3GKKA

Insights into the alkyl peroxide reduction activity of xanthomonas campestris bacterioferritin comigratory protein from the trapped intermediate/ligand complex structures
Total Genus 44
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
44
sequence length
159
structure length
156
Chain Sequence
b'AMTDAVLELPAATFDLPLSLSGGTQTTLRAHAGHWLVIYFYPKDSTPGCTTEGLDFNALLPEFDKAGAKILGVSRDSVKNFCAKQGFAFPLVSDGDEALCRAFDVIKEKNMYGKQVLGIERSTFLLSPEGQVVQAWRKVKVAGHADAVLAALKAHA'
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
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publication title Insights into the alkyl peroxide reduction pathway of Xanthomonas campestris bacterioferritin comigratory protein from the trapped intermediate-ligand complex structures
pubmed doi rcsb
molecule keywords Bacterioferritin comigratory protein
source organism Xanthomonas campestris pv. campestris
molecule tags Oxidoreductase
total genus 44
structure length 156
sequence length 159
ec nomenclature ec 1.11.1.15: Peroxiredoxin.
pdb deposition date 2009-03-11

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00578 AhpC-TSA AhpC/TSA family
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.30.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich Glutaredoxin Glutaredoxin 3gkkA00
1PX6A 3UL3A 4LA1A 5F05A 3ZTLA 3IAM2 1T7PB 1UA5A 2YWOA 3FY7A 3GH6A 22GSA 1YDKA 2M72A 2LJAA 2R5GA 4NAXA 3LQ7A 3FR9A 1OE8A 4GLTA 1GSUA 3D4MA 1NHOA 1Y6EA 1GTBA 3C1SA 1A2LA 4PURA 1SKWB 1XOAA 5KN2A 3QFBC 1X5CA 2FWEA 4OCEA 2FNOA 4NHZA 2C3QA 3P8WA 5J5NA 1U3IA 3TJBA 3EYTA 1FW1A 2HSYA 2E2MA 4HS1A 3VK9A 2GLRA 5INYA 1DE1A 1OAZA 4HDEA 3ZMLA 1SL2B 2WDUA 4ECIA 4MZBA 3GHAA 4JU5A 1WE0A 2R37A 1F6MC 2CA8A 2YZHA 2B1KA 2YWMA 3DGQA 10GSA 2GT6A 1ZYQB 2F3MA 3ISOA 