2R2JA

Crystal structure of human erp44
Total Genus 97
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
97
sequence length
370
structure length
328
Chain Sequence
TSLDTENIDEILNNADVALVNFYADWCRFSQMLHPIFEEASDVIKEEFNQVVFARVDCDQHSDIAQRYRISKYPTLKLFRNGMMMKREYRGQRSVKALADYIRQQKSDPIQEIKRNIIGYFEQKDSDNYRVFERVANILHDDCAFLSAFGDVDNIIYKPPGHSAPDMVYLGAMTNFDVTYNWIQDKCVPLVREITFENGEELTEEGLPFLILFHMKEDTESLEIFQNEVARQLISEKGTINFLHADCDKFRHPLLHIQKTPADCPVIAIDSFRHMYVFGDFKDVLIPGKLKQFVFDLHSGKLHREFSSPPESSFQKLAPSEYRYTLLR
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
{{ tooltip.sname }} connected with {{ tooltip.tname }} : {{qFormat(tooltip.svalue) }}
molecule tags Chaperone
source organism Homo sapiens
publication title Crystal structure of human ERp44 shows a dynamic functional modulation by its carboxy-terminal tail.
pubmed doi rcsb
molecule keywords Thioredoxin domain-containing protein 4
total genus 97
structure length 328
sequence length 370
ec nomenclature
pdb deposition date 2007-08-25

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00085 Thioredoxin Thioredoxin
A PF13848 Thioredoxin_6 Thioredoxin-like domain
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.30.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich Glutaredoxin Glutaredoxin 2r2jA03
3.40.30.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich Glutaredoxin Glutaredoxin 2r2jA01
3.40.30.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich Glutaredoxin Glutaredoxin 2r2jA02
2B6MA 1KEBA 1THOA 4RI7A 2CAQA 3QAVA 4RQRA 3LWAA 8GSSA 2V6KA 4FO5A 5JWQB 4DVCA 2JSZA 1B9XC 1F3AA 4EVMA 5JCGA 1PX7A 3EURA 1TK8B 2H8LA 4MH2A 3ZZXA 1TU8A 1SK0A 4RUVA 3M1GA 5CAXA 3ZITA 2V1MA 1PA3A 5COHA 4TR0A 4GCIA 2FNOA 4GSSA 5KEJA 1M9AA 3GV1A 4G2EA 3DVWA 1GSQA 2WZ9A 2MMZA 5DCGA 1WIKA 3HYPA 4GWRA 3HZ4A 