4MJAA

Synechocystis sp. pcc 6803 glutaredoxin a-a75i
Total Genus 30
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
30
sequence length
99
structure length
99
Chain Sequence
MRGSHHHHHHGSAVSAKIEIYTWSTCPFCMRALALLKRKGVEFQEYCIDGDNEAREAMAARANGKRSLPQIFIDDQHIGGCDDIYILDGAGKLDPLLHS
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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publication title Utility of Synechocystis sp. PCC 6803 glutaredoxin A as a platform to study high-resolution mutagenesis of proteins.
pubmed doi rcsb
molecule keywords Probable glutaredoxin ssr2061
molecule tags Electron transport
source organism Synechocystis sp.
total genus 30
structure length 99
sequence length 99
ec nomenclature
pdb deposition date 2013-09-03

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00462 Glutaredoxin Glutaredoxin
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.30.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich Glutaredoxin Glutaredoxin 4mjaA01
4POBA 3G7JA 1ML6A 2AAWA 2H72A 5G5FA 4TKYA 1S3DA 1YKCA 1TXXA 2GSRA 3GMFA 2IMFA 3QMXA 1EP7A 1TW9A 1ZZYA 4HOJA 4MJAA 5DJLA 4OFTA 3V1WA 3ISOA 3L9VA 1PL2A 3KTBA 3W6GA 22GSA 4IP1A 2YNXA 4Q5QA 5IMFA 5DALB 2C0FA 2AUVA 3D0ZA 4K0NA 2JZTA 4BPYA 2H6XA 1KTEA 4LLRA 1K0DA 2WDUA 1T4YA 2DJ2A 5B8AA 3BCKA 3D21A 2YP6A 4EXJA 2G0FA 3IE3A 3FKFA 3VWVA 1GUKA 1X5DA 2B3SA 2IJYA 6GSTA 5G1KA 4IP6A 4HZ2A 2FD3A 5IPGA 3EE2A 2F8FA 1ZGNA 1LJRA 2MBSA 2O89A 2MMOA 1V57A 1OVNA 4MF6A 4MABA 4XS1A 2K9FA 1PN9A 1SU9A 4MZBA 2E7PA 4WR5A 2LUSA 1BQ7A 4TR3A 2FHEA 1JZWA 4J57E 4TW5A 4WR4A 2B1LA 1YF0A 2GTUA 4RI6A 16GSA 11GSA 2H6ZA 2PN8A 3RPNA 3VPTA 1M2AA 3HJPA 3M9JA 4KCAA 2LJKA 3QPMA 4L5LA 2FA4A 1GLPA 3HHVA 4PGTA 1RK4A 2H1DA 1UN2A 