2RIIA

Crystal structure of human peroxiredoxin i in complex with sulfiredoxin
Total Genus 49
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
49
sequence length
184
structure length
184
Chain Sequence
SGNAKIGHPAPNFKATAVMPDGQFKDISLSDYKGKYVVFFFYPLDFTFVCPTEIIAFSDRAEEFKKLNSQVIGASVDSHFEHLAWVNTPKKQGGLGPMNIPLVSDPKRTIAQDYGVLKADEGISFRGLFIIDDKGILRQITVNDLPVGRSVDETLRLVQAFQFTDKHGEVSPAGWKPGSDTIKP
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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molecule keywords Peroxiredoxin-1
publication title Structure of the sulphiredoxin-peroxiredoxin complex reveals an essential repair embrace.
pubmed doi rcsb
source organism Homo sapiens
molecule tags Oxidoreductase complex
total genus 49
structure length 184
sequence length 184
chains with identical sequence B
ec nomenclature ec 1.11.1.15: Peroxiredoxin.
pdb deposition date 2007-10-11

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00578 AhpC-TSA AhpC/TSA family
A PF10417 1-cysPrx_C C-terminal domain of 1-Cys peroxiredoxin
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.30.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich Glutaredoxin Glutaredoxin 2riiA00
2L57A 4ECCA 1ABAA 3IR4A 3D0ZA 3GX0A 3WGDA 1YEXA 3EVIA 4IN0A 2IFQB 3MDKA 1SK1A 3G9BA 5F8BA 4WF4A 3CBUA 2RUFA 2YWNA 2CAIA 1F3AA 4KDYA 4NHWA 2IL3A 2D2ZA 1YJ6A 3CRUA 3ZYWA 4JU5A 2VL9A 5DCHA 2IPAA 4POMA 5EL8A 4IW9A 2GZPA 1K0OA 2R3XA 4QL7A 1XFLA 2H1GA 3GFKA 1TW9A 5GAPD 5ECQB 4IKHA 3BJ5A 4L0UA 3J7Yk 3FW2A 5GZZB 2LQQA 2VCQA 2R4VA 4K6XA 1VF2A 2YWMA 3F8UA 3GKKA 3D5JA 4WBJA 5IPHA 3IE3A 5D9WA 4ILFA 4K7OA 17GSA 3N9JA 3F4TA 3C7MA 3KH7A 1F3BA 5G5FA 5DAKA 4TR3A 3HHVA 2JACA 1HYUA 4KDXA 1O85A 4XHMA 1LU4A 1A2LA 2VL3A 5ECMB 1JZWA 4I97A 2FGXA 