4Z2UA

Crystal structure of 2-hydroxybiphenyl 3-monooxygenase r242q from pseudomonas azelaica
Total Genus 191
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
191
sequence length
581
structure length
563
Chain Sequence
AETDVLIVGAGPAGAMSATLLASLGIRSLMINRWRSTSPGPRSHIINQRTMEILRDIGLEESAKSLAVPKEYMGEHVYATSLAGEEFGRIPAWASHPQAHAEHELASPSRYCDLPQLYFEPMVVSEAALRGADVRFLTEYLGHVEDQDGVTARLLDHVSGAEYEVRAKYIIGADGAHSLVAQNAGLPFEGQMGIGDSGSINIEFSADLSSLCEHRKGDMYWMFVAALQMIRPWNKWICVWGYITKEEAKKIIHEIIGTDEIPVEVGPISTWTINQQYAVRNTSGRVFCMGDAVHRHTPMGGLGLNTSVQDAYNLAWKLALVLKGTAAPTLLDSYDAERSPVAKQIVERAFKSLSTFPPVFEALSLPPAPTESEMAEALVRLKDASEEGAKRRAALRKAMDATIIGLGGGHGVELNQRYVSRAVFPDGTPDPGFVRDQEFFYQASTRPGAHLPHVWLTENQRRISTLDLCGKGRFTLLTGLSGAAWKHEAEQVSQSLGIELKVCVIGPGQEFVDTYGEYAKISEIGESGALLVRPDMFIAFRAKDASREGLEQLNVAVKSILGR
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
molecule keywords 2-hydroxybiphenyl-3-monooxygenase
publication title A crystal structure of 2-hydroxybiphenyl 3-monooxygenase with bound substrate provides insights into the enzymatic mechanism.
pubmed doi rcsb
source organism Pseudomonas nitroreducens hbp1
molecule tags Oxidoreductase
total genus 191
structure length 563
sequence length 581
chains with identical sequence B
ec nomenclature ec 1.14.13.44: 2-hydroxybiphenyl 3-monooxygenase.
pdb deposition date 2015-03-30

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF01494 FAD_binding_3 FAD binding domain
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.30.120 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich Glutaredoxin Glutaredoxin 4z2uA03
3.50.50.60 Alpha Beta 3-Layer(bba) Sandwich FAD/NAD(P)-binding domain FAD/NAD(P)-binding domain 4z2uA01
3AE9A 4IVOB 2A87A 4TM3A 1E1LA 3IC9A 4B64A 3KU9A 4U8LA 2C70A 3LJPA 4H7UA 4B67A 1AOGA 2X8GA 3NLCA 4H4VA 3PO7A 3FPZA 2E4GA 3D8XA 1XANA 2H89A 4PABA 4ZCCA 1IUTA 1ZX9A 1ZK7A 3KVEA 1DJNA 4B66A 5BVAA 1IUXA 1D4DA 2GH5A 1LQTA 2V5ZA 3DJEA 3JSKA 2XLUA 4YSZA 3AE7A 2BS3A 5FS6A 2C66A 4M52A 4ADWA 4UDQA 2APGA 2YG6A 4CCRA 4EM4A 2C65A 3CGBA 4PAAA 5IQ1A 4REKA 4USRA 3H8IA 3GMBA 2FJBA 4Z43A 2GV8A 3AECA 3COXA 1DOBA 4H2NA 1GRAA 1ZDLA 2R4JA 3DJDA 3IWAA 5KVIA 1GETA 