4MH3A

Crystal strucutre of bovine mitochondrial peroxiredoxin iii
Total Genus 52
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
52
sequence length
166
structure length
166
Chain Sequence
APAVTQHAPYFKGTAVVSGEFKEISLDDFKGKYLVLFFYPLDFTFVCPTEIIAFSDKASEFHDVNCEVVAVSVDSHFSHLAWINTPRKNGGLGHMNIALLSDLTKQISRDYGVLLEGPGLALRGLFIIDPNGVIKHLSVNDLPVGRSVEETLRLVKAFQFVEAHGE
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
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molecule tags Oxidoreductase
molecule keywords Thioredoxin-dependent peroxide reductase, mitochondrial
publication title Improved Catenated Structures of Bovine Peroxiredoxin III F190L Reveal Details of Ring-Ring Interactions and a Novel Conformational State.
pubmed doi rcsb
source organism Bos taurus
total genus 52
structure length 166
sequence length 166
chains with identical sequence B, C, D, E, F, G, H, I, J, K, L
ec nomenclature ec 1.11.1.15: Peroxiredoxin.
pdb deposition date 2013-08-29

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00578 AhpC-TSA AhpC/TSA family
A PF10417 1-cysPrx_C C-terminal domain of 1-Cys peroxiredoxin
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.30.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich Glutaredoxin Glutaredoxin 4mh3A00
1RK4A 3QFAC 4WBRD 2MMNA 4HOJA 4NMUA 2M72A 4O5RA 5G5EA 4XHMA 4EKZA 5KN0A 11GSA 3Q74A 3CSIA 4FYUA 4OCFA 2H66A 1BEDA 3LYKA 6GSWA 3C7MA 2PPTA 3ZZXA 4EVMA 4CW9A 2M80A 3L78A 4N11A 1Z5YE 2GLRA 4HQSA 2DJKA 2DJJA 2YANA 4IS0A 2L6DA 2C0GA 4XS6A 4KDUA 1FG4A 1SL1B 4GQCA 5H5QA 2KHPA 2GSRA 3F0IA 22GSA 4IP6A 2YWNA 1E6BA 4MZWA 4G9HA 4KAEA 4P3YB 2XBIA 1C72A 3HYPA 1HYUA 1ZGNA 3NOFA 5H5RA 3G7YA 4MH3A 6GSUA 2JSYA 3VLNA 1TXXA 1JZRA 1A8YA 4NWYA 4MZCA 3FKFA 1EOHA 2ZCTA 2RM6A 1SK0A 3VI5A 3ERWA 3TKQA 