4Z2UA

Crystal structure of 2-hydroxybiphenyl 3-monooxygenase r242q from pseudomonas azelaica
Total Genus 191
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
191
sequence length
581
structure length
563
Chain Sequence
AETDVLIVGAGPAGAMSATLLASLGIRSLMINRWRSTSPGPRSHIINQRTMEILRDIGLEESAKSLAVPKEYMGEHVYATSLAGEEFGRIPAWASHPQAHAEHELASPSRYCDLPQLYFEPMVVSEAALRGADVRFLTEYLGHVEDQDGVTARLLDHVSGAEYEVRAKYIIGADGAHSLVAQNAGLPFEGQMGIGDSGSINIEFSADLSSLCEHRKGDMYWMFVAALQMIRPWNKWICVWGYITKEEAKKIIHEIIGTDEIPVEVGPISTWTINQQYAVRNTSGRVFCMGDAVHRHTPMGGLGLNTSVQDAYNLAWKLALVLKGTAAPTLLDSYDAERSPVAKQIVERAFKSLSTFPPVFEALSLPPAPTESEMAEALVRLKDASEEGAKRRAALRKAMDATIIGLGGGHGVELNQRYVSRAVFPDGTPDPGFVRDQEFFYQASTRPGAHLPHVWLTENQRRISTLDLCGKGRFTLLTGLSGAAWKHEAEQVSQSLGIELKVCVIGPGQEFVDTYGEYAKISEIGESGALLVRPDMFIAFRAKDASREGLEQLNVAVKSILGR
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

publication title A crystal structure of 2-hydroxybiphenyl 3-monooxygenase with bound substrate provides insights into the enzymatic mechanism.
pubmed doi rcsb
source organism Pseudomonas nitroreducens hbp1
molecule tags Oxidoreductase
molecule keywords 2-hydroxybiphenyl-3-monooxygenase
total genus 191
structure length 563
sequence length 581
chains with identical sequence B
ec nomenclature ec 1.14.13.44: 2-hydroxybiphenyl 3-monooxygenase.
pdb deposition date 2015-03-30

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF01494 FAD_binding_3 FAD binding domain
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.30.120 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich Glutaredoxin Glutaredoxin 4z2uA03
3.50.50.60 Alpha Beta 3-Layer(bba) Sandwich FAD/NAD(P)-binding domain FAD/NAD(P)-binding domain 4z2uA01
