3HCZA

The crystal structure of a domain of possible thiol-disulfide isomerase from cytophaga hutchinsonii atcc 33406.
Total Genus 50
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
50
sequence length
147
structure length
147
Chain Sequence
NAPLLLGKKAPNLYMTDTTGTYRYLYDVQAKYTILFFWDSQCGHCQQETPKLYDWWLKNRAKGIQVYAANIERKDEEWLKFIRSKKIGGWLNVRDSKNHTDFKITYDIYATPVLYVLDKNKVIIAKRIGYENLDDFLVQYEKSLKTK
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
publication title The crystal structure of a domain of possible thiol-disulfide isomerase from Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406.
rcsb
molecule keywords Possible thiol-disulfide isomerase
molecule tags Structural genomics, unknown function
source organism Cytophaga hutchinsonii
total genus 50
structure length 147
sequence length 147
ec nomenclature
pdb deposition date 2009-05-06

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00578 AhpC-TSA AhpC/TSA family
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.30.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich Glutaredoxin Glutaredoxin 3hczA00
2L4QA 3EMXA 4XS6A 2IMEA 2H01A 2M72A 1K3OA 19GSA 2YCDA 3CSHA 2VL2A 3M9JA 3UL3A 3LJRA 1GLQA 16GSA 1GH2A 1YEPA 3TCOA 3ZIVA 1O73A 3C1SA 4AJ7A 4KSMA 6GSYA 3UEMA 5CRDA 1VF2A 3P2AA 2HYXA 3QCPA 1EV4A 2IMKA 5IMAA 2LNSA 2CX3A 2DJKA 1ZYQB 1JZDA 4I5QA 2P5QA 2VLUA 2L6CA 3DVWA 5CRWA 4F03A 1JLWA 1K0AA 4HJMA 4PX1A 1E2YA 1BEDA 2OE0A 4E8EA 3DD3A 4MZBA 1Z9HA 2HLSA 5DDLA 1BAYA 3C1RA 2OBKA 4IJIA 4GQCA 1K0OA 2FWEA 2H0GA 4YQUA 3EYTA 2KP1A 1OYJA 1TI3A 2GS3A 3RPNA 2L4CA 3E3EA 3WD6A 3FR6A 5A4UA 1PA3A 3FEUA 4MABA 3HCZA 2JADA 5J3RA 1PKWA 2LRCA 1HNBA 2H0HA 3HDCA 1UVZA 3IR4A 4MLYA 5IMFA 1YEXA 3GH6A 3D4MA 3I69A 2IMDA 3VPTA 2LRNA 5H5SA 2YV9A 1K0CA 4MZCA 1QFNA 