4MABA

Resolving cys to ala variant of salmonella alkyl hydroperoxide reductase c in its substrate-ready conformation
Total Genus 56
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
56
sequence length
165
structure length
165
Chain Sequence
SLINTKIKPFKNQAFKNGEFIEVTEKDTEGRWSVFFFYPADFTFVCPTELGDVADHYEELQKLGVDVYSVSTDTHFTHKAWHSSSETIAKIKYAMIGDPTGALTRNFDNMREDEGLADRATFVVDPQGIIQAIEVTAEGIGRDASDLLRKIKAAQYVAAHPGEVA
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
{{ tooltip.sname }} connected with {{ tooltip.tname }} : {{qFormat(tooltip.svalue) }}
molecule keywords Alkyl hydroperoxide reductase subunit C
publication title The sensitive balance between the fully folded and locally unfolded conformations of a model peroxiredoxin.
pubmed doi rcsb
source organism Salmonella enterica subsp. enterica serovar typhimurium
molecule tags Oxidoreductase
total genus 56
structure length 165
sequence length 165
chains with identical sequence B, C, D, E
ec nomenclature ec 1.11.1.15: Peroxiredoxin.
pdb deposition date 2013-08-15

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00578 AhpC-TSA AhpC/TSA family
A PF10417 1-cysPrx_C C-terminal domain of 1-Cys peroxiredoxin
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.30.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich Glutaredoxin Glutaredoxin 4mabA00
4MJCA 2F8FA 2JSZA 2PN8A 1PQNA 2IMKA 3Q19A 2YCDA 3LXTA 4V2NA 2C8UA 3FYGA 4G10A 4PUAA 5ECKB 1ACVA 1A0RP 2RM6A 4ZILA 3HDCA 4HEA2 3RHBA 1LBKA 5J3RA 5GAND 2JADA 4Q5RA 2X64A 4PURA 4GLTA 1GLQA 5HR2A 3ZIJA 1GTIA 4IJ3A 3FKFA 1XOBA 2H01A 3NOFA 4OCEA 4K2DA 5FWGA 1HNAA 1GLPA 4E8HA 3FR3A 6GSTA 5DALA 5DVBA 2FLSA 3ERWA 5EL8A 3MDKA 4BVYA 2JZTA 4OCFA 1J0FA 2C0GA 3APQA 3WGDA 3LWAA 1QK8A 1HNCA 4NHZA 1EOGA 1GNEA 1MDKA 4KE3A 3WGEA 3GMFA 4HQZA 3VPTA 1FO5A 5CO3A 4ZB6A 4ZB9A 3EE2A 