4MJAA

Synechocystis sp. pcc 6803 glutaredoxin a-a75i
Total Genus 30
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
30
sequence length
99
structure length
99
Chain Sequence
MRGSHHHHHHGSAVSAKIEIYTWSTCPFCMRALALLKRKGVEFQEYCIDGDNEAREAMAARANGKRSLPQIFIDDQHIGGCDDIYILDGAGKLDPLLHS
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
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molecule tags Electron transport
molecule keywords Probable glutaredoxin ssr2061
publication title Utility of Synechocystis sp. PCC 6803 glutaredoxin A as a platform to study high-resolution mutagenesis of proteins.
pubmed doi rcsb
source organism Synechocystis sp.
total genus 30
structure length 99
sequence length 99
ec nomenclature
pdb deposition date 2013-09-03

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00462 Glutaredoxin Glutaredoxin
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.30.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich Glutaredoxin Glutaredoxin 4mjaA01
1ZYQB 2DJ3A 4ZBDA 4N0ZA 2I9HA 4HZ4A 5ECOB 4TXOB 5D9WA 4V1Ap 1EEMA 4NWYA 3ZFBA 2DIZA 3E9JB 4DSSA 1B4QA 2V6OA 4AJ8A 4K7IA 3UOMA 4F2IA 4I2TA 3FZ4A 3QOUA 4HI7A 2ZNMA 4P3YB 4N10A 2I1UA 5GAND 1HNBA 3BCKA 5IPGA 1KNGA 1YEXA 2JSYA 1PX7A 5KN0A 1X5EA 5ABRA 1ZL9A 2VO4A 2WCIA 4G10A 2G0FA 1M2AA 3Q74A 1VF4A 3TRPA 3BBYA 4K0NA 1JLVA 3P7XA 2LJKA 3LXTA 1B4PA 4XS4B 3UBKA 2N5BA 1G6YA 3G7YA 4FO5A 1MEKA 1M9BA 2XPEA 2MMOA 3RPPA 4GSNA 3DVWA 3DMLA 2F9SA 4MH3A 1VF2A 2OKAA 5EPFA 5ECMB 3CSHA 4GQFA 1TK8B 5A5KA 2VCZA 1EV4A 1X0RA 1TOFA 4ZBAA 3GTUA 2VLTA 3LYPA 1R7HA 1YJ6A 2GQMA 4POLA 3F4RA 2FGXA 3APQA 3EMXA 4DSQA 4LLRA 1E2YA 1EP8A 4PURA 1F2EA 3Q18A 4L5LA 4IP1A 2IJYA 2GZYA 2FWHA 1J08A 1XWAA 1Z7PA 3FW2A 3ZMLA 2PWJA 2A2SA 3WGDA 3TJFA 