3HZ8A

Crystal structure of the oxidized t176v dsba1 mutant
Total Genus 70
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
70
sequence length
192
structure length
192
Chain Sequence
PAGLVEGQNYTVLANPIPQQQAGKVEVLEFFGYFCPHCAHLEPVLSKHAKSFKDDMYLRTEHVVWQKEMLTLARLAAAVDMAAADSKDVANSHIFDAMVNQKIKLQNPEVLKKWLGEQTAFDGKKVLAAYESPESQARADKMQELTETFQIDGVPTVIVGGKYKVEFADWESGMNTIDLLADKVREEQKAAQ
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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molecule tags Oxidoreductase
source organism Neisseria meningitidis mc58
publication title Biochemical and structural study of the homologues of the thiol-disulfide oxidoreductase DsbA in Neisseria meningitidis.
pubmed doi rcsb
molecule keywords Thiol:disulfide interchange protein DsbA
total genus 70
structure length 192
sequence length 192
ec nomenclature
pdb deposition date 2009-06-23

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF13462 Thioredoxin_4 Thioredoxin
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.30.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich Glutaredoxin Glutaredoxin 3hz8A00
4L0WA 1XPVA 2VCTA 3PR8A 2F51A 3F0IA 1AQXA 3TOTA 22GSA 2HFDA 1OKTA 3UMAA 4WXTA 2O8VB 3TJBA 5ECPB 4HZ2A 4ECCA 4FIWA 1DE1A 2GZZA 3NZNA 4KA0A 1ON4A 2PBJA 2MMNA 5D73A 3N9JA 4TR3A 2PUKC 2DBCA 4OD7A 1AXDA 1SD8A 2M80A 1XWCA 4BL7A 2LJKA 3FHKA 2C80A 3GSSA 4LLRA 3TCOA 4IN0A 5JCUA 2MBSA 3MAKA 1NM3A 1CQGA 2MMZA 3DKSA 4MJEA 2L4QA 3HJOA 4MJCA 1SYRA 3IAM2 5ECLB 3VK9A 1FVJA 2GQKA 1FG4A 3H4KA 3FR3A 3MNGA 3LEFA 3IAS2 2B5XA 4CHSA 2L59A 1N8JA 3D0ZA 1GL8A 1M2BA 1O73A 4LMVA 1ILOA 3EYTA 1B48A 5COHA 5EL8A 5HR0A 1UC7A 1JZDA 5IMCA 3HCZA 3ME7A 1GTAA 4GSSA 17GSA 3UOMA 4ML6A 1DUGA 2YV7A 2H1DA 4OFMA 1B4QA 2QC7A 4IJIA 4GF0A 3O3TA 5A4UA 