1Z7RA 4HJMA 1R26A 1FVJA 4EXJA 4EO3A 2QC7A 1Q98A 2MMNA 4KH7A 2LEGA 5IMVA 5IMFA 2FWEA 5G5EA 1SKWB 3D22A 4PNFA 3G7YA 3D6IA 2WULA 3UAPA 1VGLA 2M80A 5CAXA 3KP8A 2VCZA 2CAQA 1SL2B 5AGYA 4KSOA 1WJKA 3VK9A 2G2QA 2FD3A 1GSYA 4X43A 2H6YA 2HSHA 3TKRA 4MPGA 3KM6A 4IW9A 4J56E 4K0GA 4NV2A 1B4QA 3F63A 3ZMKA 1BJXA 4N0ZA 1THOA 1JLVA 2I1UA 1EP8A 4OO5A 3FHKA 1FHEA 1TRWA 1K0OA 4TVEA 1OC3A 2JL4A 1BEDA 5ABRA 5COHA 1QXHA 1SK0A 1FW1A 4QL9A 3W6GA 5D9TA 4POBA 5J4UA 2WCIA 1J08A 3KH7A 2CX4A 3BBYA 4I5QA 1PKZA 1ST9A 2OJLA 2GSTA 5DDLA 3QR6A 2WS2A 2OE0A 1XWCA 1B4PA 7GSSA 3DRNA 3TJKA 4KDYA 3P90A 3HHVA 2ZCTA 22GSA 2FGXA 3TB2A 4XCSA 4K9ZA 5DQSA 5J9BA 2V6KA 1AXDA 1BQ7A 2FWFA 2YN1A 2K8VA 3GRXA 3UJ1A 2LS5A 2VD0A 1UA5A 2C0EA 3H79A 5DALB 1R5PA 1PL2A 2Z9SA 5ECLB 3U6VA 2OE1A 2E0QA 3APOA 1R4WA 1XW9A 3IAS2 1GTBA 3ISOA 1XVWA 2GQLA 5G30A 4OFMA 3TJBA 4YQVA 2XC2A 2QKEA 1I5GA 1QUWA 3TKSC 2HYXA 3F3QA 4ID0A 1X5EA 3KCMA 3TRQA 2H8LA 4HU9A 4IP1A 3L9VA 3D4TA 1O8XA 2IL3A 2LRCA 3ZREA 4I2TA 2ALBA 3GTUA 1MEKA 3KTBA 2I81A 4AGSA 2YNXA 1K0CA 1V98A 5D96A 5GSTA 1ML6A 3TGZA 3IPZA 4MH2A 3JCML 5EY6A 3ZLPA 5CYYA 1EEMA 5JWQB 3TKPA 4LLRA 3UIWA 2HRFA 4FYUA 3Q74A 4OFNA 4OD7A 2IN3A 3A2XA 3IAM2 2LKUA 3L0HA 2LNSA 1DE1A 2H1DA 1K0AA 3GHAA 4V1Ag 4ZXGA 4NV5A 5HFIA 3ZMLA 1YKAA 1XWKA 3EYTA 3HJMA 3HCZA 2MBSA 4TXVA 1F9MA 1RQMA 4HJ2A 2GTUA 1XZOA 5INYA 1SJ6A 4ZBAA 2NVLA 2IMEA 3DXBA 2KP2A 3ZFLA 2F3MA 4JBBA 1M7TA 1AC1A 3EWLA 1E6BA 4MZBA 2GZYA 4ZBDA 2P0GA 3RPNA 2CAIA 4DEJA 2I4AA 5JWRB 2YZHA 3KD0A 5IPGA 2HZEA 3UOMA 2GSRA 2JACA 2MBTA 2DJ3A 1TI1A 1GUKA 3H4KA 1O7UA 4BPYA 4KDXA 4CDOA 2AAWA 5A4VA 1TU7A 3DVWA 1GNWA 3GURA 5B7CA 3KXOA 4HUAA 4TR1B 1PL1A 4NXIA 3EC3A 4FYCA 5HR3A 2A4VA 3WD6A 1ABAA 2DJ2A 3SWLA 1K0MA 4MA9A 2DMLA 1M9AA 2H66A 4FYBA 2VCVA 1VF1A 1SK1A 2O7KA 2C3TA 1T3BA 4MJAA 1SL1B 4YQUA 3IXRA 2H6XA 4YAVA 1K0DA 3UMAA 3IBHA 4FH8A 2K9FA 2FWGA 