2E7PA

Crystal structure of the holo form of glutaredoxin c1 from populus tremula x tremuloides
Total Genus 35
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
35
sequence length
107
structure length
107
Chain Sequence
SKQELDAALKKAKELASSAPVVVFSKTYCGYCNRVKQLLTQVGASYKVVELDELSDGSQLQSALAHWTGRGTVPNVFIGGKQIGGCDTVVEKHQRNELLPLLQDAAA
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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molecule tags Electron transport
source organism Populus tremula x populus tremuloides
publication title Functional, structural, and spectroscopic characterization of a glutathione-ligated [2Fe-2S] cluster in poplar glutaredoxin C1
pubmed doi rcsb
molecule keywords Glutaredoxin
total genus 35
structure length 107
sequence length 107
chains with identical sequence B, C, D
ec nomenclature
pdb deposition date 2007-01-12

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00462 Glutaredoxin Glutaredoxin
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.30.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich Glutaredoxin Glutaredoxin 2e7pA00
1K0MA 2H70A 4ZIJA 3CSIA 1SYRA 4K0GA 3C73A 2M46A 3L9UA 2NTOA 5A4UA 4GCIA 1ZGNA 2YWOA 5H5SA 5B7CA 3ZL5A 2B5YA 4IJ3A 2F51A 4YAVA 2AYTA 1K0NA 2L5OA 1AUCA 1FG4A 4EDZA 5G5FA 2FWEA 2IFQA 4XRAA 4EL1A 4WBRD 3EURA 4OFNA 1X5DA 2ZNMA 1HYUA 4KDXA 2GTUA 4IP1A 1U6TA 2GGTA 4PNGA 4LA1A 3CRUA 3FZ5A 2K8SA 3FKFA 4TXOA 4WF5A 1H4OA 1G7OA 2OE0A 3NIVA 2L6DA 4NMUA 4GLTA 2OE3A 2R2JA 4FO5A 1OE8A 2H1AA 3DD3A 4F0BA 3WT2A 4KCEA 3V1WA 2X99A 1V2AA 4IP6A 2GSTA 4OCFA 2H19A 4JR6A 5CRGA 1A2JA 4ZL7A 4I5QA 6GSXA 1K3LA 3M8NA 2GZZA 1U3IA 1MEKA 5IPHA 4Q5QA 3FW2A 2QC7A 2L4CA 3IAM2 3GH6A 2FA8A 1SK2A 2VCTA 5HFIA 1F3BA 2YOIA 3U5RE 2OJLA 