4AT2A 1IUSA 3AE8A 2JAEA 1TDNA 2GR1A 5ER0A 1VQWA 1QLBA 2V60A 1JRZA 4U2LA 3ZDNA 4C3XA 4NZHA 5IPYA 2R45A 2R0PA 2WPCA 3KA7A 4YT0A 2RABA 1YKJA 2R9ZA 3GD3A 4EQRA 2GEWA 2IIDA 3M12A 3UKFA 1K0IA 1V59A 5GRTA 3REDA 1TDFA 4X9NA 4HB9A 4XWZA 1OJCA 2TPRA 1TDKA 1PXAA 3CNJA 4U2TA 2GMJA 1D5TA 1GEUA 3ALLA 4H4QA 1QJDA 5TR3A 3AEDA 3AWIA 3NK2X 4YSHA 2GVCA 4A9WA 4USQA 4HA6A 1JU2A 3C4AA 1O95A 1PJ6A 1CF3A 4AOXA 1KFYA 3NYFA 1JRYA 3II4A 2C72A 3B6DA 3VRAA 4BK3A 4YXDA 3G5RA 1O5WA 2BC1A 1CC6A 4FK1C 4OPCA 2BK3A 2FJEA 2I0ZA 3AD9B 2NPXA 4C77A 2WS3A 1CJ4A 5M10A 4U2SA 2IVEA 3ALJA 4U8PA 2YG4A 3SFDA 2OALA 1GRFA 3AEFA 3AEAA 3BNMA 1DJQA 4KX6A 5U1OA 3K7TA 4Z25A 5HXIA 2RGJA 4K22A 4Y4NA 2HQMA 2XFUA 2GAHB 1BGNA 3BHFA 1GT8A 1Y0PA 3DA1A 3Q9TA 3BI5A 4A6NA 4DGKA 4BK2A 5HYMA 1E7PA 2EQ8A 5HHFA 2YLRA 3AB1A 2PHHA 3QSMA 1B8SA 4TM4A 4AT0A 4CRTA 3QFBA 3AYLA 5FS9A 2B9YA 3M13A 5EOWA 1PJ7A 2TMDA 1E1KA 2XVHA 5U63A 2A8XA 2V3AA 4CNKA 4JDRA 4EIQA 4H2RA 1VG9A 2X8HA 4IVMB 1ZY8A 2QAEA 4H2PA 4CBQA 1S3EA 3UKQA 4X4JA 1MO9A 2GB0A 3WE0A 2VQ7A 3IHGA 1CJCA 2YLZA 2FBWA 3P4SA 5DBJA 1HYUA 3UOZA 5KXJA 2YLWA 3P1WA 4J56A 1FECA 1PXCA 1BGJA 2GAGB 1FCDA 2VRMA 2WPFA 3F8RA 1PBBA 2JKCA 5JCIA 3DK9A 1H7WA 1Q9IA 3UKAA 3P4QA 2PYXA 3D1CA 1PN0A 2GR3A 1SEZA 4UP3A 1CJ3A 3I3LA 1Z6LA 4H4WA 3H8LA 4EQSA 1N1PA 2GRTA 4U8OA 1GRHA 4KPRA 3ALMA 2RGOA 3GDNA 2GQFA 2VZ2A 4A6NB 1ZOYA 2YR4A 4JNAA 2C73A 4EMJA 1NG4A 2XDOA 2ZBWA 2WHDA 1E1NA 1LV0A 2XFOA 1DOCA 2Q6UA 2GF3A 4JNQA 4C5OA 4A99A 4NTDA 4H4XA 2XFPA 3NRNA 2BA9A 4NEWA 2C67A 3Q6JA 4H2QA 5J7XA 4YSYA 3AEBA 1YQ3A 2A89A 3DK8A 3AE6A 1KNPA 3CPHG 2XFNA 3DGHA 4UDRA 4H4UA 1E39A 1ZMDA 3BI2A 2WESA 2BK4A 2BK5A 2WDQA 3DH9A 3UTGA 3C96A 4AOSA 4A79A 2C3CA 3HZLA 3AE1A 1GERA 3GSIA 4AP1A 5FMHA 3UOYA 3AEEA 1MOKA 3CNDA 2B9XA 3UP5A 2ZZ0A 4U8IA 5GSNA 3CNTA 2Z5XA 1CBOA 2WP9A 3ICRA 2YLXA 4C74A 1XHCA 4H4SA 2VVMA 1NG3A 4K5SA 3NKSA 3AE4A 2WOVA 3CN8A 2VRLA 3ICTA 1H84A 5KOXA 3AYJA 4J31A 3P9UA 2Z5YA 4FK1A 3ITJA 3M0OA 3VRBA 4H4RA 3LADA 3G5SA 1NENA 1Y56A 1PXBA 1RSGA 3NT6A 1KF6A 4B63A 4GUVA 3UP4A 3ABVA 1L9DA 3SQPA 2VQBA 4BK1A 2BC0A 4H4ZA 2X99A 2E1MA 2GMHA 4LA1A 3UOVA 1M64A 2CDUA 1LTXR 2X3NA 3LOVA 2CFYA 1L0VA 4TLZA 1F8SA 1GRTA 2O9ZA 1F8WA 1KSSA 3V3NA 1FL2A 3GYJA 2YQUA 