4ECJA 3DEXA 3ZIJA 3GL3A 2VUPA 2WCIA 1NM3A 5IM9A 4V2LA 2GQKA 1V2AA 4ECBA 5D8IA 3A3TA 1Z7PA 4IQ1A 3KD0A 5ELGA 4KSOA 1ERWA 2KP2A 2IFQA 3D22A 1WE0A 2C3QA 2XPDA 3JCML 2B1KA 5E4WA 1K3LA 3ME8A 2HNLA 3AY8A 2YWMA 1I9DA 3ERFA 3W8JA 2H76A 4ML6A 4KUNA 2H70A 3UVHA 3MNGA 4RUVA 4HI7A 4XTSA 3CYNA 2OKAA 1A0FA 3KJYA 3D21A 2FA8A 2CVDA 2P5RA 5B6NA 1HYUA 1U6TA 3QAVA 4LL4B 2YWOA 4KDUA 5GZZB 5D96A 6GSWA 3NIVA 4BWSA 2V6OA 4G10A 1BJXA 5HQPA 2GSTA 1G6WA 1JLVA 4JRRA 1A2LA 2FWHA 4CW9A 2LSTA 4OMVA 1XPVA 4GTUA 2BTOT 4G9HA 2E2GA 3TKQA 4NV2A 2MBTA 1SL0B 2LNTA 1JZOA 4HUAA 3KCMA 1EGOA 2GLRA 4IS0A 4OCFA 3HVXA 3KEBA 2ES7A 5ECIB 4PUAA 1B48A 2GZPA 4AF2A 1NHOA 2B7KA 5G1KA 2C4JA 4MF6A 4JEDA 3QDNA 1A8YA 3A5WA 4FYUA 1TKDB 1WP0A 3GKXA 4PXOA 1JZRA 2H19A 3FRCA 3HZ8A 4K6XA 2VO4A 1SJ6A 1G6YA 2AB6A 2FUG2 2YPMA 4OO4A 1KEBA 2AYTA 2VCQA 2WRTA 4ML1A 2YNXA 3GFKA 3TKRA 2FWFA 4LA1A 4KH7A 4HOJA 1XIYA 2V2GA 1TK0B 4GSSA 2JSYA 2GTUA 1MDKA 1PX6A 4PQIA 1XW6A 3M3MA 4OFNA 3RHCA 3TB2A 5ECSA 1W89A 1Z7RA 3FR3A 4ZB9A 1TW9A 4PQ1A 1CQHA 5ABRA 4KDXA 3GSSA 4F82A 2CX4A 3GRXA 2X64A 4Q5NA 1F3BA 1X0RA 4Q5QA 3BBYA 4V2MA 3DMLA 4LL1B 1MDJA 4LMVA 1OKTA 4TXOB 3GUSA 1V40A 1A24A 3TKSC 1TRVA 2VD1A 4OD7A 5KN3A 3UIWA 1OE8A 2F9SA 4NHZA 1EP8A 2B5YA 2L5OA 3ZZXA 3F4SA 3VWWA 3CRUA 3M8NA 4EL1A 1TDIA 3ME7A 3LYKA 1Y25A 4WF4A 3MDKA 3KMNA 1TP9A 2LQQA 4JZQA 1QXHA 1V98A 3HJPA 2YWIA 1Q98A 1GNEA 5IMVA 1M9BA 1RK4A 1K0DA 2WFCA 5IOXA 4KCEA 3WGDA 1SJIA 2PU9C 3HHVA 1M2AA 1GNWA 5F8BA 2CQ9A 4OO5A 3QMXA 4YAPA 3F3QA 4BPYA 1A2MA 4J56E 2PBJA 1ML6A 2HXKA 2CAQA 4MJEA 3GA4A 3LORA 5AGYA 3NZNA 3CMIA 3A2VA 2VCVA 4MJBA 1WJKA 1PRXA 2OA7A 1OKDA 1FAAA 4Q5FA 5HR1A 4EC0A 3TDGA 2DJ0A 5JCGA 4G19A 3LEFA 2JZTA 4IN0A 5HFKA 5HR2A 1ERVA 1ON4A 1XWGA 4V1Ap 2AUVA 2E0QA 3ZL5A 3FY7A 1BG5A 2HT9A 1UA5A 2JL4A 2RM6A 4ISDA 