3CTFA 3ZLPA 5DBQA 1M0UA 4N30A 2V2GA 2VLUA 4EC0A 2N5FA 3ZMKA 4NV5A 3O76A 4MF5A 3RHCA 3GUSA 1X5EA 3RPNA 4HQZA 4K2DA 2OBIA 3TJFA 3PH9A 1URMA 2H1DA 4N10A 1XWBA 2ES7A 4HJ2A 5E4WA 4MH3A 2B5XA 3KD0A 3PR8A 5ELGA 4JRRA 3BCIA 1T00A 3QAWA 3VWVA 2O87A 3P7XA 4KE3A 4OD7A 1ABAA 3ZFBA 3D6IA 3LEFA 2P5QA 1DE2A 4OWYA 5HR0A 4ILFA 4OO5A 4FIWA 2OKAA 4MP4A 4FYBA 2R5GA 2CVDA 3GRXA 5JCWA 2RIIA 4OCEA 4J56E 3HVVA 2CA8A 3DEXA 1YDKA 3GTUB 3C71A 1PQNA 2VOCA 2V6KA 4ZL8A 3UAPA 2O8VB 4HDEA 6GSSA 1FAAA 1TK0B 3J7Yk 2KP1A 1FVJA 5CP1A 4IGJA 3HKRA 1ML6A 5ECQB 2B5EA 1RQMA 3FR3A 4HU9A 1CQHA 5B8AA 2E2MA 1TW9A 4ZBBA 1SD8A 2LJKA 3LSZA 4Q5FA 4KGIA 2IWTA 1SL2B 5IMAA 1U3AA 4ECJA 5J3RA 1AC1A 2AV4A 3KCMA 3JCML 1JLWA 1O8WA 3M1GA 2R6KA 2MYGA 3Q18A 2AAWA 4LMVA 3FZAA 1FHEA 3RPPA 2BMXA 3UBKA 2WJUA 2XBQA 4EE0A 3J7Yb 4O5RA 1OC8A 3VWXA 2FLSA 5ECNB 3R2QA 2PU9C 1K3YA 2BJXA 1TDIA 1AIUA 2WZ9A 2VCWA 2LTKA 1EOHA 2YZHA 5B6NA 5HFKA 1K0BA 1ZZYA 4ECIA 5IOXA 4XIHA 3IHQA 2PERA 3M3MA 2VL2A 5ID2B 1GTBA 1GRXA 1K0AA 4IW9A 1OYJA 3QR6A 1YF1A 3IXRA 1T7PB 1FB6A 1M2BA 2OE1A 1VF2A 2X8HA 2YWNA 4GF0A 5EVOA 2LNTA 1M9BA 2LQQA 4JE1A 5ECSA 2F9SA 3VK9A 1PSQA 1Z6MA 2YCDA 1A2MA 1YY7A 1OAZA 2F3MA 4I2UA 1LU4A 4G9HA 4K8MA 3TGZA 4MJCA 2RUEA 1GSDA 4V2LA 1JZDA 3UJ1A 4CHSA 3HVSA 5DAKA 1AQXA 3CSJA 1TK5B 5CAXA 3APOA 4X0XA 1XVWA 2GZYA 1BEDA 2MZCA 3IOSA 3I6AA 5IMZA 2GS3A 5ABRA 5AIVA 1F37A 3VI5A 3G7JA 3HHVA 5IMDA 4YQVA 3KIJA 5ECOB 5IQYA 2FY6A 1R4WA 2DJ2A 1M9AA 4OO4A 2YWIA 4ULXA 5COHA 2KHPA 3GKKA 3TRPA 3UARA 5L71A 4NPBA 2MMOA 1V9WA 2H73A 3FK8A 4TR1B 2GVPA 1XCCA 5ECMB 2B6MA 1GUKA 5FWGA 2HRFA 1A8YA 2N5AA 2LJRA 2DBCA 4PUAA 2GQKA 2P31A 3NOFA 3TJJA 4ID0A 3CYNA 1V40A 3WD6A 4K7NA 4AJ7A 3HD5A 3VPTA 3FRCA 2HE3A 3QPMA 2YZUA 3F9UA 1AQVA 2VL9A 2C0DA 3KEBA 2K9FA 3ME8A 2N5BA 