3F4TA 1XVQA 1QUWA 2RIIA 4WBJA 1DE2A 2MMZA 3ERGA 5B6MA 3RHBA 2OE1A 3IHQA 1K0BA 2HRNA 1GSEA 2AV4A 4O5RA 1B48A 3GTUB 3IDVA 3RPPA 5ECNB 3CYNA 1A8LA 1J9BA 2CVBA 3LXZA 4N30A 2KP2A 4GQFA 1DSBA 5JCWA 2YN1A 3VWXA 2N5AA 3IRAA 4I97A 3DVXA 2GVPA 5IMVA 1A2MA 5JCUA 2LRCA 2C0DA 1WP0A 4Q5FA 3HXSA 5HQPA 2YJ7A 4I5QA 2IFQA 1T00A 4IS0A 1OKDA 4MCUA 4NV2A 4MH3A 3VLNA 1EGOA 4IBPA 5IM9A 4JRRA 5ECOB 4HQSA 5DAKA 5G1LA 4ECIA 3ERWA 1SD8A 1B4PA 3MSZA 5F07A 4NXIA 2WGRA 4TR0A 1W4VA 5H5RA 3U6VA 2KUCA 2IMIA 5A4VA 5IMCA 3WT1A 2JSZA 1X9MB 4XS4A 2H19A 4L8EA 2GZYA 1A2JA 2E0QA 1AQXA 1TI3A 3RAZA 1GRXA 4JR6A 1HQOA 1S3CA 3LGCA 1M0UA 4FO5A 1U88A 4ZL7A 3A5WA 4MPFA 3CTGA 2PMTA 4PURA 3UAPA 1AW9A 1X0RA 4EL1A 3QR6A 1F2EA 4XRAA 4EE0A 1JZRA 4EDZA 3F6FA 4AJ6A 1XWCA 1K0OA 2C3NA 4PQIA 3ZIJA 3TCOA 3TB2A 4GTUA 4TOPA 1Z7PA 2KOKA 2YZHA 3GL3A 4NHZA 4LMVA 2YWNA 1ON4A 3C8EA 2GQLA 2FWEA 2XHFA 3F4SA 3VFIA 3GKKA 1A23A 18GSA 2VCZA 1SKSB 2EIRA 3VK9A 1R5PA 5JWOB 1BJXA 3IAS2 2C3TA 2NVLA 2EC4A 5ELGA 5DCHA 2VCXA 3FR6A 5F06A 1A0RP 4J2FA 2HSYA 3CBUA 1DE1A 2L6CA 3NOFA 4JBBA 3GRXA 2R5GA 2C3QA 1K0AA 1TRUA 3ED3A 1X5EA 1M9AA 3HCZA 2MBTA 1ERWA 1SL1B 2R4VA 4V2LA 4LL4B 4POMA 1T1VA 4EDYA 1GSUA 5IO0A 2H1GA 5J3RA 1PX6A 4MA9A 3WGEA 1Q4JA 5IPHA 1OC8A 4TXOB 2RM5A 1F9MA 1U87A 3QFBC 5CRWA 1ACVA 1TI1A 1PSQA 2VL3A 2VM2A 2F3MA 5KN2A 3Q6OA 1KBNA 2K8VA 2IMKA 5DQSA 4IJ3A 5LCZA 4MJBA 4N10A 1TTZA 3H93A 3TKSA 1EGRA 1FW1A 3FZ4A 4ILFA 1JZOA 1SENA 2OKAA 3PINA 4IELA 2VL2C 5GAND 3KM6A 2MZCA 3UVHA 3UBKA 3MDKA 1QQ2A 2GDRA 4Q5RA 5LD0A 1XOBA 3TRXA 2HZEA 3UEMA 4WKWA 4O32A 3WT2A 5IOXA 2F9SA 3VWWA 3KTLA 2YV7A 3GNJA 3LJRA 1VF4A 8GSSA 2LQQA 3GYKA 1ZYEA 4NPBA 4EC0A 1QXHA 3HZ4A 1OC9A 4I2UA 1PD21 2QGVA 4FIWA 3ME7A 5HR3A 4V2MA 4TR1A 3GIXA 4XIHA 1J08A 4HS1A 