2N5AA 3TJKA 1K0NA 1TJDA 1T8EB 3EC3A 3PINA 1HD2A 2HZEA 2KHPA 2R4VA 1OE7A 4BL7A 3DVXA 3FK8A 3CRTA 4IKHA 1WRYA 3EVIA 3F0IA 4NPBA 2VL3A 3TOTA 3MSZA 3ERGA 4QL9A 2DJ3A 2PMTA 2GT5A 2VCWA 3HYPA 3J7Yb 3EURA 3BCKA 4K8MA 3CXGA 4MZWA 2PPTA 2I4AA 1QK8A 1XZOA 1SL1B 3FKFA 1M0UA 4N0VA 2DJJA 3GSTA 3EINA 1U87A 4ZBBA 3ZYWA 4ZBAA 1T7PB 5CO3A 1M2BA 2WDUA 4HQSA 4JU5A 1ERTA 3UJ1A 4XCSA 1EOHA 4YQMA 4MF7A 3LFLA 1CQGA 3UBKA 2HFDA 4EXJA 2MMOA 3F63A 3BOAA 1SYXA 1PN9A 4X1UA 2JU5A 3GL5A 3ZREA 1FO5A 3C73A 2O7KA 5H5RA 4ULXA 5AN1A 5GSSA 2OE1A 1KNGA 4AJ8A 4FYBA 4XS4B 3VURA 1C72A 2CZ3A 2REMA 3FZ9A 1THOA 4GRFA 1AIUA 4ZBDA 4MCUA 2P31A 2J9HA 4IVFA 2C3NA 3V1WA 1R4WA 2KUCA 2R6KA 1QMVA 2VLTA 1TK5B 2LRTA 4RQXA 3H8QA 3A2XA 5J9BA 1XBSA 3TJFA 1SU9A 5F07A 1ZCPA 3Q19A 3U6VA 4IHUA 1ZZYA 2NTOA 4IP6A 3LGCA 4EF0A 4L5LA 2PERA 1SKWB 5DQYA 4I97A 4D73B 3IK7A 2FA4A 1RW1A 2ALBA 4PUFC 1S3CA 5EPFA 1OC3A 3DYRA 1ABAA 4TXOA 3VLNA 2IWTA 2JZRA 2IJYA 2XC2A 4KCAA 4RI6A 3FR9A 1J08A 4L0UA 1SKSB 2LEGA 2K18A 1BQ7A 3HJMA 3WYWA 2VL2C 4GXZA 3IAM2 4TVEA 3NOFA 2L5LA 1TK8B 9GSSA 1S3DA 2C0EA 4J57E 1XWAA 2GSSA 2CT6A 4IW9A 3ZTLA 1O8XA 1N2AA 4MJCA 2DC5A 5ECRB 2RM5A 3ZMLA 1AXDA 4L8EA 4HQZA 3I43A 2H66A 4I2TA 2K9FA 1PGTA 2M46A 2YZUA 2ZNMA 4TOPA 2B5EA 1PMTA 1PX7A 3LQ7A 1OC9B 3F3RA 3M0FA 2GZYA 1K3YA 3ED3A 3KTBA 4EVMA 4TR0A 4KNDA 2A2SA 6GSUA 2YJ7A 2PWJA 3IAS2 5DVBA 3HKRA 5IOWA 4HJ2A 3C71A 4ZILA 1ZGNA 4ECCA 2Z9SA 5KN2A 3F8UA 3KMOA 1HNAA 2WS2A 3FYGA 3VFIA 2P0GA 5IMCA 4GF0A 4KDYA 2I3YA 1BYEA 2VCTA 5AISA 3APSA 1A8LA 4N10A 5G30A 1B8XA 1QGVA 3G7YA 2HSYA 5DCHA 2H30A 1XWBA 2FGXA 1MTCA 3G9BA 1FW1A 4WF5A 14GSA 2R5GA 2AAWA 2GSRA 3DWVA 4ILFA 3UAPA 2IMIA 2C80A 4V1Ag 1ZYEA 1F37A 3UBLA 2DIZA 1LBKA 1THXA 2MMAA 4Z7XA 2WGRA 4MMMA 3HD5A 3QFBC 4FH8A 2NDOA 4F9ZA 3L9UA 3IXRA 5DJLA 3TJJA 4POMA 3UVTA 