1KTEA

Crystal structure of thioltransferase at 2.2 angstrom resolution
Total Genus 35
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
35
sequence length
105
structure length
105
Chain Sequence
AQAFVNSKIQPGKVVVFIKPTCPFCRKTQELLSQLPFKEGLLEFVDITATSDTNEIQDYLQQLTGARTVPRVFIGKECIGGCTDLESMHKRGELLTRLQQVGAVK
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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publication title Crystal structure of thioltransferase at 2.2 A resolution.
pubmed rcsb
molecule keywords THIOLTRANSFERASE
molecule tags Electron transport
source organism Sus scrofa
total genus 35
structure length 105
sequence length 105
ec nomenclature
pdb deposition date 1996-02-15

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00462 Glutaredoxin Glutaredoxin
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.30.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich Glutaredoxin Glutaredoxin 1kteA00
1KNGA 3L9UA 2YOIA 5KEJA 2CVBA 2YV7A 2LTKA 6GSWA 2X99A 2FLSA 4DEJA 1AUCA 2IFQB 4ZBAA 1FB0A 3KM6A 2CA8A 4KX4A 2TRXA 4POLA 2G2QA 3WGDA 1B8XA 1K3YA 1AW9A 1YKAA 3RPPA 4MPGA 4K7IA 1FVJA 4IQAA 3QFAC 2K8SA 4K1FA 2B3SA 1BX9A 3APQA 3TKSA 4TXOB 5IPHA 1F3AA 2IN3A 5HFIA 4GWRA 4IVFA 1DE1A 3UVTA 4ID0A 1XOBA 4IELA 2KP2A 1NHOA 2DJ2A 2OACA 3TJJA 2L5OA 2VLVA 4L0WA 2GS3A 2P31A 4ZB6A 1ZGNA 5GSTA 5J3RA 3OR5A 5AGYA 1PA3A 4WBJA 3HJPA 1MTCA 4KDUA 1SJ6A 1QXHA 2GQKA 5IO2A 4NXIA 4HJ2A 4G9HA 2HNLA 2LV3A 4ZL8A 2H30A 4DSSA 5ECOB 1NSWA 1B9XC 1UC7A 1ZYEA 1M7TA 4MZCA 5GZZB 1HD2A 3A2XA 1GSQA 2V6KA 3IXRA 5D8IA 5HR1A 1GSSA 3QCPA 4MZWA 4KSMA 3GH6A 3HZ4A 4YQUA 2H71A 2GSRA 1J08A 2WGRA 1GP1A 5D93A 5DDLA 3BCIA 3IR4A 1TU7A 3ZIJA 4J57E 3VK9A 5AISA 4IGJA 2BMXA 1RW1A 