2R2JA

Crystal structure of human erp44
Total Genus 97
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
97
sequence length
370
structure length
328
Chain Sequence
TSLDTENIDEILNNADVALVNFYADWCRFSQMLHPIFEEASDVIKEEFNQVVFARVDCDQHSDIAQRYRISKYPTLKLFRNGMMMKREYRGQRSVKALADYIRQQKSDPIQEIKRNIIGYFEQKDSDNYRVFERVANILHDDCAFLSAFGDVDNIIYKPPGHSAPDMVYLGAMTNFDVTYNWIQDKCVPLVREITFENGEELTEEGLPFLILFHMKEDTESLEIFQNEVARQLISEKGTINFLHADCDKFRHPLLHIQKTPADCPVIAIDSFRHMYVFGDFKDVLIPGKLKQFVFDLHSGKLHREFSSPPESSFQKLAPSEYRYTLLR
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
{{ tooltip.sname }} connected with {{ tooltip.tname }} : {{qFormat(tooltip.svalue) }}
molecule keywords Thioredoxin domain-containing protein 4
publication title Crystal structure of human ERp44 shows a dynamic functional modulation by its carboxy-terminal tail.
pubmed doi rcsb
source organism Homo sapiens
molecule tags Chaperone
total genus 97
structure length 328
sequence length 370
ec nomenclature
pdb deposition date 2007-08-25

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00085 Thioredoxin Thioredoxin
A PF13848 Thioredoxin_6 Thioredoxin-like domain
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.30.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich Glutaredoxin Glutaredoxin 2r2jA03
3.40.30.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich Glutaredoxin Glutaredoxin 2r2jA01
3.40.30.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich Glutaredoxin Glutaredoxin 2r2jA02
4GLTA 2B7JA 2YNXA 1OC8A 3HDCA 2XPEA 1R5AA 2R3XA 3F6FA 5ELGA 14GSA 4GSNA 1SK0A 4GCIA 3KP9A 4MF7A 8GSSA 2HZEA 4JEDA 3DXBA 3P8WA 5CAXA 2MMOA 1A8YA 2H6ZA 2VLTA 2G2QA 1GSFA 3BCKA 3US3A 5F07A 2MBTA 5KN0A 3IA1A 3M0FA 1O8WA 1FB6A 1NW2A 4F0BA 1PMTA 2AV4A 1G0TA 2OBKA 3M8NA 2ZCTA 3KZQA 1XZOA 3W6GA 4JR4A 4KCAA 3S9FA 5G2ZA 4NXIA 