1SL1B 2JZRA 3HY2A 2HRFA 1PKWA 3TGZA 3DVWA 3ZL5A 3CSHA 1K0BA 3GHAA 5GSTA 3V1WA 4N11A 3GURA 5IMAA 1S3CA 2NDOA 1X9SB 3UAPA 2H0GA 3JCML 1MDJA 5E4WA 4L5OA 1PRXA 4OFTA 3LORA 3TKSE 2YP6A 1X0RA 4Q5FA 3L9SA 1EEMA 1FO5A 1PQNA 2HNLA 4NV5A 3G9BA 4N0VA 3ZZXA 1G0TA 4WKWA 4XS1A 1GSSA 2VM1A 2H72A 2VD0A 3GKNA 3DRNA 1K0CA 4POKA 1NW2A 4KSOA 3KM6A 2TIRA 2HZFA 4XCSA 5HFGA 3UVHA 1VRSD 2PGTA 4IBPA 5D9VA 1T4YA 2YZUA 1GSYA 2GQLA 5DQYA 1X5EA 2OADA 4ISDA 2E2MA 5AIXA 3TUEA 1A8YA 3I6AA 1TU7A 3ERGA 3WT2A 1HYUA 1XW5A 5G31A 2H66A 3D4MA 6GSTA 1ZYQB 1QXHA 4ZBBA 2C1YA 1ERUA 3VPTA 2AYTA 4XIHA 4LL4B 2WFCA 3L9VA 4POMA 1OC8A 1B4PA 4K8MA 4XRAA 5DCHA 4IHUA 1WE0A 3MDKA 4XRDA 1SL2B 1T4ZA 1FB0A 5C00A 4V2NA 4WETA 5B6MA 3MWHA 4TR0A 2K9FA 4I6XA 1QQ2A 4WR4A 3VPQA 2H0HA 2OA7A 4V2MA 5HQPA 2K8VA 1V57A 1MD4A 3FK8A 4MK3A 4HUAA 1YQ1A 3BJ5A 14GSA 1GSUA 4TKYA 2LRCA 4ZBAA 2CT6A 3HVVA 2FA8A 2OKAA 2IMFA 1T3BA 3H79A 2DJ0A 3L0HA 2NPBA 3ZFBA 18GSA 1GTIA 2RM5A 5KN2A 2IWTA 1KEBA 1CQHA 1B8XA 2C4JA 4XHMA 2WRTA 1YKCA 3IE3A 1YDKA 4KH7A 1EOHA 3IC4A 4TXVA 4GWRA 1BEDA 4MDCA 4ZBDA 3A2VA 1I5GA 3D5JA 1PKZA 1X9WB 4I8BA 5IOWA 5D93A 6GSVA 3HJPA 3IRAA 2PERA 3UBLA 1A2MA 1PX7A 1V58A 2AHEA 3L9UA 3W8SA 1M2DA 2YPMA 2F9SA 4FYCA 1H75A 3QMXA 4MZBA 1XWKA 5B8BA 2H75A 1URMA 4POLA 5ABRA 4IS0A 5GAND 1SKSB 1EV4A 2XPEA 5IMDA 4QL9A 1KBNA 1GSEA 4RUVA 1Z5YE 5DDLA 5DJLA 2IL3A 5IO0A 2B1KA 1TI1A 2HYXA 4WF4A 1TTZA 5EY6A 4ZL9A 2P5QA 1TU8A 5ECRB 2HLSA 1GTBA 2F3MA 2LV3A 3TB2A 5J4UA 3SWLA 2G0FA 3ZIVA 2KLXA 3R2QA 4OO4A 3EVIA 4HEA2 2E7PA 1LBKA 5FWGA 1MDKA 2HE3A 3K8NA 4TXOA 1WMJA 4ECJA 3IK9A 5DBQA 2MMAA 2DJ3A 1OKDA 2R2JA 1SKWB 1J0FA 5CREA 1JFUA 3APOA 4MCUA 3DGQA 4RI6A 4EKZA 1WRYA 5H5QA 3TKRA 3VWWA 2YANA 3LYKA 2L4CA 1PSQA 2NBSA 3BBYA 4KDUA 3DYRA 3TRQA 2O89A 4XS6A 3ZLPA 3IK7A 4L0UA 4MH3A 3GTUA 