4MABA

Resolving cys to ala variant of salmonella alkyl hydroperoxide reductase c in its substrate-ready conformation
Total Genus 56
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
56
sequence length
165
structure length
165
Chain Sequence
SLINTKIKPFKNQAFKNGEFIEVTEKDTEGRWSVFFFYPADFTFVCPTELGDVADHYEELQKLGVDVYSVSTDTHFTHKAWHSSSETIAKIKYAMIGDPTGALTRNFDNMREDEGLADRATFVVDPQGIIQAIEVTAEGIGRDASDLLRKIKAAQYVAAHPGEVA
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
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molecule tags Oxidoreductase
molecule keywords Alkyl hydroperoxide reductase subunit C
publication title The sensitive balance between the fully folded and locally unfolded conformations of a model peroxiredoxin.
pubmed doi rcsb
source organism Salmonella enterica subsp. enterica serovar typhimurium
total genus 56
structure length 165
sequence length 165
chains with identical sequence B, C, D, E
ec nomenclature ec 1.11.1.15: Peroxiredoxin.
pdb deposition date 2013-08-15

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00578 AhpC-TSA AhpC/TSA family
A PF10417 1-cysPrx_C C-terminal domain of 1-Cys peroxiredoxin
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.30.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich Glutaredoxin Glutaredoxin 4mabA00
4BWQA 5IOXA 3H93A 2HYXA 4N0VA 4IKHA 3Q6OA 4XRDA 5ECLB 1GSQA 6GSUA 5IPHA 2KP2A 1EGRA 5EPFA 3UJ1A 1N8JA 3FKFA 4ID0A 1U3IA 4PNFA 1TRUA 3HKRA 3EURA 4N0ZA 3ME8A 2GZZA 4HQZA 2LRTA 4YQMA 2LRCA 4POLA 1TRSA 5F06A 1R4WA 2P5QA 2PMTA 2IIYA 4TR4A 1F6MC 1QGVA 4E8HA 1OKTA 2YP6A 1TK0B 4XS4B 2H30A 3IPZA 4MP4A 2CAQA 4O92A 3M1GA 3L9VA 2L5OA 1MDIA 4IVFA 1SU9A 4K7NA 3UOMA 1XWBA 2HSYA 3FR6A 2K9FA 1S3DA 4IBPA 1YKAA 4AF2A 5HR0A 1YY7A 3HVSA 4IQ1A 3J7Yk 4IN0A 2DJ2A 4TVEA 3GUSA 