2GT5A 1Z9HA 4NHZA 3ZZXA 7GSSA 3TJBA 1X0RA 2I1UA 9GSSA 3AY8A 1ZYEA 5E59A 12GSA 2Z9SA 4PXOA 3ZIVA 4RUVA 4LL4B 3HYPA 3KM6A 3F6DA 4RQXA 4GXZA 3DVXA 5G1KA 3UEMA 3KH7A 1X9WB 3E3EA 3VPQA 4F2IA 2VLVA 1GH2A 3GKMA 4RI7A 1GL8A 2V6OA 5IMCA 3VI7A 3MAKA 1GLQA 5JWQB 1XZOA 3EMPA 1MDKA 2HT9A 4ML6A 4KUNA 1FO5A 3WGEA 2M72A 1EP7A 1I9DA 2D2ZA 1NW2A 2LJAA 1OVNA 3C1RA 3F4RA 3TKSE 1DSBA 1SU9A 5FHIA 1WWJA 2HNLA 2IMDA 4JEDA 5IMFA 3BCKA 3UOMA 3HXSA 2HZEB 3QD9A 5GAPD 4WR5A 1WMJA 3IR4A 2VCXA 3DKSA 1EZKA 2CVKA 5DQSA 3Q6OA 1B4PA 1RW1A 1PX7A 3QFBC 1V58A 2FWGA 4D73B 2C80A 4NWYA 5GAND 2H6YA 1MDJA 1TRSA 5ECHB 4JU5A 1EEMA 2GDRA 2H0HA 2HFDA 3A3TA 1AW9A 2F8FA 3W6GA 1TU7A 4EVMA 2LNSA 3CSHA 3Q74A 5D9TA 13GSA 2IIYA 2LQOA 5F0GA 1PRXA 3I43A 2P0GA 1K0DA 2OADA 2H74A 4K7OA 3LYKA 3DGQA 3RDWA 1FVKA 4IBPA 2L57A 5LNKe 1PKZA 5DCGA 5F06A 3TRQA 4G19A 2PBJA 1M99A 4KDYA 2ZUPA 4ZB6A 2C4JA 5EL8A 1GP1A 4NXIA 1TKDB 4QL7A 4I6XA 2KLXA 2QGVA 1UN2A 2CT6A 4IQ1A 3D5JA 1K3OA 4TXVA 3GTUA 2C0EA 2JADA 3ZVJD 3IC4A 3H1NA 3ERWA 2C3NA 2NBSA 3KTBA 2MBTA 3IK9A 4HJMA 2H1BA 3SWLA 2CZ3A 3GSTA 4HZ4A 5AIXA 3GSSA 2KP2A 4RI6A 1T3BA 3C7MA 4OMVA 2H0GA 1PL1A 3G7YA 1TI1A 5CNWA 1SKSB 3RBTA 4PURA 1ZMAA 4P3YB 1GSEA 1SKRB 1R26A 3DRNA 5DCHA 1GUHA 1PD21 2DJJA 3P90A 2NVLA 3G9BA 5D96A 3KXOA 2DMMA 2WFCA 1EV9A 2HSYA 5D9WA 3KMNA 1A0FA 4I97A 4L5OA 3HDCA 5HFGA 1N2AA 3US3A 3OR5A 2C3TA 3CBUA 4YAPA 2NPBA 2VCVA 3UBLA 3ERFA 1A2LA 4TRXA 2FA4A 1TK8B 1ZCPA 3GV1A 4F82A 1KEBA 2IN3A 5ID2A 4GRFA 5IO0A 3GN3A 4HZ2A 3ERGA 4FH8A 1Z6NA 3P2AA 5EPFA 1DUGA 3HZ4A 2VO4A 2EIRA 3NZNA 3D22A 1O7UA 1ACVA 3HJOA 4MF7A 8GSSA 2WS2A 2K8VA 1WOUA 4AGSA 1MD4A 2K6VA 5HR2A 2K18A 1T1VA 4K9ZA 2EIOA 1ON4A 4K6XA 4PNFA 2XPEA 1TI3A 1F3AA 1Q98A 1F2EA 1WPIA 1WJKA 2X64A 3IA1A 2WULA 3HJMA 2H71A 2VL2C 1HD2A 3TKRA 