1K0MA 2ON7A 3CTGA 1VF1A 4EE0A 3KTLA 5G2ZA 3TOUA 1X5EA 2X8GA 1V9WA 2MYGA 2H1DA 4FO5A 3DIEA 2OACA 3BCIA 5JWRB 1DBYA 1W4VA 1GSQA 2V1MA 1M7TA 3GTUB 4NWYA 5DAKA 2DIYA 4OWYA 4K7OA 2B7JA 4JR6A 1R26A 3LG6A 1WIKA 4IJ3A 1IYIA 5ECHB 1M2DA 3D0ZA 3LSZA 3DXBA 1F9MA 1LJRA 4DSSB 4X43A 5F05A 1F3AA 3IDVA 1YJ6A 2PVQA 4CDOA 4GCIA 3LYPA 3UARA 4WEYA 1O7UA 5DALB 2D2ZA 1SENA 3BJ5A 4F2IA 2YP6A 2OJLA 4D73A 3ZRDA 4DSQA 4RQRA 1USBA 2L6DA 2K6VA 4K9ZA 4V2NA 4IQAA 4PNGA 4IBPA 2HI7A 5G5FA 5GAND 3ZMKA 1YF0A 2VM2A 1GP1A 2H0IA 2E2MA 2C0GA 2NBSA 2PUKC 3KZQA 3W8SA 4ZB8A 1F6MC 1B9YC 3E9JB 3TJGA 1YKCA 1GTAA 5DBQA 1MD3A 3DGQA 5B8AA 4GSNA 1OC8A 5CNWA 4ZXGA 1XXUA 2VD0A 5J4UA 1WMJA 1XVQA 1PD21 1XVWA 6GSTA 2XHFA 1O6JA 2AHEA 4LMWA 1F2EA 3OR5A 1AW9A 1A23A 4GSTA 1NHYA 2KOKA 5D9XA 4GWRA 3KIJA 5IIZA 2MZCA 1AUCA 3N9JA 1NSWA 1HNCA 3QOUA 3TRXA 4CHSA 4ZIJA 1OC9A 2VL9A 2ON5A 5J9CA 1GUMA 1ILOA 3RHBA 2B1LA 2X8CA 2EIQA 2HRFA 2C1YA 1YQ1A 2RUEA 4F0CA 1T1VA 1ZL9A 2JSZA 2CVKA 2TIRA 2AV4A 2VOCA 2QSIA 4K2DA 5ECMB 5ECNB 3SWLA 4KAEA 5D9WA 4MH2A 5D73A 3GKKA 4WXTA 1PQNA 1FVKA 2GSQA 3D6IA 3QAGA 4EKZA 5B6MA 1VF4A 1Z6NA 3L0HA 5F0GA 2O87A 3D5JA 3F4TA 4WKWA 4YAVA 2WB9A 1GSDA 5H5QA 2H6XA 2FHEA 3VWVA 3GX0A 1JHBA 3FZAA 4EO3A 4BA7A 1MDIA 1YDKA 1XOAA 3VI7A 2JZSA 1OAZA 5C04A 2BJXA 2O85A 3A2WA 2GT6A 5F06A 3C8EA 22GSA 3L4NA 2CA8A 1GUKA 3WT1A 4ZL8A 5IPHA 4YQVA 6GSSA 4TXVA 1SD8A 5J41A 3IV4A 1B9XC 4IGJA 2ZUPA 2LV3A 1TRSA 4L5OA 4AJ6A 4MDCA 1SYRA 3IPZA 1WOUA 3M1GA 5EVOA 2CZ2A 4NHWA 4NV5A 3H79A 4TR1B 2VCZA 4MPFA 2YJHA 4JBBA 2YZHA 3W6GA 1T4ZA 2VLVA 5ELAA 3ERWA 1UC7A 3KXOA 2I9HA 1KBNA 1M99A 3FZ5A 3RAZA 3TKPA 4TRXA 1LU4A 2V32A 4RI7A 2F51A 3IBHA 2X8HA 4K7IA 4EDYA 5JCUA 3L9SA 3GTUA 5G5EA 1AC1A 1A2JA 3RPPA 2XBQA 4LLRA 3GHAA 4MJAA 2GGTA 5A5KA 3R2QA 4HZ4A 2WZ9A 1FG4A 1QUWA 2GDRA 