3LFLA 4AGSA 3A2XA 4KE3A 4RI6A 3CBUA 3PINA 5GSSA 3D22A 1E2YA 4AJ7A 3IHQA 4JE1A 3UEMA 6GSYA 1C72A 1JZWA 2ZUPA 3P90A 2VCVA 3CXGA 5F8BA 3FZ9A 1UVZA 4KA0A 1B48A 1OC9B 4KH7A 3UBKA 5EY6A 5IPGA 2ALBA 1XBSA 1PD21 2YOIA 1RW1A 4EF0A 1K0MA 3P7XA 3HYPA 1LBKA 1G7OA 5AISA 3IK7A 4OFNA 4PUFC 3KP9A 1X9WB 2F8FA 2O85A 1GSFA 3SWLA 4MF5A 4MJCA 4FH8A 4I6XA 2I4AA 5DJLA 4CHSA 2YV9A 2LNSA 1GSDA 4TXVA 1RK4A 4POKA 2XPEA 3LG6A 4ECCA 5DBQA 4IGJA 1GTAA 5HFIA 18GSA 3K8NA 4IQAA 3DGQA 5DALA 2TIRA 1ILOA 4TR3A 4ZIJA 2X8HA 3IE3A 3VWUA 4KGIA 4L5LA 2GSRA 4EDZA 5L71A 2C3NA 2GZPA 3Q74A 3N9JA 3GTUA 1V58A 3TKSA 5IIZA 2JL4A 2JU5A 3TKQA 1F9MA 4L5OA 4ZBDA 3KXOA 1H4OA 4IP1A 3EYTA 4LMVA 4MMMA 3MSZA 1WOUA 2AJQB 3GL3A 1G6WA 4ZL9A 4EE0A 2L5LA 2IFQB 3ZFBA 4BVXA 1JZRA 1XW6A 2FHEA 4PX1A 2L6CA 1T4YA 1SYXA 4G19A 3TRPA 3CRUA 4OO5A 12GSA 3RBTA 4ACSA 5J3RA 5DAKA 3CYNA 3WGXA 1SL2B 1JFUA 5HFGA 4ZB8A 2GQLA 1SD9A 1ST9A 4OWYA 1SK1A 3IC4A 2HRNA 4PQHA 5B6NA 1BAYA 2RIIA 4WKWA 1TP9A 3F3QA 5CRWA 1PX6A 5ID2A 2WB9A 2IMKA 1TW9A 5H5RA 3TOUA 4EL1A 1JZOA 1TTZA 2LRNA 1A8YA 1T8EB 2V6OA 2DJKA 4J57E 5KN0A 2NTOA 2CZ2A 1XWKA 2V41A 3U5RE 3G7YA 2PUKC 2NVLA 4F2IA 4HZ4A 2CX3A 3TKSE 3CTFA 1ZYEA 1ON4A 5JCGA 5G2ZA 2K6VA 3EWLA 5HR3A 3DKSA 3TDGA 3ED3A 3EINA 1DUGA 4K0NA 2V1MA 5JWQB 3IOSA 1PQNA 1TXXA 3BCKA 3MAKA 1EOGA 3DEXA 1QQ2A 4OD7A 1UC7A 4I2UA 1FOVA 1USBA 3J7Yb 4ULXA 4MJEA 4P3YB 1Q98A 3ZRDA 3H8QA 1W4VA 1XIYA 2VM1A 4F82A 1MTCA 3V1WA 2Z9SA 1R5PA 4NV2A 2FUG2 1M2DA 4I2TA 5HFKA 3GRXA 1KEBA 1HQOA 3LEFA 4KDYA 3GKNA 2L6DA 5AN1A 2CX4A 2PGTA 3NOFA 6GSSA 4WBRD 4MZCA 1EP8A 3LYPA 2FA8A 2HZFA 3ZTLA 3A5WA 6GSTA 4CW9A 2H0IA 3RPNA 5GSTA 2FNOA 2H01A 5A4VA 3QCPA 3TJJA 2HE3A 2XBQA 4N11A 2PBJA 3A2VA 3GV1A 3KP8A 5ECPB 2C0FA 3CSIA 2E2MA 1XVWA 2RUFA 4EC0A 2H6XA 2PVQA 3QFAC 2B1KA 1O81A 3LSZA 5D96A 2XC2A 3VFIA 1XOAA 1BX9A 1IYHA 