3UIWA

Zebrafish grx2 (apo)
Total Genus 31
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
31
sequence length
110
structure length
110
Chain Sequence
PGLSSSACGQFVQDIVSSNCVVIFSKTTCPYCKMAKGVFNEIGATYKVVELDEHNDGRRLQETLAELTGARTVPRVFINGQCIGGGSDTKQLHQQGKLLPLIEQCRPCCL
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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molecule tags Oxidoreductase
source organism Danio rerio
publication title A New Mode of Iron-sulfur Cluster Coordination in Glutaredoxins is Crucial for Axonogenesis
rcsb
molecule keywords Glutaredoxin 2
total genus 31
structure length 110
sequence length 110
chains with identical sequence B
ec nomenclature
pdb deposition date 2011-11-06

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00462 Glutaredoxin Glutaredoxin
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.30.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich Glutaredoxin Glutaredoxin 3uiwA00
3ZREA 2VM1A 4BVXA 4TXVA 3ZL5A 3QR6A 3DKSA 4HJ2A 2O7KA 3IE3A 3BD2A 3LFLA 1JZOA 3GKKA 4K1FA 3ZFLA 4WBRD 2C0EA 1BJXA 4OD7A 2YWNA 3TOTA 2C80A 3HKRA 5A4WA 2V32A 2L5LA 4TN8A 4RUVA 3HVSA 2RM5A 1MDIA 2AAWA 7GSSA 2GZPA 3WGEA 1DE2A 2B6MA 1PQNA 1E2YA 2GGTA 4KCAA 4ZBDA 2DJJA 3GNJA 4L5OA 4JZQA 22GSA 3WD6A 5D9XA 2HLSA 3M0FA 2DC5A 1K0AA 3HA9A 4XRAA 5KN0A 4G10A 1AIUA 3ZIVA 5GSSA 1O73A 5CAXA 3DGQA 3ED3A 1K0OA 4X43A 4BWQA 9GSSA 5G30A 2X64A 2O87A 4DEJA 1TTZA 2IFQB 4GSNA 1I9DA 1A8YA 1Y6EA 1TK8B 2ON5A 4Q5RA 1FO5A 1PRXA 5DALA 2DBCA 4O7HA 5JWRB 5ECQB 3DMLA 2CX3A 4JU5A 2VCVA 1A24A 3E3EA 18GSA 2VL2A 1EP7A 2A2RA 2H75A 3M9JA 1B9YC 1YY7A 1ERWA 3ERGA 5CREA 5CNWA 1AUCA 1OE8A 3LWAA 4GLTA 3ZRDA 1U3IA 1O8WA 1XFLA 2GSSA 4G9HA 1BYEA 3QAGA 4QQ7A 