1A0FA 2KP1A 4BWQA 2IWTA 5KN2A 4Q5FA 1J0FA 2V41A 3FR6A 1ZCPA 2LNSA 2VUPA 3UVHA 2MZCA 3US3A 1OKDA 3UVTA 4MLYA 2M80A 4OFTA 1C72A 4EO3A 2AJQB 5DAKB 2LJAA 5ECKB 1SD9A 3HVSA 1FB6A 5A4UA 2FLSA 1A2MA 3QMXA 3TRXA 1O8WA 3VFIA 2KP2A 4PUFC 4NWYA 2O7KA 1AXDA 2LQOA 3LXTA 3NZNA 1MD3A 1FO5A 3ZLPA 2C80A 1MD4A 3UBKA 3L9VA 2C8UA 4IKHA 2TRCP 4TW5A 1M99A 2DJ3A 3FR3A 3KMOA 2L4CA 2VM1A 5HR3A 4O7HA 1M0UA 2LV3A 2JZSA 3DMLA 1F3BA 6GSUA 2C1YA 4XHMA 1PSQA 4N0VA 5INYA 4HQSA 1ILOA 4EKZA 4IW9A 1EEJA 2FA8A 3F4TA 2WFCA 3G7JA 2CVBA 2OE1A 3PH9A 3PGTA 4GQFA 4K0GA 4V2MA 5AGYA 1RQMA 4GSNA 4HZ2A 1NM3A 4X0XA 2VO4A 1GTIA 4Q5RA 1I5GA 1B4PA 2HI7A 3Q19A 1TW9A 3M8NA 1GUHA 3O3TA 1Z7RA 1SJIA 3TKPA 2QSIA 3F3QA 4F03A 3FY7A 5HFIA 4N0ZA 2GSRA 2OA7A 3NIVA 3IAS2 4KDUA 4YH2A 2GS3A 4AGSA 4ZB9A 2CV4A 1T1VA 1Y25A 3A2WA 4HDEA 3CSJA 4MF5A 3BOAA 1ZMAA 4TR3A 2DJ2A 1DUGA 2CAIA 3DGQA 2R3XA 3VK9A 3C1SA 3K8NA 4MK3A 4KX4A 2DLXA 4CW9A 1N8JA 1EGRA 2PPTA 4KDXA 3M3MA 1FVJA 1CQGA 4MZWA 2E0QA 1TRSA 1NW2A 4KAEA 1TU7A 5FT3A 1HNAA 3LJRA 3Q18A 4XRDA 3D5JA 14GSA 4KSOA 1Z3EA 3HVVA 3ZMKA 2CQ9A 4IQAA 4V2NA 4AF2A 1R4WA 4F2IA 2B5XA 1YKCA 4POKA 4GTUA 1PX6A 1W89A 4ECJA 4FIWA 5D9XA 4PNFA 3Q74A 3P7XA 4TN8A 4PURA 2WB9A 2AUVA 2LS5A 3ZIVA 3VPTA 3L78A 5G1LA 4EE0A 5IMZA 2YWMA 4PNGA 2H70A 1IYHA 5F05A 2VD0A 1EV4A 1FVKA 5ID2A 1GSUA 1OC8A 2VCVA 5G5FA 2DJ1A 1KTEA 9GSSA 5J5NA 4ZBAA 3TKQA 4J2FA 2YPMA 3ERWA 2YCDA 3U6VA 1K0NA 1E6BA 1M9BA 3QFBC 2EIQA 1GRXA 3KZQA 3ISOA 1NSWA 2XC2A 2G2QA 3GHAA 2WS2A 2PBJA 1EP8A 3H93A 2VCXA 2ZNMA 4ECIA 4NXIA 5JCUA 3WT1A 1LJRA 2GSTA 3TJGA 1ZGNA 1QFNA 1XIYA 2HSYA 4IELA 3ZMLA 3IHQA 1SJ6A 2H01A 1Z7PA 2H76A 1Z6NA 1GTBA 5EVOA 5F06A 5GSSA 3KH7A 2F3MA 4HUAA 2B5EA 10GSA 4MJEA 3EU4A 1GH2A 3G7IA 3FK8A 3QOUA 3EYTA 3A3TA 4GLTA 5LD0A 4F0CA 1BX9A 3MAKA 5CO3A 4I8BA 1XW6A 3LORA 4MABA 5IQYA 1V9WA 3CRUA 1O8XA 2A4VA 5ECMB 