4ZB9A 2GSSA 2H0GA 2HT9A 3MDKA 4QL9A 4O5RA 5D9WA 4H86A 1G6WA 2I3YA 1K0BA 2I4AA 4KH7A 4DVCA 4POBA 3WT1A 3ZVJD 3QCPA 2OADA 4ZBAA 3RPNA 1BQ7A 1XWAA 2A2SA 4L5OA 2K9FA 3C71A 6GSXA 3RHCA 3LQ7A 1XIYA 4IS0A 2E2GA 1PGTA 2CVKA 4K0NA 1BX9A 1M99A 1ERVA 4QL7A 1MDIA 3ERFA 5DCGA 3VWXA 5KN2A 5IMAA 3MNGA 3HZ4A 4Q5RA 2VL2A 3A2VA 1SENA 3ZFLA 1YKAA 1DBYA 3NZNA 3BBYA 4PUAA 2L6DA 1XPVA 1XFLA 4KNDA 1XOAA 3K8NA 1K3LA 3TKSA 2XHFA 3CTGA 1VF3A 2VOCA 2JU5A 1GLQA 1GNEA 5F8BA 4YAPA 2YPMA 4ZL9A 2H6XA 1HNAA 1PL1A 3HHVA 1SL1B 1AQWA 4EDYA 2CX3A 2JADA 5A4UA 2C3TA 2I9HA 4K1FA 1GSUA 3W8SA 1XVWA 2DJ3A 5LNKe 1S3DA 4MP4A 2WS2A 1M9AA 1C72A 3DYRA 1OYJA 3O76A 4IGJA 5KN3A 1O8XA 2WRTA 3GL3A 3UOMA 3KTBA 5A4WA 4ZIJA 3EMPA 4OD7A 2QKEA 3FY7A 3J7Yk 2HNLA 2VIMA 1F6MC 2QC7A 2LS5A 4HDEA 3G7JA 3UVTA 7GSSA 4IW9A 1BG5A 5D96A 2VM2A 3GV1A 2HRNA 2O89A 3QD9A 3ZMKA 3A2WA 2YWIA 5C00A 3UAPA 4LL4B 4MF5A 5EPFA 4BL7A 3D21A 2O7KA 4F2IA 5EL8A 1WIKA 4DSRA 3H79A 1EP7A 3EMXA 1K0AA 2HZFA 4JBBA 2JSZA 4FIWA 1XVQA 4JR6A 3LJRA 3HJMA 2YZUA 4OO5A 2TRCP 4NMUA 2FWEA 1S3CA 3GRXA 2IWTA 4ZXGA 3VWVA 1HQOA 4EC0A 4MLYA 2C8UA 5IOWA 2CQ9A 2YN1A 1RK4A 1DE2A 2MBSA 2RM6A 4GWRA 3GUSA 5KEJA 3RBTA 1TU7A 1PSQA 3HA9A 2BMXA 1GSEA 1X9MB 5DVBA 4GTUA 4Q5QA 2IFQB 2OE3A 4XRAA 1LBKA 4TR1A 4HJMA 1TK5B 4ML6A 2NTOA 4MH2A 3HD5A 4MZCA 3ZTLA 3GL5A 2VO4A 4MZWA 3KJYA 3LXZA 1T00A 3U6VA 1NSWA 5CREA 2DIZA 3CXGA 5HR1A 2REMA 1ERUA 3GTUA 4MCUA 2KP2A 2HSYA 3IK7A 1YEXA 4LL1B 2HFDA 4E8HA 3FZ9A 4K7OA 3ZIVA 1TOFA 2YWMA 3F3RA 2IJYA 2QGVA 3GKNA 1ZCPA 3GURA 3GFKA 9GSSA 4XS4B 5J9BA 4PQIA 2H1AA 1YF0A 1WPIA 2A4VA 2VL3A 4K7NA 4LMWA 2YANA 4HU7A 2PERA 3WT2A 2AAWA 5GSTA 5IO2A 1A24A 4Q5FA 2OACA 6GSWA 2OA7A 2IMKA 5JCUA 1OE8A 5IMCA 1HYUA 4FO5A 4HOJA 1Q98A 2LJAA 4MK3A 5LCZA 2P0GA 5HFKA 3F6DA 4NAXA 3ERWA 2H76A 3C1SA 3HYPA 1V57A 1B48A 1GTUA 4ZL7A 2IMEA 4IBPA 3CRTA 2F8AA 4GSTA 4JRRA 4J2FA 