4Z2UA

Crystal structure of 2-hydroxybiphenyl 3-monooxygenase r242q from pseudomonas azelaica
Total Genus 191
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
191
sequence length
581
structure length
563
Chain Sequence
AETDVLIVGAGPAGAMSATLLASLGIRSLMINRWRSTSPGPRSHIINQRTMEILRDIGLEESAKSLAVPKEYMGEHVYATSLAGEEFGRIPAWASHPQAHAEHELASPSRYCDLPQLYFEPMVVSEAALRGADVRFLTEYLGHVEDQDGVTARLLDHVSGAEYEVRAKYIIGADGAHSLVAQNAGLPFEGQMGIGDSGSINIEFSADLSSLCEHRKGDMYWMFVAALQMIRPWNKWICVWGYITKEEAKKIIHEIIGTDEIPVEVGPISTWTINQQYAVRNTSGRVFCMGDAVHRHTPMGGLGLNTSVQDAYNLAWKLALVLKGTAAPTLLDSYDAERSPVAKQIVERAFKSLSTFPPVFEALSLPPAPTESEMAEALVRLKDASEEGAKRRAALRKAMDATIIGLGGGHGVELNQRYVSRAVFPDGTPDPGFVRDQEFFYQASTRPGAHLPHVWLTENQRRISTLDLCGKGRFTLLTGLSGAAWKHEAEQVSQSLGIELKVCVIGPGQEFVDTYGEYAKISEIGESGALLVRPDMFIAFRAKDASREGLEQLNVAVKSILGR
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

publication title A crystal structure of 2-hydroxybiphenyl 3-monooxygenase with bound substrate provides insights into the enzymatic mechanism.
pubmed doi rcsb
source organism Pseudomonas nitroreducens hbp1
molecule tags Oxidoreductase
molecule keywords 2-hydroxybiphenyl-3-monooxygenase
total genus 191
structure length 563
sequence length 581
chains with identical sequence B
ec nomenclature ec 1.14.13.44: 2-hydroxybiphenyl 3-monooxygenase.
pdb deposition date 2015-03-30

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF01494 FAD_binding_3 FAD binding domain
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.30.120 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich Glutaredoxin Glutaredoxin 4z2uA03
3.50.50.60 Alpha Beta 3-Layer(bba) Sandwich FAD/NAD(P)-binding domain FAD/NAD(P)-binding domain 4z2uA01
3EPTA 2GB0A 4NTDA 1LQUA 1UKVG 3CNJA 1PBEA 4FX9A 4FK1C 3UTGA 2VVLA 3M0OA 3UKFA 1KSSA 2R4JA 2JBVA 1IUUA 4IVMB 3V3NA 4EMJA 3CTYA 3DK9A 5KOXA 1ZP0A 4A99A 1Z6LA 2Q6UA 2XFPA 4PABA 1H6VA 3AD8B 4JNAA 4B65A 2JB3A 2YVFA 4Z2RA 2V6OA 1PJ7A 2WS3A 3NLCA 3NYFA 4H4TA 2YLWA 1ZDLA 2C73A 3PO7A 5BVAA 2WBAA 1KNPA 4U8IA 2C72A 4ZCDA 1REOA 3KU9A 2WPEA 3BI2A 2ZZCA 3R9UA 4XXGA 5IQ4A 3UTEA 2YVGA 3AE2A 1GRGA 1HYUA 3I6DA 3NYEA 4K2XA 1DJNA 2YQUA 4E0VA 1GRBA 3CPHG 1JNZA 