2LKUA 3VWWA 3VPQA 2TIRA 4PX1A 2JZSA 3RDWA 1J9BA 2FWFA 1XIYA 3KMNA 2G0FA 4HQSA 2H76A 3CTGA 3QOUA 2LNSA 4WF4A 5H5RA 1USBA 1Z3EA 1GUMA 5D9WA 2RM5A 1SL1B 5CRHA 4ECJA 4HS1A 3IOSA 2IFQA 1Q98A 5E4WA 3QPMA 3ZYWA 1O6JA 4ZL9A 3C73A 3M1GA 3HJOA 1AQWA 1SJZA 2L57A 2IMIA 5DALA 1FO5A 1G7OA 1E6BA 1U6TA 4E8HA 2HRNA 2ON5A 4QL9A 5J5NA 3LEFA 2GDRA 2RUEA 4PGTA 1NM3A 2H73A 1WIKA 5IO0A 4TXOA 3O6TA 3P90A 2WFCA 2PVOC 2ZUPA 1VF3A 2VD1A 3ZZXA 1T4YA 3EC3A 2H1BA 4MF6A 1YY7A 4P3YB 4J56E 3F6DA 1ZL9A 1NHYA 2FD3A 4L8EA 3IBHA 2R4VA 1OKDA 2B1KA 5HQPA 3LXZA 2HT9A 5CAXA 4NWYA 1E2YA 4XS1A 4PQIA 1JZWA 3KH9A 5CO3A 2EIQA 2H72A 1GTAA 3G7YA 3TJKA 1TOFA 1V57A 3IDVA 3LYPA 2F8AA 1Q4JA 6GSTA 3DD3A 1Z7PA 3HKRA 3J7Yk 4KAEA 4E8EA 3GRXA 5D96A 1SL0B 4IBPA 5J9CA 2CX4A 3E0UA 1PGTA 1AQXA 4G19A 2ZNMA 22GSA 1U3IA 4ZIJA 4IKHA 4F82A 4LL4B 5G31A 2IMKA 2VD0A 4MZBA 2YJHA 1XBSA 3ME7A 4HZ2A 1SU9A 4POKA 5COHA 3ZL5A 2XBIA 1WP0A 1PX7A 3EVIA 1GTUA 3W8JA 2F51A 3UEMA 2P5QA 3ERFA 5EPFA 3CXGA 2EIOA 2NDOA 1TRSA 4JR6A 1HQOA 2E0QA 2I9HA 3W6GA 2FGXA 4KGIA 1LU4A 2LUSA 3CSJA 11GSA 2EC4A 2FWEA 2R37A 4EXJA 2VL2C 4POMA 3P7XA 3GN3A 2K8VA 5ECMB 1XW6A 1Z9HA 1JHBA 5JCGA 5D73A 4HDEA 4Q5FA 3TJBA 1F2EA 4YQMA 1G6WA 4KUNA 1G6YA 4EL1A 3UBKA 3LQ7A 5JWQB 6GSYA 3IAS2 1C72A 2YWMA 4MH2A 3S9FA 1X0RA 1V58A 5IMZA 1AXDA 5H5SA 5EL8A 3ZLPA 3HJMA 3CTFA 3APOA 4HOJA 4NHZA 1BG5A 5B8BA 2OKAA 2HFDA 5C04A 2FHEA 4V2NA 2VCTA 4PXOA 3EWLA 3E9JB 4BPYA 2X8HA 5J4UA 1TRVA 4WR4A 3RBTA 1YZXA 5GAND 1W89A 2GZPA 5ECKB 2HE3A 5INYA 2A4VA 1V98A 3LORA 1PD21 4EDYA 3CRTA 1AC1A 4CHSA 1ML6A 5HR3A 2WCIA 4GRFA 3GV1A 1X5DA 2VCVA 3UARA 3CYNA 3DYRA 3PH9A 5ID2B 1K0DA 3H4KA 4L0UA 5ECRB 4FIWA 1K0BA 2M46A 3IK9A 1JZDA 5ECPB 2K9FA 3LG6A 4F2IA 4MABA 4OWYA 4V2LA 2VL2A 1GSYA 4ACSA 