2BS2A 2IVDA 3LZXA 4WCTA 3VRBA 3NRNA 4H4ZA 3FMWA 5EB4A 4YSHA 4FK1C 4J2WA 5FMHA 3M0OA 4H4YA 2BXRA 4XXGA 3UTEA 4A7AA 3IWAA 3P1WA 3S5WA 3P4QA 2YG7A 4DNAA 5EBKA 3DH9A 4ZCCA 2BK3A 1ZKQA 5HXIA 3GDNA 4ADWA 2GF3A 2TMDA 5JCKA 3ALMA 3GDPA 1JOAA 2V3AA 4OPIA 1GRFA 4A6NA 1TYPA 4B1BA 4X4JA 1GESA 1YQ3A 3K30A 3EPTA 4EMIA 3ICTA 2WQYA 5U25A 2YR6A 1B5QA 3AE9A 4K5SA 2WDRA 3QFAA 4I59A 2AAQA 4UDQA 3CN8A 4DSGA 3O0HA 3F8DA 3V3NA 1DJNA 1S3EA 3V76A 4Z2RA 4J31A 3NK1X 2AR8A 4A6NB 3C4NA 3NG7X 3DGHA 2YR5A 3DGZA 3EANA 4AT0A 1CC6A 3UTFA 2YG4A 1BF3A 3GMBA 3QSEA 4U8JA 2VRMA 2WOVA 4IV9A 1JRZA 5HY5A 1K4QA 2CVJA 4D04A 5BVAA 2YVGA 3BHFA 2CULA 1ZDLA 2YG5A 3GRTA 3ISHA 2WOWA 2C3DA 3CGEA 2YAUA 1DXLA 1E1MA 3QSSA 3FPZA 2GR0A 3CNJA 3UKQA 5KWFA 4KX6A 3RHAA 4U8OA 1F8WA 2A8XA 1MOKA 1CJ3A 4U2TA 3LXDA 4U8PA 2PYXA 4J56A 3K7TA 4I58A 2H88A 2OLOA 1ZOVA 2GVCA 3NN6X 3CGBA 4K22A 2GH5A 2R4EA 2B7SA 4B68A 2E1MA 1PBCA 4TM0A 4EM3A 4USQA 1NPXA 1M6IA 3UKFA 1Q9IA 4OPGA 3OC4A 1PBEA 3KVEA 4MJWA 4X9MA 1TDEA 4A65A 3CGCA 1TDOA 3URHA 5M0ZA 1QLBA 2XFUA 3SM8A 2QA1A 1D7YA 4Z44A 2CFYA 3RNMA 2RGOA 3AB1A 2X99A 2GR3A 1Y56A 3ATRA 4H4XA 3NN0X 2WPFA 1TDKA 2JB3A 2B9YA 2XFOA 4FX9A 1OJTA 5KRQA 4Y4LA 4EM4A 4NTDA 1ZY8A 2Q7VA 2Q0LA 2ZZCA 3CNTA 4AT2A 1W4XA 1E6EA 5JCIA 2GR1A 4BURA 5C3JA 2IIDA 4TLZA 1FEBA 1EBDA 3Q6JA 2WP9A 1D7LA 3ALJA 3BI5A 3NYEA 1K0LA 2VVMA 1GREA 1GOSA 1H81A 4H2PA 4ZCDA 2A89A 2O9ZA 2OA1A 1X31B 4J34A 3GD3A 1XDIA 4RG3A 3S61A 2DKIA 1IUXA 3V3OA 4X9NA 1GT8A 2C72A 3BI2A 4GR1A 2VVLG 4IVOB 4JY2A 3LB8A 4O5UA 3UCLA 3ZYXA 1GEUA 3UTGA 4YTMA 2OLNA 2B76A 2EQ9A 1MXTA 1RSGA 1NHPA 1EL9A 3REDA 5KVHA 4Z26A 2QCUA 2XLRA 1NHSA 3LOVA 2OALA 2E5VA 2BC1A 2XVEA 2C75A 3AEGA 3R9UA 1YKJA 2WP5A 2GQWA 3DA1A 3LZWA 2V60A 1KSSA 2WP6A 1KNRA 1Z6LA 2ZBWA 4HA6A 4YT0A 4APNA 1YQ4A 3C96A 2VRLA 4FK1A 4H4UA 4KPRA 2IVEA 4EMJA 2XLTA 3NNEA 3P4PA 1RP0A 2R46A 3UOZA 3UKAA 1VQWA 4CRTA 4CY6A 1ZOYA 3FG2P 4H4WA 3NLCA 3UKHA 1GPEA 2JAEA 2XVHA 5EOWA 2JB2A 3VRAA 2FJAA 4XWZA 4YSZA 3AEFA 4A9WA 3NTDA 4C3YA 4YKGA 3SQPA 5BRTA 3ZDNA 4YTNA 4YWOA 1E39A 1MO9A 4CY8A 1VG9A 1XHCA 3DJDA 1ZMCA 4JNQA 2WS3A 2WPCA 5KOWA 3I6DA 4DGKA 2ZZBA 3AEDA 1KSUA 2Y6QA 2WU5A 3AYLA 4ECHA 2GRTA 4K7ZA 1QJDA 4BV6A 1ZK7A 1D4CA 4H2QA 3D1CA 4OPLA 2YM2A 3AE3A 4IA6A 