1NHOA 4EUYA 5F07A 1OC9A 4BPYA 2VIMA 4TR3A 2FHEA 1TOFA 3EE2A 1XVQA 1DE1A 3TOUA 3KGKA 1QUWA 2WB9A 1JZOA 4YQMA 2YP6A 1XIYA 2WCIA 4KX4A 2ON7A 2JACA 3M0FA 4XS6A 2AUVA 2MMNA 2DC5A 1EGRA 2IPAA 2JZSA 5H5QA 1SL0B 2PPTA 1HNBA 2JZRA 3DWVA 2L6CA 4WKWA 2WRTA 4OFMA 2YNXA 3L9VA 2C8UA 4TR0A 2YANA 3DXBA 4TR1A 2YV7A 1U88A 3W8JA 2X8CA 2WGRA 2IMIA 4BVXA 2R37A 4MZWA 4F9ZA 1V98A 5C04A 5GSTA 2M80A 1G6YA 3IAS2 4XS4B 1ST9A 4MH2A 1W89A 2PMTA 3F3RA 1MD3A 2H01A 3LJRA 4JZQA 2I81A 4AJ6A 4J2FA 2TIRA 3BBYA 4V2MA 4MPFA 4J57E 5HR1A 2LRCA 3GNJA 5DALB 3ZREA 3GL5A 1VF1A 1BJXA 3D4TA 2LEGA 3D4MA 3CMIA 5DQYA 2ON5A 4O7HA 4HS1A 2L5LA 1LBKA 4Z7XA 2A4VA 2CV4A 2B3SA 2GQMA 2V1MA 4GQFA 2OBKA 3GKXA 5J5NA 1YQ1A 4HI7A 4HU7A 4ECCA 4Q5RA 3ZRDA 3VURA 3TUEA 4TW5A 4POLA 3HCZA 4ACSA 10GSA 1SD9A 5FT3A 3PINA 3QOUA 4PQHA 5CYYA 1G6WA 1LJRA 4OFTA 2HRNA 1VRSD 2E0QA 1TRVA 1XFLA 5G30A 2FD3A 4X1UA 1EWXA 5CRDA 4NHWA 2EIQA 5JCGA 1TU8A 4IS0A 2HZEA 2WDUA 4F03A 5IO2A 3KP8A 1XW5A 2L59A 1J9BA 2H8LA 6GSTA 1OC3A 3GX0A 3O3TA 1YZXA 4TKYA 4D73A 5J9BA 2O89A 2PVOC 1OC9B 5F8BA 3BJ5A 1PKWA 3P8WA 4PGTA 2DIYA 2L4QA 1JZRA 1X5CA 5J9CA 2GSRA 1BQ7A 4BWSA 1EV4A 2IMKA 1SJZA 3O6TA 3LGCA 1UA5A 3GL3A 2DSAA 5INYA 4DSSA 1XWKA 4O92A 2HXKA 4KNDA 3HA9A 1H75A 3ZITA 1XW6A 4XCSA 4IHUA 5IIZA 5F05A 5G5EA 3EWLA 3QFAC 2E7PA 3WGDA 4WBJA 4L0WA 1YF0A 1SL1B 1YKCA 5EY6A 2GT6A 4IQAA 2F8AA 4EO3A 3TOTA 6GSVA 2YV9A 1N8JA 1CQGA 3DYRA 2E2GA 3ZMLA 3Q19A 4WR4A 3L4NA 4GSTA 5AN1A 4FYUA 1O6JA 4GWRA 3FR6A 2DLXA 5JCUA 1O8XA 4Q5NA 1PN9A 4KCAA 1O73A 1Y25A 2XPDA 3QMXA 1WRYA 5KN2A 2JSYA 1G7EA 1Z7PA 4LMWA 2PUKC 2H72A 2YWMA 1S3AA 3TKSA 4TR4A 3M9KA 18GSA 1GULA 1WE0A 2PWJA 3ZTLA 14GSA 5DVBA 4WXTA 5DJLA 1AAZA 4XRDA 1IYHA 5AGYA 1KTEA 1XOBA 1GSSA 3F3QA 2VD0A 5ELAA 1THXA 3TCOA 4DVCA 5DDLA 1SENA 