3LJRA 3EE2A 4YAVA 2KLXA 1R7HA 3LGCA 3GL5A 4IJIA 3L4NA 2R4VA 4ZL8A 2F9SA 5IMVA 4KUNA 2WZ9A 1GNWA 2VCTA 1SJIA 1GUKA 4OFMA 2OKAA 4K8MA 2IMIA 3ME7A 2A4VA 5JWRB 2LJKA 4LL1B 1PSQA 2H8LA 2HZEB 2RUEA 1FB0A 1ACVA 10GSA 4NV5A 1TRVA 2KP1A 2VL3A 3FZ5A 2X8GA 4D73A 3C7MA 4NHWA 3GN3A 4HZ2A 4ZB9A 2PU9C 3GFKA 1T00A 2MMAA 2YWMA 1LJRA 2V6KA 3IR4A 5G5EA 1B9YC 1X5EA 4JBBA 4JZQA 4ILFA 1HD2A 4ZB6A 3IV4A 4NHZA 2YV7A 4ZL7A 1V40A 2PPTA 1EV4A 2GQKA 3ERFA 1T7PB 3VWVA 1TDIA 5ENUA 1VF2A 13GSA 4XIHA 4V2MA 2ZNMA 3KGKA 4N30A 3GH9A 3M9JA 3M0FA 2JZSA 2YWNA 4V2NA 5B7CA 4OFTA 2VLUA 5ECOB 1M9BA 1R5AA 1HNCA 1OAZA 4MABA 1GRXA 3EU4A 2H6YA 2QSIA 2R2JA 4EKZA 3UBLA 1SKRB 1GH2A 4TN8A 1T1VA 1AXDA 1AAZA 2AUVA 2LJRA 3LXZA 3WT2A 2FLSA 1WIKA 2JSYA 4V1Ap 4KCAA 5ELGA 1GSUA 3O3TA 5ECNB 4K9ZA 2H19A 4XRAA 1ERTA 1B4PA 5KEJA 4KSMA 2DIYA 2TRCP 3R2QA 1AUCA 2B7JA 3UVHA 3CMIA 1V57A 1TKDB 3GURA 1A23A 1PX7A 1U6TA 3VPTA 2VOCA 3L9SA 2JZTA 1AIUA 5HR2A 3KD0A 5DDLA 5G30A 1K3LA 5D9TA 3F0IA 2CVDA 2F3MA 4KAEA 3UVTA 2VCQA 5F07A 2LEGA 5B6MA 4CDOA 2N5FA 2C0EA 4XS1A 2LKUA 4LLRA 4YQVA 4HJMA 5D9VA 4JR6A 4KDXA 4FIWA 1M99A 5AGYA 1GSYA 3D4TA 2VM2A 5IQYA 3OR5A 1Z6NA 2JSZA 3GKMA 2J9HA 1TI3A 1VF4A 1GTIA 2OBKA 1SK0A 4NPBA 2HLSA 2EIOA 4QQ7A 2O7KA 4DSRA 4I5QA 4GQFA 1Z3EA 2AV4A 2HI7A 5ELAA 2CT6A 3VLNA 1M0UA 3KJYA 4E8EA 5IM9A 3HZ4A 5LNKe 1XW9A 2P0GA 2DJ0A 3UAPA 2H1BA 2OBIA 1X9MB 2IMEA 3U6VA 3CSJA 2ON5A 1YZXA 2CZ3A 1PA3A 2GT6A 5CRHA 4XHMA 4OCFA 2KHPA 5ECMB 5CP1A 3QAGA 3P8WA 14GSA 1A2JA 3HDCA 4PGTA 1F3BA 3IXRA 2GZYA 1OVNA 2GGTA 5G31A 1GNEA 2BMXA 3GYKA 2MBTA 1FG4A 3L0HA 4POMA 3GH6A 1XW5A 2YANA 2OJLA 1F37A 5CREA 3DVXA 3HVXA 4OMVA 1ERUA 4TXOA 3HJMA 3QMXA 4MA9A 2B3SA 4EDYA 3ISOA 5D93A 3VI5A 5JWOB 4ECIA 3GSSA 1SYRA 4IELA 3QAWA 5LCZA 4F0CA 1XVQA 1XCCA 5DALB 3KTLA 3D5JA 5IMDA 1OC3A 3FW2A 1JHBA 4FYBA 3KMNA 4ZBAA 