4Z2UA

Crystal structure of 2-hydroxybiphenyl 3-monooxygenase r242q from pseudomonas azelaica
Total Genus 191
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
191
sequence length
581
structure length
563
Chain Sequence
AETDVLIVGAGPAGAMSATLLASLGIRSLMINRWRSTSPGPRSHIINQRTMEILRDIGLEESAKSLAVPKEYMGEHVYATSLAGEEFGRIPAWASHPQAHAEHELASPSRYCDLPQLYFEPMVVSEAALRGADVRFLTEYLGHVEDQDGVTARLLDHVSGAEYEVRAKYIIGADGAHSLVAQNAGLPFEGQMGIGDSGSINIEFSADLSSLCEHRKGDMYWMFVAALQMIRPWNKWICVWGYITKEEAKKIIHEIIGTDEIPVEVGPISTWTINQQYAVRNTSGRVFCMGDAVHRHTPMGGLGLNTSVQDAYNLAWKLALVLKGTAAPTLLDSYDAERSPVAKQIVERAFKSLSTFPPVFEALSLPPAPTESEMAEALVRLKDASEEGAKRRAALRKAMDATIIGLGGGHGVELNQRYVSRAVFPDGTPDPGFVRDQEFFYQASTRPGAHLPHVWLTENQRRISTLDLCGKGRFTLLTGLSGAAWKHEAEQVSQSLGIELKVCVIGPGQEFVDTYGEYAKISEIGESGALLVRPDMFIAFRAKDASREGLEQLNVAVKSILGR
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
molecule tags Oxidoreductase
source organism Pseudomonas nitroreducens hbp1
publication title A crystal structure of 2-hydroxybiphenyl 3-monooxygenase with bound substrate provides insights into the enzymatic mechanism.
pubmed doi rcsb
molecule keywords 2-hydroxybiphenyl-3-monooxygenase
total genus 191
structure length 563
sequence length 581
chains with identical sequence B
ec nomenclature ec 1.14.13.44: 2-hydroxybiphenyl 3-monooxygenase.
pdb deposition date 2015-03-30

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF01494 FAD_binding_3 FAD binding domain
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.30.120 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich Glutaredoxin Glutaredoxin 4z2uA03
3.50.50.60 Alpha Beta 3-Layer(bba) Sandwich FAD/NAD(P)-binding domain FAD/NAD(P)-binding domain 4z2uA01
4Y4NA 4AOSA 2GVCA 4M52A 2BYBA 4WCTA 1CJ2A 1FEBA 3S5WA 4CY6A 2R9ZA 2RGOA 3CNTA 4CY8A 5FS8A 5HXIA 2JAEA 3T37A 4H4QA 1MO9A 1VRQB 4U2LA 1B4VA 2Q0KA 4B67A 3GMCA 1CJ3A 2YG6A 1Y0PA 1H6VA 2B7RA 5C3JA 1RYIA 1ZK7A 2JB2A 5EB5A 4N9XA 2XFNA 1GERA 4OPIA 1GV4A 1HYUA 4TM1A 3ICTA 5CQFA 2BCGG 3NK1X 2WOWA 2XYOA 2YWLA 3PVCA 3KVEA 3SFEA 3V3NA 3NN6X 3ZYXA 1VG0A 2BK3A 2YVJA 1PXAA 3DMEA 1VDCA 4H4WA 2QA2A 2B9YA 1XPQA 1OJDA 2Z5YA 3FPZA 1REOA 2BA9A 3ALMA 1CHUA 2GAHB 3P4RA 5JCIA 3AWIA 