4Z2UA

Crystal structure of 2-hydroxybiphenyl 3-monooxygenase r242q from pseudomonas azelaica
Total Genus 191
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
191
sequence length
581
structure length
563
Chain Sequence
b'AETDVLIVGAGPAGAMSATLLASLGIRSLMINRWRSTSPGPRSHIINQRTMEILRDIGLEESAKSLAVPKEYMGEHVYATSLAGEEFGRIPAWASHPQAHAEHELASPSRYCDLPQLYFEPMVVSEAALRGADVRFLTEYLGHVEDQDGVTARLLDHVSGAEYEVRAKYIIGADGAHSLVAQNAGLPFEGQMGIGDSGSINIEFSADLSSLCEHRKGDMYWMFVAALQMIRPWNKWICVWGYITKEEAKKIIHEIIGTDEIPVEVGPISTWTINQQYAVRNTSGRVFCMGDAVHRHTPMGGLGLNTSVQDAYNLAWKLALVLKGTAAPTLLDSYDAERSPVAKQIVERAFKSLSTFPPVFEALSLPPAPTESEMAEALVRLKDASEEGAKRRAALRKAMDATIIGLGGGHGVELNQRYVSRAVFPDGTPDPGFVRDQEFFYQASTRPGAHLPHVWLTENQRRISTLDLCGKGRFTLLTGLSGAAWKHEAEQVSQSLGIELKVCVIGPGQEFVDTYGEYAKISEIGESGALLVRPDMFIAFRAKDASREGLEQLNVAVKSILGR'
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

molecule keywords 2-hydroxybiphenyl-3-monooxygenase
publication title A crystal structure of 2-hydroxybiphenyl 3-monooxygenase with bound substrate provides insights into the enzymatic mechanism.
pubmed doi rcsb
source organism Pseudomonas nitroreducens hbp1
molecule tags Oxidoreductase
total genus 191
structure length 563
sequence length 581
chains with identical sequence B
ec nomenclature ec 1.14.13.44: 2-hydroxybiphenyl 3-monooxygenase.
pdb deposition date 2015-03-30

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF01494 FAD_binding_3 FAD binding domain
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.30.120 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich Glutaredoxin Glutaredoxin 4z2uA03
3.50.50.60 Alpha Beta 3-Layer(bba) Sandwich FAD/NAD(P)-binding domain FAD/NAD(P)-binding domain 4z2uA01
2GAGB 3NNEA 4U8NA 3EPTA 2WDQA 1E1KA 2AAQA 3QSMA 2YLSA 4XWRA 3VQRA 1TDOA 4H4WA 3G5QA 2CULA 4CRTA 2R4JA 2XLSA 3CTYA 3NKSA 3ICRA 1S3BA 1E39A 2JB3A 1V59A 3DMEA 3UOXA 1PHHA 3NHOX 5U63A 2BYBA 5EBKA 3NYEA 1DOCA 1YQZA 3AYLA 4A6NB 2JKCA 1D4DA 4CNJA 3NTDA 4JQ9A 1IUUA 3KVEA 1NHPA 3H4KA 1F8SA 1EL7A 1PBEA 4Z25A 4OPLA 3UTFA 4Y4NA 3RNMA 5L46A 1PBDA 5U1OA 1Q9IA 3COXA 4YSZA 2XVEA 4Y4MA 3IWAA 3ISHA 2XFPA 2DKIA 2JAEA 3AE5A 3WE0A 4H4PA 2YWLA 3ZDNA 1GERA 3CN8A 