5AN1A 1WOUA 1PL1A 4CW9A 1MD3A 1RQMA 2GS3A 5D96A 4KSOA 3IR4A 1BX9A 3WGXA 2H0IA 3L9SA 4XHMA 3FHKA 4H86A 3SBCA 4RI7A 2IMEA 5GZZB 5CP1A 3M8NA 5FHIA 1LU4A 4LL1B 4L0UA 1TP9A 2B1KA 2VD1A 4I6XA 3IAM2 4OFMA 4KGIA 1W89A 2X64A 5CRGA 3ZZXA 1GULA 1NM3A 5CAXA 2PUKC 5F05A 4DSSB 1J0FA 5F8BA 3ZVJA 2C80A 4D73A 1X5CA 2I81A 2WRTA 3L0HA 2RUEA 3D6IA 4ZXGA 1T4ZA 1O8WA 1C72A 5ID2A 4EVMA 2DJ1A 2B7KA 1ERVA 4TRXA 2GZZA 2CZ2A 3GURA 1TRSA 2E2GA 4N0VA 3W8SA 1PRXA 5COHA 1Q98A 1M2DA 2ON7A 4GWRA 3TJJA 4HDEA 3G7IA 1Z7RA 4KCEA 1XWAA 3KMOA 1SK1A 1SKWB 3TJBA 4EO3A 3GH9A 1U3AA 1YJ6A 4KDUA 1WPIA 3TKSE 2WZ9A 2CQ9A 1M7TA 4RUVA 2I3YA 5AISA 1QK8A 5G5EA 2F8AA 4OFNA 3TRPA 2PERA 3GX0A 2V6OA 1EZKA 1XWGA 2FCHA 1TOFA 4YQMA 3D4MA 4O92A 3ZYWA 1F3BA 1YDKA 2PVOC 4GSSA 4I2TA 4FH8A 4WEYA 1WMJA 2O85A 1EV4A 1O8XA 4BWQA 3HA9A 2MMAA 4PXOA 5ECRB 3HJMA 4HEA2 4ECBA 2V41A 1Z6NA 1URMA 2CAQA 5INYA 3GKNA 3M1GA 2X8HA 5JWQB 1PQNA 5GSTA 1GSSA 3A3TA 5D9TA 2GQKA 2RLIA 2JSYA 3ZVJD 1AIUA 4MZCA 3MAKA 1O85A 5KEJA 4NV5A 1K3YA 3E9JB 4GSTA 2GLRA 2ON5A 2LNTA 3ZRDA 1YEPA 2M46A 2K18A 1X9SB 1O6JA 1A8YA 2L57A 4IN0A 1ST9A 2R2JA 1EWXA 3F0IA 3P90A 4QL9A 4AJ7A 4NMUA 2YOIA 3IK7A 3QD9A 2LSTA 4KB3A 4YAVA 3VPQA 1THOA 5KN1A 5IOWA 4ZBAA 1G7EA 3TKRA 4ISDA 5IIZA 1CQGA 3EWLA 4AJ8A 2KLXA 5CNWA 3LORA 2BMXA 3Q18A 3ZFLA 1SL0B 19GSA 3DVWA 9GSSA 3BCIA 3UMAA 2N5BA 1SKRB 3GSSA 1EOGA 2VLVA 5A4WA 5LNKe 2DJ3A 1SYRA 2ZNMA 3ZITA 3TGZA 5FWGA 2LV3A 2ZUPA 3C73A 4XRDA 2IN3A 3DYRA 4XCSA 4HU9A 2WS2A 2M80A 5G31A 1JFUA 5J41A 2GZPA 3WGDA 4GQCA 4N11A 1AUCA 1FVJA 3HVSA 1NW2A 1FAAA 3GFKA 1ERUA 4JE1A 4HJ2A 4YQVA 2DC5A 5J5NA 3J7Yk 2VUPA 3DXBA 3IOSA 3TJGA 4F2IA 1G0TA 4RQRA 1SL2B 4F0BA 4WF4A 4GF0A 3GN3A 3KEBA 1PMTA 1FVKA 2B5XA 3GKXA 4RQXA 1GSDA 4K0GA 2LRNA 4FYCA 2FNOA 4G19A 