1A2LA 4TKYA 5IMCA 3FRCA 3UEMA 2FWGA 1MTCA 1TJDA 3EVIA 2H73A 3F4SA 2C3TA 4HQZA 3EINA 2H30A 3CXGA 1X9WB 3C71A 2LRNA 1A8YA 1TK0B 3HJPA 2YJHA 3GL5A 3HXSA 1YEXA 4JBBA 1QQ2A 1V57A 1SKSB 1FW1A 3TJJA 1GLQA 4ZBDA 4BPYA 3GA4A 3IAM2 5IOXA 5ECIB 1XVWA 4EF0A 1EGOA 1YF1A 3FYGA 3GNJA 4KGIA 3KP9A 4XS6A 3IK9A 3F0IA 2MMAA 5AN1A 1Q4JA 2DC5A 3GFKA 1SK1A 1JLWA 2K18A 4IN0A 4OFMA 1IYIA 2FUG2 2QC7A 1T00A 2HSHA 4WKWA 2KLXA 1M2DA 1QK8A 3JCML 4BA7A 2R4VA 4EDYA 1SU9A 1AIUA 2VL2A 2YN1A 2ZUPA 1ACVA 4IVFA 1ZL9A 1FG4A 1O6JA 2LKUA 1AQVA 1QXHA 2C3QA 1B48A 4TXOA 3HJMA 5FHIA 4KA0A 5KN3A 6GSSA 4K7NA 4JU5A 5HR0A 2H75A 5DQSA 1PMTA 2CX3A 3HD5A 3A5WA 3RBTA 1SENA 6GSWA 5ID2B 4L5OA 1A2JA 3CTGA 5ECSA 3KMNA 4ZIJA 2Z9SA 2FA4A 3I9V2 4CDOA 1UN2A 3FHKA 2X8CA 4WR4A 3D4TA 3ZIJA 3GKXA 5KN0A 2B7JA 2R2JA 5EPFA 2H1GA 1FB0A 4NPBA 1AW9A 3WYWA 5JWRB 5G1KA 2LJKA 1PKWA 1SYXA 3BBYA 5D9TA 1XWKA 1S3AA 3GX8A 2HRNA 3KM6A 5IPHA 3UL3A 1GNEA 1QUWA 1EP7A 2IL3A 4KUNA 4QL9A 17GSA 1ERTA 1WOUA 4MZCA 3SBCA 2I3YA 1SD8A 4ZL8A 1S3CA 5FWGA 1VF3A 1UC7A 4MJCA 5DDLA 1K3YA 5H5QA 2REMA 2FWEA 1OKTA 3ERFA 2KUCA 3GIXA 4LMWA 2VIMA 3GKMA 1UVZA 2VL3A 3IBHA 4X43A 1DE2A 1VF4A 1YKAA 1GUMA 1TP9A 20GSA 4HU7A 1TI3A 5ECLB 2XHFA 4YQUA 5GZZB 4XIHA 3TJFA 4DEJA 1EZKA 1YJ6A 1K0OA 2RIIA 3F63A 3MDKA 4MDCA 2RM6A 3RDWA 4POMA 1T4ZA 5D9VA 1VGLA 2YZUA 3TKSA 2GZYA 2LJRA 1R5PA 1GTUA 1F2EA 1FAAA 4XRAA 4KW6A 2H72A 4V1Ap 4ZB8A 2GQLA 1YF0A 3TRQA 3ZTLA 4F9ZA 2L5OA 4E8HA 2H6YA 1R26A 2J23A 2H1BA 5IM9A 3MWHA 3M0FA 3UBLA 3IK7A 3O6TA 1K3OA 1EV9A 3RHBA 2IMEA 3G9BA 2IPAA 2JZTA 3WGEA 4YQMA 3FZAA 1WMJA 5B8BA 4MF7A 4RI6A 3BJ5A 4TVEA 1Y6EA 3EE2A 3HKRA 5IMDA 2R6KA 4O32A 5CYYA 2KHPA 1H75A 1M2BA 5IIZA 1VRSD 3LGCA 4PGTA 1KBNA 4O5RA 2WCIA 1G7OA 5DALA 2DBCA 1O81A 2VLVA 3FZ4A 4G10A 2GSQA 4MPGA 1R7HA 3TKRA 4OO4A 2B1LA 5D8IA 4TXOB 1J08A 4CHSA 1NHOA 13GSA 2X8HA 4I5QA 