4Z2UA

Crystal structure of 2-hydroxybiphenyl 3-monooxygenase r242q from pseudomonas azelaica
Total Genus 191
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
191
sequence length
581
structure length
563
Chain Sequence
AETDVLIVGAGPAGAMSATLLASLGIRSLMINRWRSTSPGPRSHIINQRTMEILRDIGLEESAKSLAVPKEYMGEHVYATSLAGEEFGRIPAWASHPQAHAEHELASPSRYCDLPQLYFEPMVVSEAALRGADVRFLTEYLGHVEDQDGVTARLLDHVSGAEYEVRAKYIIGADGAHSLVAQNAGLPFEGQMGIGDSGSINIEFSADLSSLCEHRKGDMYWMFVAALQMIRPWNKWICVWGYITKEEAKKIIHEIIGTDEIPVEVGPISTWTINQQYAVRNTSGRVFCMGDAVHRHTPMGGLGLNTSVQDAYNLAWKLALVLKGTAAPTLLDSYDAERSPVAKQIVERAFKSLSTFPPVFEALSLPPAPTESEMAEALVRLKDASEEGAKRRAALRKAMDATIIGLGGGHGVELNQRYVSRAVFPDGTPDPGFVRDQEFFYQASTRPGAHLPHVWLTENQRRISTLDLCGKGRFTLLTGLSGAAWKHEAEQVSQSLGIELKVCVIGPGQEFVDTYGEYAKISEIGESGALLVRPDMFIAFRAKDASREGLEQLNVAVKSILGR
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
publication title A crystal structure of 2-hydroxybiphenyl 3-monooxygenase with bound substrate provides insights into the enzymatic mechanism.
pubmed doi rcsb
molecule keywords 2-hydroxybiphenyl-3-monooxygenase
molecule tags Oxidoreductase
source organism Pseudomonas nitroreducens hbp1
total genus 191
structure length 563
sequence length 581
chains with identical sequence B
ec nomenclature ec 1.14.13.44: 2-hydroxybiphenyl 3-monooxygenase.
pdb deposition date 2015-03-30

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF01494 FAD_binding_3 FAD binding domain
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.30.120 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich Glutaredoxin Glutaredoxin 4z2uA03
3.50.50.60 Alpha Beta 3-Layer(bba) Sandwich FAD/NAD(P)-binding domain FAD/NAD(P)-binding domain 4z2uA01
2BK3A 4Z25A 1IUXA 2E5VA 3AE1A 1DNCA 2R46A 4OPCA 5IQ1A 2WOVA 1GETA 1TRBA 3KPFA 2WU2A 2OLNA 1E1MA 1E1KA 3EAOA 3EF6A 3CGBA 4H7UA 3UTGA 4CNJA 1QO8A 4YTPA 3NIXA 4LIIA 1CBOA 2CULA 2B9YA 1JRZA 1KF6A 1GRHA 2XLPA 1PXCA 3M13A 3UCLA 3P9UA 2C75A 2R0PA 1GRGA 4B65A 2WBAA 2OLOA 1S2YA 5M10A 3AEAA 3NLCA 4YSHA 1XDIA 2R9ZA 3BNUA 3RHAA 4A6NA 4H4WA 1S2QA 3UKAA 3NK1X 5HXIA 1CL0A 1D4EA 2FJBA 1OJCA 2V6OA 2XVEA 3IHMA 3VR8A 3SFDA 2EQ8A 4IA6A 1BKWA 1LJ1A 2UZZA 2X50A 