3GKKA

Insights into the alkyl peroxide reduction activity of xanthomonas campestris bacterioferritin comigratory protein from the trapped intermediate/ligand complex structures
Total Genus 44
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
44
sequence length
159
structure length
156
Chain Sequence
AMTDAVLELPAATFDLPLSLSGGTQTTLRAHAGHWLVIYFYPKDSTPGCTTEGLDFNALLPEFDKAGAKILGVSRDSVKNFCAKQGFAFPLVSDGDEALCRAFDVIKEKNMYGKQVLGIERSTFLLSPEGQVVQAWRKVKVAGHADAVLAALKAHA
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
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molecule tags Oxidoreductase
source organism Xanthomonas campestris pv. campestris
publication title Insights into the alkyl peroxide reduction pathway of Xanthomonas campestris bacterioferritin comigratory protein from the trapped intermediate-ligand complex structures
pubmed doi rcsb
molecule keywords Bacterioferritin comigratory protein
total genus 44
structure length 156
sequence length 159
ec nomenclature ec 1.11.1.15: Peroxiredoxin.
pdb deposition date 2009-03-11

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00578 AhpC-TSA AhpC/TSA family
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.30.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich Glutaredoxin Glutaredoxin 3gkkA00
1YZXA 1ZZYA 4L8EA 3FR6A 1XOBA 4JRRA 4F03A 2HYXA 4AF2A 3P90A 2GQMA 2HFDA 4GWRA 2WJUA 1FW1A 3D5JA 5FT3A 1A2MA 1ST9A 1X5EA 2PBJA 2FNOA 1SYXA 2X8HA 7GSSA 2WDUA 3MNGA 2I1UA 4FO5A 4MABA 3TRXA 2JZRA 3HA9A 2DJ3A 2PVOC 4QQ7A 2ON5A 1SKSB 4X43A 3GIXA 5ELAA 1CQGA 2DJJA 4PNGA 4EC0A 1MDKA 5J9BA 2YZUA 4DSQA 1TI1A 1TU7A 2JZSA 1EWXA 3KMNA 4ECIA 4OCEA 3VWVA 4IELA 4KAEA 1T4YA 4O7HA 2JSZA 3TJFA 1QUWA 5D9XA 3H8QA 3IAM2 5ELGA 2LJRA 1T7PB 1K0OA 2C0EA 1XW6A 2YWMA 1X0RA 3IAS2 2AUVA 3C1RA 3BJ5A 3V1WA 2RLIA 4TR1A 2H72A 5EVOA 3IRAA 1RQMA 