1T1VA

Crystal structure of the glutaredoxin-like protein sh3bgrl3 at 1.6 a resolution
Total Genus 34
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
34
sequence length
93
structure length
93
Chain Sequence
b'MSGLRVYSTSVTGSREIKSQQSEVTRILDGKRIQYQLVDISQDNALRDEMRTLAGNPKATPPQIVNGNHYCGDYELFVEAVEQDTLQEFLKLA'
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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publication title Crystal structure of the glutaredoxin-like protein SH3BGRL3 at 1.6 A resolution
pubmed doi rcsb
molecule keywords SH3 domain-binding glutamic acid-rich protein-like 3
source organism Mus musculus
molecule tags Signaling protein
total genus 34
structure length 93
sequence length 93
chains with identical sequence B
ec nomenclature
pdb deposition date 2004-04-19

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF04908 SH3BGR SH3-binding, glutamic acid-rich protein
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.30.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich Glutaredoxin Glutaredoxin 1t1vA00
3BCIA 4EC0A 4OD7A 4NWYA 5CP1A 2HYXA 1JZRA 3IOSA 5ECKB 4QL9A 2VLTA 2JZRA 3D0ZA 4GCIA 2VIMA 4NMUA 2XBQA 3A5WA 2QGVA 4XIHA 3CRUA 2PVQA 2C4JA 2PBJA 4KA0A 4EKZA 2GQKA 4OO4A 5B8BA 2GTUA 2B1KA 1GUMA 2P0GA 1GTUA 2OE0A 4KDUA 3QDNA 3GX8A 1SJZA 4F9ZA 3ERWA 5DALA 20GSA 3Q19A 2B7JA 2OA7A 2PU9C 4AGSA 1HYUA 4ZB6A 3EE2A 3EYTA 1GSEA 4XHMA 3DGQA 1AC1A 1G6WA 1XW9A 3TJGA 6GSSA 5DDLA 1O7UA 5C04A 1S3DA 2DMMA 4ULXA 4TR1B 1C72A 3GKMA 3QOUA 4MA9A 1K0AA 1F3BA 3GKNA 2LUSA 4GWRA 3US3A 4LA1A 3GRXA 5CRDA 5ID2A 1K0NA 5ECRB 4Q5RA 4GTUA 3RDWA 4D73A 3GA4A 2VCQA 5CRGA 2GS3A 1HNCA 3P8WA 2H01A 2B3SA 2M72A 3H8QA 1JZWA 1OVNA 3HJPA 1BYEA 4KSMA 5HQPA 4WBJA 4PUFC 1Z6MA 3LXZA 3BCKA 1AUCA 3FKFA 