2GQMA 4EKZA 4J2FA 3LXZA 1LJRA 1OE7A 4YQUA 4LL4B 1PX7A 2EIRA 3IPZA 4IJ3A 5G1LA 5GAPD 3HA9A 5ID2A 2CX3A 1SD9A 2LRNA 4MDCA 2C1YA 1X9SB 1M9BA 3I69A 3KMOA 4JR4A 1SK0A 2LUSA 1T3BA 3H79A 4H86A 4NMUA 4HI7A 4F82A 4RUVA 1X5EA 2GTUA 2IL3A 2J23A 3ERGA 3IA1A 5IO2A 1ZCPA 1UN2A 1OYJA 4TRXA 5FHIA 3EMPA 5L71A 3I6AA 3CSHA 4TR1B 4FIWA 2J9HA 5IMCA 1XVQA 3LJRA 1Q4JA 4HUAA 3GH9A 4GTUA 1USBA 3VPTA 11GSA 2V2GA 2VIMA 1VF3A 3DIEA 3ME8A 3VWXA 3I43A 1FB6A 3E3EA 3L78A 3HVVA 3MWHA 2I81A 5KN1A 4G10A 3D22A 4MK3A 1OC9A 5ABRA 1BAYA 2B7KA 3EWLA 4GXZA 3A5WA 4KNDA 4XRDA 1XWBA 4MF6A 2RUFA 1X9WB 2Z9SA 1EOGA 1AUCA 1EP7A 2H30A 4ZB6A 2VCWA 3FZ4A 1T1VA 2NDOA 5J9BA 3UVTA 1EGOA 1MD4A 2ZCTA 2HI7A 5IMFA 4GQCA 2C80A 3M8NA 1FB0A 4KGIA 4G9HA 1NM3A 2FUG2 1ERWA 1GSSA 2ZUPA 2REMA 3IDVA 1E2YA 3TOTA 5ECPB 3H1NA 1F3BA 2H1GA 4OWYA 2HZEA 3HCZA 4RQXA 5AGYA 4FYUA 4K9ZA 1QQ2A 2NTOA 2HFDA 1WWJA 1JLWA 3H4KA 3IHQA 3RBTA 5COHA 1TU8A 2I3YA 1DE2A 3H8QA 3IE3A 1XVWA 2V41A 1T00A 4PGTA 4IBPA 2VM1A 3GRXA 5G2ZA 1GSYA 2XPDA 4HZ2A 3KMNA 6GSUA 2X99A 4JR6A 5J4UA 1IYIA 4HJMA 3TB2A 4ZL7A 5G1KA 3CYNA 3H93A 1AQXA 4NXIA 3WT1A 2VL2A 1ILOA 5A4WA 3GX0A 5IIZA 1QUWA 2PGTA 1JFUA 2B3SA 1A0FA 4IJIA 4ZB8A 1Z3EA 5DVBA 1W4VA 2ZNMA 3QOUA 3I9V2 3ZZXA 4MABA 2LV3A 4O7HA 1OKTA 4ISDA 1EGRA 4K7NA 3GFKA 4O5RA 2LQQA 1PN9A 2YV7A 4I2UA 1TK8B 2AYTA 4L0UA 3Q6OA 3UAPA 1BX9A 3WGXA 3UEMA 6GSWA 3G7JA 3HKRA 3GKMA 3SWLA 2LKUA 4MJAA 1VF2A 4MF5A 5AN1A 3TKSA 3LG6A 1TU7A 3ZIVA 1A0RP 4PNFA 2H0GA 3UARA 3DWVA 5LCZA 2I9HA 14GSA 1EWXA 2FGXA 1M2DA 2VOCA 2H73A 5KEJA 3O3TA 4N11A 3A2VA 3F3QA 1YF0A 3IV4A 3L4NA 1NW2A 4EC0A 2OADA 4P3YB 3SBCA 4ZBBA 3QPMA 2VL3A 2IPAA 3D6IA 2B5YA 3F4RA 1TI1A 1FAAA 1K0OA 1QGVA 1JZDA 2L59A 1GL8A 2GZYA 2GGTA 4HQZA 4LMVA 3CXGA 2HLSA 2FCHA 1AW9A 2JZSA 4MJEA 3J7Yb 1TTZA 1VGLA 4KSMA 4V2NA 4MZWA 1XWAA 