5AISA 1UVZA 1GL8A 3FY7A 3I6AA 3CSJA 1O73A 4MZCA 4EXJA 3TKQA 1JZWA 1O8XA 2FWHA 4NAXA 3C1SA 2KP2A 1RK4A 1K3OA 4EO3A 3KJYA 1EZKA 2AHEA 3D6IA 3GRXA 4ULXA 5DQYA 1F37A 1EOGA 3UVTA 2C80A 1F9MA 2R3XA 4ZL9A 1GUHA 10GSA 2RM6A 2L57A 3LORA 1XWCA 4D73A 1H4OA 1EP8A 2VD0A 5CP1A 5EY6A 1GSSA 1PA3A 1ZOFA 5CRDA 3PGTA 3IR4A 3EVIA 3UEMA 2RM5A 1FAAA 3NIVA 4FH8A 4TOPA 1V98A 3CSHA 1U3IA 3D22A 4KX4A 3PINA 3RAZA 1B48A 4XRDA 3EYTA 3HVSA 4NPBA 1VF4A 12GSA 2TRXA 3ZITA 1K3YA 3HHVA 1TU8A 3BD2A 5EPFA 2MMAA 3EMPA 3M9JA 4K8MA 3FKFA 3UIWA 3HCZA 1XCCA 1PKWA 3HD5A 3DVXA 2AB6A 2MBTA 2OACA 2WFCA 3LJRA 1E2YA 2PWJA 4MCUA 2VLTA 1ERTA 3DWVA 2OE3A 2GSRA 2H0GA 3O76A 4KNDA 4LMVA 4MH2A 4NMUA 2K18A 5LCZA 4K7NA 1SL0B 4JR6A 1OC8A 1U6TA 3N5OA 2LRTA 2YJ7A 3VLNA 2JL4A 2H70A 2VOCA 1EEJA 4IS0A 1GUKA 2H76A 4PQ1A 4ZBDA 3EMXA 1FVJA 1AQWA 4ACSA 19GSA 2FHEA 1R5AA 1K0DA 2LJKA 5HFGA 2NDOA 4WKWA 4KGIA 1PKZA 1HNAA 4GLTA 1GNEA 4OFMA 5ECMB 2DJ0A 2QKEA 1A2LA 3G7JA 4IKHA 3ERFA 1QGVA 4HEA2 4PQIA 4GTUA 1XW5A 4XRAA 5KEJA 1U3AA 3TOTA 3KCMA 3APSA 3TRPA 3VWUA 1O6JA 1IYHA 18GSA 3L9UA 1Q4JA 2YWOA 2D2ZA 2HSHA 4XS6A 1VRSD 3VK9A 2FY6A 3CXGA 2YV7A 1OC9A 3KP8A 2G2QA 2L6DA 4V1Ap 3BCIA 4KE3A 4ZL7A 1XXUA 2C0FA 1YKCA 2F9SA 4LLRA 4ML6A 3M0FA 1SJIA 2GZPA 4EDYA 1PMTA 3DEXA 2N5AA 3HKRA 4JE1A 1A0FA 3WT2A 4NV5A 1ZCPA 4JR4A 2JU5A 1V2AA 2VCZA 3KMOA 1OC9B 4K7IA 2LEGA 3H79A 2H0IA 1WE0A 3GL3A 2VO4A 3IOSA 2L5OA 3GV1A 5HQPA 4V2MA 1TI3A 6GSUA 5DJMA 2RUFA 3HXSA 3TJBA 4IN0A 5JCUA 5B8BA 4GQFA 4HQSA 5DAKA 1IYIA 1ERUA 5LD0A 1R4WA 4MZWA 1FG4A 2J9HA 1SD8A 5DQSA 5G31A 5GSTA 4WETA 4K7OA 1GLQA 1JHBA 3P8WA 3CRUA 2O89A 2GGTA 4LL4B 3DIEA 13GSA 2OKAA 1BX9A 4OMVA 1T00A 1EV4A 1JFUA 1K0MA 5CAXA 3F6FA 4FYCA 5ECHB 2KP1A 2REMA 4WF4A 3TKSA 2LS5A 4OWYA 1GSEA 5DAKB 2FWFA 1AQVA 3FZ5A 4PQHA 1TRWA 20GSA 4Q5QA 1JLWA 3G9BA 1PQNA 3ZMLA 3ZZXA 3LFLA 4NWYA 2A2RA 2R37A 5IMFA 1K0CA 3C71A 2LNTA 