3RP7A 4LA1A 3AE1A 4U8NA 1PJ6A 4EQSA 2XDOA 3VR9A 3NHOX 3PO7A 5CQFA 3NT6A 3WE0A 1BGJA 3AEAA 1NHRA 2B7RA 2YLTA 4Z2UA 2FJDA 3ABVA 2C70A 4C5OA 4K5RA 4TM4A 1PHHA 1CF3A 3NTAA 4B69A 4UDPA 2Q0KA 4K8DA 3QJ4A 4N9XA 2Z5XA 4B66A 3II4A 3F8RA 4HB9A 2I0ZA 2XFNA 1CBOA 3AE4A 3UOXA 2XVIA 4H4VA 3JSKA 2E4GA 3GRSA 1OJAA 4DSHA 2V5ZA 1LVLA 1O94A 4TM1A 5FS8A 3UKPA 4CNKA 2EQ6A 4A79A 4B63A 4YSYA 2GQFA 3NIXA 3LJPA 4RSLA 4EQWA 4Z2TA 3GYIA 2GV8A 1H83A 4NEWA 5KOXA 3GMCA 2X50A 4H4SA 4H7UA 4U8MA 2J3NA 4H2NA 4JNAA 3GSIA 1CJ2A 3BHKA 1TRBA 2YLWA 1UKVG 2BS3A 1LQTA 1NG3A 4NZHA 1CJ4A 1DJQA 2EQ8A 2BYBA 2RGHA 3IHGA 3ADAB 5GRTA 1GRGA 4JQ9A 4BJZA 5IQ4A 4H50A 1BGNA 4RG4A 2WU2A 5TR3A 2R9ZA 2XVFA 3OZ2A 4J57A 1N4WA 1EL5A 2X8GA 5HHFA 2C66A 3CIRA 2BA9A 5KVIA 2YQUA 4OPCA 1LV0A 1K0IA 1CC2A 2YG6A 2GAGB 2BACA 4Z43A 4H4QA 4YXDA 2C76A 2YG3A 5L46A 1FCDA 1D5TA 4NTCA 4C3XA 2V6OA 5GSNA 3ITJA 1JRYA 2C3CA 4OPUA 1GXFA 2QAEA 3AEBA 3P9UA 3KLJA 3AE5A 4EQXA 3BI4A 2VQ7A 4B64A 4C77A 2B9WA 2BC0A 4BK2A 3B6DA 2A87A 3COXA 1CL0A 4BK3A 3QSMA 3DK4A 2RABA 3VQRA 3CTYA 1IUSA 3AD9B 1F3PA 4H4RA 1F8RA 4LIIA 4GDPA 4J33A 2FBWA 3G5QA 1PXAA 2WDVA 1S2QA 3UKLA 4PAAA 4JDRA 1GRAA 1GTEA 4U8KA 3PVCA 3KKJA 5IPYA 1LPFA 3EF6A 3GWDA 2GEWA 4C74A 1L0VA 1GRHA 5FS6A 3UP4A 4P9SA 4H4TA 1KFYA 2R45A 3H8LA 5BULA 1AOGA 2Z5YA 2WHDA 2ZZ0A 5C2TA 3P4RA 4GRTA 1D4DA 1NAAA 1NENA 2BXSA 2B9XA 4AOSA 3CPJG 4TM3A 3H4KA 4U8LA 1NDAA 3NKSA 1B37A 3AE2A 4WX1A 5EB5A 5J60A 2FJBA 4BJYA 4BK1A 1SEZA 4CCQA 4U2LA 4EIQA 3UOYA 4YKFA 3G5RA 2XLUA 4U8IA 4GDEA 2GR2A 1F6MA 3AYJA 1JNZA 2WPEA 1PJ7A 3AECA 5HYMA 3P4SA 1XANA 1ZP0A 4NEVA 3NK2X 1PJ5A 2V61A 1OJ9A 4M52A 2Q6UA 3AYIA 2XFPA 3VR8A 4D03A 1H86A 3E1TA 2R0CA 2WEUA 4H4PA 1JU2A 1CC4A 4ICYA 1GNDA 3ICRA 4CNJA 1H7XA 2WOIA 1CHUA 2YLRA 2YWLA 2RGJA 3FIMB 2NVKX 4REKA 2XLSA 4A5LA 4JN9A 1JNRA 3SFDA 5FS7A 3DK9A 1PN0A 1XPQA 1ONFA 4UDRA 3KD9A 4AP3A 2VQBA 3KA7A 3G5SA 3NYCA 1PBDA 1FECA 2CDUA 3UKKA 1IUVA 3D8XA 4Z24A 2R4JA 3AD7B 2BABA 5JCMA 2DKHA 1BKWA 1E1NA 5JCLA 1DODA 