4YQVA 2O87A 5C00A 3TKRA 2FWGA 2MMZA 3C1RA 4K6XA 2F8FA 3FEUA 1OKTA 3FW2A 2AUVA 1B48A 4WETA 4MJBA 2GGTA 2DLXA 3L78A 2WB9A 2HLSA 1EGOA 2ON7A 3F4RA 18GSA 1TK5B 1OE7A 3ZVJA 3F63A 2OE1A 3GKKA 4ULXA 3EMPA 2LQOA 1QUWA 1XW9A 2FA4A 2REMA 5B6NA 2H6YA 2VAFA 4N11A 3IC4A 2IMEA 1R5AA 9GSSA 2L6DA 4JRRA 4WXTA 4L5OA 5JCUA 3TRXA 1PL1A 4I97A 5IOXA 2EIRA 3HA9A 3F3RA 5DJMA 4AJ7A 4TN8A 3DVWA 3ED3A 3J7Yb 3QAGA 1X9SB 3C8EA 1XFLA 5E59A 5CNWA 2HZEB 4XS4B 4ZB9A 1GSFA 1WJKA 4X1UA 3KGKA 1GULA 3GFKA 1PRXA 2VCQA 4KNDA 3KZQA 4DVCA 1SKRB 2J9HA 2ALBA 4HI7A 2HRFA 3TOTA 1KBNA 3CRUA 4GF0A 1Z7RA 2HSHA 4GCIA 4BVXA 5IQYA 1ZMAA 2OJLA 1SYXA 4GSTA 4TRXA 3H79A 2RM6A 4FYCA 1T1VA 1X9WB 1OE8A 3TDGA 2PU9C 2H75A 5G5EA 2R5GA 2DJ1A 2H1DA 1I9DA 1K0OA 3WYWA 2VLUA 4IQ1A 1YF1A 1GSDA 4YAPA 2FNOA 3FR3A 1QK8A 4N0ZA 4H86A 3BD2A 1S3CA 4F0CA 1A0RP 2K6VA 2DMMA 2I1UA 2JZRA 4K8MA 1O7UA 2MYGA 4V1Ag 1MD4A 5DALB 2H6ZA 3GX0A 4QL7A 3VI5A 2KOKA 1M2BA 1T3BA 3TCOA 3FR9A 5ABRA 1NW2A 1K3OA 5AIVA 2CVDA 1ST9A 2H66A 3M3MA 4KDYA 5ID2A 3LYKA 2L6CA 4PNGA 3QD9A 3GTUB 2H6XA 2O89A 2KHPA 2VCWA 5G5FA 2C80A 5IMDA 2LNTA 1GL8A 1URMA 1XCCA 3CBUA 1PSQA 3GYKA 2V6OA 3UAPA 3UIWA 4RUVA 2CT6A 1PQNA 3R2QA 5EY6A 2OE3A 1ZZYA 3IK7A 1PKWA 2X8GA 3GKMA 5F05A 1K0CA 1M9AA 2P5RA 5FHIA 4BA7A 2YP6A 3EURA 1ACVA 3NZNA 1FB6A 1WPIA 4HZ4A 4BWQA 4LA1A 3D6IA 1GWCA 1XW5A 2CZ3A 1MDJA 2C8UA 2I4AA 5CRDA 1VRSD 4IP6A 5A4UA 5AN1A 1UVZA 1SKWB 3GKNA 2LRTA 3SWLA 2MMOA 3I6AA 3KIJA 13GSA 2FCHA 2IL3A 1GUHA 1H4OA 4RQRA 2M72A 2WJUA 5LCZA 1K0AA 2HZEA 3V1WA 2PUKC 2AYTA 2H1AA 4XS4A 3QAVA 1WMJA 4CDOA 2GLRA 1XWGA 4RI7A 3ZRDA 4RI6A 3TRPA 16GSA 2VUPA 5L71A 1ERVA 3L9SA 17GSA 3EU4A 2C3TA 2H0IA 3KP8A 1HNCA 4OD7A 1R7HA 2XPEA 3L9VA 2R2JA 3LFLA 1IYIA 1M2AA 4TVEA 3IA1A 4XRDA 2B7KA 