4MF7A 1UN2A 4IP6A 1FHEA 2LNTA 4QL9A 4L0UA 2C3TA 3F4RA 3IXRA 3GL5A 3A2XA 2XPEA 2QKEA 1H75A 1XBSA 5DVBA 4MH2A 1TJDA 4J2FA 1PKWA 5ENUA 4IS0A 2CA8A 3PH9A 3F4SA 3G7YA 3HDCA 4GRFA 5CRGA 4MPFA 4D73A 2QC7A 1F37A 3GX8A 4DSSB 3P7XA 4EVMA 5HFKA 3KD0A 4MCUA 2DMMA 4OCFA 1NW2A 3SBCA 3GRXA 1YF0A 2K18A 3U6VA 5HR3A 3TKRA 2N5BA 2H1DA 2HZEB 5CO3A 2B5YA 1XWAA 2VCWA 1A0RP 3FEUA 4TR3A 3R2QA 4TVEA 4DSRA 1MD3A 2QSIA 4HUAA 3CTFA 3QMXA 2RUFA 2AB6A 6GSSA 4Q5FA 3GMFA 5C04A 2HYXA 3KP9A 4N10A 1TRUA 3VLNA 4EE0A 1A2MA 2CX4A 2WDUA 3W8SA 5D9WA 2XHFA 4L8EA 2O89A 1MDJA 1M7TA 3UOMA 2H66A 1VF3A 2H6ZA 1GULA 2TRCP 4TXOA 1XW9A 3M3MA 4HI7A 1GTBA 2VCQA 5FT3A 2WB9A 4GF0A 5G2ZA 12GSA 1XOAA 2K9FA 1YEXA 3IC4A 2RIIA 3TKQA 2GT5A 3DVXA 2CZ2A 2MMNA 4OO4A 4X1UA 1LU4A 3N5OA 1K0MA 1H4OA 2YJHA 1X5DA 2EC4A 3H8QA 5DAKB 2YPMA 1Z5YE 4FYBA 5JCWA 2JSYA 3F9UA 2I9HA 3IRAA 3C73A 3TKSC 3TRQA 3HXSA 1U88A 1VF2A 4J57E 2PVOC 2F3MA 4OFTA 4DSQA 4OO5A 2V6OA 1IYHA 3VI7A 2VCZA 4KB3A 5IOXA 5GSTA 3O3TA 3FZ5A 1XWBA 4V1Ap 4RQRA 2P0GA 4IW9A 3ZVJA 4HDEA 5H5RA 2VL9A 3VURA 4IVFA 5CRHA 1G0TA 2VLTA 1MTCA 2MMOA 4K7IA 1EZKA 4EUYA 4MA9A 3NOFA 4ZB9A 3TJKA 4IHUA 1F6MC 4BPYA 3MAKA 2VIMA 3N9JA 5IPHA 1FOVA 2IMDA 4HEA2 4ZL8A 3Q6OA 1KBNA 2E0QA 4FIWA 2HI7A 3D0ZA 2WS2A 1GUMA 4MJEA 1ABAA 1SK1A 1QGVA 3LSZA 4KUNA 4MABA 3A3TA 3UIWA 3FK8A 5JWOB 4HQSA 2V6KA 3PR8A 4G19A 2LUSA 3CBUA 3FZ9A 2NPBA 2YWIA 3C8EA 3US3A 5ECNB 3ZITA 1EEJA 4ECJA 4NHZA 1OC9B 5ID2B 1V58A 5HR1A 4ACSA 4ISDA 4IJ3A 2PPTA 4KNDA 2FGXA 5IQYA 3CXGA 4FH8A 1B9XC 4OFNA 1SJZA 1YEPA 4WXTA 1YJ6A 5COHA 4V1Ag 3KXOA 1K0DA 3LORA 3GTUA 4ZL7A 3QFBC 1XZOA 4QL7A 1FG4A 3ERWA 2PBJA 2YV7A 4GXZA 3DD3A 4XS6A 3FKFA 1SD9A 2MZCA 4KCEA 3VWUA 2JACA 3P90A 2VOCA 1A0FA 3GH9A 4JBBA 1F3AA 5IMAA 3O76A 3GA4A 4XCSA 