1TOFA 3KMOA 3HZ8A 4BL7A 2JSZA 5D73A 2DC5A 4Q5FA 3O76A 1XW6A 5EPFA 1EP7A 1I5GA 3GTUA 2ON5A 2FWFA 1YDKA 3QAWA 4TXOB 3Q19A 1A24A 1VF1A 4OCEA 1XIYA 4V2LA 3FZAA 3M1GA 2HZEB 4LL1B 4ZL8A 5H5RA 2DIZA 1TDIA 2M80A 3APSA 5D93A 2RM5A 2LNSA 4WKWA 1H75A 4YAPA 4HZ4A 5A4WA 5HFGA 1THXA 3ISOA 3ED3A 4ZB8A 5B6NA 2TRCP 1GSSA 3CTGA 1RQMA 2VM1A 2J9HA 4YH2A 5IQYA 2JU5A 1SK2A 1U3IA 3E0UA 2GQLA 2AJQB 1ZZYA 1GSEA 1N8JA 4IJIA 2VLVA 1GUKA 3OR5A 1K0AA 1VF4A 1AQXA 3GKXA 4RQXA 5D9TA 3PINA 2PERA 4KE3A 4FH8A 4HS1A 2V2GA 2FCHA 2YZHA 3EMPA 5ECKB 2CAQA 5CRWA 3LQ7A 4ECJA 1PKWA 1QUWA 1PRXA 2JZSA 1CQGA 5DALA 3BD2A 2H0GA 4GLTA 3WT2A 4PNGA 4HEA2 3RPNA 5ECPB 4EUYA 4FYCA 1WIKA 1ACVA 3UJ1A 1JHBA 1FHEA 2GZYA 5JCGA 1OKDA 1PGTA 1EV9A 1ERUA 3RPPA 4MA9A 1BJXA 1TRVA 4NV5A 3MSZA 5A4UA 4P3YB 2V41A 3GV1A 4ZB9A 2WGRA 3ZIVA 2HZFA 2IIYA 1WPIA 2AB6A 5KN3A 1EOHA 1M0UA 1FG4A 3ERWA 2WFCA 5KN2A 1UA5A 1B9YC 5CNWA 1X9WB 2B1KA 1V57A 4PUFC 3LJRA 2YV7A 1PL2A 1ZL9A 3KIJA 2VCXA 1FVKA 1Z5YE 1DUGA 3GL5A 3QPMA 3IOSA 4J2FA 3BCKA 4OWYA 3APOA 3IK9A 2H01A 3H8QA 3GSSA 3MNGA 2VM2A 2H0HA 2FUG2 2J23A 1SENA 2YNXA 2X8HA 4OMVA 3IAM2 3L4NA 1FB0A 4GXZA 4JEDA 1ZMAA 4ACSA 3VWXA 1JLWA 4GQCA 3TJBA 3M9KA 1Z7RA 3M8NA 5HFIA 2VIMA 4PQHA 1N2AA 1Q4JA 1G7OA 2FA4A 1Z6NA 2G0FA 3F3RA 3C1RA 1K0MA 5KEJA 4MJCA 1EGRA 3GIXA 4F03A 2EIRA 1DBYA 4XS1A 1QQ2A 3LEFA 1OC9B 3LORA 3JCML 2IMIA 3M9JA 3HXSA 1A8YA 3GL3A 5DBQA 4PQIA 2TRXA 4IS0A 4K0GA 4KSOA 2GSTA 4RUVA 4JR6A 1ERVA 3F3QA 3ZFBA 20GSA 1OE8A 2KP2A 4GRFA 1C72A 3H4KA 4MH2A 5JWRB 2N5BA 3EC3A 4DSQA 3O6TA 1AQVA 1TTZA 22GSA 3P7XA 4KA0A 5G5EA 2PWJA 2YJHA 4ZB6A 3DVWA 5COHA 3US3A 2H6ZA 3W8SA 2WCIA 1JZOA 2X8CA 4Z7XA 3ZVJA 1U3AA 2NVLA 4KGIA 2CZ3A 3RDWA 1XWGA 2A2SA 4L8EA 1SJZA 4IHUA 2H0IA 2B7KA 1FOVA 2PUKC 4HDEA 5ECRB 5D8IA 3DEXA 5HR2A 1GL8A 5HFKA 