3I43A 3ME8A 3KXOA 3RPNA 2NVLA 5CP1A 2RUFA 2H0HA 1GLPA 4Q5NA 1V2AA 4J56E 2A2SA 2N5AA 4WETA 1WRYA 1ON4A 3DXBA 2PUKC 1USBA 2M72A 4KCAA 2L57A 3WGXA 3KP8A 2IN3A 2ON7A 2VD1A 2NBSA 4AJ8A 5B8AA 3APSA 2P0GA 2CT6A 3CRTA 3P8WA 4IP1A 4KCEA 4NV5A 2IMIA 1YY7A 2VCTA 3GYKA 1TK5B 3H4KA 5CREA 2H19A 1ERUA 2VL2C 2XPDA 1F37A 3ZL5A 2FWFA 1XWAA 4WEYA 1PL2A 4N11A 3HZ8A 4TXVA 1K0BA 1OC9A 3W8SA 4PXOA 4ZILA 4NMUA 4ML6A 4ZBBA 3FW2A 1G0TA 4POLA 2DIZA 5JWOB 4ZL9A 2H1AA 3HA9A 2PERA 1U3IA 3N5OA 1FHEA 2EIRA 4K7OA 4GSTA 2C0FA 3VPQA 5ECPB 3NOFA 2H0IA 3F4RA 3FEUA 3IOSA 3KGKA 2QKEA 2JL4A 1K0DA 1PRXA 2LRCA 4K8MA 4LLRA 2L5LA 5JCWA 3APOA 4WXTA 1JFUA 3KD0A 5J4UA 3GKNA 2HNLA 1URMA 22GSA 3RPPA 2L59A 4H86A 4HOJA 3CTFA 3GKKA 6GSTA 1X9SB 2XBIA 3L9SA 2VLUA 2BMXA 5A4VA 2H1DA 2JZRA 1GNWA 3DYRA 4XS4A 1HNCA 2LTKA 2B7KA 4NV2A 2O89A 4V2LA 3VURA 1JZWA 1X0RA 2H71A 2H0GA 3MSZA 4MMMA 4YAVA 4IP6A 3RHCA 4ZL7A 2N5FA 3DWVA 2OKAA 3CSIA 1GSDA 4WBJA 2GVPA 3DRNA 1EOHA 1JZDA 3BCKA 3F8UA 5E59A 2WRTA 1HYUA 2C0DA 4V1Ag 2C4JA 1Q98A 2FCHA 1HQOA 1BG5A 1CQHA 3KEBA 1GSYA 1PKZA 3DKSA 2LRTA 2HYXA 3IE3A 5B6MA 1NHYA 5HR1A 1XBSA 5CRHA 2VLTA 4Z7XA 5HQPA 3E3EA 5D73A 1R5AA 1XW5A 4MH3A 2DMLA 4XTSA 2RM5A 1YDKA 2OACA 5F0GA 4FYUA 3GN3A 2N5BA 3LYKA 5DQYA 3TKSC 1WWJA 3ZRDA 3ZFBA 2FWHA 4YAPA 2YV7A 1XWGA 2NPBA 4HS1A 3J7Yb 4HJMA 1SYRA 2AAWA 4FH8A 2PWJA 12GSA 1TRVA 4N10A 4IQ1A 3CSHA 4J57E 4HEA2 2F8AA 2WULA 2XPEA 1KNGA 3W8JA 4KB3A 1A8LA 1GTAA 5H5RA 1O85A 4ECBA 5G5EA 5KN1A 5H5SA 1ZOFA 4I6XA 5EL8A 3WGDA 1TOFA 1F9MA 2R37A 2XBQA 5CRDA 1OC3A 4WR5A 2HLSA 3C73A 2NTOA 5C00A 1AUCA 1W4VA 2FGXA 5EY6A 2YJ7A 3FR9A 5ENUA 4BVYA 1ZZYA 3O76A 5DCHA 2H66A 1K0AA 3HVXA 1WP0A 4NHWA 3ZYWA 3FKFA 3EMXA 1EEMA 3IR4A 2MBTA 1VF2A 1YZXA 5J9BA 16GSA 1AC1A 3I69A 3UJ1A 1WE0A 1QMVA 1OC9B 4O92A 4L0WA 1XOBA 3TUEA 1PGTA 2GDRA 3L4NA 2B1KA 2PVOC 3C7MA 2L4QA 1XPVA 3ED3A 