2HRF | Genus

Total Genus 55

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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus	55
sequence length	173
structure length	173
Chain Sequence	SFTGKPLLGGPFSLTTHTGERKTDKDYLGQWLLIYFGFTHCPDVCLEELEKMIQVVDEIDSITTLPDLTPLFISIDPERDTKEAIANYVKEFSPKLVGLTGTREEVDQVARAYRVYYSPGPKDEDEDYIVDHTIIMYLIGPDGEFLDYFGQNKRKGEIAASIATHMRPYRKKS

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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Genus data interpretation

Chord Diagram

publication title	Human Sco1 functional studies and pathological implications of the P174L mutant. pubmed doi rcsb
molecule keywords	SCO1 protein homolog, mitochondrial
molecule tags	Metal transport
source organism	Homo sapiens
total genus	55
structure length	173
sequence length	173
ec nomenclature
pdb deposition date	2006-07-20

pfam database annotations

chain	Pfam Accession Code	Pfam Family Identifier	Pfam Description
A	PF02630	SCO1-SenC	SCO1/SenC

Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)

cath code	Class	Architecture	Topology	Homology	Domain
3.40.30.10	Alpha Beta	3-Layer(aba) Sandwich	Glutaredoxin	Glutaredoxin	2hrfA00

2MMZA 2ON5A 2V6OA 5AIXA 2I1UA 4KSOA 3UBKA 4K9ZA 5INYA 4HQZA 2DMLA 3RHBA 3LG6A 2C80A 4HZ2A 5CRGA 4I5QA 3TJGA 1B48A 2MMNA 2YJ7A 5HR0A 2LSTA 3FK8A 1YJ6A 3FEUA 1WIKA 1T7PB 1TU8A 2MBSA 2IJYA 3HDCA 4MJCA 1QMVA 4MABA 4POLA 2R37A 1AQWA 1MD3A 3FZ9A 3M9JA 3O6TA 2CX4A 3CYNA 3TCOA 4F82A 3C8EA 1KEBA 1VRSD 4OFMA 4POBA 5AGYA 4ML6A 5HFIA 4XRAA 1S3CA 2VD0A 1XW6A 2LJRA 1Y25A 5HR1A 4ZILA 2PWJA 5CAXA 1ERUA 3LJRA 1A24A 1O7UA 3TJBA 4BPYA 1AQVA 3LYPA 1AC1A 5IIZA 3GMFA 1CQHA 1Z9HA 3ZL5A 3KP8A 4ZL8A 5HR3A 4WR5A 3RBTA 1SYRA 4OD7A 4I2UA 5CREA 4Q5RA 2IMFA 4E8HA 3D21A 12GSA 2FLSA 2HZFA 5LD0A 4ZL9A 4G19A 4HZ4A 