1OE8A 4AJ7A 5KN3A 2K8VA 4OFTA 4GSTA 5ECRB 1UC7A 3ME7A 3ZVJA 5L71A 2O85A 3C8EA 4EKZA 3PH9A 2HT9A 2FGXA 5ECNB 2N5BA 4MF5A 2R5GA 2I3YA 1HD2A 1B4PA 2B5XA 1C72A 2EIOA 2DSAA 1GSUA 4ZL8A 5DCHA 3L78A 5JCWA 4NHZA 3ZIJA 3NZNA 1YEPA 4MJEA 2H1BA 1F2EA 2MMNA 2PU9C 5IMVA 3LXZA 1THXA 4BA7A 1XVWA 3UBLA 3L9VA 1PRXA 5G5FA 2C4JA 1I5GA 2GSTA 2IJYA 4GCIA 3A2WA 4POBA 1ON4A 4YQVA 1ILOA 1NW2A 2B7KA 2H8LA 2VL3A 5LNKe 3D21A 3P7XA 3ERWA 2L5LA 1TDIA 4PXOA 4K9ZA 4WR5A 1GNWA 2GZZA 1YY7A 1KEBA 3HYPA 5H5RA 2FA8A 4WEYA 5EL8A 3G7IA 2CAIA 4XTSA 5A4UA 4E8EA 2VM2A 4ZIJA 4POKA 1T8EB 2HE3A 2FWEA 3A5WA 3IPZA 1R7HA 3A3TA 3EE2A 2L6CA 3EU3A 1GULA 3HZ4A 4L0WA 2F3MA 1GSDA 3UBKA 4ZB8A 1JLVA 3ZFBA 3C73A 1ZL9A 4FYBA 2G0FA 1G7OA 4LMWA 2ON7A 1AUCA 3GL5A 3M8NA 4YAVA 4O5RA 4AJ8A 3HJPA 4HI7A 3LYPA 4YH2A 17GSA 5DVBA 2GDRA 2MMOA 2LNSA 2H1AA 3WT1A 5B8AA 3ME8A 2ZNMA 3CSIA 1BJXA 1DUGA 2VUPA 1KBNA 3MWHA 3H1NA 3H93A 1MD4A 1VF2A 3GSTA 4QL7A 2CAQA 1M0UA 4EUYA 4XHMA 4WF5A 4TR4A 3K8NA 4MPGA 2H19A 5G1KA 4PUFC 2PN8A 4DEJA 4ZB6A 2LKUA 4XS1A 1EGOA 4K0GA 5ID2A 4TR3A 2OE0A 4IJIA 2C3NA 2NBSA 5CYYA 3ERGA 4PX1A 4Q5RA 5D8IA 2HLSA 1K0AA 1BQ7A 4N11A 4POMA 5C00A 2V6KA 1XWGA 2M46A 2CZ2A 3J7Yk 2PMTA 3VFIA 1VF1A 3QCPA 3IK9A 2J23A 8GSSA 4IJ3A 2EC4A 1S3AA 3DKSA 5ID2B 2GS3A 3KXOA 3GA4A 3CMIA 1XIYA 2YWNA 2IPAA 1WOUA 5E4WA 1SD9A 1PSQA 1SL1B 1WRYA 2AAWA 1YF0A 2H75A 3W8SA 4KB3A 1QMVA 1U88A 1GTBA 3TRQA 1HQOA 2YN1A 4MLYA 4NV2A 4L5OA 4PURA 3GUSA 5ECPB 5F0GA 5JWOB 2XPEA 1BG5A 2XBQA 2O7KA 3QFBC 2QC7A 1SJ6A 3GN3A 5HR0A 4V1Ag 5IMZA 4CW9A 3E3EA 1XVQA 2VCTA 3L0HA 3GKXA 2WULA 1M2AA 3DD3A 5D73A 1WMJA 3SBCA 2C3TA 1O8WA 2DIZA 5J3RA 1OKTA 1G0TA 2L4QA 4IP6A 1UN2A 3APOA 1AC1A 4BL7A 1NM3A 3GNJA 1ACVA 5B6NA 2P0GA 4MK3A 4BVYA 1SYRA 1WPIA 1B8XA 4F82A 1R5PA 1S3DA 5G2ZA 3LWAA 3HY2A 2LTKA 3UAPA 1Z6NA 3F9UA 2JACA 3LSZA 2GQKA 2YPMA 5G5EA 2HZFA 5KN2A 5FWGA 2FWGA 3KTLA 3LQ7A 