2HXKA 2LV3A 1PL1A 3GSTA 1YEXA 3LQ7A 3TKSA 5ECQB 4GLTA 1MDIA 4TR4A 3WD6A 4KE3A 4RI7A 5G5EA 1DE2A 1SD9A 3QR6A 4HQZA 5A4WA 2H30A 2AYTA 1AQVA 3HVXA 2HI7A 4QQ7A 3TJFA 2VD0A 3GKXA 3W8SA 4V1Ap 3VFIA 4MJEA 1MDJA 4IQ1A 2GSTA 1M2BA 3WGXA 5KN3A 3DWVA 4MZCA 5A4VA 2NBSA 3S9FA 1GTAA 2LQQA 3GH6A 2CV4A 3FHKA 4NV2A 5ECSA 1ZGNA 4I6XA 4TN8A 2HZEA 3A2WA 1OC9A 4WF5A 2MZCA 4KX4A 4LMVA 2IPAA 4F03A 3UJ1A 2WS2A 2J9HA 3F3RA 1J0FA 2H73A 7GSSA 5F05A 2O8VB 2H75A 4HOJA 18GSA 1PN9A 4X1UA 4YQMA 1SKWB 4KH7A 3ZTLA 3FR3A 2C0DA 3MSZA 5IM9A 4G2EA 1SJ6A 5CAXA 4PQHA 4L8EA 4MF6A 4FYBA 2IJYA 2YV7A 4TXOB 2VOCA 4XS6A 5KN0A 1PL2A 1PQNA 4HS1A 5GAND 2JSYA 5ECMB 1Z7RA 5CO3A 1TKDB 1JFUA 2DJJA 3MAKA 5E4WA 1IYHA 3IRAA 3A2XA 3TOUA 1AQXA 3DKSA 1W4VA 4PX1A 4YAPA 2L4CA 3ED3A 4O7HA 4N0VA 2FWEA 2BJXA 5H5QA 3ZMLA 2CVBA 2E2GA 3I6AA 4JR6A 5A4UA 3VI7A 4AJ6A 3LEFA 1EV9A 4K9ZA 4KGIA 1UN2A 1VF2A 4JRRA 3WT1A 2FLSA 1AIUA 3UARA 3N5OA 2YWNA 3BBYA 3NZNA 4ZB9A 2EIQA 2PN8A 4XS4A 2VAFA 1A2JA 2WJUA 5HR1A 1ZOFA 5ELAA 1EP7A 3BJ5A 2GSQA 5J5NA 6GSYA 3UBLA 4ZXGA 2CA8A 3V1WA 1Z3EA 1IYIA 4XRDA 3VLNA 1K3YA 1M2AA 2OJLA 3PH9A 3ZMKA 1FG4A 5LCZA 3HJMA 2B7KA 2N5FA 2CVDA 1GULA 2DJ2A 4MPGA 3U6VA 3HCZA 1O8XA 5HFGA 4BWSA 2CVKA 2PWJA 1U6TA 3FRCA 4MDCA 2TRCP 2L6DA 4Q5QA 2DMLA 1TDIA 4OCEA 2B6MA 4POMA 2I1UA 3GUSA 3GH9A 1XIYA 1FAAA 3HJOA 5CYYA 2FCHA 4GRFA 1NSWA 1GNWA 2KP2A 1XCCA 3PR8A 5ECPB 1A2MA 2CX4A 1G6YA 3ZZXA 3QFBC 3F6DA 4KNDA 3KJYA 3KMNA 2IMIA 5D9TA 5IIZA 2AV4A 3C1RA 1PMTA 4MABA 2GZYA 5G2ZA 3O3TA 2H76A 2VCXA 5D9VA 4V1Ag 2F8AA 2WGRA 4K7OA 5EY6A 1XOAA 1F3AA 1A23A 4JBBA 2CQ9A 2LJAA 3DIEA 4O92A 2LRNA 1PD21 4RUVA 2HE3A 3IE3A 1BG5A 4MLYA 2CAIA 4HZ2A 5IMCA 2LNTA 1YY7A 4EO3A 5AISA 3GTUA 2J23A 4GSNA 1OYJA 2K8SA 13GSA 2TRXA 1SL0B 1DE1A 2IFQA 5JCUA 3EINA 1EGRA 2K9FA 2H19A 3DD3A 3FW2A 