2QA2A 1PBFA 1Y0PA 2XYOA 3HZLA 5DBJA 3SGLA 1L9EA 5FS9A 2VZ2A 1GTHA 2ACZA 2F5ZA 1N1PA 3ICSA 1E1KA 2R0GA 4EQRA 4AOXA 3LADA 3DJEA 2W0HA 3K7QX 4CCRA 4EMWA 5JCNA 3K7MX 3GWFA 2FJEA 3H8IA 2BK5A 1COYA 3BNUA 4OPTA 1RYIA 1GETA 2C73A 3ALLA 1O95A 5M10A 1DNCA 2BCGG 2YM1A 2TPRA 3CGDA 5CKUA 3KU9A 4NTEA 4FDCB 1BWCA 1OJDA 1GRTA 4UP3A 2XCGA 3IC9A 5ER0A 1Y56B 1JEHA 4YTPA 2PHHA 1GRBA 4O5QA 2NPXA 3AD8B 1L9DA 3F8PA 4U2SA 1LJ1A 3QFBA 3VRDB 3CPIG 3NGCX 1H82A 3NK0X 4LU6A 4Y4NA 4YSXA 1GSNA 3CNPA 2C67A 4AP1A 2XLPA 4Z25A 3ATQA 3BNMA 3T37A 2JB1A 1JRXA 1KNPA 1M64A 2YR4A 3FBSA 2VOUA 3L8KA 1TDNA 1EL7A 2YLZA 2YVJA 4GCMA 4IVMB 4XWRA 1IUUA 1YY5A 1GALA 2GMJA 2YLXA 3AE8A 2V3BA 3GD4A 3L1RA 1E1LA 4GF7A 4OPDA 4PABA 4A99A 3CPHG 5BUKA 3NH3X 1BZLA 2VVLA 3DK8A 1L9CA 3QVPA 1Q1RA 4TLXA 1O5WA 3QVRA 2YVFA 3UOVA 3AE6A 3PS9A 1IJHA 1P2EA 3SFEA 3NYFA 1KF6A 2X3NA 1F8SA 4IA5A 1PBBA 1PS9A 4OCGA 1ZMDA 1LQUA 3EAOA 4E0VA 3UP5A 1P2HA 4CBQA 1Q1WA 3AXBA 4ZN0A 1FOHA 2GB0A 1D4EA 1TYTA 1K0JA 2APGA 2YLSA 1IUWA 2WESA 1E7PA 4OVIA 1S2YA 1S3BA 2BK4A 5U1OA 1VG0A 1H7WA 1KDGA 1NG4A 2JBVA 1IUTA 3CNSA 5KXJA 5LV9A 3DJJA 4K2XA 2HQMA 3IHMA 2AQJA 4J36A 2Y6RA 4B65A 3I3LA 2GAHB 3DMEA 4B67A 2ARDA 2JK6A 2XFQA 3DJGX 2BS4A 3M13A 1CJCA 3IF9A 2JKCA 2EQ7A 1ELIA 1H6VA 1VRQB 2BCPA 1VDCA 2WETA 5U63A 2C7GA 1REOA 1DOEA 3AEEA 1NEKA 3UTHA 2R0PA 2C64A 4H2RA 3RP6A 1B4VA 4Y4MA 1YQZA 1GV4A 1N4VA 1PDHA 3B3RA 4EIPA 2X8CA 3GYJA 3AE7A 3AWIA 1B8SA 2WBAA 2XVJA 1EL8A 1PXCA 3M12A 5IQ1A 4GUVA 2X8HA 2UZZA 1ZX9A 2WDQA 3KPFA 1NHQA 1FL2A 2GMHA 1QO8A 1OJCA 1TDFA 1GERA 2H89A 1N4UA 4JY3A 1LTXR 1V59A 5J7XA 2C65A 2OAMA 1DOCA 1FEAA 3Q9TA 4USRA 1HYUA 3C4AA 1H84A 3RP8A 3CNDA 1DOBA 1PXBA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