2ARDA 1CJ3A 2ACZA 1M64A 1GXFA 1NDAA 4ECHA 1KSUA 3M13A 1IUXA 4BJZA 5U25A 2GMJA 1QO8A 3AEGA 3QSSA 5TR3A 2YR5A 1EBDA 2BS2A 4DSGA 1L9EA 2GV8A 3R9UA 2V60A 3BNMA 3AE8A 2R0PA 4OCGA 3AE9A 2WQYA 4A6NA 4FX9A 3VRAA 1NHSA 4Z2RA 1BWCA 1OJTA 1PXCA 4OPDA 1JRYA 2H89A 1B8SA 2YR6A 5IPYA 4EMIA 1FCDA 1LV0A 1YQ4A 2Q6UA 3KD9A 2XFQA 3NG7X 1DOBA 5FS6A 2JB2A 1JNZA 2GR2A 3KLJA 3FMWA 3I3LA 2B9WA 2OAMA 4GRTA 2GR3A 2W0HA 3AECA 3QSEA 1N4VA 4YWOA 1NG4A 3DJJA 4D04A 3P4PA 4TM3A 2HQMA 3G5SA 1KF6A 3AEFA 3AE4A 2GR0A 4H4XA 4IV9A 3DJDA 4U2TA 4D03A 1BGNA 4NTCA 2YG7A 1GRFA 2GEWA 3LB8A 2WPEA 3CPHG 3UP5A 1K0LA 1CJCA 4EIPA 3DA1A 4AT2A 2BA9A 1EL9A 4U2SA 3URHA 1BKWA 4NZHA 4H2NA 2BXSA 1E1MA 3BI2A 4YSYA 2X8GA 4H2QA 4Z2UA 4H4RA 5BRTA 1CBOA 2R45A 4EIQA 4X9MA 1PXBA 4J56A 2GH5A 2RGJA 5HXIA 3IC9A 3LJPA 2B76A 4EMJA 1H6VA 1KSSA 4B65A 1E7PA 2BC1A 1F3PA 2C73A 4B64A 4AP1A 3ADAB 2VOUA 4U8MA 1B37A 1YKJA 4LA1A 4USQA 3V76A 4A79A 1E1NA 1KNPA 5HYMA 5JCKA 4AOSA 3UKKA 3NTAA 3GYJA 3VR9A 5LV9A 3UKAA 4J2WA 5C3JA 4Y4LA 4HA6A 2IVDA 2YLTA 3SGLA 3AE2A 4J31A 1DNCA 3VRBA 4MJWA 3D1CA 2WEUA 4ZCDA 1OJAA 2WPFA 1PS9A 3GSIA 2OA1A 3F8PA 4JDRA 1JU2A 5IQ4A 3FPZA 1BF3A 1H7WA 4OPCA 1GRBA 3RHAA 3GWFA 1W4XA 2EQ6A 2XVHA 2VRLA 1ZP0A 1DODA 2BK5A 4NEVA 4GUVA 5HY5A 2WP6A 1DXLA 2C3CA 3QVPA 3UTGA 2EQ7A 2VQBA 1GV4A 2ZZ0A 2B7SA 1PJ6A 4C77A 2YG3A 1PBFA 5DBJA 2VZ2A 2C64A 2B7RA 3AYIA 4O5UA 2ZBWA 4C74A 1RSGA 1H81A 2GVCA 1F8RA 2XFUA 3ATRA 3NGCX 3KA7A 3IHGA 1LQUA 4U8OA 4EQSA 4WX1A 2GF3A 1KDGA 1OJDA 2B9XA 2Q0LA 4BURA 1OJ9A 1Q1RA 1TDKA 1P2EA 2Q0KA 4H4ZA 4PAAA 4YSXA 1ELIA 5FS9A 3QFAA 3BHFA 4A7AA 1F8WA 3FG2P 3VRDB 2GQFA 2IIDA 3K7MX 4BK3A 2XYOA 4U8PA 4EQWA 3NYCA 3UKQA 4K5SA 1K0JA 1D7LA 1K4QA 1GOSA 2A89A 1N4UA 1GRGA 1GTHA 4YT0A 3PVCA 2XFOA 3H8LA 1F6MA 2BK3A 3AD7B 4YKFA 3AD9B 5M10A 4PABA 2C66A 3C4NA 1RP0A 1ZMDA 3JSKA 2ZZBA 1GRAA 2C76A 2QA2A 1COYA 2C72A 2JB1A 2X8CA 3QFBA 3SFDA 3KKJA 2I0ZA 2YG4A 2YLXA 1TDEA 4B66A 4B63A 2YQUA 5C2TA 2YAUA 4GCMA 2PYXA 1XANA 1N1PA 2AR8A 4P9SA 1FECA 4U2LA 2XLUA 2FBWA 4RG3A 1ZX9A 2YVFA 4EQXA 2A8XA 2OLOA 4I59A 2R0CA 3AEBA 3GDPA 1CHUA 3G5RA 3K7QX 5EB4A 3RP7A 2C67A 5JCIA 1JRZA 1CC6A 2XCGA 1ZOVA 3UOVA 5EOWA 4YTNA 2V5ZA 3H8IA 4A65A 5CQFA 4CY8A 1E1LA 1IJHA 1CJ2A 