2PU9C 4MJBA 2FUG2 4KDYA 5CYYA 4BVYA 5A5KA 3GH6A 1JZDA 1TRWA 4LA1A 3KM6A 2VCXA 4K7OA 3H93A 2FHEA 3TGZA 1X0RA 5EL8A 3IK9A 4P3YB 3TDGA 4EDZA 4JR4A 5ECHB 3F4TA 1R5AA 4ZIJA 2NBSA 5LCZA 1DSBA 2JZSA 4K2DA 3F3QA 4WBJA 4FYUA 4AF2A 1EOGA 2HRFA 2CVKA 3I9V2 4MMMA 3A5WA 4K6XA 2YNXA 4I2TA 2I1UA 1CQHA 2GS3A 3RAZA 2H1GA 3BCIA 4YQVA 1EGOA 4PUAA 2RM6A 3EMXA 4ZB8A 5G31A 3DXBA 2EIOA 2DSAA 2OACA 1OVNA 1BX9A 4LL4B 4E8EA 1USBA 3C71A 1T00A 3VWVA 2H1BA 5ECOB 4I6XA 2N5AA 3GL3A 2GZYA 1ZOFA 1TDIA 4GTUA 2D2ZA 4MK3A 1GLPA 2M80A 1X9MB 4F82A 2ALBA 3GSSA 5IO0A 1EEMA 1K0NA 3FR6A 1ILOA 2DLXA 5DALB 2CT6A 2DMLA 1R5PA 3BJ5A 2OBKA 1FB0A 1XW5A 3GSTA 4FYCA 2CAIA 5D73A 2V1MA 4KW6A 5KEJA 2WCIA 4K9ZA 4Z7XA 4V2MA 1ERUA 1ZMAA 3TUEA 1VGLA 1EWXA 1JFUA 2DIYA 3GX0A 1NSWA 1GUKA 2H8LA 5IMFA 1B4QA 2YZHA 1M9BA 1WPIA 2WFCA 3U5RE 1AC1A 3S9FA 1GP1A 5H5SA 1K0CA 4MF6A 4TR1A 3ZLPA 2C0FA 1WIKA 2OKAA 2B1KA 3MWHA 5G5EA 4MF5A 1V98A 2OBIA 4L0WA 2H0GA 5ECLB 5G1LA 2K8SA 3K8NA 1T8EB 3KIJA 1GSFA 2YP6A 4D73B 1ZYQB 3EVIA 4NMUA 5ABRA 2R3XA 2B5EA 4NV2A 4PUFC 1G7OA 1TI3A 3CSJA 1O85A 1K0BA 3Q74A 1Y25A 1J08A 4V2NA 3DYRA 2GQLA 1PL2A 2AYTA 2B7JA 3EC3A 1EV4A 1TU7A 5DCGA 1FVJA 4IBPA 1A2LA 3LJRA 1DUGA 4O32A 3L9VA 1OC8A 4NV5A 1GSUA 2F9SA 1EV9A 3UJ1A 3SWLA 2OA7A 3GUSA 1XWGA 5DQYA 4EF0A 5HQPA 4PX1A 1G7EA 1S3DA 5ECRB 1NHOA 4WR5A 3QDNA 1F3BA 4MDCA 5F06A 2YCDA 10GSA 4ZXGA 3DIEA 2P5RA 3ZIJA 6GSUA 5J5NA 2YJ7A 3FR9A 2WZ9A 3WT2A 3QOUA 2YANA 1SJ6A 1WWJA 4XRDA 3QAVA 2H72A 6GSTA 4ECCA 2FWEA 13GSA 1Q98A 4TXOB 5DJLA 4L5LA 2XBIA 4IJIA 2AUVA 1ZZYA 4BWSA 1SL2B 1TI1A 3KJYA 1ZYEA 5IIZA 2CVDA 2OE0A 3ERFA 4EKZA 1ML6A 4O5RA 4TR0A 1GH2A 1TU8A 3GV1A 2DJ3A 2V2GA 2LJKA 3I43A 5ECIB 3PINA 1TKDB 16GSA 1YF1A 1DBYA 4ID0A 1QUWA 4J56E 2X8HA 3EINA 2KLXA 