1W89A

Structure of the reduced form of human thioredoxin 2
Total Genus 33
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
33
sequence length
110
structure length
110
Chain Sequence
HGSTTFNIQDGPDFQDRVVNSETPVVVDFHAQWCGPCKILGPRLEKMVAKQHGKVVMAKVDIDDHTDLAIEYEVSAVPTVLAMKNGDVVDKFVGIKDEDQLEAFLKKLIG
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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molecule tags Electron transport
source organism Homo sapiens
publication title Crystal Structures of Oxidized and Reduced Forms of Human Mitochondrial Thioredoxin 2.
pubmed doi rcsb
molecule keywords THIOREDOXIN
total genus 33
structure length 110
sequence length 110
chains with identical sequence B, C, D, E, F
ec nomenclature
pdb deposition date 2004-09-17

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00085 Thioredoxin Thioredoxin
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.30.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich Glutaredoxin Glutaredoxin 1w89A00
4IP6A 1GSFA 5A4WA 3ZFLA 2AHEA 1HD2A 1J0FA 1GH2A 3ZFBA 1SL2B 5ECQB 2LV3A 1NW2A 5ID2B 5KN3A 4TKYA 5COHA 2H6XA 3M9KA 1Z9HA 2P5RA 1X5DA 2PMTA 1O8WA 1MEKA 4ECBA 1YEXA 3A2VA 4K7OA 2DMMA 2K8VA 3CSIA 3LEFA 2CQ9A 2PN8A 3MNGA 1SYRA 2H73A 3HVSA 1NHOA 3IE3A 4XS6A 2I1UA 22GSA 4JE1A 4QQ7A 4TXOA 2H74A 4NV2A 3IR4A 2IMFA 1LJRA 1X9WB 3M0FA 5F0GA 3TGZA 2WZ9A 2JZRA 1UC7A 3MDKA 1Y6EA 4OMVA 3EWLA 3DVXA 1K0NA 2VO4A 1OKTA 4DSRA 2X99A 3D6IA 3PR8A 3WD6A 4KH7A 3GUSA 3UIWA 1GTBA 1XVWA 4MZCA 3IHQA 3IXRA 2PPTA 1M9AA 2IPAA 5IPHA 4MH3A 3TOTA 2HZEB 1QXHA 2VCVA 3HJMA 1Q98A 3TB2A 3TKSA 4PQIA 4G10A 1GTIA 3A3TA 2IMDA 1NM3A 3VWXA 5J4UA 1ZMAA 4BL7A 1TU8A 3PINA 2DJJA 4O7HA 2GZYA 1TK8B 3TJGA 5HR3A 1HNBA 3P2AA 2FLSA 2QGVA 5ECHB 3UAPA 4F03A 