2NDOA 1NHOA 1V2AA 1X5CA 3TB2A 1PL1A 3GTUB 1DBYA 3ERGA 1TJDA 4O5RA 5E59A 2OE0A 2TRXA 3ZREA 1TU8A 2OE1A 3HXSA 6GSWA 2O87A 3FK8A 4V1Ag 4BWSA 5EVOA 2E7PA 1A0FA 3I43A 3DVWA 2CV4A 4GLTA 4L0UA 1M9AA 1QMVA 3A2WA 1BJXA 2IN3A 4GSSA 3LQ7A 5DAKB 5D9WA 3FEUA 2REMA 1XWGA 2B7KA 2QGVA 1G0TA 2CVKA 1EV9A 3DIEA 4NWYA 4ZBBA 3UARA 3WYWA 5GZZB 1GL8A 1T4ZA 3BOAA 3QDNA 3EMPA 4O7HA 4K7IA 1I5GA 1MD4A 1SL1B 2DSAA 4TW5A 1K3OA 4TR1B 3DD3A 3FZ4A 2CAIA 1Z5YE 3TJFA 4HS1A 4NAXA 4DSSA 4NXIA 2HXKA 1EGOA 1BYEA 5ID2B 3Q19A 2MZCA 1MEKA 4GSNA 2GS3A 4OCEA 5IMFA 3RDWA 4L0WA 3C1SA 4KNDA 5JCUA 2VD1A 4RUVA 4GRFA 1THOA 1KBNA 4Z7XA 1T3BA 5IMCA 1QXHA 2H66A 4AJ8A 4MH2A 2YPMA 1GP1A 2B5YA 5ABRA 1HYUA 1EP7A 3DWVA 1URMA 2XPDA 1HNBA 2FWFA 1N2AA 1U3AA 3BBYA 1FHEA 5KN2A 1WE0A 2YJ7A 4K1FA 3BCIA 1AC1A 4MDCA 5IMZA 2OA7A 1NHYA 1K0AA 2I3YA 2R6KA 2YZUA 4I97A 3W8SA 1WJKA 2MYGA 1ZOFA 1F2EA 3I69A 1MDJA 2H0GA 4Q5FA 3N5OA 3APQA 1V98A 2VO4A 3TRXA 2QKEA 3F4RA 2X8CA 2M72A 3KMOA 3GX0A 3S9FA 2FWEA 1ZZYA 4ZXGA 4G9HA 1VF1A 2YCDA 2DJ3A 3FR3A 2AB6A 1PGTA 3O6TA 4MH3A 1SENA 5JCWA 2B1LA 1DE2A 3TKPA 1SJZA 3TRQA 2BTOT 3DMLA 4TKYA 4OO4A 3BJ5A 2VCZA 2H70A 1KNGA 3FR9A 1SKSB 2PERA 3GKXA 2RLIA 4YQUA 5C00A 2JADA 3UMAA 1M7TA 1VF3A 2VL9A 2KUCA 1YQ1A 2HT9A 2VD0A 1CQGA 2N5BA 1GTBA 4KCEA 2JACA 3KM6A 4TR0A 5FWGA 4WR4A 2GSQA 3F4SA 4KW6A 1TU7A 3APOA 2YWOA 3PGTA 3AY8A 2DBCA 3QOUA 1THXA 4EO3A 4PURA 4KX4A 2YNXA 3A3TA 5B8AA 1DE1A 2K18A 1O85A 5AIVA 1GWCA 1J0FA 3FZAA 2LJAA 1A2MA 3M9KA 2VLTA 4QL7A 2H75A 1GSEA 3HHVA 2E2GA 1GUHA 9GSSA 2H72A 2R5GA 4ML6A 3ZIJA 4BA7A 4J2FA 5H5QA 3D6IA 1R26A 3G9BA 3M8NA 3NIVA 3GA4A 2AHEA 3IBHA 2H71A 2IPAA 4I8BA 2YJHA 3VI7A 2H74A 3QPMA 2DJ1A 2GT5A 3G7IA 1X9SB 3US3A 1XZOA 1TRWA 2PWJA 4POBA 1HNAA 5CRDA 2XBIA 5KN1A 3RPPA 2PN8A 1U87A 4HU7A 3ZLPA 2WS2A 3C73A 5ECSA 4MJBA 4L8EA 2FY6A 3QFBC 