5CYYA

Structure of the c-terminal domains of dipz from mycobacterium tuberculosis
Total Genus 91
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
91
sequence length
333
structure length
333
Chain Sequence
TGTEIREQLNLGGIVNAQNAQLSNCSDGAAQLESCGTAPDLKGITGWLNTPGNKPIDLKSLRGKVVLIDFWAYSCINCQRAIPHVVGWYQAYKDSGLAVIGVHTPEYAFEKVPGNVAKGAANLGISYPIALDNNYATWTNYRNRYWPAEYLIDATGTVRHIKFGEGDYNVTETLVRQLLNDAKPGVKLPQPSSTTTPDLTPRAALTPETYFGVGKVVNYGGGGAYDEGSAVFDYPPSLAANSFALRGRWALDYQGATSDGNDAAIKLNYHAKDVYIVVGGTGTLTVVRDGKPATLPISGPPTTHQVVAGYRLASETLEVRPSKGLQVFSFTYG
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

molecule tags Membrane protein
molecule keywords Protein DipZ
publication title Structure of the ectodomain of the electron transporter Rv2874 from Mycobacterium tuberculosis reveals a thioredoxin-like domain combined with a carbohydrate-binding module.
pubmed doi rcsb
source organism Mycobacterium tuberculosis
total genus 91
structure length 333
sequence length 333
chains with identical sequence B, C, D
ec nomenclature
pdb deposition date 2015-07-31

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00578 AhpC-TSA AhpC/TSA family
A PF17991 Thioredoxin_10 Thioredoxin like C-terminal domain
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
2.60.120.260 Mainly Beta Sandwich Jelly Rolls Galactose-binding domain-like 5cyyA02
3.40.30.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich Glutaredoxin Glutaredoxin 5cyyA01
1Z6NA 3KP9A 2VZPA 3QR6A 2FWHA 2X05A 4CUBA 2H6ZA 4JR4A 5JCUA 4QX0A 1RQMA 2VCAA 2VL2C 3ZLPA 5EVOA 4MK3A 2VZ1A 1JZRA 4N10A 1CZVA 2B5XA 3K46A 4XS6A 1A8YA 5A5KA 2OJLA 1YKCA 3C71A 3WF3A 2DBCA 2FA8A 4PQ1A 3FR9A 2DJ2A 1GTUA 4KE3A 4GZ9A 2VCVA 1H6YA 3ZFBA 4D73B 2J1UA 1PD21 3SWLA 4PQQA 5G5EA 3HY2A 1GNYA 3NJVA 5DQ0A 4K6XA 5CREA 3FHQA 4I8BA 2I3YA 1GMMA 1GNEA 4IP1A 1OKTA 3CQOA 3DECA 5AIXA 4QB6A 5HFKA 3WSOA 5DALB 3QFBC 2CX3A 1BG5A 5B6MA 2C3TA 3K77A 1IYIA 4ML1A 4TTGA 3W8JA 1JZ5A 5D9VA 1TOFA 1P8JA 3APOA 1OVNA 4PT6A 5KN0A 3THDA 5G05L 4OCFA 4PX1A 4DXRA 1OC9A 3CRUA 4O5RA 1WRYA 1NSWA 