3HYPA 3DGQA 5JCGA 1K3LA 3US3A 1R26A 1GSFA 1OKTA 4K8MA 5DJMA 3CSHA 1O81A 3A2XA 4IHUA 4GCIA 4XS6A 4TN8A 4ZBDA 4TR4A 4K2DA 1XPVA 5D73A 5D93A 5B7CA 1T7PB 3NZNA 3JCML 1EOHA 5AIXA 2XBIA 3DIEA 1Y25A 3EU4A 1ZCPA 2LEGA 3LG6A 2C8UA 3UOMA 5DAKB 5IMDA 4JEDA 3IK9A 3GHAA 2GSSA 2P31A 4PQ1A 5E59A 1XCCA 3AY8A 1TRVA 3LYPA 2H75A 3O76A 4G2EA 2HLSA 1GNEA 3GL5A 4V1Ag 5A4UA 1SD9A 3HJOA 2B5YA 1U3IA 3H4KA 4K6XA 4POKA 3H1NA 1EEMA 1VGLA 5HR0A 1SK0A 5ECQB 2OE0A 3F3RA 4OMVA 5KN0A 4JZQA 5IMAA 2JL4A 1OAZA 2NTOA 2YPMA 3CTFA 3GX8A 1MDIA 3IXRA 3TUEA 1MTCA 3APSA 2CX3A 1ABAA 2PWJA 4V1Ap 1ERTA 2OACA 3KGKA 5FT3A 1KEBA 4K9ZA 3ME8A 4PQHA 4KDXA 3CXGA 4POLA 1XFLA 3UIWA 1XZOA 2VO4A 5HFKA 4TXOA 2HI7A 1SJ6A 1DUGA 1H75A 3FZ5A 4MP4A 4PUAA 3MNGA 4WF5A 2H1AA 1OE7A 1TRWA 2A2RA 3L9UA 3PH9A 2XBQA 3IV4A 4AF2A 1YF1A 2TRCP 3KIJA 3KMNA 1GSYA 3J7Yb 2HYXA 3WD6A 2ALBA 1GH2A 1UA5A 5L71A 3N9JA 4MDCA 3HVVA 4ZB6A 4MF5A 3O3TA 4L0WA 5GAPD 20GSA 1YQ1A 2FLSA 2X8GA 1FHEA 1TK5B 5HR2A 2IIYA 3E0UA 3A2WA 1GP1A 4OCEA 1GNWA 4IVFA 1BAYA 3H8QA 2NDOA 4IQ1A 1A0FA 2AHEA 2PPTA 2V2GA 6GSVA 3FEUA 1E2YA 3D4TA 3LEFA 2REMA 2L4QA 3GA4A 2H6YA 4KA0A 4K7NA 3Q74A 2VLUA 1H4OA 2YWMA 3KH7A 3O6TA 2ES7A 1Y6EA 4AGSA 1GL8A 2WCIA 1UVZA 5G2ZA 14GSA 4KSMA 1CQHA 1GTAA 2VL9A 3ZMKA 4K7IA 2C0EA 1O73A 2AJQB 2DBCA 3BBYA 2KP1A 3CSJA 4O7HA 1GUMA 4YH2A 2VD0A 1GLQA 3IPZA 1WWJA 1K0MA 4YAPA 2VCTA 3QDNA 2H76A 3LQ7A 2O87A 3DMLA 3TOTA 2MYGA 3ERFA 5J4UA 1ILOA 1TK0B 1AQVA 3CMIA 3C1RA 5EPFA 4DSQA 2DLXA 1WE0A 3VWUA 2I1UA 2KHPA 2HZEB 4CDOA 2R3XA 2GSQA 5C00A 3GKMA 5ECSA 2LTKA 3FZAA 2OBIA 3FY7A 3Q19A 1GUHA 3QAVA 1NHOA 5ECHB 2AB6A 3KP9A 1THXA 4QQ7A 2H66A 3I43A 1HYUA 1M99A 1V2AA 2H0GA 4MMMA 4KNDA 3D5JA 4KE3A 5C04A 2I9HA 3BOAA 3R2QA 4HQZA 1EV9A 4ML6A 2FY6A 3RDWA 4OD7A 