3N9JA 2C80A 1YQ1A 3VK9A 2GS3A 2DIZA 1XWAA 4O92A 4CHSA 4K0GA 1PSQA 1FG4A 9GSSA 3TOUA 3TJJA 2H0HA 2X8GA 5ELAA 2EIQA 4ZB9A 4WR5A 3L9VA 4FYBA 2FGXA 1PRXA 5IPGA 1V40A 5G5FA 5JCWA 3ERGA 1AQWA 1FVKA 2KHPA 4ZBDA 4GSSA 1IYHA 5ABRA 3U5RE 4GXZA 3KM6A 4WF4A 2L6DA 6GSWA 3QFAC 2LEGA 2V6OA 1SKRB 3VFIA 4OFNA 2ALBA 3I6AA 3IBHA 4ZB8A 4IVFA 5F07A 2H0IA 2YANA 12GSA 1Z3EA 4HS1A 2H1DA 1OKDA 3FR9A 1O8XA 2P5QA 3VI7A 2YWNA 3LSZA 2HI7A 2CZ3A 4HU7A 4XS1A 4IBPA 3F0IA 3BOAA 4F0CA 5HR2A 2F9SA 3HA9A 2LS5A 4WBRD 1YEPA 1X9MB 2DJ3A 3D0ZA 2O85A 5A5KA 5F8BA 2FUG2 1YKAA 3JCML 4KNDA 3H93A 5G5EA 5JWQB 3D21A 4L5LA 3P90A 2PVOC 5D96A 1V9WA 3TRPA 3D22A 1XWBA 2NTOA 4EVMA 2BMXA 2VAFA 5IOXA 1YF1A 3OR5A 1AQXA 4JU5A 4PNGA 3NZNA 1A24A 1M99A 1WPIA 3WGEA 4V2LA 1FW1A 2VOCA 3FY7A 3TKPA 2H8LA 3ZITA 1H75A 4ECIA 1SKWB 4PUAA 5AISA 2YZUA 1J08A 1S3DA 3EYTA 4KCEA 3TJBA 1T4YA 2K9FA 3ED3A 1GRXA 1GULA 1HNCA 3HZ4A 1C72A 3MSZA 3L9SA 4JR4A 1WMJA 2IWTA 4EL1A 3C1RA 4G19A 5IMAA 5FHIA 1T7PB 3EU4A 2K18A 4I8BA 3HY2A 4WETA 1EV4A 2VL9A 1JHBA 4X1UA 4IW9A 3VI5A 4YQUA 4HZ2A 4Q5FA 5DQSA 3W8JA 4MH2A 5HQPA 5G1LA 1PN9A 2LJKA 3C7MA 3F4RA 3D4MA 4ECJA 1WIKA 3HCZA 3EMXA 2ON5A 1Z7RA 2M80A 4BVXA 3E3EA 5FT3A 2PGTA 3GH9A 1ZOFA 4AGSA 6GSUA 1USBA 4LMWA 1T3BA 1SYXA 4D73A 4N10A 4K7NA 4PGTA 4EXJA 2KP1A 1GSSA 2MMAA 1B9YC 6GSSA 1QMVA 5ECRB 2YP6A 4N30A 1XW9A 4IHUA 2J9HA 2LQOA 1JLWA 5J5NA 3A2WA 4CDOA 4GWRA 1XWGA 1O81A 4OCFA 5E4WA 1ACVA 2O87A 3QD9A 5D93A 1A2LA 3KZQA 2YWIA 3W8SA 2GQLA 3C73A 2HLSA 2JZSA 1RQMA 2GDRA 1NSWA 3KEBA 1KBNA 2ES7A 2OA7A 3VPTA 2L6CA 1UN2A 2OBKA 3F6DA 3WT1A 2HYXA 2VD1A 3BJ5A 1EWXA 5ECIB 3QAWA 3C71A 2HRNA 4KSMA 2DJKA 2PERA 5KEJA 2HXKA 3DYRA 18GSA 3US3A 5DAKA 5DBQA 3DVWA 4GF0A 3M8NA 5DJLA 4IP1A 2LNSA 1K3LA 5IMVA 1AXDA 3FRCA 3PGTA 3IK7A 4RI7A 4GQCA 1B9XC 