4OPUA 2VVMA 4H4SA 2RABA 4BK1A 2WPCA 3D8XA 3NLCA 1TDFA 1LPFA 4XXGA 3M0OA 4U8JA 4AOXA 1NEKA 1CC4A 1FOHA 3DH9A 5GRTA 1GEUA 5HHFA 4DSHA 4C3YA 4K7ZA 2BS4A 1CL0A 2RGOA 2Y6RA 3P9UA 4FDCB 3DK8A 3NK0X 4LIIA 4EM3A 4NTEA 1IUTA 4FK1C 2QA1A 1NENA 4JN9A 2X50A 4K22A 4UP3A 5KOXA 5CKUA 3B6DA 1Y0PA 3RP8A 3UKLA 2WP9A 3Q9TA 2VVLA 3GDNA 4GR1A 1BZLA 1E6EA 1ZKQA 4H4TA 1B4VA 2Q7VA 1O5WA 2XVFA 1GT8A 3QJ4A 5ER0A 2WP5A 2XDOA 4ZN0A 4H2PA 1L9DA 3LADA 5KXJA 4KPRA 3NN0X 2YLRA 1LJ1A 3CIRA 4GDPA 4YTPA 2BCGG 1ZMCA 1KNRA 2DKHA 3BHKA 4DGKA 3DGZA 1CJ4A 3F8DA 4OVIA 4YTMA 1GPEA 4H4YA 3ICTA 3QVRA 4H50A 2GRTA 2CDUA 3NRNA 4NTDA 3UCLA 4AP3A 4I58A 3CGBA 1DOEA 4OPIA 2BS3A 3OC4A 4IA5A 1D4CA 1MOKA 1ZDLA 1CC2A 2YLWA 3LZXA 3NYFA 3T37A 2YM2A 4TM0A 1D5TA 3ABVA 4IVOB 3UKHA 4FK1A 1BGJA 3AE3A 4O5QA 2WU2A 4J57A 2BABA 2V61A 2XLRA 4REKA 3REDA 3DJGX 1L9CA 1X31B 4C5OA 3V3OA 1N4WA 3KU9A 3NK1X 4NEWA 5IQ1A 3CGEA 3RP6A 4Z43A 3AD8B 3AEDA 1M6IA 1REOA 2V6OA 3CGCA 2YG6A 4U8KA 3AEAA 4JY3A 5FS7A 5KVIA 1ZK7A 4H2RA 4JNAA 3FBSA 1NAAA 1GALA 1GREA 2CVJA 1H86A 2TMDA 4H7UA 5BUKA 4ICYA 1GNDA 1VG9A 4CY6A 2X99A 4LU6A 4UDPA 4X4JA 4EMWA 2WOWA 5KWFA 3ALMA 1NHQA 3L8KA 1JNRA 2FJDA 2EQ8A 5JCMA 5JCLA 2GQWA 1SEZA 3AWIA 4B68A 3CGDA 1B5QA 4BK2A 2JBVA 1K0IA 3ATQA 3E1TA 1AOGA 2RGHA 1H83A 2A87A 2C70A 5KRQA 4ADWA 1TDNA 1JOAA 1TYTA 2ZZCA 4TM4A 2Y6QA 1RYIA 4Z44A 5JCNA 2TPRA 2FJEA 3CNDA 1PN0A 2XFNA 1VG0A 2XLTA 4J33A 3K7TA 1P2HA 2WOVA 3AE1A 1Y56B 2QCUA 4RG4A 4USRA 2X3NA 2JK6A 4YSHA 3BNUA 4A9WA 1Q1WA 3ALLA 2WDRA 3II4A 1KFYA 2GAHB 5FMHA 2R0GA 3DK9A 3UTEA 1PJ7A 4Z24A 2EQ9A 1S2QA 3CNTA 4H4UA 1GRHA 1PXAA 2Z5YA 2R4EA 4BJYA 1PJ5A 1TYPA 3NK2X 3OZ2A 2NVKX 3GMBA 4M52A 4DNAA 1Z6LA 4B69A 3LXDA 1L0VA 2WS3A 2F5ZA 2VRMA 3ICSA 4HB9A 2WBAA 4K2XA 4U8IA 4K5RA 4A5LA 1GRTA 1VRQB 4A99A 1O95A 4OPTA 3C96A 3S5WA 1GETA 1Y56A 1FEAA 3O0HA 2GR1A 1IUWA 3V3NA 1YQ3A 5J60A 5M0ZA 2GMHA 5KVHA 3IHMA 2E4GA 3CNSA 4WCTA 1XPQA 2H88A 4GF7A 3DK4A 3GD4A 3CPJG 3GWDA 3L1RA 2WETA 1JRXA 4JY2A 4UDRA 4ZCCA 1VDCA 3NH3X 5BULA 3SFEA 1O94A 3UOYA 3AEEA 2YM1A 1MO9A 3ALJA 2OALA 3ZYXA 4UDQA 3GMCA 1NG3A 2FJAA 3DGHA 4N9XA 2YR4A 3LZWA 2UZZA 3NIXA 4CNKA 4APNA 1ZY8A 2BXRA 2C3DA 2WU5A 1CF3A 3CNJA 3NN6X 3SM8A 3K30A 2V3BA 3KPFA 4H4VA 4YKGA 