2FA4A

Crystal structure of oxidized form from saccharomyces cerevisiae
Total Genus 29
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
29
sequence length
104
structure length
104
Chain Sequence
MVTQLKSASEYDSALASGDKLVVVDFFATWCGPCKMIAPMIEKFAEQYSDAAFYKLDVDEVSDVAQKAEVSSMPTLIFYKGGKEVTRVVGANPAAIKQAIASNV
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
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molecule tags Electron transport
molecule keywords Thioredoxin II
publication title Crystal structure of the yeast cytoplasmic thioredoxin Trx2
pubmed doi rcsb
source organism Saccharomyces cerevisiae
total genus 29
structure length 104
sequence length 104
chains with identical sequence B
ec nomenclature
pdb deposition date 2005-12-06

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00085 Thioredoxin Thioredoxin
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.30.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich Glutaredoxin Glutaredoxin 2fa4A00
1A8YA 4WF5A 1WP0A 3QAVA 2FHEA 5D9XA 4MP4A 3GA4A 3C7MA 4HQZA 5HR2A 2CA8A 2K18A 2D2ZA 5FT3A 19GSA 1YY7A 3VURA 2OE3A 1GULA 2FWFA 3DVWA 3WGEA 4HJMA 2FCHA 3PH9A 4MJCA 2HFDA 3LORA 2IFQB 5ECIB 1FVKA 2DC5A 5DALA 1Z6NA 3TOUA 1PD21 4N11A 3EC3A 5JCGA 1OE7A 2B5XA 1SYRA 4TR1A 2L6DA 2LJKA 1SL2B 4MA9A 4TW5A 2IJYA 4NXIA 2XHFA 4FYCA 4MF6A 1C72A 1QGVA 3DWVA 2H0HA 1B4QA 1TP9A 3E0UA 4TR3A 2P31A 3TKPA 5JWRB 1GUMA 1ML6A 2WCIA 1XW5A 4K0GA 5AIVA 5ECKB 2H1BA 3LYPA 1AIUA 4POLA 2VUPA 2M80A 5G1KA 1TI3A 3EU3A 2B6MA 3KH7A 2JADA 5IO2A 2PBJA 3RHBA 2LUSA 1SK1A 3ZITA 3GNJA 1FAAA 1Q4JA 5E59A 2DJ0A 2GQMA 1F37A 2A2SA 4TR1B 1TDIA 2LEGA 1K3LA 2VLTA 5J9BA 2WB9A 5AISA 3OR5A 3UOMA 2IMEA 1YQ1A 4X1UA 4POKA 2TIRA 1EP8A 5AN1A 5ECRB 