3RPPA 3UIWA 4NHWA 2GQLA 3I69A 4MCUA 1UVZA 1OAZA 4FYUA 1M0UA 1W89A 2DC5A 3VPTA 3L9SA 4K2DA 3CMIA 2WDUA 3F9UA 3R2QA 2F3MA 3Q18A 2AAWA 3TJKA 4JU5A 4WETA 3A2VA 3TB2A 1PX6A 1V57A 2H1DA 5JWQB 2CAQA 4IJ3A 4RI6A 3KD0A 1GSUA 1ABAA 1Q98A 4GF0A 4WR4A 1V9WA 4TR3A 4DEJA 1YKAA 5DVBA 4P3YB 4DSQA 3CTFA 4AF2A 1WE0A 4GQCA 5CRHA 2OBKA 1TOFA 3VI5A 1XWGA 5AIXA 2D2ZA 3DXBA 2JL4A 2B5EA 2CX3A 2DJKA 3TKRA 5J4UA 4YH2A 2R5GA 4G19A 1O8WA 5JCGA 2LEGA 3KZQA 1O81A 4TR0A 1PX7A 3WT2A 1NHOA 4XRAA 3UVTA 1GL8A 3LJRA 6GSWA 12GSA 3JCML 5F0GA 5ECIB 4F0CA 1ST9A 1XWKA 3ERFA 5ECNB 5G1LA 1EGOA 3PGTA 2H70A 1X5EA 2H6XA 3CTGA 5DAKA 2RIIA 2C0EA 1WRYA 5F8BA 3EMXA 1X0RA 2OE1A 2YWMA 2I81A 4F0BA 3IA1A 3KTBA 1GTBA 5DCHA 1GUKA 5IOWA 5EPFA 4K7NA 3QD9A 3QMXA 1THXA 5G5FA 4WXTA 1E2YA 2VUPA 3F0IA 2GLRA 1JZOA 2H0IA 3IK7A 4ZIJA 3G7JA 4L0UA 5AIVA 4NAXA 5IOXA 1SYXA 2NDOA 5B7CA 3HYPA 1ZYEA 5IO2A 1DUGA 2NPBA 2VM2A 2DJ3A 1OKDA 2RUEA 8GSSA 2WCIA 1H4OA 3P90A 1JLWA 3BOAA 5HFIA 4ZB8A 5DQSA 2L59A 2IMDA 2WULA 4D73B 3P2AA 1Z9HA 1M9AA 1SD8A 1Y25A 2V32A 3TGZA 4OFMA 1O73A 5CNWA 1PSQA 1G7EA 3CSHA 2X64A 4DSSB 1AQWA 5GSTA 4OCFA 1SK1A 4TR1A 4ILFA 2L6CA 1DSBA 3EVIA 1WOUA 3VPQA 1NW2A 2V2GA 2ZNMA 1UA5A 4L5LA 3CXGA 3HD5A 1AW9A 2GDRA 1XXUA 1TTZA 1OE8A 4N10A 1ZMAA 1K3LA 1R26A 1NM3A 4NHZA 1YF1A 2F8FA 1ERTA 4IGJA 3WGEA 1YZXA 1B4QA 3W6GA 3ME7A 4K0NA 1ZZYA 3CSIA 4KCAA 4TVEA 5A5KA 1SK0A 4Q5FA 3IDVA 2VL2C 1U88A 1FVJA 2E2MA 2IMFA 1J9BA 3F6FA 1SL1B 1XZOA 4JEDA 3FK8A 2LQOA 1O6JA 2C0GA 2H6YA 3GYKA 4ECBA 4HU7A 1A8YA 3VK9A 2FWHA 2AB6A 3RHBA 5E59A 4JR4A 5IMAA 2FHEA 4GSTA 1LJRA 3KP8A 4IQAA 2CT6A 3MWHA 4PQ1A 1YKCA 2VLUA 2FA8A 4L5OA 3L9VA 5DJLA 1YJ6A 1B9YC 4HJ2A 2VCTA 2YJ7A 2ZCTA 5B6MA 5IQYA 1I9DA 5DBQA 3H93A 3G9BA 4KSOA 4HZ4A 4IP1A 1PKWA 4ECJA 4PGTA 2O89A 3C73A 4E8EA 2MBSA 4MZBA 3NOFA 