2CAIA 1WIKA 2XPEA 5ECIB 5ECKB 4HZ4A 5D9VA 1SK2A 4P3YB 5ECLB 2X99A 5A5KA 1V98A 1E6BA 3CSIA 3EMPA 3F4RA 1JLWA 5D9XA 2HNLA 2YZUA 4F0CA 1YKAA 4OWYA 1Z3EA 2DIYA 2MMNA 2YANA 1K3OA 3KP8A 1GTUA 3TKSC 5AIVA 2B7JA 2HFDA 3L78A 2VCVA 2BTOT 1GSQA 6GSYA 5H5SA 3UBLA 1PA3A 2LJRA 1UC7A 5CO3A 1T3BA 4MH2A 4K1FA 5ECPB 2YJHA 4MJCA 2BJXA 2VM1A 3KXOA 2HXKA 1USBA 5DALA 3SWLA 17GSA 4ZIJA 1N2AA 2L5OA 5KN3A 2LQOA 3FW2A 2P5QA 4N0ZA 4ZILA 1GTBA 1PX7A 3VI5A 2V1MA 4BWSA 3UJ1A 4JR4A 4ACSA 1VRSD 1B9YC 3ZFBA 2H71A 4TXVA 2RUFA 2HT9A 2N5FA 2C1YA 6GSUA 2H1BA 7GSSA 1TJDA 1GTIA 4GSNA 2CVKA 3C7MA 4BVYA 1ZL9A 2CVDA 1BG5A 2CV4A 2OADA 2JZSA 3D22A 1M9BA 4EKZA 4MZWA 2O8VB 1F3AA 2L4CA 5ELAA 3W8JA 4L5OA 2IPAA 5J9CA 1SJIA 3HZ8A 2LJAA 1JZDA 5DCGA 2X8CA 2VCWA 3TJKA 1EP8A 3QAWA 1QGVA 3HVXA 3GV1A 2FWHA 2B5EA 1FB0A 2J9HA 1RW1A 1T8EB 4F82A 3ZTLA 3LWAA 3KZQA 1GWCA 2FUG2 2EIQA 1O7UA 1KNGA 1XIYA 5ENUA 1ZMAA 1JLVA 3CRTA 2H8LA 2DIZA 2JADA 5EL8A 4CHSA 1IYHA 2GGTA 1JHBA 1FO5A 2VAFA 1V58A 3IA1A 3TJFA 1SJZA 4HUAA 1F37A 5F0GA 2LRTA 2DMMA 5DBQA 3GTUA 3C71A 3M3MA 5J9BA 4KAEA 1OC3A 4IQAA 3EINA 5D8IA 1HD2A 5IMZA 1Z5YE 3F63A 2YWIA 3F9UA 2V32A 4LA1A 13GSA 3HD5A 2PU9C 5IQYA 1FOVA 3FZ9A 2CA8A 1I9DA 3GUSA 4TVEA 3VURA 1HNCA 1TU8A 3ZMLA 3PGTA 3TDGA 2DSAA 4ZB8A 3QFAC 5EY6A 4IKHA 3EYTA 1TDIA 3WYWA 1QFNA 12GSA 1A2LA 1YY7A 2XC2A 2F51A 4G9HA 2L59A 4PNFA 5CYYA 3M0FA 2I4AA 4DSRA 5DVBA 3OR5A 3QOUA 2QKEA 2GQMA 4IW9A 4LMWA 2YWOA 4ZB9A 2B6MA 2H30A 4ECCA 3U5RE 2DJJA 3DEXA 3G9BA 2IWTA 4F03A 3P8WA 4WXTA 2CT6A 2FA8A 2WJUA 3KD0A 3C1SA 1R4WA 3DD3A 1M2BA 2L6DA 3K8NA 3A2VA 3F3QA 1XWKA 2VOCA 2OE3A 3KH9A 2IFQB 4KDYA 4G10A 1MDJA 4NWYA 2R37A 3UL3A 2R6KA 4MF7A 3FYGA 1R5AA 4OO4A 1OYJA 1AAZA 4NAXA 1PGTA 1XOAA 3NIVA 5CREA 4ZL9A 5ECMB 6GSSA 2TIRA 