5J4UA 3WGEA 4O32A 4MPGA 3RAZA 6GSVA 2GLRA 5DQYA 4HU9A 2EIRA 1MD3A 4K6XA 4GSTA 2B5EA 1PN9A 1YEXA 2C4JA 3TKRA 3O76A 2GDRA 2LS5A 3P2AA 3TJGA 4GXZA 2LV3A 1O6JA 2P5RA 2R3XA 2LQOA 4MZBA 1B9XC 2CQ9A 1VGLA 3F3RA 2RM5A 1O8XA 3MWHA 1F3AA 1JLVA 1JZDA 4WR5A 3F8UA 5ECHB 1XWCA 2DIZA 1AQXA 3NZNA 2HNLA 4HOJA 2OADA 3QD9A 3QAVA 4DVCA 1NM3A 4ML1A 5A5KA 4HEA2 2FA4A 4MPFA 4XS4A 3IA1A 2ES7A 3F4TA 3KH7A 2L4CA 4ZILA 2I1UA 3D4MA 3HVVA 2BJXA 5DQSA 4WF5A 4HJ2A 4IW9A 4BVYA 3WD6A 4MF7A 1A2LA 2L57A 3VWWA 4KDUA 4K2DA 1Z7RA 1EOHA 2WULA 3W6GA 2C3TA 3FHKA 4GWRA 3HJOA 4MCUA 1Q4JA 2IWTA 1Y25A 4DSQA 4PXOA 1ZL9A 4WBJA 1Z6MA 1BQ7A 2A2RA 2G2QA 2O8VB 3ZVJA 2MMZA 2C0GA 2C1YA 3VPQA 2MMNA 3L9UA 2P31A 4G10A 4GCIA 2B6MA 1E6BA 3ZVJD 1OC9A 2VLVA 2HRFA 2F8AA 4WF4A 1K0DA 1ERVA 3EU3A 4IJ3A 3CRTA 4K7OA 1O73A 3TOTA 5KN3A 1SKWB 3F6FA 1YDKA 4EVMA 2V32A 1TK8B 3SBCA 2N5AA 1M2BA 1EZKA 1U88A 2M46A 3GX8A 5CRGA 3VWXA 4GTUA 3PH9A 2IJYA 4ECBA 4WXTA 2YZHA 3CSHA 5FT3A 2LUSA 1X5DA 3F6DA 1PL2A 1S3AA 3RHCA 1QK8A 1OC8A 16GSA 1IYIA 3QR6A 4F03A 3LWAA 3DYRA 2DMMA 3HD5A 1J08A 3TCOA 3LYKA 4Q5QA 4TOPA 2FD3A 5GAPD 1GLPA 1OE8A 5COHA 2OE3A 5E4WA 4JR4A 2L59A 4RI7A 2XHFA 5CYYA 3D0ZA 3PR8A 1QUWA 3E3EA 2VCWA 2EC4A 1OKDA 4TXOB 3HY2A 2HFDA 1J9BA 5DJMA 5A4UA 3KTBA 2IL3A 1VRSD 2H1GA 2IMDA 5D73A 3D21A 1AW9A 4HQSA 2H1DA 2X64A 2DC5A 5DCHA 1YKCA 3LORA 1FW1A 5G1KA 1ABAA 3EC3A 3ZZXA 4RQRA 3C1RA 3FRCA 4ECJA 3GNJA 4MLYA 4XCSA 1QFNA 3IK9A 1S3CA 3TKSC 4AJ6A 2LQQA 5J5NA 1PMTA 3ZFLA 2EIQA 2IFQA 5FHIA 2CVBA 2LTKA 8GSSA 3IRAA 4V2LA 2GQMA 1B4QA 2I9HA 3FY7A 2K8VA 2FCHA 5F0GA 3H4KA 6GSXA 2VIMA 4FO5A 3GMFA 3DRNA 1ZMAA 1SJ6A 3H79A 2MMOA 4TRXA 4F9ZA 4BL7A 1G6YA 4X1UA 3KEBA 17GSA 1NSWA 3L78A 4X0XA 5ECQB 1OE7A 3E0UA 1ZCPA 2DJJA 2AYTA 1K0CA 4TR1A 1TK5B 3VURA 2V2GA 3ZYWA 4IS0A 5J9BA 1GSSA 3ZMLA 4FYCA 1X0RA 2R37A 1XXUA 3ERWA 