4MCUA 3ZIJA 4L8EA 2VL3A 5LCZA 2CX3A 2H72A 6GSWA 1SYXA 1V9WA 4HQSA 2CVBA 3HYPA 3GKNA 4HJ2A 3GRXA 1EEJA 3DGQA 2OBKA 2GT5A 5JWQB 1SK1A 1O85A 1GUKA 1ON4A 2H71A 4TR4A 1OC8A 1TW9A 1LJRA 2H66A 4JR6A 2WB9A 1TI1A 4PXOA 2NPBA 1MDJA 2WJUA 2NDOA 3IK7A 3I69A 3W8JA 3I43A 4PNFA 3ME8A 4NV2A 5G1LA 3DIEA 1XW6A 1T1VA 1N2AA 4RQXA 4EDYA 3DVXA 4IQAA 4ZB8A 3TKSC 5LNKe 1USBA 1AQVA 1A8LA 16GSA 1O7UA 4IGJA 4MZBA 3GSTA 1GTAA 1GULA 4H86A 4KDUA 1K3YA 5ECHB 3DKSA 1Y25A 3PGTA 2LJRA 3GYKA 2VUPA 2KP2A 2IMDA 3HJMA 3EE2A 2B3SA 2YPMA 5G2ZA 3WD6A 1MTCA 2G2QA 1AQWA 1EV9A 1GTBA 1WE0A 4TOPA 3W6GA 3ERFA 3LJRA 1WP0A 3OR5A 1MD4A 1XW9A 1R4WA 2FLSA 3QAWA 4LL1B 4XS6A 4JR4A 3HD5A 4BWQA 1OC9A 2PBJA 2H73A 6GSVA 2K8VA 3GTUB 4V2NA 3KH7A 1EZKA 4J57E 2MMNA 3S9FA 2O89A 3HDCA 1OKDA 2B5XA 2C4JA 2V32A 3IBHA 1TRVA 1MDIA 3C73A 2ALBA 2KP1A 3O76A 4YQVA 1YKCA 5G31A 5ECNB 5DJLA 2H70A 2L6DA 1WMJA 3FZ5A 2YCDA 5FT3A 4CW9A 2E2MA 2X8CA 2DMLA 2HZFA 5G1KA 4ACSA 3TKSE 1UC7A 4KA0A 2B7KA 1SKWB 4L5OA 2MYGA 4MABA 19GSA 4IN0A 3O3TA 4ZXGA 1LBKA 4RI7A 5IO0A 2JSZA 2H6XA 5AN1A 4V2LA 3TKSA 1S3DA 2R5GA 3VI5A 5CRDA 1SENA 1FVJA 3M9JA 2MBSA 2PN8A 4EUYA 2NTOA 20GSA 3TRXA 4EDZA 1GWCA 5KEJA 3J7Yk 1QXHA 1SJIA 2WDUA 5DAKB 3DRNA 10GSA 1RQMA 4YQMA 2OACA 5IO2A 2HZEA 1OC3A 1Q98A 4MF6A 3GKMA 5D93A 5IOWA 1GLQA 4OCEA 2H1DA 2AUVA 18GSA 1U3IA 1V2AA 4ZL8A 3SBCA 4X43A 1ERUA 3FZ9A 4IHUA 3TGZA 2P5RA 5F05A 4K7OA 4TRXA 1BG5A 1BEDA 2MMZA 1ML6A 3ZMKA 1RW1A 3IHQA 4XHMA 2LNSA 3IK9A 2MBTA 4O32A 1I5GA 3NOFA 13GSA 4ID0A 2X64A 4NXIA 4IKHA 1TK5B 2L57A 4GSSA 2CV4A 6GSUA 1X9SB 3GV1A 2YJHA 1QUWA 2HT9A 3I6AA 4TXOA 4WKWA 5IOXA 1HYUA 5H5SA 2AYTA 4FH8A 1XBSA 1KTEA 2F51A 3FR6A 3FY7A 4OO5A 1PX6A 3TJBA 2LRCA 3IXRA 3ZLPA 3TCOA 4G19A 4DVCA 2YV7A 1XVWA 4F03A 2VM1A 4TVEA 2VCWA 5KN2A 2V41A 