5IIZA 5ECNB 1PN9A 3LFLA 3M1GA 3RAZA 1TDIA 4DSQA 3KMNA 5B7CA 3DKSA 1WWJA 2NVLA 4G9HA 2IMIA 2X99A 2DJKA 5IQYA 1SYXA 1TTZA 5JWQB 1GSSA 4L8EA 4BWSA 3F4RA 3TDGA 4KDYA 5L71A 4HQZA 4N10A 4OO4A 2FD3A 3OR5A 2ALBA 2CAIA 1F3AA 3UMAA 1PX7A 1ILOA 3FR6A 3H8QA 2DJ1A 2GSTA 3D4TA 1Y6EA 2GLRA 5DALB 5ECKB 3DGQA 1V98A 2CVDA 3W8JA 4GQCA 3QOUA 2A2RA 3F63A 4GRFA 4HJ2A 4GSSA 4D73B 3HCZA 3F4SA 3VI7A 2LV3A 1AW9A 1QFNA 2BTOT 2XBQA 5IOXA 5G1LA 4XTSA 3KXOA 5EY6A 2NDOA 4WF5A 1BAYA 1JZOA 5CNWA 4DEJA 3QMXA 2ES7A 2H1BA 5CP1A 2MMZA 2AJQB 2GQKA 4K8MA 2OKAA 3P7XA 2XPDA 1TRWA 3IE3A 1ZYEA 2TRXA 1MTCA 3EURA 4J57E 5H5RA 1OVNA 5HFGA 1EP8A 1M2BA 4KX4A 4GF0A 3P90A 1V2AA 4RUVA 2B3SA 5A5KA 5HR2A 1JFUA 3NOFA 1ZZYA 5ID2B 1PA3A 4TOPA 1U3AA 4MPFA 1PL2A 3GX8A 1XWGA 4N30A 3FK8A 2LJRA 2AUVA 3L9VA 3RDWA 3ZVJA 4PURA 3GN3A 5GAND 1K0NA 3LYPA 2B7KA 1A23A 2B1LA 2X8CA 1U6TA 3GYKA 1O85A 4J56E 2GSQA 1EOGA 1GUKA 4P3YB 3QPMA 2DIYA 3HVXA 5INYA 2E2MA 4NHZA 2B5XA 2F51A 1GWCA 4I2TA 3DRNA 1AQVA 5J4UA 5ECQB 4BA7A 1FAAA 3EWLA 6GSUA 2KUCA 2M46A 2JZTA 3UBLA 5ABRA 2M72A 1XW6A 1OC3A 1T4YA 4RQRA 4POKA 3VWUA 3E9JB 3CYNA 3EU4A 2L5OA 3IRAA 1ERTA 2CX4A 3FKFA 2O8VB 2HE3A 3ERGA 1HNCA 1ZMAA 1SK2A 3MAKA 3APSA 5B6MA 2XBIA 5ECPB 3L0HA 3LGCA 2VLUA 2H0IA 4KW6A 2PVQA 3TJKA 2GZPA 1A2JA 1GSDA 3E0UA 3TJBA 2FWHA 2P5QA 4EVMA 3PR8A 2J9HA 1Z3EA 5ECMB 1KTEA 4I5QA 5DAKA 1AAZA 2WGRA 1EGRA 4NPBA 3D0ZA 2LJKA 6GSVA 4HEA2 1W89A 1TKDB 3QAGA 2WDUA 4RI6A 4XS4A 2C1YA 2R5GA 3I9V2 3VI5A 1WMJA 1A2LA 3Q6OA 3G7YA 2OE1A 2H74A 3WYWA 1RQMA 2RM5A 1DSBA 2VUPA 3KD0A 1OC9B 3QR6A 4E8EA 1F9MA 2ZNMA 2VCXA 1G6YA 3L9UA 2GSRA 1SKWB 1HD2A 3DVXA 1KBNA 4V2MA 2IPAA 1HNBA 3RHBA 2LRNA 1XCCA 4K2DA 4HQSA 1VRSD 3CSHA 3M9JA 3U5RE 2WCIA 3EYTA 5G5EA 2CVBA 4PUFC 4JZQA 2LKUA 3A2XA 2FA4A 1FVJA 1XW9A 2C4JA 3D5JA 1G7EA 3TKRA 1X9WB 2F9SA 3KH9A 4AJ7A 4OFTA 3KTLA 2LTKA 4EDZA 1TP9A 5A4VA 1GL8A 