3DH9A 1TRBA 1EL5A 1BGNA 1OJDA 2XDOA 3CGDA 3F8DA 5FMHA 1YQZA 4OPDA 1EBDA 1RP0A 1CC6A 1S3BA 2V61A 2YG5A 2YG7A 1E6EA 3AWIA 1DODA 2XLTA 1FOHA 1B8SA 1FECA 4J31A 3RP6A 2BS2A 3II4A 3NGCX 3GYIA 4NTCA 1BKWA 1JOAA 2C66A 1PXBA 4RG4A 1D5TA 3O0HA 2C70A 4EM4A 1P2EA 4B69A 1TDOA 4GUVA 2GVCA 4BV6A 1JRXA 1GTEA 3DJDA 2YG3A 1FCDA 2XFOA 4U8NA 1XANA 4A5LA 5TR3A 3S61A 3GDPA 3QJ4A 3RP8A 4Z25A 4X4JA 3P4QA 2V60A 1N1PA 3ICRA 2APGA 4BK2A 2C64A 2WU5A 2FJDA 2GR2A 2BK4A 3BHKA 4WX1A 2R0PA 1GALA 2BS4A 3AE5A 2OLOA 3FPZA 3NHOX 4B67A 3BNMA 1NPXA 3P4PA 2BCPA 3LOVA 3H8IA 3ALLA 5U63A 1BF3A 2GQFA 4FK1A 1Q1WA 1IUWA 3DGZA 4A65A 4JN9A 2AR8A 4OVIA 1VG0A 4TLXA 2XFUA 2WP5A 1ELIA 4GDEA 1E7PA 1PBFA 2YLTA 2VRMA 3KKJA 4BJZA 4Z2UA 5KVHA 4ADWA 2WPFA 2R45A 1GRHA 2H88A 4EMIA 1TDEA 5HYMA 2ZZ0A 3CN8A 1GRTA 2BK3A 4H4PA 4JNQA 3NG7X 2XVFA 2YG4A 3KD9A 3NTDA 2Q0LA 1Y56B 2ARDA 4H4ZA 3ZDNA 4AOSA 5M10A 4Z44A 4USQA 1CJ3A 2IVDA 1L9DA 2R9ZA 4A6NB 1K0JA 3FBSA 1MOKA 4K8DA 2VVMA 4O5UA 4BK1A 4EIQA 4D03A 4CCQA 4JDRA 2J3NA 2AQJA 4YT0A 4H4XA 3DMEA 4HA6A 3UP5A 3DK8A 1TDKA 3RP7A 4B68A 3UKPA 3NIXA 5KOWA 2BABA 1E1LA 2BA9A 3CGEA 2X8GA 4B1BA 3Q6JA 3L8KA 1H82A 2AAQA 4NTEA 2CFYA 4OCGA 1DXLA 5KXJA 1PN0A 2Y6RA 4RSLA 3D8XA 4U2SA 1GT8A 1IJHA 2JK6A 2W0HA 3NK2X 3GWDA 3ADAB 2E4GA 4TM0A 2C67A 2C3DA 3QFAA 3VR8A 2EQ6A 2V3AA 3G5SA 2QA1A 4J2WA 4J56A 4OPLA 2CULA 4H4SA 1ZMDA 1B4VA 3FIMB 4BURA 1GPEA 3UKQA 2XVHA 2WPCA 1TYTA 4AP1A 5FS8A 2GV8A 2C76A 1S2QA 1CJ2A 3EAOA 4O5QA 4A9WA 5C3JA 3FMWA 1GXFA 1KF6A 1W4XA 4N9XA 3GRTA 1K0IA 3SFEA 1PXAA 3UP4A 1VRQB 3CGCA 2ZZBA 1X31B 4XWRA 2GAHB 3AE9A 3NRNA 4Z43A 3AEDA 3K30A 2WETA 1CC4A 3UOVA 1CJ4A 1PHHA 3NH3X 1S3EA 3QFBA 4NEWA 2X99A 2QAEA 4YTPA 2WEUA 4UDQA 3IC9A 1BWCA 1QO8A 2BC0A 4YSZA 5KRQA 1KFYA 2JAEA 1LJ1A 2Z5XA 2YLRA 3CGBA 2EQ9A 4IV9A 3AEEA 5U1OA 4B63A 3H4KA 4OPCA 4H2NA 4H4UA 1EL9A 2OALA 4Z24A 4B64A 2WHDA 1Q1RA 1DNCA 2C7GA 5KWFA 4IA6A 5BRTA 4U8KA 3REDA 1JRZA 2WDRA 2YWLA 1N4UA 4Z2TA 1M64A 2B9YA 3CNTA 4H4QA 4AP3A 4EQWA 1OJTA 4U8JA 2VQ7A 2WDVA 3FG2P 3UKAA 2VRLA 4K5RA 5JCNA 1K4QA 1EL8A 1FEAA 3C4NA 2XFNA 3B6DA 1PXCA 4RG3A 3KA7A 3DJJA 3NKSA 4GR1A 1NAAA 1YQ3A 3ALJA 4UP3A 2RGOA 4EMWA 1ZOVA 3H8LA 1E1NA 5GSNA 1F8WA 3G5RA 3E1TA 2V3BA 5JCKA 1DJQA 2TPRA 