3C1RA 5HR0A 3VURA 3VWWA 1M99A 1AQWA 1GTIA 2HRNA 3PR8A 1PSQA 4N0ZA 4MPGA 3CSJA 5FT3A 2PWJA 3D5JA 3UIWA 3ME7A 1SJIA 4KUNA 4X1UA 5DBQA 2VM2A 19GSA 4OFTA 1XBSA 3BD2A 2NPBA 3P7XA 1MDKA 1FVJA 5ID2B 3KGKA 4KCAA 1PL1A 2QC7A 5IMVA 2K8VA 4DEJA 3KP8A 5AIVA 1SKRB 2C4JA 4K8MA 4YH2A 2B5EA 4IELA 2FWHA 3TJKA 4DSRA 3KH9A 1AAZA 2HNLA 4F2IA 3LWAA 2YJHA 4DVCA 1XWGA 3N9JA 2OA7A 3J7Yk 3W8SA 3US3A 2L6DA 4WXTA 1B48A 3IR4A 3GSTA 1ML6A 2OJLA 5IMDA 2D2ZA 2O7KA 1A8YA 1SD8A 5CYYA 3TRPA 1ZL9A 1TW9A 2HXKA 5D9VA 3EURA 5D9XA 2QSIA 2WGRA 2IN3A 1XCCA 1OC3A 4OCFA 2MMZA 4N30A 2CQ9A 4N10A 2DJ3A 3VI7A 3HJMA 5IMAA 1SL0B 1ZZYA 3M1GA 4KX4A 1S3DA 4OMVA 1VF1A 2YJ7A 3G9BA 3KP9A 1ZGNA 4J56E 4MF7A 5CREA 1RQMA 5HFKA 3FR3A 2H1AA 1T8EB 8GSSA 3GKNA 3FZ9A 2VCVA 3CMIA 4JRRA 2GDRA 2QGVA 2DJ0A 1JZRA 2IMKA 13GSA 5IMZA 2FWFA 2R6KA 3U5RE 1Y25A 4K0GA 2VLTA 1YKCA 5DALA 3KEBA 2G2QA 4MMMA 3IRAA 2HZEB 3PGTA 2VCQA 3F9UA 1XW9A 1XOBA 1A2MA 1V9WA 2RIIA 4L8EA 1R7HA 3HZ8A 2IMDA 3ZMKA 4KCEA 2GSRA 1VF4A 3GV1A 4TR0A 3IC4A 1F2EA 4KDUA 4KDYA 5IOXA 2GZZA 1YEPA 3BOAA 5GSSA 2CVBA 2VAFA 3GNJA 4ZL8A 2CX4A 3K8NA 2B6MA 2L6CA 2F51A 3HYPA 2HYXA 1PKWA 5ECQB 4OFNA 2X8HA 4NWYA 2HRFA 4EF0A 2I1UA 3UBLA 4ECJA 1O7UA 5HFIA 2GSQA 2MYGA 4KA0A 3C8EA 4TXVA 4GSTA 3S9FA 3QAGA 2ON5A 1K0AA 2DMMA 1K3YA 1BYEA 1ST9A 1O81A 2IMIA 3LGCA 2JADA 4ULXA 3F4TA 1QK8A 4HQSA 1R5AA 3APQA 2L5LA 5F06A 4TR4A 2WZ9A 5ECIB 1MDJA 1SJ6A 4MJCA 1ZYEA 5A4UA 2JL4A 2WJUA 3RPPA 1WPIA 1AC1A 1I5GA 3C73A 1YEXA 3GMFA 2LQOA 2V1MA 3W8JA 1MTCA 1Z9HA 1A24A 1XW6A 2VO4A 3ZFBA 2R3XA 2LTKA 5DJLA 3LORA 2C0EA 7GSSA 4QQ7A 4IS0A 1A8LA 4Q5FA 4ZL9A 4X43A 2LNSA 3LYKA 3ERFA 4BVYA 3WT2A 3GTUA 5F8BA 2IWTA 1T4ZA 6GSVA 3GL3A 1XW5A 2PU9C 3RHCA 2AV4A 2X64A 4IHUA 1N8JA 1R26A 1H4OA 4PXOA 3KM6A 2GT5A 4Q5NA 4IQAA 2WRTA 2H1BA 2GS3A 6GSYA 1K3OA 3BBYA 