3VWWA 3H4KA 3H93A 1YDKA 3ISOA 4WKWA 3TCOA 5DQYA 1OKTA 2HSHA 4MMMA 1O73A 3GX0A 5B8AA 1M2AA 4MJEA 3KGKA 2H1GA 2P31A 13GSA 3IOSA 2IIYA 3HVSA 2H6YA 3LYKA 4Z7XA 3FR3A 1MDKA 1EEMA 5D8IA 2GTUA 5DALA 2MYGA 1Z6MA 2L59A 4FYCA 1R5PA 4PXOA 1GSQA 2N5BA 1USBA 5J41A 3VLNA 1H4OA 1F3BA 4CHSA 5HR3A 2R2JA 2LUSA 3C7MA 4NV2A 3IBHA 4K6XA 1FO5A 5G31A 2H1DA 1MD4A 3ZRDA 3ME7A 2MMAA 3I43A 1XXUA 1BYEA 2P5RA 1B9YC 2GVPA 1GUHA 4IQAA 4G19A 2PPTA 4WBRD 4AF2A 4IP1A 5IPGA 4K7IA 2VCVA 5IMVA 3UL3A 2H0HA 2CZ3A 3ZYWA 3APQA 5HQPA 4O92A 2R6KA 2HZEB 4XHMA 4G2EA 1M2DA 1GNWA 20GSA 2DSAA 2ON5A 1T4ZA 4GQFA 1GTAA 3BOAA 3M9KA 1X9SB 3IV4A 5JWOB 5ECSA 2LEGA 3F0IA 4EF0A 4TKYA 2GZYA 2GT6A 5ELAA 4ZB6A 1QXHA 19GSA 4EKZA 1FW1A 1XWCA 4HZ2A 1F2EA 2FGXA 1SL0B 3HZ8A 1ZGNA 4I97A 2LRCA 3O3TA 1Z7RA 1K3YA 4TR4A 3NIVA 4WETA 5CO3A 2C0GA 2I81A 1EV9A 5G30A 3VK9A 2JZRA 1O81A 1F37A 2KHPA 1X5EA 1GP1A 3GH6A 3M3MA 5KN1A 2YCDA 3QFBC 5C04A 3TJJA 2X8GA 2VCWA 3E3EA 1SK1A 5AISA 3GKKA 4TXOB 2DMMA 3A3TA 5ECRB 5LD0A 2DLXA 1SD9A 3MWHA 5F05A 2HYXA 2FWGA 4ZB8A 5GSSA 3Q19A 4IJ3A 3WD6A 1Z5YE 3TKQA 3EU3A 4N0VA 3TOUA 3QDNA 5DJMA 2ZUPA 4MZBA 16GSA 17GSA 5IO0A 4IVFA 3IDVA 2M80A 3UEMA 4ULXA 1IYIA 4MABA 1ERWA 3PH9A 1GRXA 1A0RP 2CAQA 1H75A 3FW2A 2OBIA 4YH2A 2MZCA 1OKDA 2DC5A 4MJAA 1Q4JA 5H5SA 2VL9A 5DCHA 2B5YA 2X8HA 3CRUA 3DWVA 5ENUA 5E59A 2FHEA 2JL4A 4JU5A 1J08A 11GSA 3CSJA 5AN1A 1QK8A 1VF4A 1OE7A 1EOHA 3VPQA 3LEFA 2KP1A 4WR4A 1GSYA 2C3NA 1AUCA 1E2YA 3I69A 2B5EA 2FWFA 2YWNA 3ZITA 1N8JA 2YP6A 5JWRB 4HS1A 2VCZA 3QAVA 1UC7A 2RIIA 1EV4A 1M9BA 2PMTA 3FR9A 2YJ7A 3FHKA 5D9TA 5IMZA 1AIUA 5ECOB 1N2AA 1YY7A 6GSSA 4PQHA 3CMIA 3PGTA 4IELA 1K0MA 4MA9A 2H66A 2IMFA 2FY6A 2VD1A 5IMFA 5D73A 2E0QA 1ZOFA 1TK8B 1B9XC 2L6CA 1PKZA 3N9JA 5CRHA 3UARA 4K9ZA 1TRVA 5B6NA 1FHEA 4WXTA 2F3MA 3UIWA 5D9XA 2J23A 2GGTA 4KE3A 1GUMA 4L0WA 2V6OA 1SKRB 2KOKA 2LQOA 1WJKA 2FNOA 