3UMAA 2LNSA 5KN1A 5J5NA 1J9BA 2P5RA 2Z9SA 4XRDA 5G5EA 1LBKA 2AB6A 4ML1A 3WGXA 2BTOT 2YJHA 5F07A 3VI5A 2B1KA 4MJEA 2AJQB 3ZRDA 1ERTA 2CZ2A 5GSTA 1YF0A 3I9V2 2R3XA 3GH6A 5IMVA 2H6YA 1FB6A 5F05A 1ZZYA 2VCWA 4CDOA 3UEMA 2H70A 3QD9A 4ULXA 2GQLA 3HVXA 1SD9A 3DXBA 2ES7A 4YAVA 3F3QA 1QUWA 1S3AA 4DSQA 3FW2A 4PXOA 3VPTA 1ZCPA 3HJOA 5A4VA 1PL2A 1TRSA 3ZMLA 1M99A 2YCDA 1BEDA 3GTUB 4POKA 4PQIA 4J56E 2B5EA 2HLSA 2DJJA 3P2AA 2M72A 4MZCA 1GTBA 1TXXA 5IMDA 1GUMA 4XIHA 5DALA 1AXDA 4AF2A 3HJMA 2D2ZA 1XXUA 2B1LA 3LYKA 2XBQA 3HYPA 4AGSA 2R5GA 2AYTA 2EIRA 5ELAA 18GSA 3FR6A 4EXJA 4NV5A 2B6MA 4PQHA 2RUEA 3F4SA 4FO5A 1T8EB 2G2QA 1SJ6A 2VM1A 5D9VA 5C04A 3H8QA 1Z5YE 2HSHA 2V32A 3DVWA 4O7HA 3US3A 4XS4B 3QAWA 1BG5A 3APSA 5ELGA 1FW1A 1B4QA 4HDEA 3H1NA 4KDUA 5CRHA 1K0DA 1AIUA 4IP1A 2WGRA 2VCVA 4TXOA 4IHUA 2YWOA 1EEJA 2GDRA 1Z6MA 1ACVA 3TKSC 1X5EA 4HEA2 2A2SA 1FVKA 4PNGA 4KGIA 2L59A 3FRCA 1X5CA 4TOPA 5G1KA 1A8YA 3LXTA 1XCCA 3IOSA 1T1VA 4OFTA 4FYCA 3ERGA 4HU9A 2DIZA 3TRXA 1GSEA 4GQCA 5KEJA 5HFGA 11GSA 4ZBAA 3QR6A 2H1GA 2LTKA 2X8GA 1USBA 2B3SA 2MMAA 2I3YA 2ON7A 2H1AA 4GWRA 4OO5A 2PBJA 1OC9A 1B8XA 2OE1A 4MJBA 5B6NA 3KTBA 3GIXA 4FH8A 3F9UA 1DBYA 1Z7RA 1GNEA 2YWNA 2E7PA 4MDCA 4AJ8A 2EC4A 5JWOB 1XVQA 2L6DA 3A2XA 1THOA 1V58A 2GVPA 1XVWA 2TIRA 2VD1A 1G6YA 4TW5A 3QOUA 1H4OA 3I69A 3BCIA 1SL2B 5E4WA 3A5WA 4OCEA 5D93A 1E6BA 2REMA 1PQNA 1K0NA 1Z7PA 3IE3A 3TKSA 2GTUA 3E3EA 2ZUPA 2DJKA 1OKDA 1GNWA 3HZ8A 13GSA 4KH7A 4P3YB 2C0GA 5ECQB 1YKCA 1Q98A 2CQ9A 4G10A 5HFKA 2N5FA 2X64A 4NXIA 4TVEA 4EE0A 1GL8A 1JHBA 3FY7A 2EIQA 4TR0A 3PH9A 2VCQA 3GA4A 4RI7A 1NHOA 2LRTA 3ZLPA 4H86A 1VF4A 2HE3A 2C4JA 1J08A 4BWSA 3G7JA 3QCPA 4YQUA 2QSIA 1GUKA 3KMNA 3L4NA 2NBSA 1TRVA 5J9CA 3KEBA 3L78A 3MNGA 2H72A 5CO3A 1DUGA 3CSIA 5GAPD 2CVBA 2VL9A 1X5DA 2P31A 1WWJA 5EY6A 3IXRA 5DQYA 5ECSA 5ID2B 3KGKA 