3PGTA 1EWXA 1BX9A 2H1AA 1T3BA 2X99A 2C0FA 1EOGA 3H4KA 3QD9A 1XFLA 1FHEA 5DALA 5HR0A 3H1NA 1Y6EA 2VIMA 2VCXA 4QL7A 1ST9A 1GTIA 1B4QA 1XWKA 1T4YA 3KP9A 3O3TA 5ECPB 1GSYA 5CP1A 3J7Yk 2N5BA 1T00A 2K8SA 1XCCA 3O76A 2YN1A 3H93A 1TRWA 2LQOA 1GSSA 1H75A 4PURA 4EDZA 5DJMA 3ZFLA 2EIRA 1FB6A 1V57A 1M9AA 2YOIA 5IO2A 1X5CA 1K0BA 3ZVJD 4GLTA 3E0UA 2H75A 3LWAA 2PGTA 1AQVA 2I1UA 2PVOC 1TI1A 1B4PA 5FWGA 2LJKA 3TJBA 1H4OA 3TUEA 1XOBA 5GSTA 1FB0A 2GZZA 3WGXA 1WPIA 4OCEA 3F6DA 4I2UA 4KE3A 3N5OA 2DJ2A 3HY2A 2DJ1A 4H86A 5KN1A 3P8WA 4HDEA 1GSEA 1U3IA 4K0GA 2V41A 4ACSA 5ID2B 12GSA 2WJUA 4MH3A 3HVVA 3TRQA 5C00A 4XRDA 1UN2A 1PL1A 1GSFA 2I81A 2B3SA 4POBA 4ID0A 3IA1A 3G7JA 4WR4A 4I6XA 3M9KA 2RLIA 3IOSA 1GWCA 1XWCA 1Z6MA 1IYHA 2V6KA 5CYYA 2L59A 6GSVA 4NMUA 3F6FA 2L57A 1Q4JA 2FWGA 2GQMA 1SK0A 4L0WA 2LS5A 2XBIA 3U5RE 3QAWA 1S3AA 3D4TA 1O81A 1NW2A 1YKAA 2F3MA 2H1GA 2BMXA 2G2QA 4KB3A 3K8NA 3KH9A 1O8WA 1J9BA 1SD9A 2R2JA 2ZCTA 3Q74A 4TR3A 1EEMA 3LXTA 2LTKA 1ZOFA 3F4RA 5ECLB 2G0FA 3CSIA 1ACVA 1SKRB 3IRAA 5IMDA 2J23A 1DE1A 4I8BA 17GSA 1EZKA 3LXZA 1GUHA 2DMMA 1TU7A 2R3XA 2OBIA 4MPGA 3TGZA 5B8BA 2GQLA 4F0BA 1GULA 2HZEB 5LD0A 1TRUA 2NPBA 3QPMA 5EL8A 2OADA 3CTFA 5ECOB 2N5FA 5G1LA 2EIOA 1YF1A 4TR1A 2QGVA 4BVXA 3US3A 4BWQA 4N30A 8GSSA 2FCHA 5DQSA 3S9FA 4J2FA 4YH2A 5ECKB 5A4VA 1E6BA 1J0FA 1EV9A 2B6MA 1ZMAA 2WULA 5KN0A 1XW9A 5CRHA 4XRAA 2DBCA 5GAPD 5A4WA 3FW2A 2LKUA 3PH9A 1JFUA 1G0TA 1I5GA 1R7HA 4XS4A 3Q6OA 4Q5RA 3KH7A 3MWHA 4K1FA 2OE3A 4PNFA 1GRXA 3EMPA 4HEA2 3VWXA 3GX8A 3GKNA 2A2RA 2K8VA 2LJAA 1VRSD 1R5PA 1TXXA 2M80A 1X9MB 1X9WB 4JE1A 1JZWA 2R37A 3ZITA 1SJZA 1GTBA 2B5XA 4N0ZA 5AIVA 5CAXA 3ZVJA 1TOFA 3VI5A 2YWNA 4NAXA 1A0RP 3WT2A 1PKZA 1GSUA 4PQHA 1GL8A 3VWUA 2HZFA 5L71A 2IPAA 3TKSA 4TR4A 2F8FA 1G7EA 5EY6A 1DE2A 1SK1A 2CAIA 3EU4A 5JCWA 