1EL5A 5BVAA 1XDIA 1LTXR 3AB1A 1DJQA 2J3NA 2OLNA 4GDEA 4OPGA 4X9NA 4YXDA 3P4SA 4CCQA 2R46A 4B67A 3AE6A 3I6DA 4RSLA 2WHDA 3NT6A 1XHCA 1UKVG 4CBQA 4JNQA 4H4QA 3CNPA 3P4RA 4XWZA 3UKFA 1FEBA 5FS8A 2XVIA 1MXTA 2B9YA 2NPXA 4C3XA 1GSNA 3SQPA 1TRBA 4CCRA 3EAOA 3FIMB 1PDHA 3Q6JA 3GRTA 2FJBA 3EANA 3F8RA 2BC0A 1NHRA 3UTHA 3GRSA 4Z26A 2VQ7A 1H82A 4J34A 2WOIA 2YVGA 1GESA 1VQWA 2XLPA 1H84A 1GTEA 3HZLA 1LQTA 3M12A 5GSNA 1D7YA 4BV6A 1IUVA 1S3EA 3UP4A 4AT0A 2BK4A 2VVLG 2YLZA 3B3RA 1YY5A 1ONFA 4EM4A 2PHHA 3BI4A 1PBBA 1QJDA 2CFYA 3LOVA 1DJNA 2AQJA 2C65A 2C7GA 2WESA 2WDVA 2X8HA 3AXBA 4IA6A 1IUSA 2YVJA 1JEHA 2Z5XA 1H7XA 2GB0A 3BI5A 4EQRA 3UOZA 4J36A 2V3AA 3AYJA 4B1BA 3AE7A 4TLXA 1D4EA 3C4AA 1NPXA 3DJEA 3PS9A 3PO7A 3EF6A 4KX6A 2QAEA 2YG5A 1LVLA 4IVMB 3GD3A 4U8LA 2E5VA 1ZOYA 1FL2A 2BCPA 5J7XA 1PBCA 2E1MA 1EL8A 3ITJA 3S61A 3P1WA 2C75A 3GYIA 5KOWA 2BACA 1QLBA 1HYUA 4K8DA 3IF9A 2XVJA 3CPIG 4Z2TA 4TLZA 3VR8A 4E0VA 2APGA 1OJCA 5EB5A 3UKPA 4TM1A 2IVEA 1S2YA 3P4QA 2O9ZA 2R9ZA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
1K3YA 2AAQA 3ZREA 2GT5A 4WBJA 3GX8A 3TOTA 3TCOA 4CRTA 1ZYEA 2CT6A 1GSQA 5G30A 2GZYA 1TU8A 3DMEA 2GQMA 5U63A 2HRAA 3QAVA 3UAPA 4HOJA 4CHSA 5EBKA 2PUKC 2MBSA 5DJMA 3IE3A 2PBJA 5ABRA 5D9XA 2C0DA 5AIVA 3UVTA 4JZQA 4PQ1A 4ECIA 1DUGA 2R3XA 1U3AA 1F8SA 4Z25A 5DAKA 1YDKA 4ML1A 5U1OA 5B6NA 1X0RA 3N5OA 4Y4MA 3IWAA 3T14A 4ECJA 1EP8A 4I8BA 2V2GA 4IN0A 4BJZA 3TDGA 2GMJA 2YANA 3AEGA 3QSSA 4DSGA 2YR5A 1EBDA 1AC1A 1L9EA 1V40A 2GV8A 1R26A 3AE8A 2LEGA 3ZRDA 2WQYA 1NHSA 5E4WA 1BWCA 1PXCA 5D8IA 2FUG2 2H89A 2YR6A 3A5WA 1FCDA 4GAPA 5KN1A 1R5PA 5IO0A 3LSZA 2VL2A 1N4VA 3E9JB 3MAKA 4TM3A 3TKSC 3HYVA 4IV9A 3DEXA 4NTCA 2YG7A 1XZOA 2H0HA 3CPHG 4EC0A 4EIPA 1FOVA 1EL9A 3SWLA 2CVBA 2C4CA 1BKWA 4H2NA 1E1MA 4IS0A 4GLTA 4YSYA 1FW1A 1J9BA 2XBQA 2DJ3A 4YQUA 1X9WB 2B1KA 3TKQA 1C72A 2RGJA 1PKWA 2YWNA 4EMJA 4B65A 3SZCA 4NXIA 1F3PA 1JFUA 4HU7A 4B64A 2FGXA 3D6IA 4U8MA 1B37A 1YKJA 3V76A 5EPFA 1SD9A 1KNPA 4WXTA 3GYJA 3GRXA 1SK0A 4J2WA 2A2PA 4Y4LA 3GKXA 4HA6A 3AE2A 1EOHA 2L4QA 3D1CA 4XTSA 1ACVA 1AW9A 1JU2A 3FPZA 1H7WA 3F4RA 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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