4Z2UA

Crystal structure of 2-hydroxybiphenyl 3-monooxygenase r242q from pseudomonas azelaica
Total Genus 191
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
191
sequence length
581
structure length
563
Chain Sequence
AETDVLIVGAGPAGAMSATLLASLGIRSLMINRWRSTSPGPRSHIINQRTMEILRDIGLEESAKSLAVPKEYMGEHVYATSLAGEEFGRIPAWASHPQAHAEHELASPSRYCDLPQLYFEPMVVSEAALRGADVRFLTEYLGHVEDQDGVTARLLDHVSGAEYEVRAKYIIGADGAHSLVAQNAGLPFEGQMGIGDSGSINIEFSADLSSLCEHRKGDMYWMFVAALQMIRPWNKWICVWGYITKEEAKKIIHEIIGTDEIPVEVGPISTWTINQQYAVRNTSGRVFCMGDAVHRHTPMGGLGLNTSVQDAYNLAWKLALVLKGTAAPTLLDSYDAERSPVAKQIVERAFKSLSTFPPVFEALSLPPAPTESEMAEALVRLKDASEEGAKRRAALRKAMDATIIGLGGGHGVELNQRYVSRAVFPDGTPDPGFVRDQEFFYQASTRPGAHLPHVWLTENQRRISTLDLCGKGRFTLLTGLSGAAWKHEAEQVSQSLGIELKVCVIGPGQEFVDTYGEYAKISEIGESGALLVRPDMFIAFRAKDASREGLEQLNVAVKSILGR
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
publication title A crystal structure of 2-hydroxybiphenyl 3-monooxygenase with bound substrate provides insights into the enzymatic mechanism.
pubmed doi rcsb
molecule keywords 2-hydroxybiphenyl-3-monooxygenase
molecule tags Oxidoreductase
source organism Pseudomonas nitroreducens hbp1
total genus 191
structure length 563
sequence length 581
chains with identical sequence B
ec nomenclature ec 1.14.13.44: 2-hydroxybiphenyl 3-monooxygenase.
pdb deposition date 2015-03-30

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF01494 FAD_binding_3 FAD binding domain
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.30.120 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich Glutaredoxin Glutaredoxin 4z2uA03
3.50.50.60 Alpha Beta 3-Layer(bba) Sandwich FAD/NAD(P)-binding domain FAD/NAD(P)-binding domain 4z2uA01