3D4TA 4LLRA 5DJMA 5LNKe 4NXIA 1K0OA 3C7MA 4IVFA 4EF0A 1QFNA 5IMDA 2H6ZA 5HR3A 1OC3A 1QK8A 2KP1A 1SK2A 3DMLA 4PURA 4K8MA 1MEKA 5G31A 3L78A 4F2IA 1E6BA 3GKKA 4KW6A 1M99A 3IAM2 1ZYQB 1Z5YE 2YZUA 2R4VA 2YANA 1V58A 2H72A 2OADA 2KOKA 4CDOA 4WEYA 4OFNA 2B5XA 1GNEA 5D93A 1B8XA 1RQMA 3L9UA 3KIJA 3LORA 2H74A 3C8EA 3NIVA 2HLSA 2MMNA 3DVWA 1X9WB 3ZREA 4ZBDA 4ZILA 1T4ZA 2ALBA 2L5LA 1CQGA 4ID0A 4ZBBA 3GV1A 4POBA 1SJIA 4HEA2 1TK0B 3WGDA 3GURA 2YJHA 3D21A 2H0GA 1S3CA 4BPYA 5IO0A 1QMVA 1YEPA 3RBTA 3TRXA 3CSJA 5GAPD 4PNFA 3IXRA 3U5RE 3VURA 2X8HA 4XTSA 3ERGA 1A8LA 2F51A 3Q6OA 4ISDA 1GWCA 2L4QA 4IHUA 1QGVA 2C3NA 1JHBA 2G0FA 1HNBA 2IMEA 3H79A 4EDZA 2YZHA 3CRTA 4QL7A 2DLXA 2MBTA 5D96A 1SKSB 1OE7A 4EDYA 2GSSA 1ML6A 1UC7A 3J7Yb 4YQUA 1TK5B 1THOA 3EU3A 2VL3A 2LRCA 2A2SA 1BJXA 1MD3A 1V2AA 3F8UA 2LS5A 3E3EA 1VGLA 1G0TA 1G7OA 4N11A 2PGTA 1TW9A 2VCWA 4LL1B 3M1GA 5J9CA 3M0FA 1HNAA 4J56E 3IHQA 2V6OA 3D6IA 3TKSC 5ECLB 3DEXA 1V40A 1KBNA 1XVWA 4K1FA 4HUAA 4KB3A 5D9WA 3KGKA 1ERUA 2L57A 2GVPA 6GSTA 2H1BA 4MF5A 2IMKA 1USBA 2V6KA 4K6XA 16GSA 2BMXA 1O85A 1R4WA 10GSA 2RUFA 3W8JA 2K18A 5J41A 2YN1A 3RAZA 2YOIA 3C1SA 3GSSA 2GZZA 4X0XA 5LD0A 1XVQA 1LU4A 4FO5A 3ISOA 4TXVA 4EL1A 3HVVA 4V2LA 3FR6A 2WB9A 2X8CA 2C80A 3KTLA 3LYKA 1A24A 4X43A 2IFQB 3TCOA 1EEJA 2MMZA 3DRNA 1T7PB 3LG6A 3KM6A 3ZFLA 5COHA 1TU8A 1BAYA 1GTIA 2H1AA 3O6TA 5GZZB 4ML6A 3D5JA 1T1VA 2ON7A 3GX0A 1QQ2A 4K0GA 3KH7A 1SENA 3LWAA 3IR4A 3FY7A 2VL9A 2VCVA 2VO4A 4GXZA 4K7IA 2A4VA 2P31A 1OC8A 5D9XA 4MJAA 2EC4A 3H1NA 1EP8A 2V1MA 4YQVA 3IPZA 3GMFA 3KMOA 4BWQA 3J7Yk 2MMOA 1YQ1A 3ZIJA 3I9V2 22GSA 2LJRA 3FYGA 3ZVJD 3KH9A 2F9SA 4XS1A 5HR2A 3ZITA 2KHPA 4PXOA 4N0ZA 5H5SA 3BD2A 4HQSA 1ZCPA 3A3TA 3KEBA 4OWYA 4I5QA 3ZVJA 2O7KA 5FHIA 2JZTA 3D22A 3GL3A 1GRXA 1WP0A 3UVHA 3F63A 3LFLA 