3F3RA 2EIQA 4OD7A 3GKKA 5B6MA 2DJ2A 2YWIA 5KN0A 1ZMAA 3EE2A 4RQRA 2JU5A 5LD0A 1SK1A 1PGTA 1AIUA 1HNAA 4BPYA 1FG4A 3HY2A 3TJFA 4N0VA 5DQYA 5HR1A 2BJXA 4HEA2 1TK0B 4ZBDA 3TKQA 4EXJA 2MMOA 1KNGA 2K8SA 1BQ7A 2ON7A 3Q18A 2H72A 3RHBA 5D73A 2RM6A 12GSA 1GNEA 2TRXA 4OO5A 2WFCA 2IMEA 4ZXGA 5H5SA 2DIYA 3GN3A 3VLNA 4WR5A 5CRHA 2PMTA 3DEXA 1PQNA 5GSTA 2K9FA 2R2JA 2CZ3A 4JBBA 2PBJA 1TJDA 3F63A 3WGEA 3O6TA 1A2JA 1SJZA 20GSA 4DSSA 1BEDA 4ILFA 1Q98A 1GWCA 2LRTA 2H01A 1GULA 4J57E 3FEUA 1QXHA 1FO5A 1UC7A 4WKWA 2GSSA 4MJBA 2DMLA 1SKSB 1GLQA 2KP2A 4O32A 1XFLA 1YJ6A 5DAKB 1SK2A 2V6OA 2MZCA 2MBTA 2CVKA 1KEBA 5J3RA 3CTGA 3IK7A 4ZB9A 3WGDA 3R2QA 5IO0A 4CW9A 4LMWA 3MNGA 4HOJA 2CAIA 1PMTA 4AJ7A 3OR5A 4YQMA 1FHEA 3VI5A 4BVXA 2FLSA 1CQGA 1TDIA 2JSZA 5AIXA 3KIJA 5J9CA 4I6XA 1M0UA 1MDIA 3CTFA 1JHBA 3IOSA 4F0CA 2VL2C 1TRSA 5DCHA 2DSAA 3NOFA 4NV5A 4V2LA 3U6VA 4TOPA 2VLUA 3DRNA 2PUKC 5D9TA 1TP9A 3Q74A 2KOKA 1JLVA 2KP1A 1R4WA 2OKAA 4ML1A 2H6YA 5A4VA 4MCUA 2L57A 1U87A 2FHEA 5C04A 1PL2A 17GSA 5IPGA 1GNWA 4MH3A 5DALB 3GA4A 2VCTA 3HJPA 2KUCA 2E2GA 3EMXA 1PKZA 4WR4A 2K6VA 3TKSC 5D9WA 3KCMA 5ELGA 2N5BA 1X5DA 1SENA 2XBQA 3GL5A 2HT9A 2JZRA 2F8FA 4ACSA 4Z7XA 3DVWA 3P90A 2VD0A 4XS4B 3EINA 4CHSA 3VWVA 1TOFA 4WF4A 1KTEA 4OFMA 2CV4A 1OKDA 1IYHA 3C7MA 4PQ1A 3MAKA 3C71A 4FO5A 1PD21 5HQPA 2IJYA 5CO3A 2FY6A 1GSQA 1V40A 1A23A 3VWUA 1N2AA 3HJOA 1ERVA 5JWOB 2FD3A 1THXA 1EP8A 1NSWA 4AJ6A 4RI6A 4L5LA 3TOUA 4MLYA 5DJMA 4XRAA 1YQ1A 1SU9A 5LNKe 3TUEA 4LLRA 2G0FA 2YN1A 3APSA 5G5EA 2E7PA 3M9KA 1TXXA 4X0XA 2H76A 4HU7A 4AF2A 4ZBAA 1TK5B 2H19A 5ECKB 1DSBA 3TRXA 5CRWA 4TN8A 1XWKA 4MA9A 1XZOA 3MDKA 1EOHA 3ERWA 4POMA 3TJGA 4L0WA 3TKSE 1O6JA 2XBIA 2XC2A 2TIRA 4MH2A 4IGJA 2C0GA 2BTOT 2DC5A 2X8CA 3PH9A 1DUGA 1GLPA 4ID0A 2DIZA 4TW5A 4Q5RA 4POBA 1MD3A 3CBUA 4BWQA 3IXRA 