2A2SA 1NHYA 1X9SB 1ZOFA 1QGVA 2XBIA 4GTUA 1XBSA 2JU5A 1XWCA 3C1SA 3IV4A 2RLIA 4KAEA 2G2QA 4KSMA 2CZ2A 2FUG2 5J4UA 2CAIA 5LD0A 3TJGA 1ZYQB 5IOWA 1M2DA 3I9V2 2V32A 3ZVJA 4MJBA 1SYXA 4GQCA 2RUFA 4IN0A 3H79A 2CAQA 1ERVA 1SKWB 4LL1B 1SK0A 3F4TA 6GSWA 1TJDA 1MDIA 4PQIA 3WYWA 3BD2A 3H93A 3C8EA 2HI7A 4IVFA 4HEA2 2V41A 3TKPA 1GTAA 3PGTA 2PGTA 2MBSA 4LLRA 5C00A 5HQPA 2LUSA 2J9HA 4DSSB 4IELA 3UVTA 4BVYA 1QK8A 1K0CA 4KH7A 4ZB8A 1E2YA 1XOAA 4KB3A 1E6BA 1J0FA 3GKNA 2CQ9A 3VLNA 3VWUA 4AF2A 2ZCTA 3HY2A 4HOJA 1UVZA 4HQSA 3A2WA 2VLTA 2VL3A 1HNAA 3GX8A 1T4ZA 4O32A 6GSYA 4DEJA 3CXGA 4L8EA 3N5OA 1ERTA 1R7HA 3APQA 5A5KA 5D93A 1FOVA 11GSA 2GSSA 2H6XA 5J41A 2LS5A 3LG6A 5CRWA 3LQ7A 4BWQA 1HNCA 2HSHA 1OE7A 2LKUA 1T8EB 4ZB9A 2FGXA 2IJYA 22GSA 5CRHA 2VUPA 4JR4A 1J08A 6GSUA 3IBHA 4V1Ap 2DJKA 1SJIA 3M9JA 2DIZA 5B8BA 4I8BA 2MMZA 4XS4A 5G2ZA 2DJ3A 3TB2A 2HLSA 4E8HA 1W4VA 1QQ2A 1U87A 3E9JB 1Q4JA 4XHMA 1OKTA 1SJ6A 5DALA 1SK1A 1TP9A 4WF4A 4MA9A 2GQLA 3MDKA 3ZYWA 3TRXA 5JWRB 2FNOA 1UC7A 3QAVA 3HZ8A 1EGOA 1XW9A 3RHBA 3HVXA 3A5WA 4GSSA 4ZILA 3MWHA 1JHBA 1ERWA 4JBBA 4DSRA 3ZFLA 4F0CA 2B1KA 3KH9A 1GSYA 3GIXA 1TRUA 1GLPA 2JSZA 3CRTA 3H8QA 2C1YA 5A4WA 1O85A 4MK3A 3GMFA 3LFLA 2C0FA 1M7TA 1WIKA 4EKZA 2B7JA 1XXUA 1PA3A 3LYPA 3GYKA 2NDOA 5GZZB 1FW1A 3ME7A 3IE3A 2H6ZA 2DMLA 1YEPA 2GZPA 2REMA 5D73A 3QDNA 4ZBAA 1AXDA 5KN1A 4ZL9A 3GA4A 3CTGA 4XS1A 1K0OA 1THOA 3L0HA 1VF3A 3UL3A 4IJIA 4V1Ag 1BX9A 3GH9A 4TN8A 3EU4A 3MSZA 3FR9A 1XPVA 1B9XC 2CX4A 3UVHA 2HYXA 4BL7A 5HR3A 3D0ZA 2VD1A 3GHAA 2VCZA 3FZ4A 4RQRA 1XWAA 2CX3A 2CVBA 2FWHA 4MABA 3BOAA 1PGTA 3N9JA 1ILOA 4ZBDA 2IMEA 4MPGA 3DVWA 4N0VA 1TXXA 4MDCA 4YQUA 2IFQB 2TRCP 5A4VA 1RK4A 2RM6A 1V57A 4MF6A 3DMLA 5G31A 5IPGA 1KNGA 1VF4A 4K0NA 3EMXA 3A2XA 4KSOA 1GSFA 1A24A 2X8GA 