1SK2A 11GSA 4J56E 3WGDA 2WGRA 4WETA 1WP0A 1ZYQB 1GUMA 5CNWA 5C04A 4PQIA 4F0BA 2L4QA 1FB6A 1KTEA 1YEPA 5G1LA 2KOKA 1YF0A 1H75A 1B8XA 4NMUA 4DSSB 3TJKA 5AIXA 2O89A 3ZL5A 5INYA 2C8UA 2ZCTA 2DLXA 3KZQA 2HSHA 1XFLA 4HI7A 2GSSA 1I9DA 5A4WA 2AAWA 2H0HA 2B5XA 1EEMA 1WMJA 4LMWA 4JRRA 1FO5A 1XWAA 3FYGA 4YH2A 3E9JB 3EVIA 4YAPA 22GSA 4Q5RA 3W8JA 7GSSA 5D9XA 4RQXA 4IP6A 1M2AA 2YWIA 2NPBA 5B8BA 3KIJA 3IDVA 2X99A 1K3YA 4XS6A 3TJBA 4EUYA 3LXTA 3H1NA 2C0DA 3VK9A 5IO2A 4HDEA 3I9V2 5ECRB 3I6AA 3GKKA 5IMAA 3MNGA 2WDUA 3ZITA 2NBSA 4DEJA 2GSTA 1LU4A 19GSA 4H86A 5EL8A 5LD0A 3APSA 1ML6A 3C71A 2A2SA 4GQCA 4PNGA 1RQMA 1GTUA 2K8SA 2M80A 3ZMKA 2VUPA 1A24A 4PQ1A 3MDKA 5G5FA 1GLQA 4XTSA 4X43A 3IAS2 1Z9HA 3RHBA 2PVOC 20GSA 3GSTA 3Q18A 3EMXA 4N10A 2H1AA 2WFCA 1AQVA 2WCIA 5J41A 4MK3A 1SL0B 4FYUA 2C3QA 2IMFA 1WRYA 4HUAA 3C8EA 1W89A 1SD8A 1XPVA 4K0GA 1PKZA 1CQHA 2FWGA 2HZEA 1PKWA 1FVKA 2WJUA 2H73A 3JCML 4WEYA 1O8WA 1UA5A 5H5SA 4MZWA 2H6ZA 2JZRA 2LNTA 1UN2A 1AQWA 5HQPA 4PUAA 3F63A 2I81A 3GIXA 3IAM2 1K0OA 2FWHA 3HCZA 1K0NA 1MDKA 2VAFA 2OACA 1O7UA 1YF1A 4D73B 2ON7A 2CA8A 1XOBA 3UL3A 3ZIVA 2C80A 2F51A 2VCXA 1A0RP 3HZ8A 1ZGNA 1EWXA 1OYJA 1TI1A 4IHUA 1WPIA 2LSTA 5DCGA 5ECKB 3HJPA 2G0FA 1Y6EA 2D2ZA 1EEJA 1FAAA 3KCMA 1ERWA 2MBSA 1TOFA 5IOWA 1BEDA 5CAXA 5DVBA 5F05A 3BD2A 4MJAA 2WRTA 2J23A 4BPYA 1DSBA 3KH9A 4QL9A 4KB3A 3UIWA 3WT1A 3CTGA 4LL4B 1GULA 3GHAA 2YN1A 2DMLA 2RM6A 5ECIB 4JEDA 3F9UA 5IO0A 2H76A 4JU5A 5J9CA 2FGXA 1G7EA 4G2EA 3G7JA 2QC7A 5CO3A 4KSOA 5HR1A 2VL2C 1Z7PA 2VL2A 2GTUA 3TUEA 2GVPA 3HA9A 1A8LA 1WWJA 1PRXA 1BG5A 4LA1A 4EXJA 4GF0A 5GAND 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chains in the Genus database with same CATH homology


 
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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