4ZL9A 2H71A 5JWQB 5D9TA 1XW5A 4KX4A 3BD2A 5ECQB 3EU3A 3UOMA 1FOVA 2F8AA 4TW5A 2HSHA 2TRCP 5ENUA 5IQYA 1AQWA 2CV4A 3DRNA 4HU7A 2EC4A 2FLSA 1SK2A 2H1BA 4POKA 1FVJA 2IIYA 4JR4A 5HFIA 2AJQB 3F9UA 2HE3A 4OFMA 1U3AA 2NVLA 3EE2A 4X0XA 4BVYA 2IN3A 2MMNA 1VF3A 13GSA 3HVSA 3GH9A 3GYKA 3IE3A 5HFGA 2MMZA 2O89A 2A4VA 4K0NA 5ID2A 1U88A 3CSJA 3CBUA 20GSA 3C7MA 4GQFA 1DUGA 2DMLA 3EWLA 4IELA 3KGKA 1PSQA 1MEKA 2H6YA 4XIHA 2LUSA 1WWJA 3KP8A 4DSRA 5G31A 1AQXA 2C3TA 4O7HA 3WGEA 1X9SB 2H73A 7GSSA 4MA9A 3HZ4A 5COHA 2RIIA 3RBTA 4PGTA 1X5DA 4XHMA 2YANA 3SBCA 5CRGA 2HRNA 2H72A 2QC7A 3O6TA 2CVBA 2PN8A 1HQOA 5FHIA 1R5AA 2H6ZA 5FT3A 2O8VB 2YV7A 4NXIA 1URMA 1AAZA 1VGLA 2VAFA 4KGIA 5IO0A 4N11A 11GSA 1RQMA 2IFQB 1N8JA 3PR8A 3KM6A 2TRXA 3FZ4A 5DCGA 3APQA 2JACA 3IHQA 6GSXA 2H74A 2QKEA 3UMAA 18GSA 4K7NA 3ISOA 4DEJA 3L9VA 2MBSA 2VM1A 3P7XA 4WR5A 3TRPA 1EGRA 3GMFA 3Q18A 2FY6A 1Z3EA 5B7CA 1MD4A 2DLXA 2FD3A 4IP1A 5D93A 5IMZA 1TTZA 4XS1A 5CREA 4HZ2A 1DSBA 4ZB6A 3GIXA 1TU8A 3GNJA 4P3YB 5KEJA 4E8HA 4FYCA 1V58A 4ECIA 3IC4A 2RUFA 4ZL7A 4OFTA 5D9VA 3IK9A 1Z5YE 3HXSA 1EP7A 3GN3A 1PL2A 3G7IA 3GV1A 1SL2B 4O5RA 2LJRA 4MF5A 4KW6A 4TN8A 3VPQA 3TKSE 3FHKA 1G7OA 1OVNA 3HJOA 3L78A 4TKYA 5JWOB 5HR3A 3RDWA 4MK3A 2H8LA 1O85A 3APOA 4G2EA 4HS1A 2C0DA 4WBJA 1GLPA 1KTEA 4O92A 3GKMA 5J5NA 1GTUA 4AGSA 1ERUA 1EEJA 5LNKe 3VK9A 4POLA 2XPEA 3MAKA 5LCZA 2KLXA 3I9V2 5AIXA 5IPGA 2C8UA 1YY7A 1YZXA 4MP4A 4DSSA 3P90A 4KA0A 4FIWA 3ZFBA 3DKSA 3ZLPA 4DVCA 2GVPA 4WBRD 5DAKB 2IL3A 10GSA 2DSAA 1QQ2A 3QR6A 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chains in the Genus database with same CATH superfamily
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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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