2P5RA 4N10A 1WWJA 4Q5RA 2V32A 2EC4A 3ME8A 4EKZA 1ERTA 2B7JA 4YQMA 1JFUA 3LWAA 1Z7PA 1B8XA 2MBSA 5LCZA 1PA3A 2V6KA 2BTOT 2H75A 3EU3A 3HJMA 4WR4A 1U87A 2XBQA 3BCIA 1F2EA 1G7EA 1BX9A 4JR4A 1T1VA 4V2MA 2OACA 5AISA 5G31A 5KN1A 4XRDA 2VUPA 5GAND 3I43A 2DSAA 2B5YA 3VPTA 1GP1A 1OC8A 3I69A 1G0TA 1B4QA 2LS5A 3DRNA 3ZZXA 5J5NA 4GSSA 3Q6OA 4TOPA 3KGKA 4KNDA 1XW5A 4K7IA 1TRUA 4EDZA 2C4JA 3IPZA 1OE7A 2RM6A 2IMEA 3FRCA 1OKTA 1Y25A 5HR3A 5B7CA 1B9XC 3VLNA 2VO4A 4GF0A 3G7YA 4QQ7A 3QR6A 4NPBA 1R26A 2KP1A 4PUAA 2WS2A 2H8LA 2REMA 1TU8A 5ABRA 2GVPA 2JADA 5ELGA 4IQAA 1SYRA 4GSNA 1A2MA 3UVHA 3GKMA 3F9UA 4K1FA 5CRHA 3ZMLA 3TOTA 5FHIA 3D22A 5AIVA 3UBKA 1PN9A 2H70A 3A2VA 1XWBA 3U6VA 2GLRA 3IK7A 1PX7A 5DALB 5DJMA 2DIYA 2GQMA 5HR1A 1AUCA 2XPDA 4ZXGA 5AGYA 4MF6A 2R37A 3UARA 2DJ1A 2YN1A 3FHKA 2B1LA 2K8SA 4MP4A 4WEYA 4DVCA 2KOKA 5AIXA 4YQUA 2DJ2A 1TK8B 4TRXA 2QKEA 2EIOA 2CVBA 1YF1A 4AJ8A 2Z9SA 1M99A 5J3RA 4WETA 1I9DA 1RW1A 5DJLA 2C3QA 3HVXA 3WT1A 1ZGNA 5IO0A 1SL1B 2OBIA 3IC4A 1BG5A 2AHEA 3F6FA 2DMLA 4OFTA 2HYXA 1SL0B 6GSWA 4PXOA 5INYA 2MMZA 5L71A 4K0NA 2OE0A 4EF0A 3QFBC 1F37A 2AUVA 3P2AA 1ML6A 2LJRA 4JE1A 3LXTA 2WZ9A 4I2UA 1OAZA 2IJYA 1BQ7A 2YV9A 3VI7A 1PL1A 1MDJA 2XHFA 1T00A 3GURA 3GH9A 3GRXA 4KH7A 3HKRA 2N5FA 3G7IA 2C3TA 5ECIB 2TIRA 3TKPA 3UOMA 4OCFA 3FR6A 1GWCA 16GSA 3TGZA 1UVZA 2L5OA 1MDKA 3QDNA 2LRNA 2PU9C 3VK9A 4NV2A 2FWEA 3CTFA 4CHSA 2GDRA 2ZUPA 3FEUA 3TJKA 1TKDB 2F8FA 3UMAA 4I8BA 3TRXA 1CQHA 5C00A 5IMFA 1QXHA 2XPEA 1ILOA 4RI7A 1K3OA 5G2ZA 3V1WA 2CZ2A 3EE2A 4MF7A 2I9HA 4XTSA 2P0GA 2P5QA 1SJIA 2H1DA 3GA4A 3L9UA 1TRWA 3U5RE 3IHQA 3KP8A 2GQKA 3TCOA 2GSSA 1PMTA 3TJJA 2CA8A 1ZOFA 3MWHA 4XS4A 3LFLA 4XCSA 6GSXA 3UBLA 4F82A 1TP9A 1UN2A 3C8EA 6GSSA 2O7KA 4WR5A 1GH2A 4D73A 1OC3A 3DKSA 4G2EA 3J7Yb 1SD8A 2JZRA 