3VURA 2NVLA 2TRCP 2VM2A 2WDUA 3ZFLA 3TGZA 2O85A 5ECIB 2AJQB 2XBQA 3IPZA 4HUAA 4XHMA 1EP8A 2VLTA 4EO3A 3UOMA 1U3AA 1V2AA 2HSYA 1DUGA 2FA8A 1SK1A 3QFBC 2LRCA 5LNKe 1I5GA 2VM1A 3FHKA 3DWVA 1A2JA 1XWAA 3WGXA 4FO5A 1XVWA 4KCAA 3GTUA 2A2RA 1F37A 1U88A 4QQ7A 1S3DA 3WT2A 4HU7A 5DAKB 1B9YC 1SD9A 4PQHA 3GIXA 1Z6MA 4X0XA 2AV4A 1EP7A 2JZTA 3EINA 1PL2A 3GHAA 2GQMA 2YWNA 1TJDA 3VPTA 5D9VA 3DXBA 2C4JA 4HQZA 3FK8A 4Q5QA 4PUFC 4WBRD 1GLQA 1BAYA 2GZYA 4IJIA 4LMWA 5JCWA 2WRTA 6GSUA 5KN3A 5H5QA 3GSTA 3Q74A 3H1NA 3CSIA 5CREA 3FZ5A 4GTUA 4F0BA 4KCEA 4TR4A 5KN0A 3TKPA 2H0GA 5IOWA 1A24A 2IMFA 1TK0B 1HYUA 5LD0A 4AF2A 1OC9A 4ZILA 2IMDA 3E3EA 1F3BA 1G7EA 2X8CA 3DGQA 3HZ8A 3TB2A 3HHVA 5DJLA 4DSRA 4F03A 5DQSA 4O5RA 2YCDA 3D21A 2BTOT 4J2FA 3G7IA 3NOFA 4Q5NA 2V41A 5F0GA 3ERGA 1JLVA 1THXA 3G9BA 4G2EA 2XHFA 1K0NA 3UJ1A 2VIMA 2DJ3A 1BYEA 4Z7XA 4K2DA 2VL3A 2ES7A 4EUYA 3LJRA 3H8QA 1U87A 5HFKA 1S3AA 2V1MA 3LGCA 4MDCA 2GQLA 2HI7A 5G1LA 3A3TA 3EU3A 4MK3A 1TP9A 2NBSA 1M9BA 2LQQA 2OADA 1BQ7A 2JU5A 4L5LA 2LEGA 2R3XA 2YWIA 4ECCA 4OO5A 5ECQB 1OYJA 5G1KA 3KCMA 3Q19A 4JU5A 4JR4A 2DBCA 3ZMLA 2CVKA 3I69A 6GSSA 1GUKA 2B1LA 2BJXA 1ZCPA 1QMVA 4ECBA 3D4TA 5F06A 4D73B 3KXOA 4DSQA 3LWAA 1X5CA 5KN1A 5DAKA 5F8BA 1JFUA 2CQ9A 3FKFA 1VGLA 1O8WA 4I2TA 1V40A 4FYBA 5IMCA 4EC0A 5B6MA 1CQGA 2YN1A 4JBBA 3ME8A 2JSZA 3GUSA 3M9KA 3A2VA 1AIUA 4MF5A 4TR3A 2A2SA 2MBTA 2KP1A 2DJKA 5KN2A 4MCUA 2B7JA 5CRGA 2JADA 1O8XA 2XPDA 3ZITA 3H93A 4MA9A 1ERTA 2E2MA 3HVSA 3N5OA 3PR8A 2O8VB 4NPBA 3I9V2 2FUG2 1TRWA 2JACA 1DSBA 4I5QA 2CV4A 3KEBA 2YZUA 2H1GA 4OCEA 1R5PA 3DRNA 3D0ZA 5A5KA 2YPMA 2B5XA 1N8JA 2C0EA 3IE3A 3IV4A 2DMLA 2D2ZA 3ERWA 1A8LA 1XOAA 5B7CA 3Q6OA 2GSQA 3GX8A 3F4TA 5D9TA 5FWGA 2YJ7A 5HR0A 10GSA 1OC3A 2C0FA 2DC5A 