1FOVA 2H0GA 1PRXA 4NV5A 2E2GA 6GSXA 3KMNA 1X9WB 1GP1A 3LWAA 2WZEA 4ZBAA 3C7GA 2W47A 2PUKC 1Q98A 4ULXA 4LHSA 1X9MB 4KA0A 1TK5B 5ECOB 4HOJA 2X09A 5IO0A 1CQHA 3F4SA 5FUIA 1YJ6A 2CA8A 2H71A 3GIXA 3HD5A 4EVMA 1GLPA 1KEBA 4N0ZA 2NTOA 4UI9L 1U88A 3TRPA 1JU4A 5JR2A 3IIIA 1YKAA 3HOBA 2WFCA 3G7IA 4TR1A 1ZCPA 3DEXA 2DC5A 1V58A 5DN2A 1W89A 3DD3A 3ETPA 4K2DA 3KEBA 10GSA 3SBCA 3ZMKA 1O8WA 1UY2A 1GOFA 5EIYB 1GSFA 4ZB6A 2HT9A 5C70A 4DXTA 4EE0A 2JU5A 3OR5A 5G31A 3KH9A 4Z7XA 3ZTLA 1K0CA 2PGTA 5F05A 3D0ZA 1VF3A 4X0XA 4OMCA 2VLUA 4MPFA 1G6YA 2VL3A 3JCML 4ECBA 4ILFA 2FY6A 3BBYA 4OUEA 3MWHA 2AB6A 3QDNA 1JZDA 4WR5A 1SYRA 3GTUA 4Q5NA 4W50A 4DSRA 3HZ4A 1BX9A 3UEMA 4AJ6A 4ZBBA 2WAOA 4MPGA 2OE1A 2IIYA 2XHFA 3PH9A 2JD9A 3M8NA 2VIMA 3VK9A 2R6KA 14GSA 1PMJX 2K9FA 2WAAA 3BD2A 4MMMA 1AIUA 2LJRA 1NHYA 3OEBA 5J9BA 2R4VA 3RBTA 3DYRA 1HNBA 4CDOA 3CZUA 2W1WA 1SKRB 4TR4A 3UETA 1CIYA 1GOGA 4E8HA 2XQXA 2H76A 3MV11 1NHOA 2PERA 6GSTA 2W3JA 1US3A 4PUAA 2RM5A 1TRVA 2H6YA 2F3MA 1FB0A 4BK5A 3EYTA 4L0UA 4MJEA 2RIIA 3EE2A 4JKLA 5D8IA 3H79A 2WDBA 3I2FA 4IJ3A 4IQAA 5ECMB 1QUWA 3D4TA 17GSA 1T4ZA 3TUEA 2I9HA 5ECNB 2DMMA 3IHQA 1EGRA 3C8EA 4IELA 3ZL5A 3WNPA 2YZUA 22GSA 1G6WA 2XC2A 4OO4A 2Y8KA 1X9SB 5J3RA 3I2KA 3VFIA 2AJQB 1W9SA 4YPJA 1TK0B 4AJ8A 4KDXA 3VPQA 2ZNMA 2IPAA 2V2GA 3A21A 2VLTA 3SKJE 3QMXA 3DVWA 3FHKA 4A41A 4JRRA 4RQRA 2HSYA 2H66A 1DYOA 3M3MA 4MZBA 3EU3A 5EY6A 3HCZA 3NJXA 1A0RP 4GF0A 3UL3A 2IMEA 5HR0A 3QAWA 3GYKA 2ZUPA 1R64A 3LXTA 1UMIA 1EOHA 3TJBA 5F7UA 5DALA 1TW9A 3C1SA 2CDOA 1AW9A 2CAQA 1DSBA 1SK0A 1NM3A 1B4PA 1HQOA 4ISDA 5G04L 1NUKA 2JKXA 3FZ9A 1M2DA 3PUIA 1MD4A 4L5LA 2WABA 2ON7A 2JZSA 2WCIA 1IYHA 1WPIA 2I4AA 2W1QA 1R4WA 2H1GA 4OMDA 2LRCA 3E1F1 2FWFA 3I2GA 1X5CA 5DJLA 1XPWA 2YC4A 1UN2A 2AV4A 2K8SA 4TR0A 2L5LA 1OAZA 2MMAA 5JWRB 3J7Yb 3I9V2 4DEVA 3D22A 5H5RA 1GSEA 1XNTA 4IUGA 3L4NA 4XS4B 4OO5A 3R2QA 4A3ZA 5J4UA 2FHEA 3WNKA 1J9BA 3L9UA 4IN0A 4J57E 3LQCA 2X10A 3HNBM 1PKWA 4XUTA 4ZZ8A 2OE3A 3GL5A 2L4CA 5KN3A 3DVXA 4XHMA 5ECPB 4MCUA 4ZIJA 3KTBA 2VUPA 2VMFA 4DEJA 1MDKA 1MDJA 1TDIA 2LS5A 2B9VA 4F03A 4KB3A 3DIEA 1G7EA 