3RAZA 4CW9A 3SBCA 4TXOB 1BYEA 4EXJA 3GFKA 2H30A 4I2TA 3W8SA 1PX6A 1PL2A 1GWCA 4NV2A 2GSQA 3ZIJA 2ALBA 4PQ1A 2KOKA 3K8NA 2R3XA 3FHKA 2H1GA 2RM5A 2O7KA 1G0TA 2PVQA 2B7KA 5ECKB 3QCPA 1HQOA 1OKDA 4XTSA 5D9VA 1S3CA 3H4KA 3KZQA 5ECIB 1PMTA 4WEYA 1GUMA 1GTIA 2QKEA 3DIEA 1Z7RA 4POMA 2TRXA 2VM2A 5ENUA 4YH2A 1A8LA 2EC4A 2DJ1A 1JZWA 3U6VA 2LRTA 1Y6EA 1YKAA 3UMAA 1QMVA 4MLYA 2I9HA 5LCZA 3FYGA 1X9MB 1F9MA 3KTLA 3TKSC 1GNWA 2LSTA 1T4YA 1XWGA 2C0GA 2JZTA 1JLVA 4IKHA 2XC2A 3F8UA 3TKQA 4QL9A 4HUAA 3IDVA 4N0ZA 1NSWA 3EC3A 2FWFA 2MMAA 2PN8A 1GSQA 4ML1A 4POBA 1M2AA 2QSIA 1EOGA 4KW6A 3EYTA 19GSA 1R5PA 4ZXGA 3EINA 4L0UA 1B8XA 3KJYA 2J23A 3FY7A 2YJHA 3S9FA 4NAXA 2JL4A 5KN3A 4MJEA 3HJPA 2H75A 3KP9A 1F6MC 1ERUA 4TOPA 1S3DA 4EF0A 3I69A 3F4SA 4E8EA 1BG5A 2BTOT 1AQWA 1FB0A 4PX1A 3QAGA 2H0IA 3KMOA 1EEJA 3LORA 3ED3A 2VAFA 2HZFA 3ISOA 3WGXA 5CO3A 1NM3A 2AB6A 2LRNA 17GSA 4H86A 4DSQA 5JWOB 5KN0A 1A0RP 3EU3A 4V2NA 3FZ9A 1YJ6A 3D21A 4N11A 2DJ0A 1B4QA 1O81A 3VFIA 2B1LA 1B48A 2LV3A 2XHFA 1EP8A 3F6FA 4BA7A 3APSA 3FEUA 1QXHA 3E0UA 20GSA 4KDUA 2GLRA 4K7IA 2IMFA 2AHEA 3L78A 4MCUA 5G1LA 1GTUA 4KA0A 2H66A 2YN1A 2A2RA 3UIWA 5ECRB 4QQ7A 3IRAA 2I4AA 1GSUA 2VM1A 3LWAA 1I5GA 1DBYA 3LXTA 5AISA 4MZBA 1TRWA 3F63A 3L9SA 2IL3A 5DJMA 5CREA 1A23A 1KBNA 2OA7A 1C72A 3VWWA 2YJ7A 2VCQA 4G10A 1B9YC 4X43A 2P5RA 1YEXA 2KUCA 4TVEA 5B6MA 3MNGA 1VGLA 4G2EA 1IYIA 2I3YA 4ECBA 2AJQB 4MMMA 1BAYA 4AJ8A 5IM9A 5ECLB 5ECPB 2C3QA 2FCHA 3F0IA 5H5RA 3G7IA 4K1FA 3TJKA 3EVIA 1JFUA 5IMVA 1GNEA 1Z5YE 1WP0A 2R4VA 4EDYA 3A2VA 4L5LA 1R5AA 16GSA 3IPZA 5D8IA 4MJAA 3TDGA 1TTZA 4CDOA 5D9XA 1USBA 3IK7A 3LXZA 3WT1A 1QFNA 1Z3EA 5KEJA 4GSNA 2O85A 5DAKB 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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