5B8AA 3ZFLA 3L0HA 1G7EA 3IBHA 4XCSA 1UVZA 2JZSA 3HZ4A 1XWCA 3GN3A 1X9MB 1WP0A 2GLRA 4FYUA 4X0XA 1W89A 3IRAA 2PGTA 3FZ5A 5J41A 4IQAA 5H5SA 1R5PA 4EDZA 6GSTA 1FOVA 8GSSA 2FD3A 2EIOA 5ECIB 1A8LA 3GUSA 3FR3A 4IW9A 2V2GA 3HA9A 2F9SA 4TR3A 1YQ1A 2C0DA 3TJJA 3VFIA 4PQ1A 1IYHA 2NTOA 2LNTA 4MK3A 1SENA 3CRTA 2LEGA 2H66A 2P0GA 1VF2A 2I81A 5JWRB 4MMMA 3KJYA 3ERWA 3IA1A 5D9WA 4MZWA 1VF3A 3K8NA 4BWQA 1K0MA 4ECBA 4QL9A 1GTUA 2VO4A 4DSRA 3EC3A 5IOXA 4GQFA 4K0NA 4Q5QA 4N0VA 2YANA 1K0OA 3MDKA 4NHWA 4PUFC 22GSA 1VF1A 1DSBA 2I4AA 3SWLA 2IWTA 1XOAA 2JZTA 1ZMAA 1EP7A 3GX8A 2MYGA 3E9JB 1BQ7A 3KIJA 2JU5A 4LL1B 2M80A 2A4VA 5DAKB 1VGLA 2MZCA 3KH9A 2M46A 1HD2A 2YOIA 3VWUA 2TRCP 5COHA 1AQXA 3VI7A 2LQQA 1OE7A 3AY8A 4IQ1A 1R7HA 5E59A 4K6XA 1M2AA 3GYKA 1JZOA 4KDYA 2V41A 2GGTA 3DD3A 2DBCA 3EMXA 2DLXA 4PURA 3TJFA 2NPBA 4IP6A 4WF4A 4Q5FA 2B5YA 4IS0A 3GH9A 2YNXA 4RQXA 1GLQA 3GL3A 5ECOB 5FHIA 2H74A 5G30A 3TOUA 2DJ0A 3PINA 4K2DA 3GKNA 4MA9A 5J9BA 2QC7A 4LMWA 2C3NA 2KP2A 2GSQA 4TKYA 1JLVA 5IO2A 1EGRA 4MH3A 3GTUA 1SJIA 2H0IA 5D9TA 3QAGA 1TJDA 3HHVA 2CX3A 3WYWA 2I9HA 4MJAA 1MD4A 5F06A 3FHKA 3O3TA 4KA0A 4K7IA 1YF1A 4HU7A 5DJMA 2VL2C 1T4YA 10GSA 1BAYA 3QAVA 2CAQA 2F3MA 5AN1A 1EZKA 2HNLA 4GXZA 1GSUA 1UC7A 3DKSA 1FAAA 1Y6EA 4HI7A 1E2YA 5ECRB 3BBYA 4K8MA 2H8LA 3TKSE 2CV4A 2LJAA 4XS4A 1FVJA 2IIYA 3F63A 2PVQA 1O85A 4GRFA 2PVOC 2FHEA 3IAS2 1OC3A 4JRRA 2YZUA 4ISDA 3VWXA 1EEMA 1M2BA 5B8BA 3RAZA 4LL4B 1B4PA 4RQRA 1S3DA 3EU3A 3DVXA 1T4ZA 3GV1A 3DYRA 2YP6A 5CNWA 1HYUA 2IMEA 3A2WA 1TKDB 2YZHA 4PX1A 2X8HA 1GP1A 4FIWA 2XPDA 1GSDA 2CZ3A 1GSQA 4MPFA 3QPMA 3O76A 3W8SA 2JACA 1V9WA 1TW9A 4JE1A 4TR4A 1X9WB 3NIVA 2VL2A 3F3RA 1PSQA 1O6JA 1XWKA 2K18A 5DCHA 3ZIVA 5F8BA 4WKWA 1MDJA 3P8WA 3ME7A 2H76A 1K0BA 1JZRA 2H75A 2YN1A 2E2GA 1TI3A 3F6DA 5G5FA 3WT2A 4BVYA 3R2QA 3M3MA 1QK8A 2WB9A 3L9SA 