2IN3A 2I9HA 1F2EA 5L71A 3IV4A 2H8LA 3HA9A 3H4KA 1ON4A 2PMTA 2ES7A 1N2AA 4EXJA 2HSHA 1M9BA 4E8HA 3UBKA 1GUHA 6GSVA 3FR9A 3VWXA 1MD4A 1Z7PA 3IAS2 3EWLA 2A2RA 1M2DA 2C3TA 3VWWA 3QAGA 1XW6A 4EE0A 1WJKA 3IC4A 2XPEA 3UOMA 1A0FA 1GSSA 6GSUA 2LKUA 1XFLA 2O85A 4ZL7A 4GSSA 2MYGA 1ZL9A 1MDKA 4EUYA 4TKYA 4WR5A 4AJ8A 1KTEA 5G30A 2N5AA 4BL7A 2LNSA 1U3AA 4RQRA 5CRWA 2YWIA 4IELA 2REMA 2FUG2 1F6MC 5DALB 3HZ8A 2C1YA 2LJKA 1WWJA 3CYNA 2VM1A 3P7XA 2R6KA 2R2JA 5HR0A 3TUEA 4PNGA 1TU7A 1T00A 19GSA 1GLQA 1M7TA 2YCDA 3LSZA 1EV4A 4WF4A 1GSYA 2TIRA 5ID2B 4PUAA 1X9MB 2XC2A 3MDKA 4FIWA 1DBYA 1TI3A 3EMPA 2R3XA 2QSIA 1PGTA 2OACA 3LGCA 4JE1A 2DBCA 2GT6A 4TRXA 2WFCA 4O32A 1LBKA 1TRUA 5ECOB 2HNLA 1GP1A 1TRWA 2I4AA 5INYA 5D73A 3TRQA 3FZ5A 1V98A 2GZPA 2K8VA 5FT3A 2FGXA 3HXSA 5HFKA 4J2FA 4HU9A 5F07A 3L4NA 2RLIA 2X8GA 3SBCA 17GSA 5GSSA 3APOA 3PINA 2HSYA 1J08A 3F4TA 3I43A 4MPFA 2M46A 4XCSA 2DIYA 4L0WA 5JCWA 2GGTA 1B9XC 1FVKA 2HRNA 4MH3A 1FHEA 4MZWA 4DSSA 1K0CA 3RPNA 4ZBAA 1GSFA 2PVOC 4KDYA 1ERWA 3DVXA 4MJCA 1R5PA 1RW1A 2ON5A 1YF0A 3FZ4A 4DSRA 1EZKA 3F4RA 3TJJA 3SWLA 4YAVA 4MP4A 1HD2A 2OE3A 2H1GA 3FZAA 2AUVA 2C0FA 2FNOA 3G7YA 2L5OA 2O87A 2PERA 5D8IA 4KCEA 2HZEB 2HFDA 1OC9B 2H71A 6GSXA 2GT5A 4FH8A 4LL4B 3TKSE 4HJMA 2VD1A 2QC7A 1AAZA 3GN3A 3C71A 2IWTA 4Z7XA 4CW9A 1EWXA 4HDEA 2JSZA 3E0UA 1QUWA 1VF1A 9GSSA 3OR5A 2NTOA 4H86A 3GL5A 2LTKA 3L0HA 2VCZA 4BVYA 2DIZA 1XWCA 3UAPA 1WMJA 2B5YA 3M8NA 3QAWA 1Q4JA 2CZ2A 5J9BA 2N5BA 3APSA 3TRPA 2G2QA 1R5AA 2MMAA 4ACSA 4HI7A 5DCGA 1PKZA 3O76A 3E9JB 4IS0A 1JZDA 5JWRB 4GQFA 4Q5NA 1TK8B 3HDCA 1U87A 3QPMA 3ZRDA 1RK4A 5ABRA 4OMVA 4OFTA 1Z6NA 1VF4A 1GLPA 4BVXA 1VRSD 1ERVA 2Z9SA 1FO5A 1EEMA 5EVOA 1F9MA 5IMVA 1WIKA 1VF3A 4PQIA 1XWBA 3UEMA 3IBHA 4TXOA 3APQA 4XS4B 3N9JA 3Q74A 1XWAA 2AJQB 5C00A 1EOGA 1H75A 