3GURA 5DAKA 2YNXA 3E9JB 3FRCA 4EDZA 5H5RA 1I9DA 4ECCA 1B4QA 3BCIA 3HZ4A 1S3AA 1V98A 3GTUB 1W89A 5ELAA 4E8HA 1F37A 1H75A 4KDXA 1M2AA 3GUSA 3RDWA 3DMLA 3UOMA 3JCML 3UJ1A 1QFNA 1YZXA 2V6KA 2GQLA 2FA8A 2MBSA 3Q19A 2V32A 2WCIA 5JCGA 1O8WA 1GUHA 1GRXA 5ECOB 2WULA 2E0QA 4IW9A 3F6DA 2HE3A 1M7TA 4D73A 4ML6A 1K0NA 1XPVA 2FA4A 1OVNA 1U3AA 2EIOA 1K0CA 1V57A 5ECNB 4F03A 5JCWA 4AGSA 4K2DA 5CRGA 1EEMA 3QD9A 3EVIA 3HDCA 2VLVA 2DBCA 4OO4A 4WBJA 3UBKA 3G7IA 4YAVA 1TKDB 4WBRD 5B6NA 3L9VA 2O85A 2IFQA 1G0TA 2PPTA 3GSSA 2AJQB 2AUVA 2LJKA 2YWNA 4DSSB 1JZWA 2OE1A 1QMVA 2H75A 4XS4A 4EE0A 4G19A 1THOA 3FKFA 4LL1B 4K6XA 3ZVJD 2L4QA 1F9MA 4KE3A 4EUYA 2O8VB 3V1WA 1ACVA 2ALBA 5C00A 3CRUA 2DJ1A 5E59A 4KW6A 5D8IA 3VFIA 5G5FA 1WP0A 1EZKA 5IPHA 5B7CA 4V1Ap 5EL8A 1HYUA 1UVZA 2AHEA 1GUKA 2B7JA 4K7IA 2NVLA 1O85A 4V2MA 4GRFA 2NBSA 4NHWA 1R5PA 1FVKA 3A2WA 5B8BA 1SL1B 3WD6A 5FWGA 18GSA 1B4PA 1WIKA 3MSZA 2L5OA 3QR6A 2P5QA 3APOA 2JACA 3UVHA 1Z7RA 3LYPA 1JZOA 4KH7A 5A5KA 4IN0A 4ZIJA 2AAWA 1G6YA 5H5QA 3NIVA 1ABAA 1K0BA 3M0FA 3FK8A 5CAXA 4I97A 4PQHA 1LBKA 1URMA 3D21A 2H0HA 1WOUA 4FH8A 4KSOA 1TI3A 3LXTA 3QDNA 1BJXA 4WETA 4I8BA 4MZCA 4K0NA 1F3AA 4XS1A 2M46A 1MEKA 5IM9A 3DXBA 4PUAA 2KLXA 3FZ5A 4TKYA 4TVEA 2RLIA 3F4SA 2VD1A 2M80A 4AJ8A 2TRCP 4K1FA 2KHPA 1K0MA 3AY8A 2GVPA 2YP6A 5B8AA 4CDOA 2PN8A 2C0FA 2LS5A 5GZZB 3FW2A 3RPNA 4I2TA 2VL9A 2C8UA 3M3MA 2AB6A 5DQSA 5JCUA 1GP1A 3GX8A 4PNGA 5GAND 4GSNA 3F8UA 5HFGA 3IK9A 1ZOFA 3EC3A 3ZLPA 3GIXA 5IOWA 1OC8A 1EV4A 2CT6A 2GSTA 1SYRA 2H6XA 2F9SA 2ES7A 4TXOA 1ON4A 5ECRB 2O87A 3CRTA 4POLA 1AQVA 4E8EA 2F8AA 2OACA 3FYGA 3ZL5A 1FOVA 2A2SA 2MMNA 4IVFA 3GKXA 9GSSA 5CNWA 2BMXA 4XTSA 5G31A 4KB3A 4GCIA 2C3NA 16GSA 3WYWA 1CQHA 4EDYA 2YOIA 1B9XC 3L0HA 5ENUA 4EL1A 1O8XA 1EV9A 6GSSA 1K0DA 1NHYA 2H1DA 1Z6MA 2YZUA 1LU4A 