3WE0A 1CJ3A 2B76A 3DA1A 4D04A 2WHDA 3SGLA 2WPCA 2BK5A 3H4KA 1NAAA 3VRAA 1PHHA 4UDRA 2Q7VA 1EBDA 2DKIA 3P1WA 4U8NA 2AR8A 3QSSA 4JN9A 5EB5A 1NPXA 4H2NA 3T37A 2ARDA 1Q1RA 3CNSA 4J36A 4ADWA 1PJ6A 1MOKA 1H6VA 1N4UA 1L9DA 3I6DA 3LJPA 1JNRA 3GYJA 1S3BA 4UP3A 2JB2A 4CNKA 1IUSA 2RGOA 2JB3A 2V3AA 3FPZA 4PAAA 1H86A 3DH9A 4USRA 5JCKA 2NVKX 5GSNA 3DK9A 4K8DA 1DXLA 3G5RA 1PBFA 4OPTA 4U2LA 4B64A 1NENA 1PBDA 3JSKA 4JNAA 3PS9A 5EBKA 5IPYA 4OPDA 4B68A 2BS2A 1NHRA 5CQFA 1GT8A 3NYFA 2WP9A 4ECHA 4TLZA 3AE6A 4FDCB 1KNPA 2YVGA 4YXDA 1Y56A 3AEBA 3PO7A 4YTMA 3LXDA 1LTXR 4EM4A 4DGKA 3H8LA 3UP4A 4H2RA 1IJHA 2YM1A 3QVRA 1OJAA 3SQPA 3G5SA 3R9UA 1BWCA 4U8LA 4NTEA 1YKJA 1O5WA 4H4TA 1O94A 3UOXA 3LADA 4A9WA 1YY5A 4FX9A 2C76A 3DGHA 3L8KA 4Y4NA 1KDGA 3CNJA 2AQJA 4IV9A 3NYEA 5JCIA 2C65A 1N4WA 4ZCDA 3ZDNA 4GR1A 4H4QA 5J60A 3D8XA 2J3NA 2GMHA 1M64A 2VZ2A 2YLWA 3CNTA 3QSMA 4H4XA 4GDPA 3UKLA 3VR9A 3IC9A 2EQ9A 3L1RA 2F5ZA 4P9SA 4X9NA 4LA1A 2X8GA 1RSGA 1BGJA 1REOA 4JY3A 2YG4A 2GH5A 2C72A 1L9EA 2WP5A 4KPRA 2YR4A 2JKCA 1EL5A 3NGCX 3AECA 3AYJA 1E1LA 1PXAA 3GD4A 4I58A 2XVFA 3GDPA 3ALMA 3VQRA 3AE7A 4H4SA 4JDRA 2GVCA 4CRTA 3RP6A 3II4A 1TDKA 2C70A 1ZP0A 1EL8A 1D5TA 1DOCA 2XLRA 5HHFA 2PYXA 4DSHA 3BI5A 2W0HA 4ZCCA 2B7SA 1RYIA 4K5RA 2B9WA 4BJZA 3F8RA 4NZHA 2WETA 3AYLA 3GWDA 2B9XA 3DMEA 4NEVA 4H50A 3AEGA 3NK2X 5U63A 1NEKA 3AD7B 2XLSA 1ZY8A 2BC1A 4BK3A 2WU5A 1B4VA 1Q9IA 5C3JA 2X8CA 2GQFA 4Z2RA 4CBQA 3GMBA 4H2PA 3GWFA 3HZLA 1K0IA 2C3DA 2YVFA 4Z24A 2AAQA 5EB4A 1HYUA 5FMHA 2BS3A 3EPTA 4A6NB 2QA2A 3IHGA 5LV9A 5ER0A 2YLRA 4TM1A 2GB0A 2BXSA 3QJ4A 2X3NA 4NEWA 4OCGA 5CKUA 2Z5XA 3NKSA 4GF7A 1XHCA 3C96A 1FEBA 1NHPA 3PVCA 5GRTA 5TR3A 3GDNA 2YLXA 2WEUA 4YSZA 1NG4A 1YQ4A 2JK6A 4H4RA 1CJ4A 3UOZA 3SFEA 4Z2UA 1GXFA 1GRTA 1Q1WA 2E1MA 2CFYA 2WS3A 2BCGG 2VVLA 2XFQA 2Y6QA 3ABVA 3LZXA 4Y4MA 3KVEA 2GF3A 3C4AA 3UKFA 1ONFA 2FJAA 1TDOA 2BCPA 2WDVA 2XLTA 2IIDA 5U1OA 1CJ2A 4H2QA 1L0VA 1K0JA 1ZMDA 1ZKQA 2FBWA 5HY5A 4IVOB 2JAEA 4B66A 1H7WA 3K7QX 5KRQA 1IUUA 2XFNA 2V5ZA 2I0ZA 3V3OA 1F8SA 4E0VA 3NN6X 2IVEA 3LZWA 4BV6A 4J34A 1K4QA 1GTEA 4BURA 1CC4A 1ZMCA 5HYMA 3P4SA 4GUVA 1DOEA 1S3EA 4U8PA 5BVAA 2YLZA 1FL2A 3QVPA 1ZOVA 1PBCA 3UTFA 1O95A 3BI2A 2ZZCA 4Y4LA 5BUKA 2R4JA 