4CDOA 2E7PA 4XRDA 4ECBA 4I8BA 3ISOA 1V57A 3E0UA 4IELA 4ECIA 4MZCA 1CQHA 3ERGA 4GSTA 4K1FA 2K8SA 4XS4A 5IMVA 1YZXA 2GGTA 4DSRA 5CRHA 2DJ2A 4K6XA 4F0CA 2VM2A 3UAPA 2FA8A 2PU9C 2LKUA 2FHEA 2L4QA 1WIKA 4HU9A 4HZ2A 1Y6EA 4I5QA 1K0CA 4K8MA 3C7MA 1J9BA 1FO5A 5IM9A 5ID2B 1O6JA 5E4WA 3KXOA 4HS1A 3DD3A 3Q19A 2JL4A 3KIJA 2PGTA 1GRXA 3RAZA 2LJAA 2IMFA 2FNOA 3KM6A 5AGYA 4YAVA 3QAVA 1AQXA 4MK3A 1C72A 2REMA 3KEBA 5DALB 1GSQA 3C71A 4NHZA 3C1RA 4JEDA 3ZVJA 3HXSA 1K3LA 3R2QA 1VF1A 1OAZA 2I4AA 4ZILA 3QDNA 2DJ0A 2L6CA 2WZ9A 3GIXA 5B8BA 4LMVA 3WT2A 2B1LA 4TR3A 7GSSA 1XFLA 1OKTA 2B5EA 1TJDA 5J9BA 3F0IA 3WGXA 1FOVA 2VCTA 2LS5A 2HRFA 1EGOA 1H4OA 2GQLA 3MSZA 5ELGA 2H0HA 5ECIB 1G7EA 4E8EA 2YZHA 4OWYA 2H01A 2IMKA 2R2JA 1R5PA 4MP4A 2VD0A 3TOTA 2O7KA 1U88A 3F8UA 1QMVA 1AUCA 5GSTA 1AXDA 1JZOA 1DE2A 2JZRA 4JU5A 3CSIA 5LD0A 1PSQA 3FHKA 5F0GA 3D4MA 3EC3A 1TK0B 6GSTA 4YQUA 2CX4A 4MPGA 3UEMA 1BQ7A 3TRQA 3HVVA 1SKSB 5A4UA 3UMAA 1JHBA 3M3MA 4EKZA 2A4VA 1WJKA 2AB6A 2OE1A 4AGSA 3FRCA 4OD7A 2KLXA 3LQ7A 1H75A 4WR4A 3TDGA 3GL3A 1F37A 1O81A 1ILOA 3IV4A 9GSSA 2FA4A 2HSHA 5B6MA 2PVOC 3IC4A 2GZZA 4K0GA 5J5NA 2P5QA 3RBTA 4IVFA 2VLVA 4ZIJA 5ECRB 1KEBA 1U6TA 1NM3A 2H1AA 3GMFA 2DIYA 4PNGA 2BTOT 5AISA 2L5OA 2H0GA 3M1GA 3ZREA 3L4NA 1V58A 3L78A 4GRFA 4TR1B 3VURA 5ECQB 4BL7A 2C0FA 3JCML 5INYA 1GSYA 3F9UA 2O87A 1K0DA 1A8YA 1X9MB 1THOA 3QMXA 4HOJA 5DQSA 3LWAA 4IQ1A 3CTGA 3EU4A 3DWVA 4MJCA 2XHFA 2L59A 3IR4A 3FR3A 3MAKA 4WR5A 2VCQA 5H5RA 2GS3A 1DSBA 3IA1A 1M99A 3HA9A 5G5FA 3DXBA 1F3BA 2XPDA 3RHBA 2C0GA 3HVSA 3M0FA 2DJKA 5G30A 1RK4A 2X8GA 3G9BA 3IE3A 1DE1A 3TJJA 1X9WB 1O73A 4CHSA 1G0TA 2YANA 5HQPA 1S3CA 2H0IA 3EURA 3QAGA 4MMMA 1Z9HA 2ON7A 3QFBC 3FK8A 1NSWA 3GX8A 2LEGA 1IYIA 5IPHA 3N9JA 5E59A 4ZB6A 1M0UA 5DJMA 1SJZA 2CT6A 3EWLA 