2PVQA 2H66A 1HNCA 2X8GA 4HU9A 5HR2A 3N5OA 4XIHA 1GTUA 2LRCA 2IMFA 4JZQA 1T4YA 1XIYA 2L4CA 2H8LA 3VPQA 2H6ZA 4HZ4A 4TR3A 2LJRA 4HJ2A 3EU4A 2XHFA 4IP6A 1J08A 3KXOA 3ED3A 2OBKA 1HD2A 1HNBA 5ECLB 2A2RA 1WMJA 3GYKA 5D96A 1O73A 3UMAA 3A2XA 1YF1A 2DJKA 3ZITA 4GWRA 2LEGA 5JWRB 1DBYA 3ZVJA 3TKPA 2XPEA 3TDGA 2DLXA 3QMXA 2N5AA 5CRDA 1SYXA 1G6WA 2MMAA 3KD0A 2VCZA 4EO3A 5AISA 1BG5A 3DYRA 1TRVA 4JEDA 3KJYA 4V1Ag 1B9YC 2HZFA 1TRUA 3LSZA 2H74A 4D73B 2IIYA 1YY7A 4K7OA 3W6GA 4EVMA 2YCDA 2HSHA 4MPFA 2PVOC 3TKRA 3QAWA 1U88A 2PERA 5JWQB 1J0FA 3O76A 2I4AA 1XWCA 3HD5A 5EVOA 3FR6A 3NZNA 4FYCA 2CVDA 4F0BA 1RW1A 3M9JA 4F9ZA 3IAS2 3QAVA 2RM5A 4DSQA 1GUMA 2IFQB 1ERTA 3IBHA 2H71A 2H0IA 4TR1A 4WEYA 1GSDA 1HQOA 4GF0A 3DD3A 2RUEA 1GSEA 3RAZA 3QFAC 2CZ2A 4O92A 4POKA 2LNTA 2K18A 2N5FA 3EU3A 3TCOA 3KH7A 4I5QA 4XCSA 3A3TA 5IQYA 6GSTA 5EPFA 2YPMA 4PUFC 2OE3A 1EEJA 4QL7A 3FZAA 2B5XA 4FYBA 1KBNA 5ECHB 3KZQA 2H70A 3HHVA 3ZYWA 4WF5A 5ECSA 4QL9A 4YAPA 4ZILA 1AXDA 2GQKA 1M2BA 2JZTA 1PRXA 2VUPA 5DDLA 3DVXA 4IKHA 3F0IA 4XS6A 2OE0A 3D0ZA 1GTAA 4BL7A 3KTBA 1X9MB 2P31A 6GSXA 4IP1A 1K3LA 5G30A 2DJJA 3ZREA 2LSTA 3P2AA 2VCXA 5EY6A 1V2AA 1TRWA 2GZPA 1G7OA 1U6TA 1E6BA 2P0GA 1X0RA 1ERUA 3F6FA 2YANA 5HR3A 3BJ5A 5KN3A 2EC4A 2O89A 3BCKA 1J9BA 3L9UA 2R4VA 2JSYA 2C3TA 4MP4A 4BWSA 4PQIA 1V58A 2YV9A 3DKSA 3KTLA 3LEFA 2WS2A 1VRSD 3TRQA 3TJJA 3TGZA 1Z6NA 1WRYA 4BA7A 4ECBA 1YKAA 4Q5QA 1G7EA 4G2EA 5F07A 3FHKA 4XHMA 5D93A 2B1LA 4NPBA 4JE1A 3ZIJA 1Z5YE 3D4TA 2QKEA 3L9SA 1PA3A 3QCPA 1B8XA 1RK4A 4NV2A 5CP1A 3ZRDA 2C0DA 4GQFA 1S3CA 2A4VA 4L5OA 5DCGA 1WJKA 2WB9A 3HVSA 3PINA 4TXOB 3LFLA 4YQVA 1OC9B 3E0UA 3HXSA 2FWGA 1GSFA 1M9AA 5F0GA 1Z7PA 4PX1A 5J41A 2OBIA 3CSIA 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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