1Y6EA 4HI7A 4ISDA 3V1WA 3GTUB 4PQ1A 1AUCA 2DJJA 1FG4A 3LEFA 4IN0A 1ZL9A 3IR4A 3PH9A 4Q5QA 1FAAA 2RIIA 1HNBA 1X9SB 5ECOB 5E4WA 3LXZA 4MZCA 1OE8A 4WKWA 4RI7A 5ECRB 2YV7A 1TI3A 3RPPA 5IPHA 2LJRA 2PPTA 4O92A 3CXGA 4D73B 2C0DA 5ECMB 3HZ4A 1MDJA 2ZNMA 4HS1A 4IVFA 3VFIA 5B6MA 4O5RA 3DWVA 3MSZA 1CQHA 3GSSA 1SJIA 1XWBA 3Q18A 3TJJA 5CRWA 3KIJA 2YANA 4XS1A 2DJ1A 20GSA 3D0ZA 1XCCA 2RUFA 5JCWA 2H72A 1YKCA 2B1LA 2E7PA 2HZEB 1J9BA 1RW1A 1XFLA 2O8VB 1PD21 2CVKA 4N11A 4EDYA 2KHPA 4L5OA 3GA4A 4MF5A 2P5QA 4V2MA 3ZTLA 3NIVA 4LL4B 1ERUA 1PKWA 2HFDA 1PA3A 1F3AA 3E9JB 3F9UA 3KMNA 3TCOA 3IOSA 3P7XA 3UVTA 4RI6A 5D73A 4KB3A 1MD3A 4KUNA 5FT3A 4KX4A 2VO4A 4MP4A 5A5KA 4HDEA 3VI5A 1G6WA 4V2LA 2VM2A 2XBQA 3K8NA 5DJMA 5GAPD 2AJQB 1YY7A 3CSHA 2GZPA 2C3NA 1GUMA 1TTZA 1EWXA 4KDUA 1TDIA 4P3YB 2RLIA 2H30A 2P31A 4DSSA 3N5OA 1K0BA 1AIUA 3HJOA 4MF6A 2N5AA 2V1MA 2M72A 1EGOA 1T8EB 3TDGA 3QFBC 2HNLA 3GFKA 4RUVA 1YEPA 2WRTA 5IO2A 2C3QA 1BAYA 1IYIA 2OE3A 3EURA 3ZZXA 3FZAA 4NMUA 6GSYA 2DIYA 1G7OA 4EC0A 2C80A 3VI7A 1QQ2A 5ELAA 4GCIA 1EP7A 3N9JA 3CTFA 1DSBA 4AJ8A 1GUHA 3BCKA 3TRXA 5KN3A 2CQ9A 4IQ1A 4IQAA 1EGRA 3F4RA 3TKSA 3LYKA 1G0TA 1B48A 1F2EA 3QAGA 2D2ZA 1TW9A 2OKAA 3W8JA 1X5CA 3AY8A 3ME7A 1ZCPA 1F3BA 5GSSA 2YPMA 5F05A 1WPIA 2VCQA 4ULXA 3LG6A 4XTSA 3IHQA 4WXTA 3NZNA 1EZKA 4GTUA 1A0FA 5C00A 2HSYA 5LCZA 2VL2C 3G7IA 2B7KA 2F8AA 4QQ7A 1UC7A 4MLYA 2HI7A 1W4VA 1BG5A 1DE2A 5G1LA 3F6FA 3M9JA 2WFCA 3VWXA 2WJUA 4ECBA 1V57A 4BWQA 3FRCA 3CTGA 4DSQA 2R4VA 2OA7A 2FWHA 2IMFA 2H0IA 3QOUA 4TR3A 1EOHA 3CYNA 2GS3A 3GV1A 2L5OA 1LU4A 3TOUA 2PVQA 2BTOT 9GSSA 4MH3A 1JZRA 1V40A 3VPQA 4WETA 3QMXA 3VWUA 3DKSA 4KAEA 5ECPB 4JRRA 1SYRA 3UVHA 2GQMA 1FB6A 3CSIA 2DJKA 2AYTA 5G2ZA 1M0UA 2L59A 2VLVA 5B8BA 5HFGA 1A2MA 3RDWA 5J5NA 4L0WA 1NHOA 1Z5YE 4DSSB 2MYGA 1GULA 1PX7A 4F9ZA 1EV4A 2GGTA 1O81A 4IGJA 1WP0A 1WE0A 1QGVA 1FVKA 2CZ2A 