3EINA 3GMFA 4MK3A 3UBLA 2FWEA 1A24A 5A4VA 2X8HA 4KDXA 5B6NA 3EURA 4K9ZA 1DBYA 3VPQA 4YH2A 4J56E 1AC1A 4CDOA 4JEDA 3GKNA 1ZCPA 1BAYA 2H1AA 3UMAA 1OC9B 4NV5A 4MZBA 1NM3A 5HR0A 2NVLA 4TR0A 1JZDA 2NBSA 2F8FA 1GSUA 2H30A 4TXOB 2B5YA 3UJ1A 5CREA 3V1WA 4KX4A 1ERTA 3M1GA 2NTOA 2YJHA 3IXRA 4XS4A 2PVQA 1XW6A 3JCML 2E2GA 5G5FA 1UC7A 3RDWA 1F9MA 1YDKA 3FZ9A 2MYGA 1GUKA 5D9VA 1URMA 5CRWA 4ML6A 3GKXA 4OWYA 3F6DA 4L0WA 5CYYA 4KW6A 2XPEA 2L5LA 5IMAA 1OAZA 2R2JA 4V2MA 1EV9A 4POBA 9GSSA 5F07A 1B8XA 1MDIA 4K7NA 3G7JA 3VI7A 3ZVJA 3VWXA 3LYKA 1GTIA 1X0RA 4IKHA 4HUAA 2V6KA 4BPYA 2C3NA 1I9DA 1U6TA 2O7KA 2VLVA 2IMFA 4L5LA 1B48A 4BWSA 3DXBA 5DQSA 4IELA 4G19A 1EP7A 3LG6A 2WGRA 3UVHA 4PUAA 4MPFA 3ZIVA 2CVBA 1XWAA 2IIYA 2XC2A 2HT9A 2I3YA 4NV2A 1SU9A 1GNEA 5DAKB 1K0BA 2GSTA 2H19A 1GSYA 3FR9A 1VF1A 4ECBA 1PL2A 2VCXA 1M2BA 3P7XA 2RM5A 2WJUA 1AQVA 3GIXA 3BBYA 3IOSA 4GTUA 4KUNA 2VCTA 5J3RA 2J23A 3Q19A 3I69A 2GQLA 1NHOA 5GAND 4F0CA 2MMNA 2H76A 4LMVA 5D8IA 2OACA 1DSBA 3GL3A 2JSYA 2VLUA 3KZQA 2CAIA 3IC4A 1M7TA 2ZUPA 4Q5FA 2JU5A 4DSSA 3FZ5A 4IVFA 1SKWB 4IJ3A 1SENA 3HXSA 3M9JA 4K7IA 1QUWA 4PX1A 3LGCA 3NIVA 3WT1A 3IV4A 1EZKA 1CQGA 4L8EA 4TN8A 5J41A 3ZTLA 3GFKA 1TRVA 1VF4A 3E3EA 2I9HA 1R4WA 1T4YA 1M2AA 5IPGA 1X9SB 2GVPA 2XBQA 4FIWA 2H0IA 4BVXA 1JZWA 4Q5RA 3I9V2 2DIYA 5ECOB 6GSUA 2CVKA 2GZZA 4KCAA 1SD9A 2V2GA 5DDLA 2PN8A 3H93A 1XWBA 1ZYQB 1TU8A 2H75A 3ZREA 3IR4A 4HZ4A 1ST9A 1X5EA 4PXOA 5JCWA 1K3YA 4FYUA 4QQ7A 5CO3A 4KNDA 5F8BA 2AUVA 4ECCA 1ZMAA 3GL5A 2Z9SA 5ELAA 4JR6A 4IP1A 2VIMA 1F3BA 1R26A 4DVCA 1U87A 2RLIA 1DUGA 3FEUA 3GSTA 4MF7A 4F03A 5DCGA 2G2QA 1FB6A 1S3CA 2K8SA 2VO4A 5EY6A 2OBKA 1FVJA 1WOUA 5AIXA 1PKZA 2HZEB 1TK5B 1H75A 3DVXA 4EDYA 1RW1A 3DMLA 2HZFA 3UL3A 4EUYA 4XCSA 3KP9A 1BYEA 