5DJMA 3TKSC 2LV3A 3FEUA 2WGRA 1ABAA 2KOKA 5DALA 2HSHA 4PURA 4GCIA 4XS1A 3E0UA 5ECIB 2N5FA 1EZKA 5GSSA 1QQ2A 3KZQA 3CXGA 5B6MA 4IELA 5EVOA 5G31A 5HR0A 3RHBA 4LMWA 2WJUA 4PQHA 2PMTA 4MK3A 1G0TA 2YPMA 2OE0A 3WGEA 1SD9A 4JRRA 1B4QA 4YAVA 3BOAA 2ZNMA 3HJOA 4L8EA 1WJKA 3F3QA 4ZBBA 3Q6OA 2OE3A 4I8BA 2KP1A 3ZMLA 2LJKA 2MYGA 4Q5FA 2LEGA 1V57A 4EL1A 6GSXA 4DSQA 1XFLA 4POKA 2GQLA 4V2LA 3O6TA 4TN8A 3WT1A 1A24A 2YJ7A 2HXKA 4LL1B 4QL7A 1ST9A 1X5CA 2VL3A 1XXUA 5G1KA 3DYRA 1F9MA 1GRXA 2WDUA 3UEMA 3H93A 3EC3A 1SD8A 5DAKB 3IPZA 4AJ7A 2H8LA 3FZ9A 4TR3A 2FA4A 4FO5A 3UBLA 1J08A 2P5QA 2LNTA 3QFBC 3ZVJA 4K9ZA 3ZFBA 2GSQA 2FGXA 3G7JA 1GULA 2LNSA 3RPNA 3ZVJD 1M99A 3DRNA 2XHFA 5GAPD 3UMAA 6GSSA 3FZ5A 4TKYA 3CBUA 2I81A 4L5LA 2HZFA 3UOMA 2C80A 5F06A 3S9FA 5AN1A 1M0UA 1R5PA 1PQNA 1VGLA 2MMZA 2HI7A 2GQMA 4HDEA 2LJAA 16GSA 3L4NA 4K7OA 3GH6A 2Z9SA 4IN0A 4ZBDA 1N2AA 4KA0A 3IHQA 2H1BA 1JZWA 3O76A 3F4RA 5DQSA 3F9UA 2X8HA 5CAXA 1H4OA 3L9UA 1NW2A 5IMFA 3GX0A 2XC2A 2GZPA 2FD3A 2PU9C 4DSRA 1Z9HA 3EYTA 3EURA 2LJRA 5COHA 5JWOB 2WZ9A 3GKNA 1PSQA 4AJ6A 2N5BA 3M3MA 1FHEA 1WE0A 2NVLA 2YWIA 4RUVA 4MABA 1MDJA 2DC5A 4GTUA 2H72A 3M9JA 4LLRA 4AF2A 5AISA 3MSZA 5IQYA 3C1RA 4GSNA 4LMVA 3HCZA 3CTFA 3LXZA 2GSTA 2PWJA 4KCAA 2JSZA 2C0EA 4OCEA 1ZCPA 4RQRA 2HRFA 4LA1A 3I43A 2HZEB 1PKZA 4TVEA 1ERTA 5ECOB 4WXTA 3M1GA 4ZB9A 1Z6NA 3GHAA 5ECMB 3LXTA 1TK5B 5C00A 4PUAA 3TB2A 1GL8A 3TRPA 3VFIA 3HXSA 3F8UA 1NHYA 2YV9A 2DSAA 4ZXGA 2XBQA 1AQVA 4XCSA 3IV4A 4JR4A 1BQ7A 3LSZA 2RM5A 2K18A 4OFTA 2WRTA 3N9JA 3D4TA 2XPEA 2L5OA 4TOPA 1V2AA 1SU9A 2R4VA 4ZL9A 2LRTA 5G30A 4WBJA 1ZMAA 1MEKA 4FYBA 3HDCA 2WULA 1GSQA 4TR1B 2OADA 3LQ7A 4OMVA 1GTUA 2EIQA 2H6YA 1MTCA 3QMXA 2DBCA 4KSMA 1OKDA 5IPGA 4PQIA 3VPTA 3FYGA 3LJRA 4IJ3A 3GL5A 5ID2B 2GGTA 5IO2A 4XS4B 5EPFA 1H75A 1ILOA 3LWAA 5D9VA 1Q98A 2PBJA 