2YWMA 5F07A 3EMXA 5IMZA 1XOAA 1B9XC 1TRSA 2CZ3A 3M9KA 5H5QA 1GSQA 3I6AA 3IC4A 4TR1A 5EVOA 1PX6A 3H93A 1A8YA 1Z7PA 3FY7A 3US3A 3IE3A 4NHWA 2LV3A 4TOPA 3FZ9A 1GSUA 4WF4A 2LSTA 5H5RA 3Q6OA 3I69A 4ACSA 2X8HA 4ZL9A 2WZ9A 4PUFC 1T7PB 2XBIA 3F3RA 2GT6A 4WEYA 2TRCP 1GSDA 3QD9A 4TKYA 17GSA 3EU3A 3BJ5A 1K3YA 3KP9A 1O6JA 2HE3A 3L4NA 1GL8A 2CA8A 3GKKA 4OMVA 2X8GA 4HU7A 4BVXA 2IWTA 3GUSA 4IHUA 1USBA 2XPDA 4K8MA 4DVCA 3IK9A 2HLSA 4ZL8A 4ZB8A 1JLWA 1ZGNA 2J23A 2YJHA 4K7OA 1QFNA 1Y25A 4D73A 3M1GA 4AJ6A 2YWIA 4LMWA 1SYXA 2ES7A 3WGXA 2FY6A 1Q4JA 3DIEA 2H0HA 2C1YA 3VWVA 3LYPA 5ECQB 1TRUA 1N2AA 5DAKB 2XHFA 2YOIA 3TOTA 4OFTA 2NDOA 4WR5A 4MK3A 2LUSA 3ZVJD 1F6MC 5DCGA 2MZCA 2I9HA 3QAWA 2YJ7A 2LNTA 5IM9A 1B9YC 1G6YA 4JU5A 3FW2A 1U88A 2IJYA 2QSIA 1X9WB 2L4CA 3RAZA 3APSA 4HZ2A 1XIYA 5L71A 19GSA 2GZZA 3OR5A 3PINA 5ECSA 5B6NA 3P8WA 13GSA 1M9BA 5ID2B 3S9FA 4XRDA 2LJAA 1JZOA 4L5LA 4MF7A 2V2GA 4MMMA 2LRNA 3HJPA 3QFAC 2RM5A 2VAFA 3A2VA 4TW5A 2NTOA 4MPFA 4O32A 5H5SA 1SKRB 4MJEA 4O7HA 1GRXA 4OO4A 1SD8A 2VCXA 3DVXA 4JZQA 1TRVA 1V9WA 3ZVJA 2B7JA 1ZZYA 3HVVA 4TR0A 2KUCA 3D4MA 3QAVA 4POLA 3C8EA 4BL7A 1Z6NA 2DC5A 1AW9A 4KW6A 5IOWA 2H74A 3EU4A 5F0GA 2PVOC 1T4ZA 3F0IA 1OKTA 2JZRA 3PR8A 4EE0A 1OYJA 3CRTA 2I3YA 4G9HA 3M3MA 2R37A 2WDUA 5LNKe 1T1VA 3LJRA 3F6DA 2PUKC 3FR6A 3C73A 1A2JA 2K8SA 2TIRA 14GSA 1AAZA 2PERA 2V41A 1TKDB 1T4YA 5AIXA 2H70A 1GWCA 1A24A 4K0NA 5J41A 2ZUPA 2GDRA 2R2JA 2P5RA 2EC4A 4EKZA 4F82A 2IFQB 3RBTA 2FUG2 3M0FA 2EIRA 3KTLA 4GQFA 1PN9A 2LQOA 5HR1A 1XWAA 1TK8B 2QGVA 1KTEA 4ML6A 3BOAA 2OBKA 1ZOFA 4H86A 1S3AA 4YAPA 1UVZA 4DSRA 1BX9A 4K1FA 3UL3A 2O85A 3DEXA 4KGIA 1A23A 1JHBA 2WB9A 1V58A 5CNWA 12GSA 2J9HA 1XXUA 2WGRA 1Z3EA 2H0GA 11GSA 4IBPA 1U87A 5ECIB 3CRUA 4EL1A 5ENUA 1YEXA 5GZZB 3E3EA 2CVBA 2OBIA 4KSMA 2CX3A 3LSZA 1OC9A 3H8QA 3FR9A 1XBSA 3M8NA 4OWYA 2HXKA 2PU9C 3MAKA 4XHMA 1H4OA 1MTCA 