5CRGA 1T4YA 4WETA 5ECKB 3MDKA 1F9MA 4MZWA 4ECJA 2OBIA 4BPYA 1EOHA 4ISDA 2PVQA 5DAKA 1GSEA 3EMPA 1JZDA 4AF2A 3APSA 1B48A 1FG4A 3ME7A 4IBPA 4KNDA 4RUVA 2QC7A 4GLTA 2C80A 3CMIA 2JZSA 3DYRA 1ERTA 3GH6A 4I6XA 2BJXA 1XOAA 2I81A 1WPIA 2YWNA 3PINA 3TKPA 2AV4A 2L5LA 2GQKA 2VAFA 4HJMA 3VLNA 1VGLA 1OYJA 1ZYEA 3D5JA 4EF0A 3F4TA 3GURA 3C8EA 4KB3A 3EVIA 1TU8A 1MD3A 1GSSA 1WWJA 3GKXA 2YZUA 1ABAA 1OVNA 1YQ1A 4PUFC 1TI3A 1GNEA 3G7JA 3P90A 3UIWA 2GDRA 2H1GA 1A2LA 4ZB9A 4EVMA 1PD21 14GSA 1PQNA 1V98A 5CP1A 3A2XA 1THXA 3ZZXA 4WEYA 4KSOA 3A2VA 1M9AA 2KUCA 3VK9A 4GWRA 3Q6OA 2DSAA 1M7TA 2NBSA 2N5FA 3GHAA 3LG6A 4JZQA 3A3TA 3DEXA 3F6DA 1FB6A 4RI6A 3A2WA 1WOUA 5HR3A 4ZL9A 3LXZA 2GT6A 1EWXA 2C0EA 4F9ZA 4MPFA 3VPQA 2CA8A 4V1Ag 4MDCA 2DLXA 1K3OA 1S3AA 4KSMA 2J9HA 4MH2A 1XPVA 3KJYA 5B8AA 1E6BA 1XZOA 3U6VA 2ES7A 3HCZA 3QPMA 4GQCA 3FR9A 5ID2A 22GSA 5AIXA 2HLSA 3KTBA 2IIYA 3TJGA 5IMAA 4WBJA 2HSYA 4I97A 2B6MA 3F3RA 1XIYA 1JZRA 2HYXA 4O92A 3FZAA 4EL1A 2C3TA 4XTSA 4XCSA 5CRWA 1PKWA 2YOIA 4IP6A 3W8SA 2B5YA 5DALA 2R37A 2LRNA 2FCHA 3APOA 5D9XA 3GA4A 2IL3A 5HR0A 5IMCA 1UN2A 1R26A 2WULA 2FD3A 5HFGA 2CAIA 2O85A 2C0DA 2DBCA 4ZL7A 2ZUPA 1FVKA 3L9VA 3GL5A 1NHOA 2VOCA 5GSSA 1F3AA 1B9YC 2EIOA 1TTZA 5HR1A 3HKRA 5D9VA 4I2UA 2CZ2A 3A5WA 3TJKA 2VD1A 12GSA 2YWMA 3EU3A 3QCPA 4POBA 4K2DA 3LORA 1GH2A 3HVXA 4IS0A 5JWOB 1TDIA 2JZTA 2FWGA 2X8HA 4ML1A 2K6VA 6GSXA 2EIQA 1O8WA 2VL2A 5CREA 3LEFA 4KCAA 2H76A 4FYCA 1LU4A 3L9SA 4DEJA 2TRCP 1A2JA 4Q5QA 2F3MA 1HNCA 2BMXA 2LV3A 4J56E 1FAAA 2J23A 4ML6A 4XS1A 4OFTA 5D96A 4PGTA 5IMZA 2H30A 4AJ6A 2FWEA 4POMA 1XWBA 2GSSA 4KX4A 1XWKA 11GSA 1PKZA 5IMFA 2FY6A 1K0NA 2KOKA 4GF0A 3KP9A 3GFKA 4WF5A 4KDXA 4KAEA 4Q5NA 2GVPA 3RHCA 3WGEA 4N0VA 3VWUA 1SD8A 2OADA 2IMIA 1HD2A 2L4CA 4N30A 3HHVA 5CAXA 