3EANA 2O9ZA 1KSSA 2JB3A 5J7XA 1F6MA 3R9UA 3AE9A 4AP3A 4EIPA 1RP0A 2C65A 2YLRA 3VR9A 2XVIA 1EL7A 1N4UA 4YKFA 3BNMA 1GTEA 5CQFA 1E1NA 3RP7A 2WEUA 1ZX9A 1ZMCA 2YG6A 4K5SA 5L46A 1PXBA 1S3EA 4Y4LA 1ONFA 1F3PA 2BCGG 5IPYA 1CHUA 4XWRA 3NTDA 4IA5A 4RSLA 3H8LA 3DGHA 3ATQA 1E1LA 4X9MA 4I59A 1PBFA 3FG2P 2V3BA 2VQBA 3F8PA 4OCGA 3UCLA 2DKHA 4CNJA 3VRDB 1NPXA 2JK6A 1N1PA 1B5QA 2VRLA 1NHQA 5BRTA 2FJEA 3Q9TA 1L9CA 4K22A 2YG4A 4H2PA 4C3YA 1GT8A 2XLPA 3G5RA 4A6NB 4H7UA 1IUWA 2R0PA 2JBVA 2WPFA 1NEKA 4DSHA 1F8RA 1QO8A 2IVDA 1K4QA 3UOZA 2QA1A 2GV8A 2GB0A 4EQXA 2FJBA 4USRA 1CJ3A 1KNRA 4ZCDA 2C64A 3WE0A 3AYJA 1H86A 3LADA 4H4ZA 4YT0A 4UDRA 3E1TA 3S5WA 2RABA 4N9XA 5M10A 2BXRA 2VZ2A 2B7RA 3QSSA 2GAHB 2GVCA 1TYTA 4U2TA 2Y6QA 3ATRA 3AE5A 1UKVG 1ZOYA 1YY5A 2XFQA 3D1CA 5EB5A 5JCIA 3AB1A 1DOEA 4GUVA 1Q1RA 1RYIA 1ZOVA 3REDA 1H6VA 4NTDA 1LQUA 3EPTA 2JB1A 2XVJA 3K7MX 3CNPA 4YSHA 2YR5A 1JRXA 2XLRA 5ER0A 4Z2UA 4E0VA 5HYMA 1NAAA 3DJEA 3V3NA 2E4GA 3C96A 3LB8A 3UKQA 1GRBA 4CRTA 4EQRA 2GR0A 4BURA 4H50A 4AOXA 3NKSA 2B76A 3UTEA 5FS7A 1ELIA 4GF7A 4O5UA 4K5RA 3QFBA 3P4RA 2WHDA 2Z5YA 3CNTA 3CPJG 3UTGA 3NNEA 3P4QA 4H4VA 1FEAA 2WETA 1W4XA 3LZWA 1E6EA 4M52A 1DOBA 2YLZA 4J2WA 3NH3X 5JCNA 4WX1A 4YTNA 4P9SA 3NTAA 2R0CA 1GV4A 1SEZA 3QVPA 3IF9A 5EBKA 2WDQA 2BS4A 3GDPA 4OPDA 2RGHA 3QSEA 3AEDA 5HXIA 2FJAA 3NK1X 1GRGA 2GMHA 3I6DA 1NHSA 1FOHA 3AECA 5U25A 1GALA 4C3XA 1MXTA 1PHHA 1BWCA 1COYA 1LTXR 3CN8A 4A5LA 2DKIA 2XVFA 1D4EA 4NTEA 4XWZA 2ZZBA 5C3JA 4OPIA 1VDCA 4UP3A 1ZK7A 5KRQA 3G5QA 3OC4A 2PHHA 2YR4A 2R0GA 4H4YA 3KKJA 4IA6A 2A8XA 4Z26A 3ALLA 4GRTA 4KPRA 4B66A 4IV9A 4AT0A 1CC6A 2WPEA 4AOSA 1V59A 1GETA 3AE8A 1JU2A 1PJ7A 1M64A 3ALMA 1F8SA 4Z2TA 2XFUA 2V60A 3NN6X 1KF6A 3DJGX 3UKHA 1D7YA 1GNDA 1H7XA 3BHFA 5LV9A 3UKAA 3C4NA 1GEUA 2QA2A 5KXJA 3P4PA 1D4CA 1PBEA 3CPHG 4CNKA 4U2LA 5BVAA 1XANA 5U1OA 3M0OA 1XHCA 4U2SA 4B68A 4DGKA 2C3DA 2Q0LA 4A79A 1Z6LA 2JB2A 3GYIA 3DA1A 1JRZA 3B3RA 2FJDA 3P9UA 2R4EA 2WP6A 4YKGA 1CF3A 3ICSA 4K7ZA 1EBDA 2CULA 1TDEA 2E5VA 2XVEA 2YG7A 4B67A 4UDQA 3NN0X 1E1KA 1K0IA 3IWAA 1L0VA 4HB9A 4A9WA 4TLXA 3DGZA 1PBCA 2R46A 4ZN0A 2BYBA 2GEWA 5IQ1A 3JSKA 1ZMDA 1REOA 3KU9A 4CY6A 2BC1A 4APNA 4BJYA 3S61A 3K7TA 1GRAA 4AP1A 1IUVA 1NG3A 4A65A 2CDUA 4MJWA 4JY2A 