4JE1A 4MZCA 1ERWA 3GTUA 2E0QA 2J9HA 3F4SA 1SKRB 5JCUA 3IAS2 3MDKA 3EMXA 2YNXA 2RUEA 4H86A 3R2QA 4RI6A 1BJXA 3PINA 1GNWA 1B9YC 2ZCTA 4PQHA 2QKEA 5B6MA 1XBSA 2DSAA 3ME8A 5CRGA 4L5OA 1K0NA 3CSHA 2H74A 4XIHA 4N0VA 2B1LA 3DEXA 1XXUA 2JSZA 2VM1A 2H6XA 2DMLA 4KB3A 3F63A 2R5GA 1GSSA 1LBKA 1RQMA 2GSQA 3IK9A 2E7PA 3TJJA 5IQYA 2IN3A 1NSWA 3A2VA 2VCWA 4WETA 2ZNMA 3G7IA 1YKCA 3H4KA 3TKRA 4I97A 3D4MA 5ID2A 1MDJA 1R7HA 4PUFC 1VRSD 5EVOA 5ECLB 1QFNA 5DVBA 1T00A 3KGKA 2HI7A 1X9MB 4ECJA 1Z3EA 1FOVA 2HYXA 4KDYA 2O89A 4DSQA 4K1FA 2DMMA 3L0HA 5H5QA 2PGTA 4V2LA 1V2AA 2X8CA 3E9JB 4AJ6A 5LCZA 2G0FA 3RBTA 1W89A 4PURA 2B3SA 2N5BA 4ZL8A 1GLPA 11GSA 4G9HA 4ZB9A 4CHSA 5D9TA 3KIJA 3PR8A 1HNCA 2H71A 2DJ2A 2MMOA 2VD1A 3QDNA 1CQHA 4F9ZA 2F9SA 1SJZA 2H73A 2P5RA 2KLXA 3CSIA 3ERWA 4WXTA 3ZVJD 2A4VA 2DJ3A 3HKRA 2LRCA 3FY7A 1T7PB 1K3OA 1PL1A 2TRXA 1EOHA 3TJBA 1EGOA 3KP8A 4OFTA 3N9JA 4MMMA 4O5RA 3BCIA 1TW9A 2M46A 3F3RA 1USBA 1M0UA 2FUG2 1TRWA 4N30A 2H0GA 5HFIA 1O8WA 2C0GA 4EXJA 2C8UA 3QCPA 4WKWA 3QOUA 3H8QA 1FO5A 2R37A 1OC8A 5DALB 3L9VA 2GT5A 1OE8A 1OKTA 2HSHA 3CRUA 4WR4A 5CRHA 3HZ8A 5D96A 6GSXA 1SK0A 4RUVA 2DIZA 3WGXA 4EVMA 3VPTA 1EOGA 3LFLA 3C1RA 1ZZYA 1U3IA 2YWNA 4ECIA 4O32A 5IOWA 1HNAA 2VL2C 3LQ7A 3J7Yb 1SJIA 1ZYEA 1SK2A 4JBBA 2RM6A 1GL8A 3WD6A 1WWJA 3CMIA 5ECNB 1VF2A 2MBTA 4I8BA 2LJRA 2LKUA 4PNFA 2H6ZA 1MTCA 2K9FA 3TOTA 4RI7A 2X99A 2R6KA 3LJRA 2LRTA 3L4NA 4KA0A 1ON4A 5IMVA 1GH2A 3A2WA 1V58A 1XW9A 3TRQA 1PGTA 2HE3A 2YZUA 2EIRA 1VF3A 3TKQA 4MABA 4ZB8A 4PQ1A 3FHKA 2L6CA 1SL0B 3VK9A 3BOAA 4IHUA 4J2FA 3DKSA 3KJYA 5IMCA 2JL4A 1GTBA 4GF0A 3D6IA 5F05A 5ECHB 1W4VA 3CYNA 5B8BA 3QFAC 3O76A 1HYUA 5HFGA 5L71A 4HU7A 3ZMKA 5G1LA 1UN2A 1XFLA 1ACVA 3KCMA 3TRXA 1YEXA 1XVQA 5KN0A 3SWLA 3TRPA 1QXHA 