2NPBA 1ZL9A 3HKRA 3G7IA 2YV7A 4JE1A 1B4PA 4OMVA 4HU9A 2C0EA 1SJZA 2VM1A 5JCWA 4IJIA 4XS1A 1V58A 2Z9SA 2VCQA 2K6VA 4DSSB 1M0UA 3WGEA 5FWGA 5HR0A 5G5FA 4X0XA 4HZ4A 2YZHA 4BVXA 1EWXA 2IMDA 4V1Ap 3P2AA 4PNFA 5E4WA 3LWAA 3BD2A 1FG4A 4HI7A 5CRWA 5AIXA 4N11A 1ST9A 2WZ9A 4WBJA 3D4MA 3WGDA 4X43A 3MSZA 3KEBA 1YJ6A 1EZKA 2XC2A 4TR1B 1QGVA 4I2UA 4ZBBA 4OFNA 3N5OA 1CQHA 2VAFA 3F3QA 5IM9A 3TUEA 2H30A 2K18A 3GTUB 5HFIA 4TXVA 1DUGA 2JACA 4XS6A 3LORA 3IC4A 4X1UA 3TKPA 2CZ2A 3WGXA 2HLSA 2D2ZA 3ZIJA 4MJBA 3HXSA 4KDXA 2H8LA 1M7TA 3IXRA 1SD8A 1PQNA 3LG6A 2WULA 2DJ0A 1U3IA 4BVYA 1LJRA 2GS3A 3F8UA 4EL1A 1FB0A 4OWYA 2OE0A 4WF4A 2C0DA 2C3QA 3PINA 1ML6A 3TRQA 2FLSA 3LXTA 1UA5A 3CTFA 3GMFA 5COHA 2HI7A 4V2LA 2JZSA 2GT5A 2YV9A 1A8LA 1IYHA 1PKWA 2GQMA 4YQUA 2IFQA 3EC3A 1Z6NA 4Q5NA 10GSA 3FEUA 1TI3A 4YQMA 1I9DA 3C1RA 2VL2C 3TB2A 5IPHA 1PD21 1WRYA 3RPPA 4MPGA 1THXA 4KCEA 1TU8A 5ECIB 2YWOA 3EINA 2K8SA 2C80A 1O6JA 2VLVA 3IAS2 4V2NA 1EGOA 4OFMA 4FYBA 1U87A 4TXOA 3TKSC 2X64A 2PGTA 18GSA 1SKSB 1BEDA 1R26A 1YQ1A 1CQGA 1YF1A 5G1KA 1NM3A 3ZL5A 3TOTA 5AGYA 3HVVA 4PX1A 1T1VA 2LNTA 3H1NA 3IPZA 1YKCA 3F9UA 2EIRA 3GSSA 4LA1A 4AJ8A 2LNSA 4IP6A 1NHYA 4KDUA 4ZILA 4F03A 1R4WA 1SJIA 3KIJA 5H5QA 4G10A 1UVZA 3KCMA 2R4VA 3SWLA 4ECJA 3IK9A 3IR4A 1GULA 1QQ2A 2R37A 3ZREA 3G9BA 3V1WA 2RUEA 4XCSA 4N0ZA 1SU9A 2B6MA 3D6IA 2FA8A 4GXZA 6GSTA 1AXDA 3UVHA 1X5CA 4WR5A 5ECLB 5DQSA 3ZLPA 4WEYA 3ZMLA 3C73A 2EIOA 2PN8A 3FRCA 1VGLA 3Q18A 1MDJA 4RQXA 4AGSA 3QAWA 4IKHA 1I5GA 5J5NA 1KEBA 5J3RA 2LQQA 5AIVA 12GSA 1GH2A 1BJXA 3SBCA 1Y25A 1TXXA 1XOBA 2FUG2 2IN3A 4L0UA 3JCML 2K8VA 3GIXA 4I8BA 4RI7A 3KP8A 4OCFA 3HJOA 2AB6A 4L5LA 3KH7A 4I6XA 4D73A 3GH9A 1MD3A 3BJ5A 1AC1A 2PVOC 3HJPA 1Z7PA 4ECIA 4KAEA 1DE1A 4LMVA 1B8XA 2MMNA 3R2QA 5ECHB 2VCTA 3KM6A 3C8EA 5EVOA 1URMA 1U88A 1TI1A 4V1Ag 3TJFA 5JCGA 4EUYA 3QFAC 1W4VA 2L4QA 2I1UA 1GTBA 1OAZA 