1JLWA 3L9UA 1WE0A 3DIEA 1OAZA 4WR4A 4DVCA 3UBLA 19GSA 2JADA 3Q19A 5B7CA 4L5LA 5C00A 1SJZA 4HS1A 3IV4A 4GSSA 2H0GA 5F0GA 1MDIA 1RK4A 4KE3A 4K7NA 5G31A 5D96A 1YEPA 2GQKA 2X99A 1K3OA 1J0FA 4KAEA 1A0FA 5A4WA 1AAZA 2HFDA 3EYTA 3G9BA 3VPQA 2WCIA 4QL7A 5KN0A 3UL3A 2OACA 1QXHA 3D5JA 2GZYA 2A2RA 5FWGA 5EL8A 5EVOA 4NWYA 1EV9A 2OADA 5H5QA 4EO3A 1F2EA 4F03A 2R6KA 2H0HA 1Q4JA 1XZOA 3H79A 1O8WA 2PMTA 3Q6OA 4GF0A 3TRPA 5JWQB 2C8UA 3IR4A 4J57E 2FWEA 1NSWA 1R5AA 3WGDA 5ID2A 2O7KA 4F0CA 5IPHA 1N8JA 1HNAA 4EUYA 1V40A 1JFUA 3GNJA 1TK5B 3QFAC 2O87A 3D6IA 4ILFA 5DJLA 4G9HA 1ILOA 4OFNA 5IMCA 4XTSA 4DEJA 2DSAA 1ZYQB 4NV2A 2L6CA 9GSSA 3WT1A 2AAWA 1G0TA 2VOCA 4MF7A 1TOFA 2H6ZA 4I2TA 5L71A 2B5XA 2YV9A 2HSYA 3IPZA 2V1MA 1K3LA 4KB3A 5B6MA 2OE3A 4ECIA 2KOKA 4KUNA 1SU9A 2ZCTA 1F6MC 1PN9A 2LUSA 1X9SB 2KP1A 1THXA 2WULA 3G7YA 3GKMA 3I6AA 4WXTA 4K0GA 4EDYA 3E0UA 3KD0A 3KZQA 3MAKA 1SKWB 2HZEB 1H75A 3F4RA 1PMTA 4JBBA 1JZDA 1O8XA 1QGVA 2LS5A 3HJPA 2J23A 3NZNA 1PX6A 3H4KA 2R4VA 3BJ5A 3UOMA 1MEKA 3GKXA 3M8NA 1ON4A 2FNOA 1EGOA 3IDVA 2FWFA 3L9VA 4MP4A 2OKAA 3EE2A 5IQYA 4K7OA 2CT6A 4O92A 4X43A 1XW9A 3QFBC 3N9JA 1R4WA 1WJKA 3Q74A 2KLXA 1PL1A 3U6VA 2FWGA 2XBIA 5DAKA 4I6XA 16GSA 2K8VA 1GSSA 2C1YA 2H19A 2GSTA 3FZAA 2X8CA 1I5GA 7GSSA 3IHQA 5HR2A 4IVFA 3F0IA 2IMIA 3RDWA 3UVTA 2FGXA 5ECNB 2DIYA 2H1DA 1PRXA 2XPEA 4XS1A 2YWIA 3TKRA 5IMZA 1YY7A 5D73A 3GURA 3ZVJD 1HQOA 3HVSA 1AUCA 1GUHA 4TR1B 2VCZA 3EU4A 1TP9A 1OC8A 1OKTA 5KN2A 3A3TA 1BYEA 2C3QA 2HXKA 1RQMA 4Z7XA 3GX0A 3IAM2 4L0WA 4TRXA 1C72A 1A23A 3RPPA 2HYXA 6GSSA 2CVKA 4JU5A 5IM9A 1NM3A 1OE8A 1QQ2A 2OBKA 1XIYA 3D4MA 3UARA 4ZB9A 1SK0A 1O73A 5EPFA 5AIVA 5GAND 3TOTA 2BMXA 4OCFA 3QDNA 4EVMA 3LQ7A 2IFQB 4HJ2A 1XWBA 4N10A 4D73B 3VLNA 6GSWA 2YV7A 1OVNA 5CYYA 4V2LA 4LA1A 2XHFA 1XW5A 4HUAA 2CA8A 5CP1A 4IELA 4GTUA 1RW1A 3CMIA 2L5LA 