2C0EA 1THOA 2DLXA 3SWLA 5ECLB 2FY6A 2HI7A 1GSDA 3F0IA 4AF2A 1ZCPA 3TOUA 3F4RA 4I6XA 3VWVA 4AJ6A 1TXXA 4EL1A 1XWCA 2GSRA 4OFMA 3KH9A 4TW5A 2A4VA 2R2JA 9GSSA 3ZVJD 3IRAA 4AJ7A 4XRAA 1MD3A 5ECOB 1EP8A 3WGXA 3D21A 2R6KA 2F51A 2HRNA 3FK8A 1XVQA 1PQNA 1Q98A 4Q5QA 5FWGA 3UAPA 2PVQA 1DE2A 3TKQA 2AV4A 3P90A 3HVSA 2OJLA 1NM3A 1SU9A 3VWWA 2ZCTA 5CREA 2DMMA 3GMFA 2WDUA 6GSUA 13GSA 4LLRA 3LXZA 4MZCA 4AGSA 2IMKA 1USBA 4J56E 3RHCA 3BBYA 1BEDA 4MMMA 1TK0B 2CT6A 4EO3A 1HD2A 1F6MC 3HVVA 4F0CA 3EMXA 4EE0A 5F07A 3NZNA 4HQSA 5JCWA 5DQSA 2HNLA 2VAFA 1AQWA 3DMLA 3IAS2 2FLSA 1M2BA 4EXJA 1T7PB 4MLYA 3A2XA 3TKSA 4HJ2A 1O73A 4BWSA 5E4WA 4K9ZA 4TKYA 3HJPA 1MEKA 5ID2B 5F0GA 1HNCA 4BVXA 4ML6A 4HQZA 3ZREA 1IYHA 3HJOA 1BYEA 5J9BA 1B48A 4ECBA 3WD6A 4MPGA 3GYKA 2LRCA 5DDLA 2X8GA 4KW6A 3KCMA 1TU7A 4FIWA 3FR3A 3HD5A 5EY6A 1MD4A 3GKNA 2YP6A 1WP0A 3ZMKA 3M0FA 2QSIA 4ISDA 3CRTA 4G10A 1GTUA 5F05A 2AAWA 4KCEA 2VCZA 5G1LA 2OADA 2PMTA 4TR0A 4TVEA 5AN1A 4ZIJA 1VGLA 1TI1A 1TK5B 19GSA 3CSJA 5CRDA 4NHZA 4MPFA 1URMA 2VCVA 2C0GA 2K9FA 3IV4A 3ZITA 2ALBA 2EIQA 1XWKA 3C1SA 1FB6A 4FYUA 1ST9A 3QMXA 1XVWA 3ME7A 5CYYA 3A2WA 1A23A 1WRYA 1YKAA 2H30A 1X5CA 3EYTA 5J41A 4OO4A 2VLTA 1XW9A 2GS3A 3KTLA 4GCIA 1GSYA 4PURA 2RLIA 1O8XA 1SYXA 1ZYQB 1T3BA 2OA7A 2LQOA 4ZL7A 2DBCA 4K2DA 2LRTA 1KTEA 2B6MA 2B5XA 1EV4A 5IPGA 5GSTA 3F4SA 1EWXA 3L9SA 4EC0A 5IIZA 2L4CA 4XS6A 1V9WA 3PR8A 1S3CA 6GSVA 4V1Ag 2OE3A 1GTBA 1ON4A 2KHPA 3UEMA 3QAVA 4POLA 4K8MA 2PN8A 3VI5A 3DIEA 2I4AA 3VFIA 2BMXA 2I81A 4OD7A 3QFAC 2FA8A 2YZUA 2GT5A 3HCZA 4NAXA 3DD3A 1GNWA 5CP1A 2FWGA 2LNTA 4F9ZA 2MYGA 3QOUA 4N30A 3ERFA 3FZ9A 3CSHA 3DYRA 3LYPA 4E8HA 1XOBA 4IP1A 4MJBA 4KAEA 5HR0A 2JL4A 1G6WA 1GSQA 4BPYA 2JZTA 1FW1A 3FZ5A 3KZQA 1FVJA 1X5EA 1X9MB 1M9BA 4X0XA 2DJ0A 3H79A 4F2IA 2IN3A 2LJKA 