1ACVA 1K0MA 4ZIJA 3M1GA 3CMIA 3GX8A 3L4NA 5F07A 3CRUA 5CNWA 1F3BA 3KP9A 1XIYA 3KEBA 4AGSA 3LJRA 1ZL9A 4HDEA 2EIOA 2REMA 2YOIA 3EC3A 3WT1A 1TI3A 5CRWA 4KAEA 4HZ4A 3CSIA 3ZVJA 2PPTA 3E3EA 3LSZA 4K0GA 5JWOB 1BX9A 4OO5A 4V1Ap 1M2AA 1GULA 4FYBA 4ILFA 1XW9A 4GQFA 2N5BA 4IVFA 1F9MA 2WCIA 3EE2A 1SK0A 4YQMA 1YEPA 4O7HA 1U87A 1JZRA 2AB6A 1W89A 1RW1A 4IW9A 2DMMA 3C8EA 5FT3A 2D2ZA 2VUPA 3APSA 3HKRA 5G2ZA 1PD21 2FWGA 2J23A 3FR6A 1LJRA 2AV4A 4TXOB 1THXA 1USBA 3M3MA 1M7TA 6GSXA 2P31A 3A2XA 3BD2A 4EL1A 2FHEA 5A5KA 1QUWA 2CAIA 2VCWA 1QGVA 4L5LA 3S9FA 2YJ7A 2HSYA 3L78A 5CAXA 1G6WA 2GQMA 3TKSC 2HZEB 1TK5B 4WF5A 2Z9SA 6GSUA 4RQXA 2PMTA 2K8SA 2CA8A 1XXUA 5IO2A 2G2QA 2VCXA 2QGVA 3WD6A 2H76A 3EURA 1ST9A 4D73A 4JEDA 1ZGNA 4Q5NA 4JR4A 3F4TA 1VF3A 4JZQA 2L6CA 1PL2A 1W4VA 1OE7A 3C73A 2E0QA 2YWOA 4MA9A 2OE1A 2B7KA 1YZXA 1S3DA 3ERFA 3QPMA 3G7YA 3GH6A 2JZTA 2GSTA 2FD3A 3GN3A 6GSYA 3GUSA 3J7Yb 3GA4A 4NAXA 2AJQB 1FOVA 2EIQA 1EWXA 4NPBA 1WP0A 1U3AA 2F8FA 3DVXA 2FY6A 2PVQA 3D22A 3FRCA 1SJZA 2O87A 2WGRA 3I9V2 4I5QA 1Y25A 2FCHA 1GLQA 2XBIA 2I9HA 3KIJA 2M46A 4IP1A 3DWVA 4PGTA 3LFLA 3F4RA 3J7Yk 1V9WA 1AAZA 1V98A 4TVEA 1BYEA 2LRTA 1AW9A 4OCEA 1T1VA 5IPHA 4LA1A 1TP9A 1F3AA 1GUMA 3GL5A 3HYPA 5E59A 4TR1A 5B8AA 3NOFA 5L71A 3NIVA 2CV4A 4LMWA 2H73A 2FWFA 5G5EA 2R4VA 3VFIA 5A4VA 4HJMA 2LRNA 3UARA 2GZPA 1MDIA 3F4SA 2H6YA 4P3YB 3ZITA 4D73B 3C7MA 3ZRDA 2FNOA 3Q18A 5CP1A 4PNFA 3LYPA 2GDRA 4NHWA 4POBA 2KP1A 2L5OA 3VURA 5F06A 3VWUA 2RIIA 2H1GA 3MSZA 5DJMA 1DBYA 1UA5A 4TW5A 3UBKA 3LWAA 3G7IA 3KJYA 2H71A 3HDCA 1G7OA 3QD9A 1X9MB 2LNSA 2VL9A 2ZUPA 2C3QA 4MF5A 2CX3A 2VD1A 3AY8A 4OCFA 1Y6EA 1K3OA 2VLVA 4N30A 2VL2A 1V2AA 3ERWA 3HJMA 1PL1A 1SJ6A 3UJ1A 5ECIB 1Q4JA 4QL7A 2H0IA 1EGRA 3TKPA 2JADA 1PGTA 1QK8A 3TDGA 2XHFA 2GT6A 3U6VA 2GVPA 1UVZA 1T7PB 4HJ2A 