3C4NA 4TM0A 4YTPA 5JCLA 1H83A 5KRQA 3EPTA 2C76A 3QVRA 1OJDA 3EANA 3GRTA 3ATQA 3NN0X 4FX9A 4OPIA 1RP0A 1OJAA 4UDPA 4J2WA 1S2QA 4A5LA 3P4RA 1L9CA 3NGCX 4JQ9A 4B65A 5C3JA 3AE2A 1NHPA 2YLTA 2XYOA 4O5QA 4U8NA 4Z26A 2AQJA 1D7YA 1CJ2A 1P2EA 2WDRA 3VR8A 2X50A 3URHA 2EQ9A 1EBDA 3QJ4A 4O5UA 3QVPA 3KPFA 4NEVA 4APNA 4OPTA 2OA1A 1ELIA 4NTCA 4JN9A 2WU2A 1EL8A 4X9MA 1IUUA 2OLOA 4GR1A 2WOIA 3CNSA 1D7LA 2ARDA 3NYCA 3SFEA 1PBCA 3GMCA 1DXLA 3R9UA 4RG3A 1VRQB 4Z2TA 2R0GA 1KDGA 2YG5A 2QA2A 3F8PA 5J60A 4YTMA 3O0HA 1NEKA 1ONFA 4DSHA 4N9XA 4EMWA 2XLPA 3OZ2A 1BWCA 2B7SA 4K8DA 5FS7A 3NTAA 3AE5A 1D4EA 1GALA 3GWDA 4U8KA 1BF3A 1L9EA 2Q0LA 3DK4A 3V76A 2YLSA 2YVGA 1YQ4A 4J36A 2WP5A 2C3DA 2ZZBA 4GCMA 4LU6A 4K2XA 4B1BA 5BRTA 4H4TA 5C2TA 1DNCA 1PBFA 1S3BA 3UKLA 3L8KA 2WP6A 3UTEA 2ZZCA 4LIIA 4Z44A 3UOXA 2OAMA 2BCPA 2WEUA 3RP7A 4IA5A 4K7ZA 2XVJA 4AP3A 1GOSA 3BNUA 1K0JA 3NN6X 2R0CA 3L1RA 2B9WA 2JBVA 2XLSA 1JRXA 3ATRA 3DJJA 2YVFA 2R46A 3KD9A 3F8DA 3PVCA 2V61A 1P2HA 1TYPA 1F8RA 3UKKA 4A65A 4EQWA 5LV9A 2AAQA 1S2YA 2WETA 1H86A 2XVEA 3ZYXA 3NG7X 4JY2A 1NPXA 5HY5A 1CL0A 1PJ5A 3AXBA 3KKJA 2OLNA 2NVKX 3KLJA 4H50A 4H4PA 1GPEA 2JB3A 1PDHA 1YY5A 3NK1X 1LPFA 5M0ZA 5BULA 3GDPA 4GDPA 3LZWA 1K0LA 3AE3A 3H4KA 3AEGA 1QO8A 2V6OA 3QFAA 3UTFA 3NTDA 5BUKA 1TDEA 4P9SA 3RHAA 1N4UA 2JB1A 4IV9A 4RSLA 2XLTA 4YWOA 3V3OA 1B37A 1GRGA 5KVHA 5EB4A 2YVJA 4OPDA 4K5RA 2XLRA 4ECHA 3CIRA 1FOHA 2CVJA 1ZMCA 2R4EA 2XVFA 4EM3A 3P4PA 3AD7B 1RYIA 5EBKA 3K30A 2Y6RA 1JNRA 5KOWA 4YKGA 1GTHA 3SM8A 1H81A 2WQYA 3FIMB 4CCQA 2V3BA 3RNMA 4B68A 4J34A 1KNRA 4I59A 1COYA 3UCLA 4D03A 3ISHA 4DSGA 4I58A 3GRSA 4BV6A 2BYBA 4OPGA 1GTEA 1N4WA 3OC4A 5L46A 3LB8A 5U25A 2WPEA 4TM1A 3RP8A 2UZZA 3VRDB 1CC2A 4OCGA 1VDCA 3VR9A 2C7GA 3B3RA 2YG3A 5CQFA 2VVLG 3NYEA 2YR5A 1CHUA 1IJHA 1XDIA 1TYTA 1CC4A 4Z24A 4J33A 2H88A 1DOEA 3FG2P 5IQ4A 1IUVA 2B76A 2YWLA 4CY8A 2JB2A 2BS4A 3CTYA 1EL7A 3EF6A 3K7QX 3VQRA 2VOUA 2YM2A 4YKFA 2GR2A 3UKHA 1DODA 2DKIA 3IF9A 3DMEA 1VG0A 2C64A 1XPQA 2RGHA 4BURA 1MXTA 3SGLA 4E0VA 4CNJA 4YTNA 4GRTA 4B69A 2FJDA 1GREA 4BJZA 2WOWA 4TLXA 4CY6A 1ZOVA 4Y4MA 4FDCB 1UKVG 1E6EA 1O94A 3FMWA 2WBAA 1F6MA 1JNZA 3NNEA 4Y4LA 1PHHA 1BKWA 2WDVA 3IHMA 1FEAA 1JOAA 3CGEA 4Z2UA 4J57A 