2OBIA 1XVQA 1SK2A 3FZ4A 4AGSA 2FY6A 5IOXA 1U6TA 2RUFA 1O7UA 2RIIA 3TKSE 3TKRA 1M9AA 3GH9A 12GSA 1EEMA 3IBHA 2GZZA 5B8BA 2I9HA 4WKWA 3I9V2 3GKXA 4K2DA 3ZIVA 4JBBA 5IIZA 4JE1A 4EC0A 1GSFA 2R3XA 5DJLA 4GLTA 3GN3A 2K6VA 4WF5A 2E2GA 4WETA 1AIUA 3N5OA 5J9BA 8GSSA 1XOAA 4GQFA 1HNCA 4ECIA 3BCKA 4POMA 1TOFA 2YWOA 3QAVA 4DVCA 3HJMA 3TRQA 5D9WA 5D93A 3QDNA 13GSA 4FH8A 3P7XA 1SKWB 3J7Yb 2H70A 2X8CA 1M2BA 3F4SA 4G10A 3HKRA 1HNAA 3LGCA 1K0AA 2FLSA 4X43A 2V1MA 1EWXA 2JL4A 2YCDA 4IKHA 5A4WA 3MNGA 2MMOA 2H19A 3A2VA 1SENA 3C8EA 1DE1A 4IW9A 1PD21 2B1KA 3DWVA 3ME8A 1GSEA 4PNFA 3F6DA 2P5RA 1O73A 3D21A 2VD1A 1V58A 1Z7RA 3DVXA 1Z7PA 3KIJA 2VLTA 3KTBA 3LORA 4XRDA 2L5LA 2FCHA 1X9SB 5FWGA 1G6YA 3D22A 4MLYA 4BPYA 4OO4A 4DEJA 1S3DA 2H76A 5ECKB 4ACSA 5E4WA 5J41A 4DSSB 2VLVA 1SYRA 2H0IA 2IFQA 3ERGA 4J57E 3UVHA 1NM3A 1T4YA 2VCTA 4G19A 3IC4A 2YV7A 3GSSA 2V32A 1F6MC 4K1FA 1GNEA 3DKSA 1TW9A 1AXDA 2H0GA 2VM2A 1YQ1A 4QQ7A 1EGOA 3ZREA 1V98A 3TGZA 3D6IA 4Z7XA 3M8NA 3KTLA 4D73A 1K0CA 4MF6A 3WYWA 4K7IA 2PERA 2E0QA 4Q5QA 3C73A 4ZB8A 2C3TA 2AHEA 1TJDA 4J2FA 3GIXA 4EXJA 17GSA 4NXIA 2AV4A 1M2DA 4GWRA 2MBSA 2CQ9A 3DEXA 1ZZYA 2GSSA 2FUG2 1QUWA 3ZYWA 3HVVA 1URMA 4XRAA 5IPHA 4E8HA 3RHCA 3IR4A 2TRXA 2QKEA 1F2EA 5IMZA 1UN2A 1VRSD 2NPBA 2GT6A 3GL3A 1VF3A 3P90A 1WWJA 3WT2A 4JEDA 2LRCA 3KJYA 3DD3A 1XVWA 1X0RA 4KSOA 3GTUB 1PGTA 4MPFA 2R5GA 3GMFA 3HHVA 1GSSA 1KTEA 2PVQA 3TCOA 2OJLA 2B6MA 2IMEA 2VLUA 4LL4B 1KEBA 1V40A 4HU9A 2F51A 3UBKA 1DSBA 4BWSA 3LFLA 3O3TA 1CQGA 3QAWA 4RI7A 2ALBA 5HFKA 1ERWA 3F4TA 4ID0A 2PUKC 4PQ1A 5ENUA 5GAND 2WCIA 2CVBA 1FB0A 1WRYA 5IMAA 2C1YA 1XZOA 3CTGA 2RLIA 4YQVA 5E59A 2CX4A 5IMVA 4K0GA 1S3CA 2L4CA 5F05A 1PX6A 2LS5A 2DMLA 1PL2A 3GNJA 2JZRA 6GSVA 4O32A 3EINA 1SL2B 2HNLA 4JR6A 3E9JB 1HQOA 3IK9A 2AYTA 3H79A 3IE3A 3FY7A 5D9XA 2H1GA 1SL0B 4F0CA 