2DIZA 1JHBA 2YJHA 1TXXA 2X8HA 4TR1B 1PMTA 5C04A 3O76A 1Z6NA 2ALBA 1A2LA 5CRHA 2R6KA 2H70A 1R7HA 2I1UA 1K0NA 3GKKA 2XPDA 3M0FA 1YF1A 3GIXA 5IM9A 1ERVA 1VF2A 5J41A 3C1RA 4F0BA 3ZVJD 3M9JA 3KH9A 1GTUA 5CO3A 1HNAA 3LXTA 4ML1A 5G30A 3FY7A 2VIMA 1XZOA 2B7JA 4GRFA 3N5OA 1HNCA 1NSWA 2R3XA 1S3AA 2WDUA 3CTGA 2AUVA 1E2YA 1KNGA 2P0GA 3QAVA 3KTLA 2IN3A 4MLYA 2CAQA 3I69A 5IQYA 2FUG2 3BCIA 2I81A 2V32A 1XWGA 3WGXA 4AJ8A 3PH9A 2GT5A 3QAWA 1JLVA 2BJXA 5KN0A 1A0FA 1HNBA 1TJDA 2YWIA 3VWVA 4EF0A 2ZNMA 3ZTLA 5CYYA 3DD3A 4E8HA 3D4TA 4GCIA 5D9WA 5ELAA 4IQAA 3GNJA 2EIRA 3FEUA 5EVOA 3A2WA 1XW6A 5JCGA 2OJLA 2VAFA 1OYJA 2O85A 2GS3A 3IPZA 3ZFLA 1E6BA 4G2EA 4JR6A 1O8XA 2LJRA 1XOBA 2WS2A 1PA3A 1T8EB 2WULA 3FR9A 3GYKA 2GZYA 2DSAA 3VI5A 2HT9A 4MF7A 4Q5QA 3HVSA 3ZREA 1I9DA 5ID2A 4WBRD 3TKQA 3HZ8A 3IOSA 3KTBA 4AF2A 1R5AA 4ZXGA 2LEGA 1XOAA 3ME8A 3CXGA 2LQOA 1YKAA 2GSQA 10GSA 1QMVA 3F63A 3D21A 11GSA 4F2IA 4KDXA 4G10A 1THOA 2RLIA 4K7OA 2LNTA 1WWJA 2V1MA 1FVKA 1ZZYA 3P8WA 1ZCPA 2H6ZA 3GL3A 2A4VA 3EMPA 4KDYA 4Q5RA 3GH9A 16GSA 3RDWA 5HFKA 5CRDA 1GSFA 1QFNA 3EINA 2JSYA 4EDYA 4TN8A 3GSTA 5KN3A 3EU4A 3P7XA 2FWHA 4TRXA 2VCZA 3ZMLA 1GWCA 2C0EA 1PX6A 1G6YA 1LU4A 2N5AA 1Z3EA 20GSA 1EV9A 4I97A 3F3QA 4J57E 1VF4A 1A24A 2WZ9A 3QFBC 3IHQA 3QOUA 2CVDA 3A5WA 2YWNA 2C0FA 2M72A 3QDNA 13GSA 2K18A 3FZ9A 4BVXA 2C3TA 2XBQA 3RPPA 4PX1A 1IYHA 1RK4A 1SU9A 5ID2B 4G9HA 3TJJA 4WEYA 4YH2A 1B9XC 2A2SA 2CQ9A 2IFQA 2HZEA 4G19A 1TRUA 1B9YC 1ZYEA 3ZMKA 2V41A 1SJIA 1AC1A 4NXIA 1GSQA 5EPFA 1K0OA 5LNKe 4ZB6A 4IELA 1FAAA 3IDVA 3UL3A 5B6NA 1DSBA 3GFKA 1A0RP 1K3YA 1Z7PA 1J9BA 5F0GA 5IMFA 1GP1A 1U88A 1HQOA 4PQ1A 2B6MA 3SBCA 3DIEA 5DAKA 2IJYA 2ZCTA 4K0NA 4DVCA 2VM2A 5JWQB 1YF0A 1TW9A 4MF6A 1RQMA 1TOFA 8GSSA 3IV4A 2YWMA 1X5DA 3QR6A 3FYGA 5AN1A 5J9BA 3IXRA 1MEKA 4Z7XA 2V6OA 