1Q1RA 4IA6A 1GSNA 3ICSA 1B4VA 2J3NA 3RP6A 3BHKA 1NAAA 2BACA 3CNPA 1LQUA 3CPIG 4D04A 4JY3A 3NIXA 2JK6A 5JCNA 4OPUA 1YQZA 4WX1A 1N4VA 4H4YA 3BI4A 4A7AA 1KSUA 1D4CA 3CGCA 1OJTA 2QCUA 3FBSA 2QA1A 1Y56B 2GR0A 4ZN0A 1X31B 4OPLA 2XFQA 3UTHA 3QSEA 4ZCDA 3AYIA 4RG4A 1GXFA 4YSXA 3S5WA 4XWRA 2Y6QA 3QSSA 2FJAA 4C3YA 1FEBA 3CGDA 3DGZA 1H7XA 2Q7VA 2XVIA 2YAUA 2ACZA 3UKPA 3T37A 5FS8A 2CULA 2Q0KA 1W4XA 1BZLA 1H82A 3S61A 1GNDA 2IVDA 4ICYA 2YG7A 1TDOA 3LXDA 3LZXA 3ADAB 4WCTA 2VVLA 5EB5A 1Q1WA 2WU5A 1GRBA 2BS2A 3I6DA 1M6IA 2EQ6A 1LVLA 1H6VA 4EQXA 4EIPA 2AR8A 4U8JA 2BCGG 1E1MA 3GYIA 2BXSA 1ZKQA 4DNAA 1NHRA 4EMIA 1JEHA 2BABA 1ZP0A 3AD8B 4GDEA 4OVIA 3K7MX 1OJ9A 1K4QA 4GF7A 3DJGX 1B5QA 2F5ZA 3NHOX 4MJWA 4BJYA 1EL9A 4XXGA 3GWFA 3NK0X 2YM1A 4U8MA 1F3PA 2W0HA 5JCMA 1NHQA 3NH3X 3G5QA 2E5VA 1NDAA 3CPJG 4NTEA 5JCKA 2BXRA 2X8CA 2GQWA 3EAOA 1PBEA 1REOA 1PBDA 3E1TA 1TRBA 3PS9A 1NHSA 1LJ1A 5CKUA 3GD4A 2YR6A 2C75A 1IUWA 1PS9A 2EQ7A 2XCGA 5KWFA 1EL5A 2DKHA 2B7RA 1GESA 1GV4A 4Z2RA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
4IVOB 2DC5A 1QQ2A 4TM3A 1E1LA 3IC9A 2LSTA 4G2EA 1ERTA 3IOSA 4U8LA 22GSA 3NLCA 3PO7A 5DVBA 3D8XA 1XANA 2H89A 4PABA 1A2MA 1PKZA 1AUCA 4K6XA 3ISOA 3HZ8A 4K7NA 5G5EA 3RPPA 3AE7A 3IAS2 2C66A 2H01A 1VF1A 4ML6A 4FO5A 3DXBA 1PSQA 1NHYA 4REKA 1TTZA 3GMBA 3UJ1A 2GV8A 3HYXA 1DOBA 3ZMLA 3J7Yb 3DJDA 4EF0A 1GETA 2I1UA 4AT2A 1IUSA 2LV3A 3EU4A 2HSYA 4POBA 4C3XA 1AIUA 4O92A 2C4CA 2J9HA 2A2PA 3FY7A 1MDKA 1Y25A 4YT0A 3GD3A 7GSSA 5A4UA 3C8EA 4EQRA 3APOA 5LCZA 5GRTA 4HI7A 1PQNA 4ZBBA 3UVHA 3EWLA 2LRCA 1TI3A 2YZHA 1OJCA 2CAIA 1TDKA 3CNJA 2GMJA 4U2TA 1PL2A 1GEUA 2VL3A 1JLVA 1TU8A 1QK8A 1O6JA 5DBQA 3P8WA 3F4SA 3TRPA 1T3BA 3HCZA 1PJ6A 1CF3A 1KFYA 2D2ZA 5ECKB 1VGLA 3W8SA 2C72A 3BOAA 3VRAA 4XS1A 3G5RA 4YXDA 5GSTA 1O5WA 1NHOA 4JRRA 5HR3A 5L71A 1G0TA 1CC6A 1WWJA 2I0ZA 5KMRA 2VM2A 2NPXA 2E7PA 4J56E 4BWSA 1CJ4A 4U2SA 2H6ZA 1YJ6A 4U8PA 3IE3A 4XHMA 1EGRA 2YG4A 3UBLA 1XIYA 1DJQA 4ISDA 4CW9A 2XFUA 3BHFA 1GT8A 3Q9TA 4K9ZA 1V2AA 4BK2A 1E7PA 2EQ8A 2YV7A 4CRTA 3M13A 2AUVA 5ID2B 1PJ7A 5EOWA 2B1KA 3T31A 2H0IA 1K0MA 4MH3A 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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