3IK7A 4I2UA 5ECHB 1AQWA 4YAPA 4CHSA 3L0HA 4NV5A 4MPGA 2VL2A 2GT5A 3G7IA 2A4VA 1ERUA 1TRUA 4MDCA 1Z3EA 4POLA 1TI3A 3EU3A 4F2IA 1B8XA 2R2JA 3VWXA 5D8IA 3IXRA 6GSYA 2KP2A 1OC9A 5JWQB 1XIYA 3UIWA 5HR3A 1ML6A 4WR5A 2LSTA 1X5DA 1DUGA 2O7KA 4IBPA 3VURA 3QCPA 2VD0A 3PR8A 5IMCA 3E3EA 5HR2A 2CT6A 4KCEA 4TXOB 2CVDA 3CRUA 2L6CA 1EEJA 2X8GA 4ECBA 4ZL7A 4AJ8A 1JZOA 2GTUA 9GSSA 1GLPA 1R5AA 2LUSA 3BBYA 3IDVA 1O8WA 3FR3A 3VI7A 2EIRA 2KLXA 2YZUA 4MF7A 1EOGA 2LQQA 1X9MB 4YQUA 2L4QA 5LCZA 1PL1A 3QPMA 4EE0A 2FWHA 5JCUA 3ZRDA 5DCGA 3ZL5A 2MZCA 2OBKA 1Q4JA 1YJ6A 1THXA 1N8JA 1PN9A 1XPVA 2DMMA 3TKSA 3GX8A 5DAKA 4K8MA 4BWQA 1R26A 1GLQA 2I1UA 4ECCA 1U87A 4FYCA 4EDZA 2VAFA 3PH9A 1XWBA 1B4PA 4RQXA 1FVKA 2DJ2A 2FNOA 1XW6A 3TDGA 4PX1A 1RQMA 2QC7A 3KGKA 3HZ8A 1O81A 2HT9A 4NV2A 4O92A 1F3BA 1W89A 3MWHA 2TRCP 2MBTA 3C1SA 1G7EA 4K7NA 3ZITA 3F63A 3K8NA 3DMLA 4K6XA 3EWLA 1OYJA 2P0GA 2A2SA 2AAWA 4H86A 1PRXA 1A8LA 3KXOA 1MD4A 1Y25A 3RBTA 1A2LA 1KBNA 1GUMA 2R6KA 2WB9A 2TIRA 5B7CA 1VF4A 5JCWA 3SWLA 3DIEA 4MP4A 4TW5A 4NPBA 1U88A 1MDKA 1HD2A 3KCMA 2D2ZA 2C3NA 1HNBA 4PGTA 1BJXA 1O85A 1AC1A 1J0FA 4GRFA 3F3RA 2B3SA 1XWGA 2QGVA 5ABRA 2ON5A 4F03A 2C0DA 2KUCA 2B1LA 3IAS2 5AIXA 1JLWA 1TP9A 2V6KA 1TK8B 3W8SA 1THOA 2K8VA 3FZAA 3HJPA 4IP1A 2CZ2A 3BJ5A 3VWWA 3HA9A 2ON7A 1DBYA 1TTZA 1U3AA 2L59A 3I6AA 1WOUA 4E8EA 2HZEA 2OKAA 3EU4A 4ML6A 2CAQA 4WEYA 5IOWA 1TRSA 1AW9A 2O87A 3HD5A 2IFQB 1OC8A 3ZLPA 3BCIA 2PVOC 1K0DA 1M7TA 1ERVA 1F37A 3ME7A 1JLVA 3NIVA 3APOA 3EMXA 1YF1A 4QL9A 1I9DA 5G1LA 2HRNA 4D73B 3EVIA 4V2MA 3MAKA 3TJBA 2B5XA 2B7KA 3BD2A 5ELGA 4PXOA 2FWEA 5CRGA 5CREA 4J56E 3W6GA 4BL7A 4N0ZA 3EMPA 1K0NA 4TR1A 1QXHA 4GF0A 4V1Ap 4L0UA 1TU8A 4MJEA 3ISOA 3P2AA 1FB6A 5ID2A 3GKKA 4XS4A 4N0VA 2DJ0A 4KE3A 4EDYA 5D73A 3OR5A 1I5GA 4TXVA 3ERFA 2VCZA 3A2WA 1SK1A 2M46A 1DE2A 2RUEA 