3F6FA 3KEBA 4MJBA 4ZXGA 1WRYA 2MMAA 4JRRA 5CRDA 18GSA 1Z9HA 3Q74A 2K8VA 1A2MA 4OO4A 4IN0A 3AY8A 4XS1A 3TUEA 2CX4A 4F2IA 2M72A 4LL4B 3VWVA 3LSZA 2DBCA 2OA7A 4ML1A 4OMVA 5DCHA 2P5QA 1NHYA 4NHWA 3EU4A 1DE2A 1HQOA 1PMTA 3KM6A 1M2DA 2KP1A 1OC3A 4Q5QA 5DBQA 2C4JA 3W8JA 3IE3A 5GAPD 1M99A 4AJ7A 1BEDA 1XOBA 1YJ6A 5ECPB 1A0FA 3FW2A 1ZOFA 3GUSA 1XWKA 3H1NA 1Z5YE 4J57E 1G7OA 4XS4B 1JLVA 5ECMB 3GH9A 1H4OA 4KDUA 3TKSE 3N5OA 1PSQA 2AB6A 4OD7A 4KSOA 4BL7A 5H5SA 4JZQA 1DE1A 4ZB6A 1FHEA 1LU4A 2JZTA 3HJPA 12GSA 3C71A 2VCQA 2RUFA 1AW9A 1IYHA 3F4TA 1SYXA 1O7UA 4TR4A 3LEFA 3EYTA 3P2AA 3FR3A 4BWQA 2LRNA 1N8JA 2KP2A 4ACSA 1GUHA 4X0XA 4QL7A 2L57A 3QMXA 5A5KA 1V40A 4ISDA 3LWAA 2H6YA 1XVWA 3BJ5A 3O3TA 3SBCA 3WYWA 4OFNA 3IA1A 4FO5A 1J0FA 2ON7A 5ELGA 2JACA 3TB2A 3KH9A 5KN1A 4I6XA 2I81A 4HEA2 1PQNA 4V1Ap 1U3AA 4E8HA 2PUKC 3TCOA 1OYJA 4D73A 22GSA 4TRXA 5B8AA 2PVOC 2QGVA 3HVXA 1J9BA 2WFCA 4GSNA 2IWTA 2CAQA 2YN1A 4MDCA 4NAXA 2X64A 4HI7A 3L9SA 4EO3A 3ME7A 3MSZA 4FYBA 4AGSA 1V57A 2GDRA 2IPAA 1EGRA 1ERVA 3H79A 1KEBA 4QL9A 4GCIA 5G2ZA 1YF0A 4CW9A 3UEMA 1V98A 2VCVA 2WS2A 1TOFA 1Y6EA 5CAXA 2H8LA 2PPTA 2QC7A 1YEPA 2GSSA 4LL1B 2IMDA 2YCDA 1TK8B 5HFKA 3HCZA 2B1KA 1K0DA 3M8NA 4DEJA 2WDUA 2LNTA 2BTOT 4E8EA 2VL2A 4IBPA 2LTKA 4OCFA 1XZOA 4EDZA 4GSSA 3P90A 1XWGA 4DSSB 5FHIA 2FWGA 3J7Yk 1PN9A 2L4CA 2B5EA 2YWMA 4I5QA 2HXKA 3UIWA 2LV3A 2H1DA 1TXXA 5FWGA 2OADA 3APQA 1EV4A 3Q6OA 4WBRD 4V1Ag 3FZAA 4X43A 2HNLA 5GSTA 4L0UA 4EF0A 3IHQA 1BX9A 2AHEA 4K2DA 13GSA 4HZ2A 2HRNA 2FA4A 1S3DA 3ZYWA 1WJKA 5KEJA 3U5RE 2EIOA 1G6WA 2GGTA 4GQCA 2CX3A 1MEKA 4FH8A 3FKFA 3G7YA 2C3TA 2YWOA 1E6BA 2CV4A 2IL3A 3UARA 2BMXA 4P3YB 4AF2A 3M0FA 4OFMA 3CRTA 4WR5A 1EEMA 4ZL7A 4V2NA 5HR3A 1NW2A 4XTSA 4TOPA 2IFQA 2VCZA 3WT2A 2C0DA 