2REMA 1J9BA 1X0RA 2TRXA 1B4QA 1YKCA 1BX9A 2GT6A 1R5AA 4WF5A 4DSQA 3C1SA 3QPMA 4MZWA 3UVTA 2HFDA 4L0UA 3DIEA 1MD3A 4TW5A 3TKSC 1ZYQB 3TRXA 3GN3A 3NIVA 3KXOA 5EPFA 1PKWA 5J9CA 2MMNA 4I2TA 2I81A 2CX4A 1PD21 6GSXA 2RUEA 4YAPA 2FNOA 3LQ7A 2NPBA 5HR1A 4ECCA 1X9SB 2C0FA 1KTEA 4MPFA 4WR4A 2G2QA 3ZTLA 2N5AA 1YF0A 3A5WA 4HUAA 4FH8A 2V2GA 1QUWA 3GNJA 1VF2A 3KIJA 5CP1A 4RQRA 1SL0B 2WULA 2FA8A 4POKA 2QSIA 2A2SA 1DUGA 1V57A 1NHYA 2PUKC 5DALB 2LRNA 1B8XA 3UEMA 5F06A 3G7JA 4LL4B 5B6MA 3WYWA 3GKKA 2MBSA 4TOPA 1BYEA 2I9HA 4K7IA 4MDCA 2I3YA 4V2NA 1F6MC 5IMFA 4TR3A 3APQA 2VCQA 3IA1A 4X43A 1XXUA 3A2XA 4ILFA 2VIMA 4EF0A 4GCIA 4ZIJA 1A23A 1BQ7A 1U87A 1TW9A 3H4KA 4BA7A 2H19A 1TI1A 2GTUA 4DVCA 10GSA 3LFLA 5DCHA 3LXTA 2H01A 2BJXA 2GQKA 1T00A 1G7OA 4PQHA 1M0UA 2LSTA 4XRDA 4GSNA 4HDEA 2RUFA 5KN2A 2H72A 5H5QA 1F2EA 1T4ZA 2DC5A 1OE7A 3ZIJA 1W4VA 2C4JA 5CRDA 3WGDA 3K8NA 1KNGA 4HU9A 1GSDA 2RIIA 3HYPA 3GV1A 3ZRDA 5H5RA 4J2FA 2VL2A 1OAZA 3GKMA 1XW6A 2XPDA 1R4WA 3U6VA 2HRFA 4MA9A 2AJQB 4NHZA 2H1BA 4HOJA 2DJ2A 5J9BA 3BD2A 4WBJA 3FR3A 4BWSA 3MAKA 3LJRA 3GRXA 1TK0B 2E7PA 2GZPA 1BG5A 5IMDA 1SKSB 3KTLA 5CAXA 3DD3A 1U88A 5IIZA 1EOGA 1FOVA 4ML6A 4NAXA 4N0VA 2YWOA 2F3MA 1GNWA 4EC0A 1V58A 3WGXA 3DXBA 4D73B 2DBCA 4KSOA 2O89A 4MF7A 2H0GA 2H70A 2X8CA 1WJKA 3HKRA 3UBKA 5EVOA 2WS2A 3GX0A 2B1KA 4OD7A 3E9JB 3FR6A 4TR1A 5B6NA 1M2AA 2OBIA 1XOAA 1DBYA 1ZL9A 3EINA 4TXVA 4OO4A 4L8EA 2IFQB 1XWCA 3LORA 4GSTA 4HJ2A 1JZRA 1GUKA 5G30A 2LTKA 5ECSA 3UARA 2VCWA 2H6ZA 3R2QA 2LRTA 2LUSA 1BJXA 1HQOA 2JU5A 1E6BA 4AF2A 1A8YA 4RI6A 1SL1B 1T1VA 2PBJA 1Z6NA 3CRTA 4AJ8A 5ECLB 1XBSA 5CNWA 1M2BA 5JWOB 2GZZA 5CO3A 4POLA 5B7CA 1U3IA 3G7YA 3HZ8A 1TKDB 2WDUA 2KLXA 3GURA 2CVBA 3F6FA 3SBCA 5JWRB 5C04A 1SU9A 2R6KA 4O5RA 2YOIA 2CVDA 2K6VA 4I2UA 1QFNA 1PQNA 