4YTMA 3GRTA 2V5ZA 1LQTA 2OAMA 2WOIA 1GTHA 3AE1A 3AWIA 4GDEA 4LA1A 3RNMA 4IVMB 2XFOA 2YVGA 2H89A 3SQPA 2F5ZA 2GQWA 4D04A 1O94A 4BK3A 1QLBA 1DJQA 4H4WA 1N4VA 2GAGB 2V6OA 1BF3A 2EQ7A 3Q6JA 4EMJA 4EMWA 3O0HA 3CGBA 1PXAA 4EQWA 1XPQA 3AEAA 1TRBA 2GMJA 2C73A 3P1WA 3VQRA 2X8CA 3PO7A 3GD3A 3AYLA 3LXDA 3V3OA 4Z25A 1AOGA 4TM1A 1Y56A 1N4WA 4TM4A 3AEEA 3H4KA 4C74A 1S2QA 2APGA 3NYCA 4U8JA 2WOWA 1TDOA 2Q6UA 3GYJA 4Z43A 2ARDA 1NHRA 4U8KA 1PXCA 3II4A 1E1MA 2JAEA 1PBBA 1EL5A 1LV0A 4NZHA 5FMHA 3ICTA 2B9WA 5KVIA 3T37A 3K7QX 5M0ZA 1CJ2A 2YM2A 1BGNA 1Q1WA 4YSXA 3NRNA 2ZZ0A 1Y56B 5HY5A 4TM3A 4U8NA 3FBSA 3NLCA 5EB4A 4A7AA 2VVLA 3K30A 2YR6A 3P4SA 1VG0A 2ZBWA 3FMWA 2XDOA 3M12A 1XDIA 1FEBA 2WU5A 1E7PA 1D5TA 2VQ7A 4BK1A 4OVIA 4TLZA 2BK3A 1IUUA 2H88A 5JCKA 2YAUA 4Y4MA 3KA7A 3GSIA 2CVJA 3NK0X 5KWFA 1PJ6A 4Z2RA 2A87A 4JN9A 1OJDA 1S2YA 2X3NA 3RHAA 4D03A 1FL2A 2XFNA 1FCDA 3GDNA 3AE2A 3NG7X 2YLSA 1ZKQA 1OJTA 3GRSA 2CFYA 3RP6A 4EQSA 2BACA 4U8PA 2W0HA 2JKCA 5KOWA 5JCLA 4OPLA 1RSGA 4JDRA 2R4JA 3VR8A 4YXDA 2BS2A 2Z5XA 2C76A 4NEWA 4OPUA 2C70A 1QJDA 2OALA 5BULA 2C7GA 2XYOA 3IC9A 2FBWA 4H2QA 2ZZCA 2YQUA 3CGEA 4H4XA 2WQYA 5HHFA 1DXLA 5BUKA 2YVJA 1KNPA 2XFPA 4YWOA 1CC4A 1B37A 1LJ1A 5FS6A 3KPFA 1IUTA 1H81A 1YKJA 3BHKA 3H8IA 3AE7A 3DJJA 2XVHA 2XLUA 4H2RA 4H4PA 3EF6A 3DH9A 4JNAA 4DNAA 1PS9A 2BK4A 2YLXA 1TDFA 2VVMA 3PS9A 3AD9B 3CNSA 2C3CA 3IHGA 3L8KA 2Y6RA 1B4VA 4EM3A 3QSMA 4CCRA 2WP5A 3C4AA 4GCMA 1B8SA 3UKLA 1K0LA 3UKPA 4EMIA 4B69A 3UP4A 3GWDA 4ZCCA 3ISHA 2OLOA 2WESA 3CIRA 1CL0A 5TR3A 4KX6A 4U8MA 2VRMA 1DODA 2YLTA 4JQ9A 3KLJA 3SFDA 4LU6A 3ALJA 2Q7VA 1K0JA 3BI2A 4BK2A 5KOXA 4REKA 3G5SA 1VG9A 4YSZA 2E1MA 4ECHA 1MOKA 3VRBA 1ZY8A 2GRTA 3CPIG 2C67A 3KD9A 2B9XA 3CGDA 3ADAB 4OPGA 4TM0A 1EL8A 5KVHA 5C2TA 3FPZA 4C5OA 1H83A 1GOSA 1TDKA 4O5QA 1BGJA 4DSGA 2I0ZA 2RGJA 2WPCA 3BI5A 3CNJA 4K8DA 2GH5A 2QCUA 4H4UA 2AAQA 3NGCX 1BZLA 1Q9IA 1GSNA 3HZLA 2X8HA 3CTYA 4FK1C 5U63A 4PAAA 5CKUA 4USQA 1NENA 2YM1A 2QAEA 2AQJA 4J33A 4A6NA 1KFYA 