1AAZA 3F6DA 5ECQB 3ZREA 1DBYA 5E4WA 5GAPD 1Z9HA 2IJYA 3APQA 2LUSA 1O7UA 2YP6A 2GTUA 2LEGA 4EC0A 2FHEA 3F9UA 2DJ0A 4PQIA 3V1WA 1XFLA 1K0MA 1G7EA 4DSRA 3LSZA 2HZFA 2YWNA 3QR6A 1V40A 4WF5A 4LA1A 4KNDA 3QAGA 5ABRA 1E2YA 1ZYEA 2TIRA 3IA1A 5HFKA 1ERWA 1G6YA 2YZHA 5J9CA 1Z5YE 2GQMA 4XS4B 3EC3A 3TCOA 1GSFA 4HJ2A 1JHBA 2JSYA 4OO5A 2GZZA 4EXJA 2R5GA 1T4YA 3CMIA 5G2ZA 3TRPA 2K8SA 2JADA 3QDNA 2VOCA 1SL2B 2GLRA 1OAZA 2I4AA 1TKDB 2EC4A 2ZCTA 4MZBA 5ECRB 4N30A 2GT5A 2DJJA 4DSSA 1AQXA 5A5KA 2O87A 2H6XA 1N2AA 2PVQA 3C1RA 3GSSA 5ELAA 1RK4A 5IMVA 5IO0A 3GSTA 4ISDA 4TR1A 1MDIA 2BTOT 4ML1A 4ECCA 1JZRA 3QPMA 4OWYA 3D4MA 4K1FA 2CA8A 3CYNA 4IS0A 4RQXA 1SL0B 2J9HA 2DJKA 1OE7A 4MP4A 2DIYA 2JU5A 3EU3A 3GH6A 2DMMA 3GMFA 2CVKA 4JE1A 1PQNA 1SJZA 3LXZA 2VAFA 2CZ2A 1SKWB 1RW1A 3KTBA 3ME7A 3PINA 3F3RA 1EWXA 4ZB6A 3WT2A 5CNWA 4L8EA 1BAYA 3QFAC 4MJAA 5GSTA 5J3RA 4E8EA 2HXKA 5IOWA 1I9DA 3D22A 3OR5A 2RUEA 3ZFLA 4L0UA 2PGTA 1PN9A 2WGRA 2VCWA 3GTUA 2P31A 3BCIA 3DD3A 2EIOA 4GXZA 2A2RA 1M2AA 3Q6OA 1G6WA 4POBA 3U5RE 4K0NA 1TXXA 1BQ7A 1V58A 3EWLA 5B6NA 2YV9A 1XCCA 1T7PB 3WD6A 4L5LA 3KJYA 2CVDA 2JACA 5IO2A 5CRWA 4FYCA 1BEDA 2HT9A 4G19A 5HFGA 4IHUA 5IMAA 1LU4A 2E7PA 4ZXGA 3LQ7A 4NAXA 5LNKe 3L9UA 4JEDA 5AIVA 2OJLA 1DE1A 4F82A 2G0FA 3GUSA 1T3BA 3D6IA 4BL7A 2YWIA 1TRUA 2LQQA 1J9BA 4OD7A 5LCZA 3VLNA 4KDYA 3A2XA 4BVXA 2OBKA 4G9HA 2AHEA 3H1NA 5F8BA 4HZ4A 4WF4A 1GUKA 5B7CA 3DEXA 1TI1A 3KIJA 3ZVJA 2HFDA 2OE3A 4K7IA 4I97A 1A23A 4IGJA 3VI7A 3UAPA 2I9HA 2V32A 1AQWA 1X5DA 2AV4A 3HY2A 1PD21 5AIXA 4QL7A 4JRRA 4IJ3A 3GH9A 2P5RA 2F9SA 2M46A 2OE0A 2IMFA 2HZEA 11GSA 2IMDA 4IBPA 5AISA 2IIYA 3CBUA 4TRXA 4NHZA 3HJOA 4ILFA 1MEKA 4MJBA 4JR4A 2GQKA 2IFQA 6GSVA 2TRXA 4XCSA 1BYEA 4K2DA 1XZOA 1THXA 3TJBA 2K6VA 1B9YC 3TOUA 2VL9A 3VWWA 3TKSE 4DSSB 1ML6A 3M9KA 5CRGA 1BJXA 1VF1A 3I6AA 1MDJA 2FD3A 4TR1B 4OCFA 