3W5NA 3FR3A 2WB9A 2WQ8A 5HXMA 2R7EB 2YNXA 1GLQA 2LKUA 2XPDA 5IPGA 1R7HA 4F0BA 1GSQA 3ZZXA 3FZ4A 2J1TA 1UYZA 2VZUA 1O8XA 1GUMA 3HN3A 4FYCA 3IOSA 2A2RA 1U87A 3ERGA 3UESA 4RQXA 1XWCA 5F06A 2LRTA 4XIHA 3N9JA 1VF4A 4DUXA 2P0GA 1PX3A 3P90A 4TOPA 1FVKA 3IAPA 2FWGA 1B9XC 2PN8A 3DGQA 1MEKA 1X5DA 5ELAA 3WF2A 4A42A 4V2LA 2W5FA 4ZY9A 5AISA 4HG6B 1H75A 2W46A 3TJKA 1FHEA 1HNCA 2ORXA 3VD3A 1A2LA 5ECHB 3M0FA 3KD0A 1YEPA 3WF0A 2QQKA 4MP4A 2XBQA 2VL2A 3VWWA 1VF1A 4OZOA 4KH7A 4KWUA 2EIRA 2LJKA 3KP8A 4ECCA 1OE8A 4TR1B 3C8XA 2YFZA 2RM6A 3OGSA 1XOAA 4WKWA 1YZXA 5EPFA 2LSTA 3ZVJA 2VZSA 1SJZA 5JXHA 3A2XA 2E31A 3P1IA 4ZXGA 2V6KA 1E6BA 4E8EA 4CW9A 1AC1A 3ZFLA 2Y6HA 1K45A 4XCSA 1WOUA 1UYYA 2DSAA 3CSHA 3FEUA 1YF0A 1GTBA 3MBWA 2JZRA 3GX0A 4W8JA 3D5JA 2WBKA 3F4TA 1N8JA 1GQPA 3D3AA 1K3OA 1WCQA 5E4WA 4YQMA 1U6TA 3CZJA 4H86A 1EUUA 1SG3A 2WZ9A 4MGQA 4WXTA 3ED3A 1JZ4A 5GSSA 1PMTA 4TN8A 2CVKA 2HSHA 3APSA 2PWJA 1AQWA 1XVWA 2XHNA 5D9XA 1QMVA 4BWQA 4DSQA 4HI7A 2P5QA 1T7PB 1O7UA 4RI7A 1XW6A 1DBYA 1GSSA 5CYYA 2V41A 2WGRA 3I6AA 1W4VA 2H1BA 2VLVA 3F2ZA 3D21A 3QOUA 2KOKA 3MNGA 2QQLA 1G7OA 2WJUA 3LSZA 4QQ7A 2V4VA 2L6CA 3FW2A 3T08A 2C26A 3V1WA 4RUVA 5IIZA 3KXOA 3EINA 4J2FA 5EJ1B 1U3IA 3WNOA 5CO3A 2BBAA 5GZZB 3HVSA 2L6DA 1A2JA 3I2JA 2P31A 2DCKA 1K0OA 3NNGA 2YN1A 1EUTA 3CTGA 3FK8A 2IJYA 3I3EA 2K18A 5ECLB 3M9KA 2X64A 2H72A 2WO3A 3EURA 2LTKA 1VGLA 3KJYA 4XS4A 5CZKA 2WN3A 3GURA 4LL1B 3LEGA 3A2WA 2C4XA 1GTIA 3I43A 3MV01 1UMHA 3Q19A 1S3DA 4WF5A 1W0NA 4MDCA 2YZHA 5AGYA 2HYXA 5B7CA 2VM9A 1AXDA 5LNKe 4PGTA 3L9VA 4DEQA 4M4RA 1OE7A 2C80A 2DJ1A 5DAKA 1UY4A 4TW5A 2KP2A 2ID4A 5IMVA 3I2IA 1XW5A 5G1LA 2LNSA 3D6IA 2FGXA 4XUOA 5IFPA 3ME7A 4ARXA 3A2VA 2ALBA 1Y6EA 5INYA 4A45A 2BMXA 2J9HA 2ZEXA 3WNNA 4ZBDA 2YWOA 2GZPA 1WMJA 1K0BA 4IS0A 3ME8A 3U37A 2J1AA 1QFNA 1SHWB 4YQVA 4A6OA 5A4VA 2IL3A 2GSSA 3H1NA 4MJCA 2QBXA 7GSSA 1T1VA 1B8XA 2W87A 2BERA 2G0FA 2VMCA 5F8BA 4K8MA 1NKGA 1O85A 1URMA 1YY7A 2JL4A 4EL1A 4ZXEA 4AAXA 2W91A 2CVBA 3GH9A 4HDEA 1OD3A 2L5OA 3ZM8A 2C4JA 4LQRA 2VCQA 4I2UA 3P2AA 4QB1A 1TTZA 2OE0A 1EV4A 2TRCP 3O6TA 4PNGA 3ECQA 2IN3A 