3GMFA 3QOUA 4J57E 5GZZB 2V6OA 3A2VA 3PR8A 1SL2B 1URMA 1ABAA 2R2JA 3TGZA 5IPHA 1PX6A 1XWBA 2H0HA 4TKYA 1TRVA 1S3CA 3G7YA 2C3QA 5HFKA 1UA5A 2AV4A 3H4KA 3ZRDA 2I81A 3O6TA 3D4MA 5ECIB 1SJZA 3MSZA 3Q19A 1U87A 2KLXA 3RPPA 1ZYEA 3IV4A 4FIWA 2C8UA 2DLXA 1ERVA 4JU5A 1TRUA 3UARA 1V40A 4BPYA 3F3RA 3TB2A 2VL2A 2IN3A 3GHAA 4LL1B 3QAGA 2I9HA 4KDYA 5J5NA 2CVDA 2HRNA 4MH3A 3M3MA 2YP6A 2YANA 2LV3A 1M2BA 2YCDA 3FR3A 3MDKA 4V2LA 5GSSA 2VAFA 4ISDA 3UMAA 2HZEA 1AAZA 3CTFA 2H1DA 5ENUA 2YOIA 2DBCA 4KCAA 1X5CA 5F06A 2IWTA 1VF3A 3E9JB 4Q5FA 1G6YA 3KEBA 4WXTA 4PUAA 3RBTA 3TKRA 2ZUPA 2DIYA 1TP9A 1J9BA 4YQMA 3QDNA 4OD7A 4IW9A 3GKKA 5B6MA 4JBBA 5A4WA 1F3AA 1DSBA 2CT6A 2HZEB 2E0QA 4F0CA 1WIKA 4J56E 5COHA 1SK0A 2GQLA 1ZMAA 1NHYA 2BJXA 3HVVA 4JEDA 2VCXA 2C0GA 5IMDA 1XZOA 3IC4A 3TUEA 4RUVA 2B1KA 3D0ZA 2V41A 3UOMA 4MDCA 1MEKA 3M1GA 1YKAA 2NPBA 3ZYWA 4HDEA 1AXDA 3GSSA 2LQQA 1T3BA 3GH9A 3IE3A 2ZCTA 4KCEA 1H75A 3BCKA 1Q98A 3ISOA 3QR6A 3FK8A 1QQ2A 1XFLA 2WB9A 1YF1A 1YEXA 3QAVA 3GURA 1OAZA 3Q6OA 4HJ2A 5IIZA 3BOAA 1E6BA 3QMXA 3CRTA 1JZRA 3EINA 2WZ9A 3TKSE 1K3LA 3FEUA 5HR3A 2H66A 6GSVA 1K0NA 1TKDB 4H86A 3KH7A 4I97A 5F8BA 5IOXA 3KGKA 3TOUA 3HVXA 2LSTA 5DALB 3Q18A 5INYA 2H30A 1A8YA 5J9CA 4IHUA 2MYGA 4CDOA 2CVKA 4I2TA 2TIRA 9GSSA 4RQRA 1SK2A 1USBA 3LYKA 6GSYA 4GXZA 4RI6A 1XWKA 1PGTA 4F2IA 5JWQB 2QSIA 3TJJA 2H74A 3IXRA 3LXTA 2YZHA 2H71A 1I9DA 2CX4A 4IBPA 3TCOA 2VD1A 3Q74A 3UJ1A 2X99A 3QFAC 1XOAA 1GP1A 3RDWA 1BEDA 2GZYA 4XCSA 5IM9A 2OBKA 4N0ZA 1TJDA 3GTUA 2CA8A 1YQ1A 4KDUA 4IQ1A 1MDIA 4MP4A 2QGVA 1LJRA 4KW6A 4G2EA 2GT5A 3ZLPA 4EVMA 2CV4A 1AIUA 3EWLA 1LBKA 2OE1A 1EP7A 3IDVA 11GSA 1GLPA 4EF0A 5GAPD 3LGCA 4V2NA 1X5DA 2H1GA 4ID0A 3F4RA 1MDJA 3VI7A 2IMEA 1EOHA 4FYUA 4WBRD 4ECCA 4F9ZA 1KNGA 3GTUB 1GTUA 1ERWA 1G6WA 2X8CA 5E59A 1M9BA 1X9MB 3EURA 4ZB9A 2IMDA 2E2MA 1R26A 1Z9HA 2GTUA 4K0NA 2VIMA 1V58A 1Z5YE 3IA1A 2MBSA 