5L71A 1CQGA 3TJFA 2KP2A 1O7UA 3FHKA 1A2JA 3VFIA 4K0GA 3GKXA 3Q19A 1R4WA 4AJ8A 1FAAA 4POMA 4NPBA 5D96A 3GYKA 5EPFA 4WEYA 2YV9A 2MMAA 5CP1A 1GSSA 1A8LA 4HOJA 2P5QA 4AGSA 1HNAA 14GSA 1HNBA 3EYTA 1HD2A 4HU7A 4MPGA 3UAPA 4K8MA 3D21A 4PQ1A 2ZNMA 1WMJA 3QAWA 1Z7PA 2OADA 1KEBA 2HFDA 1FW1A 5E4WA 1EP8A 2DJKA 1TRSA 3L9UA 3TB2A 2J23A 2GLRA 4N0ZA 1TW9A 3C1SA 3DEXA 4POBA 5CRDA 3HD5A 5D8IA 3FZ4A 3IK7A 2PGTA 3MSZA 4TW5A 2IIYA 6GSYA 2HNLA 4F0CA 1X5EA 4IGJA 2LTKA 4O92A 3QD9A 4N30A 4YQMA 5LD0A 1ZL9A 5IMCA 4WR4A 3E0UA 3G7IA 1PSQA 3KP8A 1MD4A 19GSA 5AGYA 4TKYA 3RPNA 2GSTA 3IDVA 3UL3A 1YKAA 3HZ8A 4G2EA 2FWFA 4F03A 2RLIA 1X5CA 3VPQA 3HY2A 2C3QA 2XPDA 5J9CA 1O81A 1GL8A 1MDKA 3EU3A 5AIXA 3D4MA 1GSEA 3C1RA 5IOWA 2HSYA 2CVBA 3E9JB 2CV4A 3H1NA 1K3YA 1WOUA 4WF5A 1UC7A 3H4KA 2IMKA 3L9SA 2LNSA 3FR3A 11GSA 8GSSA 2H74A 3GTUB 2HZEA 3TJBA 3GHAA 2MYGA 3IV4A 5KN1A 2I3YA 1PD21 5B8AA 3FW2A 4DVCA 3TOUA 2NVLA 2FA8A 1FB6A 1QK8A 5IMDA 2GT6A 4HZ4A 3QPMA 3V1WA 2CQ9A 4K0NA 3LGCA 3KTBA 2LRCA 3TJJA 3J7Yb 4CHSA 2GVPA 3H79A 3QCPA 3MNGA 2V41A 3CSHA 2ZUPA 1MEKA 3G7JA 1BEDA 2H19A 2KP1A 4X0XA 3TCOA 3F63A 3KH9A 3PGTA 5IO2A 4IELA 1EOHA 4TOPA 1F2EA 5ELGA 1U87A 5A4VA 4AJ7A 2K8VA 1B4PA 5KN3A 1XVQA 2LV3A 1AQXA 5F05A 2R37A 2YOIA 1JHBA 2E7PA 1QFNA 3I6AA 3M9KA 1JLVA 2L6CA 5J3RA 3Q18A 1XIYA 5DAKA 2F8FA 1XWCA 3ZFBA 1SL1B 2HT9A 3KCMA 1TP9A 3GIXA 4OMVA 4JEDA 1E6BA 1QMVA 4IKHA 2IMEA 5E59A 3HZ4A 3IPZA 2LRTA 3AY8A 2LSTA 2VUPA 4YH2A 3UBKA 3APSA 2KUCA 2C4JA 2C8UA 4MZCA 1VF1A 2FWHA 2QGVA 1THXA 2L4QA 1TOFA 1GTIA 4LMWA 2O85A 1PX7A 2B3SA 2LEGA 5AISA 2ES7A 3J7Yk 2JU5A 2ZCTA 3KZQA 3APQA 1WE0A 2PMTA 3HCZA 1ERTA 3D22A 2PN8A 1BQ7A 2FWGA 5HFGA 1R26A 4XS4A 2MBTA 2PUKC 3G9BA 3WGDA 3HJPA 1WRYA 3KGKA 3HJOA 4TR1B 2CAQA 4I97A 