1K0JA 4H4ZA 4AP1A 1M6IA 3NT6A 4EQWA 4AT0A 4J2WA 3GRSA 1H7XA 3Q9TA 1GRFA 3H4KA 4J31A 2WHDA 4USQA 3VRDB 1L9EA 3P4QA 3IC9A 4A99A 1EL8A 3ATQA 2XLTA 2QAEA 2GR1A 1H84A 3BI5A 1GRTA 4H4YA 2WP5A 4USRA 3VQRA 5J7XA 2W0HA 2Q0LA 2XVJA 1EL9A 2VVLG 3I6DA 5IPYA 2F5ZA 4RSLA 2H89A 4H2RA 2ZZBA 4YSXA 2C72A 3ISHA 3GD3A 2R4JA 1M64A 5JCKA 2GB0A 5ER0A 3UTFA 1GRAA 2OAMA 4ZN0A 1F8RA 4JY3A 5C2TA 4FK1A 1GRHA 1E39A 4XWZA 1IUXA 2ZBWA 3KLJA 2ZZ0A 1GSNA 3C4NA 3KA7A 5M0ZA 4B64A 3DJJA 5KVIA 4I59A 1S2YA 2YG3A 2YM1A 3DJEA 1H83A 1S3BA 5U63A 2R45A 2YVGA 4GDPA 1F6MA 5M10A 4X9MA 3VRBA 2AQJA 1ZP0A 2HQMA 2V5ZA 2XVFA 1KSSA 1D7YA 3UTHA 3BNMA 2YLRA 4D03A 1PXCA 2WESA 1DNCA 3UKLA 2FJBA 4DGKA 1Y56B 4IV9A 2Q6UA 1F8SA 1FEAA 3K7QX 5LV9A 1EL5A 2E4GA 2WDQA 1VQWA 4H4XA 4H2PA 1PJ7A 2TPRA 4PABA 4U2TA 1JNRA 3LOVA 2YG7A 4UDRA 1NHSA 1S2QA 3GDPA 2GR2A 3NKSA 5L46A 3II4A 5GSNA 1LQUA 4B69A 1DOCA 2BACA 1IUTA 2YLWA 2X8GA 4TLZA 5IQ1A 2Q7VA 2X8CA 5FS6A 3KPFA 4H50A 4FX9A 3K7MX 4D04A 1GRBA 2V6OA 2YR5A 1QLBA 1YQ3A 5KOWA 2BS4A 1Q9IA 2VVMA 4CNKA 1D4CA 2B9XA 1BF3A 2C75A 3FIMB 4FK1C 1KDGA 2WDVA 5KOXA 3G5SA 4YSZA 4H4TA 5EB4A 3NK2X 1YQZA 4NTCA 1E7PA 1N4UA 5KVHA 3E1TA 3GDNA 3URHA 4O5QA 2GEWA 2DKHA 1CL0A 1E6EA 2FJAA 1KFYA 2IVEA 1PS9A 2ARDA 4GDEA 3R9UA 2IIDA 3K7TA 3L8KA 4B1BA 4C74A 1N1PA 1ELIA 2I0ZA 1DOEA 3DGZA 3ATRA 2Z5XA 4Y4MA 4YT0A 1B37A 1OJTA 1PBCA 2BC1A 2JKCA 4HB9A 3AE6A 2NPXA 1TDEA 1ZOVA 3NTAA 2XFUA 4U8PA 3QVPA 3UOXA 4ECHA 4JY2A 1TYTA 3AB1A 2OLNA 3LADA 1NG3A 2XFOA 5HY5A 4GRTA 4I58A 1PBDA 1KF6A 2C70A 1NAAA 2VRMA 2XLPA 1BGJA 2XVEA 3AE2A 4H4UA 3B3RA 5JCMA 3AE9A 2C3DA 3KKJA 2YVFA 4DSGA 4CBQA 1D5TA 3CNPA 2E5VA 4CCQA 3AYJA 3KD9A 5JCLA 2WBAA 2YLTA 3NH3X 2YLSA 3DK9A 2GRTA 4Z44A 1GREA 1CJ4A 2WDRA 3UP4A 3FBSA 1LPFA 1GTHA 1CC2A 1BWCA 1E1MA 4IVOB 4K8DA 3I3LA 3NIXA 4K7ZA 4EMWA 2BXSA 4C77A 4K5SA 3L1RA 2B7SA 3QJ4A 4FDCB 4AOXA 1OJ9A 3S61A 5KXJA 1IJHA 2EQ6A 2RGHA 3BHFA 2ZZCA 1PJ6A 4WX1A 1LJ1A 1TDNA 4Z2UA 1O94A 3D8XA 4UP3A 2B9WA 1E1NA 3ALLA 1GETA 1LVLA 5CKUA 2V60A 3F8RA 2V3BA 2IVDA 3IHGA 2A89A 1ZY8A 1DOBA 4Z25A 2JK6A 1CC4A 3LZXA 1K4QA 4ADWA 4YXDA 3AECA 1YKJA 3NTDA 2OLOA 4C3YA 5EBKA 4BJYA 1X31B 4OPGA 1XDIA 3KU9A 4H2NA 1GT8A 1BZLA 1PBFA 3P4SA 4DNAA 3H8IA 5KRQA 2BS3A 2C7GA 3UOYA 