4H2NA 4C77A 4J31A 1YQ3A 3NT6A 1S3BA 1TYPA 2HQMA 4H4SA 3AEGA 2J3NA 2BC0A 1H7WA 1PDHA 1YQ4A 1NDAA 2GF3A 3FIMB 2GQFA 1ZDLA 2R45A 1PJ5A 1M6IA 2WDRA 2X8GA 3DJDA 4B1BA 1O5WA 3AXBA 3AE4A 1GESA 2C72A 2AR8A 2VOUA 2WU2A 3NYFA 3NK2X 4PABA 3UP5A 2R9ZA 3EAOA 4J34A 4BV6A 1IUXA 1GERA 3AE3A 2YG3A 4WCTA 4FDCB 3BI4A 4Y4NA 3QJ4A 4AT2A 3AEFA 4EM4A 2BCPA 4CCQA 5J60A 3GWFA 4H4RA 1O95A 1CJ4A 1VQWA 2GR3A 4BJZA 4UDPA 3URHA 2OLNA 3ABVA 3DMEA 1TDNA 3CGCA 3COXA 2WP9A 1IUSA 4H4TA 4J57A 1FECA 1MO9A 1Y0PA 2V61A 3LJPA 1IJHA 1GXFA 4FK1A 1DNCA 1OJ9A 4I58A 4H4QA 3DK8A 3UKKA 3ZYXA 1D4DA 1EL9A 2X99A 2C75A 4RG3A 4A99A 3GD4A 1PBDA 1GRHA 2C66A 4NEVA 3AE6A 3SGLA 2VVLG 2X50A 3UOVA 2Q0KA 4IVOB 4ICYA 1CJCA 1HYUA 1LVLA 3AD7B 2B9YA 5GSNA 3D8XA 2PYXA 2TMDA 3CNDA 3SFEA 3ICRA 2BS3A 4X9NA 3UKFA 4CBQA 2WOVA 3F8DA 1L9EA 1JNRA 4RG4A 1VRQB 1JOAA 1KDGA 1YQZA 1GRTA 2EQ9A 4J56A 1NHPA 2GR2A 3ITJA 4CY8A 4EIQA 2ACZA 1OJCA 3UOYA 1JEHA 4YSYA 1LPFA 2WBAA 4U8LA 1L9DA 1GRFA 2B7SA 1CC2A 1E39A 1DJNA 2V3AA 4GR1A 4J36A 2XLTA 5GRTA 3RP8A 2BXSA 4OPTA 2YVFA 3NYEA 3M13A 4X4JA 3BNUA 3QVRA 4XXGA 5DBJA 4B63A 2WDVA 4K2XA 1F8WA 2RGOA 3GMBA 3UTHA 2NVKX 2EQ6A 1ZP0A 5JCMA 5FS9A 2IVEA 3LZXA 2YWLA 3ZDNA 4FX9A 1GREA 3DK9A 5EOWA 2TPRA 1KSUA 2BK5A 1X31B 2UZZA 1D7LA 3NHOX 3SM8A 3AD8B 4GDPA 3B6DA 3NIXA 3AEBA 4U8OA 2YG5A 5IQ4A 1DOCA 3PVCA 2BABA 2YLWA 4U8IA 3KVEA 4Z24A 1P2HA 1PN0A 1H82A 1JNZA 1JRYA 2BA9A 4B65A 3L1RA 2IIDA 1P2EA 1CBOA 3I3LA 3QFAA 4LIIA 4Z44A 1OJAA 3DK4A 3UTFA 4B64A 3OZ2A 4YTPA 1BKWA 4ADWA 3AYIA 3F8RA 3UOXA 1H84A 4JNQA 2XCGA 5FS8A 1NG4A 4NTCA 2EQ8A 2WS3A 3LOVA 2NPXA 2OA1A 3V76A 2XLSA 2GR1A 1GPEA 3IHMA 4OPCA 4HA6A 2A89A 3VRAA 3GMCA 4JY3A
chains in the Genus database with same CATH superfamily