1GULA 3IC4A 1U3IA 1TDIA 4PUAA 3UVHA 2C3TA 5ECLB 3C1RA 4E8EA 5LCZA 1GLPA 4MCUA 3KTLA 3V1WA 1TK0B 1WOUA 3FYGA 1KNGA 3D22A 2JL4A 3HXSA 4JEDA 3P7XA 1TRWA 5A5KA 5DVBA 1FB0A 4I97A 2OBIA 2FWHA 3UIWA 1N2AA 4MF5A 5HQPA 2YWMA 3MWHA 2DC5A 1BJXA 5FT3A 2KHPA 2IN3A 3GL5A 1BX9A 3J7Yb 2VCTA 3I43A 2B7KA 5G1LA 4JR4A 4BVXA 3DEXA 2JSYA 3HVVA 1K0AA 3ZYWA 3MSZA 4WBRD 1M2DA 1URMA 2NDOA 2GZPA 2RLIA 1Z6NA 6GSUA 2RIIA 1GTIA 1XOBA 4GLTA 5D8IA 1M9BA 2CAIA 4NMUA 2AHEA 2VLVA 4Q5NA 4EKZA 3DWVA 1HNCA 1SL1B 1M9AA 3D0ZA 2LV3A 2C0EA 2GT5A 2VCXA 3NOFA 3S9FA 4MZBA 3SBCA 4FYBA 1TK8B 4XHMA 4ACSA 3LORA 4AJ6A 1K3YA 4ZXGA 14GSA 1T3BA 3LGCA 4RUVA 2TRXA 4KSMA 4GCIA 1XWAA 1A2LA 4ZBDA 3HY2A 3UJ1A 1V57A 3RHCA 2PN8A 3HD5A 4L5OA 1IYIA 2LRCA 4DSSB 3W8JA 3CBUA 5JCWA 1F37A 1FG4A 1NHYA 1GTAA 3KM6A 1PA3A 1KTEA 5ENUA 3TKQA 1SK2A 4ZL7A 2AUVA 5G2ZA 1SK1A 2O89A 3APQA 3VWVA 4ZIJA 1TI1A 1U87A 3VK9A 2C0FA 2P5QA 1PKWA 2LJKA 4F2IA 1NW2A 2O85A 1GH2A 1YDKA 3C71A 2DJ2A 3M9KA 4KW6A 2VUPA 1B9XC 2HRFA 3ED3A 4JR6A 3A2VA 4CHSA 3KXOA 4BL7A 4ECJA 3TJKA 1TRUA 1M0UA 1EOGA 1V2AA 4KDXA 3BD2A 1EV4A 1R26A 2NVLA 1U6TA 2GT6A 3QMXA 4IGJA 4X1UA 5IOWA 2H1BA 1ML6A 3UAPA 2LQOA 4OWYA 3TUEA 1XFLA 3GSTA 2N5BA 1F3AA 2QKEA 3Q18A 1SD8A 3IK9A 5J4UA 3W6GA 2ALBA 5KN3A 2GQMA 1T00A 1F9MA 3FZ4A 1OYJA 2PUKC 2H30A 1PGTA 2IMKA 2HZEA 3KH7A 2E2MA 2H01A 1WMJA 4IJIA 3C1SA 4TN8A 3HCZA 3WGEA 2FA8A 1A2MA 5DBQA 1XPVA 2WFCA 4WEYA 4V1Ap 5ECHB 3U5RE 4O5RA 5AISA 3CXGA 3APOA 2VL3A 4ECCA 1CQGA 3FR9A 6GSXA 2CVDA 4N0ZA 2H71A 2J9HA 1M7TA 3D4TA 2GSRA 2HI7A 1SKRB 2GSSA 3LFLA 4IKHA 3DGQA 2V6KA 4ZB6A 4XS6A 4BA7A 4MLYA 1JZWA 6GSVA 3ZITA 1GSYA 3GRXA 3P90A 2VM2A 1A2JA 4PGTA 1ZL9A 2LRNA 20GSA 3ZVJA 1GWCA 1WRYA 1PX7A 2OJLA 1G6WA 3CTGA 4EL1A 1XWGA 2FCHA 3LWAA 1U88A 3GFKA 1PKZA 2L5OA 4TR1A 4V1Ag 1MTCA 2JSZA 3J7Yk 3EVIA 2RM5A 1TTZA 4K1FA 3G7IA 2WDUA 