4LA1A 1A8LA 4G9HA 4HZ2A 3CMIA 4BVYA 1XWAA 4MK3A 5LD0A 3Q18A 4TR1B 5LNKe 3UL3A 1AAZA 3KEBA 4XS4B 3UIWA 3ZTLA 1Z6MA 2HT9A 2JSYA 4HUAA 2HSHA 2AYTA 3IBHA 4JZQA 12GSA 1K0CA 4MZBA 4D73B 2HRFA 3KJYA 2LTKA 2OE1A 5ID2A 4V1Ap 3VPQA 5ECNB 2C80A 4IP6A 4DSSB 4NXIA 4TN8A 3A5WA 2PGTA 2CX3A 2BJXA 4IQ1A 3H93A 4GWRA 5HQPA 3DWVA 5ECSA 1JLVA 2F3MA 1PD21 3P8WA 2L4QA 3TDGA 1EGOA 3FY7A 6GSTA 2RUEA 2YWOA 3ZLPA 4KB3A 3GNJA 4YQVA 1XZOA 1YQ1A 2YANA 3VWUA 4N0ZA 4ZBDA 1SJ6A 3FKFA 1M2DA 2X99A 2C3NA 2NTOA 3GSTA 1VF3A 4WF5A 2PPTA 2H19A 1OYJA 1YEPA 3W6GA 1RK4A 3TRQA 1GRXA 14GSA 1K3YA 1AC1A 1EEMA 4MH3A 5D9VA 4PNFA 1JZRA 3SBCA 3R2QA 5J4UA 3HDCA 4NMUA 2M72A 5E59A 5B8AA 2IMFA 3EINA 4G19A 3KXOA 4HJMA 2H76A 5DQYA 1V58A 2NDOA 1O8WA 2NPBA 5H5SA 1R7HA 5JWOB 3QCPA 5D96A 4OFNA 2CVDA 2NBSA 3KM6A 3TKSC 1O7UA 1HNAA 5G30A 3DVXA 1F9MA 2LUSA 2N5AA 1PKZA 4WBRD 4MF5A 1NHOA 2H6XA 5G1KA 2LJAA 3TB2A 2I3YA 4XIHA 1LBKA 3CSIA 2E2MA 1E6BA 5IO2A 1T4ZA 6GSYA 4L5LA 1W4VA 3BOAA 4YAVA 1V2AA 4EDYA 1PSQA 2X64A 3CYNA 3IXRA 4NWYA 5H5QA 3RBTA 5DVBA 1XCCA 1JZDA 2DJ3A 1YF0A 2GTUA 2I1UA 2LSTA 4ZBAA 2CV4A 2YJ7A 3E9JB 1KNGA 4KUNA 5CAXA 1WOUA 2FWHA 4LMWA 2XBIA 5CRGA 1GULA 3L9VA 5B8BA 1H4OA 3WGEA 3LYKA 2R5GA 2VL2A 4FO5A 1J9BA 1K3LA 2G2QA 3TUEA 1GNEA 2XC2A 2WB9A 3ZFLA 5IOWA 11GSA 4MJEA 2QC7A 1TJDA 3RAZA 3S9FA 2E7PA 5ELAA 4PX1A 5IOXA 5A5KA 5KN0A 5IM9A 2O87A 1FO5A 4IELA 2B5EA 4DSRA 7GSSA 4TR1A 1T8EB 2MZCA 3E3EA 3EWLA 1M7TA 4DEJA 1SKSB 4POBA 2GSQA 1GLPA 3DXBA 1GTAA 2VCWA 2VCTA 4FYBA 4O92A 4GQFA 2H66A 3ZL5A 8GSSA 2V6OA 2H71A 3DGQA 2YWIA 3I6AA 1R5AA 3NIVA 3VURA 1T4YA 2VD0A 4RQRA 1YY7A 1Y6EA 4ULXA 4TXVA 1O81A 4DSSA 4ML1A 2GT6A 2O8VB 3HZ4A 4X1UA 2LV3A 1GSFA 4KDUA 4KX4A 4MABA 5EVOA 2PVOC 1SKRB 4JBBA 2V1MA 1NHYA 2GZZA 4H86A 3CXGA 5J9CA 2H1AA 4L5OA 3H1NA 3KP9A 4O5RA 