1XXUA 4AJ7A 1U3AA 4HU9A 5F07A 1TRWA 5D96A 3E9JB 4D73A 4JR6A 2I81A 4FYBA 3TB2A 1EOGA 1OVNA 2HRFA 2X99A 4WBRD 2GT6A 2OBIA 4KSMA 2YWOA 4AJ6A 2QGVA 1TTZA 3N9JA 3C8EA 4ACSA 5D93A 3EMPA 4ID0A 2VCZA 5IPGA 3MNGA 2X64A 3QCPA 2DSAA 4LL4B 1DSBA 2E2GA 4TR4A 4XS1A 5D9WA 2YOIA 3H8QA 2P5QA 1SK2A 1B4QA 2B5YA 2MMOA 3SWLA 3GTUB 4PQHA 3IXRA 3IC4A 2HE3A 1MDKA 1M7TA 2O8VB 6GSYA 1GULA 2I1UA 1XWBA 3KH9A 3IRAA 2NDOA 1U88A 3FZ9A 5IMFA 3UARA 1X9MB 2K8VA 3UMAA 3IV4A 1GL8A 3TJKA 5GAND 2F8FA 3VWXA 3AY8A 1SKRB 2C0EA 2FY6A 2GZPA 1OE8A 1U6TA 3J7Yk 3QAWA 5G31A 5ECHB 4YQVA 3P2AA 3L0HA 3LYPA 4EL1A 4GRFA 1YQ1A 1XW9A 3GRXA 1T8EB 2OADA 5DALB 3LFLA 1ABAA 4ULXA 2C3NA 3GL3A 1V98A 2IMKA 1WJKA 3S9FA 4MCUA 1ZYQB 2GSSA 4GF0A 4MPFA 5DAKA 3TOTA 18GSA 5A4WA 5ELGA 2MBSA 3GURA 3E0UA 3A2VA 1B8XA 6GSXA 1S3DA 4OMVA 5DJMA 1XOAA 2F51A 2L6CA 1X5CA 5DBQA 2BJXA 1H4OA 3DVXA 5L71A 1GSSA 3R2QA 3TGZA 3HHVA 1SL1B 1GWCA 3HCZA 5HR2A 4TOPA 1X5EA 4BWSA 4F0BA 4DSQA 3LG6A 2HZEB 2V2GA 1GP1A 2ON5A 4HI7A 4LMVA 4PUAA 4MF6A 2PMTA 3TDGA 4OFNA 3F6FA 5ECNB 4P3YB 4KE3A 1XWCA 1O73A 4Q5QA 3P90A 5ECOB 4EUYA 3VI5A 5DJLA 2IFQB 1A24A 2PU9C 1TDIA 4K6XA 3HDCA 1WPIA 2E2MA 2MMNA 2GGTA 3VWVA 2K9FA 3ERGA 2ALBA 1JZOA 5J41A 2LSTA 1UA5A 3UOMA 3GX0A 4GQCA 2H74A 3UIWA 1LBKA 4OCEA 4JZQA 7GSSA 1PL1A 5G30A 1F6MC 2L6DA 1ST9A 5DVBA 2V6OA 2CZ3A 1YEPA 1Z6MA 3VWUA 4EDZA 2H6ZA 2ES7A 1JLVA 2B3SA 4MA9A 2LNTA 4IJIA 3IDVA 1HNBA 4PX1A 19GSA 3D21A 4PQ1A 3LEFA 4D73B 1FOVA 2VM2A 5C04A 2WDUA 3H79A 3PR8A 2WJUA 2D2ZA 2KOKA 4K9ZA 2O85A 4QQ7A 4LL1B 1HD2A 2YNXA 2X8GA 3FZ5A 4KH7A 1QGVA 3RAZA 3G7YA 3ZVJD 3D0ZA 1K3LA 3DIEA 2C0GA 3M9JA 2CX4A 4I2TA 1XVQA 4I2UA 1U87A 2RLIA 1A0RP 3KTLA 2VCQA 2AYTA 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chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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