1Y56B 1COYA 1EL7A 1DJNA 2XFOA 1PBBA 4H4UA 4B63A 1L9CA 1GSNA 1PJ5A 2ACZA 2QCUA 1JNZA 3ADAB 3I3LA 2RGJA 1CJCA 3AE4A 3DJEA 1TDEA 1KSSA 1NHQA 3ALLA 4CY8A 1GV4A 5KXJA 4MJWA 3RP7A 1W4XA 5KOWA 1ZDLA 3AYIA 2HQMA 1FEAA 1YQZA 3GSIA 3ICRA 1TDFA 5FS6A 2R0GA 4REKA 1IUWA 3AEFA 2H89A 4X9MA 2IVDA 4A5LA 1GTHA 2PHHA 4O5UA 4GRTA 2O9ZA 2APGA 1VG9A 3CNDA 4EMJA 3GD3A 2VOUA 1ZX9A 2Y6RA 4WX1A 4YTNA 4EIQA 2Z5YA 1NG3A 2A8XA 3V76A 3OZ2A 1ELIA 4KX6A 4YSYA 4A99A 2GV8A 3ZYXA 2TMDA 3CNPA 3ATQA 3P4QA 3UKKA 3CPIG 4EMIA 4U2TA 2GR2A 2XYOA 3S5WA 2RABA 1E6EA 1VDCA 3UKHA 2BABA 2GR3A 3DK8A 4IVMB 1CHUA 2A89A 3AE8A 4C77A 3ITJA 1Z6LA 5FS7A 3NYCA 2BS4A 3AXBA 2GMJA 2X8HA 1JRXA 3ISHA 5KVHA 1N4VA 5DBJA 1V59A 4EQWA 2EQ6A 4J56A 4Z43A 2YR6A 5JCNA 3P4PA 3CGCA 1F8WA 4CCRA 2BACA 2XDOA 4UDPA 3ICTA 2OALA 1PBEA 2XCGA 4H4ZA 2CDUA 2YWLA 4JNQA 3NG7X 2XFPA 3DJJA 2XLUA 1DODA 3QFAA 1D7YA 4HA6A 3NNEA 4U8JA 3NTAA 5U25A 3CN8A 4A65A 1E39A 2XVJA 2WPEA 1RP0A 3UP5A 4D03A 1LVLA 4XWZA 3URHA 2GAGB 1JEHA 1KFYA 1Y0PA 4Z2TA 1GREA 3CGEA 1F8RA 4H4YA 4J33A 2GEWA 4AP1A 1FCDA 4TM4A 4DSGA 4JQ9A 3CIRA 3KU9A 2JBVA 2C67A 3REDA 5KWFA 3K7TA 4C3XA 4YSXA 4AOXA 2ZZ0A 1ZOYA 1AOGA 1XANA 1MO9A 2GR0A 1CF3A 2WDRA 2WOWA 3V3NA 4OPGA 2Q0KA 3OC4A 3AE5A 4BJYA 1H84A 4APNA 5BULA 5C2TA 3GRSA 4CCQA 1H7XA 4ZN0A 2CVJA 2R4EA 3KKJA 1JOAA 3FG2P 4O5QA 4K7ZA 4C5OA 2Q0LA 3B6DA 4EQSA 4J57A 3RP8A 1BZLA 1LQTA 3KD9A 3M0OA 3GYIA 3CPHG 3KA7A 2GRTA 2VRLA 1JU2A 4AT0A 1GEUA 3M12A 3GMCA 5M0ZA 2X99A 2YG5A 2R0CA 4IA5A 4EIPA 2WESA 3O0HA 3KLJA 4B1BA 1DJQA 4AP3A 1BF3A 2EQ7A 2DKHA 2VQBA 3GRTA 3Q6JA 3QFBA 2FJDA 2OAMA 1SEZA 3NTDA 3VRDB 2ZBWA 4U8IA 1GPEA 2C3CA 4AT2A 2BC0A 4USQA 1QJDA 2YLSA 1YQ3A 1KNRA 2V60A 4EM3A 5JCMA 1E1NA 4YWOA 1K0LA 1UKVG 1GNDA 2RGHA 1NDAA 5FS8A 1H83A 4H4VA 5J7XA 4I59A 3UOYA 1JRYA 4U8OA 3UOVA 1M6IA 1MXTA 5KOXA 1GRBA 2TPRA 4OVIA 1F3PA 1OJ9A 3EANA 1FECA 2Q6UA 5L46A 2GQWA 4FK1A 1GRFA 2R45A 1TYTA 2YR5A 4K22A 1PS9A 2VQ7A 3AD9B 3SM8A 1H82A 2E4GA 3B3RA 4N9XA 2WOIA 1GALA 2WPFA 1D7LA 3DGZA 1E7PA 4Z44A 1ZK7A 2YM2A 4DNAA 2GAHB 4J31A 3AEDA 2YAUA 4AOSA 1QLBA 3NHOX 3AD8B 3DK4A 1GRAA 3ICSA 1NHSA 1D4CA 3UTEA 2YG6A 3AE3A 3UTHA 4RG4A 2V61A 3E1TA 5EOWA 2XVHA 4ICYA 2QAEA 1N1PA 4OPLA 2BA9A 1B37A 3FIMB 