2DLXA 1T1VA 1OVNA 3MDKA 1K3YA 4TR4A 1BG5A 1K3LA 3GUSA 1W4VA 5D9TA 3TRXA 2H01A 5DALB 2P31A 1YF0A 4KDYA 2NBSA 4JU5A 1OE8A 2YWMA 2JZTA 1AUCA 4RI6A 5FHIA 1JFUA 5J4UA 4YH2A 2X99A 1XWAA 3FHKA 2V41A 2FA8A 1A23A 2B5YA 3CSJA 1X9WB 3NZNA 1VF2A 2DJ1A 2YN1A 3J7Yk 3V1WA 2HLSA 2V6OA 3GV1A 3SBCA 5F8BA 1TI1A 3M9KA 4HEA2 2EC4A 1GWCA 3AY8A 4I5QA 2DIZA 2BTOT 5EY6A 1K0OA 4MJBA 1TU7A 4WF4A 3KMOA 1MD3A 1SYXA 1NSWA 3QOUA 3QD9A 1V9WA 4OO5A 3GKMA 5CP1A 4HZ2A 4NHWA 3IRAA 2X64A 4HUAA 3GRXA 3RDWA 4MMMA 1KNGA 2E2MA 2OA7A 3KH9A 5D96A 4BVXA 1YKAA 3FK8A 1WPIA 1GUHA 2C0FA 4PNGA 1EV9A 1A2MA 2OE1A 2CV4A 3LEFA 3IAM2 2C3QA 10GSA 3DGQA 3RPPA 1A0FA 1EV4A 3VWUA 1A0RP 5JWRB 1S3AA 3ZIJA 4ZB6A 1OC9B 1GSYA 2H71A 1T8EB 4N10A 4ZBAA 3UVTA 1SJ6A 2AB6A 2I3YA 5H5SA 4ML1A 5J3RA 3G9BA 6GSTA 2DIYA 3DXBA 1BYEA 2H1AA 4DSSA 1BAYA 1GTAA 5IMDA 2WS2A 2LQOA 2VOCA 4MZBA 5JCGA 1OKTA 5EL8A 2IPAA 1B9XC 3R2QA 2CAIA 5HR1A 1FO5A 1J9BA 4FIWA 5CRHA 2VUPA 5F0GA 2C4JA 1XCCA 2YOIA 5CRDA 2CZ3A 5DVBA 3L9VA 1T7PB 3FR6A 1OAZA 2H6ZA 4YQMA 4F82A 3UAPA 3ZMKA 1Y6EA 3UL3A 5ECLB 5G5FA 3GA4A 2IMKA 1NHOA 2JACA 4GSTA 4V2NA 2WFCA 4PUFC 5G2ZA 1SJZA 3UJ1A 4KDXA 2F3MA 1T3BA 1GH2A 1QGVA 4G2EA 2HE3A 4IQAA 2VO4A 4L5OA 3FR9A 3HZ4A 1SKRB 3HVSA 1ZOFA 2O8VB 4I97A 2C8UA 2MMAA 1VF1A 3APSA 3TOTA 1F3AA 4EO3A 3M0FA 4HS1A 20GSA 1XW5A 2GZYA 4GSSA 3Q19A 3GTUA 2B5EA 1U3IA 2JZSA 2F8AA 3ED3A 3HY2A 2QSIA 19GSA 2H0HA 1EP7A 3TJJA 4V1Ag 4O7HA 2HYXA 4Q5RA 3QAGA 3IOSA 2CX3A 4POBA 3QR6A 4OFMA 1Z6MA 2H30A 4HZ4A 2JADA 3PGTA 4MJAA 2GS3A 2VCQA 1QFNA 4N30A 3P8WA 2VM1A 4ZILA 5J9CA 2NTOA 2IL3A 1GNWA 3TKPA 5CRWA 1JZDA 5DCHA 2IIYA 3DVWA 3VWVA 1TDIA 2I4AA 3CRTA 1EGRA 1G7OA 1M9BA 4MJCA 5AIVA 5KEJA 4Q5NA 2PGTA 3ZFLA 1EP8A 3APQA 3WD6A 2CA8A 1QMVA 3L9SA 4HQZA 1XWKA 4KX4A 1R4WA 4JZQA 3KH7A 2J23A 4F9ZA 4ECJA 3GFKA 2O89A 3C71A 2IMDA 1T4ZA 