3EANA 5ECKB 2X64A 4AP3A 4EIPA 5ID2B 2C65A 2YLRA 1XWAA 2XVIA 4YKFA 3D22A 1E1NA 3D4MA 3UIWA 5L46A 4ZB6A 2H6YA 2MYGA 1NHOA 2BCGG 5J4UA 4IA5A 5E59A 3LG6A 2OBIA 5HR3A 3DGHA 3ATQA 3A2VA 3APQA 4ZIJA 1E1LA 4I97A 20GSA 2VQBA 3F8PA 3SZWA 3Q74A 4J2FA 3TDGA 1B5QA 1NHQA 2PVQA 1YDKA 4K22A 3Q9TA 4H2PA 2YWMA 4A6NB 4H7UA 1IUWA 1F3BA 2WPFA 2QKEA 1QO8A 2IVDA 1XFLA 1K4QA 2QA1A 4O92A 2XPEA 1KNRA 3W8SA 2DIYA 2F51A 6GSXA 4H4ZA 4WBJA 2CV4A 2LQQA 4YT0A 1J0FA 5M10A 4MZBA 1TK0B 2GAHB 2GVCA 4OFNA 3VWVA 5JWRB 2MMOA 1TOFA 1OE8A 3AB1A 2H1GA 3REDA 1XBSA 3C73A 4PX1A 4NTDA 3I9V2 1LQUA 2XVJA 4YSHA 4K6XA 3HXSA 4XS6A 4BPYA 1JRXA 3IV4A 3PGTA 3DJEA 1ON4A 4EQRA 2B5YA 1TU8A 1K0NA 2HNLA 4XTSA 3KP9A 2B76A 5FS7A 3QFBA 3P4RA 3CNTA 2M80A 3NNEA 3LXZA 1PD21 1FEAA 17GSA 1XWCA 5J3RA 2GQMA 2IFQA 3LZWA 2YLZA 4J2WA 3F4SA 4G0LA 4WX1A 4P9SA 4YTNA 3NTAA 1K0AA 1GV4A 1SEZA 3IF9A 1AQVA 1ZCPA 2R5GA 2BRAA 4I6XA 1LJRA 1GSDA 2LNTA 6GSSA 3KZQA 4O5RA 4ZL9A 4G0IA 3HA9A 1MD3A 2GSTA 3L0HA 1PHHA 1BWCA 1EV4A 4F0BA 1LTXR 3Q19A 4MJBA 2DKIA 4EVMA 3GKKA 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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
 3EAN A;  5ECK B;  2X64 A;  4AP3 A;  4EIP A;  5ID2 B;  2C65 A;  2YLR A;  1XWA A;  2XVI A;  4YKF A;  3D22 A;  1E1N A;  3D4M A;  3UIW A;  5L46 A;  4ZB6 A;  2H6Y A;  2MYG A;  1NHO A;  2BCG G;  5J4U A;  4IA5 A;  5E59 A;  3LG6 A;  2OBI A;  5HR3 A;  3DGH A;  3ATQ A;  3A2V A;  3APQ A;  4ZIJ A;  1E1L A;  4I97 A;  20GS A;  2VQB A;  3F8P A;  3SZW A;  3Q74 A;  4J2F A;  3TDG A;  1B5Q A;  1NHQ A;  2PVQ A;  1YDK A;  4K22 A;  3Q9T A;  4H2P A;  2YWM A;  4A6N B;  4H7U A;  1IUW A;  1F3B A;  2WPF A;  2QKE A;  1QO8 A;  2IVD A;  1XFL A;  1K4Q A;  2QA1 A;  4O92 A;  2XPE A;  1KNR A;  3W8S A;  2DIY A;  2F51 A;  6GSX A;  4H4Z A;  4WBJ A;  2CV4 A;  2LQQ A;  4YT0 A;  1J0F A;  5M10 A;  4MZB A;  1TK0 B;  2GAH B;  2GVC A;  4OFN A;  3VWV A;  5JWR B;  2MMO A;  1TOF A;  1OE8 A;  3AB1 A;  2H1G A;  3RED A;  1XBS A;  3C73 A;  4PX1 A;  4NTD A;  3I9V 2;  1LQU A;  2XVJ A;  4YSH A;  4K6X A;  3HXS A;  4XS6 A;  4BPY A;  1JRX A;  3IV4 A;  3PGT A;  3DJE A;  1ON4 A;  4EQR A;  2B5Y A;  1TU8 A;  1K0N A;  2HNL A;  4XTS A;  3KP9 A;  2B76 A; 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