5KN2A 2HSHA 4AJ6A 4ECIA 4IN0A 3CMIA 5B6NA 2MMZA 4KGIA 2AHEA 4LMVA 5GZZB 4KDXA 1EGRA 2L57A 4WKWA 4HZ2A 4POLA 5ID2A 2PVQA 5GAND 4PQIA 5JCGA 2DJ0A 1C72A 3TJGA 2YWMA 2HRNA 4F0BA 1T4ZA 5J9BA 2HXKA 2CZ3A 2P31A 1XXUA 3EE2A 5LNKe 5JWQB 1IYIA 4RI7A 3HHVA 3OR5A 1JZRA 5B6MA 3UARA 2VLVA 1X9SB 4XS1A 2Z9SA 1PMTA 4EC0A 1GNEA 3VWWA 4IQ1A 1VF4A 1BG5A 5EY6A 4XTSA 4XIHA 1VRSD 4KA0A 1LJRA 4RI6A 5F8BA 2K6VA 3DRNA 4BL7A 1W4VA 3IAM2 5JCUA 1SKRB 1XW6A 2YN1A 2C0DA 2H0IA 1SJIA 3IA1A 2BJXA 3BCKA 1LBKA 4MJCA 1OC3A 1J9BA 3HVXA 3CTGA 1I5GA 4MZBA 1TRVA 4ECBA 5B7CA 2WGRA 2GSQA 3FY7A 2AV4A 4E8HA 3GKMA 4HU9A 3LQ7A 4YAPA 2RUEA 2TRXA 3P8WA 2LJAA 3ZZXA 3EURA 2I81A 1AAZA 5D93A 1QXHA 2O8VB 3HVVA 3VK9A 3ZTLA 2M46A 5IM9A 5GAPD 2JSZA 1GSYA 1B8XA 4PGTA 4MJAA 3A2VA 3CRTA 3VI5A 5J4UA 1M99A 3F0IA 1OYJA 5CRWA 2X8GA 2LQQA 2IMFA 3IHQA 3CSIA 1AQWA 4GWRA 2M72A 3LXZA 2VL3A 2C3NA 5DBQA 1OKTA 1SD8A 2HZFA 1SK2A 3KEBA 4GSSA 2G0FA 2VM2A 4KSMA 1KTEA 2B5XA 1SL0B 3D5JA 2ON7A 2H6XA 2GTUA 3KMNA 4TRXA 2VCTA 2HE3A 1QQ2A 2B1LA 3M8NA 3EU4A 5ECPB 1T1VA 4F9ZA 2EIQA 5ECMB 2LJRA 5AIVA 1GLQA 1XCCA 1YQ1A 4MP4A 4OCEA 4BA7A 1T3BA 1ON4A 4KE3A 1ST9A 2EIRA 4GSTA 3TKSE 5DQSA 3L0HA 4LLRA 3IOSA 2JZRA 6GSXA 2AJQB 1RQMA 5ELAA 3VPTA 4JE1A 1SYXA 2X8CA 3O6TA 3KMOA 3TRXA 2NDOA 3EMPA 4NWYA 2JL4A 1PGTA 2IN3A 3FYGA 4GCIA 5B8BA 1T4YA 4HQZA 1Z7RA 2H71A 3EWLA 4GQFA 4WF4A 4CW9A 1SENA 4EDYA 2DJ1A 1PL1A 3UMAA 3LEFA 1NM3A 3WGXA 1N8JA 2VO4A 3BOAA 4POKA 2FD3A 3FZAA 3IAS2 4RQXA 1XPVA 4ZBAA 2C1YA 2OE1A 3ME7A 3LXTA 1GWCA 4KX4A 1GRXA 5G5FA 2IFQA 1SKSB 2L5OA 1M2DA 1NHYA 1N2AA 1SYRA 1AW9A 4N11A 2IPAA 2L4CA 3VWXA 1JLWA 5FHIA 17GSA 5IMVA 5DDLA 4NHWA 2WULA 1GTAA 1OKDA 1W89A 4PNFA 1ZCPA 2TIRA 1ZGNA 1M2BA 1F9MA 3A2WA 2IL3A 1A23A 4IP1A 1Z6MA 1GTUA 