4G2EA 1UA5A 3ZFLA 4PQIA 1MDKA 4EXJA 1VF3A 3KMNA 4K9ZA 4WXTA 5D8IA 1Z7RA 1TKDB 5D73A 2YWIA 2PMTA 1XW5A 2QSIA 1K0AA 3EYTA 1T4ZA 1XWGA 4TR1A 2V6KA 3KH9A 5DVBA 1TRWA 4V2MA 2H19A 1PN9A 1T3BA 1PL1A 4JE1A 5D9TA 5DDLA 2GTUA 5DCHA 3TUEA 4FYUA 3NIVA 2IN3A 2M72A 1A0RP 4F0BA 5AIVA 1ZGNA 4XIHA 2CAQA 2YWOA 1GSUA 4XRAA 4OFNA 3J7Yb 3ZIVA 4IJ3A 2TRXA 3M8NA 4JRRA 3LGCA 1EGRA 2VCXA 2YV9A 3H8QA 1XOBA 2PPTA 5B6NA 3FEUA 3VWVA 3UVHA 3BCIA 3CRTA 1U87A 3ZTLA 4EE0A 5J9CA 3F6FA 5IIZA 3V1WA 1K0BA 2OA7A 3WT1A 2OJLA 3D4TA 4AJ7A 2YP6A 3H1NA 4HQZA 3ERWA 2LQOA 1PGTA 1PRXA 2VL9A 1YDKA 1SYRA 4OMVA 1AIUA 3F4SA 1EOGA 4RQRA 1NHYA 4QQ7A 1CQGA 4WBRD 4MF7A 2C8UA 1Q4JA 3E3EA 1IYHA 4IJIA 1ACVA 3HY2A 1K0OA 2YNXA 2LSTA 4O5RA 3GNJA 2DC5A 1AW9A 4KE3A 4TN8A 4FIWA 2IFQB 3CBUA 1A24A 2CZ3A 1TRSA 2H6ZA 3O6TA 3M9KA 3LFLA 3PH9A 2C3NA 1N8JA 1F6MC 3VFIA 2IMEA 5H5QA 2AAWA 4OCFA 4ZBBA 2EC4A 1Z5YE 2WFCA 2F8FA 3H4KA 2X99A 2JADA 1W89A 1NW2A 2B1KA 3BOAA 4IW9A 1J0FA 1ZCPA 1YKAA 4TW5A 5DQYA 4MA9A 1T00A 2VIMA 2HI7A 3RPNA 3VI7A 4BA7A 3US3A 2A2RA 3LSZA 4GTUA 1SK2A 2H75A 2GLRA 3EINA 2QKEA 1VRSD 2R4VA 4N11A 4D73B 4OFMA 3TOUA 2H74A 2LRTA 5JCWA 5J3RA 2TIRA 3IAS2 4MJBA 3GN3A 4LA1A 3HJOA 1K0MA 2IPAA 2FWFA 4BVYA 3RDWA 2PUKC 1JLWA 3UL3A 5ELAA 3L9UA 4ILFA 5F07A 5F8BA 8GSSA 5GAPD 1XWCA 2K9FA 3ZL5A 5DBQA 4L0UA 1G6WA 4YAPA 3FYGA 2HXKA 3IAM2 4QL9A 4QL7A 2PERA 1ERWA 3KGKA 4Q5RA 2C3QA 3GUSA 3VPTA 4NMUA 3UBLA 2Z9SA 2JACA 5FHIA 2R6KA 4X0XA 3GX0A 4Z7XA 5ECLB 2HFDA 2DJJA 2GSTA 1Z6MA 3KMOA 4DSSB 3QR6A 1M2DA 5L71A 4MLYA 2XBIA 3KD0A 4HU7A 1A23A 2GSRA 1GNWA 4ULXA 4PUAA 1GSFA 2N5AA 1SKRB 2ZCTA 1JZWA 4NAXA 3N5OA 4PQHA 1V40A 4NPBA 4FYBA 4K7NA 1YEPA 5FWGA 4KCEA 1A0FA 2ON5A 1GL8A 2FUG2 2E0QA 3D21A 5GZZB 2CVDA 4KUNA 4KGIA 2LTKA 1SJ6A 2B7JA 1GLPA 4WF4A 4J2FA 4NV5A 