1ABAA 5DDLA 2YOIA 1QMVA 4MJCA 3DMLA 1YEPA 4F0CA 2FCHA 1V40A 4POLA 4DSSA 1O7UA 2PBJA 1PRXA 3DIEA 1J9BA 2V2GA 1K0DA 2VD0A 2DBCA 4CDOA 6GSYA 5ID2A 1MEKA 2OJLA 2GZZA 4MDCA 3UBKA 1TK0B 1PX6A 3D22A 1JZRA 4KSOA 2KLXA 5B8BA 2H01A 4TVEA 1SL2B 1EEJA 1SJ6A 2H19A 4BWQA 4ID0A 2DJ2A 2DJJA 3DVWA 3BCIA 5F06A 1TRUA 2F8FA 3ZFBA 1TW9A 3ED3A 2NBSA 3F4TA 2JSYA 4IQ1A 2EC4A 3VFIA 2L4CA 4YQVA 3L78A 2V32A 3O6TA 3I6AA 1SYRA 5DAKB 2RUFA 1THOA 2EIQA 5J9CA 2H73A 3Q74A 3TGZA 4ACSA 3ME8A 2L57A 3TJGA 1GLPA 1J0FA 2O85A 4MF6A 2O87A 1WP0A 4NWYA 4IHUA 4EO3A 3GA4A 2WJUA 1XBSA 2V1MA 2H72A 2LSTA 1JLVA 2RLIA 2TIRA 1R7HA 3TKSE 1ZYQB 2E7PA 2HRFA 4O32A 5D9VA 2V6KA 3GHAA 2CA8A 5GAPD 1K0OA 2V41A 1V9WA 1X0RA 3J7Yb 3EVIA 2DMLA 2C0FA 1X5DA 4TW5A 3HY2A 1VF2A 4PQ1A 4NV5A 1WE0A 4ILFA 2CV4A 2WB9A 4YAVA 5GZZB 1ON4A 1JLWA 2HXKA 1KNGA 4KUNA 2H75A 2PWJA 4EXJA 2G0FA 5F0GA 2IL3A 3TRPA 3VPTA 4ECCA 4FH8A 1XWKA 5DBQA 4F9ZA 3EE2A 1S3AA 1T8EB 1RW1A 3GSTA 5FT3A 3ZZXA 3APOA 3AY8A 1G7OA 5CYYA 4BPYA 5CRDA 4EE0A 2B1KA 1AQXA 4HUAA 1OC9A 2ON7A 3DD3A 5D93A 2H70A 3FZ4A 3L4NA 1VF1A 1T7PB 1JZWA 3KMOA 2PUKC 3UJ1A 22GSA 3LSZA 1E6BA 1A0FA 4TR3A 4KGIA 1JZDA 1TRSA 2AYTA 2CT6A 2WFCA 1FVKA 3GKMA 4ISDA 5FHIA 2PU9C 3FZ5A 3FZAA 4PGTA 4ML1A 4MH3A 1ACVA 4XRDA 2AHEA 2YJHA 4ZBDA 1QUWA 5IMDA 3L9SA 4CW9A 1T3BA 1A2MA 1WOUA 1JHBA 3CBUA 2N5FA 4K0GA 4ZL8A 3GKXA 4QQ7A 3DEXA 4OCEA 3IHQA 1XW5A 4ECBA 4FYUA 1NHOA 1GTIA 4NHWA 4TN8A 2L5LA 1UN2A 4IN0A 2GDRA 3CSIA 1Z9HA 1K3OA 2GQLA 1LU4A 4POMA 1XWBA 1FOVA 2QSIA 1K0CA 4PNGA 2H71A 3FYGA 5CRGA 1TJDA 3TRXA 5DJLA 4KB3A 4KSMA 4AJ6A 4O7HA 3GNJA 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chains in the Genus database with same CATH superfamily
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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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