2IJYA 2KOKA 2H01A 6GSWA 1PN9A 3GKNA 3DVWA 4H86A 1JZWA 2N5FA 3RBTA 2C0GA 3ZMLA 1RK4A 1UVZA 3W6GA 2LQOA 3DWVA 4FO5A 4I8BA 3HYPA 3IBHA 4N0VA 1THOA 2H30A 4KSOA 1YKCA 4KDUA 2VD1A 3UVHA 4WETA 3FRCA 2FNOA 1M9AA 2E2MA 3NZNA 2YWOA 3KH7A 3TKPA 5ECSA 5J41A 1GUHA 4ILFA 5HR2A 4DSSA 2OE3A 1U3AA 1X9WB 1M0UA 2H6YA 1R7HA 2L59A 2H70A 3APOA 4KH7A 2JADA 1GNWA 3RDWA 2NTOA 5C00A 2GQMA 2BTOT 1PX6A 3BBYA 5F07A 2DJ2A 1G6YA 4OFMA 2YZUA 4I2UA 4HS1A 1ACVA 1G6WA 5HR0A 3RPPA 5F0GA 2I4AA 3RHBA 4MH3A 1Z3EA 1PA3A 2H0HA 3W8JA 5G1KA 2OJLA 1URMA 1SKWB 2VLUA 3JCML 3QFAC 2LKUA 2FY6A 4MZWA 4YAVA 4EXJA 4JR6A 3I69A 4ZBBA 2F51A 1B48A 1K3OA 2R2JA 3F6DA 5EVOA 2FCHA 2PERA 3F3RA 2FLSA 1K3LA 4I5QA 1TK5B 4GQCA 1YZXA 3ISOA 5D9TA 4XS4B 2REMA 2VD0A 2GQKA 2KHPA 4ML1A 4ZL9A 5DJMA 1DE1A 3NIVA 2PWJA 4KAEA 5AN1A 3LYPA 3MDKA 4K7NA 1UA5A 1RW1A 4NXIA 2H76A 1WP0A 4EO3A 2L6DA 2H1AA 3KTLA 3ZMKA 4ZB6A 3D4TA 2E2GA 2R5GA 3TRPA 4HJMA 2J9HA 2B7KA 1M2AA 3IR4A 1AXDA 3GURA 3UBLA 1O6JA 2XBQA 1OE7A 1XVWA 1S3AA 5H5QA 3WT1A 1OAZA 4PXOA 3HJMA 4ULXA 3F8UA 2XC2A 3TKSA 1SK0A 3WYWA 5HFIA 2LRNA 5D9VA 1HYUA 2R6KA 5ECKB 1GSDA 20GSA 5DCHA 2VAFA 3LYKA 1YDKA 1KNGA 2GZZA 5A4UA 4YQUA 1ERVA 3GFKA 3L78A 4NAXA 1BAYA 1WJKA 2A4VA 2GSRA 1V40A 4PQHA 4TR4A 5FWGA 4OWYA 4IQAA 4ML6A 4EL1A 2R4VA 4ZILA 3D6IA 4Q5QA 1J0FA 3ZYWA 3UEMA 3F6FA 1HQOA 2IMIA 3ZVJD 2H73A 2X99A 4Q5NA 1XWKA 1OC9A 1TK0B 1V2AA 3LG6A 4CDOA 3CRUA 4F2IA 1O8XA 1V9WA 1SU9A 5IPGA 1TXXA 2FA4A 4LL1B 2WRTA 2LS5A 1GSQA 1XOBA 3RHCA 2BMXA 4PNGA 3GN3A 1Q4JA 2G2QA 5INYA 3L4NA 4MLYA 4PURA 2JZTA 4V2LA 2IWTA 2DIZA 2VL2C 1HNCA 3C7MA 3P2AA 1V57A 2F8AA 5IMZA 2GDRA 1PKZA 2A2SA 3M1GA 4XHMA 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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