1XCCA 1ZMAA 3WYWA 1TXXA 5ECPB 3D0ZA 3VWXA 1SL0B 1AC1A 1T8EB 1GUMA 5ECSA 3I9V2 2KHPA 2HE3A 5EVOA 2WGRA 3GSSA 3CTFA 1ERVA 3HZ8A 3D6IA 3HJPA 5EY6A 2D2ZA 3GKKA 2RUFA 2RM6A 4YH2A 2LQQA 4KW6A 2F8AA 17GSA 3ED3A 2CVKA 5CYYA 3TB2A 4EO3A 2VL2C 1SL2B 4X1UA 1QQ2A 3HZ4A 2P31A 4TR0A 4G9HA 3ZITA 6GSSA 1ZOFA 1TU7A 3SWLA 2GZPA 4GCIA 2AJQB 5B7CA 5IQYA 3CSJA 2VLUA 1WRYA 3CRUA 5JCGA 4F82A 3G7IA 5CNWA 2MZCA 4HDEA 1AAZA 1KBNA 2I3YA 5KN1A 4JBBA 5DCGA 4KH7A 5A4VA 3UJ1A 4TKYA 4L0WA 4MJEA 2RLIA 3TKQA 1QGVA 3IOSA 1OE8A 4Q5FA 2M80A 5COHA 4MF5A 4EC0A 5J41A 1FW1A 4HUAA 1GUHA 4OO4A 2YN1A 4HEA2 3BD2A 1Z3EA 1SL1B 2LUSA 2JU5A 4BVXA 3F63A 2V2GA 2O8VB 4NHWA 5A4WA 1QFNA 1T7PB 1SU9A 3KZQA 2OE0A 3NZNA 1BJXA 1OE7A 5C00A 1I9DA 2WS2A 2HNLA 1O8XA 5KN3A 1GTIA 2OE3A 2GSQA 1ST9A 3IDVA 3CXGA 1FHEA 1U3AA 2HRNA 1YF0A 5F06A 1OC9B 3MNGA 3ZVJD 3KCMA 1YF1A 3PR8A 5HFIA 3QD9A 1B8XA 3C1SA 1URMA 2M46A 1JFUA 1TP9A 3TKRA 3P8WA 1A2MA 5CO3A 1QK8A 2LNTA 1SK0A 5J4UA 5C04A 2IFQA 3UVTA 4E8HA 2RM5A 1TRUA 1EP7A 4POKA 4TXVA 1XVQA 1G7OA 2RIIA 2NVLA 2IWTA 2P0GA 2DJ1A 4ECCA 2V1MA 4LMWA 1Z6NA 3F3QA 2YJ7A 1PA3A 3K8NA 4GXZA 1M2BA 3KP8A 2XBQA 2XC2A 1X5DA 1PMTA 6GSYA 3FKFA 2MMAA 3H79A 1BX9A 3D22A 3IRAA 5JCUA 4BWSA 3ZYWA 3P2AA 1GTUA 5JWRB 1HQOA 4LL4B 2RUEA 5IMDA 5ENUA 4O7HA 2K18A 4D73A 2VCVA 2H1BA 1GP1A 3U5RE 1FB0A 1ZZYA 3L0HA 4KDYA 2R3XA 3LYKA 5HR2A 1DUGA 3VWWA 5EL8A 1X5CA 2H6YA 2HZEB 4PQ1A 3BJ5A 1GSDA 2C1YA 5HFKA 2H8LA 4PX1A 3UARA 2DMMA 1B9XC 3MWHA 1YY7A 3KTLA 3GH9A 3ZRDA 1HNAA 1SD9A 3CYNA 2CQ9A 1BAYA 2WRTA 1W4VA 1BYEA 3QFAC 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chains in the Genus database with same CATH homology


 
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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