2TMDA 1ZK7A 3AEGA 3GMBA 4I58A 4OPIA 4DSHA 3UOYA 2CVJA 1QJDA 1YKJA 4J57A 4K7ZA 5CKUA 1GERA 2OA1A 4USRA 5FS6A 2RGJA 1E1MA 2YM2A 3VQRA 3NYCA 2GQWA 3NTAA 4A6NA 5GRTA 2PYXA 4HB9A 4J33A 3UKKA 1YY5A 4Y4MA 3BHFA 1GV4A 4XWZA 4DNAA 2BK5A 2NPXA 3I3LA 2VQBA 1O94A 2EQ7A 1GTHA 3IWAA 2QCUA 2GR1A 2GMHA 3CPIG 4BJYA 2IVEA 1XPQA 2CDUA 3IF9A 3AXBA 3CNDA 4YTMA 3VR9A 5JCIA 5EOWA 2YR6A 1NDAA 1P2HA 2X3NA 5KVIA 4NZHA 4YWOA 1ONFA 4U8LA 4CCRA 2XVJA 3LADA 4H2PA 5U25A 1L0VA 1H84A 2R4EA 2I0ZA 4KX6A 5BULA 4B66A 4C77A 4MJWA 2R0CA 1EL7A 1ZY8A 2NVKX 2Z5YA 4U8MA 5HHFA 2BYBA 1JRYA 1GRAA 3ICSA 5EB5A 2YR4A 3UOZA 4CY6A 4TM4A 4CRTA 2XLUA 3UKHA 1PBDA 4H2QA 2X50A 2YLSA 4H4WA 2XVEA 3AE3A 5IPYA 1VQWA 1PS9A 1VG9A 3DK4A 3VRDB 4YSYA 3AEFA 3WE0A 4C3XA 2X8CA 3GYJA 2R0GA 1GNDA 1OJCA 4APNA 2BXRA 4YSHA 4YTNA 4PAAA 4AOXA 3T37A 2GRTA 1D4CA 1NEKA 4D04A 3P1WA 4TLZA 1YQ4A 1CC2A 4U2LA 5C2TA 3OZ2A 3P4SA 3COXA 2WQYA 1D7LA 1K0LA 4J34A 3ICTA 2DKIA 4U2TA 3QVRA 3IHGA 5CQFA 5HY5A 4EIPA 3VRAA 3ZYXA 1L9EA 2HQMA 3C96A 1PDHA 3AE6A 1N4VA 2VOUA 4YKFA 4A79A 2YAUA 4YXDA 4GCMA 2VZ2A 3D1CA 2YVJA 4H4YA 1RSGA 1H7WA 4Y4LA 3B3RA 2BC1A 3JSKA 3QSMA 5LV9A 1F3PA 2OAMA 3BNUA 1GESA 2YM1A 2GH5A 2B7RA 2GAGB 2X8HA 2YG6A 1OJ9A 2R46A 1NHQA 4EM3A 2BACA 3KPFA 4GF7A 4EQRA 2Y6QA 1GSNA 1NENA 3K7MX 4LU6A 2WESA 1IUTA 2XLPA 1BZLA 3AB1A 3LB8A 3L1RA 2EQ8A 3K7QX 3KVEA 1MXTA 1KNRA 2B9WA 4Z26A 5IQ1A 4ICYA 1CF3A 2WOVA 3AD9B 1V59A 3RNMA 3SFDA 3AE4A 1FEBA 1O5WA 4CNKA 2A89A 3UTHA 3SGLA 3AE7A 3NK1X 2FBWA 2XYOA 1B37A 4IVOB 1F6MA 3CNSA 4P9SA 1LVLA 1LTXR 4JY3A 5FS7A 5L46A 1NG4A 3PS9A 4H4RA 2A8XA 3AEBA 2B9XA 4YSXA 1CHUA 2H89A 2XCGA 3EANA 3DJEA 1F8SA 3F8PA 1JU2A 2WP6A 1D7YA 1LQTA 2JB2A 4OPUA 1OJAA 4GDPA 3NK0X 2WU2A 3V3OA 2GR3A 3NN6X 1COYA 4EQXA 4ZN0A 1QLBA 3PVCA 4U8PA 4CBQA 4CNJA 4DSGA 1Y0PA 4H2RA 5HXIA 1IUVA 3EF6A 1PJ5A 2C75A 4UDPA 4LA1A 5ER0A 1H86A 3P4RA 2OLNA 1Y56A 3QSEA 1KDGA 2WDQA 3NT6A 3NN0X 2WP9A 1D4EA 4H7UA 2GEWA 4REKA 5J60A 2FJAA 1TYPA 2YLZA 3HZLA 3P9UA 3F8RA 2O9ZA 4H4VA 1L9CA 3ATQA 1MO9A 1GEUA 4TM3A 4X9MA 2QA2A 1ZOYA 3QVPA 3LZWA 1Q9IA 2A87A 1LV0A 2BXSA 2BS3A 4OPTA 2JKCA 1PBCA 4TM1A 3GD3A 3M12A 3RHAA 4A7AA 3CPJG 4K5SA 3AECA 2YR5A 4Y4NA 1KSUA 1BGJA 1ZX9A 3GWFA 3ISHA 2BCGG 4DGKA 