1SYRA 4TR0A 1TDIA 3ERFA 4RI6A 3D5JA 3FMWA 4OFNA 2FGXA 5EB4A 4J2WA 5IIZA 4H4YA 3FKFA 3VK9A 2PWJA 3EE2A 2VCXA 4ADWA 4KW6A 5DCHA 2H0GA 2TMDA 4V2MA 3CSHA 1U88A 3GDPA 1JOAA 1FG4A 2C1YA 2MMOA 3KIJA 4WKWA 1GRFA 4L0WA 1PSQA 3A5WA 2MMNA 4I2TA 4EMIA 3ICTA 2WQYA 2YR6A 2P5RA 1B5QA 3L78A 3AE9A 2WDRA 5CO3A 3TKSA 4EVMA 2LSTA 2FWEA 3CN8A 4IJIA 1SL0B 3O0HA 2LJRA 2A2SA 3F8DA 4OCEA 3V76A 2E2GA 1GNEA 1X5DA 2VLVA 3EU4A 1JHBA 3C4NA 2WFCA 4AT0A 1CC6A 3GMBA 2H76A 3QSEA 4JR4A 1V57A 3BHFA 2CULA 5DQSA 2YG5A 2WOWA 3CGEA 5IO0A 2YAUA 3QSSA 5KWFA 3T2KA 3TGZA 3ZMLA 3ZZXA 2HRNA 2A8XA 1ZMAA 4BL7A 5HQPA 4ISDA 4I58A 1X5CA 2AB6A 1PMTA 1ZOVA 3NN6X 3CGBA 2R4EA 1EP8A 1PBCA 4TM0A 2C3QA 2N5BA 3QAGA 1Z3EA 4YQMA 4D73B 1NPXA 4OPGA 3OC4A 4A65A 1TDOA 5M0ZA 2CVDA 2YOIA 4Z44A 3U5RE 4XRDA 3NN0X 1TDKA 2YWMA 2KUCA 3FZ5A 3EINA 2OA7A 3DRNA 4EM4A 4NTDA 1ZY8A 3TUEA 2Q0LA 3CNTA 4AT2A 5JCIA 2FHEA 1RW1A 5C3JA 1HNAA 1QMVA 4LLRA 2WP9A 1XVQA 3VWXA 1R5AA 4JR6A 5D73A 4H2PA 4MH2A 3APSA 2O9ZA 4J34A 4I97A 1M2DA 3G9BA 1GT8A 1M2AA 2C72A 4IVOB 5D93A 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2C66A 2BA9A 1GUHA 5CNWA 4OPCA 1LV0A 2YG6A 2GAGB 1SK0A 4MK3A 3A2WA 3RAZA 1D5TA 2GSRA 2V6OA 5DAKA 1A0RP 1AQXA 2EC4A 3H8QA 4K9ZA 3IBHA 1XG8A 5DDLA 4GWRA 2QAEA 3G7JA 2VUPA 5KN3A 3F8UA 3BI4A 2I81A 1WOUA 2C3NA 5KN2A 1XOBA 2A4VA 2E2MA 3COXA 3I6AA 4TR4A 2RABA 3HHVA 2IN3A 2JSZA 2K9FA 4GSTA 1F8RA 1GH2A 2H0IA 3KJYA 5KEJA 2CAIA 4JDRA 4PAAA 1V58A 2EIOA 5IPYA 4C74A 1ZGNA 1LU4A 4GLTA 3C8EA 1FB6A 3IC8A 4PURA 2LEGA 2I1UA 2IJYA 3V1WA 1XIYA 3KD0A 1AOGA 2HE3A 2ZZ0A 3KH9A 5C2TA 4GRTA 4KAEA 3CPJG 5KMSA 2NPBA 3T0KA 3ZIVA 3VI7A 3Q74A 3WGXA 5EB5A 3JCML 2GQMA 1SEZA 4QL9A 4EIQA 4PUAA 4TOPA 2JZTA 4YKFA 1SJIA 4U8IA 5JWRB 2GR2A 4TW5A 4PUFC 3CSIA 3K8NA 1XANA 4V2LA 1ZP0A 1QUWA 4KGIA 4G9KA 4NEVA 3NK2X 5G1KA 2VM2A 5GAPD 3CRUA 2HSHA 4M52A 2YWOA 2XFPA 2XBIA 3VR8A 3E1TA 4A5PA 1O6JA 4G0IA 3UMAA 1QFNA 3O76A 5IO2A 2WOIA 2HSYA 3GTUA 4REKA 2XLSA 2GSTA 2K18A 2NVLA 2HRAA 4UDRA 1G6WA 1JZWA 1VF2A 1YEPA 3G5SA 2CDUA 1IUVA 1KNGA 2R4JA 2DKHA 2GSQA 1E1NA 5JCLA 2VM1A 3HZLA 4MF5A 4BA7A 5FS9A 3HZ4A 2ACZA 4OMVA 1E1KA 1V40A 1TOFA 2W0HA 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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