2HT9A 4HZ4A 3HYPA 1SL0B 2HRNA 5IMDA 1R7HA 1PGTA 4Q5NA 1M2DA 2DLXA 2GSQA 3D5JA 1YF0A 3I43A 1YF1A 4J2FA 3ZIVA 2VL3A 5B8AA 3L9SA 2VM1A 2DSAA 3UBLA 4XS4B 1K0NA 4I6XA 1TU8A 1THXA 1URMA 5ECNB 1OKDA 5J9CA 4I97A 1M99A 4GSTA 2FHEA 4N30A 3WYWA 3FEUA 3I9V2 2IMDA 1VF4A 2CV4A 2VOCA 4ML1A 3DYRA 3ZFBA 1G7EA 2NPBA 5KN2A 4AJ7A 2H75A 2X99A 3LORA 4PNGA 1UN2A 2B3SA 3HKRA 4KCAA 3GKNA 3KH9A 4K7IA 3TUEA 4IS0A 5KN1A 4LL1B 2IPAA 4IKHA 3VLNA 1U3IA 2F51A 4J57E 4F0CA 2VCTA 1OC8A 1HD2A 1EEJA 4CHSA 3ERGA 1X5DA 1M2AA 2L6DA 3KEBA 2H1AA 5KEJA 1WWJA 5JCUA 3ED3A 5D9VA 2YP6A 3SBCA 2K6VA 2FCHA 5AN1A 5KN0A 4AF2A 3GNJA 5A4WA 3TJGA 4N0VA 1ERWA 6GSXA 4X1UA 4WBJA 1SD9A 5AISA 2TRXA 1DUGA 1RK4A 2BMXA 5DBQA 3QCPA 2B1KA 4FO5A 3QPMA 4POKA 2O87A 4GWRA 3C7MA 2RUEA 3IV4A 1CQGA 3GL5A 5ECHB 2DBCA 2PBJA 4POMA 1TXXA 3R2QA 2YWOA 5DJLA 1VF2A 1SK2A 5A4UA 4ZBBA 2GT5A 2EIOA 3HA9A 3LQ7A 2CVDA 3HXSA 4I8BA 1OC9B 1AQVA 3DD3A 3D21A 4XS6A 4JE1A 3DMLA 1TOFA 1GP1A 1GH2A 4EVMA 1FB0A 1SJZA 4KA0A 4ECIA 1GSEA 3G9BA 1AQWA 3ERFA 1JFUA 2B5XA 18GSA 5DAKA 1SU9A 1WMJA 1E2YA 5IIZA 2GVPA 3G7JA 1U3AA 2ON5A 2V32A 4WBRD 3GKMA 4WR4A 1T00A 1AQXA 2LJKA 4YH2A 3KZQA 2C4JA 1K3LA 4MDCA 2R6KA 5IO0A 2OADA 2EIQA 2GSSA 4LMVA 2B5EA 4RQXA 2KOKA 2GLRA 2KP1A 4YQMA 2H71A 4ECJA 4V1Ap 1V2AA 1XW6A 2OACA 4IELA 1DBYA 5IOXA 4GXZA 3W8SA 2H76A 2K18A 2PGTA 3O76A 2DMMA 3ZYWA 1A8LA 5IMAA 1VF3A 3VURA 6GSSA 6GSUA 5ID2A 1ZYEA 4ZIJA 3GYKA 2JZSA 4CW9A 1LJRA 2REMA 5F8BA 4MZWA 1M2BA 1PSQA 1YJ6A 3F8UA 2VL9A 3CSJA 1MDIA 1OVNA 4NAXA 2HZFA 3GIXA 1Z6MA 2MMOA 5EPFA 16GSA 4TRXA 1R5AA 2FNOA 1S3DA 3EVIA 2N5BA 2VLUA 4MJBA 4XIHA 3E0UA 2XPEA 3A3TA 2JSYA 2AB6A 5D9XA 4BA7A 3IK7A 2AUVA 1GTUA 4EDZA 2R5GA 3MWHA 1ON4A 3C1SA 4Q5FA 3TRPA 3IA1A 3ME8A 1ILOA 4KNDA 1Z9HA 1FOVA 1X0RA 5G5FA 2AV4A 1NW2A 8GSSA 5DCHA 1F37A 3KJYA 1TJDA 1HYUA 1TK0B 4IP6A 1EV9A 4E8EA 4EF0A 2MMAA 2B5YA 1O85A 1HQOA 