1XBSA 2H73A 5H5QA 3ZIVA 4JU5A 2K8SA 3BJ5A 2VL2A 4ZBBA 3I69A 1BEDA 2A4VA 4GRFA 1AQWA 4BL7A 4K7OA 1WRYA 2HRFA 4FYUA 4XS4B 4KUNA 4YQUA 3F6DA 5JWRB 5E4WA 3UVTA 4DVCA 1FG4A 3HY2A 2PGTA 2G2QA 5DDLA 3ZLPA 4I8BA 2H70A 1N8JA 1DBYA 4EF0A 4WBRD 6GSXA 2JU5A 2GT6A 1V9WA 4GXZA 2VCQA 1XW6A 2GSTA 2M72A 2OBKA 3DRNA 2A2SA 4ZL8A 5GSSA 3FRCA 4E8HA 3ZREA 3QCPA 1WJKA 1NSWA 1XXUA 1X9WB 3PR8A 1ZOFA 1YZXA 1IYIA 3P7XA 4ULXA 3KCMA 2HE3A 4QL7A 3IBHA 2C0GA 1XWBA 1I5GA 1VF3A 4IGJA 1TK8B 2J23A 1U6TA 2IMDA 2VIMA 2PBJA 1G6WA 3EVIA 3HDCA 2LNSA 4PX1A 3CRUA 4OCFA 3LXTA 3N5OA 2RM6A 4HJMA 3IC4A 1AXDA 2WFCA 3ZL5A 2E2MA 1PKWA 2LKUA 3EURA 3MWHA 4KW6A 1XW5A 1NHYA 1V40A 1VF1A 2FWFA 1FB6A 3P2AA 1A24A 2O7KA 4V2NA 1HNAA 3I9V2 4MK3A 1G7OA 1YEXA 1MD4A 4Q5NA 1PKZA 4X43A 5G30A 4DEJA 5CRHA 2V6KA 1Z6MA 3APOA 6GSWA 4BVXA 4PNGA 2DJKA 4IJIA 2IL3A 5ABRA 3DWVA 1B9XC 10GSA 2JZRA 4WETA 3RBTA 3GH6A 5B6NA 1HNBA 2HZFA 2QC7A 3LFLA 5CRDA 4X1UA 5HR1A 4MLYA 4KX4A 3APQA 2H74A 1XW9A 2EIOA 4Z7XA 1MEKA 1SYXA 2H0HA 3DKSA 5DQYA 4ML1A 2VLTA 3HKRA 2QSIA 3VI7A 4PUFC 3EU3A 3GSTA 1BYEA 1G6YA 5AGYA 3F8UA 3G7YA 2NPBA 4E8EA 4XTSA 2PVQA 2DMLA 1XVWA 1OE8A 5EVOA 2P5RA 3TRQA 3I6AA 2NBSA 2HSHA 2FWGA 2YCDA 3FR9A 4ID0A 1Z9HA 3UARA 1OC9B 2H01A 3FR3A 1TU7A 1EEJA 4DSSA 4MJEA 4J56E 2AYTA 3EC3A 4KH7A 1F6MC 3RHCA 4TR1B 4HU7A 2C4JA 2CZ3A 5HFIA 3TKQA 1ZYQB 2WULA 2TRXA 3LSZA 2ZCTA 1R7HA 3H79A 3LYKA 2Z9SA 1MDKA 2GT5A 3EMXA 1K0NA 4HI7A 4MPGA 4X0XA 4EUYA 2D2ZA 4FYBA 3M9KA 4GLTA 5D9WA 2XPDA 2LS5A 3FK8A 5HFGA 3S9FA 5B8BA 2P0GA 1S3AA 1K0CA 3KJYA 4BA7A 4NHWA 3QAGA 1LBKA 2JACA 2DJ0A 2OA7A 2WB9A 1VF2A 2L5LA 1AC1A 1QMVA 2YV9A 3BD2A 4D73B 2K6VA 1B4QA 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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