4A6NB 3F8PA 3FMWA 3M12A 1ZKQA 2RABA 2BK5A 5KWFA 2GMHA 1KNRA 1PDHA 1E1LA 3NNEA 4UDPA 1OJCA 4Z43A 2PYXA 3CNJA 4AT2A 2JB1A 2YLZA 1RP0A 5U1OA 1OJAA 1Y56A 3QSSA 4YTMA 3SQPA 2YM2A 2WS3A 1IUSA 3C4AA 1QJDA 5HYMA 1Q1RA 2PHHA 4O5UA 2YQUA 2VVLA 3GYIA 4A79A 3ALJA 4DSHA 3JSKA 2C73A 2WU5A 3EF6A 1F8WA 2H88A 5FS9A 2Y6QA 3COXA 4KX6A 2GR3A 3WE0A 4J36A 1IUWA 1RSGA 4C3XA 1Z6LA 4TM3A 3P4PA 1O95A 1ONFA 2A8XA 3UP5A 1IUUA 1B8SA 1YY5A 1JOAA 1S3EA 3IHMA 3LJPA 1DJNA 4IA5A 4YSHA 3EANA 3UKHA 4H4PA 1N4WA 2CVJA 3PO7A 3UCLA 1JEHA 1XHCA 2WOVA 4YKGA 4CNJA 1COYA 3NYFA 5BUKA 2WPCA 4EQRA 1EBDA 1D4DA 1LQTA 3LXDA 2WETA 2FJEA 3GWDA 4J57A 1LV0A 3LB8A 2JBVA 3BI2A 1NHPA 1K0LA 2X99A 3CGBA 1MXTA 3ICSA 4AP3A 1ZMCA 3Q6JA 1YQ4A 5TR3A 2J3NA 2GAGB 2VOUA 2GR0A 3AE4A 2YR6A 3UKFA 2VZ2A 5FMHA 2XLUA 4BURA 2X3NA 4JDRA 5BVAA 3AEEA 2VQ7A 2WP9A 2XFQA 1PHHA 2YG4A 1V59A 2WPFA 3CTYA 4Z2TA 4NTEA 4BJZA 3P1WA 2C3CA 2CULA 3SFDA 1MOKA 4A65A 3HZLA 4BK3A 3UKQA 3P9UA 1GALA 4TM0A 1DJQA 2R4EA 3UOVA 3B6DA 3IF9A 1W4XA 4J56A 3H8LA 3OC4A 4OPCA 2C64A 3DK8A 1DODA 3GMBA 3ICRA 3VR9A 1NENA 1TYPA 3AEBA 4LIIA 3DK4A 1DXLA 1PN0A 1UKVG 1B5QA 4E0VA 2GQFA 2WOIA 1P2HA 4YWOA 3ZDNA 4Z26A 4REKA 2C66A 4ZCCA 2XLSA 5BULA 4B63A 2BS2A 3NHOX 2XLRA 4IVMB 1JRYA 3CNSA 4U8JA 2DKIA 2XFPA 3NK0X 4RG3A 4YKFA 2OALA 3AE5A 4Z24A 2XCGA 4OCGA 2JB3A 3V76A 1CBOA 4CRTA 3QFBA 1NDAA 4H4SA 2CFYA 4NEWA 2O9ZA 3AEAA 3REDA 1FL2A 2E1MA 2XDOA 3D1CA 3AD9B 1L9CA 4H7UA 4KPRA 1JU2A 3GSIA 4U8OA 4U8NA 3LZWA 1F3PA 2X8HA 1D4EA 4BV6A 3SGLA 2XVHA 1AOGA 2GV8A 1ZMDA 4XWRA 3AEDA 1JRXA 4A7AA 1CF3A 4A6NA 5JCNA 4J33A 1FECA 1O5WA 3QSMA 3DJGX 2AR8A 5DBJA 3GWFA 2EQ7A 3NGCX 5EOWA 3UOZA 3AE8A 3CPHG 4J34A 3M0OA 1H81A 2V3AA 3NYCA 4NZHA 3VR8A 3AE7A 5J60A 5GRTA 2B76A 2EQ9A 1NG4A 4NEVA 2X50A 4TM4A 4XXGA 1XANA 4EIPA 4HA6A 3EAOA 3UKKA 1K0IA 1Q1WA 2R46A 3SM8A 4C5OA 4B65A 1ZX9A 3GRTA 2BK4A 4JNQA 4OPTA 2XVIA 4OPDA 2C67A 2Y6RA 1BKWA 1P2EA 2YAUA 1PXBA 2APGA 4U8IA 1TDKA 4PAAA 3CPIG 3NG7X 3RHAA 2C76A 3AD8B 3CN8A 3QFAA 1GESA 3BHKA 2FBWA 2WPEA 3DGHA 3DA1A 4GCMA 2CDUA 3RNMA 3O0HA 3V3OA 4APNA 2WQYA 3AYLA 3DJDA 5BRTA 1NHRA 4ZCDA 1GXFA 3CPJG 3FG2P 2WP6A 4Z2RA 2BCPA 1GTEA 3AEGA 2UZZA 3C96A 4B68A 3K30A 1CC6A 4EQSA 4H2QA 3OZ2A 3VRAA 4X4JA 3ADAB 3RP6A 4EMIA 