2H72A 2V1MA 1M9BA 4O92A 2LQQA 3MNGA 5C00A 2O87A 4KGIA 2CQ9A 2I4AA 1V9WA 2R4VA 1GTAA 1JLWA 3CXGA 4ID0A 1JZRA 4XRAA 2FNOA 1YZXA 2YV7A 6GSVA 3D21A 6GSYA 5IPHA 14GSA 2EC4A 4EC0A 3DYRA 1AQWA 4MPGA 3GSSA 4WEYA 5EPFA 2FY6A 3BCKA 3C1SA 2C0EA 2HRFA 5IO0A 3TJKA 1A0RP 3GX0A 3NZNA 2CZ2A 1WMJA 4ZBDA 4ZILA 3K8NA 2DLXA 5IIZA 3RPPA 4IJIA 1E2YA 5ABRA 3GTUB 3IK7A 5ENUA 3L78A 1GSEA 1Z7RA 3IPZA 1RK4A 3TJFA 3VWUA 4NMUA 3F8UA 4IW9A 2B7JA 4KE3A 2IMKA 2O8VB 2YWIA 3BD2A 5B7CA 2L5OA 4N0ZA 2KUCA 3HVSA 1PA3A 2LSTA 2FD3A 1YF1A 2ALBA 3ERGA 4HDEA 1EWXA 5G30A 2AAWA 3TJGA 2GS3A 1PX6A 3FYGA 6GSSA 3CTFA 2GZPA 3MWHA 2F3MA 5ID2B 3ZL5A 4OO5A 2AV4A 2WRTA 4G10A 2MMZA 1LJRA 1N2AA 2RIIA 3EWLA 3ISOA 2OE0A 2YP6A 3DGQA 5CP1A 1OC9A 3HHVA 5F0GA 2OKAA 5D73A 2LJAA 1PKWA 1KTEA 2NPBA 3VFIA 5G5EA 1ZGNA 4JR4A 4TXOA 1ABAA 1GLQA 10GSA 4LMWA 1TRUA 2C80A 3C8EA 1Q98A 5IM9A 5JWQB 3Q18A 3US3A 5AGYA 3DIEA 2VAFA 4LA1A 2OE1A 1JFUA 1OVNA 2E2MA 3I6AA 3DD3A 4MCUA 1XOAA 1VGLA 2BJXA 1GTUA 2B7KA 2PMTA 1A23A 1SJ6A 2YZHA 3QFBC 3GHAA 3A5WA 3D5JA 4PQIA 4RQRA 4HS1A 4O7HA 3KMNA 3GKMA 4XS6A 3PGTA 5G31A 2C1YA 1WPIA 2VL3A 5C04A 1ZL9A 5A4UA 4IP6A 5HR1A 1GSFA 2AJQB 1O6JA 2XPDA 1QMVA 4OCEA 2GZYA 1M9AA 1BQ7A 4NHZA 1Y25A 2YPMA 1T8EB 4K6XA 4N10A 1K0AA 4EKZA 1KNGA 4YAPA 3GURA 4XRDA 4AJ8A 2C0FA 4HU9A 2LQOA 4RQXA 5KN3A 4ZBBA 2OBIA 2XBIA 2YJ7A 4IGJA 3W8SA 4I2TA 5DJLA 3IDVA 1T3BA 3HJOA 3QAGA 2YANA 3VLNA 2H1GA 4EL1A 4GXZA 4GLTA 2QSIA 1O73A 2CT6A 4ZL9A 4LLRA 5ECSA 4YAVA 5ECQB 2DJKA 1UA5A 4DSRA 3O6TA 3HZ4A 3FRCA 3ZIJA 3D4TA 3TKSC 5IMZA 1MD3A 1A2LA 2VD0A 3F3QA 3CTGA 3L9UA 2MBSA 5DAKA 3UBKA 1GWCA 2V6OA 1GP1A 4TVEA 1I5GA 1TK0B 3KXOA 2TRCP 3GX8A 1TU7A 3APSA 5J9CA 3IAM2 1J08A 5H5RA 5E4WA 1F2EA 2GQKA 1T1VA 3ZFLA 1XCCA 4NPBA 1X5CA 7GSSA 4IQAA 