3ZIVA 2B5YA 4EUYA 2LJAA 1U3AA 5IYYA 1W8NA 1TRUA 3E0UA 2AUVA 5IFTA 1ERTA 3HA9A 5D93A 3GV1A 3A3TA 3ZMLA 1KNGA 3HJMA 4XUQA 3GGLA 2OBIA 1YEXA 1T00A 2Z4FA 1GOHA 3F6DA 2E7PA 3BCKA 1H6XA 2VCWA 4ACSA 1ACVA 2L57A 3UIWA 2VQTA 2HLSA 2NDOA 4MF7A 3IAS2 5J1XA 1X0RA 1UY3A 2GSRA 2H30A 1JZ2A 3PR8A 1J84A 2JADA 2DIZA 3I69A 2ZCTA 5JUVA 1JYWA 2WO1A 5KN2A 2H6XA 3TOTA 5ID2A 1JHJA 4CU8A 1TU8A 2EIQA 3HHVA 5DJMA 3T0BA 4V1Ag 1OC3A 2J7MA 2GDRA 4QPWA 3GX8A 1EP7A 1EOGA 3VPTA 4I5QA 4IBPA 5J41A 3QCPA 1E2YA 12GSA 4PQIA 1TK8B 11GSA 1TJDA 4WEYA 4KGIA 1OF3A 4X43A 1PMHX 3G7YA 4Q5RA 2L9LA 4GXZA 1UA5A 4MADA 1GSYA 2QQJA 2VJXA 5ECSA 2YOIA 3HVVA 1LNSA 1O6JA 4GRFA 1OYJA 3PINA 2BTOT 1TI3A 4PXOA 4ZB8A 3TOUA 1NX9A 4NMUA 5IMCA 3C7MA 2YWMA 1YDKA 5EL8A 3HDCA 1T8EB 2O85A 3ACHA 2VMDA 2FA4A 1K3YA 1PGTA 5G30A 1BJXA 4BDVB 3PGTA 6GSWA 4LKSA 4RN5A 3CDZB 4N11A 4ID0A 2VC9A 5HR2A 4GWJA 1O8PA 2CZ2A 2WRTA 4V1Ap 1SD9A 3EYPA 1VRSD 4XUPA 2VZOA 3IDVA 2QQIA 3GH6A 1XWGA 2DMLA 3UOMA 2O7KA 2XONA 1M99A 4QX3A 1HN1A 2KD7A 5B4XA 2W92A 3T0DA 4IW9A 5ABRA 2VMEA 3HZ8A 2H1AA 4MA9A 1TI1A 3FZAA 4YQUA 4CU7A 2K6VA 3TDGA 1ULOA 3TJFA 1XZOA 3TKSC 4LMWA 2B7JA 3EWLA 5G5FA 2RJ2A 3DRNA 4TXVA 1GTAA 4EKZA 2KHPA 1PL1A 4KSMA 3P6BA 2W95A 5IOWA 2C1YA 2YB7A 2WUHA 3ACFA 1YQ2A 3LE0A 3CMGA 2J22A 2ZEWA 1SK1A 4CVUA 5CP1A 3OGVA 3K4AA 1WKYA 3UAPA 2B1LA 2I81A 1M2AA 1V2AA 1HNAA 3ABZA 2IMIA 3F4RA 1V57A 2X99A 3KMOA 1TXXA 5D96A 3FRCA 5IMDA 2B4KA 4PNFA 3F3QA 4YH2A 2QGVA 4K7NA 3TKSE 1PX7A 1OF4A 3LXZA 2QC7A 2OBKA 2VM1A 1LJRA 1UY0A 1JU3A 2GS3A 3RDWA 3UVHA 3OBAA 3WQBA 1GUHA 1O59A 4ET7A 2LS6A 3KIJA 1WJKA 3H8QA 2FWEA 1M9BA 2GTUA 3LG6A 3GNJA 2CVDA 4OFNA 5JXIA 2WYSA 1LU4A 2AHEA 3RPPA 4EDZA 4OCEA 6GSSA 4HUAA 2E32A 3HKRA 3VWVA 4JZQA 3BOAA 4I97A 2VCZA 4V2MA 5CAXA 3VLNA 4LLRA 2Y64A 4BWSA 4KNDA 6GSUA 2MMOA 3CMIA 1LBKA 3IB3A 1DLCA 5IO2A 4ARYA 3C7FA 1JFUA 5IPHA 2WZ8A 3CBUA 1K12A 3A7QA 2HFDA 3GMFA 4MJAA 2V1MA 2YFUA 3J7Yk 3F6FA 2OKAA 3QAGA 2F51A 2PU9C 4NAXA 2GT6A 2ZEYA 4GWIA 2VO4A 1JHBA 2YPMA 3APQA 1DE2A 1FB6A 2O87A 4HJ2A 2QQMA 1VF2A 4KMQA 2HZEB 2MMNA 2RUEA 2VOTA 4F2IA 5C00A 2VM2A 4P3YB 5HFGA 