4ILFA 1EGRA 4WR5A 5HR2A 2PVQA 4TR1A 1SK0A 4ISDA 1TW9A 2CZ2A 5CRWA 5DVBA 1T8EB 1BEDA 2C3QA 2GVPA 2VL9A 4OCFA 1K0MA 7GSSA 8GSSA 2LJRA 4IW9A 2B6MA 3HXSA 1EOHA 4POBA 6GSVA 5FT3A 1AQVA 3ZIVA 1X5EA 4HJMA 1GNEA 1CQHA 3US3A 3GNJA 3A5WA 2YV9A 5AIXA 5CP1A 2H19A 1EOGA 2F9SA 2YANA 5ECHB 1MDIA 1IYHA 5G2ZA 2WULA 1TI1A 4D73A 3HDCA 3ZFBA 2CAIA 1QQ2A 3C1SA 2CX3A 3LSZA 4IS0A 1B4PA 1GSEA 5A4VA 3HYPA 3APSA 1SKSB 3FY7A 3KTLA 4GQFA 2OBIA 4AJ6A 2PMTA 3BCKA 2I81A 2OA7A 1PN9A 1WWJA 2QGVA 3VI7A 2MMNA 3VWUA 1A8YA 2H8LA 2IWTA 1WOUA 5IIZA 3GA4A 4JEDA 1YEPA 4EKZA 2CAQA 5ECLB 4MJEA 1N2AA 2MMAA 3L0HA 1A2LA 4O32A 1YJ6A 3HD5A 1O73A 1GRXA 5IMVA 3DMLA 3D4MA 4WF5A 2PWJA 2PN8A 1R4WA 1WE0A 3GMFA 2F3MA 5CYYA 3M8NA 4IN0A 2PBJA 2C0DA 3UBLA 2H70A 3MSZA 3EMXA 4TXVA 1UN2A 2L5LA 1FW1A 1TDIA 1RQMA 3K8NA 4JZQA 3F0IA 1MD3A 2X64A 1TKDB 2V32A 3TUEA 3KP9A 2IIYA 1YKCA 2MZCA 5IM9A 3W8SA 1W4VA 4XIHA 2XC2A 1M2DA 1J0FA 2LJAA 3M9JA 3HVXA 3Q18A 3L4NA 12GSA 2AHEA 1OC9B 1GTBA 4MMMA 4I6XA 3P2AA 4O7HA 3MNGA 5HFGA 3EYTA 2DSAA 3QMXA 2V2GA 2IJYA 3O76A 4MH3A 1RK4A 3M0FA 2RLIA 1GTIA 2QSIA 4KDXA 1PX6A 2GSSA 3F4SA 4LMVA 3FZ4A 1XZOA 5IPGA 4XS6A 4GQCA 1VF2A 2L4QA 2I3YA 3RPNA 3HY2A 3F6FA 4NHWA 14GSA 3VWXA 3DKSA 4LL1B 3D5JA 2VOCA 2VCZA 3N9JA 4AGSA 1UA5A 3UL3A 4KB3A 1BJXA 1YF0A 3CSHA 1GNWA 3DEXA 3FZAA 3A2WA 2N5BA 4IJ3A 5G30A 1JLWA 2RUFA 4NAXA 1FOVA 4K7NA 2H01A 3GL3A 4X43A 2R6KA 4NV5A 5IMFA 4YAVA 1EWXA 2FY6A 1T7PB 3KTBA 2AAWA 2GZZA 3P8WA 3IAM2 3RHBA 3KJYA 3I43A 4WKWA 2QC7A 4K0GA 1M99A 2P0GA 5JWOB 1G0TA 1ZOFA 3GURA 1XWCA 4PNFA 4MJCA 4ZL7A 5J41A 4WEYA 1FG4A 2MBSA 1FAAA 4XRAA 3CMIA 1OVNA 4Q5RA 2E7PA 2J23A 2C3NA 4F9ZA 3TKQA 1X9MB 2PGTA 4JE1A 1TI3A 3ZVJD 1ILOA 1EZKA 4MJAA 3HVVA 3VFIA 2DJJA 4AJ8A 4V2MA 1F9MA 3KMOA 4KA0A 