4MJEA 5IMDA 1FW1A 3RHCA 4MZWA 3LXTA 2NDOA 4MH3A 3QD9A 1X5DA 4BVYA 4HOJA 4KH7A 3G9BA 3W6GA 3HYPA 4ZIJA 1SD8A 3QR6A 1HNBA 3KTLA 4TKYA 1Z7PA 4F0BA 1GSDA 3NOFA 1GRXA 2V41A 2JZRA 4NWYA 3TDGA 2PU9C 2F8AA 1EEJA 3S9FA 2X8GA 4KAEA 2DJ1A 5IMFA 3GYKA 1Z6MA 5CNWA 4TXVA 1AXDA 3VWWA 3F4RA 1XWCA 4G2EA 2VOCA 3ED3A 4HQSA 2R3XA 3EVIA 1X9WB 4WF4A 2PERA 4XHMA 5LNKe 2HLSA 2L4QA 5LD0A 3C73A 3CSJA 2L59A 3QPMA 1TJDA 3GN3A 3TGZA 1XPVA 4MLYA 2O85A 1XIYA 3GH6A 1TKDB 4F82A 1WE0A 2ES7A 5JWOB 4K8MA 2HSYA 3ZZXA 1G0TA 2KHPA 1SL1B 4GQFA 2CVDA 3UAPA 2PWJA 3FK8A 1FB0A 3QAWA 3I43A 2JZSA 3HY2A 4HJ2A 1MDKA 3HJMA 2OJLA 5DJMA 2WZ9A 1BG5A 5HQPA 3KD0A 4ILFA 3U6VA 3MAKA 1QK8A 1SKSB 2N5FA 5KN2A 2FLSA 2GT6A 3IRAA 2GTUA 1O85A 3ZLPA 4MF5A 3A3TA 1K0OA 2DJJA 3UVTA 4EE0A 4K0NA 6GSTA 5EL8A 5F06A 8GSSA 3FZ4A 3ZRDA 1O8XA 3M3MA 4WBJA 2EIQA 3IBHA 2H01A 3P8WA 2VL9A 1OKDA 2CZ3A 2HZEA 1KBNA 2C3QA 1MD4A 3F0IA 2A2RA 2LS5A 3RAZA 3GKKA 1GSQA 1TI1A 4I2UA 1ERUA 1PX7A 1THXA 2FA8A 1UVZA 4MJAA 4Z7XA 2I1UA 1IYIA 3GRXA 3KMOA 4KSMA 1QQ2A 4IQ1A 4D73B 3M9KA 3CBUA 3EE2A 20GSA 3HA9A 5INYA 5IOXA 3A2XA 3DRNA 4KCEA 1AQXA 5D9WA 2GLRA 1O81A 4JU5A 1T4ZA 1A8LA 1JZOA 3ZMLA 1B4PA 2YOIA 16GSA 5GZZB 4GRFA 2IMIA 3VI5A 3APOA 2GSRA 4GSTA 2WULA 3HD5A 3WGDA 2V32A 1G7EA 3F9UA 5GSSA 2FWHA 3LXZA 2N5AA 2LNSA 1A2JA 2REMA 1U88A 1K0CA 3HDCA 2F51A 3KTBA 2H70A 1K0MA 4PGTA 5DQYA 3EMPA 4ZBAA 4GWRA 4K7OA 2ON5A 2FGXA 6GSWA 1S3AA 1AAZA 1TTZA 3HVVA 2AYTA 4IS0A 3D0ZA 5J4UA 5J5NA 4YQVA 1F6MC 1G6YA 1THOA 1FG4A 3GV1A 3ZFBA 5A4WA 4YQMA 1B9XC 1HD2A 4POMA 1ILOA 1F3AA 1TRSA 2H66A 1YKAA 1R5PA 2KOKA 4Q5NA 2K6VA 1PRXA 3TKSA 4PNGA 4BA7A 1AUCA 17GSA 3FR6A 2YV9A 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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