5DPNA 1ULPA 1A8LA 3EB7A 4IQ1A 2HRNA 4XS1A 1ERWA 3FKFA 4P5YA 3U6VA 3F0IA 3WF1A 2AYTA 2LEGA 2YV7A 4L0PA 5ENUA 1JZWA 1O8SA 1UC7A 1W9WA 5DAKB 2R3XA 4GQFA 3CRTA 1JYVA 4OFMA 6GSVA 1M2BA 1KGYA 2OA7A 1W8OA 2OKXA 2H8LA 2Y6LA 5J5NA 4K7OA 5DMYA 5JCWA 4I2TA 1BEDA 2B7KA 5C7GA 1FVJA 3OGRA 3ACIA 4KW6A 3THCA 2PQSA 3AC0A 3ZREA 1XWBA 1K3IA 2H70A 4E8CA 4DVCA 4I6XA 3HVXA 3OB8A 2JDAA 1UYXA 3DMLA 1BAYA 1ABAA 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 1GUL A;  2EID A;  1XVQ A;  1L7Q A;  1ERV A;  1CX1 A;  3GN3 A;  4WBJ A;  3VUR A;  2PMT A;  1UXX X;  3VD9 A;  1WP0 A;  3F8U A;  2TRX A;  2F9S A;  1MTC A;  4JKM A;  2N5B A;  3C73 A;  4BVX A;  1GL8 A;  2M80 A;  3HPN A;  3UBL A;  1ZYQ B;  5DVB A;  4MF5 A;  1F2E A;  5AIV A;  5HFI A;  1S3A A;  2PBJ A;  4F9Z A;  1X5E A;  1EP8 A;  2VO5 A;  3AY8 A;  2BJX A;  1XWK A;  2GT5 A;  4HQS A;  4NWY A;  4TXO B;  2QKE A;  2HZF A;  1SKS B;  3WNM A;  3Q18 A;  3I2H A;  4UAP A;  3NRU A;  1A0F A;  1SEN A;  4BPY A;  4WF4 A;  2H19 A;  4POL A;  4QDS A;  3GFK A;  4UOJ A;  1O81 A;  3C7H A;  2FCH A;  3HNY M;  5A4W A;  2W1S A;  2IFQ A;  3NQH A;  3UBK A;  3OEA A;  1RK4 A;  4OD7 A;  3VD7 A;  1EZK A;  2H1D A;  2VL9 A;  3GSS A;  5IHR A;  1XWA A;  2K8V A;  2VD0 A;  4JED A;  3WF4 A;  1CZS A;  1EWX A;  3KGK A;  1MD3 A;  2E0Q A;  3WT2 A;  3DWV A;  2JSZ A;  3O76 A;  1OC9 B;  3WT1 A;  4P08 A;  3TCO A;  5KN1 A;  4KSO A;  4HQZ A;  3P8W A;  1DE1 A;  2YWI A;  2VZR A;  4WR4 A;  1KEX A;  1S3C A;  1W99 A;  2H74 A;  4DSS B;  2J1S A;  16GS A; 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 2XOM A;  2ZEZ A;  3GL3 A;  1Z7R A;  2ORZ A;  3F63 A;  2AAW A;  3T2O A;  1K0D A;  2IWT A;  1BQ7 A;  2GQK A;  4MH3 A;  2P5R A;  5FHI A;  2O8V B;  1XC6 A;  3GKN A;  5LD0 A;  1AQV A;  1RW1 A;  3US3 A;  5CRW A;  2A4V A;  1MPX A;  2KUC A;  3WD6 A;  1GSU A;  1TRS A;  4LL4 B;  5F0G A;  2YG0 A;  2YCD A;  4ZL9 A;  1M7T A;  1K42 A;  2DJ0 A;  4ECJ A;  1EGO A;  2VTF A;  1CQG A;  5LCZ A;  5L71 A;  4HZ4 A; 
#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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