3H4KA 4CDOA 2VIMA 2REMA 3CYNA 3A3TA 4MA9A 2NDOA 3LYPA 1GTBA 5DBQA 3TJKA 5GSTA 2IJYA 1SJIA 4IVFA 4NHZA 3TJFA 5C04A 5LNKe 3A2XA 4I2TA 2LRNA 3EE2A 1OE7A 4TR0A 1YKCA 2CVKA 1K0BA 5ECRB 2YNXA 2N5AA 1YZXA 1FAAA 1TRVA 1O8XA 3CSHA 1QK8A 4ISDA 3WGDA 1YEPA 1AQXA 1LBKA 1ON4A 1GP1A 3IA1A 4OFNA 3KM6A 1R7HA 5AGYA 2AUVA 1XW9A 5LD0A 3LG6A 2H73A 5ECPB 4MF5A 4BA7A 4TXOA 5FT3A 1YDKA 3GYKA 1JHBA 2H6XA 7GSSA 1XWCA 2HFDA 4KNDA 5HFGA 2FHEA 2AJQB 4BVYA 4XTSA 4ILFA 1GUKA 2O85A 2A2RA 4L0WA 4ZL8A 3U6VA 4OD7A 1IYIA 2G0FA 3VK9A 2IMIA 5B6NA 3A5WA 2IWTA 1IYHA 5HFIA 3H8QA 1K0MA 4ZIJA 4EF0A 2YJHA 3D0ZA 1G6WA 1ZL9A 3U5RE 2JU5A 3KP8A 1SKSB 4K0NA 4MCUA 1PA3A 3Q18A 1XOBA 14GSA 5ECSA 4IHUA 4I6XA 4HJ2A 3W8JA 2K8SA 4KH7A 3TOUA 2H1DA 1K3OA 4F0BA 1B9YC 1BX9A 5IO0A 3GSTA 4KGIA 1MDIA 1X5EA 3CMIA 4TRXA 1TKDB 4KB3A 1UVZA 1RW1A 2VCVA 2J9HA 4IQ1A 2H75A 1TRWA 2LTKA 3KEBA 2VL9A 3RAZA 4OWYA 2H74A 5L71A 3KMNA 1ZYEA 3JCML 2FWFA 2BMXA 5B8AA 3VPQA 3H1NA 2EIOA 2F9SA 1GTIA 4NAXA 2GQKA 2DJ3A 5IM9A 5DQYA 18GSA 1CQHA 1YEXA 4KW6A 1WP0A 1O6JA 3TJGA 2GVPA 2VCXA 5CNWA 3KP9A 1T00A 5A4UA 2L57A 4KUNA 1ZYQB 2F8FA 1FW1A 4HI7A 3D5JA 1WIKA 2OACA 4HU7A 2V2GA 5A4VA 5CYYA 4MH2A 3ZTLA 2GDRA 1A2JA 2IMFA 2BJXA 5INYA 4GXZA 1ACVA 5ECQB 2LKUA 5F07A 1M2AA 5KN2A 5KN1A 2YP6A 4IGJA 5A5KA 1YY7A 5ECNB 3D4MA 5CO3A 2B7JA 5DDLA 2E7PA 2XPDA 1FVJA 1LJRA 3US3A 4X0XA 1B48A 2ES7A 1UC7A 3KD0A 1FOVA 5KN3A 5GZZB 4WR4A 1AAZA 3UARA 1USBA 2VL2C 4HJMA 4X1UA 3WGXA 1LU4A 1WMJA 2VCWA 2YZHA 3F6FA 3FW2A 1TK0B 1GSDA 5HQPA 2ZUPA 3HVXA 1PX7A 2G2QA 1GSUA 5ELAA 4EUYA 2K9FA 1XBSA 3I69A 2HSYA 2IN3A 3GURA 4ULXA 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chains in the Genus database with same CATH homology


 
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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