2IWTA 1KBNA 5JCUA 1XXUA 2VLUA 2FHEA 1YZXA 3N5OA 3D6IA 1WE0A 2OKAA 2KLXA 5IMVA 1S3DA 2IFQA 4E8EA 2CQ9A 3GX8A 3FR9A 5F06A 1Z9HA 2PBJA 4RI6A 2LKUA 1FAAA 3D4TA 1TRSA 2VD1A 1ERWA 4N0VA 3I9V2 3M3MA 4HOJA 4X43A 2MMNA 1SK0A 4OO5A 2P31A 5IMAA 4KCAA 2M46A 2C8UA 2CX4A 3TRPA 1EEJA 2H1BA 3G7JA 1GUMA 2C0FA 1EOGA 1Z3EA 4GSTA 3AY8A 3O3TA 1XOAA 4HU7A 3FZ4A 3RHBA 3F6DA 1R4WA 4TR4A 4WXTA 1QGVA 4ZILA 1U6TA 2LEGA 2IMDA 2GGTA 4IVFA 1A0FA 4JRRA 1M2AA 1J08A 2HLSA 2C0DA 4HI7A 3KTBA 1XPVA 1GLQA 3HYPA 4GTUA 4MJAA 1K0DA 4K7NA 1QK8A 1WJKA 4N11A 2YOIA 4IJ3A 4Q5NA 4TXOA 4CDOA 1HQOA 2MBTA 4LL4B 2YPMA 1HNBA 2DJKA 3QD9A 3KD0A 2L5LA 1J0FA 1AW9A 1A0RP 4POKA 4BWQA 2HZEA 2OBKA 4O32A 4I2TA 1K0NA 2K18A 4BA7A 1LJRA 1WMJA 3TKSE 10GSA 3KMNA 2YCDA 1R5PA 1U88A 3L0HA 2WRTA 2HFDA 5IMDA 5ENUA 3ERGA 3EU4A 1UC7A 3GH6A 3LG6A 1MTCA 3EURA 3W8JA 3NOFA 1OVNA 1BAYA 2DJJA 1ZYEA 3PGTA 4PQ1A 1GSUA 3HY2A 4V2NA 5JWQB 1X9SB 5A4VA 3K8NA 1W89A 3LGCA 1V40A 1M9AA 4MDCA 4LMVA 3D4MA 1MDIA 3IA1A 2VOCA 1NSWA 4PGTA 4I5QA 5DAKB 4ECIA 4ID0A 1V98A 2E0QA 1SKWB 4IBPA 2HSYA 1X0RA 1PX6A 1QFNA 2L59A 3PH9A 3TJGA 5B6MA 4HU9A 1AIUA 4CW9A 1B4PA 1DE1A 1SL2B 2MMOA 3ZRDA 3GTUB 5DCGA 5IMZA 3APQA 2VL2C 2F8AA 18GSA 2H74A 1X5DA 3LSZA 5D9XA 3ZIJA 3HA9A 1AXDA 1EZKA 3L78A 2QGVA 1S3AA 4QL9A 2H6YA 2E2GA 3TKRA 2B3SA 1A2JA 2CVKA 2RIIA 2O85A 4KSMA 3UVTA 2H72A 1G6YA 3QAGA 2L6CA 3FYGA 2FD3A 2K6VA 2L6DA 2HE3A 2HXKA 4EVMA 4ZL9A 3IDVA 3TJFA 5FT3A 5C04A 2O89A 4IGJA 1XBSA 4L0WA 2K8VA 3C73A 1K0BA 1GTIA 2WULA 3WYWA 2MMAA 3F63A 1DSBA 3C71A 1O6JA 1TI3A 2KUCA 1VRSD 4MCUA 2WJUA 1SD9A 3GHAA 5IMCA 4MZWA 2FNOA 2ON7A 5ECHB 4ZBBA 1E2YA 1QMVA 3GUSA 1GUHA 5CO3A 1IYIA 3Q74A 1NW2A 2ES7A 4J57E 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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