1FCDA 1QO8A 1H86A 3UKPA 4EQXA 4CCRA 2GMJA 5U25A 1H7WA 3PS9A 3AE1A 4NTDA 2R0PA 3DH9A 5IQ4A 1ZOYA 4BK1A 1CJCA 2C65A 3ABVA 4JN9A 1L0VA 3F8DA 4B66A 4H4RA 1ZDLA 4EIQA 2VRLA 4U8MA 3UKAA 1L9DA 3BI4A 2R0CA 4RG4A 2RGJA 4K2XA 1PJ5A 3QVRA 2BABA 3AE3A 4LU6A 3QSEA 3AD7B 2V61A 4P9SA 3RP8A 1NPXA 1NEKA 1TDFA 2FJDA 2QCUA 1LTXR 3G5QA 4JNAA 2TMDA 4JQ9A 1GEUA 2A87A 1E1KA 4U2SA 1GNDA 1GPEA 2YR4A 4UDQA 1GRGA 1PBBA 2WU2A 4YTNA 2BC0A 4A5LA 1IUVA 2QA1A 3CGCA 1JNZA 1EL7A 2GQWA 1VG9A 1NHQA 4A9WA 4OVIA 3UTEA 4EM4A 4GR1A 3UTGA 1PBEA 4MJWA 3GD4A 4U8LA 2WEUA 2YLXA 3NN0X 3G5RA 2AAQA 3CIRA 3GYJA 1GOSA 4K5RA 3M13A 4BK2A 1KNPA 3ITJA 2EQ8A 1JRZA 4H4VA 1KSUA 1SEZA 3NRNA 2R0GA 1N4VA 4YSYA 4ICYA 5HHFA 3AEFA 3AXBA 4X9NA 3CGDA 4LA1A 4EM3A 2NVKX 3EPTA 4GF7A 4GUVA 4K22A 2BXRA 2GH5A 1D7LA 3NLCA 2ACZA 2YG5A 4OPLA 3CGEA 2GF3A 4U8KA 1BGNA 1H82A 3CNDA 4Y4LA 5FS7A 3AYIA 1TRBA 1TDOA 1FOHA 4OPUA 4YTPA 4TLXA 2OA1A 2VQBA 4EMJA 4IA6A 3RP7A 3IWAA 3NYEA 3BNUA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
1FW1A 4AOSA 4GCIA 5CRGA 2BYBA 1EV4A 1QUWA 1CJ2A 4J56E 3CNTA 5FS8A 1XWKA 3ZVJA 1VRQB 4U2LA 1B4VA 3GMCA 1WWJA 4JBBA 5EB5A 4IJIA 4N9XA 1YZXA 3M3MA 3O3TA 4TM1A 3ICTA 2BCGG 2WOWA 3FK8A 3PVCA 3EMXA 5E4WA 3NZNA 4D73A 2BK3A 2MMZA 1N2AA 4LMVA 3DMEA 3HZ8A 1VDCA 2J9HA 3M9JA 5KNLA 4FIWA 1REOA 2LNSA 4HUAA 22GSA 1F3AA 2H6XA 2RUEA 2WJUA 5JCIA 3HD5A 2JACA 5IMZA 4H4ZA 1XWCA 4XS4B 4IKHA 1TDIA 1K3LA 1ZCPA 4J2WA 3Q9TA 2DIZA 5GAND 4USQA 2WHDA 1L9EA 2PMTA 1S3AA 3IC9A 1LBKA 7GSSA 1V9WA 1EL8A 3F3QA 3LJRA 1M9AA 4USRA 5JCGA 3KH7A 1NHOA 2GZPA 2HT9A 2Q0LA 1ERTA 2VVLG 2JZSA 3ISHA 1NHYA 3SYIA 5JCKA 3WGDA 2DMLA 1F8RA 4KB3A 4K7NA 3DYRA 4MMMA 2ZBWA 2EIQA 4MNNA 3ZFBA 1GSNA 3KA7A 5HFKA 4JR6A 2VL2A 4NWZA 4ZXGA 5U63A 2R45A 4USSA 4GDPA 2OA7A 1W4VA 1ZP0A 4LL4B 2V5ZA 2B5YA 4EXJA 3QAGA 1PXCA 4DGKA 1Y56B 5LV9A 5KEJA 4ZBAA 1EL5A 2WDQA 4G6HA 4KCAA 4IP6A 2H0HA 4H2PA 4H4XA 5CAXA 2DMMA 5FHIA 4ZL9A 2FGXA 3CBUA 4Z7XA 3TJGA 1B4QA 3II4A 2FNOA 2Q7VA 2X8CA 2M46A 1PN9A 1GRXA 2KOKA 5KOWA 2BS4A 1BYEA 2CA8A 3FIMB 5F07A 1IYIA 3HHVA 2WDVA 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chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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