1K3OA 2H1AA 1SJZA 3FEUA 1UA5A 4KGIA 4MMMA 4V2MA 1TK5B 8GSSA 5JCUA 2M72A 1WOUA 4KE3A 3GSSA 2B5YA 4JRRA 1K0BA 3S9FA 1EP7A 2IMEA 3APSA 3W6GA 4XS4A 1XPVA 1GWCA 2H75A 5GAPD 1ERTA 2ZNMA 2C0EA 4IN0A 3HJOA 4PXOA 2VM1A 2VCTA 5LD0A 4Q5NA 4MZBA 2BTOT 2R5GA 2M46A 1LU4A 1JZDA 1YZXA 2N5BA 3DEXA 3H1NA 4ML1A 1MD4A 2MZCA 1ERUA 5ID2A 4KDUA 3FZ9A 3TRQA 1F3AA 2MMZA 3GYKA 2A2RA 3ZMKA 1YDKA 5LCZA 2CV4A 2GSQA 2B5EA 1VF4A 3GTUA 1IYIA 3ZMLA 4GLTA 3L4NA 4KDXA 1VF3A 1R7HA 3IRAA 4Q5QA 4K8MA 4HZ4A 5IOWA 1LBKA 2Z9SA 1K0CA 3KGKA 1SK2A 4QL9A 2LNTA 3VWVA 2HE3A 2GT5A 1AAZA 2CA8A 2PVQA 1OE8A 1PKZA 2XHFA 4ULXA 1U3AA 3O76A 2TRCP 3CBUA 2QKEA 2WCIA 4Q5RA 1X5EA 3HVVA 3P7XA 5EY6A 3TKSE 3TJKA 5KN1A 3C8EA 2B7JA 3F3QA 2HT9A 4ZILA 2CZ2A 1I5GA 1M9BA 4NMUA 2OE3A 4K2DA 14GSA 2MMOA 2XPEA 4L5OA 4E8EA 1PA3A 3I9V2 1XZOA 2XC2A 2AV4A 17GSA 4X0XA 1O73A 1Z6MA 2EIRA 3RHCA 4YQVA 5CYYA 5HFGA 2GSRA 4TXOB 4KX4A 2GGTA 1MDJA 1F37A 4O32A 2X64A 5FWGA 1OVNA 3RDWA 4NV5A 5C00A 3G7IA 5IQYA 2L57A 4MJCA 2C3QA 4K9ZA 5ECNB 2H6YA 1GUHA 3FHKA 5ECPB 1MTCA 3O3TA 4NXIA 3DGQA 1ERWA 4GQFA 1TRSA 4NWYA 5D9VA 1EEMA 4MPGA 5KN0A 3DWVA 1XW5A 4EE0A 1JFUA 3H8QA 2NBSA 2GSTA 2X8HA 1X5CA 3UOMA 3RPPA 4J57E 3ZIVA 1GSQA 2GSSA 1FAAA 2WB9A 2IJYA 2HNLA 3DRNA 3IV4A 3CTFA 3NOFA 5E59A 3QAVA 2V41A 1PMTA 4YQMA 2VL2C 4FYCA 1G6YA 2VUPA 5B8AA 1ZCPA 3TKQA 5B8BA 5ECMB 4TRXA 2GLRA 4YAVA 1F3BA 3GIXA 2C3TA 1SJIA 3FZ4A 5IO2A 3I43A 4QL7A 3IK9A 4V1Ag 2R2JA 3TDGA 3J7Yk 2CAQA 1URMA 4H86A 4MLYA 4TR0A 1KEBA 2IN3A 3GKNA 20GSA 3FK8A 5IMZA 2VCZA 2XBQA 3F63A 2H76A 2R37A 3L78A 4F0BA 3EVIA 3HHVA 1EZKA 4JR6A 1GSUA 2F8FA 5HR0A 2EIOA 3QCPA 4EDYA 3RBTA 3DMLA 5H5SA 1ERVA 3UBLA 1Q4JA 4PURA 1FB6A 1OC8A 1QQ2A 3GKXA 2N5FA 1BAYA 2CVKA 3IC4A 3ZYWA 5LNKe 4FYUA 3GA4A 2R4VA 1B48A 2JL4A 3LG6A 3H79A 3HXSA 2FA4A 