4XWRA 1CC2A 2WDQA 5FS9A 3F8PA 2JB1A 3RNMA 1PN0A 3ATRA 1P2EA 3D1CA 3IF9A 4FK1C 2H88A 3BNMA 3NT6A 4GCMA 4NTDA 1OJDA 2C7GA 4GDEA 4HB9A 1PJ7A 1X31B 3AEEA 3UKQA 2C64A 3NH3X 3NRNA 1GERA 2YG3A 4U8MA 2ZZBA 2VVMA 2YG7A 2XVIA 3VRBA 1LPFA 1GESA 1TDNA 1IUTA 4U8KA 4BK1A 4EQXA 3S61A 3AWIA 3F8DA 3COXA 2WP6A 2YQUA 1XPQA 5JCLA 1VG0A 2V3BA 4TM3A 4YKGA 4C3YA 1PXBA 2BYBA 3CPJG 4C74A 4A79A 4B67A 5IQ4A 3IWAA 2BXRA 4OPIA 3FBSA 4CY6A 1KSUA 3AE2A 1H81A 3DJGX 3BHKA 1CC6A 4RSLA 4JY2A 3BI4A 3UKPA 1VRQB 3K30A 4NTCA 4OPUA 3H8IA 4LU6A 2NPXA 3AB1A 1VQWA 4M52A 5BRTA 2XFUA 2C66A 3FMWA 4K2XA 1PDHA 4YT0A 4EQRA 3LOVA 1DOBA 1B5QA 4Z26A 4EMWA 2GR1A 3G5QA 4UDQA 1F6MA 4TM0A 4B69A 1LQUA 1BGNA 1LV0A 2YVJA 2QA1A 3AE9A 2A87A 3NK0X 1IUVA 3QSEA 4K5SA 2BK4A 4WCTA 4A7AA 3BHFA 1TYPA 3CGDA 2VRMA 4X4JA 1EL9A 3P4RA 4H4PA 2C73A 4J2WA 2YLTA 3Q9TA 1FOHA 1D4DA 1GOSA 1OJTA 3K7MX 3LB8A 2FJEA 1P2HA 3DJDA 4U2SA 2WQYA 4BK2A 4YKFA 2VVLG 4XXGA 5KVIA 3NN0X 2B7RA 1B8SA 3CTYA 3ALJA 4RG3A 3C4NA 4TLXA 2OA1A 4PABA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
4TN8A 2BK3A 5HR1A 4Z25A 4DSRA 5H5SA 4EUYA 3O3TA 5ECHB 2OLNA 4KH7A 4HEA2 1E1KA 4CNJA 3O6TA 2R5GA 4IVFA 4YTPA 3NIXA 1LU4A 2B9YA 1OC9B 3M13A 3UCLA 3U6VA 3ME7A 3ZFLA 2R0PA 3NZNA 1GRGA 4B65A 4N11A 2DJ1A 1MDKA 4YSHA 3DYRA 1QXHA 4AJ8A 4EDYA 1TRSA 3D4MA 2GQMA 2V6OA 2XVEA 3IHMA 4IA6A 2UZZA 2KLXA 1CJ3A 1M3IA 2MBSA 2WHDA 3SGLA 1V2AA 3H4KA 2BK5A 4UDRA 1O81A 5EPFA 4KNDA 1EBDA 4IELA 3P1WA 1X9WB 4MZBA 4NNJA 1V9WA 4FYBA 4JN9A 5EB5A 3APOA 3KPKA 2ARDA 4TR4A 3Q19A 3M3MA 4J36A 2H1GA 1EGRA 5KMQA 3I6DA 1L9DA 1SKRB 3GYJA 1S3BA 4ZL7A 4MPFA 3L4NA 3DMLA 5D9VA 3DH9A 3IK9A 1PBFA 4U2LA 4B64A 2DLXA 2PPTA 4MNNA 2HT9A 4JNAA 2WP9A 1GSQA 3HZ4A 5JCUA 1KNPA 4OMVA 1XWGA 4HS1A 1Y56A 3AEBA 1F2EA 3LXDA 1ST9A 4DGKA 3FKFA 3FW2A 3R9UA 3P8WA 3UOXA 3VPQA 1ERUA 1ILOA 1M2DA 2LJRA 5GSSA 1KDGA 3CNJA 3NYEA 5JCIA 5F07A 2LNTA 2V2GA 1BX9A 1M64A 2VZ2A 1M9AA 2EC4A 4DSQA 2BRYA 2VOCA 3UKLA 1SL1B 1UN2A 5B6MA 5IPHA 1XW6A 1WRYA 4LA1A 2X8GA 4WF4A 1BGJA 1A2MA 1R26A 4ZB9A 2YR4A 2LNSA 3UARA 2JKCA 3AECA 2C8UA 5B7CA 4QQ7A 5LD0A 4I58A 3ALMA 3VQRA 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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