LMVA 1O73A 4H2NA 2BABA 1M99A 1TDKA 2XFQA 2N5AA 4N0ZA 1FEAA 1CJ2A 4HOJA 1ZCPA 2AV4A 3NG7X 2XCGA 4GQFA 6GSSA 3MAKA 4Q5NA 4ECIA 3SWLA 3NH3X 4U2SA 1MXTA 3VRBA 1TW9A 3UOMA 4MA9A 2I81A 3O6TA 3SY4A 1I5GA 4IJ3A 1FEBA 4MH3A 3CNJA 1BEDA 1DJNA 5LD0A 3CQFA 1TDNA 3DJGX 1BGNA 1OC9A 1YKJA 4EQWA 2WPFA 3VK9A 2VCQA 2OKAA 1YQ1A 1O6JA 2XFUA 3AE3A 4TRXA 5M0ZA 2BS3A 1WWJA 3F4SA 4BJYA 3H8LA 4IN0A 4GTUA 1FOVA 3LG6A 4K7OA 4JEDA 4IKHA 1AIUA 1T3BA 3HYPA 2DMMA 3QFBC 3T37A 1QFNA 4B67A 22GSA 2C4JA 2YP6A 2P0GA 4TOPA 1W89A 2DJ2A 2H70A 4KCAA 3CXGA 4PUAA 1GALA 2V3AA 5F06A 2XC2A 3P9UA 2H76A 2IFQA 1K4QA 3P7XA 1EZKA 2GV8A 4Z7XA 4OCFA 2XFPA 1FAAA 1TU7A 4IQ1A 4DVCA 1F8WA 4K8DA 2H0IA 5B8BA 1TYTA 3QDNA 4HI7A 5IMDA 3H1NA 3GL3A 3GX0A 3P4RA 1J0FA 4QL9A 5CNWA 2E5VA 2C3DA 5CP1A 3RHAA 3UKKA 4X1UA 1V98A 1PX6A 2B9YA 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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