2HSYA 5IO2A 3EU4A 1FB6A 5A5KA 4BWSA 3R2QA 2CQ9A 1PX7A 3RHBA 1MTCA 4HU7A 5IOWA 4L0UA 1THOA 2EIQA 4MA9A 3QAWA 1GRXA 4O92A 2H6XA 4EL1A 4BVXA 6GSXA 1A24A 2K9FA 1SKWB 2VCQA 1DE1A 1J08A 3P2AA 3W8JA 4G9HA 3TKSC 4IGJA 2PUKC 5IMCA 1G7EA 2OBIA 2DJ1A 5IPGA 3O3TA 2WS2A 4MF6A 3DXBA 5G1LA 1WJKA 4TR0A 4TRXA 3ZIVA 1Y6EA 2A2SA 4KH7A 4WR4A 2VLUA 1QK8A 2HNLA 1PL2A 5ECLB 3VPQA 1TK5B 1GTIA 4TW5A 4KSMA 4HZ2A 2OADA 3VPTA 3GFKA 3TDGA 2EIRA 4PGTA 2K6VA 3IBHA 4AGSA 4DSSA 2F8AA 3FHKA 1LU4A 2E2GA 2LRCA 3F4SA 1QFNA 5DDLA 1M2DA 3QD9A 3WGEA 4GQCA 5ECSA 2GLRA 3CBUA 2OA7A 5AGYA 4OO5A 1B9XC 1V57A 2KUCA 5H5SA 5HR1A 5CNWA 2VCVA 1A0RP 2MZCA 3RHCA 3GX8A 4AJ6A 1FO5A 5ECKB 2H01A 1N2AA 4RI7A 3I43A 2VLVA 3WD6A 3ZTLA 3DVWA 5DJLA 2Z9SA 1N8JA 5CRGA 4E8HA 4DSSB 4HS1A 2CX3A 1EEMA 3GX0A 2AJQB 2KOKA 2PVQA 1YJ6A 4HJMA 3WGXA 4TR1B 2IIYA 4N0VA 1CQHA 1RW1A 3FR9A 2RUEA 5FHIA 3CTGA 4K6XA 4HQZA 1VGLA 2HRFA 2LQOA 1M99A 4ZXGA 1Z6MA 3HJMA 3D4TA 3HZ8A 1T1VA 5A4VA 2IMIA 3QPMA 3DGQA 3FYGA 2FLSA 2I4AA 1HYUA 2IMKA 5CRWA 3E0UA 3MAKA 4D73B 1BAYA 2HI7A 2R4VA 1PL1A 1F3BA 5IMAA 1YDKA 4CHSA 2C0DA 2A4VA 4BWQA 1WWJA 2M72A 1JZOA 2CVBA 4EDZA 3VI5A 4ZBBA 2IL3A 1GSQA 3F6DA 4O32A 4TVEA 2P5QA 4ZILA 2DMLA 2GVPA 4HZ4A 2VM1A 3ZFLA 1ZYQB 2YNXA 4QL9A 2LUSA 1ZGNA 2O87A 2M80A 1OE7A 5CO3A 1TOFA 5AIXA 2PERA 5F05A 1X9WB 2B1LA 4ECJA 5KN1A 1W4VA 2KHPA 3US3A 5H5QA 1Z7RA 4I5QA 2DC5A 2YV9A 1F6MC 3F0IA 4ILFA 6GSWA 4K2DA 3U5RE 1FB0A 2IFQA 5IO0A 1JZDA 4OCFA 3DRNA 4KSOA 3FZ4A 2WRTA 5D96A 2XBIA 5C04A 3IK7A 1TTZA 4GSSA 3I69A 1GSFA 2F51A 1HNBA 2DJ2A 1A2JA 3A2XA 5CREA 3KIJA 1X9SB 16GSA 3DMLA 3FW2A 4MJAA 3FZ9A 3JCML 1XWAA 2FUG2 4PNFA 1EV9A 1NHOA 2IFQB 4IVFA 5J4UA 2ES7A 3ZREA 2CZ3A 4GSNA 2X64A 1QXHA 1SKRB 4N10A 2WGRA 3L9SA 3F3QA 4TXOA 3F8UA 5CRHA 4X0XA 3UVHA 3ED3A 1XPVA 1XBSA 1M7TA 1Y25A 14GSA 1M9AA 4OO4A 2F8FA 4MF7A 4TXVA 2XC2A 4ECBA 2V2GA 3VWXA 2R6KA 4LA1A 5IQYA 