2XC2A 5DCGA 1V98A 3F8UA 2QGVA 2FY6A 2VLTA 3KCMA 4V2NA 1YKAA 3DRNA 4G2EA 1QFNA 1FO5A 2BJXA 2N5AA 1YZXA 1ABAA 4LLRA 4YQMA 3LSZA 2IPAA 4IBPA 2AV4A 4L0UA 2KUCA 4POMA 4HQSA 3ZIJA 2IMDA 4YQVA 5LNKe 3EINA 5GSSA 5DALB 4HOJA 1LJRA 2F51A 3TRQA 2DJ3A 4GSTA 2IFQA 4D73A 1GSFA 3DMLA 2RM6A 2WJUA 4N11A 2VIMA 4WETA 4V2MA 1UA5A 3ZZXA 2K6VA 4KCEA 3ZFBA 2E0QA 4WBJA 2ZNMA 1W4VA 3FKFA 4AJ7A 2MBTA 1ZGNA 3F6FA 4EF0A 1A0RP 3IK7A 1FHEA 5DDLA 4GSNA 17GSA 5IPGA 1LU4A 2K8SA 4L8EA 1PD21 3VWWA 2L4CA 2L57A 5CRDA 3ZMKA 4I8BA 1XBSA 4IJ3A 4TXOB 1G7OA 2G0FA 1GRXA 2F8AA 2B7JA 2WRTA 2JZRA 2PPTA 1SYXA 3EWLA 3PGTA 1O81A 3CRUA 4F9ZA 1ZOFA 3ME8A 1ST9A 3TB2A 3F4TA 4N30A 2FA4A 1X0RA 4TXVA 4KNDA 1DE1A 5IMAA 3N5OA 3M0FA 3LXZA 4ID0A 4ZBBA 4RI6A 5ABRA 2O8VB 3BOAA 2GZZA 3ZTLA 3JCML 5JCUA 4KCAA 2DMMA 3C73A 5H5RA 1B9YC 2VLUA 1HNBA 1EP8A 3PR8A 1OC9B 1TU7A 3EMPA 4OO4A 2OE0A 5IO0A 2LKUA 2K9FA 5GZZB 4NPBA 1MDKA 4CW9A 3ZREA 4MF6A 1ERVA 2PERA 3LEFA 4NAXA 3OR5A 1F3BA 3GKKA 4PNFA 2HT9A 3EURA 2WS2A 3BCKA 3TGZA 3GHAA 4WF5A 1SL0B 2H6XA 5JCGA 3CSHA 5ECPB 3TKPA 3VURA 2DJ1A 3RPNA 4OMVA 4EC0A 2OA7A 3H93A 4YH2A 2RUFA 1K0CA 1DE2A 5DQSA 3GSSA 3HKRA 3ERFA 5A4UA 4LMVA 2GS3A 2H73A 3M1GA 1EWXA 4J2FA 4YAPA 2MMOA 4IN0A 5ECKB 1UN2A 5ECMB 1I9DA 2PU9C 3WD6A 2VAFA 1Z3EA 2WZ9A 3KMOA 5D9XA 4QQ7A 2F8FA 3C7MA 4ZB8A 4DSSA 1ZYEA 4KX4A 4F0BA 2R2JA 5CRWA 5J3RA 3ISOA 1EOHA 4MH2A 2YPMA 1KBNA 2L4QA 4HJMA 2HRNA 4NHZA 3TDGA 3CSJA 2IL3A 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chains in the Genus database with same CATH superfamily

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chains in the Genus database with same CATH homology

#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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2HRFA

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