4HQZA 2TIRA 1K0AA 3TCOA 3ZZXA 2JADA 2JZTA 1GSEA 1VRSD 4IS0A 3LYPA 2LJRA 3FZ5A 4XS4B 4IQ1A 3BBYA 2YWMA 1THOA 4F2IA 2XBIA 4KCAA 1R5PA 1TOFA 2MYGA 4ZB6A 13GSA 1WE0A 3QFBC 4MJEA 3KMOA 2FWEA 3LGCA 5J3RA 4WKWA 3IAM2 3UL3A 4ACSA 4AJ6A 4DEJA 1QGVA 1A2MA 1ILOA 5ECOB 3EURA 2QC7A 1M2DA 1CQGA 1V2AA 4BWQA 1AQVA 1HYUA 3KP9A 3BCIA 4DSSA 1G7EA 1OYJA 4F9ZA 5JCGA 4GRFA 5G31A 1DE1A 5AN1A 3EMPA 3CYNA 3EU3A 3GTUB 4N0ZA 4IQAA 2L4QA 4LMVA 1JZOA 2V32A 3I69A 3PH9A 1WP0A 1YY7A 1ABAA 2IL3A 4NPBA 3HVXA 1VF1A 2LJAA 1YJ6A 3M1GA 3APOA 1PL2A 3M9JA 5GZZB 3CSJA 5D8IA 1SENA 2LKUA 1ZYEA 4ZL7A 3RAZA 2OKAA 5CREA 4TVEA 2B3SA 4ISDA 1XVQA 4MP4A 3N5OA 4ZXGA 2VD0A 4IELA 4HJMA 2D2ZA 4MCUA 4EKZA 2DJ1A 1ML6A 1EV9A 3J7Yb 2IIYA 1TRUA 4PNFA 1Z5YE 4IJ3A 4OWYA 4AJ7A 4KUNA 2WRTA 2WJUA 3WT2A 1GNEA 1N8JA 3QOUA 1N2AA 3UVHA 4G9HA 1PX6A 1GLQA 1SD9A 2RLIA 3KH9A 5IO0A 3KJYA 3QR6A 5CRWA 4BPYA 2VM2A 11GSA 4BVYA 3TJFA 5J41A 2H1GA 1F9MA 3VLNA 2AB6A 5D9WA 4WXTA 5G2ZA 3ME8A 3IOSA 2A4VA 4KA0A 2VLVA 2R3XA 4PQ1A 2B6MA 1FO5A 3F8UA 1AC1A 4P3YB 3QDNA 1K0MA 4CW9A 2H66A 3VWUA 2YV7A 5ECKB 2O8VB 1TI3A 1SK0A 4J56E 1V98A 5DAKB 4K0NA 4OO5A 3HD5A 2H71A 3HDCA 1OC9A 2AAWA 2VL3A 3KMNA 3KD0A 4RUVA 1R26A 2C0DA 4LLRA 2DMLA 2OADA 2C1YA 2FWHA 3RPNA 2F8AA 4TR4A 4MJBA 4XHMA 3CMIA 2B1LA 2OE1A 3L0HA 3TKRA 3KTBA 1TP9A 1Y25A 2LRCA 5GSSA 5DALA 3D4TA 1GTAA 4WEYA 2FWGA 2JSYA 2O7KA 4LA1A 4KAEA 2CT6A 1G0TA 1RK4A 4FO5A 2V6KA 1WWJA 2NVLA 1BEDA 4ZBBA 1O7UA 3L9UA 2YV9A 3ISOA 2VCXA 4MK3A 3P8WA 3FKFA 1A0RP 2VLTA 1CQHA 4OFTA 5ELGA 3ZREA 4LL1B 2L5OA 2CAIA 2F51A 3E0UA 5EL8A 4ID0A 1XIYA 4G2EA 2AUVA 5INYA 3Q74A 3ME7A 1S3AA 3AY8A 2HSHA 2RM5A 1MDIA 3V1WA 4POMA 2H30A 2DSAA 5A4VA 1ZZYA 3GHAA 5GSTA 3QMXA 3KCMA 3LXZA 4JEDA 5GAND 1GLPA 3GL3A 1I9DA 2C3NA 3FZAA 2ZUPA 3VURA 1EGRA 4L0WA 5D73A 