5IIZA 4E8EA 3US3A 4TR4A 1IYIA 2DJ2A 1H4OA 1R4WA 1C72A 5B7CA 5ECQB 1TK0B 2QKEA 1EGOA 3BCKA 1XVWA 4OWYA 1FHEA 1YY7A 5D96A 3HHVA 1GLPA 1N2AA 4MZCA 3LGCA 2MYGA 2IFQB 1K0AA 2GTUA 2IIYA 7GSSA 3DEXA 2H19A 3M8NA 5DALA 3RHBA 1NHOA 5F8BA 2FWEA 1O8WA 3KMOA 5JWRB 3C1SA 1ABAA 1EP7A 1V40A 5IOXA 4MJBA 5ECNB 2FA4A 3KGKA 1F37A 4GSNA 2AAWA 3EWLA 5DCGA 4RQRA 4MPGA 5DAKB 3TRXA 4K6XA 2DMLA 3F9UA 2DIYA 1U3IA 3P2AA 1JZOA 2WB9A 4OFNA 4TOPA 3WGEA 6GSWA 2HI7A 1JZWA 1AUCA 4K7IA 1GSDA 3IA1A 1HD2A 4F9ZA 4YAPA 4K9ZA 3IBHA 2H74A 3A3TA 5D8IA 3VWXA 1OAZA 1O85A 1X5CA 2C3NA 1OE8A 2DC5A 1BJXA 4EUYA 2GGTA 1ZOFA 4EC0A 4LL1B 2MBTA 4YQVA 3CBUA 3UVTA 4MP4A 2PVOC 1AQVA 1FB6A 2YZHA 4PNGA 1WJKA 5INYA 4EO3A 5JCWA 5H5RA 1Z7RA 2ON5A 1J08A 1WOUA 1ERTA 5DALB 1F6MC 2C0DA 4I2TA 3UEMA 4FH8A 4H86A 4WBJA 2CX4A 3UIWA 5GZZB 1SKRB 4GXZA 4RI7A 1VGLA 2QSIA 2OACA 1GRXA 5IPGA 2B5YA 2OBIA 3ZIJA 4NV2A 2FGXA 2VLUA 5J3RA 1GNWA 4PUFC 2MZCA 2L6DA 5G5FA 2JL4A 4ULXA 3TJFA 2LQQA 4YQUA 4OMVA 3E9JB 1M99A 3TOUA 4CW9A 4HQSA 3EU3A 2RM6A 4AJ6A 3M9KA 5G1KA 4YAVA 2H8LA 4O5RA 2OBKA 5D9XA 2YNXA 2VO4A 4PUAA 4HU7A 4ECBA 4FO5A 2I4AA 1BQ7A 4DSRA 4JU5A 3CSJA 2MMOA 2L57A 2F8AA 2PN8A 5G1LA 3O6TA 4IGJA 3FZAA 2ON7A 1DE2A 3WGDA 3LQ7A 2PWJA 1BAYA 2DJ1A 1ZMAA 2E2GA 3QFAC 2X99A 3APQA 3VI7A 4F82A 1O7UA 2GSRA 3HA9A 4K1FA 3Q6OA 2CVKA 4J56E 1R5PA 3W6GA 2LSTA 3KD0A 4XTSA 2LTKA 4L8EA 4KSMA 4KB3A 5D9TA 4F0CA 2FLSA 2YCDA 1YJ6A 2L5LA 5AISA 2H1AA 4X43A 4HOJA 2KUCA 3C71A 3FW2A 4PXOA 3HZ4A 3ZYWA 3HD5A 3QCPA 2GLRA 3EMXA 4ZL7A 1OC9A 4X1UA 4PURA 3KXOA 3QAGA 3I43A 4N10A 3TKSA 3CRTA 2OE0A 4ZB8A 1XWBA 1MD3A 2B1LA 4ZL8A 2A2RA 4DEJA 3FZ4A 1M0UA 3GKMA 1U6TA 2TRXA 2R5GA 2VOCA 4MPFA 5IMVA 2C8UA 3GRXA 1A2JA 3W8JA 1F2EA 5DVBA 1XVQA 2H30A 1GUKA 1EEJA 5ECKB 2HXKA 4KE3A 1EP8A 5LCZA 1GUHA 4GQCA 3WYWA 4HI7A 4XS4A 