4MPFA 1NSWA 2P5RA 3KM6A 4TXOB 4ZBAA 2P31A 4L5LA 2L4CA 1PD21 1J0FA 3M9KA 3LEFA 2RIIA 3TKPA 1GH2A 4RQXA 2FD3A 3OR5A 1FOVA 1SK1A 1Z7PA 3F63A 3TJKA 2GSQA 4Q5NA 2XHFA 5DALA 1A23A 4WBJA 4NHWA 2VL9A 3TJGA 4J2FA 3IHQA 4G19A 5G30A 1GTAA 3ZVJD 3S9FA 3BBYA 1DBYA 4N30A 4P3YB 2NVLA 2LRNA 2IMFA 2WCIA 4KDXA 2JSYA 1OKDA 4K1FA 2K8SA 2GSSA 4IQAA 2H6ZA 3FRCA 4HUAA 1TK0B 2V32A 6GSSA 2FCHA 2X8GA 5B7CA 3RPNA 1SENA 4YQUA 2OJLA 4Z7XA 1TK8B 3FZAA 4DVCA 3KH9A 2GT6A 3NOFA 1AQXA 3EC3A 2L59A 1OYJA 2JZTA 5ABRA 2YWIA 4G10A 5AN1A 4MJBA 2B3SA 5ECOB 5D9VA 3ZL5A 2B5EA 5DCGA 2B7JA 4KA0A 1OVNA 2B5YA 1BYEA 1B9YC 1GWCA 4POLA 2NTOA 1FHEA 3C7MA 4GF0A 1MD3A 1TW9A 3KD0A 1A8LA 3CYNA 4MMMA 3HDCA 2V1MA 3KTBA 2VL2C 1W89A 3VURA 1TXXA 1GSYA 2H73A 1ML6A 2DJKA 4I8BA 2DMMA 5HR2A 2PPTA 1PN9A 2YJHA 2C1YA 2H6YA 2TRCP 3N9JA 1O81A 1KTEA 2VCWA 5DBQA 1O7UA 1SU9A 4XS4A 6GSTA 3HJOA 3U6VA 4MJCA 3UL3A 2XPDA 5J41A 5JCGA 5D93A 3W6GA 2BMXA 1EGRA 3VWWA 3GH6A 5GAND 1V9WA 5HFIA 4ML1A 1FVKA 2MMZA 4DSRA 4EE0A 1DE2A 1Z3EA 5D9TA 1AW9A 3APQA 4XS4B 1O85A 3ZMKA 4HOJA 3DYRA 5KN0A 3GYKA 3J7Yb 4GRFA 5F07A 1OC3A 3F4TA 4HU9A 1TRSA 4F0BA 1GUMA 2O8VB 4IP1A 3SWLA 22GSA 4JZQA 2E7PA 2LJAA 4I6XA 2N5FA 5AIVA 3KZQA 2FA4A 2AYTA 1K0BA 4YAPA 5JWRB 2HXKA 3AY8A 1HNCA 3GKMA 3WGDA 3I9V2 2B6MA 3L4NA 4X1UA 3KP9A 2PGTA 4NXIA 1T4ZA 5ECQB 2BTOT 5D9WA 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chains in the Genus database with same CATH superfamily
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chains in the Genus database with same CATH homology


 
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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#similar chains, but unknotted
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#similar chains in the pdb database (?% sequence similarity)
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