4OO4A 4BVYA 5B8AA 4EE0A 4KW6A 2QKEA 3F8UA 2JSYA 3NIVA 3O3TA 3IHQA 4EF0A 3C7MA 1B4QA 1H75A 3RAZA 1F6MC 3TJGA 1OAZA 1YQ1A 1WRYA 3TJFA 2LSTA 4KSOA 2LJKA 2N5FA 4FYUA 4I2UA 3TKSE 3VWVA 3WGEA 2GT5A 4LLRA 1SENA 4TOPA 4NV2A 4ZBBA 3PINA 3BJ5A 5DQYA 3FYGA 5ELAA 2E2GA 1FHEA 1M0UA 1ZYQB 4OMVA 4EDZA 1V9WA 2NPBA 4TR1B 5JWRB 1DE2A 1QGVA 1LJRA 3WT1A 4MF7A 3ISOA 1XWKA 1A0FA 2DIYA 2OE0A 2YNXA 1T4ZA 3UMAA 2NTOA 4O92A 4GXZA 1EEJA 1A23A 3D22A 2OBKA 4GSNA 2C0GA 2N5AA 5F07A 4NMUA 4CW9A 3AY8A 3BOAA 1XPVA 3U6VA 4OFNA 3ZREA 4OFTA 2HXKA 2RIIA 1Z6NA 3UVHA 4OFMA 3DVXA 1SL2B 4EVMA 5ECNB 1OC8A 2M80A 4RQXA 1ON4A 1EV9A 3QDNA 3SBCA 5A4WA 5DCGA 1GH2A 4ZXGA 2GT6A 4FH8A 3F3QA 4XTSA 1Z5YE 2PERA 5IMAA 4ZBDA 3GKXA 3F9UA 3ZTLA 2L59A 2VO4A 4PQ1A 1R26A 4IHUA 3FZ9A 3KD0A 4ECIA 2WZ9A 3MAKA 1FVKA 4KE3A 1JZRA 1SD8A 3BBYA 1GLPA 5DCHA 1Y25A 1KTEA 2GTUA 4N30A 1AAZA 2DJ0A 1QFNA 1ABAA 4IP1A 4BWSA 3HCZA 1HNBA 5D9XA 3VLNA 3WD6A 1ERWA 2WS2A 2LRNA 2O7KA 2Z9SA 2B5YA 5ELGA 5GSSA 2L4CA 2HZFA 3FRCA 4TW5A 1SK2A 3GSSA 3TOUA 2YWOA 3TRQA 1PKZA 20GSA 1ERUA 3PGTA 3GH9A 3KH7A 4KH7A 1K3LA 4HU9A 1A2MA 1XWBA 1O81A 1YEXA 4PURA 4V1Ap 1KEBA 3MWHA 6GSXA 2IPAA 4ML6A 1JZOA 4N10A 2LS5A 2YZHA 1PMTA 1TK8B 1TTZA 4TKYA 2AB6A 2KLXA 4MLYA 5GAPD 3IRAA 2KUCA 3LXTA 4MPFA 2C1YA 4G10A 1EEMA 1MDKA 1THOA 4K0NA 1EV4A 5DBQA 3C71A 2GSTA 5ENUA 1XXUA 3TKSC 4DSSB 1XVQA 4K7OA 1Y6EA 2HYXA 4ML1A 3U5RE 4BL7A 3ZMKA 2B5EA 2DIZA 1SYRA 1O85A 1VF1A 3FR6A 4I8BA 1DBYA 19GSA 2H74A 3EE2A 1HNAA 3GL5A 4GSSA 4PUAA 4K9ZA 4ZB8A 4XCSA 2VCXA 1GSUA 4N0VA 4TR0A 5EVOA 1SJIA 3JCML 3QR6A 3DIEA 2H0HA 4GLTA 5J9BA 2K18A 3MDKA 2PPTA 4MP4A 1TU8A 2FWHA 5ECSA 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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