3IRAA 3MNGA 2B6MA 2LRTA 2E2MA 3FK8A 3GKXA 4FIWA 3CMIA 1X9MB 1WIKA 4NPBA 3J7Yb 2VLTA 5HR0A 4N10A 3HY2A 4L8EA 3GL3A 1GSFA 4PQIA 2NBSA 2IFQA 2A2SA 4X0XA 2FA4A 4GRFA 3ZL5A 1OE7A 3FZ5A 1GTAA 5FHIA 3F4TA 3EMPA 3CBUA 3ZITA 4F03A 2H1GA 2VIMA 4PGTA 3WT1A 5C04A 1O73A 2JU5A 2PMTA 5IQYA 5LD0A 3QDNA 1SKSB 3U5RE 3A5WA 3C1RA 4RQRA 1S3CA 4PQHA 3O6TA 1MD4A 1JZWA 3KGKA 4TXOA 3O3TA 4JR4A 2GQKA 4IJIA 1YDKA 5IMCA 4F2IA 2O89A 4LA1A 2LTKA 3GX0A 2BJXA 1N8JA 1BYEA 1C72A 2A2RA 2G0FA 3F4SA 4L0UA 2MMZA 4G19A 2H73A 2VUPA 4F0BA 4K6XA 2X8CA 4ECCA 3L78A 4TN8A 1W89A 1O8WA 1OAZA 3GX8A 2ON7A 4ZL7A 5E59A 2V6OA 4MABA 3HZ8A 2R3XA 2CT6A 3UBKA 1ERVA 4XS4A 3UEMA 4GSNA 5D8IA 5JWOB 1A2LA 3GN3A 1TK5B 2F9SA 1KEBA 2YV9A 4Z7XA 2M46A 1YQ1A 2C0FA 5CRDA 4NWYA 3A2WA 2H1BA 1PRXA 1XW5A 3GH9A 5HQPA 2N5FA 2H19A 1U6TA 2VD1A 3H1NA 5CP1A 1NHYA 3LGCA 2L4QA 1PMTA 1JZDA 4PX1A 3C71A 4TR4A 2H6ZA 3HD5A 4WF5A 1NSWA 3ZRDA 3LFLA 3J7Yk 1GSSA 5HFKA 6GSWA 4GSSA 1KBNA 1NM3A 3KMOA 2FA8A 2IMIA 1B8XA 4ILFA 3EINA 5G1KA 2YWNA 2DJ0A 3GSTA 4G2EA 3FZ4A 3P2AA 5CRHA 2VL2A 3PGTA 4HOJA 2L57A 4EUYA 1ERTA 6GSVA 5D93A 3TKQA 1VRSD 2E2GA 4GQCA 5D9WA 4TXOB 5DQYA 4I2UA 3BD2A 1KNGA 4K7NA 5F06A 1H75A 1SENA 1I9DA 5CREA 1XVQA 4PXOA 4BWSA 5AIVA 3TKSE 1QMVA 4MCUA 5G31A 3WT2A 2PWJA 3TJFA 5JCGA 2IIYA 4JEDA 3DGQA 1YZXA 2L5LA 5CRGA 1WRYA 2LQQA 4KCEA 1XWGA 2YZUA 2AHEA 2L6CA 3BCIA 3HVSA 3HVXA 4JR6A 3GH6A 3IDVA 3RHCA 10GSA 1TP9A 5ELGA 1ZYQB 4GF0A 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chains in the Genus database with same CATH homology


 
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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#similar chains, but unknotted
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#similar chains in the pdb database (?% sequence similarity)
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