1S3AA 2RM6A 3FEUA 4I2TA 4IBPA 4RQXA 4TOPA 3KP9A 1AXDA 3GHAA 2DSAA 1ILOA 5IMFA 4LMWA 4BA7A 3K8NA 1XOBA 5J3RA 4ECIA 3F3QA 2LSTA 2GSRA 3QFAC 1SKRB 1T8EB 2FWFA 5G1KA 5CREA 3GFKA 3HVSA 2KLXA 1A2LA 1FW1A 3M9JA 2WRTA 4G10A 1R7HA 4POLA 1XPVA 1K0MA 1TRVA 2XBIA 3TJBA 1TP9A 3ZLPA 2AHEA 2E7PA 3TDGA 2K6VA 1TI1A 1NHYA 1TRSA 2JZSA 2GQMA 2JADA 1I5GA 2C3QA 1KEBA 4MF7A 1K3OA 3TOTA 2P5RA 4IJIA 1Y6EA 2EIRA 1TXXA 2H0HA 4I97A 4TW5A 1GH2A 2CZ3A 4NPBA 14GSA 3MNGA 3IK9A 1YDKA 3VWVA 1GSDA 5ENUA 5AN1A 2QKEA 2M80A 4I2UA 2R37A 3TKPA 1SU9A 2HRFA 4ZL8A 3TKQA 4IN0A 5B8AA 4WBRD 5IPGA 1U3IA 2P5QA 2E0QA 3CBUA 2IIYA 5B6NA 1B48A 1KNGA 11GSA 2HZFA 1XBSA 1T4YA 4MMMA 2DJ1A 1SYRA 3AY8A 2BTOT 2JU5A 1X5CA 1OKTA 3F4SA 3ME8A 5FWGA 2FA4A 3GTUB 1URMA 2IL3A 4J57E 2JACA 2C8UA 5EL8A 2PUKC 3GIXA 2YWOA 3HY2A 3EURA 4KDXA 3DYRA 1A0RP 3GNJA 1TJDA 3EU4A 4F82A 4N30A 5DQYA 1N8JA 1T3BA 5KEJA 5KN2A 2I3YA 2RM5A 2FD3A 5IPHA 3FZ9A 3WYWA 3QAVA 1XW5A 1FOVA 5IMZA 1K0BA 2EIOA 4V2NA 1BX9A 4IKHA 3KCMA 4O5RA 1QXHA 4I8BA 3ZYWA 4MK3A 2VLVA 4ML1A 2OBIA 3ZL5A 1MTCA 4DVCA 4MH2A 1BQ7A 5KN1A 5JWOB 4ECCA 2YNXA 3EC3A 2YPMA 4EVMA 2YP6A 1HQOA 3UMAA 2OKAA 1GSQA 3KXOA 2LRTA 4NV5A 1F37A 3UL3A 4FYCA 4CHSA 2XHFA 1EOHA 3M9KA 1SL2B 2H66A 5H5RA 1ACVA 3HHVA 4OO5A 3ZFBA 2X99A 2XPDA 4V2MA 4AJ7A 2VL2A 4IP6A 1BEDA 3QCPA 1JLVA 2PPTA 2B1LA 1X5DA 2NVLA 4WKWA 3ZIVA 1PRXA 1FB6A 3D4MA 2KUCA 2DJ0A 2V41A 2HT9A 3RHCA 4IW9A 5ELGA 4POKA 2FY6A 1K0DA 2ZUPA 3HZ4A 4KAEA 4KUNA 5ECHB 4MJBA 5DAKB 1FB0A 2FWGA 3VWUA 5F06A 1CQHA 3LXTA 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chains in the Genus database with same CATH superfamily
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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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