4K22A 1E1KA 4GRTA 2YLXA 4JQ9A 5JCLA 1XDIA 1NHRA 2WOIA 2C3CA 2UZZA 3AYIA 3GDNA 3LZXA 4H50A 4I59A 3M13A 1JEHA 3VRBA 3QSSA 2XFQA 3AEAA 2GR0A 2GF3A 1ZKQA 2PHHA 3LXDA 4NEVA 1B5QA 3IHMA 1O95A 4IA5A 2Q0KA 2E1MA 5M0ZA 2RGHA 2VVLG 4U8OA 5EBKA 1E39A 4CY8A 4AT0A 4WCTA 1PJ6A 2B7SA 2WOWA 1XHCA 3Q9TA 3SQPA 3V76A 4ECHA 3G5QA 1SEZA 4ZCCA 3UOXA 5BUKA 2ACZA 4X9NA 5J7XA 3KLJA 1D4DA 1RYIA 3AE8A 2JB1A 3ALMA 4UDRA 4C5OA 1NHSA 3GSIA 3NNEA 3AE1A 1GOSA 4LIIA 1FL2A 1TDFA 3ATRA 1NG3A 4KPRA 3UCLA 1CBOA 4C3YA 4BK3A 3C4AA 3CNPA 3LJPA 1H7XA 2E5VA 2Q7VA 3AYLA 3CIRA 3BI5A 3DA1A 2IIDA 3DJGX 3GRSA 4M52A 2C65A 1CJCA 1H81A 2XLRA 3ITJA 1F8RA 2RABA 3OC4A 1VDCA 3S5WA 1ZMCA 4AT2A 3DGHA 3URHA 4OPGA 3AYJA 3AD7B 2DKHA 3SM8A 5DBJA 1H83A 1IUXA 1LPFA 2F5ZA 2XVIA 3UTFA 2FJBA 2GMJA 4C74A 1IUSA 1CL0A 1AOGA 1PBBA 3BI4A 1S2YA 5FS9A 4JY2A 2XLSA 4FDCB 2B76A 1TDNA 2V5ZA 1GREA 2FJEA 1GETA 3ABVA 1M6IA 4J36A 4YKGA 3GD4A 3GMCA 3UKLA 5JCMA 1DOCA 1JNRA 4EQSA 1N4WA 1DOEA 1GRFA 1NHPA 2ZBWA 1DOBA 5EB4A 3K7TA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
3EPTA 4JZQA 4NTDA 1UKVG 2PMTA 3UTGA 2GSSA 2C3TA 3M0OA 3F3QA 3CSJA 3M9KA 3CTYA 16GSA 1ZP0A 2XBQA 3A2XA 2YVFA 4PX1A 4G9KA 3N5OA 2V6OA 3NLCA 4LMVA 4H4TA 2YZUA 5LCZA 3S9FA 2C73A 1EGRA 3PO7A 2WBAA 4U8IA 1K3LA 1REOA 4AJ6A 5JWRB 2WPEA 1M3JA 2RUEA 4JE1A 4MZBA 2YANA 3HHVA 4DEJA 2MYGA 3CPHG 1KNGA 1TRBA 3GNJA 5FT3A 3LWAA 1S3BA 4F0CA 1T4ZA 1EZKA 2EIRA 2XLTA 3DVWA 4POKA 4PQIA 4J31A 1ZYPA 1BKWA 2O8VB 4EXJA 1YKAA 4RG4A 4EM4A 2HSHA 3FR6A 2GVCA 5J5NA 4BV6A 1FCDA 2XFOA 1XANA 1GTBA 3HVVA 4NNJA 4Z25A 4GCIA 5HQPA 3ICRA 3WT2A 3Q74A 1M2BA 2WU5A 2LTKA 1GALA 2R5GA 1ZYEA 3BNMA 1NPXA 3ME7A 4XS6A 2H66A 2LNTA 1BF3A 5HFIA 4G10A 2GQFA 3SX6A 3DGZA 5AIXA 2WB9A 2H72A 4JN9A 2OE0A 1X9WB 2AR8A 2C0FA 2BTOT 2WP5A 4GDEA 3ZVJA 3UJ1A 2M72A 3RPPA 1V40A 4BJZA 2LNSA 2GDRA 4Z2UA 1ZMAA 1YEXA 2ZZ0A 2H6ZA 3GA4A 1GUHA 3NG7X 2HRNA 2XVFA 2YG4A 3IR4A 4II3A 5ECLB 2Q0LA 3ZDNA 4H4ZA 1PL1A 2QGVA 3DMLA 2R9ZA 1O8XA 3FEUA 1K0JA 2WJUA 1MOKA 3QCPA 2WCIA 4K0NA 3RPNA 4EIQA 1MEKA 1ERWA 1SL0B 4CCQA 4JBBA 3UP5A 3IK7A 3TCOA 3FZ5A 3RP7A 3NIXA 5KOWA 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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