9GSSA 1SL0B 4X0XA 5DQSA 3GMFA 4IQ1A 3GX0A 2VL3A 4PQIA 2GSSA 3LXZA 2H1BA 3RBTA 4EE0A 4IP6A 4DSSA 4JRRA 2KOKA 5ECSA 4MABA 2V2GA 2XC2A 1KTEA 2PU9C 2X8CA 2O7KA 1JLWA 3Q19A 4JBBA 3PGTA 5A4WA 5HFIA 1SD9A 3OR5A 3KZQA 2X64A 1TDIA 4O92A 3CTFA 4CDOA 4HU9A 4NHZA 3FZ5A 5ECMB 2LUSA 1OC9B 2JSZA 5HR2A 1EOGA 3E0UA 4F03A 1AQWA 4MH2A 2V6KA 5AIVA 4KX4A 2CZ3A 4ZILA 4ACSA 2VCQA 3PINA 3H1NA 5IMZA 2VCVA 2NVLA 2RUFA 5ECHB 1OC3A 1M9BA 1TRVA 4EVMA 2KP2A 1VF1A 4V1Ag 3GV1A 4XS4B 2LS5A 1AIUA 3GKXA 1WIKA 2WJUA 2CVBA 12GSA 2HSHA 1SENA 2OE3A 2IMEA 2IMKA 4J2FA 4DSSB 1GNEA 1TRSA 3TJGA 5ENUA 5HR3A 3DXBA 2I3YA 2DLXA 1FW1A 3F3RA 3FKFA 2EC4A 3ISOA 5LD0A 3RPNA 4V2LA 4GTUA 1YEXA 4QQ7A 5J5NA 1TRWA 3RAZA 2VLTA 4BA7A 3F6DA 1TKDB 6GSSA 3IR4A 3ED3A 2LJAA 4JE1A 4BWQA 4O32A 1R26A 3P90A 4BWSA 4NWYA 1Z6MA 4K7NA 3KCMA 4MJAA 2K6VA 3Q74A 1SYXA 4IKHA 3U5RE 2N5FA 4GSTA 5FHIA 1TK8B 3KP8A 1GH2A 4KNDA 5ECOB 2B5EA 3RHCA 1G7EA 1O6JA 4KCEA 4KCAA 4DSQA 3HVXA 1UN2A 5HR1A 2R37A 4KW6A 3F6FA 4MMMA 2BMXA 2VL2C 2IPAA 1ML6A 19GSA 3KH7A 5KN1A 5F05A 5AGYA 1O81A 2IMIA 2CZ2A 2J9HA 4ID0A 1K0DA 1BG5A 4EXJA 2RUEA 1WPIA 4MZWA 2IMDA 4WR5A 4NMUA 2BTOT 1ERWA 3CYNA 4BPYA 1XCCA 2H01A 3D6IA 4N0ZA 3HXSA 4K2DA 2X8GA 2JZSA 1OVNA 3F8UA 3G7JA 4KUNA 4ZB9A 3TJKA 5ELGA 3VLNA 2H6XA 4EDZA 1XBSA 5H5SA 3H93A 1A23A 1NHYA 5CRGA 3H8QA 2JACA 4HQZA 2HRNA 2JU5A 4I2UA 2NTOA 5GAPD 3LG6A 4KGIA 2TRCP 3BOAA 1M9AA 1PN9A 4PQHA 2YN1A 1Q98A 1T00A 2P5RA 1SK1A 5KEJA 3DMLA 3KMNA 1MTCA 4ECIA 1XWAA 2DJJA 1A8LA 1Z9HA 2YV9A 2DJKA 4FYUA 3TRPA 2C0GA 5GSSA 2LKUA 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#similar chains, but unknotted
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#similar chains in the pdb database (?% sequence similarity)
...loading similar chains, please wait...
How to cite