4EO3A 5L71A 2DLXA 4XCSA 3LWAA 3GL5A 4F82A 4K6XA 1GSYA 4YH2A 1O85A 4ZBAA 4OCEA 4E8HA 1XWKA 1G6WA 1EOHA 2EC4A 5F05A 1ON4A 3EE2A 2P0GA 5DDLA 1A2JA 4K1FA 2PU9C 2JSZA 5D9XA 1SJ6A 1DE2A 2ZCTA 2B7KA 2IMKA 2YJ7A 2HZEA 3QAGA 2OACA 1SD8A 5A4UA 2J23A 5DVBA 1THXA 4V1Ap 3VWWA 4I6XA 3ZVJD 3GX8A 1XFLA 3F3RA 1B4PA 5HFKA 3HJPA 4MABA 5DQYA 2FHEA 1E2YA 4OFMA 1WRYA 3O6TA 3EC3A 2PWJA 4DSSB 3ZLPA 4RQXA 1K0OA 1PL1A 3G9BA 1ZGNA 1TTZA 1GUMA 4I5QA 2KOKA 1GTUA 4EDZA 2E2GA 1XCCA 4MF5A 1TRWA 3F4SA 1HNAA 2C8UA 2L4CA 2YCDA 5ENUA 2GQMA 3BCKA 2YZHA 1AIUA 2IFQA 3SWLA 1JLVA 4GTUA 1RW1A 2WGRA 4HI7A 1TDIA 3Q19A 2YNXA 1Z7PA 4FIWA 1PX7A 2KP2A 2NDOA 3KH7A 4KW6A 4IGJA 4POBA 1K0DA 6GSTA 4MJAA 2OJLA 1EP8A 2YN1A 1FHEA 16GSA 3IAS2 3ZVJA 2MBTA 1S3CA 4ZL9A 2FY6A 3UMAA 4XIHA 2I4AA 4IKHA 1M7TA 1OC3A 3RHBA 1FB0A 4PX1A 1FVJA 3IPZA 2L5LA 3M3MA 4PUFC 4JZQA 5AGYA 1GP1A 4TR1B 1W89A 1EEJA 4XTSA 3ERFA 4HQSA 4MF6A 4IJIA 2FCHA 1SK1A 1UVZA 1U6TA 4Z7XA 2LQQA 1EGOA 6GSVA 2KUCA 3IDVA 5IM9A 2OE0A 1TXXA 4I97A 5CRGA 1TJDA 5CRHA 1K3YA 2WFCA 4EUYA 4KDYA 2ON7A 2GVPA 3CSHA 5DJMA 2C0GA 1TU7A 1DSBA 1O6JA 5IMCA 2HZFA 1TRVA 3CTGA 2IMIA 2HSYA 3Q6OA 5G1KA 2VLUA 3VPQA 2E0QA 2JACA 2CX3A 2YJHA 1JZWA 4KB3A 3GFKA 3KP8A 3UJ1A 1QK8A 1OC9B 3F9UA 2P31A 4N11A 1GL8A 1A8LA 2DIYA 2YPMA 2DJ0A 3ZL5A 4JBBA 3GSTA 3GH6A 5DCGA 2FWFA 1A0FA 3DKSA 3FYGA 1ST9A 1T8EB 2FD3A 3F4TA 4ZL8A 7GSSA 1H4OA 1MDKA 3TUEA 3CXGA 3D5JA 3Q18A 2G0FA 3CRUA 2RM6A 1PGTA 5D9TA 4XRAA 1XOBA 3LYKA 3ERWA 6GSYA 1AUCA 2E2MA 19GSA 2K8SA 5AIVA 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chains in the Genus database with same CATH superfamily
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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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